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sintesis-de-proteinas-1
11 pag.
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ó
• La síntesis proteínica es un proceso en el que la información genética codificada en los ácidos
nucleicos se traduce en el “alfabeto” de los 20 AA.
• La síntesis de proteínas incluye los procesos de modificación y de direccionamiento posteriores a
la traducción
• Al menos 100 moléculas diferentes participan en la síntesis de proteínas.
• Entre las más importantes se encuentran las componentes de los ribosomas, grandes máquinas
ribonucleoproteínicas que sintetizan polipéptidos. (unen información)
• Cada ribosoma “lee” la secuencia de bases de un mRNA e, impulsado por GTP, convierte de manera
rápida y precisa esta información en la secuencia de aminoácidos de un polipéptido.
• La rapidez es necesaria porque los organismos deben reaccionar de manera expedita a las
condiciones ambientales siempre cambiantes.
• La precisión en la traducción del mRNA es crítica porque el funcionamiento adecuado de cada
polipéptido depende no sólo de la secuencia primaria de la molécula, sino también de su plegamiento
exacto.
• En su mayor parte, las proteínas ribosómicas tienen funciones de soporte.
Código genético
• Durante la síntesis de proteínas una secuencia de bases de ácidos nucleicos se convierte en un
lenguaje del todo distinto, de ahí el término traducción.
Se traduce la secuencia de las bases, la traducción cambia la secuencia de bases en otra
secuencia, pero sigue siendo el mismo mensaje
• El código genético puede describirse como un diccionario codificador que específica un
significado para la secuencia de bases.
• El conjunto de codones de tripletes en un mRNA que codifica los aminoácidos en un polipéptido se
llama marco de lectura abierto.
La unión de diferentes tripletes forma los AA.
• Cuatro codones actúan como signos de puntuación. UAA, UAG y UGA son señales de parada (de
terminación de la cadena polipeptídica).
• AUG, el codón de metionina, sirve también como señal de inicio (que algunas veces se denomina
codón de iniciación).
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• Propiedades:
1. Especificidad. Cada codón es una señal para un aminoácido específico.
2. Degeneración. Se dice que cualquier sistema de codificación es degenerado cuando diversas
señales tienen el mismo significado. El código genético es en parte degenerado debido a que la
mayoría de los aminoácidos está codificado por varios codones. Por ejemplo, a la leucina la
codifican seis codones diferentes (UUA, UUG, CUU, CUC, CUA y CUG). De hecho, la metionina
(AUG) y el triptófano (UGG) son los únicos aminoácidos codificados por un solo codón.
3. Ausencia de superposición. La secuencia codificadora del mRNA la “lee” un ribosoma desde
el codón de iniciación (AUG) como una secuencia continua que toma cada vez tres bases hasta
que se llega a un codón de terminación.
4. Universalidad casi total. La gran mayoría de los organismos utiliza el código genético, con
unas pocas excepciones.
✓ Si se necesita iniciar una
lectura hay que ver
dónde está el AUG
✓ Se necesita traducir ese
idioma en AA
✓ Cada triplete se
transforma en ciertos
AA
Tendencia en el uso de codones
• La tendencia al uso de codones es resultado de las presiones evolutivas para mejorar la
eficiencia de traducción, ya que la tendencia de codones es muy frecuente en organismos
unicelulares de crecimiento rápido
• Cada organismo tiene una preferencia distintiva por codones particulares.
Por las presiones evolutivas y las necesidades que se tienen para mejorar la
traducción son las causas por las que ha habido una “tendencia “al uso de codones
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Interacciones codón-anticodón
• Las moléculas de RNA de transferencia son los “adaptadores”
necesarios para la traducción del mensaje genético. Cada tipo Las moléculas ARNt sirven
de tRNA transporta un aminoácido específico (en el extremo 3′) como adaptadores que
y tiene una secuencia de tres bases llamada anticodón. traen un idioma que el
cuerpo no entiende
• Hay un tipo de ARNt para cada tipo de AA
• El apareamiento de bases codón-anticodón es el mecanismo real
de traducción de las moléculas de mRNA. Aunque los apareamientos codón-anticodón son
antiparalelos, ambas secuencias se dan en dirección 5′ → 3′.
• La mayoría de las células posee alrededor de 50 tRNA, aunque se han observado cantidades
menores
Hipótesis de balanceo
• La hipótesis del balanceo, que permite múltiples interacciones codón-anticodón por tRNA
individuales
1. Los dos primeros apareamientos de bases en una interacción codón-anticodón confiere la
mayor parte de la especificidad requerida durante la traducción
• La mayoría de los codones redundantes que especifica cierto aminoácido Primeros dos = +
tiene nucleótidos idénticos en las primeras dos posiciones. importantes , son los
que dan especificidad
2 Las interacciones entre los terceros nucleótidos del codón y del
anticodón son menos estrictas. Tercera += menos
estricto , hay
variaciones
Se necesita que haya un equilibrio
molecular a la hora de realizar la
lectura para que no haya una
dominancia basado en el hecho de
que se necesita que los dos
primeros apareamientos que se
den le dicten al diccionario qué
orden es el que va a continuar y
si no hay un balance no va a haber
codón de terminación ni de
iniciación
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Reacción de la Aminoacil tRAN sintetasa
• La unión de los aminoácidos a los tRNA ( ARN de
trasnferencia ) , que se considera el primer paso de la El ARN de
síntesis de proteínas, es catalizada por un grupo de enzimas transporte
que se denominan aminoacil-tRNA sintetasas
requiere que los AA
• El proceso que une un aminoácido al extremo 3′ del tRNA se adhieran para ser
correcto consta de dos reacciones secuenciales que se transportados
producen dentro del sitio activo de la sintetasa
• 1. Activación. La sintetasa cataliza en primer lugar la formación de
aminoacil-AMP.
Esta reacción, que activa al aminoácido por la formación de un enlace anhídrido mixto de alta
energía, a través de la hidrólisis de su otro producto, el pirofosfato.
Se necesita activar las enzimas (ARNT sintetasa) que van a ayudar a sintetizar las
proteínas, se activa y forma aminoacil AMP, que se forma por el enlace de alta energía
(enlace anhidrido) que sale de la hidrólisis del pirofosfato.
• 2. Unión del tRNA. Un tRNA específico, unido también en el sitio activo de la sintetasa, queda
unido al grupo aminoacilo de forma covalente a través de un enlace éster.
• La suma de las reacciones catalizadas por las aminoacil-tRNA sintetasas es la
siguiente:
Aminoácido + ATP + tRNA → aminoacil-tRNA + AMP + PPi
Síntesis de proteínas
• La traducción de un mensaje genético en la secuencia primaria de un polipéptido puede
dividirse en tres fases
• Iniciación
• Elongación
• Terminación
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• La subunidad ribosómica pequeña se une a un mRNA.
• El anticodón de un tRNA específico, que se denomina tRNA iniciador, se aparea a continuación
con el codón de iniciación AUG del mRNA.
• La iniciación finaliza cuando la subunidad ribosómica grande se combina con la subunidad
pequeña
• Sitio p (subunidad pequeña) y sitio A (subunidad grande) se unen.
• Un mRNA con varios ribosomas unidos se denomina polisoma.
• El proceso de elongación en los procariotas inicia cuando un aminoacil-tRNA, especificado por el
siguiente codón, se
• une con el sitio A ya vacío.
• el polipéptido se sintetiza según las especificaciones del mensaje genético.
• 3 fases:
1.Apareamiento codón-anticodón en el sitio A ( sitio grande)
El siguiente aminoaciltRNA se une con el sitio A
2 Formación del enlace peptídico
La formación del enlace peptídico se cataliza por la peptidil transferasa
Transpeptidación: el nitrógeno del amino del aminoácido en el sitio A ataca al grupo carbonilo
del aminoácido en el sitio P ( sitio pequeña )
3 Transferencia del peptidil-tRNA al sitio P.
• Translocación: Conforme un ribosoma se desplaza a lo largo del mRNA, un triplete de
longitud se cambia al sitio P y el tRNA descargado en el sitio P se libera del ribosoma o
cambia al sitio E o salida de donde se libera luego del ribosoma.
• La fase de terminación comienza cuando un codón de terminación (UAA, UAG o UGA) entra al
sitio A.
• En la terminación participan tres factores de liberación (RF1, RF2 y RF3)
• Se libera del ribosoma la cadena polipeptídica.
• La traducción se termina porque un codón de terminación no puede unirse a un aminoacil-
tRNA.
• La traducción finaliza cuando el ribosoma libera el mRNA y se disocia en sus subunidades
grande y pequeña.
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Vamos a tener la subunidad pequeña ,
en la cual se va a pegar un primer AA
que va a buscar el ARNt hace la
lectura y el sitio P se pega al sitio A ,
Cuando ya están los sitios unidos se
va a agregar un segundo AA que se
unirá al sitio A , una vez que se tiene
un AA en cada subunidad , el grupo
amino del AA del sitio A ataca al grupo
carbonilo del AA de la subunidad P . El
AA 2 ataca A1, ese formará el enlace
peptídico que se necesita. dejan de
ser 2 cadenas peptídicas y pasan a
ser una sola cadena polipeptídica (se
unieron ambos aminoácidos)
Se termina cuando las subunidades se
separan y se liberan del ribosoma.
Síntesis de proteínas procariotas
• El ribosoma bacteriano 70Subunidades está formado por una subunidad gran de 50S y una
pequeña 30S
• La subunidad grande consiste en rRNA 23S y 5S, y 34 proteínas.
• La subunidad pequeña contiene rRNA 16S y 21 proteínas.
• Además de los sitios P, A y E, existen otros tres centros funcionales:
Centro decodificador
Centro peptidil transferasa
Región relacionada con GTP-asa.
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• El centro decodificador (DC) se localiza en el sitio A de la subunidad 30S
• Es donde el codón de mRNA se aparea con un anticodón de tRNA entrante.
• Tres bases del rRNA 16S muy conservadas (A1492, A1493 y G530) son contiguas al
triplete de pares de bases codón-anticodón.
• Cuando ya se formaron los pares de bases Watson-Crick correctos, se produce un cambio en
la conformación de A1492 y A1493 que acelera la fase de selección de tRNA del ciclo de
elongación
• Entre los primeros dos pares de bases del triplete de pares de bases codón-anticodón
Un ribosoma funcional donde se pean los ARNm , las 50 unidades del
sitio grande, las 30 unidades del sitio pequeño , sin embargo está el
sitio E que es el sitio de la salida, es distinto a lo que hacemos como
eucariotas.
Síntesis de proteínas eucariotas
• Iniciación:
1. Estructura secundaria del mRNA: el mRNA eucariota se procesa por la adición de un
capuchón (casquete) de metilguanosina y una cola de poli(A) y por la eliminación de los
intrones. . Además, el mRNA eucariota no se relaciona con un ribosoma hasta que sale por
completo del núcleo en complejos con varias proteínas.
2. Exploración del mRNA: las moléculas eucariotas carecen de secuencias Shine-Dalgarno ( que
tienen procariotas) que permiten la identificación de la secuencia de iniciación AUG.
- Los ribosomas eucariotas “exploran” cada mRNA por medio de un proceso complejo en el
que los ribosomas se unen al extremo 5′ encasquetado de la molécula y se desplazan en la dirección
5′ → 3′ buscando un sitio de inicio de la traducción.
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• Los eucariotas utilizan un espectro más complejo de factores de iniciación que los
procariotas. Existen al menos 12 factores de iniciación eucariotas (eIF), varios de
los cuales poseen numerosas subunidades
• El inicio eucariota comienza con el ensamble del complejo de preinicio (PIC,
preinitiation complex) formado por la subunidad pequeña (40S) y varios
factores de inicio.
Iniciación
Ensamble del complejo de preinicio (PIC) formado por la subunidad pequeña (40S) y varios factores
de inicio.
1. La subunidad pequeña se une con eIF1 y eIF1A, una molécula que bloquea el sitio A durante el
inicio.
2. Los factores eIF3 (complejo proteínico con múltiples subunidades que facilita el proceso de
unión de mRNA, además de evitar la unión prematura con la subunidad grande y eIF5 también
se unen con la subunidad 40S). El eI F5 es una GAP( proteína) específica para GTPasa eI F2.
3. Una vez que estas proteínas se unen con la subunidad pequeña, el metionil-tRNA (met-tRNA)
iniciador, se une con el sitio P.
4. El complejo de preinicio 43S (formado por la subunidad 40S, eIF1A, eIF2-GTP, eIF3, eIF5 y met-
tRNA) ya está listo para unirse con un mRNA.
Se tiene la subunidad de 40 s se le agregan los factores 1( 1ª) ,3 ,5 el 5 y 2
siempre preparan el uno para el otro entonces el factor 2 se une con el Met
ARN de transferencia , se genera el espacio para que el factor 2 y el met
inicador se unan a la subunidad pequeña y que tengan preparado todo el
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complejo de pre inicio de 43 s para que venga el ARN m y se una al sitio
pequeño para que la lecturaDescargado
se pueda dar
por Jesus (
[email protected])
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• La mayoría de las moléculas de mRNA no pueden realizar este paso hasta que estén unidos
con un complejo de unión al casquete.
• El complejo de unión al casquete (CBC, cap-binding complex), también llamado eIF4F
• Consiste en:
• eIF4E( factor de iniciación ) (proteína de unión al casquete) + eIF4A (helicasa) +
elF4G (proteína de andamiaje).
1. Se une con la región capa del mRNA después de que una helicasa dependiente de ATP (eIF4A),
asistida por eIF4B, elimina cualquier estructura secundaria en el 5′-UTR que pudiera
interferir con el proceso de exploración del mRNA.
2. La cola 3′-poli(A) del mRNA se aproxima al extremo 5′ con casquete mediante interacciones
entre eIF4G y múltiples copias de la proteína de unión con poli(A) (PABP, poly(A)-binding
protein) para formar un mRNA circular.
3. El complejo de inicio 48S completo procede a examinar el mRNA en busca de 5′-AUG-3′ cerca del
extremo 5′.
4. Cuando se llega al codón de inicio, un cambio en la conformación del complejo explorador hace que
se fije al mRNA.
5. El cambio en la conformación también induce la hidrólisis mediada por eIF5 del GTP unido a eIF2.
6. Se hidroliza el GTP, el eIF2-GTP y se regenera mediante eIF2B, un GEF.
7. La unión subsiguiente de eIF5B una GTPasa dependiente del
Ya teníamos a la subunidad
ribosoma, induce la unión de la subunidad pequeña que estaba
pegada al mismo ARNm y
ahora necesitamos que se
de la exploración del ARNm
y que se peguen los
factores de iniciación que
conforme se van inhibiendo
se vuelva a usar GTPasa ,
se usa el complejo de
iniciación de 48s .Después
de haber pegado los
factores necesarios se
prepara la Sub pequeña
para pegarse a la grande,
después de esto empieza
la elongación .
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Elongación
• Se requieren varios factores de elongación (eEF) ( factor de elongación ) durante esta fase
de la traducción.
• Unión de un aminoacil-tRNA al sitio A
• eEF1, un polipéptido de 50 kD, es el equivalente eucariota de EF-Tu, o sea que se trata
de una GTPasa que se une con el aminoacil-tRNA y lo entrega en el sitio A.
• Si se produce el emparejamiento codón-anticodón correcto, eEF1 hidroliza su GTP
unido y sale del ribosoma, deja atrás el aminoacil-tRNA.
• Si no se produce el apareamiento correcto, el complejo sale del sitio A, lo que previene
la incorporación de aminoácidos incorrectos.
• Transpeptidación:
• La actividad peptidiltransferasa de la subunidad ribosómica grande cataliza el ataque
nucleófilo del grupo -amino del sitio A sobre el carbono carboxílico del residuo de
aminoácido del sitio P.
• El eEF1-GDP se disocia del ribosoma justo antes de la transpeptidación.
• El eEF1 alfa y el eEF1 intermedian la regeneración del eEF1-GTP impulsando un
intercambio de GDP por GTP.
• Traslocación:
• Requiere un polipéptido eEF2, que también es GTPasa.
• El eEF2-GTP se une al ribosoma durante la translocación.
• La hidrólisis del GTP proporciona la energía necesaria para mover físicamente el
ribosoma a lo largo del mRNA.
• Al final de la translocación se expone un nuevo codón en el sitio A.
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Terminación
• Dos factores de liberación median el
proceso de terminación:
• eRF1( factor de terminación )
(reconoce codones de
terminación y se une a ellos) y
• eRF3 (una GTPasa).
• Cuando un codón de terminación (UAG,
UGA o UAA) ingresa en el sitio activo,
eRF1 se une a él.
• La peptidiltransferasa cataliza la
hidrólisis del enlace éster entre el
polipéptido y el tRNA del sitio P.
• La hidrólisis del GTP unido a eRF3
impulsa la disociación del eRF1 desde el
ribosoma.
• La disociación de las subunidades
ribosómicas procariotas se atribuye a eIF3, eIF1 y eIF1A.
• Tan pronto como las subunidades ribosómicas y sus factores proteínicos auxiliares se
liberan, quedan posicionados de manera óptima para su reclutamiento por nuevos ribosomas.
• La síntesis proteínica es un proceso complejo en el que la información codificada en los ácidos
nucleicos se traduce a la secuencia primaria de las proteínas.
• Las interacciones de apareamiento de bases entre los codones y la secuencia de bases de los
anticodones de los tRNA dan lugar a la traducción exacta de los mensajes genéticos.
• Los procariotas y los eucariotas difieren en su empleo de mecanismos de control de la
traducción. Los procariotas y los eucariotas difieren en su empleo de mecanismos de control
de la traducción.
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