QUÍMICA BIOLÓGICA
Hoy vamos a trabajar los siguientes temas:
Introducción a la bioquímica
Laboratorio de bioquímica
Bioenergética
Enzimas
¿Qué estudia la bioquímica?
Bioquímica:
“la química de la vida”
¿Biología + química?
Disciplina que busca comprender los procesos vitales a nivel
molecular en el organismo. Estudia las funciones y los
procesos en que participan las biomoléculas (hidratos de
carbono, lípidos, proteínas, ácidos nucleicos).
Metabolismo: conjunto de reacciones químicas
intracelulares cuya función es mantener la homeostasis en
los seres vivos.
Vía metabólica: conjunto de reacciones químicas sucesivas,
catalizadas por enzimas y ordenadas en una secuencia
definida que llevan a la conversión de un sustrato inicial a un
determinado producto.
E1 E2 E3
A+B C+D E+F G+H
¿Qué estudia
la bioquímica?
¿Cómo se aplica en la práctica?
Centrífuga
Suero
Coágulo
Espectrofotómetro
Resultados de laboratorio
El laboratorio de bioquímica
Debe contar con:
Conexiones de energía eléctrica, gas y agua
Adecuada iluminación y ventilación
Abundantes grifos de agua y gas y enchufes
Piletas amplias y profundas
Campana de extracción de gases
Espacio amplio y cómodo para el desplazamiento
Mesadas amplias de materiales resistentes al calor y a reactivos químicos
Repisas y alacenas para guardar reactivos y aparatos
Botiquín de primeros auxilios
El laboratorio de bioquímica
Elementos de seguridad:
Guardapolvo
Gafas protectoras
Barbijos
Cofias
Guantes
Duchas y lavaojos de emergencia
Matafuegos
Salidas de emergencia
Clasificación de sustancias químicas
El laboratorio de bioquímica
Para trabajar correctamente en el laboratorio se necesita:
Utilizar la vestimenta apropiada
Conocer los sistemas y elementos de seguridad
Mantener limpio y ordenado el lugar de trabajo
Devolver a su lugar cada reactivo, aparato o elemento utilizado al finalizar el
trabajo
Conocer el destino de los distintos residuos que se generan
Leer con atención los rótulos de los reactivos antes de utilizarlos
Saber qué es lo que se va a hacer en el laboratorio
El laboratorio de bioquímica
Clasificación de materiales de laboratorio:
Volumétricos
No volumétricos sin graduaciones
No volumétricos con graduaciones aproximadas
MATERIAL VOLUMÉTRICO
Matraces volumétricos
Probetas
Pipetas (manuales y automáticas)
Buretas
Pipeta
automática
MATERIAL NO VOLUMÉTRICO
Material no volumétrico sin graduaciones
Tubos de ensayo
Material no volumétrico con graduaciones aproximadas
Vasos de precipitados
Balones
Erlenmeyers
OTROS MATERIALES
Gradilla Escobilla Pie universal Mechero Trípode
Rejilla de metal Embudo Varilla Mortero Placas
de Petri
OTROS MATERIALES
Eppendorfs o viales Propipetas
Tubos Falcon Pipeta Tips
Pasteur
EQUIPOS DE LABORATORIO
Balanza
pHmetro
Centrífuga
Espectrofotómetro
→¿Preguntas?
Bioenergética
Principios de la termodinámica
Termodinámica de las reacciones químicas
Sentido de las reacciones químicas
Compuestos de alta energía
Carga energética de una célula
Bioenergética: estudia la transformación y el uso de la
energía en los sistemas biológicos (sistemas abiertos).
Primer principio de la termodinámica: la energía no se
crea ni se destruye sino que se transforma y permanece
constante.
Segundo principio de la termodinámica: la entropía del
universo se incrementa en cada proceso.
Energía libre de Gibbs
Variación de la energía libre (G´)
Variación de la energía libre estándar (G´)
¿REACCIÓN ESPONTÁNEA O NO ESPONTÁNEA?
Progreso de reacción Progreso de reacción
G´ negativo = espontánea G´ positivo = no espontánea
¿REACCIÓN EXERGÓNICA O ENDERGÓNICA?
G’
G’ negativo = exergónica G’ positivo = endergónica
Equilibrio
¿Qué es el equilibrio?
Constante de equilibrio (Keq)
A+B C+D Keq = [C] [D]eq
[A] [B]eq
En el equilibrio G´ = 0
0 = G’+ RT ln [C].[D]eq
[A].[B]eq
G’ = -RT ln Keq
Reacciones acopladas
K1
A + B –––––––––> C G1 = +10 Kcal/mol
K2
C + D –––––––––> E G2 = -30 Kcal/mol
KT
A + B + D –––––––––> E KeqT = Keq1 . Keq2
GT = G1 + G2
GT = [+10 + (-30)] Kcal/mol = -20 Kcal/mol
Hidrólisis de ATP ATP + H2O –––––––––> ADP + Pi G10´= -7,3 Kcal/mol
Fosforilación de la glucosa Glu + Pi –––––––––> G 6-P + H2O G20’= + 3,3
Kcal/mol
__________________________ __________________________
Reacción acoplada ATP + Glu –––––––––> ADP + G 6-P GT0’= - 4,0 Kcal/mol
Reacciones sucesivas
A + B –––––––––> C + D –––––––––> E + F
G´ = G + RT ln [C] [D]
[A] [B]
Isomerasa G6P –––––––––> Fru6P
–––––––––>
G1 ´= + 0,4 Kcal/mol
0
G´ = - 0,6 Kcal/mol
FFQ1 Fru6P + ATP –––––––––> Fru 1,6-biP + ADP
G2 ’= - 3,4 Kcal/mol
0
COMPUESTOS DE ALTA ENERGÍA
Compuestos con grupo fosfato (ATP, PEP, fosfocreatina)
Tioésteres (acetil CoA)
Carga energética
Carga energética = [ATP] + ½ [ADP]
[ATP]+[ADP]+[AMP]
Relación [ATP]
[ADP]
Ecuaciones fundamentales y puntos a recordar
A+B C+D
G´ negativo = espontánea
G´ = G + RT ln [C] [D] G´ positivo = no espontánea
G´ en equilibrio = 0
[A] [B]
G’ negativo = exergónica
G’ = -RT ln Keq G’ positivo = endergónica
Keq = [C] [D]eq
[A] [B]eq
R = 2 cal/°Kmol = 0,002 Kcal/°Kmol
T = 25°C = 298°K
→¿Preguntas?
Actividad práctica
1) Calcular la G’ de la reacción global.
2) Calcular la G’ de la reacción global teniendo en
cuenta las siguientes concentraciones de R y P:
[PEP]= 0,087 mM
[ADP]= 11,52 mM
[piruvato]= 0,022 mM
[ATP]= 1,32mM
Enzimas
Catálisis enzimática
Cinética enzimática
Inhibidores enzimáticos
Regulación enzimática
Aislamiento y purificación de enzimas
Aplicación en la clínica y en la industria
Catálisis enzimática
E + S ↔ ES → E + P
Enzima Sustrato Complejo Enzima Producto
enzima-sustrato
Sitio activo
Estado de
transición
Energía libre
de activación
Clasificación y nomenclatura
[Link]/iubmb/enzyme
Por ejemplo… Malato deshidrogenasa E.C. [Link]
Factores que afectan el funcionamiento de las
enzimas
Coenzimas
Isoenzimas y compartimentalización
Cinética enzimática
Cinética michaeliana
Cinética alostérica
Michaeliana
Alostérica
Dobles recíprocas
Inhibidores enzimáticos
Aplicaciones:
Conocer la forma en que las vías metabólicas se encuentran
reguladas in vivo
Utilizar inhibidores específicos con fines terapéuticos o
agroindustriales
Inhibidores:
Reversibles
Competitivos
No competitivos
Irreversibles
Inhibidores reversibles competitivos
Ejemplos: succinato, fumarato, malonato,
sulfamilamida, glifosato
Inhibidores reversibles no competitivos
Ejemplos: plomo
Inhibidores irreversibles
Ejemplos: penicilina, aspirina, organofosforados
Regulación enzimática
Regulación alostérica
Regulación por modificación covalente
Regulación por inducción o represión génica
Regulación alostérica
Regulación por modificación covalente
Regulación por inducción o represión génica
Aislamiento y purificación de enzimas
Unidades enzimáticas (UE): UE/ml Rendimiento
UE = µmol sustrato/[Link]
Actividad específica (AE): UE/mg Pureza
AE = UE/ml
mg proteínas/ml
Aplicaciones en veterinaria
Las enzimas como herramientas
Diagnóstico de patologías
Tratamiento de patologías
Investigación de nuevos métodos diagnósticos y terapéuticos
Elaboración industrial de alimentos de origen animal
→¿Preguntas?
Actividad práctica
1) Determinar, para cada gráfico de cinética
enzimática por dobles recíprocas, qué tipo de
inhibición enzimática se trata. Completar lo
que indica cada eje.
2) Explicar a través de qué mecanismos se puede
regular una enzima.