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Introducción a la Bioquímica y Enzimas

Este documento presenta una introducción a la bioquímica y cubre varios temas clave como la bioenergética, las enzimas y la aplicación práctica de la bioquímica en el laboratorio. Explica conceptos como la termodinámica de las reacciones bioquímicas, la catálisis enzimática, los tipos de inhibidores enzimáticos y las formas en que se regulan y purifican las enzimas. También describe los equipos y procedimientos de seguridad esenciales para trabajar en un laboratorio

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Introducción a la Bioquímica y Enzimas

Este documento presenta una introducción a la bioquímica y cubre varios temas clave como la bioenergética, las enzimas y la aplicación práctica de la bioquímica en el laboratorio. Explica conceptos como la termodinámica de las reacciones bioquímicas, la catálisis enzimática, los tipos de inhibidores enzimáticos y las formas en que se regulan y purifican las enzimas. También describe los equipos y procedimientos de seguridad esenciales para trabajar en un laboratorio

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QUÍMICA BIOLÓGICA

Hoy vamos a trabajar los siguientes temas:

Introducción a la bioquímica

Laboratorio de bioquímica

Bioenergética

Enzimas
¿Qué estudia la bioquímica?

Bioquímica:
“la química de la vida”
¿Biología + química?
Disciplina que busca comprender los procesos vitales a nivel
molecular en el organismo. Estudia las funciones y los
procesos en que participan las biomoléculas (hidratos de
carbono, lípidos, proteínas, ácidos nucleicos).
Metabolismo: conjunto de reacciones químicas
intracelulares cuya función es mantener la homeostasis en
los seres vivos.

Vía metabólica: conjunto de reacciones químicas sucesivas,


catalizadas por enzimas y ordenadas en una secuencia
definida que llevan a la conversión de un sustrato inicial a un
determinado producto.

E1 E2 E3
A+B C+D E+F G+H
¿Qué estudia
la bioquímica?
¿Cómo se aplica en la práctica?

Centrífuga

Suero

Coágulo
Espectrofotómetro

Resultados de laboratorio
El laboratorio de bioquímica

Debe contar con:


 Conexiones de energía eléctrica, gas y agua
 Adecuada iluminación y ventilación
 Abundantes grifos de agua y gas y enchufes
 Piletas amplias y profundas
 Campana de extracción de gases
 Espacio amplio y cómodo para el desplazamiento
 Mesadas amplias de materiales resistentes al calor y a reactivos químicos
 Repisas y alacenas para guardar reactivos y aparatos
 Botiquín de primeros auxilios
El laboratorio de bioquímica

Elementos de seguridad:
 Guardapolvo
 Gafas protectoras
 Barbijos
 Cofias
 Guantes
 Duchas y lavaojos de emergencia
 Matafuegos
 Salidas de emergencia
Clasificación de sustancias químicas
El laboratorio de bioquímica

Para trabajar correctamente en el laboratorio se necesita:


 Utilizar la vestimenta apropiada
 Conocer los sistemas y elementos de seguridad
 Mantener limpio y ordenado el lugar de trabajo
 Devolver a su lugar cada reactivo, aparato o elemento utilizado al finalizar el
trabajo
 Conocer el destino de los distintos residuos que se generan
 Leer con atención los rótulos de los reactivos antes de utilizarlos
 Saber qué es lo que se va a hacer en el laboratorio
El laboratorio de bioquímica

Clasificación de materiales de laboratorio:

 Volumétricos
 No volumétricos sin graduaciones
 No volumétricos con graduaciones aproximadas
MATERIAL VOLUMÉTRICO

 Matraces volumétricos
 Probetas
 Pipetas (manuales y automáticas)
 Buretas

Pipeta
automática
MATERIAL NO VOLUMÉTRICO

Material no volumétrico sin graduaciones


 Tubos de ensayo

Material no volumétrico con graduaciones aproximadas


 Vasos de precipitados
 Balones
 Erlenmeyers
OTROS MATERIALES

Gradilla Escobilla Pie universal Mechero Trípode

Rejilla de metal Embudo Varilla Mortero Placas


de Petri
OTROS MATERIALES

Eppendorfs o viales Propipetas

Tubos Falcon Pipeta Tips


Pasteur
EQUIPOS DE LABORATORIO

Balanza

pHmetro

Centrífuga

Espectrofotómetro
→¿Preguntas?
Bioenergética

 Principios de la termodinámica
 Termodinámica de las reacciones químicas
 Sentido de las reacciones químicas
 Compuestos de alta energía
 Carga energética de una célula
Bioenergética: estudia la transformación y el uso de la
energía en los sistemas biológicos (sistemas abiertos).

Primer principio de la termodinámica: la energía no se


crea ni se destruye sino que se transforma y permanece
constante.

Segundo principio de la termodinámica: la entropía del


universo se incrementa en cada proceso.
Energía libre de Gibbs

 Variación de la energía libre (G´)


 Variación de la energía libre estándar (G´)
¿REACCIÓN ESPONTÁNEA O NO ESPONTÁNEA?

Progreso de reacción Progreso de reacción

G´ negativo = espontánea G´ positivo = no espontánea


¿REACCIÓN EXERGÓNICA O ENDERGÓNICA?

G’

G’ negativo = exergónica G’ positivo = endergónica


Equilibrio

 ¿Qué es el equilibrio?
 Constante de equilibrio (Keq)

A+B C+D Keq = [C] [D]eq


[A] [B]eq

En el equilibrio G´ = 0
0 = G’+ RT ln [C].[D]eq
[A].[B]eq

G’ = -RT ln Keq


Reacciones acopladas

K1
A + B –––––––––> C G1 = +10 Kcal/mol
K2
C + D –––––––––> E G2 = -30 Kcal/mol
KT
A + B + D –––––––––> E KeqT = Keq1 . Keq2
GT = G1 + G2 
GT = [+10 + (-30)] Kcal/mol = -20 Kcal/mol
Hidrólisis de ATP ATP + H2O –––––––––> ADP + Pi G10´= -7,3 Kcal/mol

Fosforilación de la glucosa Glu + Pi –––––––––> G 6-P + H2O G20’= + 3,3


Kcal/mol
__________________________ __________________________

Reacción acoplada ATP + Glu –––––––––> ADP + G 6-P GT0’= - 4,0 Kcal/mol
Reacciones sucesivas

A + B –––––––––> C + D –––––––––> E + F

G´ = G + RT ln [C] [D]


[A] [B]
Isomerasa G6P –––––––––> Fru6P
–––––––––>
G1 ´= + 0,4 Kcal/mol
0

G´ = - 0,6 Kcal/mol

FFQ1 Fru6P + ATP –––––––––> Fru 1,6-biP + ADP


G2 ’= - 3,4 Kcal/mol
0
COMPUESTOS DE ALTA ENERGÍA

 Compuestos con grupo fosfato (ATP, PEP, fosfocreatina)


 Tioésteres (acetil CoA)
Carga energética

Carga energética = [ATP] + ½ [ADP]


[ATP]+[ADP]+[AMP]

Relación [ATP]
[ADP]
Ecuaciones fundamentales y puntos a recordar
A+B C+D
G´ negativo = espontánea
G´ = G + RT ln [C] [D] G´ positivo = no espontánea
G´ en equilibrio = 0
[A] [B]
G’ negativo = exergónica
G’ = -RT ln Keq G’ positivo = endergónica

Keq = [C] [D]eq


[A] [B]eq

R = 2 cal/°Kmol = 0,002 Kcal/°Kmol


T = 25°C = 298°K
→¿Preguntas?
Actividad práctica

1) Calcular la G’ de la reacción global.


2) Calcular la G’ de la reacción global teniendo en
cuenta las siguientes concentraciones de R y P:
[PEP]= 0,087 mM
[ADP]= 11,52 mM
[piruvato]= 0,022 mM
[ATP]= 1,32mM
Enzimas

 Catálisis enzimática
 Cinética enzimática
 Inhibidores enzimáticos
 Regulación enzimática
 Aislamiento y purificación de enzimas
 Aplicación en la clínica y en la industria
Catálisis enzimática

E + S ↔ ES → E + P
Enzima Sustrato Complejo Enzima Producto
enzima-sustrato
Sitio activo
Estado de
transición

Energía libre
de activación
Clasificación y nomenclatura
[Link]/iubmb/enzyme

Por ejemplo… Malato deshidrogenasa E.C. [Link]


Factores que afectan el funcionamiento de las
enzimas
Coenzimas
Isoenzimas y compartimentalización
Cinética enzimática
Cinética michaeliana
Cinética alostérica
Michaeliana

Alostérica
Dobles recíprocas
Inhibidores enzimáticos

Aplicaciones:

 Conocer la forma en que las vías metabólicas se encuentran


reguladas in vivo
 Utilizar inhibidores específicos con fines terapéuticos o
agroindustriales

Inhibidores:
 Reversibles
Competitivos
No competitivos
 Irreversibles
Inhibidores reversibles competitivos

Ejemplos: succinato, fumarato, malonato,


sulfamilamida, glifosato
Inhibidores reversibles no competitivos

Ejemplos: plomo
Inhibidores irreversibles

Ejemplos: penicilina, aspirina, organofosforados


Regulación enzimática

 Regulación alostérica
 Regulación por modificación covalente
 Regulación por inducción o represión génica
Regulación alostérica
Regulación por modificación covalente
Regulación por inducción o represión génica
Aislamiento y purificación de enzimas

 Unidades enzimáticas (UE): UE/ml Rendimiento


UE = µmol sustrato/[Link]

 Actividad específica (AE): UE/mg Pureza


AE = UE/ml
mg proteínas/ml
Aplicaciones en veterinaria

Las enzimas como herramientas

 Diagnóstico de patologías
 Tratamiento de patologías
 Investigación de nuevos métodos diagnósticos y terapéuticos
 Elaboración industrial de alimentos de origen animal
→¿Preguntas?
Actividad práctica

1) Determinar, para cada gráfico de cinética


enzimática por dobles recíprocas, qué tipo de
inhibición enzimática se trata. Completar lo
que indica cada eje.
2) Explicar a través de qué mecanismos se puede
regular una enzima.

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