Preguntas de actividad de metabolismo de aminoácidos:
Qué es el equilibrio nitrogenado
→ Es el balance entre la ingesta y la excreción de nitrógeno en el organismo.
Se considera que un individuo está en equilibrio nitrogenado cuando la
cantidad de nitrógeno ingerido en forma de proteínas es igual a la cantidad
de nitrógeno excretado en forma de urea, ácido úrico y otros productos
nitrogenados.
→ El catabolismo de aminoácidos forma parte de un proceso metabólico más
extenso, el de las moléculas que contienen nitrógeno. El nitrógeno entra en
el organismo en forma de diversos compuestos presentes en los alimentos,
de los cuales los más importantes son los aminoácidos contenidos en las
proteínas de la dieta. El nitrógeno abandona el organismo en forma de urea,
amoníaco y otros productos derivados del metabolismo de aminoácidos. La
función de las proteínas corporales en estas transformaciones implica dos
conceptos importantes: el conjunto de aminoácidos y el recambio de
proteínas.
Qué es el equilibrio nitrogenado positivo y negativo
→ Equilibrio nitrogenado positivo: Se produce cuando la ingesta de nitrógeno
supera a la excreción. Esto ocurre durante el crecimiento, la pubertad, el
embarazo y la lactancia, cuando el cuerpo necesita más proteínas para
construir y reparar tejidos.
→ Equilibrio nitrogenado negativo: Se produce cuando la excreción de
nitrógeno supera a la ingesta. Esto ocurre durante el ayuno, la desnutrición,
el envejecimiento y en algunas enfermedades como las quemaduras o las
infecciones.
En qué situaciones se da un equilibrio nitrogenado positivo
→ Crecimiento: Los niños y adolescentes en etapa de crecimiento necesitan
más proteínas para construir nuevos tejidos.
→ Pubertad: Los cambios hormonales que se producen durante la pubertad
aumentan la síntesis de proteínas.
→ Embarazo: La mujer embarazada necesita más proteínas para el desarrollo
del feto y la placenta.
→ Lactancia: La mujer que amamanta a su bebé necesita más proteínas para
producir leche materna.
En qué situaciones se da un equilibrio nitrogenado negativo
→ Ayuno: Cuando no se ingieren proteínas, el cuerpo comienza a utilizar las
proteínas de los tejidos para obtener energía.
→ Desnutrición: La falta de proteínas en la dieta conduce a la degradación de
las proteínas de los tejidos.
→ Envejecimiento: La síntesis de proteínas disminuye con la edad, lo que
puede llevar a un balance nitrogenado negativo.
→ Quemaduras: Las quemaduras graves provocan la pérdida de proteínas a
través de la piel.
→ Infecciones: Las infecciones aumentan la degradación de proteínas en el
cuerpo.
Qué es la velocidad de recambio proteico
→ Es la tasa a la que las proteínas se sintetizan y se degradan en el cuerpo.
La velocidad de recambio proteico varía según el tipo de tejido, la edad y el
estado fisiológico del individuo.
→ En adultos sanos, la cantidad total de proteínas en el organismo
permanece constante, porque la velocidad de síntesis de las proteínas
es justo la suficiente como para reemplazar la proteína que se
degrada. Este proceso, denominado recambio de proteínas, produce
cada día la hidrólisis y resíntesis de 300-400 g de proteína corporal.
La velocidad de recambio de las proteínas varía ampliamente para
cada proteína. Las proteínas de vida corta, con semividas de minutos
u horas (p. ej., muchas proteínas reguladoras y proteínas mal
plegadas), se degradan rápidamente. Las proteínas de vida larga, con
semividas de días o semanas, constituyen la mayoría de las proteínas
en la célula. Las proteínas estructurales, como el colágeno, son
metabólicamente estables y presentan semividas de semanas o años.
Investigar las dos vías de degradación de las proteínas
→ Existen dos sistemas enzimáticos principales responsables de la
degradación de las proteínas: el sistema de ubiquitina-proteasoma
dependiente de trifosfato de adenosina (ATP) del citosol, y el sistema de
enzimas degradadoras no dependientes de ATP de los lisosomas. Los
proteasomas degradan de manera selectiva la proteínas dañadas o de vida
corta. Los lisosomas utilizan hidrolasas ácidas para degradar de manera no
selectiva proteínas intracelulares («autofagia») y extracelulares
(«heterofagia»), tales como proteínas plasmáticas, que son absorbidas por
la célula por medio de endocitosis.
a) Vía de la ubiquitina:
• La ubiquitina es una proteína pequeña que se une a las proteínas que van a ser
degradadas.
• La ubiquitinación de las proteínas es un proceso complejo que requiere la
participación de varias enzimas.
• Las proteínas ubiquitinadas son degradadas por la proteasoma, un complejo
multiproteico que las fragmenta en pequeños péptidos.
b) Vía lisosómica:
• Las proteínas son internalizadas en los lisosomas, que son orgánulos celulares que
contienen enzimas proteolíticas.
• Las enzimas lisosomales degradan las proteínas a aminoácidos.
Explica la vía de la ubiquitina
→ La proteína diana es reconocida por una enzima ligasa de ubiquitina.
→ La ligasa de ubiquitina activa la ubiquitina y la une a la proteína diana.
→ Se añade una cadena de ubiquitinas a la proteína diana.
→ La proteína ubiquitinada es reconocida por la proteasoma.
→ La proteasoma degrada la proteína ubiquitinada a aminoácidos.
Las proteínas seleccionadas para la degradación por parte del sistema ubiquitina-
proteasoma del citosol son modificadas en primer lugar por la unión covalente de la
ubiquitina (Ub), una proteína pequeña y globular no enzimática mayormente conservada en
las especies eucariotas. La ubiquitinación del sustrato diana se efectúa a través de la unión
del isopéptido del carboxilo a de la glicina C-terminal de la Ub al grupo e-amino de lisina de
la proteína sustrato mediante un proceso en tres etapas catalizado por enzimas, un proceso
que depende de ATP. [Nota: la enzima 1 (E1, o enzima activante) activa la Ub, que a
continuación es transferida a la E2 (enzima conjugante). La E3 (una ligasa) identifica la
proteína que va a degradarse e interactúa con E2-Ub.] La adición posterior de cuatro o más
moléculas de Ub a la proteína diana genera una cadena de poliubiquitina. Las proteínas
marcadas con Ub son reconocidas por un gran complejo macromolecular proteolítico en
forma de barril, denominado proteasoma (fig. 19-3). El proteasoma despliega desubiquitina
y corta la proteína que se quiere degradar en fragmentos que a continuación se degradan
mediante proteasas citosólicas hasta llegar a aminoácidos, los cuales pasan a formar parte
de la reserva de aminoácidos del organismo. La Ub se recicla. Cabe destacar que la
degradación selectiva de las proteínas mediante el complejo ubiquitina-proteasoma (a
diferencia de la simple hidrólisis por enzimas preoteolíticas) requiere energía en la forma
de ATP.
Explica la vía lisosómica
→ puesto que las proteínas tienen diferentes semividas, está claro que su degradación
no puede ser aleatoria, antes bien, se ve influida por ciertos aspectos estructurales
de la proteína. Por ejemplo, se degradan con preferencia las proteínas que han sido
alteradas químicamente por oxidación o marcadas con ubiquitina. La semivida de
una proteína también depende del residuo aminoterminal. Por ejemplo, las proteínas
que tienen serina como aminoácido N-terminal son de vida larga, con una semivida
de más de 20 h, mientras que aquellas con aspartato en el extremo N tienen una
semivida de tan sólo 3 min. Además, las proteínas ricas en secuencias que
contienen prolina, glutamato, serina y treonina (denominadas secuencias PEST en
función del código de una sola letra para estos aminoácidos) se degradan
rápidamente y, por lo tanto, tienen semividas cortas.
o Las proteínas son internalizadas en las células por endocitosis.
o Las proteínas se fusionan con los lisosomas.
o Las enzimas lisosomales degradan las proteínas a aminoácidos.
o Degrada proteínas de vida larga, de membrana, extracelulares
o ATP independiente
o Dos procesos: Endocitosis (De proteínas extracelulares) y Autofagia
(Proteínas intracelulares y organelos)
Enlista las enzimas que participan en la vía de la ubiquitina
→ Enzimas activadoras de ubiquitina: E1
→ Enzimas conjugadoras de ubiquitina: E2
→ Enzimas ligasas de ubiquitina: E3
Explica cómo se dan las señales para la degradación
→ UBIQUITINIZACIÓN. Ubiquitina C-Gly, se une a Proteína N-Lys.2.
→ SECUENCIA PEST. Regiones ricas en aminoácidos Pro-Glu-Ser-Thr, de
proteínas de semividas cortas
→ CAMBIOS CONFORMACIONALES. Exponen región PEST, susceptible a la
acción de proteasas
→ REGIONES N-TERMINALES: Estabilizadores: Met, Gly, Ala, Ser [semivida
larga]. No son fácilmente marcados por Ub.
Desestabilizadores: Fen, Trp, Asp, Arg, Lys [corta]. Señales de marcaje
rápido por Ub.
Señales intrínsecas:
→ Errores en el plegamiento: Las proteínas que no se pliegan correctamente son
más propensas a ser degradadas.
→ Daños en las proteínas: Las proteínas dañadas por oxidación o por otras causas
también son más propensas a ser degradadas.
→ Secuencias de aminoácidos: Algunas proteínas tienen secuencias de aminoácidos
específicas que las marcan para su degradación.
Señales extrínsecas:
→ Ubiquitinación: La ubiquitina es una proteína pequeña que se une a las proteínas
que van a ser degradadas. La ubiquitinación de las proteínas es un proceso
complejo que requiere la participación de varias enzimas.
→ Proteasas: Las proteasas son enzimas que degradan las proteínas. Algunas
proteasas son específicas para proteínas con ciertas señales de degradación.
→ Autophagy: La autofagia es un proceso por el cual las células degradan sus
propios orgánulos dañados o proteínas.
Explica cómo se da la eliminación del grupo amino de los aminoácidos
→ El grupo amino de los aminoácidos se elimina mediante un proceso llamado
transaminación. En la transaminación, el grupo amino se transfiere de un
aminoácido a un α-cetoácido, con la ayuda de una enzima llamada transaminasa o
aminotransferasa. El α-cetoácido se convierte en un aminoácido y el aminoácido
original se convierte en un α-cetoácido.
Transaminación:
→ En la transaminación, el grupo amino se transfiere de un aminoácido a un α-
cetoácido, con la ayuda de una enzima llamada transaminasa o aminotransferasa.
→ El α-cetoácido se convierte en un nuevo aminoácido y el aminoácido original se
convierte en un α-cetoácido.
→ Las transaminasas son enzimas muy específicas que solo catalizan la transferencia
del grupo amino entre ciertos aminoácidos y α-cetoácidos.
→ La reacción de transaminación es reversible y juega un papel importante en el
equilibrio de los aminoácidos en el cuerpo.
Desaminación oxidativa:
→ En la desaminación oxidativa, el grupo amino se elimina como amoníaco (NH3) y se
produce un α-cetoácido.
→ Este proceso es irreversible y está catalizado por una enzima llamada desaminasa.
→ La desaminasa más importante en el cuerpo humano es la glutamato
deshidrogenasa, que cataliza la desaminación del glutamato a α-cetoglutarato y
amoníaco.
→ El amoníaco producido por la desaminación oxidativa se transporta al hígado, donde
se convierte en urea a través del ciclo de la urea.
Explica cómo se forma la urea en el ciclo de la ornitina
La urea (H2NCNH2) es la principal forma de eliminación de los grupos amino procedentes
de los aminoácidos y constituye aproximadamente el 90% de los componentes
nitrogenados de la orina. Uno de los nitrógenos de la molécula de urea proviene del
amoníaco libre y el otro, del aspartato. El carbono y el oxígeno de la urea proceden del
CO2 (como HCO3 –). La urea se produce en el hígado y después es transportada por
la sangre hasta los riñones para su excreción en la orina.
A. Reacciones del ciclo Las dos primeras reacciones que conducen a la síntesis
de urea transcurren en la matriz mitocondrial, mientras que las demás
enzimas del ciclo están localizadas en el citosol
1. Formación del carbamoil-fosfato: la formación de carbamoil-fosfato mediante
la carbamoil-fosfato sintetasa I (CPS I) es impulsada por la disociación de 2
moléculas de ATP. El amoníaco incorporado en el carbamoil-fosfato es
proporcionado principalmente por la desaminación oxidativa del glutamato
mediante la acción de la glutamato deshidrogenasa. Finalmente, el átomo de
nitrógeno procedente de este amoníaco se convierte en uno de los nitrógenos
de la urea. La CPS I requiere N-acetilglutamato como activador alostérico
positivo
2. Formación de citrulina: la porción carbamoilo del carbamoil-fosfato es
transferida a la ornitina por la ornitina transcarbamoilasa (OTC) a medida que el
fosfato de alta energía se libera como fosfato inorgánico. El producto de la
reacción, citrulina, se transporta al citosol. [Nota: ornitina y citrulina son
aminoácidos básicos que participan en el ciclo de la urea; atraviesan la
membrana mitocondrial interna por medio de un cotransportador. No se
incorporan en las proteínas celulares, porque no existen codones para estos
aminoácidos] La ornitina se regenera con cada vuelta del ciclo de la urea, de
una forma muy similar a como se regenera el oxalacetato mediante las
reacciones del ciclo del ácido cítrico
3. Síntesis del argininosuccinato: la argininosuccinato sintetasa combina citrulina
con aspartato para formar argininosuccinato. El grupo a-amino del aspartato
proporciona el segundo nitrógeno que acaba incorporándose en la urea. La
formación de argininosuccinato es impulsada por la disociación del ATP en AMP
y pirofosfato. Ésta es la tercera y última molécula de ATP que se consume en la
formación de la urea.
4. Disociación del argininosuccinato: el argininosuccinato es disociado por la
argininosuccinato liasa para proporcionar arginina y fumarato. La arginina
formada en esta reacción sirve de precursor inmediato de la urea. El fumarato
producido en el ciclo de la urea se hidrata a malato, proporcionando así una
conexión con varias vías metabólicas. Por ejemplo, el malato puede
transportarse al interior de las mitocondrias por medio de la lanzadera de malato-
aspartato, volver a entrar en el ciclo de los ácidos tricarboxílicos y oxidarse a
oxalacetato, que puede usarse para la gluconeogénesis
5. Disociación de arginina en ornitina y urea: la arginasa hidroliza la arginina a
ornitina y urea y prácticamente es exclusiva del hígado. Por lo tanto, sólo el
hígado puede escindir la arginina y sintetizar urea, mientras que otros tejidos,
tales como el riñón, pueden sintetizar arginina por medio de estas reacciones.
6. Destino de la urea: la urea difunde desde el hígado a la sangre, que la
transporta hasta los riñones, donde es filtrada y excretada con la orina. Una parte
de la urea difunde desde la sangre al intestino y se disocia en CO2 y NH3 por
acción de la ureasa bacteriana. Este amoníaco se pierde en parte con las heces
y en parte se reabsorbe hacia la sangre. En los pacientes con insuficiencia renal,
los niveles plasmáticos de urea están elevados, lo que provoca una mayor
transferencia de urea desde la sangre al intestino. La acción intestinal de la
ureasa sobre esta urea se convierte en una fuente de amoníaco clínicamente
importante, que contribuye a la hiperamoniemia observada con frecuencia en
estos pacientes. La administración oral de antibióticos reduce el número de
bacterias intestinales responsables de esta producción de NH3.
B. Estequiometría global del ciclo de la urea
Aspartato + NH3 + HCO3 – + 3 ATP + H2O → urea + fumarato + 2 ADP + AMP + 2 Pi + PPi
Debido a que en la síntesis de cada molécula de urea se consumen 4 fosfatos de alta
energía, la síntesis de urea es irreversible, con un DG muy negativo. Uno de los nitrógenos
de la molécula de urea proviene del NH3 libre y el otro, del aspartato. El glutamato es el
precursor inmediato tanto del nitrógeno del amoníaco (a través de la desaminación oxidativa
catalizada por el glutamato deshidrogenasa) como del de aspartato (a través de la
transaminación del oxalacetato catalizada por la AST). De hecho, ambos átomos de
nitrógeno de la urea provienen del glutamato que, a su vez, recoge nitrógeno de otros
aminoácidos
C. Regulación del ciclo de la urea El N-acetilglutamato (NAG) es un activador
esencial de la CPS I, la etapa limitante de la velocidad en el ciclo de la urea.
Aumenta la afinidad de la CPS I por el ATP. El NAG se sintetiza a partir de
acetil-CoA y glutamato por acción de la N-acetilglutamato sintasa, en una
reacción para la cual la arginina es un activador. El ciclo también es regulado
por la disponibilidad de sustrato (regulación a corto plazo) y la inducción
enzimática (a largo plazo).
La urea se forma en el ciclo de la ornitina, que se lleva a cabo en el hígado. El ciclo de la
ornitina consta de cinco reacciones:
• Formación de carbamoil fosfato: El amoníaco se combina con el bicarbonato para
formar carbamoil fosfato.
• Adición de carbamoil fosfato a la ornitina: El carbamoil fosfato se añade a la ornitina
para formar citrulina.
• Transporte de citrulina a las mitocondrias: La citrulina se transporta a las
mitocondrias.
• Conversión de citrulina en argininosuccinato: La citrulina se convierte en
argininosuccinato.
• Conversión de argininosuccinato en arginina y urea: El argininosuccinato se
convierte en arginina y urea.
Calcula el equilibrio de ATP en el ciclo de la urea
→ Consumo de ATP: 1 ATP (reacción 1) + 1 ATP (reacción 4) = 2 ATP
→ Producción de ATP: 1 ATP (reacción 5)
→ Balance neto de ATP: 2 ATP - 1 ATP = 1 ATP
→ El ciclo de la urea consume 2 ATP y produce 1 ATP, por lo que el balance
neto de ATP es de 1 ATP. Esto significa que el ciclo de la urea es un proceso
energéticamente eficiente, ya que produce 1 ATP por cada molécula de urea
que se sintetiza.
Explica el control del ciclo de la urea:
La urea es el principal residuo de la descomposición de las proteínas. Está directamente
relacionada con la cantidad de proteínas que comemos y con las que el propio cuerpo
descompone, lo que depende de la masa muscular. La urea se produce fundamentalmente
en el hígado. Los riñones son los encargados de extraer la mayor parte de la urea (90 %)
de la sangre y eliminarla por la orina. Si los riñones no funcionan bien, no pueden filtrar la
urea correctamente, y sus niveles aumentan en la sangre. La concentración de urea en
sangre empieza a aumentar cuando la capacidad de filtrado de los riñones es una cuarta
parte más baja de lo normal.
El ciclo de la urea está controlado por varios factores, incluyendo:
• La concentración de amoníaco: La concentración de amoníaco en la sangre es el
principal regulador del ciclo de la urea.
• La disponibilidad de N-acetilglutamato: El N-acetilglutamato es un activador del
carbamoil fosfato sintetasa I, la enzima que cataliza la primera reacción del ciclo de
la urea.
• Las hormonas: Las hormonas como el cortisol y el glucagón también pueden
estimular el ciclo de la urea.
Menciona la toxicidad del amoníaco:
• El amoníaco es una sustancia tóxica para el cerebro. El amoníaco puede causar
edema cerebral, convulsiones y coma.
Explica qué es la gluconeogénesis:
• La gluconeogénesis es la síntesis de glucosa a partir de precursores no glucídicos,
como los aminoácidos, el lactato y el glicerol. La gluconeogénesis se lleva a cabo
en el hígado y en los riñones.
Explica la degradación de aminoácidos (Eliminación de los grupos amino y destino
de los esqueletos carbonados)
La degradación de los aminoácidos se puede dividir en dos etapas:
• Eliminación del grupo amino: El grupo amino se elimina mediante transaminación y
se convierte en amoníaco.
• Destino de los esqueletos carbonados: Los esqueletos carbonados de los
aminoácidos se pueden convertir en:
→ Acetil-CoA: Se utiliza para producir energía en el ciclo de Krebs.
→ α-cetoácidos: Se pueden convertir en glucosa a través de la
gluconeogénesis.
→ Cuerpos cetónicos: Se pueden utilizar como fuente de energía por el cerebro
y otros tejidos.
Enlista los aminoácidos cetogénicos y glucogénicos
→ Aminoácidos cetogénicos: Leucina, isoleucina, fenilalanina, tirosina, lisina,
triptófano, metionina.
→ Aminoácidos glucogénicos: Alanina, arginina, aspartato, glutamato, glutamina,
histidina, prolina, serina.
Enlista las patologías por alteración del metabolismo de los aminoácidos
→ fenilcetonuria: Es una enfermedad genética que se caracteriza por la acumulación
de fenilalanina en la sangre.
→ Alcaptonuria: Es una enfermedad genética que se caracteriza por la acumulación
de ácido homogentísico en la orina.
→ Albinismo: Es una enfermedad genética que se caracteriza por la falta de melanina,
un pigmento que da color a la piel, el cabello y los ojos.
→ Histidinemia: Es una enfermedad genética que se caracteriza por la acumulación de
histidina en la sangre.
→ Homocistinuria: Es una enfermedad genética que se caracteriza por la acumulación
de homocisteína en la sangre.
→ Enfermedad de la orina de jarabe de arce: Es una enfermedad genética que se
caracteriza por la acumulación de aminoácidos de cadena ramificada en la sangre.
Enuncia los 5 sistemas principales de transporte de los aminoácidos, basados en la
especificidad del transportador por la por la cadena lateral del aminoácido
→ Sistema de transporte Na+/K+ dependiente: Transporta aminoácidos neutros y
ácidos.
→ Sistema de transporte de aminoácidos básicos
→ Sistema de transporte de aminoácidos dicarboxílicos
→ Sistema de transporte de aminoácidos de cadena ramificada
→ Sistema de transporte de cisteína
Enlista las enzimas que participan en la digestión de las proteínas.
→ Pepsina: Se secreta en el estómago y digiere las proteínas a péptidos.
→ Tripsina: Se secreta en el intestino delgado y digiere los péptidos a aminoácidos.
→ Quimotripsina: Se secreta en el intestino delgado y digiere los péptidos a
aminoácidos.
→ Elastasa: Se secreta en el intestino delgado y digiere la elastina, una proteína
presente en el tejido conjuntivo.
Realiza un esquema acerca de la
digestión de proteínas exógenas
→ Boca: La pepsina del estómago
comienza a digerir las proteínas.
→ Estómago: La pepsina continúa
digiriendo las proteínas hasta que se
alcanza un pH ácido.
→ Páncreas: Se secreta la tripsina,
la quimotripsina y la elastasa, que digieren
las proteínas a péptidos más pequeños.
→ Intestino delgado: Las
peptidasas del borde en cepillo del
intestino delgado digieren los péptidos a
aminoácidos.
→ Absorción: Los aminoácidos se
absorben a través del torrente sanguíneo.
Define qué es una enzima y un zimógeno
→ Enzima: proteína que actúa como catalizador en una reacción química. Entre
las numerosas reacciones biológicas que son energéticamente posibles, las
enzimas canalizan selectivamente los reactantes (denominados sustratos)
en vías útiles. Las enzimas, por tanto, dirigen todos los acontecimientos
metabólicos.
→ Zimógeno: O proenzima, es una proteína precursora inactiva de una enzima.
Los zimógenos se convierten en enzimas activas por un proceso llamado
activación, y se activan por diversos mecanismos para controlar la actividad
enzimática.
Complemente el siguiente cuadro acerca de la organización del tracto gastrointestinal
según sus requerimientos nutricionales.
Órgano Función primaria en la absorción de los alimentos
gastrointestinal
Glándulas salivales Secretan saliva, que ayuda a digerir los carbohidratos y a lubricar
el bolo alimenticio para facilitar su deglución
Estómago Mezcla el bolo alimenticio con los jugos gástricos para iniciar la
digestión.
Páncreas Secreta jugos que contienen enzimas digestivas para
descomponer proteínas, carbohidratos y grasas.
Hígado/vesícula Produce bilis, que ayuda a digerir las grasas.
biliar
Intestino delgado Su función es continuar el proceso de la digestión de los alimentos
que vienen del estómago, y absorber los nutrientes
Intestino grueso Absorbe el agua y deja los productos de desecho llamados heces
