Biomoléculas

Moléculas orgánicas que constituyen a los seres vivos.

Hay diferentes: -Carbohidratos
- Lípidos
- Proteínas
- Ácidos Nucleicos

Se encuentran distribuidos por todo el organismo, se encuentran tanto al interior de las células como en
los fluidos (sangre, linfa, líquido cefalorraquídeo, etc).
Poseen funciones energéticas, estructurales y de transporte.

Características
1. Formadas por C, H y O.
2. Pueden contener N, P y S en su estructura.
3. Realizan funciones de forma independiente y asociada a otras biomoléculas.
4. Su interacción y reactividad entre las biomoléculas depende de los grupos funcionales y su posición
que las componen.

Átomo principal de una molécula orgánica es el carbono y posee una gran versatilidad.
Esto permite una diversidad en generar diferentes estructuras y funciones.

Grupos Funcionales en las Biomoléculas

Aminoácidos : poseen Bases Nitrogenadas : poseen
° Ácido Carboxílico : COOH, COO- ° Amina : NH3
° Amina : NH3 °Amida : CONH2
° Grupo R.

Monosacáridos : posee Ácidos Grasos : poseen

° Alcohol : OH ° Ácido Carboxílico : COOH
° Alquenos
Carbohidratos
Clasificación
° Grupo Funcional : Posee Aldehído o Cetona.
° Número de Átomos de Carbono : tri (3), tetro (4), pent (5), hexo (6).
° Cantidad de Sacáridos juntos : monosacáridos, disacáridos, polisacáridos.

Funciones
° Almacenamiento de combustible energético (glucógeno).
° Genera energía (ATP, NADH).
° Elementos estructurales extracelulares que proporcionan sitio de fijación específicos para determinadas
proteínas.
° Los polímeros cortos de azúcares (oligosacáridos) actúan como señales específicas cuando están unidos
a proteínas o lípidos de la superficie celular.

Lípidos
Clasificación
1. Saponificables : 2. Insaponificables : Generalmente
° Simples : Contiene C, H, O. estructuras cíclicas.
Ejemplos : Ejemplos :
-Acilglicéridos. -Terpenoides.
-Céridos (ceras). -Esteroides.
-Prostaglandinas.
° Complejos : Contiene C, H, O, N, P, S.
Ejemplos :
-Fosfolípidos.
-Fosfoglicéridos.
-Glucolípidos.

Funciones
Componentes estruturales de las membranas, reservas de combustible rico en energía, pigmentos y señales
intracelulares
 Carbohidratos
° Sólidos cristalinos de color blanco.
° De pequeño tamaño son solubles en agua.
° De gran tamaño son insolubles en agua variable.
° Formados por átomos de C, H, O.
° Se pueden unir a proteínas y lípidos.

Funciones
1. Energética : Obtención de energía y 2. Estructural : conforma a la celulosa, la cual
almacena. da sostén mecánico a células vegetales.

3. Reconocimiento : Se une a diferentes

componentes de la membrana plasmática; lípidos o
proteínas.
Detecta microorganismos (virus y bacterias),
señalización por hormonas o células adyacentes.

Grupos Funcionales
Aldehído Cetona
° Son polialcoholes : Poseen varíos alcoholes.
° Dentro de su estructura poseen un aldehído o una cetona.
° A los carbohidatros se le agrega la terminación “osa” al
grupo de átomos de carbono o a su grupo funcional principal
(cetona o aldehído).
Aldotriosa Cetotriosa
 Relación entre Configuración y Conformación
La configuración de una molécula corresponde a los átomos que la constituyen.
La conformación es la disposición espacial.
Ambos conceptos otorgan la estructura tridimensional de las moléculas, con
esto, podemos identificar las interaciones biológicas.
Las enzimas y los receptores celulares son capaces de distinguir entre diversas moléculas mediante la
estereoespecificidad.
Estereoespecificidad = organismo es específico para la conformación.
Hay moléculas con igual configuración pero distinta conformación.

Estereoisómeros distinguibles por receptores sensoriales

El cambio o modificación en la conformación de las moléculas, también está relacionada con nuestros
sentidos.
Ejemplo: aspartamo; su sabor es dulce, pero según la modificación se puede sentir amargo.

Quiralidad
Un átomo de carbono puede unirse a 4 átomos sustituyentes, formando una molécula tetraédrica.
Quiralidad : Carbono unido a sustituyentes diferentes. Genera 2 moléculas con conformación espacial
diferente.
n
Si existen 2 o más centros quirales, pueden haber 2 estereoisómeros; ejemplo : 1 centro quiral 2
estereoisómeros, 2 centros quirales 4 estereoisómeros.
 Isomería
Carbohidratos más importantes presentan 4 centros quirales, ejemplo la glucosa.
Que presente 4 centros es importante por la estereoespecificidad, ya que no da igual el orden atómico.
Estereoisómeros : Moléculas que tiene la misma fórmula, la misma secuencia de átomos, con los
mismos tipos de enlaces, pero difieren en su orientación tridimensional.
Aldehído
1 1 Que se L o D : depende de la posición
Carbono quiral 2
del grupo hidroxilo (OH) en el último
2

3 Carbono quiral 3
carbono quiral.
Carbono quiral 4
L= OH en la izquierda.
4
D= OH a la derecha.
Último centro
Quiral
si 5
Carbono quiral 5

Último centro quiral 6

6

Isómero L Isómero D
Aldohexosa
Aldohexosa

Monosacáridos

° Cadena de carbono no ramificada, solo salen hidróxilos hacía los lados.

° Solo presenta enlaces simples C-C.
° Uno de los átomos de carbono del esqueleto forma un grupo carbonilo (aldehído o cetona).
° El resto de los carbonos está unido a H y OH.

Aldheído siempre va al final de la cadena.

Cetona nunca va a ir al final, siempre en medio.
 Clasificación según número de carbonos

Forma lineal Forma cíclica

* Monosacáridos en la naturaleza se encuentran en forma cíclica o proyección de Haworth.

Monosacáridos con relevancia biológica

Todo monosocárido para ser ingerido por

nuestro organismos debe ser de tipo D.

Monosacáridos en solución acuosa se presentan en forma de anillos, no en forma lineal.

Varía el grupo hidróxilo del carbono 1

Hacia
arriba
Hacia abajo

ALFA Alfa-D-Glucosa BETA B-D-Glucosa

Formará polímeros de reserva energética como almidón y Forma polímeros estructurales como la celulosa.
glucógeno. No las digiere el organismo, a excepción de la
Solo alfa digiere el organismo lactosa.
 Disacáridos
Enlace Glucosídico
6 6
° Se generan con la unión de dos monosacáridos, lo que forma al enlace 5 5

“Glucosídico” o “O-glucosídico”. 4 1
4 1

3 2 3 2
° Se enlaza el carbono 1 de un monosacárido con el carbono 4 o 6 del
otro monosacárido, mediante el enlace O-glucosídico.
° La unión entre monosacáridos se genera por condensación, o sea se
libera 1 molécula de H2O (agua).
° El carbono 1 y 4 quedan unidos por oxígeno.
° Molécula final puede ser alfa o beta, pero depende de la molécula que
aporta el carbono 1 (izquierda), en el caso de la imagen es alfa.

Características
° Son azúcares sencillo, es decir, fáciles de digerir.
° Podemos obtener de ellos energía rápidamente.
° Abundantes en la dieta, son los más importantes de la leche (lactosa) y de las frutas (sacarosa).
° Al asociarse a alimentos de calidad, se piensa que se puede abusar de ellos, pero no es así : (ejemplo las
frutas al ser sanas se piensa que se puede consumir en gran cantidad, pero tienen gran cantidad de azúcar).

Enlace beta

Polisacáridos
° Unión de muchos monosacáridos.
° Existen dos tipos : Heteropolisacáridos y
° Varían entre más de dos y miles.
Homopolisacáridos.
° Se unen por enlaces O-glucosídicos.
° Tienen pesos moleculares muy elevados.
 Homopolisacáridos Heteropolisacáridos
Distintos tipos de monosacáridos.
Mismos tipos de monosacáridos.
Pueden ser lineal o ramificados.
Pueden ser de forma lineal o ramificada.
Lineal enlace 1-4.
Lineal son enlace 1-4.
Ramificadas enlace 1-6.
Ramificadas son enlace 1-6.
Generan estructuras más
Ej: Glucógeno, Almidón, Celulosa.
complejas.
Lineal Ramificada
Ramificada
Ej: Pared Celular en bacterias.
Lineal

Glucógeno Almidón Celulosa

*Glucógeno : Reserva de energía en animales. Enlace alfa 1-4.

*Almidón : Reserva de glucosa en tejidos vegetal. Enlace alfa 1-4.
*Celulosa : Función estructural. Enlace beta 1-4.

Lípidos
Sustancias insolubles en agua.
No forman polímeros, de por sí son estructuras muy grandes,
pero si se agrupan por interacciones hidrofóbicas.
Hidrofóbica : No se junta con el agua.
Son cadenas de carbono muy largas. Interacción hidrofóbica
 Tipos de Lípidos

1. Ácidos Grasos
2. Triacilgliceroles
3. Isoprenoides
4. Esfingolípidos
5. Esteroides
6. Glicerofosfolípidos o Fosfolípidos

Clasificación de Lípidos

1. Lípidos de Almacenamiento
° Triglicéridos : Poseen de estructura central a un glicerol, que une a 3 ácidos
grasos; cada ácido graso tiene entre 18-32 átomos de carbono. Tiene un
promedio de 60 átomos de Carbono. Por lo que entrega más energía que la
glucosa.

2. Lípidos de Membrana
- Fosfolípidos :
° Glicerofosfolípidos : Poseen de estructura central a un glicerol, que une a 2
ácidos grasos, un grupo fosfato y un alcohol.

° Esfingolípidos : Estructura central a un esfingosina que une a 1 ácido graso,

un grupo fosfato y una colina.

- Glicolípidos :
° Esfingolípidos : Estructura central esfingosina que une a 1 ácido graso más
mono u oligosacáridos.
Ácidos Grasos

Poseen un grupo ácido carboxílico con cadenas hidrocarbonadas de 4 a 34 C.

La cadena no presenta ramificaciones, son cadenas lineales, y en ocasiones, presenta uno o más enlaces
dobles.

Aquellos que poseen enlaces dobles,

poseen características y funciones
distintas.

Ácidos Grasos Saturados Ácidos Grasos Insaturados

No poseen dobles enlaces. Poseen dobles enlaces.
Son cadenas lineales, ordenadas, Desordenados, poseen menor interacciones
hidrofóbicos. hidrofóbicas.
Al tener doble enlace se quiebran o doblan.
 Nomenclatura de ácidos grasos
Su nomenclatura especifica la longitud de la cadena y el número de dobles
enlaces separados por dos puntos.
Aquellos que tienen 0 insaturaciones son sólidos a temperatura ambiente.
Los que no presentan 0 insaturaciones son líquidos a temperatura ambiente.

Nomenclatura delta ()

Los átomos de C se enumeran comenzando del ácido carboxílico (-COOH) ese es el carbono 1.
Si el ácido graso presenta insaturaciones (doble enlace), se especifíca el número del átomo de C donde está
el doble enlace anteponiendo el signo delta.
El doble enlace del COOH, NO es una insaturación.

18:2 (delta 9,12) 20:4 (delta 5,8,11, 14)

Nomenclatura omega

Su nomenclatura depende de la posición del primer doble enlace desde el grupo metilo de la cadena, en vez
del grupo carboxilo.
Solo se indica la primera instauración ; las demás no se nombran ya que en los ácidos grasos las
insaturaciones son cada 3 carbonos.

20:5 (omega -3) 20:4 (omega-6)

 Triacilglicéridos (TAG)
Son moléculas apolares y se componen de glicerol y 3 ácidos grasos.
Tienen como función : la reserva de energía y son almacenados en el tejido
adiposo.
Mayor triacilglicéroles almacenemos mayor el tamaño del adipocito.

Fosfolípidos
Componen la mayor parte de la membrana plasmática.
Está formado por un glicerol, 2 ácidos grasos, 1 grupo fosfato, 1 grupo polar.
Lo que produce que la bicapa tenga una región interna apolar hidrofóbica y
una cabeza polar hidrofílica ; generando una zona polar y otra apolar.
Generando una región anfipática.
Se pueden unir a etanolamina o colina, dando origen a los fosfatidiletanolamina y fosfatidilcolina.

Esfingolípidos
Los esfingolípidos componen gran porcentaje de la membrana celular.
Posee misma estructura de los fosfolípidos, pero se le agrega un grupo de esfingosina, que se caracteriza
por la presencia de un enlace doble y un grupo amino.
A partir de estos, derivan las ceramidas

Esteroides

Son derivados del ciclopentanoperhidrofenantreno.

Entre ellos se encuentra el colesterol, que le otorga rígidez a la
membrana plasmática.
Mientras más colesterol en la membrana, más rigida.
Son precursores de hormonas como el cortisol, testosterona y
estradiol.
Las hormonas esteroidales son insolubles en el plasma y se
transportan unidas a proteínas transportadoras o carrier.
 Prostaglandinas (PGs)

Presenta un anillo de 5 átomos de Carbono, que

originalmente formaba parte del ácido araquidónico, el cual
está presente en la membrana plasmática.
Actúan en tejidos regulando la síntesis del AMPc.
Es el mediador de la acción de varías hormonas, por lo que
las prostaglandinas regulan una amplia gama de funciones
celulares y tisulares.

Ejemplos :
° Algunas afectan el flujo sanguíneo de órganos
específicos, el ciclo sueño-vigilia y la capacidad de
respuesta de ciertos tejidos a hormonas como la
adrenalina y glucagón.
° Otras, elevan la temperatura corporal (fiebre), causan *aspirina inhiba la COX.
inflamación y dolor. *aspirina es anticoagulante

* AMPc = molécula de comunicación intracelular, gatilla señales.

Vitaminas Liposolubles
Son esenciales para el ser humano, pero no somos capaces de sintetizarlas por nuestra cuenta y debemos
obtenerlas de la dieta.
Vitaminas liposolubles : A, D, E y K.
Existen vitaminas que son liposolubles (solubles en lípidos) o hidrosolubles.

Vitamina A
Se obtiene a partir de los beta carotenos.
La ruptura del beta caroteno permite la formación de 2 moléculas de vitamina A (retinol).
Se obtienen por oxidaciones sucesivas : alcohol aldehído á[Link]ílico.
En este caso : retinol aldehído á[Link].
A partir del retinal se sintetiza rodopsina : VISIÓN.
Ácido retinoico participa en la regeneración celular del epitelio.
En alimentos = zanahoria, zapallo, naranja, morrón, mango.
 Vitamina D
También conocido por el nombre de “colecalciferol”.
Ayuda al cuerpo a absorber el calcio, por lo que su déficit puede causar raquitismo, osteoporosis.
Además es utiizada para el movimiento muscular, sinapsis y es indispensable para que el sistema inmunitario
pueda combatir bacterias y los virus que lo atacan.
Se forma en la piel tras la transformación del 7-deshidrocolesterol en Vit D3, por acción de la luz UV.
En alimentos = leche, queso, mantequilla, salmón, huevos, hongos.

Vitamina E

Conocidos por el nombre de tocoferoles.

Se asocian a membranas plasmáticas y depósitos de lípidos y lipoproteínas.
Tienen un rol antioxidante, ya que su anillo aromático reacciona con radicales de oxígeno, evitando la
oxidación de ácidos grasos y previniendo lesiones oxidativas sobre los lípidos de membrana.
En alimentos = aceites vegetales, huevos y germen del trigo.

Vitamina K

Participa en la cascada de coagulación sanguínea.

Por lo tanto, son coagulantes.
En alimentos = verduras verdes, frutos secos, legumbres.

*es por esto que cuando se toman anticoagulantes no se deben

comer estos alimentos.
 Aminoácidos
° Son las unidades monoméricas de las proteínas.
° Sus grupos funcionales principales son los ácidos carboxílicos y las aminas unidos a un mismo átomo
de carbono (carbono a).
° Presentan una cadena variable (radical-R) que le otorga identidad y propiedades fisicoquímicas
particulares a cada aminoácido.
° El carbono a de los aminoácidos es un centro quiral, con la excepción del aminoácido glicina, pues posee
2 H.

*Carbono alfa, es el que une al grupo Carboxílico con

la amina *

Clasificación según grupo Radical (R)

Apolares, Alifáticos

En este caso, las cadenas R son cadenas hidrocarbonadas, o sea

compuestas de Hidrógeno y Carbono.
A excepción de la metionina.
Se caracterizan por ser apolares y la interacción que predomina es la
hidroóbica.

Ejemplos : Glicina, Alanina, Prolina, Valina, Leucina, Metionina, Isoleucina.

 Aromáticos

Son aquellos que están formados por un benceno.

Los anillos aromáticos le confieren una estructura relativamente
apolar, sin embargo hay que considerar el grupo -OH de la tirosina,
que genera puentes de hidrógeno.
El benceno es resonante, sus dobles enlaces no son fijos, se
pueden rotar, siempre estando alternados.

Los aromáticos son capaces de absorber radiaciones electromagnética del espectro ultravioleta, las cuales
se pueden cuantificar.
Poseen gran absorbancia (absorber luz), triptófano es el que más absorbe.

Ejemplos : triptófano, tirosina, fenilalanina.

Polares sin carga

Dentro de su estructura poseen un grupo hidroxilo (OH), un grupo tiol

(SH) y amidas (CONH2).
Son más solubles en agua debido a la presencia de grupos funcionales
capaces de formar puentes de hidrógeno.
Cisteína único aminoácido con grupo tiol (SH), único con capacidad
de crear enlaces disulfuros, lo que hace a una proteína más estable.

Ejemplos : Serina, Treonina, Cisteína, Aparragina, Glutamina.

Polares con carga +

Poseen cadenas R cargadas positivamente, también se les conoce como

básicos, por lo que dependiendo de su pH pueden cambiar su carga al
actuar como dadores/aceptores de protones.
Están compuesto por grupos aminos (NH2), es un grupo básico.
Tienen la capacidad de tomar protones del medio.
Ejemplos : Lisina, Arginina, Histidina.
 Polares con carga -

Poseen ácidos carboxílicos, son ácidos débiles, por lo que suelen

liberar protones al medio y transformarse en base conjugada.
Poseen cadenas R cargadas negativamente, también se les conoce
como ácidos, dependiendo de su pH pueden cambiar su carga al
actuar como dadores/aceptores de protones.

Aminoácidos

Apolar, Alifático
Polar carga +

Polar sin carga Polar carga -

Polar con carga + Apolar, Alifático

Apolar, alifático Aromático

Polar sin carga Aromático

Polar sin carga Polar carga -

Polar sin carga Polar carga +

Apolar, Alifático Polar carga +

Aromático
Polar sin carga
Aromático
Apolar, Alifático
 Clases de Péptidos
Diferentes tipos, de acuerdo a la cantidad de aminoácidos que presenta la estrutura.

° Aminoácido : 1 aminoácido.

° Oligopéptidos : Entre 2-10 residuos (aminoácidos).

° Péptidos : Entre 10-50 residuos (aminoácidos).

° Polipéptidos : Entre 50-100 residuos (aminoácidos).

° Proteínas : Más de 100 residuos (aminoácidos).

*residuos = aminoácidos ; pero es para identificar que están en cadenas.

Cadenas de aminoácidos parten con Nitrógeno libre (NH2) y terminan con grupo Carboxílico (COOH), por
lo que los aminoácidos se generan de un N-terminal hacía el C-terminal.
Aminoácidos están unidos entre sí, por el enlace peptídico.

Enlace Peptídico
Es la unión entre 2 aminoácidos adyacentes, cuando interactúa el ácido carboxílico del primero con el
grupo amino del segundo.
Se forma un enlace covalente a través de una reacción de condensación (libera H2O).
Se formará una amida, lo que convierte al enlace estable.

Características

Este enlace formará una amida, que tiene diferente reactividad.

1. Las amidas no tienen reactividad ácido-base, son polares sin carga.
2. Presentan geometría plana, dada por la resonancia del grupo carbonilo con el nitrógeno.
3. El enlace C-N se comporta como enlace doble, a pesar de ser doble.
 Ionización de los alfa-aminoácidos
Ácido y bases débiles, se encuentran en equilibrio, o sea que, se va formando de la base el ácido conjugado
y del ácido conjugado la base.
Dicho equilibrio se puede desplazar, generando mayor base o mayor ácido conjugado.

Grupo amonio es el ácido conjuado de la

base amino.
grupo amino = base débil.

Base débil capta protones (amino) generando al amonio (ácido conjugado), el cual está cargado positivo.
El equilibrio, significa que la reacción puede ir hacía cualquiera de los 2 lados :
° Aumento cantidad de protones en el medio. equilibrio se desplaza hacia izquierda, hacia el ácido (grupo
amonio).
° Disminuyo cantidad de protones en el medio, equilibrio se desplaza hacia la derecha, hacia la base
(grupo amino).
La concentración de protones (H+) se mide por pH.
Variaciones en el pH, produce variaciones en el equilibrio.

Grupo carboxilo es el ácido, grupo carboxilato

su base conjugada.

[base] A mayor Ka, menor pH

Ka =
[ácido] A menor Ka, mayor pH.

K a = constante de acidez, representa que tan buen ácido es un ácido, cuanto es capaz de
liberar protones al medio.
A mayor valor, se liberan protones, aumentan los protones en el medio; disminuye pH.
A menor valor, capta protones, disminuye protones en el medio; aumenta pH.
 pKa = - log Ka * Valores de pKa = 1-14. pKa = pH

El mejor ácido = Mayor Ka, Menor pKa = más bajo pH.

El peor ácido = Menor Ka, Mayor pka = más alto pH.

* Grupo amino y carboxilo = ácidos

* Grupo carboxilo es un mejor ácido que el amino, ya
que posee pKa más bajo.
Grupo amonio * pH =3, si el medio no tiene ese pH, no funciona de
Grupo carboxilo
manera optima.

pH pKa = equilibrio hacia la derecha, aumentan protones, liberan protones, disminuye pH.
pH pKa = equilibrio hacia la izquierda, disminuyen protones, captan protones, aumenta pH.

pH 3 pH 11

COOH (pka=3) = equilibrio hacía izquierda. COOH (pKa = 3) = equilibrio hacia derecha = COO-
NH3+ (pKa =11) = equilibrio hacía izquierda NH3+ (pKa = 11) = equilibrio hacia derecha = NH2.

pH = 7
COOH (pKa =3) = equilibrio hacia derecha = COO-.
NH3+ (pKa = 11) = equilibrio hacia izquierda = NH3+.
*zwitterión : molécula con misma cantidad de
cargas positivas que negativas.
 pH > pKa = mueve hacía la derecha, libera protones, diminuyendo pH. Especie desprotonada con carga -.
pH < pKa = mueve hacia la izquierda, capta protones, aumentando pH. Especie protonada carga +1

Punto Isoeléctrico
Punto en donde se encuentra “zwitterión”.
Punto isoeléctrico se encuentra entre dos pKa.
Es el pH preciso, donde hay misma cantidad de cargas positivas que negativas.
No es un promedio entre pKa, es la suma entre 2 pKa, donde se encuentra la especie cargada negativo.

* zwitterión = molécula con misma cantidad de cargas positivas que negativas, posee carga neta 0.

Especie Zwitteriónica y Punto Isoeléctrico

pI = 1/2 ( pK1 + pK2)

pI = 1/2 ( 2,34 + 9,60 ) Con 2 pKa
pI = 5,97

Ejercicio
1,0 2,0 4,5 11,0 14,0
pKa 1 = 2,0 -COOH pKa 1 0 - - -
pKa 2 = 4,5 -COOH
pKa 3 = 11,0 -NH3
=
pKa 2 0 0 - -
pI = ? pKa 3 + + + 0
total = + -
0 Zwitterión -
Zwitterión = 2,0 / 4,5 *Se compara si el pKa es mayor o menor a pH.
pI = (2,0 + 4,5)/ 2 *Y al saber cual es mayor se sabe que carga posee.
pI = 3,25
pKa 1 = corresponde a COOH al estar protonada tiene carga
0.
pKa bajo ( menor a 5) = -COOH
pKa 3 = corresponde a NH3, al estar desprotonada su carga
pKa alto (mayor a 5) = -NH3 es 0
 Proteínas
Niveles de Organización estructural
Estructura Primaria
º Secuencia u ordenamiento de los aminoácidos en forma lineal.
º Esta secuencia es única para cada proteína.
º Cada aminoácido está unido entre sí por enlaces peptídicos.
º Aquí se encuentra toda la información para que la proteína se defina posteriormente.
º Se empieza por el extremo N-terminal (NH3+ libre) y termina en extremo C-terminal (COO libre).
º Cada proteína tiene un número de residuos y secuencia característica.
º Hay regiones esenciales esenciales para su función, cuya secuencia se encuentra conservada.
º La estructura primaria puede variar en diferentes especies y dentro de la misma especie entre individuos;
regiones esenciales son iguales.
º Una mutación puntual puede producir un cambio en la secuencia de aminoácidos que resulta en una proteína
defectuosa.
º A partir de esta secuencia se puede predecir la estructura tridimensional de una proteína, su función y
localización celular.
º Permite clasificación de proteínas en familias.
º Detección de motivos (región de la proteína con función particular) relacionados con la función.
º Proteínas con funciones similares tienen fragmentos de secuencias similares.
º Marca de familia, motivos en común para cumplir funciones biológicas iguales o similar.

Estructura Secundaria
º Es la organización espacial (tridimensional) de un polipéptido en un patrón de plegamiento
regular.
º Esta organización se alcanza por la interacción de los átomos de la cadena polipeptídica
mediante enlaces de hidrógeno o puentes de hidrógeno.
º Las estructuras más comunes son las alfa-hélices y beta-plegadas.
º Algunos aminoácidos generan estructuras desordenadas para poder unir las estructuras
(Coiled coil o Loops).
 Alfa-Hélice
Poseen forma de espiral.
Entre grupo amino y grupo carboxilo de aminoácidos diferentes se generan los puentes de
hidrógeno, se encuentran a 4 aminoácidos de distancia.
Puentes de hidrógeno estabilizan la estructura y mantienen la forma.
La generación de los enlaces de hidrógeno, y por tanto la estructura de la alfa-hélice se
repite cada 3,6 aminoácidos o 5,4 armstrongs.
Las cadenas laterales de los aminoácidos quedan orientados hacia el exterior de la hélice.

Beta Plegada
Poseen forma en zig-zag.
Estructura se mantiene estabilizada por la unión de enlaces de hidrógeno entre amino y
carboxilo de dos aminoácidos encontrados uno al lado de la otra.
Los grupos laterales de aminoácidos vecinos apuntan en direcciones opuestas.

Se pueden presentar en dos conformaciones, dependiendo de la dirección de la cadena polipeptídica

(siempre N-terminal a C-terminal).

CONFORMACIÓN ANTIPARALELA CONFORMACIÓN PARALELA

1era hebra es de abajo hacia arriba, 2da de arriba Todas las hebras se generan en el mismo
hacia abajo, 3ra de abajo hacia arriba. sentido.

Ejemplos de antiparalelas :
 Estructura Terciaria
Es la interacción tridimensional que resulta de la interacción de
estructuras secundarias entre sí y el medio.
La abundancia relativa de las estructuras secundarias (alfa, beta o
desordenada) es específica.
La disposición de los residuos de aminoácidos hacía la superficie y el
interior depende de la solubilidad.
Las cadenas laterales polares son las que miran hacia el exterior al
medio acuoso.
Y hacia el interior cadenas laterales apolares.
Se mantiene principalmente por interacciones hidrofóbicas y puentes disulfuro.
Define la función de la proteína.
Organización globular (esfera) en medio acuoso y fibrilar (alargadas), insolubles en agua
(resistencia mecánica).

Estructura Cuaternaria
Son dos o más estructuras terciarias unidas.
Sus subunidades son las estructuras terciarias.
Permite la interacción entre estructuras muy lejanas, generando
estructuras más complejas con sitios funcionales complejos.
Su forma está definida por las interacciones proteína-proteína y
el medio.
Se mantienen estabilizadas por interacciones hidrofóbicas, puentes disulfuro, puentes
de hidrógeno e interacciones electroestáticas (enlaces iónicos).

Homodímero * Terminan en “mero”

Posee 2 estructuras terciarias (dimero)
Son iguales las estructuras terciarias, mismas subunidades (homo)
Ej : SOD 1

Heterotetrámero
Posee 4 estructuras terciarias (tetrámero).
Son distintas estructuras terciarias, diferentes subunidades (hetero).
Ej : Hemoglobina.
 Relación estructura - función de proteínas
Dominio Estructural : Región de una proteína, que es capaz de plegarse de forma
independiente.
ej : Porinas (en bacterias).

Dominio Funcional : Región de una proteína con interés biológico (función biológica). Está
compuesto por varios motivos (funciones específicas de la proteína).
ej : DnaK de [Link].

Características de las Proteínas

° Están formadas de aminoácidos, los cuales se organizan en estructuras cada vez más
complejas.
° La estructura final (3° o 4°) es la que está relacionada con cuya función va a cumplir.
° Es aquella biomolécula con mayor variedad de funciones : estructural, reguladora,
transporte, inmunológico, enzimática.

Clasificación de las Proteínas

1. Globulares 2. Fibrilares o Fibrosas

- Poseen forma de esfera. - Proporcionan soporte mecánico.
- Llevan a cabo la mayoría de las funciones - Son insolubles.
celulares. - Formadas por una unidad repetitiva
- Se degradan fácilmente. simple, que se ensambla para formar
- Son solubles en soluciones acuosas. fibras.
Ej : enzimas y hormonas. Ej : alfa-queratina (pelo) y fibroína
(seda).
 Proteínas Globulares
- Los grupos apolares (hidrofóbicos) se agrupan en el interior de la molécula, mientras que
los polares (hidrofílicos) se disponen hacía el exterior.
- Son moléculas solubles, se pueden movilizar por el medio acuoso.

Ejemplos de proteínas globulares :

Albúmina (proteína globular)

º Es la proteína más abundante en la sangre.
º Proteína de estructura terciaria, que se sintetiza a nivel hepático
(hígado), siendo la principal proteína de la sangre y abundante en el ser
humano.
º La concentración normal en sangre oscila entre 3,5 y 6,0 g/dL y supone
un 54,3% de las proteínas plasmáticas.
º Funciones : Transporte inespecífico de moléculas no solubles en agua, mantiene presión
oncótica, distribución de moléculas liposolubles, hormonas tiroidales, metales, fármacos y
líquidos corporales entre el comportamiento intravascular y extravascular.
* Una disminución de albúmina, significa que hay daño hepático.
* Existe edema cuando la concentración de albúmina es menor a 2 g/dL de sangre, ya
que se pierde la presión oncótica.

Edema = acumulación de líquidos en el intersticio.

 Proteínas Fibrosas
- Son insolubles en agua.
- Los grupos apolares (hidrofóbicos) se agrupan en el exterior de la molécula, mientras
que los polares (hidrofílicos) se disponen hacía el interior.

Ejemplos de proteínas fibrosas :

Queratina Fibroina Colágeno

Colágeno (proteína fibrosa)

º Proteína más abundante de los vertebrados, siendo una proteína extracelular que forma
fibras insolubles que resisten la tensión en estructuras tales como : huesos, diente,
cartílagos, tendones, ligamentos, piel y vasos sanguíneos.
º Consiste en el enrollamiento de 3 hélices (no alfa) y en mamíferos hay 17 cadenas
polipeptídicas diferentes que forman distintos tipos de moléculas de colágeno.
º El colágeno exhibe una secuencia característica (G-X-Y)n, donde X frecuentemente es
prolina, G es glicina e Y es hidroxiprolina. Al asociarse 3 de estas hélices, los residuos de
glicina quedan en el interior permitiendo el contacto íntimo de las hélices.

Queratina (proteína fibrosa)

º Presente en todos los vertebrados superiores (pelo, cuernos, uñas, plumas).
º Son agrupaciones de pares de hélices alfa enrolladas.
º Aparecen entrecruzamientos intercatenarios por puentes de disulfuro que las hacen
insolubles.
º Las queratinas duras (pelo, cuerno, uñas) contienen más disulfuro que las blandas (piel).
 Factores que afectan la estructura de una proteína
Alteraciones en el plegamiento
º Proteína no logra su estructura nativa (estructura normal y
funcional).
º Proteína no cumple su función.
º Genera uniones inespecíficas, se tiende a unir a otras moléculas.
º Suelen ser degradadas o se acumulan en forma patológica.
º Consume recursos celulares (materia y energía).
Ejemplo : Enfermedad de Alzheimer, hay alteración en el plegamiento de la proteína amiloide,
formando depósitos extracelulares : placas amiloides. Las cuales se acumulan en el cerebro.
También produce alteraciones en el citoesqueleto de las neuronas.

Mutaciones
º Proteína no logra su estructura nativa.
º Existen 3 tipos de mutaciones :
- Mutaciones No Patogénicas = No generan alteraciones en las proteínas, proteína sigue
funcional.
- Mutaciones Patogénicas que inducen enfermedades no invasivas = No afectan a todo el
organismo, solo afectan a una región, o genera enfermedades no graves. Generan proteínas
no funcionales o alteran su función.
- Mutaciones Carcinogénicas = Producen cáncer, generan proteínas no funcionales o alteran
su función.
Algunos cáncer tienen origen en :
~ mutaciones en proteínas que controlan velocidad de división celular.
~ mutaciones en factores que regulan expresión de genes.
~ mutaciones que inhiben apoptosis (muerte celular programada).
~ mutaciones que afectan detección de alteración de transcripción.
Cáncer = reproducción descontrolada de células.
 Denaturación
º Alteran la estructura nativa de la proteína.
º En este caso se pierde la estructura terciaria o cuaternaria de
la proteína, solo se mantiene la estructura primaria.
º Puede ser reversible o irreversible; esto depende del grado de
cambios estructurales.
~ Reversible = Proteína puede volver a su conformación nativa (funcional) si el agente
desnaturalizante es removido, proceso conocido como “renaturalización”.
~ Irreversible = La reestructuración puede ser lenta (horas/días) o puede ser totalmente
imposible.

Factores que depende la Denaturación :

° Tipo de Proteína afectada (secuencia aminoacídica) : Hay proteínas que poseen mayor
capacidad de volver a su estructura nativa, se pueden autoplegar; en cambio otras
necesitan chaperonas.

° Tipo de Agente denaturante : Factores que influyen en este proceso, dependiendo de cual
se utilice será más fácil o complicado volver a la estructura nativa.

° Intensidad de Agente denaturante : Concentración en que se utilice el agente, si está

más concentrado más rápido será el proceso.

° Tiempo de Exposición al Agente denaturante : Mientras más tiempo se someta una

proteína al agente más díficil será volver a estructura nativa.

Tipos de Agentes denaturantes :

° Temperatura
° Ultrasonidos (agitación)
° Salinidad del medio
° pH (ácido y bases)
° Agentes Químicos (DTT, urea, mercaptoetanol)

* puede existir mezcla de agentes denaturantes.

 ¿ Cómo actúan agentes denaturantes ?
- Calor = Rompe puentes de hidrógeno e interacciones hidrofóbicas.
- Ácidos y Bases (pH) = Rompe puentes de hidrógeno e interacciones iónicas o salinas.
- Compuestos Orgánicos (elementos químicos) = Rompen interacciones hidrofóbicas.
- Iones Metálicos = Rompe puentes disulfuros.
- Agitación (ultrasonido) = Rompe puentes de hidrógeno e interacciones hidrofóbicas.

A medida que se agregan agentes denaturantes a una proteína funcional, esta pierde su
forma; hay un punto en que se puede volver a la forma nativa y también uno (punto no
retorno) en donde es irreversible.
Cuando están ya todas las proteínas denaturadas estas se agrupan generando interacciones
anormales.

Diferentes
proteínas frente al
Punto 50/50 mismo agente, se
compartan de
i manera distinta.

Punto no retorno

Hidrólisis
Proteína funcional se degrada hasta aminoácidos.
Es ruptura de la estructura primaria.
Ocurre dentro de nuestro organismo : tracto digestivo y en proteosomas.
Hay ruptura química o enzimática de moléculas de proteína en péptidos.
Es un fenómeno irreversible, proteína pierde su estructura y función permanentemente.
 Tipos de Hidrólisis
1. Hidrólisis Química
Se práctica principalmente en laboratorio, se utilizan altas concentraciones de ácidos a
temperaturas altas por mucho tiempo.
Se utiliza HCl 6 M a 110°C por 24 horas o más.
Es un corte inespecífico de aminoácidos.
*excepto el bromuro de cianógeno (BrCN), posee corte específico post metionina.

2. Hidrólisis Enzimática
Ocurre habitualmente en el tracto digestivo.
Poseen cortes específicos, gracias a las proteasas (pepsina, tripsina, quimotripsina).
También ocurre en lisosomas o proteosomas (dentro de la célula).
°Tripsina corta en : Lisina y Arginina (carbono C).
°Quimotripsina corta en : Fenilalanina, triptofano y tirosina (carbono C).
°Pepsina corta en : Fenilalanina, triptofano y tirosina (carbono N).

Regulación Alostérica de Proteínas

º Sitio Funcional : Lugar donde se une ligando (molécula objetivo).

º Sitio Alostérico : Lugar diferente al sitio funcional, genera unión
de molécula distinta a la molécula objetivo (ligando).
Puede ser una regulación : * esto ocurre por
- Activa = Une ligando y cumplir su función. modificaciones
- Inactiva = No es capaz de unir al ligando. tridimensionales
del sitio
funcional.

Regulacion Alostérica : Cambio en la funcionalidad de una proteína (distribución

tridimensional), debido a la unión no covalente de una molécula en un lugar distinto al
sitio funcional (sitio activo). Mínimo deben ser estructuras terciarias.
Que se no covalente, significa que es un proceso reversible.
 Activación Alostérica Inactivación Alostérica

- Sustrato es el ligando. - Es una proteína activa, ya que el

- Sustrato no se puede unir a la enzima sustrato se puede unir sin necesidad de
inactiva, ya que no posee la molécula un cambio tridimensional.
que debe ir en el sitio alostérico - Al unirse el regulador alostérico, genera
(activador alostérico). una modificación tridimensional del sitio
- Una vez que se une el activador al funcional, ahora el sustrato no entra al
sitio alostérico, esto provoca un cambio sitio funcional.
tridimensional en la proteína - Ahora tenemos una proteína inactiva.
permitiendo que el sustrato se una al
sitio funcional, transformadola a una
proteína funcional.

Regulación por Cooperatividad de proteínas

- Solo ocurre en proteínas cuaternarias.
- Corresponde a la regulación a distancia de la unión de un ligando por una subunidad, dada
por el mismo ligando uniéndose a otra subunidad.

- Existen 2 conformaciones :
º Conformación Relajada = Une fácilmente el ligando.
º Conformación Tensa = Es más difícil unir el ligando.
En ambas conformaciones la proteína es capaz de unir al ligando.
El ligando es el que causa el cambio de conformación.
- Existen 2 tipos de Cooperatividad :
º Cooperatividad Positiva = A medida que se une ligando se fomenta la
conformación relajada.
º Cooperatividad Negativa = A medida que se une ligando se fomenta la
conformación tensa.
 Cooperatividad de la Hemoglobina :
Hemoglobina : Proteína que se encuentra dentro de los glóbulos rojos, que ayuda a la
movilización de gases respiratorios.
- La Hemoglobina posee cooperatividad positiva en la unión a oxígeno molecular, con
cooperatividad tensa.
- Unión de oxígeno con Hemoglobina, depende de la concentración del oxígeno (la cual está
dada por la
presión de oxígeno).
- Permite entregar oxígeno a los tejidos periféricos.
- A baja presión de oxígeno, la hemoglobina posee baja unión (afinidad) al oxígeno y lo une
con baja avidez.
* hemoglobina llega a los pulmones, lugar con alta cantidad de oxígeno.
- Cuando 2 subunidades de hemoglobina unen oxígeno se produce la transición a
conformación relajada. Aquí la avidez de la hemoglobina es alta (ocurre en los pulmones).
Cooperatividad en la unión de oxígeno :
Mioglobina = moviliza oxígeno en músculos.
Hemoglobina = transporta oxígeno por el organismo.
Saturación = que cantidad de la proteína está unido con el ligando (oxígeno).
Presión = concentración de oxígeno

Mioglobina está unida con el ligando en su totalidad más rápido que la hemoglobina.
A mayor presión de Oxígeno mayor es la saturación.

Afinidad de la proteína
Se determina al 50% de saturación
° Mioglobina requiere menor presión para llegar al 50%,
se une más rápido al ligando.
* Afinidad de la mioglobina es mayor que la afinidad de la
hemoglobina.
* Afinidad de la hemoglobina aumenta a medida que aumenta la presión de 0xígeno; al
inicio la unión de hemoglobina con oxígeno es lento, pero en el momento que se
cambia de forma tensa a relajada, la hemoglobina se une rápido al oxígeno.
° La cooperatividad positiva se evidencia una gráfica sigmoidea (ej : hemoglobina) (forma
similar a S), en cambio, las que poseen cooperatividad negativa se evidencia una gráfica
hipérbola (ej : mioglobina).
Relación Alostérica de la Hemoglobina :
- Hemoglobina también puede ser regulada alostéricamente.
* Una proteína cuaternaria puede tener regulación alostérica y cooperatividad.
- Hemoglobina posee 2 inhibiciones alostéricas :
1. Inhibición por protones (Efecto Bohr) : Hemoglobina posee 4 sitios
alostéricos para protones, los cuales dependen del pH.

2. 2,3-bifosfoglicerato : Presenta cambios en la conformación de la proteína

hacía su forma inactiva, pierde afinidad con el oxígeno y libera oxígeno. Es lo
que ocurre en tejidos periféricos

Hemoglobina en distintos pH.

- A mayor pH (7,6), mayor afinidad.
- A menor pH (7,2), menor afinidad

Efecto Bohr = efecto de los protones (pH) sobre la afinidad de la hemoglobina por el oxígeno.

Hemoglobina / 2,3-bisfosfoglicerato
- En presencia de 2,3-bisfosfoglicerato, posee
menor afinidad al oxígeno.
- En ausencia de 2,3-bisfosfoglicerato, posee
mayor afinidad al oxígeno.

Mioglobina y Hemoglobina
Ambas movilizan oxígeno.

Mioglobina Hemoglobina
- Capta oxígeno desde la sangre y la retiene - Transporta oxígeno por la sangre, al
en el músculo. interior de los glóbulos rojos.
- Proteína Monomérica (1 subunidad). - Es un tetrámero.
- Estructura Terciaria. - Estructura Cuaternaria.
- Posee regulación alostérica. - Posee regulación por cooperatividad y
- Posee un grupo prostético, grupo Hem, que alostérismo.
fija al oxígeno. - Posee un grupo Hem, por cada
subunidad, en total posee 4 grupos Hem.
 Similitudes :
° Ambas poseen grupos Hem, son hemoproteínas.
° Poseen estructura tridimensional similar, poseen alfas-hélices junto con hebras
desordenadas.
° Son proteínas globulares.

Diferencias :
° Hemoglobina posee mayor tamaño y peso (64,5 kDa) que la mioglobina (17,2 kDa).
° Hemoglobina es un tetrámero, en cambio, la mioglobina un monómero.
° Hemoglobina posee 4 grupos Hem, en cambio, la mioglobina posee 1 grupo Hem.
° Hemoglobina es estructura cuaternaria, en cambio, mioglobia es estructura terciaria.

Diferencia Afinidad por Oxígeno mioglobina y hemoglobina

Mioglobina Hemoglobina
- Gran afinidad por oxígeno. - Afinidad varía según presión de oxígeno.
- Capta rápidamente oxígeno. - Poca cantidad de oxígeno, baja afinidad;
- Libera lentamente el oxígeno dentro tiende a liberar el oxígeno.
de la célula muscular. - Alta cantidad de oxígeno, alta afinidad.
- Permite el intercambio gaseoso.

Intercambio Gaseoso
° Tejido Pulmonar : alta concentración de presión de oxígeno, con pH 7,6. Alta afinidad
de hemoglobina por oxígeno.
° Tejido Periférico : variación en la presión de oxígeno y pH; los cuales dependen de la
tasa metabólica (cuantos procesos realiza órgano o tejido).
- Tasa metabólica alta = baja presión de oxígeno, libera 2,3-BPG, baja pH. Baja
afinidad de hemoglobina por oxígeno, libera oxígeno.
 Bioenergética
Estudio cuantitativo de las diferentes reacciones y cuanta energía descargan en los
diferentes sistemas biológicos.
Estas transformaciones se rigen por las leyes de la TERMODINÁMICA :
1. Principio Conservación de la Energía (energía no se crea ni se destruye, solo se transfiere).
2. Aumento Natural del Desorden.

Energía Libre de Gibbs

Permite predecir la dirección en que se mueve una reacción y cantidad de trabajo que
puede realizar.
Hay 2 tipos de reacciones :
- Reacciones Espontáneas = rx que tiende a ocurrir no necesariamente rápida; van en la
dirección de más baja energía, son sistemas estables.
- Reacción No espontánea

Productos poseen mayor Productos poseen menor

energía que los reactivos. energía que reactivos.

Exergónica = libera energía.

Endergónica = capta energía.

Entalpía (H)
Cantidad de calor presente en una reacción, depende de la cantidad y tipo de enlaces
químicos que hay en reactivos y productos.

H<0 H>0
Reactivo con mayor entalpía que Productos con mayor entalpía que
productos, se libera calor. reactivos, requiere calor.
Reacción exotérmica Reacción endotérmica.
 Entropía (S)
Expresión cuantitativa de la aleatoriedad o del desorden de un sistema.
° Valor Positivo S = ganancia de entropía, productos son menos complejos y más
desordenados que los reactivos.
Estado ordenado = poca entropía.
Estado desordenado = alta entropía.
Estado sólido = ordenado, poca entropía.
Estado gaseoso = desordenado, alta entropía.

Esta reacción posee entropía positiva.

Pasó de 7 moléculas a 12 moléculas, por lo
que hay más espacio y es más desordenado.

Relación de los parámetros termodinámicos

Relación entre G, G° y Keq

G° = variación de la energía libre en condiciones
estándar.
(P=1 atm ; [R] [P]= 1 M ; pH7) valo fijo.
G = variación de energía libre real.

Si está en equilibrio la rx, G = 0 Si la rx es en condiciones fisiológicas (pH = 7)

=
 La dirección en que se desplace una reacción depende de Keq.
° A mayor Keq = hacía los productos (derecha) (-) (espontánea).
° A menor Keq = hacía los reactivos (izquierda) (+) (endergónica).
Si se desplaza hacía la derecha hay mayor concentración de productos.
Si se desplaza hacía la izquierda hay mayor concentración de reactantes.

El valor de Keq, depende de los valores de concentración de productos y reactantes.

Curva de progreso de una reacción química

Es la representación gráfica de la transformación de los reactantes y la formación de los
productos en función del tiempo.
A B
A medida que avanza el tiempo, la cantidad de moléculas
del reactivo se van perdiendo, ya que se van transformando
en producto.

Enzimas
Se encargan de catalizar las reacciones, o sea las aceleran.
Para que aquellas reacciones espontáneas, ocurran a una velocidad compatible con la vida.
Enzimas son en un 99% proteínas (hay algunas que poseen carácter de ARN).
Poseen :
° sitio activo o funcional = lugar donde se une sustrato.
° Complejo enzima-sustrato = sitio activo + sustrato.
Complejo enzima-sustrato genera modificaciones en el sustrato para generar producto,
el cual se libera, quedando enzima libre para generar nueva actividad catalítica.
 Características de las Enzimas
° Aumentan la velocidad de los procesos biológicos que en su ausencia, ocurrirían a un
ritmo incompatible con la vida.
° Alto grado de especificidad por sus sustratos y las reacciones.
° Transforman un grupo pequeño de sustratos o un solo sustrato en productos.
° No modifican la constante de equilibrio (Keq).
° Disminuyen energía de activación.
° Se encuentran a bajas concentraciones.

Energía de activación = energía mínima necesaria para iniciar un determinado proceso.

° Reacción exergónica
° G menor a 0.

Características de la Catálisis
° Aumenta la velocidad de reacción, disminuyendo la energía de activación, así a mayor
número de mléculas que alcanzan el estado intermediario o de transición, la transformación
se acelera.
° Durante la reacción, la enzima se une efectivamente al o los sustratos.
° La reacción puede tener varias etapas, que implica la formación y descomposición de las
especies químicas transitorias llamadas “intermediarios de reacción” (especie química entre
producto y sustrato inicial).
° Los cambios de la molécula durante la unión son efímeros (no son permanentes), la
enzima termina inalterada al final de la catálisis.
 Relación Enzimas / Procesos Bioquímicos
Enzimas permiten que los procesos bioquímicos sean compatibles con la vida, o sea las
aceleran.
Ruta Metabólica :
- Todas las reacciones o pasos, que le requiere al organismo para transformar una
molécula en otra.
- Actúan en secuencias organizadas, catalizan los cientos de reacciones escalonadas que
degradan las moléculas de nutrientes, conservan y transforman la energía química y
sintetizan macromoléculas biológicas a partir de precursores simples.
- Poseen 2 direcciones :
° Dirección para transformar moléculas grandes o complejas a moléculas sencillas.
° Dirección para moléculas pequeñas y transformarlas en moléculas grandes.

Naturaleza de las Enzimas

No todas las enzimas son proteínas.
Hay una pequeña cantidad (1%) de enzimas que son ARN.

Características de la actividad catalítica de las enzimas

° Actividad catalítica depende de la integridad de su conformación nativa.
° Si una enzima se desnaturaliza o disocia en sus subunidades, la actividad catalítica se
pierde.
° Si una enzima se descompone en su componente aminoácidos, su actividad catalítica
siempre se destruye.
° Así, los niveles de estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria son esenciales
para su actividad catalítica.
 Regiones de las Enzimas
° Sitio Activo = lugar donde enzima cumple sus funciones (unir sustrato y transformar
sustrato en producto). Se encuentran 2 regiones de aminoácidos :
- región para unir el sustrato.
- región para transformar sustrato en producto.
En este sitio es donde la enzima logra alterar (disminuye) energía de activación; cambia el
ambiente.
A menudo, el sitio activo encierra el sustrato, aislándolo completamente; fomentando su
cambio a producto.

¿ Qué ocurre en el sitio activo de una enzima ?

Para que exista el cambio de sustrato en producto debe
existir la unión enzima-sustrato.
* complejo enzima-sustrato = unión enzima con sustrato.

Ocurren 2 etapas :
1. Unión del sustrato : se genera complejo enzima-sustrato.
2. Etapa Catalítica : etapa post unión del sustrato, es la etapa de cambio, aquí se
generan los productos.
También es el punto de partida para los tratamientos matemáticos que definen el
comportamiento cinético de reacciones catalizadas por enzimas y para descripciones
teóricas de los mecanismos enzimáticos.

¿ Qué no ocurre en el Sitio Activo de una Enzima ?

No ocurre la formación de enlaces covalentes, la interacción sustrato-sitio activo, se basa
en acercamientos electrónicos dado la información de interacciones intermoleculares.

Complejo Enzima-Sustrato
Enzimas son altamente específicas.
Cada enzima posee un sustrato diferente, por lo cual cada
una genera reacciones diferentes.
Unión Enzima-Sustrato, se puede lograr por 2 formas :
1. Modelo Llave-Cerradura = Enzima posee forma determinada y sustrato encaja
perfectamente en la enzima. Hay reconocimiento
molecular.
2. Modelo Ajuste Inducido = Enzima posee puntos claves de unión, que una vez en
contacto con el sustrato, genera cambio tridimensional
en la enzima, generando el ajusto hacía el sustrato.
Hay reconocimiento molecular dinámico.

Estructuras adicionales de Enzimas

Cofactor = Iones metálicos positivos que entran en contacto con la enzima, para que
entre en función. Son de naturaleza inorgánica.
- Iones metálicos positivos entran en conjunción con enzimas, los cuales son
indispensables para que la enzima tenga actividad biológica.
* Algunas enzimas no necesitan grupos químicos distintos, funcionan solo con su parte
proteíca.

Coenzima = Son de naturaleza orgánica, es proveniente de las vitaminas; enlaces no

covalentes.

- Hay enzimas que necesitan de la unión de una coenzima para que cumpla su función.
- Coenzimas actúan como portadores transitorios de grupos funcionales específicos.
*Grupo Prosteico = igual a las enzimas, pero con enlaces covalentes.
En resumen …
- Enzima puede trabajar sola, con cofactor o con coenzimas.

Clasificación de Enzimas
1. Enzima Simple = Enzima que funciona solo con estructuras proteícas.
2. Enzima Conjugadas = Enzimas que requieren de una estructura adicional.
° Holoenzima = proteína funcional, que posee estructura proteíca “apoenzima” y
posee un grupo adicional (cofactor o coenzima, grupo prosteico).
 Enzima (proteína) Conjugada :
Enzima que requiere la presencia de un grupo adicional para que cumpla su función.

Posee :
° Parte Proteíca = Enzima.
° Grupo Adicional = Cofactor, coenzima, grupo prosteico.
° Sustrato
Enzima + Cofactor = Holoenzima
Parte proteica de enzima = Apoenzima o Apoproteína.

Tipos de Enzimas
1. Oxidoreductasas 2. Transferasas 3. Hidrolasas
Facilitan procesos de Transfieren grupos Facilita proceso de
oxidorreducción. químicos, entre una hidrólisis, rompe enlaces
molécula y otra. con la adición de agua.

4. Liasas 5. Isomerasas 6. Ligasas

Rompe enlaces sin la Transfieren grupos funcionales Generan enlaces
adición de agua. dentro de la misma molécula, mediante ATP.
para generar isómeros.
 ¿ Qué catalizan cada tipo de enzima ?
1. Oxidoredectusas Catalizan reacciones redox, en el que cambia el
estado de oxidación de uno o más átomos, impli
un cambio de cantidad de hidrógenos y oxígeno.
Redox = transferencia de electrones (transferencia de carga) ; ocurre siempre en pares,
algo se oxida y otro se reduce.

2. Transferasas
Transfieren un grupo de una molécula a
otra, molécula donadora a una aceptora.

Ejemplo : Glucosa se le adiciona grupo fosfato.

3. Hidrolasas Genera ruptura de enlaces, por la

presencia de agua.
De una molécula se obtienen 2.

Ejemplo :
Se generaron 2 moléculas.

4. Liasas
Generan ruptura de enlaces, por 2 formas :
° Genera ruptura = de 1 molécula a 2 moléculas (sin
agua).
° En presencia de agua se rompen dobles enlaces.

Ejemplo :

Rompe enlaces sin agua En presencia de agua, rompe enlaces dobles.

5. Isomerasas
Transfieren un grupo de una molécula a otra.
No cambia la estructura base de la molécula, sigue
misma cantidad de átomos.
Ejemplo :

6. Ligasas
Generan enlaces, a partir de la presencia de ATP.
Ejemplo :

Cinética Enzimática
Estudio cuantitativo de la función enzimática, permite comparar como son 2 enzimas.
° Afinidad de la Enzima por el Sustrato = Evaluación de la avidez de la enzima por el
sustrato; que tan rápido se une al sustrato.

° Cantidad de Unidades Enzimáticas Activas = Concentración de enzimas activas.

° Eficiencia Catalítica = Determina cuan eficiente es la catálisis enzimática.

 Velocidad de Reacción
Variación de la concentración, en relación al tiempo; midiendo la desaparición de reactante
o aparición de productos.

A medida que aumenta el tiempo, los reactantes se van a ir

degradando hasta llegar a 0 y productos se van a ir
formando.

El complejo enzima-sustrato es proporcional a la velocidad de una reacción enzimática.

Velocidad de reacción se mide en el proceso de catálisis.

MICHAELIS-MENTEN
Leonor Michaelis y Maude Menten definieron matemáticamente la curva de saturación de
sustrato.
Dicha gráfica es hipérbola; concentración sustrato eje X ; velocidad eje Y.

Vmáx = velocidad máxima, límite de velocidad.

Velocidad de reacción varía según cantidad de sustrato (complejo enzima-sustrato).

Baja S = Baja concentración sustrato, curva aumenta

Velocidad velocidad.
Inicial
Saturante S = Velocidad máxima, no hay enzimas
libres.
* la diferencia entre estas velocidades se explica por la
presencia de enzima libre o completamente saturada con
sustrato.
 BAJA CONCENTRACIÓN DE SUSTRATO
Solo algunas enzimas van a estar unidas al sustrato; pero al no haber sustrato suficiente
algunas enzimas van a quedar libres.
Todo sustrato se encontrará en complejo enzima-sustrato (no hay sustrato libre).
Enzimas se pueden encontrar de 2 maneras : enzima libre o complejo enzima-sustrato.

CONCENTRACIÓN SUSTRATO SATURANTE

Toda enzima está ocupada por sustrato, presente en complejo enzima-sustrato.
Sustrato puede estar libre o en complejo enzima-sustrato (sustrato de sobra).
Estamos en velocidad máxima.

VELOCIDAD MÁXIMA
Toda la enzima forma parte del complejo enzima-sustrato.
La velocidad es proporcional a la formación enzima-sustrato.
No se puede aumentar la concentración enzima-sustrato, la velocidad se hace constante
y no aumenta aunque aumente la concentración de sustrato.
Identifica cuanta enzima activa hay presente.

CONSTANTE MICHAELIS-MENTEN (KM)

Cuanto desaparece de complejo enzima-sustrato.
Indica afinidad de enzima por sustrato.
Posee 3 constantes :
° Constante de Formación : k1.
° Constante de Disociación : k2.
° Constante Catalítica: k3.

Cálculo KM
- Necesita valor Vmáx.
- Es necesario la mitad de la Vmáx, la cual la llevamos
a la gráfica y la hacemos coincidir con concentración
de sustrato (eje X).

Es la concentración de sustrato, para llegar a la mitad de Vmáx.

 KM / Afinidad
- A mayor KM, menor es la afinidad de una enzima.
- A menor KM, mayor es la afinidad de una enzima.

CONSTANTE CATALÍTICA (Kcat)

Es cuanto sustrato se transforma en producto por unidad de tiempo.
Se encuentra presente cuando el complejo enzima-sustrato se transforma en producto.
Posee un valor parecido a Vmáx.
EFICIENCIA CATALÍTICA
Se determina con la constante catalítica dividido por el valor de KM.
Mide la eficiencia de una enzima para catalizar una reacción,
permite comparar 2 enzimas distintas, o una enzima utilizando 2
sustratos distintos.
Para que las enzimas tengas eficiencia distinta deben tener un orden de magnitud
diferente.
*orden de magnitud : 0 más. (Ej : Enzima 1 = 10 ; Enzima 2 = 100) *normalmente se
comparan en potencias, por lo que los exponentes deben ser distintos.

Regraficaciones
Lineweaver-Burk linearizaron la curva hipérbola de saturación de sustrato, a través del
gráfico de dobles recíprocos.
*permite comparar 2
enzimas con mayor
facilidad.

Intercepto = 1/Vmáx ; es donde corta la recta en el eje Y.

-1/KM = Punto de intersección del eje X (siempre está al lado negativo).
Pendiente = KM/Vmáx ; inclinación de la gráfica, determina eficiencia.
 Lineweaver-Burk, permite discriminar más fácilmente cambios de KM o Vmáx de una
enzima, o comparar estos parámetros para diferentes enzimas.
KM
° -1/KM
° Se encuentra en eje X.
° Si la afinidad por el sustrato baja, aumenta KM ; 1/KM posee
un valor menor, se mueve hacía la derecha.
° Si l afinidad por el sustrato aumenta, disminuye Km ; 1/KM
posee un valor mayor, se mueve hacía la izquierda..
Si tenemos más de 1 enzima, aquella que está más lejos de eje Y, posee mayor afinidad
Vmáx
° 1/Vmáx.
° Intercepto.
° Se encuentra en eje Y.
° Si la Vmáx baja, aumenta 1/Vmáx; se desplazará hacía arriba.
° Si la Vmáx aumenta, disminuye 1/Vmáx, se desplazará hacía
abajo.

EJERCICIO :
Vmáx

¿ Cuál enzima tiene mayor Km ?

Respuesta = enzima B.
Vmáx
2 ¿ Cuál posee mayor afinidad por sustrato ?
Km B
Respuesta = enzima A (ya que posee menor Km).
Km A
 Pendientes
B posee menor
B posee menor pendiente pendiente, ya
1/Vmáx

i 1/Vmáx
que está más
cerca eje X

-1 /Km

° Poseen misma afinidad (mismo -1/Km). ° Poseen diferente afinidad. Enzima B

° Poseen distinta Vmáx; B posee mayor Vmáx posee mayor afinidad.
° No poseen misma eficiencia, ya que no ° Poseen distinto Vmáx. B posee
poseen igual pendiente. mayor Vmáx.
B menor pendiente, mayor eficiencia. ° No poseen misma eficiencia, B más
eficiente.
Pendiente menor = mayor eficiencia
Mayor afinidad = menor Km.
Mayor Vmáx es la que está más abajo.

Inhibición Enzimática
Inhibición Irreversible de Enzimas
Inhibición permanente de la función enzimática por unión covalente del inhibidor a la
enzima.
No ocurre en los individuos, ocurre en agentes químicos o externos. (Ej: venenos).

Inhibidor =impide que enzima realice actividad catalítica.

° Modificación Covalente de Residuos Específicos = Mediante compuestos químicos.

ej : PMSF (modifica residuos de serina) , Yodoacetamida (modifica residuos de cisteína)
* si residuos se encuentran en el sitio activo, enzima deja de funcionar y muere.
° Modificación Covalente de Grupos Prostéticos
ej : DMPA (modifica FAD).
SE UTILIZA CON FINES DE INVESTIGACIÓN
 Inhibición Reversible de Enzimas
Consiste en la inhibición de la función enzimática por unión del inhibidor a la enzima, a
través de interacciones no covalentes.
Puede afectar a la etapa de unión enzima-sustrato o a la catálisis, o ambas.
Si ocurre en seres vivos.

° Si se ve afectada catálisis, se ve afectado Vmáx.

° Si se ve afectada enzima-sustrato, se ve afectado Km.
Existen 4 tipos de inhibiciones reversibles :
1. Inhibición Competitiva
- Se produce una competencia entre el sustrato y el inhibidor por unirse a la enzima, ya
que no pueden unirse al mismo tiempo.
- Inhibidor interfiere en la etapa de unión enzima-sustrato.
- Altera valor de Km.

Baja Concentración de Sustrato :

Habrán enzimas unidas a sustratos y otras unidas al inhibidor.
Disminución aparente de la afinidad.
Km aparente aumenta.

Alta Concentración de Sustrato :

Sustrato es capaz de desplazar al inhibidor.
Inhibidor no se puede unir a enzima.
Vmáx es constante (no varía).

Gráfica negro = sin inhibidor.

Gráfica rojo = con inhibidor. Mayor afinidad recta negra.
Sin inhibidor menor Km
Con inhibidor mayor Km
Sin inhibidor mayor afinidad

Vmáx igual Vmáx igual

Km distintos Km distintos
Inhibición competitiva se utiliza en terapia médica para tratar pacientes que han ingerido
metanol, disolvente que se utiliza como anticongelante.
¿Qué pasa si ingerimos metanol? = la enzima que metaboliza metanol, lo convierte en
aldehído, el cual es nocivo.
Enzima que metaboliza metanol, posee competencia con el etanol.
¿Cómo funciona la terapia? = El etanol compite con el metanol por el sitio de unión de la
enzima alcohol deshidrogenasa. El efecto del etanol es muy parecido al de un inhibidor
competitivo, el etanol también es un sustrato; no es nocivo para el cuerpo.

2. Inhibición No Competitiva
Permite la unión de enzima con sustrato, generando complejo enzima-sustrato; pero no
se permite el paso de este complejo a la formación de producto.
Inhibidor interfiere en la etapa catalítica, evita la catálisis.
Existen 2 opciones :
° Enzima se une al sustrato (complejo enzima-sustrato), luego se un inhibidor, por lo
que enzima queda inactiva.
° A la enzima se une primero con el inhibidor, luego se une el sustrato, enzima queda
inactiva.
Baja Concentración de Sustrato
No habrá variación en la afinidad.
Provoca disminución de catálisis.
Km se mantiene constante.

Alta Concentración de Sustrato

Todas las enzimas están unidas a sustratos.
Aquellas que poseen un inhibidor no podrán realizar catálisis.
No transforman complejo enzima-sustrato en producto.
Vmáx disminuye.

Sin inhibidor negro.

Con inhibidor rojo.
Diferentes Vmáx; sin inhibidor mayor Vmáx.
Misma Km.
 3. Inhibición Mixta de Enzimas
Se produce por la unión del inhibidor a un sitio diferente del activo, afectando a afinidad
por el sustrato y la catálisis.
Existen 2 opciones :
° Enzima se une al sustrato formando complejo enzima-sustrato, luego se une inhibidor
dejando a la enzima inactiva, sin generar etapa catalítica.
° Enzima se une al inhibidor, generando modificación del sitio activo, sin poder unir
luego al sustrato, por lo que no se genera complejo enzima-sustrato.

Baja Concentración de sustrato

Depende de quien se une primero a la enzima.
Si puede haber competencia.
La unión primero del inhibidor genera : Km aparente aumente.

Alta Concentración de Sustrato

Todos los sitios activos se encuentran ocupados por sustrato.
Todas enzimas están en complejo enzima-sustrato.
Si se une el inhibidor al complejo enzima-sustrato, no se
genera actividad catalítica.
Dismuye Vmáx.

Vmáx diferentes.
Sin inhibidor posee mayor Vmáx.
Km son diferentes, sin inhibidor posee menor valor Km, por lo que posee mayor afinidad.
 4. Inhibidor Acompetitiva
Se produce por la unión del inhibidor a un sitio diferente del activo, sólo es capaz de
unirse al complejo enzima-sustrato (ES).
Inhibidor se une cuando ya está formado el complejo enzima-sustrato.
Inhibidor interfiere en la etapa de catálisis.

Baja Concentración de Sustrato

No hay Competencia.
Aumento Aparente de la afinidad.
Vmáx disminuye.
Se necesita menos concentración de sustrato para alcanzar
Vmáx.

Alta Concentración de Sustrato

No hay competencia, no hay desplazamiento del inhibidor.
Disminución Vmáx y Km.

Eficiencia catalítica es igual con o sin inhibidor (son rectas paralelas).

Resumen …
 Regulación Enzimática

Regulación = puede mejorar o impedir funcionamiento de una enzima. Puede ser positiva o
negativa.

Tipos de Regulación
1. Modulación por Alosterismo y Cooperatividad.

Cooperatividad =
Cambio en la conformación de una enzima.
° Positiva : Alta avidez por su ligando (relajado).
° Negativa : Baja avidez por su ligando (tenso).
Deber ser enzimas con estructura cuaternaria.
Enzima con baja avidez por sustrato (tenso), al llegar el sustrato a la enzima la modifica
a una cooperatividad relajada.
Va cambiando a las enzimas adyacentes, por lo que la última enzima en unirse al
sustrato tendrá una afinidad por el sustrato mayor que las demás.

- Presenta gráfica sigmoidea (cooperatividad positiva).

- La constante de disociación del complejo enzima-
sustrato es K 0,5 se calcula del mismo modo que Km.
- Al inicio de la reacción hay alta cantidad de
subunidades tensas, con afinidad baja.
Regulación Alostérica =

Ocurre en sitio diferente al sitio activo, se une molécula diferente al sustrato,

generando una variación en la forma del sitio activo.
° Positiva : Enzima y sustrato no encajan, al unir
regulador alostérico +, cambia sitio funcional
permitiendo la unión de enzima sustrato, generando
enzima activa.
Afinidad aumenta, K0,5 menor.

° Negativa : Enzima en forma activa, por lo que se

une su sustrato, pero en la región reguladora se une
una molécula que genera cambio en el sitio activo.
Disminuye afinidad, K0,5 aumenta.

Con regulador alostérico positivo aumenta

afinidad, disminuye K0,5.
Gráfica desplaza hacía la izquierda.

Misma Vmáx.
Varía valor K0,5

Regulador alostérico negativo disminuye afinidad

aumenta K0,5.
Gráfica desplaza hacía la derecha
 2. Regulación de Isoenzimas
Isoenzimas

Enzimas que poseen misma función, pero en diferentes tejidos. Pueden presentar
características físicas, estructurales e inmunológicas diferentes.
Presentan parámetros cinéticos distintos, y reguladas por mecanismos y moléculas
diferentes.

Ejemplo Lactato Deshidrogenasa (LDH) :

Posee 5 isoformas (5 tipos).
Es un tetrámero formado por 2 subunidades
proteicas diferentes : H (heart) y M (muscle).
Enzima que se utiliza para obtener energía. LDH 1 = músculo, corazón, eritrocitos.
Pero hay distintos tipos ya que cada tejido, órgano o LDH 2 = células sistema inmune.
sistema requieren de diferente cantidad de energía. LDH 3 = pulmones.
LDH 4 = riñones, páncreas y placenta.
LDH 5 = hígado y músculo.

3. Regulación por Modificación Covalente Reversible

Se van unir grupo químicos de forma covalente a una enzima. Dicha unión se puede
revertir.
En nuestro organismo existen alrededor de 100 modificaciones covalentes reversibles.

Fosforilación = adición grupo fosfato.

Glicosilación = adición azúcares.
Acetilación = adición grupo acetilo o metilo.
 Características
- La enzima se modifica con la ayuda de una enzima extra, para añadir un grupo químico.
- Para eliminar la modificación también se necesita ayuda de una enzima extra.
*enzima que participa en la adición y la que participa en la remoción son diferentes.

Enzima luego de la unión de grupo funcional se

activó.
Ej : glucógeno fosforilasa es activada por fosforilación.
Quinasas : proteína encargada de fosforilación.

Enzima inactiva unida a grupo fosfato, al perder

el grupo fosfato se convierte en enzima activa.
Ej : glucógeno sintasa es activada por desfosforilación.
Fosfatasas : enzima encargada de desfosforilación.

4. Regulación Covalente Irreversible (Escisión Proteolítica)

Enzima es sintetizada en una forma inactiva (zimógeno), el cual posee una cadena de
péptidos adicional.
Para que el zimógeno inactivo se convierta en activo, debe ocurrir “Escisión Proteolítica”
(rompimiento proteína).

Escisión Proteolítica : eliminación cadena péptidica sobrante.

Catalizado por proteasas.

La ruptura hidrolítica es en una
porción específica de la cadena
polipeptídica.
Proceso común en enzimas digestivas.
 Quimotripsinógeno (proquimotripsina) , se encuentra
inactivo, luego de un proceso de corte de su estructura
se transforma en quimotripsina, forma activa.

Enzimas de Utilidad Clínica

Existe serie de actividades enzimáticas que se miden en el suero (actividad sérica) y que
permiten conoce daños tisulares específicos.

° Isoenzimas = útiles para el diagnóstico clínico debido a que se expresan en forma

tejido específica.

° Marcadores de Daño = sólo se detectan en el suero debido a la destrucción de

tejidos.

Enzimas transaminasas, aspartato aminotransferasa (GOT/AST), alanino aminotransferasa

(GPT/ALT) y la enzima gamma glutamil transferasa (GT), son utilizadas en el diagnóstico
de daño hepático.