"La fagoterapia en acuicultura.
Antecedentes
previos y su implementación en cultivos
larvales marinos en Chile."
Benjamín Cortés, Kiea Icka, Jeremy Vergara & Tomás Fredes.
Enfermedades, Departamento de Biología Marina, Universidad Católica del Norte,
Coquimbo, Chile.
Resumen:
La acuicultura en Chile es una actividad económica relevante y dinámica, que produce
diversas especies acuáticas de alto valor comercial. No obstante, la acuicultura se ve
amenazada por enfermedades que afectan la salud y el rendimiento de los organismos
cultivados; entre ellas, la vibriosis es una de las infecciones bacterianas más frecuentes,
sobre todo en las fases larvarias. La fagoterapia surge como una alternativa prometedora,
basada en el uso de bacteriófagos para el control de bacterias patógenas, debido a su
capacidad de infectar y destruir a las bacterias huéspedes específicas. La fagoterapia
podría ser una herramienta eficiente para el control de enfermedades bacterianas en la
acuicultura, pero todavía se enfrenta a varios retos para su aplicación. Entre ellos, se
encuentran la selección y caracterización de fagos apropiados, la evaluación de su
seguridad y eficacia, la optimización de las dosis y las formas de administración, y la
regulación legal y ética de su uso. Se necesita más investigación y colaboración entre los
diferentes actores involucrados para superar estos desafíos y aprovechar las ventajas de la
fagoterapia en la acuicultura sostenible.
Palabras clave: Bacteriofagos, Fagoterapia, Chile, Acuicultura, Resistencia a antibióticos,
Antibióticos.
Abstract:
Aquaculture in Chile is a relevant and dynamic economic activity that produces various
aquatic species of high commercial value. However, aquaculture is threatened by diseases
that affect the health and yield of cultured organisms; among them, vibriosis is one of the
most frequent bacterial infections, especially in the larval stages. Phage therapy emerges as
a promising alternative, based on the use of bacteriophages for the control of pathogenic
bacteria, due to their ability to infect and destroy specific host bacteria. Phage therapy could
be an efficient tool for the control of bacterial diseases in aquaculture, but it still faces
several challenges for its application. Among them are the selection and characterization of
appropriate phages, evaluation of their safety and efficacy, optimization of dosages and
forms of administration, and legal and ethical regulation of their use. More research and
collaboration between the different stakeholders is needed to overcome these challenges
and to take advantage of the benefits of phage therapy in sustainable aquaculture.
Key words: Bacteriophages, Phage therapy, Chile, Aquaculture, Antibiotic resistance,
Antibiotics.
Introducción
Las enfermedades causadas por bacterias son la principal causa de la alta mortalidad de los
peces y de grandes pérdidas económicas en la acuicultura. Los antibióticos se han utilizado
principalmente con fines terapéuticos y profilácticos en esta industria (Vaseeharan & Thaya,
2014). Sin embargo, los antibióticos pueden ingresar al medio ambiente a través de la
lixiviación de los alimentos no consumidos y la excreción de residuos con el estiércol, ya
que los antibióticos se administran principalmente a través del alimento recubierto
(Robinson et al., 2007). Hasta donde se tiene conocimiento, los restos de componentes
antibióticos y la propagación de genes de resistencia a los antibióticos (ARG) son comunes
en la acuicultura y representan riesgos significativos para la salud (Fang et al., 2019; Gao et
al., 2018; Guo et al., 2019; Han et al. 2020). Además, los antibióticos de amplio espectro
pueden poner en peligro los microorganismos autóctonos y la microbiota beneficiosa.
Estudios recientes han demostrado que la adición de antibióticos, incluso en dosis por
debajo de las aprobadas por la FDA, puede tener un impacto irreversible en la diversidad y
estructura de la comunidad de microorganismos intestinales de los peces (Saenz et al.
2019). En los últimos años, se han producido avances en las alternativas a los antibióticos
para el control de enfermedades en peces. Se han llevado a cabo pruebas con algunas
vacunas innovadoras en la acuicultura (Vinay et al. 2018; Yan et al. 2021; Zhang et al.
2021a), y se está llevando a cabo una vacunación a gran escala en salmónidos en
particular, con resultados prometedores. Sin embargo, debido a la complejidad de los
patógenos y las dificultades de la administración de vacunas en la acuicultura (Micoli et al.
2021), la vacunación sigue siendo un tema de debate.
Los probióticos, que son aditivos alimentarios microbianos vivos que regulan la homeostasis
intestinal del huésped (Fuller, 1989), parecen ser una opción eficaz de control biológico
debido a su capacidad para afectar positivamente la actividad metabólica del huésped y
aumentar su resistencia a los patógenos (Dawood et al., 2019). No obstante, superar la
rápida colonización y proliferación de probióticos en un entorno específico ha sido un
desafío debido a la competencia por nichos y nutrientes con otras comunidades microbianas
presentes en el entorno (Van Hien et al., 2021). Estos obstáculos, en conjunto con el
creciente problema de la resistencia a los antibióticos, han generado la necesidad de
aprender, explorar alternativas novedosas y eficientes a los antibióticos en la acuicultura.
Los bacteriofagos (fagos), son los organismos más abundantes del planeta (Suttle, 2007),
son conocidos por su capacidad natural para matar bacterias (Domingo, & Delgado, 2018).
El método de biocontrol basado en fagos, también conocido como terapia con fagos, se
destaca por su alta eficiencia, especificidad y respeto al medio ambiente (Choudhury et al.,
2017; Sieiro et al., 2020) y se ha convertido gradualmente en una alternativa importante en
la era post-antibióticos (Altamirano & Barr, 2019). En la actualidad, se ha investigado
ampliamente la terapia con fagos en medicina (Onsea et al., 2019; Ooi et al., 2019),
agricultura (Kahn et al., 2019; Svircev et al., 2018), alimentación (Clavijo et al. 2019 ; Luiz
Vaz et al. 2020) y en el ámbito ambiental (Ayyaru et al. 2018; Sun et al. 2019).
De manera similar, la terapia con fagos tiene un gran potencial en la acuicultura para
combatir bacterias patógenas (Le y Kurtboke 2019). Cabe destacar, que esta terapia no es
nueva, lleva más de 100 años desde su descubrimiento y el 2017 se cumplió el centenario
de la publicación del microbiólogo francés Felix D’Herellé (Gordillo & Barr, 2019).
Fig 1. Diagráma temporal del interés, búsqueda y uso de fagoterapia y antibióticos.
En los últimos tiempos, se han registrado numerosos casos exitosos de terapia con fagos
en acuicultura, tanto con fines preventivos como terapéuticos. Estos casos han utilizado
fagos específicos dirigidos a diferentes especies bacterianas, como Vibrio sp. Va-F3 (Chen
et al. 2019), Vibrio coralliilyticus (Chen et al. 2019; Kim et al. 2019a), Vibrio alginolyticus
(Tuan Son et al. 2020), Pseudomonas aeruginosa (Cafora et al. 2019), Aeromonas
hydrophila (Cao et al. 2020; Tuan Son et al. 2018) y Flavobacterium columnare (Laanto et
al. 2015), así como otros patógenos que afectan a los peces. Sin embargo, el uso de la
fagoterapia también se ha extendido a otras prácticas de la acuicultura, como el cultivo de
crustáceos (Karunasagar et al., 2007; Borrego & Lanzas, 2022), el control de patógenos en
moluscos y como agentes de depuración en las aguas de cultivo. El presente trabajo tiene
como objetivo investigar y evaluar el potencial de la fagoterapia como una estrategia
eficiente y segura para el control de enfermedades en la acuicultura chilena.
Marco Teórico
Antecedentes
Es posible utilizarla en la acuicultura, suministrando en forma aislada o como “cocktails” los
fagos para mejorar la sanidad de los animales y la salubridad alimentaria.
Existen diversos estudios para los que se ha aplicado la fagoterapia para patógenos tales
como: Streptococcus agalactiae, Edwardsiella tarda y E. ictaluri, Aeromonas hydrophila y A.
salmonicida, Tenacibaculum maritimum, Pseudomonas plecoglossicida, Flavobacterium
columnare y F. psychrophilum, Lactococcus garviae, Vibrio anguillarum y V. spendidus.
Los bacteriófagos han aportado una serie de descubrimientos y herramientas moleculares
como enzimas fágicas, incluyendo: ligasas, nucleasas, endolisinas, polimerasas (Borrego &
Lanzas, 2022).
Fig 2.Vías de administración de fagos en Acuicultura
Se comenzó con foco en patologías de cultivo de peces, pero se ha extendido a otras
prácticas como cultivo de crustáceos, control de patógenos en moluscos e incluso como
agente depurador de aguas de cultivo (Borrego & Lanzas, 2022)
Fig 3. Cronograma principales hitos de fagoterapia en Acuicultura.
Bacteriofagos y Fagoterapia
Virus que infecta a las bacterias. Como otros tipos de virus, los bacteriófagos varían mucho
en su forma y material genético. Los genomas de fagos pueden constar de ADN o ARN. La
cápside de un bacteriófago puede ser icosaédrica, filamentosa o en forma cabeza-cola y se
estima que existen 1010 fagos por cada Litro de agua de mar, lo que representa un excelente
mecanismo de control de bacterias marinas (Ronda et al., 2016)
Fig 4. Morfología del fago.
Estos virus pueden estar actuando en dos ciclos; ciclo lítico y lisogénico.
Ciclo lítico: el bacteriofago replica su material genético en el cromosoma de la bacteria para
posteriormente provocar lisis celular, causada por las enzimas lisinas capaces de digerir el
peptidoglicano bacteriano dañando su pared celular. Importante utilizar virus con este ciclo
para aplicar fagoterapia y obtener un resultado exitoso.
Las etapas del ciclo lítico son: (Khan Academy, 2023)
● Fijación: las proteínas en la cola del fago se unen a un receptor específico (en este
caso, un transportador de azúcar) en la superficie de la célula bacteriana.
● Penetración: el fago inyecta su genoma de ADN bicatenario dentro del citoplasma de
la bacteria.
● Copia del ADN y síntesis de proteínas: se copia el ADN del fago y los genes del fago
se expresan para hacer proteínas, como las proteínas de la cápside.
● Ensamblaje del nuevo fago: las cápsides se ensamblan a partir de las proteínas de
la cápside y se rellenan con ADN para hacer nuevas partículas de fago.
● Lisis: en las últimas etapas del ciclo lítico, el fago expresa los genes para las
proteínas que hacen agujeros en la membrana plasmática y la pared celular. Los
agujeros dejan que entre agua, y hacen que la célula se expanda y se lise.
Fig 5. Diagrama mecanismos de acción del fago. Ciclos lítico y lisogénico.
Ciclo lisogénico: el bacteriofago inserta el profago o genoma en en el cromosoma de la
célula hospedera, que al replicarse produce células infectadas.
Este tipo de fagos debe ser descartado en el uso como agentes terapéuticos ya que no
pueden producir una lisis rápida ni un crecimiento exponencial en cantidades necesarias
para conseguir una eficacia total.
Los bacteriófagos son virus que se especializan en infectar y destruir bacterias. La
fagoterapia consiste en utilizar estos virus como agentes terapéuticos para combatir las
infecciones bacterianas. Esta terapia podría ser una opción prometedora frente al
problema de la resistencia a los antibióticos, que dificulta el tratamiento de muchas
enfermedades infecciosas (Domingo & Delgado, 2018).
Ventajas y Desventajas
Ventajas o fortalezas Desventajas o limitaciones
1. Los fagos se consideran 1. La aplicación de fagos requiere la
omnipresentes, de forma natural y identificación exacta de las especies
abundante. Por lo tanto, pueden ser bacterianas que causan la infección
considerados como orgánicos.
Entonces, puede haber menos
problemas para obtener la
aprobación regulatoria para su uso.
2. Los fagos por lo general son 2. La resistencia bacteriana a los fagos es
específicos de una sola especie o una de las principales limitaciones para la
incluso cepas de bacterias aplicación de fagos.
patógenas, no dañan la flora
microbiana intestinal normal y de
forma natural bacterias no dirigidas.
Los fagos pueden ser usados contra
bacterias patogénicas Gram-positiva
así como Gram-negativa.
3. Los fagos son fáciles de aislar y 3. Es necesario evaluar la aceptación del
propagar, ya que se autorreplican. consumidor a los productos tratados con
Además tiene un impacto limitado fagos
en el medio ambiente ya que se
autolimita. Su replicación es de
forma exponencial como bacterias y
disminuye cuando baja el número
de ellas.
4. Los fagos tienen una gran 4. Se requieren las aprobaciones
resistencia a las condiciones reglamentarias adecuadas antes de aplicar
ambientales, ya que los fagos y los fagos para controlar las bacterias
bacterias hospederas se encuentran patógenas en la acuicultura.
en el mismo entorno, lo que indica
su capacidad para sobrevivir en el
mismo ambiente.
5. A diferencia de los antibióticos, las 5. La conversión lisogénica del fago es la
bacterias tienen menos resistencia a mayor amenaza para la terapia de fagos.
los fagos. Aunque hay informes Existen reportes sobre la virulencia de
sobre bacterias resistentes a fagos, patógenos bacterianos inducidos por fagos.
es comparativamente más fácil
encontrar nuevos fagos mutantes
que actúen de forma lítica contra
éstas bacterias resistentes y se
pueden usar contra las bacterias
específicas.
6. La aplicación de fagos para terapia 6. La transferencia de genes virulentos
es relativamente flexible, rápida y mediada por fagos para no atacar a
económica. En la fagoterapia, la bacterias, es otro problema emergente de
enfermedad del pez huésped / la aplicación de fagos.
bacteria huésped y los fagos
terapéuticos viven en los mismos
medios, por lo tanto, su contacto
fisiológico, continuo y cercano con
los patógenos es una disposición
natural.
7. Los fagos se pueden aplicar 7. Las dosis y el modo de administración
fácilmente como aerosol o mezclado óptimos para la terapia con fagos en la
directamente en agua. Tiene un acuicultura aún no está muy claro.
efecto sinérgico cuando se aplica
como cóctel (más de un fago juntos)
y con antibióticos, conservantes o
desinfectantes.
Tabla 1. Ventajas y desventajas de la fagoterapia. Fuente: elaboración propia
Métodos de aislamiento
Preparación del Cultivo Bacteriano: Este es el primer paso en el proceso de aislamiento de
fagos. Se recolecta una muestra, que puede ser de varias fuentes como suelo, agua, entre
otros. Luego, se prepara un caldo de nutrientes y se añade una pequeña cantidad de la
muestra recolectada (Mirzaei & Nilsson, 2015).
Incubación: La muestra se incuba junto con la bacteria huésped en un cultivo líquido, a
menudo durante la noche dependiendo del huésped, para amplificar cualquier fago que
pueda estar en la muestra. Esto dará lugar a una mayor concentración de los fagos
deseados en la muestra, lo que permitiría un aislamiento más fácil. Filtración: Después de la
incubación, la muestra se pretrata tanto físicamente, por ejemplo, por extracción en una
solución tampón, por centrifugación o por filtración, como químicamente por cloroformo que
mata las bacterias presentes en la muestra (Mirzaei, 2015).
Concentración de Fagos: El pretratamiento es seguido por una etapa de enriquecimiento.
Esto implica la incubación de la muestra junto con el hospedador deseado en cultivo líquido,
a menudo durante la noche dependiendo del huésped, para amplificar cualquier fago que
pueda estar en la muestra. Determinación de la Actividad Fágica: Posteriormente, se realiza
un ensayo de doble capa en placa de agar en el que se mezcla una suspensión de
bacterias y la muestra en una capa de agar semisólido seguido de una incubación. Si los
fagos infectan a la bacteria con suficiente eficacia, se formarán placas de lisis (Salazar
Llanos, 2018).
Aislamiento de colonias fágicas: Después del aislamiento de los fagos a partir de la
muestra, se obtienen aislados puros mediante purificación en placa. Las placas de lisis
obtenidas se extraen del medio sólido, se eluyen, luego se diluyen antes de ser incubadas
con nuevas bacterias para formar nuevas placas de lisis individuales. Amplificación y
almacenamiento: Cuando se dispone de un aislado puro, se almacena un stock de fago que
contiene partículas fágicas puras en una concentración elevada. Se aísla una placa de lisis
purificada y se incuba junto con el hospedador(es) deseado(s) en cultivo líquido (Salazar
Llanos, 2018).
Aplicaciones en Chile
Más que una aplicación se realizó un caso de estudio, investigación sobre el uso de
bacteriofagos en etapas larvales de cultivos en general para tratar o eliminar la bacteria
Vibrio alginolyticus, causante de mortalidades adhiriéndose al mucus de los organismos. Se
extrajeron fagos de caracoles y choritos, los cuales fueron utilizados para crear la cepa
GV09, la cual junto con alginato sódico en polvo se disolvió en agua MiliQ a una
concentración final de 6% (p/v) como stock inicial. Para poder formar las perlas de alginato
por extrusión, se usó como medio entrecruzante cloruro de calcio (CaCl2), a una
concentración final de 1,8 % (p/v) en agua MiliQ.
Al stock inicial de alginato se añadió fago dializado hasta llegar a una concentración final de
3%, 2% y 1% de alginato/fago, con respecto a la concentración inicial. Se agitó en vortex a
temperatura ambiente, para homogeneizar (Blas S., 2023).La solución de alginato/fago se
añadió gota a gota a un volumen arbitrario de solución iónica, CaCl2 (1,8% p/v) a
temperatura ambiente, utilizando pipetas de Pasteur esterilizadas. El fago encapsulado en
perlas de alginato se dejó en reposo por 1 minuto en la solución iónica. Después del reposo
en solución, las perlas se filtraron para retirar excedente de solución iónica para
posteriormente almacenarlas a 4°C para su uso.
Fig 7. Diagrama representativo de la encapsulación de fagos en perlas de alginato.
Para liberar el fago encapsulado, se realizó la difusión de este mediante una incubación de
las perlas en Buffer SM (50 mM Tris-HCl pH7. 5, 100 mM NaCl, 8mM MgSO4, 0.01%
gelatina (v/w)), en constante agitación, 180 RPM a 25°C. Se tomaron muestras cada 30
minutos por 5 horas, para determinar el grado de difusión de las perlas y cuanto fago
liberaba al medir la concentración (UFP/ml) por microgota sobre césped bacteriano, usando
el método de doble agar. Se observó que al cabo de entre 80 y 220 minutos estos
comenzaban su etapa logarítmica de crecimiento (Blas S., 2023).
Fagos de amplio espectro y cóctel de fagos
Los fagos de amplio espectro, que tienen la capacidad de infectar a múltiples huéspedes
dentro de un mismo género o en diferentes géneros (de Jonge et al., 2019), pueden lisar
eficientemente tanto a las bacterias huésped como a los patógenos que se encuentran en la
agricultura y el entorno natural (Kalatzis et al., 2016; Rorbo et al., 2018). Por ejemplo, el
fago Vibrio KVP40, que es de amplio espectro, no solo logró retrasar la muerte o reducir la
mortalidad en el grupo expuesto, sino que también redujo la mortalidad general en el grupo
de control que no estuvo expuesto, al lisar a los patógenos presentes en el fondo (Rorbo et
al., 2018).
Esto destaca el uso preventivo del fago KVP40 en la acuicultura. También se han reportado
fagos capaces de lisar múltiples serotipos. El fago PH669 puede lisar múltiples cepas de los
serotipos O3 y O4 en Vibrio parahaemolyticus (Hu et al., 2021), mientras que el fago
vB_SPuM_SP116 y el fago vB_SalS-LPSTLL pueden lisar 9 (Bao et al., 2019) y 11 ( Guo et
al., 2021) diferentes tipos de serotipos en Salmonella, respectivamente. Sin embargo, la
obtención de fagos de amplio espectro sigue siendo un desafío debido a las diferencias en
las estrategias de supervivencia de los fagos y las limitaciones de los métodos de
aislamiento (Liu et. al., 2022).
Los cócteles de fagos, consisten en la mezcla de múltiples fagos, pueden ampliar el rango
de bacterias del huésped y reducir la frecuencia de desarrollo de resistencia bacteriana.
Esto se debe a que las bacterias que son resistentes a ciertos fagos pueden ser eliminadas
por otros fagos presentes en el cóctel. En general, se ha observado que los cócteles de
fagos son más efectivos que el uso de un solo fago (Liu et. al., 2022). Por ejemplo, se ha
demostrado que un cóctel que contiene los fagos VP-1, VP-2 y VP-3 retrasa la formación de
resistencia y mejora la capacidad de inactivación de Vibrio parahaemolyticus en
comparación con el uso de un solo fago ( Mateus et al., 2014).
Además, Chen et al. (2019) aislaron cinco fagos de amplio espectro con alta capacidad lítica
de aguas residuales de acuicultura y del tracto intestinal de camarones enfermos, y los
utilizaron para construir un cóctel de fagos para la inactivación de Vibrio sp. Va-F3. El efecto
inhibidor del cóctel de fagos sobre Vibrio sp. Va-F3 fue significativamente mejor que
cualquier fago in vitro, y la protección in vivo de los camarones puede ser comparable a la
de los antibióticos, por lo que las tasas de supervivencia alcanzaron el 91,4 y el 91,6 % en 7
días, respectivamente.
Conclusiones
La fagoterapia representa una herramienta prometedora para mejorar la salud y el
rendimiento de los cultivos larvales marinos en Chile. Podría ser utilizada como tratamiento
complementario al uso de los antibióticos y mejorar el control de patologías bacterianas. Sin
embargo, se requiere continuar investigando y desarrollando estrategias para su
implementación a gran escala, en pro de obtener un coste competitivo, mejoras
formulaciones para cada aplicación concreta, estandarizar métodos de administración, y
analizar la eficacia de los cocktails.
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