Bloque II
Bioenergética
BIOQUÍMICA
-Biología-
María Gómez Cañas
GRADO DE PODOLOGÍA [email protected]
Introducción al metabolismo
Metabolismo
Conjunto de reacciones catalizadas enzimáticamente a través de las cuales el organismo
lleva a cabo transformaciones químicas
✓ Cualquier reacción que tenga lugar entre biomoléculas presentes
en un organismo vivo se denomina metabólica
✓ Son interdependientes y sus actividades están coordinadas
Funciones del metabolismo:
1. Obtención de energía (química) a partir de los nutrientes.
2. Degradar los nutrientes en biomoléculas componentes de la célula (que se utilizarán
como precursores de las macromoléculas celulares).
3. Ensamblaje de los distintos precursores para la formación de biomoléculas complejas.
4. Formación y transformación de las biomoléculas, de acuerdo a las funciones
especializadas que son requeridas por las células
Introducción al metabolismo
7.2 INTRODUCCIÓN AL METABOLISMO
El metabolismo comprende dos fases:
• Anabolismo: reacciones metabólicas que permiten sintetizar nuevas
biomoléculas, necesarias para el mantenimiento de las funciones biológicas del
organismo, a partir de moléculas simples.
• Catabolismo: reacciones metabólicas que producen la degradación de sustancias
complejas; tales como los carbohidratos, lípidos y proteínas, en otras más simples.
Introducción al metabolismo
• El anabolismo y el catabolismo son fases contrarias pero interdependientes: en las
reacciones anabólicas se absorbe y se aprovecha la energía que es liberada por las
catabólicas
• El acoplamiento entre los dos procesos necesita intermediarios que conserven la energía
(ATP) y el poder reductor ( NADH, NADPH, FADH2) que se liberan en el catabolismo para
ser utilizados en los procesos anabólicos
Bioenergética: conceptos generales
Energía = propiedad de la materia que indica la capacidad de un sistema de realizar
un trabajo.
✓ La termodinámica estudia las transformaciones energéticas que acompañan a los
procesos físicos y químicos de la materia.
✓ La bioenergética estudia las transformaciones de la energía en los seres vivos, y la
naturaleza de los procesos químicos en los que se basan estas transformaciones, las
cuales siguen las leyes de la termodinámica.
Un sistema biológico debe cumplir las leyes de
la termodinámica
Principios de Termodinámica
✓ Para que una reacción anabólica se pueda producir, es preciso acoplarla a otra reacción
catabólica que desprenda energía.
1ª Ley de la Termodinámica La energía interna de un sistema no se
Ley de conservación de la energía crea ni se destruye, sólo se transforma.
• Sistema: parte del universo cuyas propiedades se estudian (célula, reacción química…)
• Según su relación con el entorno, los sistemas pueden ser:
➢Sistemas abiertos
➢Sistemas cerrados
➢Sistemas aislados
Principios de Termodinámica
✓ Para que una reacción anabólica se pueda producir, es preciso acoplarla a otra reacción
catabólica que desprenda energía.
1ª Ley de la Termodinámica La energía interna de un sistema no se
Ley de conservación de la energía crea ni se destruye, sólo se transforma.
• Sistema: parte del universo cuyas propiedades se estudian (célula, reacción química…)
• Según su relación con el entorno, los sistemas pueden ser:
intercambian
materia y energía
con el entorno
➢Sistemas abiertos
Principios de Termodinámica
✓ Para que una reacción anabólica se pueda producir, es preciso acoplarla a otra reacción
catabólica que desprenda energía.
1ª Ley de la Termodinámica La energía interna de un sistema no se
Ley de conservación de la energía crea ni se destruye, sólo se transforma.
• Sistema: parte del universo cuyas propiedades se estudian (célula, reacción química…)
• Según su relación con el entorno, los sistemas pueden ser:
no intercambian
materia pero si
energía con el entorno
➢Sistemas cerrados
Principios de Termodinámica
✓ Para que una reacción anabólica se pueda producir, es preciso acoplarla a otra reacción
catabólica que desprenda energía.
1ª Ley de la Termodinámica La energía interna de un sistema no se
Ley de conservación de la energía crea ni se destruye, sólo se transforma.
• Sistema: parte del universo cuyas propiedades se estudian (célula, reacción química…)
• Según su relación con el entorno, los sistemas pueden ser:
no intercambian
materia ni energía
con el entorno
➢Sistemas aislados
Principios de Termodinámica
✓ Para que una reacción anabólica se pueda producir, es preciso acoplarla a otra reacción
catabólica que desprenda energía.
1ª Ley de la Termodinámica La energía interna de un sistema no se
Ley de conservación de la energía crea ni se destruye, sólo se transforma.
• Sistema: parte del universo cuyas propiedades se estudian (célula, reacción química…)
• Según su relación con el entorno, los sistemas pueden ser:
Principios de Termodinámica
✓ En los sistemas químicos, la energía se intercambia o transfiere de un sistema a otro
a través de dos maneras fundamentales:
• Mediante calor (Q)
Energía sistema = Q + W
• Mediante trabajo (W)
ESQUEMA DE LA COMBUSTIÓN DE UNA MOLÉCULA REDUCIDA
Combustión en la célula
El trabajo es la forma Aprovechable para la
útil en que los sistemas realización de un trabajo
químicos presentes en biológico
las células transfieren
la energía. Combustión
directa
Principios de Termodinámica
El estado de un sistema se puede definir mediante las FUNCIONES DE ESTADO:
Las funciones de estado son propiedades de un sistema que no dependen de la forma en la
que el sistema haya llegado hasta ese estado, si no que dependen exclusivamente de dónde
se ha partido y a dónde se ha llegado
Principios de Termodinámica
✓ Las funciones de estado importantes en el estudio de los sistemas biológicos son:
• ENTALPÍA: Energía total de un sistema (H)
• ENTROPÍA: Desorden de un sistema (S)
• ENERGÍA LIBRE DE GIBS Energía necesaria para realizar un trabajo (G)
✓ Estas funciones se definen a partir de la variación de dos estados en un sistema (∆):
∆H= H Estado final - H estado inicial
∆= Estado final- estado inicial
∆S= S Estado final - S estado inicial
∆ reacción= ∑ productos - ∑ reactivos ∆G= G Estado final - Gestado inicial
Principios de Termodinámica
ENTROPIA ∆S reacción= ∑ S productos - ∑ S reactivos
✓ Se relaciona con el grado de desorden de un sistema
✓ La entropía se puede considerar como la energía de un sistema que no se puede
utilizar para realizar trabajo efectivo (energía no disponible )
Los procesos que ocurren en el
2ª Ley de la Termodinámica universo siempre aumentan el
Ley de la Entropía en Aumento desorden, y por tanto la entropía.
ENTROPIA
- +
Principios de Termodinámica
✓ Las sustancias químicas reaccionan de manera que parte de la energía potencial se libera
como CALOR y otra parte puede ser convertida en trabajo y se denomina ENERGÍA LIBRE
(G)
G. Energía libre
G=H–TS H: ENTALPÍA o energía total del sistema
S: entropía
T: temperatura
✓ Esta ecuación enuncia que no toda la energía almacenada en un sistema (H) está
disponible para el trabajo. El desorden del sistema, el factor de entropía (S) se resta a
la energía total para calcular la máxima capacidad del sistema para realizar trabajo útil
✓ Los cambios de energía libre, cuando un sistema va desde un estado inicial a un estado
final, es representado por ΔG
∆G = ∆H - T· ∆S
Principios de Termodinámica
ENERGIA LIBRE DE GIBS
✓ Determina la espontaneidad de la reacción
• ∆G<0 = Reacción ESPONTANEA (proceso exergónico) El signo de ΔG
• ∆G>0 = Reacción NO ESPONTANEA (proceso endergónico) predice la dirección
• ∆G=0 = Proceso en EQUILIBRIO de una reacción
LIBERAN ENERGÍA (espontáneo) CONSUMEN ENERGÍA
ΔG<0 ΔG>0
Existe una forma de expresar la Energía libre en [𝐏𝐫𝐨𝐝𝐮𝐜𝐭𝐨𝐬]
términos de la concentración de reactivos y ∆G = ∆G0´ + RT ln
[𝐑𝐞𝐚𝐜𝐭𝐢𝐯𝐨𝐬]
productos:
∆G0´ = energía libre (diferencia entre el • P= 1 atm
contenido energético de los reactivos y • [Productos] = [Reactivos] = 1 , al inicio de la reacción
• pH = 7, en reacciones bioquímicas
los productos) en condiciones estándar:
Principios de Termodinámica
Muchas reacciones químicas dentro de los seres vivos tienen valores positivos de ΔG
(endergónicas). ¿Cómo puede ser?
Los valores de energía libre son aditivos en cualquier secuencia de reacciones
Mecanismo por el cual en el metabolismo una reacción anabólica desafavorable
((∆G0´> 0) se puede producir
Acoplamiento a otra reacción que desprenda energía (∆G0´< 0) para que el valor neto
de la reacción global sea ∆G0´T < 0
Compuestos ricos en energía
✓ El acoplamiento energético entre procesos exergónicos y endergónicos sólo es posible si
la energía se libera o se utiliza en cantidades discretas
✓ Por eso, los procesos metabólicos se realizan en etapas que requieren o liberan
cantidades pequeñas de energía
✓ Los compuestos ricos en energía transfieren la energía liberada en los procesos
exergónicos a los procesos endergónicos
✓ Se considera compuestos ricos en energía a aquellos cuya energía libre de transferencia
de un grupo es ∆G0´> -7 Kcal/mol (-29 KJ/mol)
✓ Los compuestos ricos en energía liberan la energía que transportan por la rotura de un
solo enlace (enlace rico en energía) aunque la energía está contenida en toda la
molécula
✓ Los productos de la hidrólisis de estos compuestos son más estables que la molécula
original
✓ La hidrólisis del enlace rico en energía libera tensiones internas
Adenosín trifosfato (ATP)
Los seres vivos utilizan la molécula de ATP como medio principal para almacenar
energía útil proveniente de la degradación de los alimentos
El ATP tiene 2 enlaces fosfoanhidro que
liberan una gran cantidad de energía al
hidrolizarse, pero también tiene un enlace
fosfoéster
La hidrólisis del ATP es muy exergónica
Hidrólisis del ATP
✓ El ATP, ADP, AMP son interconvertibles
✓ El ATP, el ADP y el fosfato está presente en todas las células y desempeñan el papel de sistema
transmisor de la energía
✓ En las células la concentración de ATP permanece relativamente constante
✓ El ATP no se almacena en el organismo, sino que se forma y consume continuamente
✓ El ATP/ADP es la forma fundamental de intercambio energético en los sistemas biológicos
Hidrólisis del ATP
2 x Enlaces fosfoanhidro
Características estructurales que 1 x Enlace fosfoéster
hacen que el ATP sea un compuesto
rico en energía:
1. La hidrólisis libera un grupo fosfato
Eª
inorgánico (Pi) cargado negativamente
2. Disminuye la repulsión electrostática
entre los átomos de O en la molécula
3. El Pi, con 4 enlaces P-O, se estabiliza
por resonancia y el ADP se ioniza
4. Aumenta el grado de solvatación
(hidratación) de ambos productos de
reacción. La hidratación es un estado
energéticamente favorable.
PO43- ADP3-
Los productos de la hidrólisis
son más estables que ATP H+
Hidrólisis del ATP
Factores que influyen en el valor de ∆G de hidrólisis del ATP
1. Valor de la relación [ATP] / [ADP]
2. Valor del pH
3. Concentración de Mg2+
Hidrólisis del ATP
Factores que influyen en el valor de ∆G de hidrólisis del ATP
1. Valor de la relación [ATP]/[ADP]
[ADP] [Pi]
ATP + H2O ADP + Pi ∆Gh ATP = ∆G0’ h ATP + RT ln
[ATP]
Cuanto mayor sea el cociente [ATP]/[ADP], el valor de ∆Gh ATP será más
negativo, es decir, su hidrólisis será más exergónica
Hidrólisis del ATP
Factores que influyen en el valor de ∆G de hidrólisis del ATP
2. Valor del pH
✓ Las formas ATP3- y ATP4- coexisten a pH 7
✓ Las variaciones de pH modifican el estado de ionización del ATP: El aumento del pH
desplaza el equilibrio hacia la forma ATP4-, lo que aumenta la carga negativa y por lo tanto
la repulsión electrostática entre los O-
✓ Se libera mayor tensión electrostática al hidrolizarse ATP4- que ATP3-. Por lo tanto, la
hidrólisis es más exergónica a pH básico
Hidrólisis del ATP
Factores que influyen en el valor de ∆G de hidrólisis del ATP
3. Concentración de Mg 2+
Debido a que más del 90% del ATP, ADP, Pi y
PPi celulares están formando complejos con el
Mg2+, ∆Gh depende de la concentración de
Mg2+
A medida que cae la [Mg2+], el valor negativo de ∆Gh
aumenta
El Mg2+ se une a los grupos fosfato del ATP y mitiga la
repulsión entre sus cargas, por lo tanto, a medida que
disminuye la [Mg2+ ] la estabilización de la molécula de
ATP será menor, debido a la mayor repulsión y ∆Gh
será más exergónica (-log [Mg2+] es una representación logarítmica, por tanto, cada unidad
del eje X corresponde a un cambio de 10 veces en la [Mg2+])
Otros compuestos ricos en energía
Aunque el ATP no es la única forma de intercambio energético en los sistemas biológicos, existe un
papel central del ATP en la transferencia de energía, tratándose de una moneda energética
Reacciones de óxido-reducción
Oxidación: proceso bioquímico de pérdida de electrones, asociado a otro de
captación (reducción). Son reacciones de óxido-reducción o reacciones redox entre
pares conjugados.
El donante de electrones es el reductor (o agente reductor), que se oxida
El aceptor de electrones es el oxidante (o agente oxidante), que se reduce
Reacciones de óxido-reducción
Oxidación y reducción de los grupos funcionales de interés en bioquímica
A medida que se oxida el carbono se reduce el número de H unidos y aumenta el de O
Coenzimas más importantes en la transferencia de electrones
Dinucleótido de Flavina adenina
Coenzimas más importantes en la transferencia de electrones
Coenzimas más importantes en la transferencia de electrones
Dinucleótido de Nicotinamida adenina
Coenzimas más importantes en la transferencia de electrones
Potencial de reducción
Potencial de reducción (E): Tendencia de una sustancia a ganar electrones
✓ Se define como la fuerza electromotriz (voltios)
✓ E0 para cualquier par redox se calcula tomando un electrodo de referencia:
• electrodo de H2
• electrodo inerte, generalmente de Pt, sumergido en una solución 1M de H+ y H2 gas a 1 atm
• se le asigna, por convenio, un valor de E0 = 0,0 voltios
La disolución
contiene el par
redox cuyo
potencial se
desea medir
E0 signo +
E0: 25oC, 1 atm, [oxidante] y [reductor] = 1 M
La diferencia entre E0 y E0’ es que E0’ está calculado a pH=7
([Fe3+] = [Fe2+] = 1M, el pH = 7)
Potencial de reducción
Potencial de reducción bajo (-) Flujo de electrones Potencial de reducción alto (+)
Donante/Reductor Aceptor/Oxidante
ΔEo’ = Eo’ (aceptor/oxidante) - Eo’ (donante/reductor)
E0 signo +
Potencial de reducción
✓ La sustancia reductora cede e- porque es más estable sin ellos. Al cederlos pasa a un
estado de menor de energía.
✓ La sustancia oxidante acepta e- porque tiene mayor afinidad que el reductor
✓ Cuanto mayor es el valor de E0 para un par redox, más fuerte es como oxidante el
aceptor electrónico de ese par redox
Potencial de reducción
Variación de la energía libre estandar de las reacciones de oxidación-reducción
n: número de moles de electrones
G’º = - n F E’º F: Faraday (carga de un mol de
electrones, 96500 culombios/mol)
E: potencial redox en voltios
Si ΔE’o positivo, ΔG’o negativo
Cuando el oxidante es fuerte, ΔE’o positivo
Reacción termodinámicamente favorecida
• ∆E<0 = Reacción endergónica
• ∆E>0 = Reacción exergónica
• ∆E=0 = EQUILIBRIO