UNIDAD 1: ENZIMAS
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Prof. N. Mac Intosh / Prof. C. Viale
ENZIMAS
En los seres vivos se producen reacciones químicas para transformar las sustancias introducidas con los alimentos
con el fin de obtener energía y materia prima para la síntesis de nuevas estructuras moleculares.
Las enzimas tienen una extraordinaria velocidad y eficiencia en estas reacciones químicas y sin ellas la mayor parte
de las reacciones transcurriría muy lentamente o no se produciría en lo absoluto; por otro lado repetirlas en el
laboratorio solo sería posible suministrando calor, pH extremos o grandes presiones, todos ellos incompatibles con
la vida.
Un catalizador es un agente capaz de acelerar una reacción química sin formar parte de los productos finales, ni
degradarse en el proceso; en los medios biológicos se denominan enzimas.
Como todo catalizador, las enzimas actúan disminuyendo la energía de activación de una reacción. En comparación
con los catalizadores inorgánicos son más efectivas, además muestran mayor especificidad ya que solo catalizan una
reacción determinada por ej.: la glucoquinasa, enzima que cataliza una reacción con D-Glucosa y no actúa en
absoluto frente a L-Glucosa.
Características
Actúan óptimamente entre 35° y 40° pues a 65°C se destruyen y a 0°C su actividad es nula.
Son proteínas de alto peso molecular.
Aceleran una reacción química sin intervenir en ella y sin transformación química durante la reacción
Se diferencian de los catalizadores orgánicos e inorgánicos en que tienen especificidad por el sustrato.
Sustrato: es la sustancia sobre la cual actúa la enzima transformándola en producto.
Producto: es la sustancia obtenida después de la reacción química
Nomenclatura y clasificación de las enzimas
Existen distintas formas de nomenclatura:
1. Pueden designarse agregando el sufijo asa al nombre del sustrato sobre el cual actúan por ej.
ENZIMAS SUSTRATO
Amilasa Almidón
Ureasa Urea
Tirosinasa Tirosina
2. También suelen denominarse la enzima según el tipo de reacción catalizada por ej.
• Hidrogenasas: son enzimas que catalizan la sustracción de hidrógenos.
• Descaboxilasas: catalizan la eliminación de un grupo carboxilo del sustrato.
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3. Ciertas enzimas conocidas desde hace mucho tiempo tienen nombres arbitrarios que no siguen
nomenclatura alguna, por ej. Ptialina en la saliva, pepsina del jugo gástrico, tripsina y quimotripsina del jugo
pancreático, etc.
4. La confusión creada por el uso de nombres según distintos criterios llevó a proponer a la Unión Internacional
Bioquímica (IUB) a proponer un sistema de clasificación, con normas para asignar a cada enzima un nombre
descripto y preciso, y también un número que permita ubicarla inequívocamente.
En esta clasificación se consideran 6 clases principales de enzimas según el tipo de reacción que catalizan, cada una
de ellas se divide en subclases y en sub-subclases. El número de código utilizado para identificar a las enzimas consta
de 4 componentes, por ej.
subclase
Orden de la
enzima en la
sub-subclase
Clase principal Sub-subclase
Los 6 grandes grupos que comprende la clasificación internacional son:
1) Oxidorreductadasas: son enzimas que catalizan reacciones de óxido-reducción por ej.
NAD NADHH
LACTATO PIRUVATO
LACTATO
DESHIDROGENASA
NOMBRE SISTEMÁTICO: L- lactato: NAD oxidorreductasa
NOMBRE TRIVIAL: lactato deshidrogenasa
NUMERO DE CÓDIGO: 1.1.1. 27
2) Transferasas: catalizan la transferencia de un grupo de átomos desde un sustrato a otro por ej.
L-ASPARTATO + OXOGLUTARATO OXALACETATO + L-GLUTAMAT O
NOMBRE SISTEMÁTICO: L-aspartato: 2 oxoglutarato aminotransferasa
NOMBRE TRIVIAL: aspartato amino transferasa
NÚMERO DE CÓDIGO: 2.6.1.1
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3) Hidrolasas: catalizan la hidrólisis del sustrato, por ej.:
L- ARGININA + H2O UREA + L-ORNITINA
NOMBRE SISTEMÁTICO: L arginina amidino hidrolasas
NOMBRE TRIVIAL: arginasa
NÚMERO DE CÓDIGO: 3.5.3.1
4) Liasas: catalizan la ruptura de la molécula del sustrato por un proceso distinto al de la hidrolisis por ej: que
divide la fructosa-1,6- bifosfato en dos triosas fosfato.
FRUCTPSA-1,6-BIFOSFATO D-GLICERALDHEIDO-3FOSFATO +
DIHIDROXIACETONA FOSFATO
NOMBRE SISTEMÁTICO: fructosa-1.6-bifosfato-D-gliceraldehido-3-fosfato-liasa
NOMBRE TRIVIAL: fructosa-bifosfato-aldolasa
NOMBRE DE CÓDIGO: 4.1.2.13
5) Isomerasas: incluye a todas las enzimas que catalizan la interconversión de isómeros de cualquier tipo
óptico, geométrico o de posición por ej. Fosfogluco isomerasa que cataliza la interconversión de glucosa-6-
fosfato y fructosa-6-fosfato o bien la fosfotriosa isomerasa.
DIHIDROXI ACETONA FOSGATO D-GLICERALDEHIDO-3-FOSFATO
NOMBRE SISTEMÁTICO: D-gliceraldehido-3-fosfato cetol isomerasa
NOMBRE TRIVIAL: triosa fosfato isomerasa
NÚMERO DE CÓDIGO: 5.3.1.1
6) Ligasas: también llamadas sintetasas catalizan la unión de dos compuestos para formar otro más complejo
por ej. La glutamina sintetasa que actúa en la reacción entre el ácido glutámico y amoníaco para formar
glutamina. La energía es provista por la hidrólisis del ATP (adenosin trifosfato).
L-GLUTAMATO + NH4 + ATP L-GLUTAMINA + ADP +Pi
NOMBRE SISTEMÁTICO: L glutamato: amoníaco ligasa (ATP)
NOMBRE TRIVIAL: glutamina sintetasa
NÚMERO DE CÓDIGO: 6.3.1.2
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Cofactores Enzimáticos
La actividad de algunas enzimas depende solamente de su estructura proteica, mientras que otras necesitan
además uno o más componentes no proteicos llamados cofactores.
Estos pueden ser:
Una molécula llamada coenzima
Algunas necesitan ambos
Un ión metálico (metaloenzima)
Naturaleza química
Algunas enzimas son proteínas simples formadas solo por aminoácidos, por ej.: las hidrolasas.
Muchas están formadas por asociación de varias sub-unidades o cadenas polipeptídica, ósea que son
oligoméricas teniendo importancia fundamental las reacciones mutuas entre las distintas
subunidades.
Hay enzimas que solo pueden realizar su función en asociación con otra molécula no proteica de
tamaño pequeño que se llama coenzima, esta puede estar unida por uniones covalentes u otro tipo
de uniones fuertes formando un complejo que no se separa fácilmente (en este caso algunos
autores prefieren llamarlo grupo protético y reservar el nombre de coenzima para aquellas que se
asocian más laxamente a la proteína)
Las dos porciones proteica y no proteica son indispensables para la actividad de la enzima.
El sistema completo se llama HOLOENZIMA y está formada por una proteína a la que se llama
APOENZIMA y la coenzima que es una molécula no proteica de tamaño relativamente pequeño.
Las Oxidoreductasas, transferasas, isomerasas y ligasas requieren participación de coenzimas. Las coenzimas
intervienen activamente en la reacción experimentando cambios que compensan las transformaciones
sufridas por el sustrato, por ej: las coenzimas de Oxidoreductasas actúan aceptando o cediendo los
hidrógenos o electrones que se quitan o agregan al sustrato.
Si bien siempre participa en un determinado tipo de reacción, una coenzima puede unirse a distintas
apoenzimas y actuar frente a diferentes sustratos, por ej.: la lactato deshidrogenasa, glutamato
deshidrogenasa y otras utilizan NAD que acepta los hidrógenos extraídos al reconocer con precisión al
sustrato y dar especificidad a la holoenzima.
COENZIMAS: son transportadores intermediarios de grupos funcionales, de átomos específicos o de
electrones los cuales son transferidos en la reacción enzimática global. Si estos faltan (coenzimas) la enzima
no actúa.
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Metaloenzimas
Las enzimas que precisan iones metálicos se llaman metaloenzimas y en algunos de ellos el componente
metálico por si solo ya tiene actividad catalítica primaria, incrementada a su vez por la actividad enzimática,
por ej.: la catalasa es una enzima que cataliza la descomposición del agua oxigenada en agua y oxígeno
necesitando un ion férrico, las simples sales de hierro también catalizan esta reacción pero a velocidad
mucho menor. Los iones metálicos pueden actuar en las enzimas que los precisan como catalizadores de las
siguientes maneras:
Centro catalítico primario
Como grupo puente para reunir el sustrato y la enzima formando un complejo de coordinación.
Como agente estabilizante de la conformación de la proteína enzimática en su forma activa
manteniendo su estructura terciaria o cuaternaria.
En todas las metaloenzimas la eliminación del componente metálico lleva a la pérdida de actividad
enzimática.
Ejemplos de este tipo de enzimas:
Mg ++: es requerido por las enzimas que usan ATP como cofactor. La forma activa del ATP es un
complejo ATP-Mg.
Fe +++: catalasas, peroxidasas y citocromos son hemoproteínas en las que el hierro es esencial para su
actividad, etc.
Catálisis enzimática
Las enzimas aumentan la velocidad de reacción disminuyendo la energía de activación. De esta manera
las enzimas pueden aumentar millones de veces la velocidad de una reacción.
Durante el curso de la reacción, la enzima se une efectivamente al o los sustratos, formando un
complejo transitorio. Las modificaciones que puede experimentar la molécula de la enzima durante
dicha unión son pasajeras, ya que aparece inalterada al final de la reacción. Si una enzima ( E) cataliza la
transformación del sustrato (S) en producto (P), primero la enzima y el sustrato se unen formando el
complejo ES el cual luego se disocia en enzima y producto.
Al finalizar la transformación, la enzima aparece sin cambio y puede nuevamente unirse a otra molécula de
sustrato. Ello explica por qué muy pequeñas cantidades de enzima pueden acelerar enormemente la
velocidad de una reacción.
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Sitio catalítico
Para formar el complejo E-S , el S se fija a un lugar definido de la molécula de enzima llamado sitio catalítico,
sitio activo, centro activo o lugar de sustrato y es el responsable de la acción catalítica.
En general, se acepta que el lugar de sustrato posee sitios de unión y un sitio catalítico. El S al fijarse a los
sitios de unión se dispone de manera tal que el enlace a ser modificado en la reacción quede ubicado
exactamente en el sitio catalítico, para ello es indispensable una conformación tridimensional altamente
específicos en el sitio activo con grupos funcionales definidos aportados por las cadenas laterales de restos
de aminoácidos, ordenados espacialmente para que su conformación se mantenga con la disposición
adecuada es necesaria a la contribución de toda su estructura (primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria)
de la proteína.
Hay siempre una gran diferencia de tamaño entre la molécula de la enzima y la del sustrato. Aun cuando el S
sea una macromolécula, la zona esta que experimenta la acción de la E es un segmento pequeño, esto es
debido a que si la E fuese una molécula pequeña sería muy difícil obtener una configuración tridimensional
adaptable a un determinado sustrato y crear un nicho tan precisamente conformado, ósea que si bien el sitio
activo es una porción reducida de la molécula, toda esta colabora en mantenerlo en la disposición adecuada.
Zimógenos
Ciertas enzimas son producidas en forma de precursores inactivos llamados zimógenos, proenzimas o
preenzima la mayoría son proteínas simples que se activan por procesos de hidrólisis por agentes
específicos. Ejemplos de zimógenos son algunos componentes de jugos digestivos que activan al llegar a la
luz del tractogastrointestinal, otros son precursores de factores que intervienen en la coagulación de la
sangre( plasma).
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Factores que modifican la actividad enzimática
1. Concentración de sustrato: si se efectúan determinaciones de la actividad enzimática manteniendo
constantes la concentración de enzimas y las otras condiciones de reacción excepto la concentración
de sustrato y representamos en un sistema de coordenadas, con concentración de sustrato en
abscisas y velocidad de reacción en coordenadas se obtiene una curva de tipo hiperbólico.
Al principio, la actividad aumenta rápidamente con los incrementos de la concentración de sustrato,
pero a niveles elevados del mismo, el incremento de la velocidad se va haciendo más lento
tendiendo a alcanzar un máximo, del cual ya no pasa por más que se incremente el sustrato. Cuando
la concentración de sustrato es baja la actividad aumenta en forma lineal al aumentar la
concentración del mismo, en este sector de la curva existe proporcionalidad entre velocidad de
reacción y concentración de sustrato, a medida que aumenta esta los incrementos de velocidad son
cada vez menores y finalmente no hay más sustrato, a medida que aumenta esta los incrementos de
velocidad son cada vez menores y finalmente no hay más aumento de la actividad por más que se
eleve la concentración de sustrato. La curva tiende a una horizontal que corresponde a la velocidad
máxima.
La unión de la enzima al sustrato es una reacción reversible, que ocurre rápidamente, luego el
complejo se disocia en una reacción más lenta y libera la enzima y el o los productos. A
concentraciones muy bajas de sustrato parte de las moléculas de E estarán libre, cuando aumenta el
S más moléculas de E van siendo ocupadas para formar E-S. Si sigue creciendo la concentración de S
llega un momento en el cual prácticamente las moléculas de E están todas ocupadas, se dice que la
E se ha saturado con sustrato. Si la concentración sigue aumentando y excede largamente a la E se
alcanza un estado estacionario en el que la velocidad de reacción no varía.
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2. Temperatura: dentro de ciertos límites como consecuencia del incremento en la energía cinética, la
velocidad de una reacción química aumenta cuando la temperatura asciende. La velocidad de
muchas reacciones biológicas se duplica por cada 10 °C de aumento de temperatura.
Si se mantienen constantes las concentraciones de E, S y otros factores, y determinamos la actividad
a temperaturas crecientes se obtiene un aumento de actividad, pero se llega a un valor máximo, que
corresponde a la temperatura óptima. Por encima de esta la actividad cae rápidamente. La gran
mayoría de enzimas de animales homeotermos, la T° óptima esta alrededor de 37° C y la actividad
cae bruscamente a mayor T°, este efecto inactivan te a T° mayores a 40° C se debe a la acción del
calor sobre la estructura molecular de la E que se desnaturaliza (pierde su estructura
tridimensional).
T° optima
3. pH: los cambios de pH del medio afectan el estado de ionización de ciertos grupos funcionales en la
molécula de la E y del S. Para que se realice la unión, en el complejo E-S se necesita una adecuada
distribución de cargas en ambas moléculas. El pH óptimo es aquel en el cual ciertos grupos
esenciales poseen la carga apropiada para asegurar la formación del complejo E-S.
Si medimos la actividad enzimática a distintos pH manteniendo contantes todos los otros factores
obtenemos el gráfico del costado.
Para la mayoría de las E, la actividad óptima es pH 6-8, por debajo o encima la velocidad de reacción
cae más o menos rápidamente. Pero hay algunas excepciones, por ej.: la pepsina del jugo gástrico
tiene un pH óptimo de 1,5. La tripsina tiene su mayor actividad a pH 7-8 y la fosfatasa alcalina de los
huesos tiene una actividad máxima a pH 9,5.
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4. Tiempo: esta curva muestra la variación a lo largo del tiempo de los distintos participantes de estas
reacciones.
Inhibidores enzimáticos
Existen sustancias que inhiben la acción catalítica de las enzimas ya sea uniéndose a sitios o grupos
funcionales esenciales de la molécula de E.
La inhibición puede ser reversible o irreversible.
Inhibidores irreversibles: son aquellas sustancias que producen un cambio permanente en
la molécula de E que produce un deterioro definitivo en su capacidad catalítica por ej.: los
venenos organofosforados producen una inhibición irreversible de la acetil-colinesteras,
enzima muy importante para la función del Sistema Nervioso Central.
Inhibidores reversibles: la inhibición reversible puede ser de tres tipos: competitiva, no
competitiva y acompetitiva.
✓ Inhibidores competitivos: en algunos casos el inhibidor presenta similitud
estructural con el S y ambos compiten por el sitio activo de la E.
En otros casos, algunas moléculas actúan uniéndose al sitio activo de la E a pesar de
no tener semejanza estructural con el S.
Una característica de los Inhibidores competitivos está dada por el hecho de que
puede ser revertida por el aumento de la concentración de S, si este predomina en
la mezcla, tiende a desplazar al I de su unión con la E.
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Las reacciones que ocurren en presencia de un inhibidor competitivo pueden
representarse de la siguiente forma:
I y S solo pueden unirse con la E libre ya que se excluyen mutuamente. El resultado
aparente es como si la E tuviese una disminución de afinidad por el S.
✓ Inhibidores no competitivos: son compuestos que se unen a la E en un lugar de la
molécula distinto al sitio activo y provocan una disminución de la velocidad máxima.
Este tipo de inhibición no puede ser revertida por el aumento de la concentración
de S.
Las reacciones pueden representarse con las siguientes ecuaciones:
La unión del S con la E no está afectada y el I se une ya sea con la E libre o con el
complejo E-S .Una vez formado el complejo E-S-I la E se inactiva por lo tanto la
cantidad de E-S con posibilidad de liberar el producto se reduce y el resultado final
es semejante al que se obtendría con menos E en el medio
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Regulación
El funcionamiento de las distintas vías metabólicas exige una delicada regulación. Así el sistema nervioso y el sistema
endocrino cumplen este papel al asegurar el funcionamiento armónico del organismo. Como todas las reacciones
químicas son catalizadas por E, la regulación es alcanzada modulando la velocidad de reacción específica, usando
sustancias de bajo peso molecular que actúan como efectores alostéricos.
Hay ciertas E claves en una vía metabólica cuya actividad puede ser modulada por estos efectores. Cambios en la
concentración de sustrato, coenzimas, productos intermediarios o finales, etc., pueden afectar la actividad de una E,
ya sea activándola o inhibiéndola.
Un tipo muy común de regulación es la retroalimentación (feed-back) que puede ejemplificarse así: el producto final
actúa como inhibidor de la enzima (1) de esta forma cuando se a producido suficiente cantidad del producto, este
puede detener su propia producción evitando que nuevas moléculas de A se conviertan en B. La misma enzima
podría ser activada en presencia de otra molécula actuando como efector alostéricos positivo.
En vías ramificadas que se diversifican para obtener 2 o más metabolitos esenciales, cada producto final puede
actuar como efector alostéricos negativo de enzimas que en los puntos de ramificación inician el camino de síntesis
de ese producto particular.
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Modificación covalente: hay E reguladoras por agregado o sustracción de grupos unidos covalentemente por ej.: la
fosforilasa enzima que inicia la degradación del glucógeno, está en estado de reposo o baja actividad (fosforilasa a )
por adición de restos fosfato, de la misma forma la eliminación de estos fosfatos la vuelven activa nuevamente.
Metabolismo
Se llama así a las reacciones químicas que tienen lugar en el seno de los tejidos. Llamamos metabolismo intermedio
a las transformaciones químicas dentro de las células y a las reacciones que ocurren en el proceso de digestión
previo a la absorción se llama pre metabólicas.
El metabolismo intermedio abarca muchos procesos, algunos contribuyen a la degradación de sustancias con
producción final de energía y desechos, mientras que otros usan esa energía para síntesis de estructuras. Los
procesos degradativos corresponden al catabolismo y los de biosíntesis al anabolismo.
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Los procesos degradativos catabólicos tienen naturaleza oxidativa y los anabólicos son reductivos. Ambos usan
coenzimas como aceptoras de hidrógeno siendo en las etapas oxidativas el NAD el principal agente de transferencia
de equivalentes de reducción y en el anabolismo es el NADPH, el proveedor de hidrógenos para síntesis.
En el catabolismo se requiere ADP, el cual se fosforila y ATP, en cambio en el anabolismo hay reacciones
endergónicas que usan ATP y producen ADP y Pi.
Bibliografía
1. Feduchi. Bioquímica conceptos esenciales. 2° Edición 2015, Editorial Médica Panamericana
2. Blanco A, Blanco G. Química Biológica, 10° Edición2017, Editorial El Ateneo.
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