INTRODUCCIÓN A LA
BIOLOGÍA
MOLECULAR.
BIOL: NATHALIA GÓMEZ.
■ Los ácidos nucleicos, y el ADN en particular, son macromoléculas
clave en la continuidad de la vida. El ADN lleva la información
hereditaria que se trasmite de padres a hijos y proporciona las
instrucciones sobre cómo (y cuándo) hacer muchas proteínas
necesarias para construir y mantener en funcionamiento células,
tejidos y organismos.
VIRUS.
■ UN VIRUS SIEMPRE VA NECESITAR DE UN
HOSPEDERO Y PARASITAN LAS CÉLULAS PARA
PODER MULTIPLICARSE.
■ SINTETIZAN LAS MOLECULAS QUE IRÁN FORMAR
NUEVOS VIRUS.
TIPOS DE VIRUS:
VIRUS ANIMALES
VIRUS VEGETALES
FORMACIÓN DE VIRUS.
■ CADA VIRUS ES FORMADO POR 2 PARTES:
■ UNA PORCIÓN CENTRAL ( LLEVA LA INFORMACIÓN GENÉTICA)
■ PUEDE LLEVAR FILAMENTO SIMPLE O DOBLE DE ARN O ADN.
■ Los ácidos nucleicos, macromoléculas compuestas de unidades
llamadas nucleótidos, existen de manera natural en dos
variedades: ácido desoxirribonucleico (ADN) y ácido
ribonucleico (ARN). El ADN es el material genético de los
organismos vivos, desde las bacterias unicelulares hasta los
mamíferos multicelulares como tú y yo. Algunos virus usan ARN,
no ADN, como su material genético, pero técnicamente no se
consideran vivos (ya que no pueden reproducirse sin la ayuda de
un hospedero
■ En eucariontes, como plantas y animales, el ADN se encuentra en
el núcleo, una cámara especializada rodeada de membrana
dentro de la célula, así como en ciertos tipos distintos
de organelos (como las mitocondrias y los cloroplastos de las
plantas). En procariontes, como las bacterias, el ADN no está
encerrado en una envoltura membranosa, aunque sí se encuentra
en una región especializada de la célula llamada nucleoide.
DE ADN A ARN A PROTEÍNAS.
■ Muchos genes codifican para productos proteicos, es decir,
indican la secuencia de aminoácidos que es usa para construir
una proteína en particular. Sin embargo, antes de que esta
información se pueda utilizar para la síntesis de proteínas, primero
debe hacerse una copia del gen en ARN (transcrito). Este tipo de
ARN se llama ARN mensajero (ARNm) y sirve como un
mensajero entre el ADN y los ribosomas, las máquinas
moleculares que leen las secuencias de ARNm y que lo utilizan
para sintetizar proteínas. Esta progresión de ADN a ARN a
proteína es lo que se conoce como "dogma central" de la biología
molecular.
NUCLEÓTIDOS.
■ El ADN y el ARN son polímeros (en el caso del ADN, suelen ser
polímeros muy largos) y se componen de monómeros conocidos
como nucleótidos. Cuando estos monómeros se combinan, la
cadena resultante se llama polinucleótido (poli- = "muchos").
■ Cada nucleótido se compone de tres partes: una estructura anular
que contiene nitrógeno llamada base nitrogenada, un azúcar de
cinco carbonos, y al menos un grupo fosfato. La molécula de
azúcar tiene una posición central en el nucleótido, la base se
conecta a uno de sus carbonos y el grupo (o grupos) fosfato
■ Cada nucleótido en el ADN contiene una de cuatro posibles bases nitrogenadas:
adenina (A), guanina (G) citosina (C) y timina (T). La adenina y la guanina
son purinas, lo que significa que sus estructuras contienen dos anillos fusionados
de carbono y nitrógeno. En cambio, la citosina y la timina son pirimidinas y tienen
solo un anillo de carbono y nitrógeno. Los nucleótidos de ARN también pueden
contener bases de adenina, guanina y citosina, pero tienen otra base tipo pirimidina
llamada uracilo (U) en lugar de la timina. Como se muestra en la figura anterior,
cada base tiene una estructura única, con su propio conjunto de grupos
funcionales.
CARACTERÍSTICAS DEL ADN.
■ En el ácido desoxirribonucleico, o ADN, las cadenas se
encuentran normalmente en una doble hélice, una estructura en
la que dos cadenas emparejadas (complementarias) se unen
entre sí, como se muestra en el diagrama de la izquierda. Los
azúcares y los fosfatos se encuentran en el exterior de la hélice y
constituyen el esqueleto del ADN; esta parte de la molécula se
suele llamar esqueleto de azúcar-fosfato. Las bases
nitrogenadas se extienden hacia el interior, en parejas, como los
peldaños de una escalera; las bases de un par se unen entre sí
mediante puentes de hidrógeno.
■
CARACTERÍSTICAS DEL ARN.
■ A diferencia del ADN, el ácido ribonucleico (ARN) generalmente
tiene una sola cadena. El nucleótido de una cadena de ARN
tendrá ribosa (un azúcar de cinco carbonos), una de las cuatro
bases nitrogenadas (A, U, G y C), y un grupo fosfato. Aquí,
veremos los cuatro tipos principales de ARN: el ARN mensajero
(ARNm), el ARN ribosomal (ARNr), el ARN de transferencia
(tRNA) y los ARN regulatorios.
ARN MENSAJERO.
■ El ARN mensajero (ARNm) es un intermediario entre un gen que
codifica proteína y su producto proteico. Si una célula necesita
hacer una proteína en particular, el gen que codifica la proteína se
"activará", lo que significa que una enzima ARN polimerizante
vendrá y hará una copia de ARN, o transcrito, de la secuencia de
ADN del gen. El transcrito contiene la misma información que la
secuencia de ADN de su gen.
■ Sin embargo, en la molécula de ARN, la base T se sustituye por U.
Por ejemplo, si una cadena codificante de ADN tiene la secuencia
5'-AATTGCGC-3 ', la secuencia del ARN correspondiente será 5'-
AAUUGCGC-3'.
■ Una vez que se ha producido un ARNm, este se asociará con un
ribosoma, una máquina molecular que se especializa en la
fabricación de proteínas a partir de aminoácidos. El ribosoma
utiliza la información del ARNm para hacer una proteína con una
secuencia específica cuando "lee" los nucleótidos del ARNm en
grupos de tres (llamados codones) y añade un aminoácido en
particular para cada codón.
ARN
ADN
Involucrado en la síntesis de
proteínas y la regulación
Repositorio de información
Función génica; portador de la
genética
información genética en
algunos virus
Azúcar Desoxirribosa Ribosa
Estructura Hélice doble Generalmente monocatenario
Bases C, T, A, G C, U, A, G
ADN.
■ ÁCIDO DESOXIRRIBO NUCLEICO.
■ Molécula que posee la información genética.
■ Determina la información genética de cada individuo.
■ Es la encargada de transmitir la información de lo que somos a nuestros hijos.
■ La molécula de la herencia.
REPLICACIÓN DEL ADN.
■ LA UNION ENTRE ADENINA Y TIMINA SE DA CON 2 PUENTES DE HIDROGENO.
■ LA UNION ENTRE CITOSINA Y GUANINA SE DA CON 3 PUENTES DE HIDROGENO.
PROCESO DE REPLICACIÓN.
■ La REPLICACION DEL ADN NECESITA MUCHAS ENZIMAS Y UNA GRAN CANTIDAD DE
ENERGIA EN FORMA DE ATP.
■ LA REPLICACION DEL ADN EN EL SER HUMANO ES A UNA VELOCIDAD DE 50
NUCLEÓTIDOS POR SEGUNDO, EN PROCARIOTAS A 500/ SEGUNDO.
■ EL ORIGEN DE LA REPLICACION SE DA CUANDO LAS ENZIMAS HELICASAS ROMPEN
PUENTES DE HIDROGENO.
■ TOPOISOMERASAS ALIVIAN LA TENSION.
■ JUNTO CON LAS PROTEINAS SSB Y GIRASAS.
■ MANTIENEN SEPARADAS LAS CADENAS.
ADN POLIMERASA.
■ Una de las moléculas claves en la replicación del ADN es la enzima ADN
polimerasa. Las ADN polimerasas son responsables de la síntesis de ADN: añaden
nucleótidos uno por uno a la cadena creciente de ADN, e incorporan solo aquellos
que sean complementarios al molde.
■ Siempre necesitan un molde.
■ Solo pueden agregar nucleótidos al extremo 3' de la cadena de ADN.
■ No pueden comenzar una cadena de ADN desde cero, sino que requieren de una
cadena preexistente o segmento corto de nucleótidos llamado cebador.
■ Pueden corregir, o revisar su trabajo, eliminando la gran mayoría de nucleótidos
"equivocados" que se agregan accidentalmente a la cadena
■ La otra cadena nueva, que corre de 5' a 3' y se aleja de la
horquilla, es más difícil. Esta cadena se produce en fragmentos
porque, conforme avanza la horquilla, la ADN polimerasa (que se
aleja de la horquilla) debe separarse y volver a unirse al ADN
recién expuesto. Esta cadena más difícil, que se produce en
fragmentos, se llama cadena rezagada.
■ La topoisomerasa también juega un papel importante de
mantenimiento durante la replicación del ADN. Esta enzima impide
que la doble hélice de ADN que está por delante de la horquilla de
replicación se enrolle demasiado cuando se abre el ADN. Actúa
haciendo mellas temporales en la hélice para liberar la tensión, las
cuales vuelve a sellar para evitar daños permanentes.
■ Por último, se debe hacer un poco de trabajo de limpieza si
queremos que el ADN no contenga ARN ni brechas. La ADN
polimerasa I, la otra polimerasa que participa en la replicación,
elimina los cebadores de ARN y los sustituye por ADN. La
enzima ADN ligasa sella las brechas que permanecen después
de reemplazar los cebadores.
TRANSCRIPCIÓN.
■ La secuencia de ADN de un gen se "vuelve a escribir" en forma
de ARN. En eucariontes como tu y yo, el ARN se procesa (y con
frecuencia se le recortan pedazos) para hacer un producto final
llamado ARN mensajero o ARNm.
REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN
GÉNICA.
LA REGULACIÓN GÉNICA ES EL PROCESO QUE SE
USA PARA CONTROLAR EL MOMENTO, LA UBICACIÓN
Y EL NIVEL DE EXPRESIÓN DE LOS GENES.
■ LA REGULACIÓN GÉNICA PARA QUE UNA CÉLULA
SE CONVIERTA EN UN GLÓBULO ROJO, EN UNA
NEURONA O EN HEPATOCITO EN EL HÍGADO.
■ LA INFORMACIÓN GENÉTICA DE UNA CÉLULA ESTÁ
CONTENIDA EN SU ADN, EL CUAL CONTIENE LA
INFORMACIÓN NECESARIA PARA CREAR
MOLÉCULAS.
TRADUCCIÓN.
■ En esta etapa el ARNm se "decodifica" para construir una proteína
(o un pedazo/subunidad de una proteína) que contiene una serie
de aminoácidos en específico.
■ REGULACIÒN DEL PROCESO DEL ARN.
■ Empalme alternativo
■ La mayoría de las moléculas pre-ARNm tienen secciones que se eliminan de la molécula,
llamadas intrones y secciones que se unen o pegan para hacer el ARNm final,
llamadas exones. Este proceso se llama corte y empalme.
■ En el proceso de corte y empalme alternativo, pueden seleccionarse diferentes porciones
de un ARNm y usarse como exones. Esto permite formar dos (o más) moléculas de ARNm a
partir de un pre-ARNm.
■ Edición del ARN. En algunos casos, la secuencia del ARNm es modificada luego de ser
transcripta. Los cambios incluyen la inserción de nucleótidos en regiones específicas, lo que
motiva un corrimiento en el marco de lectura y genera la expresión de proteínas muy
diferentes.
■ Transporte del ARNm al citoplasma. Para poder ser transportado, el ARNm debe haber
sido procesado correctamente; de lo contrario es degradado en el núcleo
■ Iniciación de la síntesis proteica. El ARNm contiene en sus extremos secuencias que no
son traducidas y que sirven para regular la traducción 5`3`.
■
■ Cuando un gen eucarionte se transcribe en el núcleo, el transcrito primario
(molécula de ARN recién hecha) todavía no se considera un ARN mensajero, sino
que es una molécula “inmadura” llamada pre- ARNm.
■ El pre- ARNm tiene que pasar por algunas modificaciones para convertirse en una
molécula madura de ARNm que puede salir del núcleo y ser traducida. Estas
incluyen el proceso de corte y empalme, donde se puede acelerar, retrasar o alterar
para dar lugar a un producto diferente.
■ Cuando un gen eucarionte se transcribe en el núcleo, el transcrito primario
(molécula de ARN recién hecha) todavía no se considera un ARN mensajero, sino
que es una molécula “inmadura” llamada pre- ARNm.
■ El pre- ARNm tiene que pasar por algunas modificaciones para convertirse en una
molécula madura de ARNm que puede salir del núcleo y ser traducida. Estas
incluyen el proceso de corte y empalme, donde se puede acelerar, retrasar o alterar
para dar lugar a un producto diferente.
CÓDIDO GENÉTICO.
■ Durante la traducción, una célula "lee" la información contenida en
el ARN mensajero (ARNm) y la usa para construir una proteína.
En realidad, y para ser un poco más técnico, un ARNm no siempre
codifica o proporciona las instrucciones para una proteína
completa, sino que podemos decir confiadamente que siempre
codifica para un polipéptido o una cadena de aminoácidos.
■
■ En un ARNm, las instrucciones para construir un polipéptido son
los nucleótidos de ARN (A, U, C, y G), que se leen en grupos de
tres. Estos grupos de tres se conocen como codones.
■ Hay 61 codones para los aminoácidos, y cada uno se "lee" para
especificar un cierto aminoácido de los 20 que se encuentran
comúnmente en las proteínas. Un codon, AUG, especifica el
aminoácido metionina y también actúa como un codón de
inicio para señalar el comienzo de la construcción de la proteína.
■ Hay tres codones más que no especifican aminoácidos.
Estos codones de terminación, UAA, UAG y UGA, le informan a
la célula cuando está completo un polipéptido. En conjunto, esta
colección de relaciones codón-aminoácidos se llama el código
genético , porque permite que las células "decodifiquen" un
ARNm en una cadena de aminoácidos.
PROCESO DE TRADUCCIÓN.
■ ARNs de transferencia (ARNt)
■ Los ARN de transferencia o ARNt, son "puentes" moleculares
que conectan los codones del ARNm con los aminoácidos para los
que codifican. Un extremo de cada ARNt tiene una secuencia de
tres nucleótidos llamada anticodón, que se puede unir a un
codón específico del ARNm. El otro extremo de ARNt lleva el
aminoácido que especifica el codón.
RIBOSOMAS.
■ Los ribosomas son las estructuras donde se construyen los
polipéptidos (proteínas). Se componen de proteínas y ARN (ARN
ribosomal o ARNr). Cada ribosoma tiene dos subunidades, una
grande y una pequeña, que se reúnen alrededor de un ARNm,
algo parecido a las dos mitades de un pan para hamburguesa que
se reúnen alrededor de la torta de carne.
■ El ribosoma proporciona un conjunto de espacios útiles o huecos
donde los ARNt pueden encontrar sus codones correspondientes
en la plantilla del ARNm y entregar sus aminoácidos. Estos
huecos se llaman los sitios A, P y E. Pero además el ribosoma
actúa como una enzima que cataliza la reacción química que une
los aminoácidos para formar una cadena.
PASOS DE TRADUCCIÓN
■ Tus células están fabricando proteínas cada segundo, y cada una
de ellas debe contener el conjunto correcto de aminoácidos
unidos justo en el orden debido. Esto puede sonar como una tarea
difícil, pero por suerte, tus células (junto con las de los demás
animales, plantes y bacterias) están capacitados para ella.
■ Para ver cómo las células hacen las proteínas, vamos a dividir la
traducción en tres etapas: iniciación (el comienzo), elongación (el
agregar a la cadena proteica) y terminación (la finalización).
■ En la iniciación, el ribosoma se ensambla alrededor del ARNm
que se leerá y el primer ARNt (que lleva el aminoácido metionina y
que corresponde al codón de iniciación AUG). Este conjunto,
conocido como complejo de iniciación, se necesita para que
comience la traducción.
■ La elongación es la etapa donde la cadena de aminoácidos
se extiende. En la elongación, el ARNm se lee un codón a la vez,
y el aminoácido que corresponde a cada codón se agrega a la
cadena creciente de proteína.
■ Cada vez que un codón nuevo está expuesto:
■ Un ARNt correspondiente se une al codón
■ La cadena de aminoácidos existente (polipéptido) se une al
aminoácido del ARNt mediante una reacción química.
■ El ARNm se desplaza un codón sobre el ribosoma, lo que
exponde un nuevo codón para que se lea.
■
■ Durante la elongación, los ARNt pasan por los sitios A, P, y E
como se muestra arriba. Este proceso se repite muchas veces
conforme se leen los nuevos codones y se agregan los nuevos
aminoácidos a la cadena.
TERMINACIÓN.
■ La terminación es la etapa donde la cadena polipeptídica
completa es liberada. Comienza cuando un codón de terminación
(UAG, UAA o UGA) entra al ribosoma, lo que dispara una serie de
eventos que separa la cadena de su ARNt y le permite flotar hacia
afuera.
■ Después de la terminación, es posible que el polipéptido todavía
necesite tomar la forma tridimensional correcta, se someta a
procesamiento (tal como el retiro de aminoácidos), sea enviado
a la célula, o se combine con otros polipéptidos antes de que
pueda hacer su trabajo como una proteína funcional.
