Microarreglos
AKA: Chips de ADN
María Fernanda Romero Guerrero
¿Qué nos permite?
Moreno, V(2014). “Uso de chips de ADN (microarrays) en medicina: fundamentos técnicos y
procedimientos básicos para el análisis estadístico de resultados de. [Link]
revista-medicina-clinica-2-articulo-uso-chips-adn-microarrays-medicina-13057538
Aná lisis ge nétic o so bre la
expresión de m iles d e g en e s
simultáneamente Der
ech
par
a lo os
s ge
nes
Principios
Básicos
¿Genoma?
¿Genes?
¿Expresión de gen?
N/D. (2023) Hibridación. National Human Genome Research Institute.[Link]
glossary/Hibridacion#:~:text=Definición,moléculas%20de%20una%20sola%20hebra.
Hibridación
proceso en el que dos
moléculas
complementarias de
una sola hebra de ADN
y/o ARN se unen y
forman una molécula
de doble cadena Tejidos frescos o A?
ON
congelados CI
UN
O F
N/D. (2023) Hibridación. National Human Genome Research Institute.[Link]
glossary/Hibridacion#:~:text=Definición,moléculas%20de%20una%20sola%20hebra.
ÓM
Fluoróforos
Fluorocromos
2*2 cm
10,000
Murrieta, n (2019(dna MICROARRAYS: applications in microbiology.
[Link]
Murrieta, n (2019(dna MICROARRAYS: applications in microbiology.
[Link]
1. Verdes= genes
inhibidos
2. Rojos= genes
sobre expresados
3. Amarillo= misma
condición
Medición
APLICACIONES
1. Análisis del nivel de expresión
génica (infecciones, dx, tumores,
fármacos, función)
2. Genotipicación (detectar
mutaciones)
3. Detección del número de copias
del ADN (pronóstico de
tumores=genoma, oncogenes)
La dirección de la flecha indica el fluorocromo con que se marca la
muestra (base: rojo y punta verde). A: varias muestras apareadas de Moreno, V(2014). “Uso de chips de ADN (microarrays) en medicina: fundamentos técnicos y
dos condiciones (A/B). B: cada muestra (A, B, C) se hibrida con una
procedimientos básicos para el análisis estadístico de resultados de. [Link]
referencia común (R). C: diseño circular de 3 muestras. D: diseño
factorial, que permite evaluar simultáneamente 2 factores como revista-medicina-clinica-2-articulo-uso-chips-adn-microarrays-medicina-13057538
tipode tejido (A/B) y tratamiento (1/2).
Protocolo de experimentos
con microarreglos
ScanAlyze
Moreno, V(2014). “Uso de chips de ADN (microarrays) en medicina: fundamentos técnicos y procedimientos básicos para el análisis
estadístico de resultados de. [Link]
13057538
Affymetrix Human Genome U133
plus 2.0 Array, Thermo Fisher
scientific, USA
1. 24 muestras de tumor NPC
primario
2. 24 muestras de tejido epitelial
nasofaríngeo normal
Se identificaron 181 genes de alta
expresión de hipometilación.
Se encontraron 6 genes centrales
que podrían servir como
marcadores
Han, B; et al (2020) DNA methylation biomarkers for nasopharyngeal carcinoma. National Library of
Medicine.[Link]
Conclusiones
Evalúa miles de hipótesis
simultáneamente
Oncología
Verificación por otras
técnicas
Gracias