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SIMULACRO

Este documento describe un experimento de electroforesis en gel de poliacrilamida con SDS para separar y analizar proteínas. Se realizan simulaciones variando parámetros como el voltaje aplicado, la concentración de poliacrilamida en el gel y la concentración de proteínas. El objetivo es observar cómo estos cambios afectan a la separación y movilidad de las proteínas para comprender mejor el mecanismo subyacente.

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SIMULACRO

Este documento describe un experimento de electroforesis en gel de poliacrilamida con SDS para separar y analizar proteínas. Se realizan simulaciones variando parámetros como el voltaje aplicado, la concentración de poliacrilamida en el gel y la concentración de proteínas. El objetivo es observar cómo estos cambios afectan a la separación y movilidad de las proteínas para comprender mejor el mecanismo subyacente.

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• Laboratorios y técnicas virtuales

• Electroforesis en gel de poliacrilamida con SDS

• Acceso al simulador

Indica en una tabla las siguientes características de las proteínas del patrón: Nombre, Abreviatura,
Mm, Log Mm, Avance mm, Movilidad relativa

Nombre Abreviatura Mm Log Mm Avance mm Movilidad


relativa
Beta βgala 116107 5,06 1,19 0,02
galactosidasa
Ovalbúmina ovalb. 42734 4.63 9,72 0,18
Anhidrasa anh. carb. 29011 4.46 26,09 0,50
carbónica
Triosa- TIM 26527 4.42 27,51 0,52
fosfato-
isomerasa
Mioglobina Mioglob. 17183 4.24 34,86 0,86
Lisozima Lisoz. 14296 4.16 37,94 0,62
Inhibidor de BPTI 6500 3.81 51,23 0,97
tripsina

Realiza las siguientes simulaciones con una de las muestras (1-10):

a) A bajo voltaje

50V

Nombre Log Mr Movilidad relativa


Beta galactosidasa 5,06 0,02
Ovalbúmina 4,63 0,18
Anhidrasa carbónica 4,46 0,49
Triosa-fosfato-isomerasa 4,42 0,52
Mioglobina 4,24 0,66
Lisozima 4,16 0,72
Inhibidor de tripsina 3,81 0,97
b) A alto voltaje

200V

Nombre Log Mr Movilidad relativa


Beta galactosidasa 5,06 0,02
Ovalbúmina 4.63 0,18
Anhidrasa carbónica 4,46 0,49
Triosa-fosfato-isomerasa 4,42 0,52
Mioglobina 4,24 0,66
Lisozima 4,16 0,72
Inhibidor de tripsina 3,81 0,97
c) Baja concentración de poliacrilamida

7,5% poliacrilamida

Nombre Log Mr Movilidad relativa


Beta galactosidasa 5,06 0,05
Ovalbúmina 4,63 0,37
Anhidrasa carbónica 4,46 0,50
Triosa-fosfato-isomerasa 4,42 0,52
Mioglobina 4,24 0,66
Lisozima 4,16 0,72
Inhibidor de tripsina 3,81 0,97
d) Alta concentración de poliacrilamida

15%

Nombre Log Mr Movilidad relativa


Beta galactosidasa 5,06 0,00
Ovalbúmina 4,63 0,06
Anhidrasa carbónica 4,46 0,06
Triosa-fosfato-isomerasa 4,42 0,08
Mioglobina 4,24 0,66
Lisozima 4,16 0,72
Inhibidor de tripsina 3,81 0,97
Cuestiones:

1. ¿Cuál es el efecto de aumentar la diferencia de potencial eléctrico entre ambos electrodos?

La diferencia es casi inexistente entre los dos primeros

2. ¿Cuál es el efecto de aumentar la concentración de acrilamida que forma el gel? ¿Cómo lo


interpretas, en términos del mecanismo de la separación?

La mayoría de las proteínas se separan bien en el rango de 5 a 10%, entendemos entonces que
estarán mejor separadas al 15% que al 7,5%

3. Representa la gráfica Log Mm frente a movilidad relativa.

4. Calcula la masa molecular de la muestra problema

MUESTRA PROBLEMA ELEGIDA nº 5

Masa experimental 85564

Fos b MW 94969

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