TEMA 8.
TRADUCCIÓN
1.-INTRODUCCIÓN
1.1.-Los ribosomas
1.2.-Los ARN de transferencia
2.-AMINOACIL-ARNt SINTETASAS
3.-ESTRUCTURA DE LOS RIBOSOMAS
4.-INICIACIÓN
4.1.-Inicio de la traducción en bacterias
4.2.-Inicio de la traducción en eucariotas
5.-ELONGACIÓN
6.-TERMINACIÓN Y RECICLAJE DE RIBOSOMAS
7.-RESCATE DE LOS RIBOSOMAS
7.1.-Rescate de los ribosomas en bacterias
7.2.-Rescate de los ribosomas en eucariotas
8.-ANTIBIÓTICOS CON DIANA EL RIBOSOMA
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015
1.-INTRODUCCIÓN
I. La traducción es la producción de una
proteína a partir de la información en un
ARNm
II. Los ARNt leen el ARNm mediante el
emparejamiento de bases de 3 nucleótidos
III. Cada uno de los ARNt lleva un
aminoácido específico en el extremo 3 '.
Los aminoácidos se unen a los ARNt por las
sintetasas de aminoacil-ARNt
IV. La traducción tiene cuatro etapas
principales: iniciación, elongación,
terminación y reciclaje de ribosomas.
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.1: Overview of Translation Figure 11-01
1.1.-Los ribosomas
Los ribosomas realizan la traducción
Los ribosomas tienen subunidades pequeñas
que descifran el RNAm y las grandes median
la formación de los enlaces
Los ribosomas se mueven de 5 'a 3' a lo largo
de una molécula de ARNm
Las proteínas se sintetizan a una velocidad de
aproximadamente 15 aminoácidos por
segundo.
Los factores de traducción (a menudo
GTPasas) se asocian con ribosomas y
ayudan con la traducción.
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.1: Overview of Translation Figure 11-02
1.2.-Los ARN de transferencia
Los ARN de transferencia (ARNt) descifran
los ARNm y transportan aminoácidos
Los ARNt son pequeños ARN de ~ 75-94
nucleótidos. Cada ARNt es específico de un
determinado aminoácido.
El ARNt se compone de cuatro regiones de
ARN bicatenario, que incluyen 3 lazos y un
tallo receptor que une el aa.
El bucle anticodón tiene tres nucleótidos que
se emparejan con el codón en el ARNm
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.2: tRNA and the Genetic Code Figure 11-03
1. Cada codón o triplete es especifica para un solo
aminoácido (un codón con sentido) o ningún aminoácido
(codón de parada o stop; codón sin sentido).
2. El código de triplete es un código degenerado que codifica
para 20 aminoácidos.
3. El que sea degenerado, significa que varios codones
codifican para un mismo aminoácidos.
4. Los diferentes ARNt que transportan los mismos
aminoácidos se denominan isoaceptores.
5. Hay alrededor de 40 ARNt para los 61 codones
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.2: tRNA and the Genetic Code Figure 11-05
El codón interactúa con el anticodón:
Las dos primeras posiciones en el ARNm
(lectura de 5’ a 3') se leen mediante el
estricto emparejamiento de bases de
Watson-Crick con las posiciones 2 y 3 del
anticodón.
En la tercera posición del codón, se
permiten desviaciones de
emparejamiento; esto se denomina
emparejamiento de oscilación. El
emparejamiento de Wobble o no Watson-
Crick permite que el mismo tRNA puede
interpretar tanto UUU como UUC (a)
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.2: tRNA and the Genetic Code Figure 11-06
https://www.youtube.com/watch?v=z2sICp8E1BA
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015
Algunos codones se usan con menos frecuencia que otros y
tienden a ser decodificados por ARNt más raros
El código genético es casi el mismo en todos los
organismos: el AUG generalmente codifica la metionina, y
generalmente hay tres codones de parada (UAA, UAG y
UGA)
Hay excepciones al código universal. Por ejemplo, las
mitocondrias decodifican AUA como metionina (por lo que
hay dos codones de metionina en lugar de uno)
En Mycoplasma, UAG codifica triptófano en lugar de ser un
codón de parada.
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.2: tRNA and the Genetic Code
a) Los ribosomas se mueven a lo largo del ARNm, leyendo
codones (3 nucleótidos) secuencialmente.
b) Si el ribosoma se mueve por un número diferente de
nucleótidos (un número que no es múltiplo de tres), el marco
de lectura se desplaza.
c) Si el marco se desplaza, el ribosoma lee diferentes codones
y se produce un péptido diferente. El cambio de marco
ocurre con mayor frecuencia +1 (azul) o -1 (rosa) nucleótidos
del original.
Craig et al: Molecular Biology 11.13: Recoding: Programmed Stop Codon
Copyright © Oxford University Press 2015 Read-Through and Frameshifting Figure 11-47
2.-AMINOACIL-ARNt SINTETASAS
La aminoacilación une los aminoácidos a los ARNt. Esto se
realiza mediante las aminoacil sintetasa en un proceso de dos
pasos que requiere ATP. La enzima para un aminoácido
cualquiera se denota aaRS. Ejemplo: GlyRS
Para que se produzca la reacción el aminoácido se activa
mediante la unión de ATP. Esto libera pirofosfato y
proporciona energía.
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.3: Aminoacyl-tRNA Synthetases Figure 11-07
El aminoacil-adenilato
activado permanece unido
a la enzima.
La enzima transfiere a
continuación el aminoácido
al 2 'o 3' OH de la ribosa de
la adenosina terminal en la
cola del tRNA CCA-3’.
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.3: Aminoacyl-tRNA Synthetases Figure 11-07
Cada aminoácido tiene su propia aminoacil-tRNA
sintetasa. El aminoácido específico con el que se
carga un ARNt se indica con un superíndice de tres
letras, como tRNAMet
El aminoácido correcto para un
ARNt se conoce como afín:
I.La reacción es precisa: menos de
un error por 104 eventos de
aminoacilación
II.Las sintetasas de aminoacil-ARNt
reconocen los ARNt por secuencia y
características estructurales
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.3: Aminoacyl-tRNA Synthetases Figure 11-08a
Las tRNA-aminoacil sintetasa utiliza características
diferenciales de los aa para discriminar entre los diferentes aa,
como la carga el tamaño la forma la hidrofobicidad. Por
ejemplo la tRNA de glicina no cargaría a la fenilalanina porque es
demasiado grande, sin embargo aa que están relacionados son
difíciles de discriminar entonces a veces pueden entrar y a veces
hasta cargarse en tRNA para ello, la aminoacil sintetasa tiene
otro sitio activo secundario que reconoce tanto el aa cargado
como el extremo final del aminoacil del tRNA y promueve la
reacción de hidrólisis
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.3: Aminoacyl-tRNA Synthetases Figure 11-08b
Hay dos clases de aminoacil-ARNt
sintetasas clase I y II, cada una con ~ 10
miembros:
▪ La clase I une los aminoácidos al 2 'OH
de la ribosa terminal, la clase II al 3' OH (sin
consecuencias biológicas).
▪ El 3 'CCA de tRNA se muestra en rojo y la
sintetasa en azul. Las estructuras proteicas
de las dos clases son muy diferentes.
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.3: Aminoacyl-tRNA Synthetases Figure 11-09
Excepciones:
Algunas bacterias y arqueas tienen menos de 20 sintetasas;
suele faltar las que se unen a glutamina y asparagina. Para
solucionarlo, presentan diferentes estrategias:
1)Una reacción de transamidasa cambia la cadena lateral del
aminoácido unido de un ácido a una amida, produciendo ARNt
unidos a asparagina y glutamina
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.3: Aminoacyl-tRNA Synthetases Figure 11-10
Excepciones:
2)En Methanococcus jannaschii, se carga una serina
fosforilada, que por una cisteína desulfurasa se convierte en
cisteína .
Serina fosforilada Cisteína
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.3: Aminoacyl-tRNA Synthetases Figure 11-10
3.-ESTRUCTURA DE LOS RIBOSOMAS
Los ribosomas catalizan la formación de enlaces peptídicos
entre aminoácidos:
Los ribosomas son grandes - 2.5MDa a 4MDa
La subunidad pequeña lleva a cabo las interacciones entre
ARNm y ARNt
La subunidad grande cataliza la formación de enlaces y
tiene un túnel de salida a través del cual emerge el polipéptido
en crecimiento; esto a menudo es una diana para los
antibióticos
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.4: Structure of the Ribosome
La subunidad grande en bacterias también tiene un segundo ARN: el ARN 5S. Los
eucariotas tienen el ARN 5.8S
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.4: Structure of the Ribosome Figure 11-11
Los ARNr se dividen en dominios. Por ejemplo, el 16S en bacterias (18S en
eucariotas) tiene 3 dominios mayores y uno menor (a). El 23S en bacterias
(o 28S en eucariotas) tiene seis dominios (b). En la subunidad pequeña,
cada dominio se pliega de forma independiente(c; izquierda), mientras que
en la subunidad grande están entrelazados (c; derecha.
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.4: Structure of the Ribosome Figure 11-15
La interfase entre las subunidades pequeñas y grandes del
ribosoma donde el tRNA interacciona y realiza su función, es
rica en rRNA y relativamente pobre en proteínas mientras
que la parte exterior es rica en proteínas, estas proteínas
tienen unas estructuras raras que presentan una parte
globular en la parte exterior del ribosoma y brazos muy largos
que se extienden en el interior del núcleo del ribosoma hacia
el rRNA
Se encuentran capas adicionales de proteínas y ARN con
la complejidad creciente del organismo
Las funciones de estos componentes adicionales no se
entienden claramente
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.4: Structure of the Ribosome Figure 11-14
Los ARNt se unen sucesivamente en tres sitios dentro del
ribosoma: el sitio de salida (E), el sitio aminoacilo (A), el
sitio peptídico (P)
5´- -3´
https://www.lifeder.com/ribosomas/
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.5: The Translation Cycle: The Ribosome in Action Figure 11-16
4.-INICIACIÓN
El AUG indica el comienzo del marco de lectura abierto
(ORF=Open Reading Frame). Esta secuencia es identificada
por factores de iniciación (IF), el ribosoma y un iniciador de
tRNA de metionina.
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.5: The Translation Cycle: The Ribosome in Action Figure 11-17
La iniciación temprana involucra la subunidad ribosómica
pequeña, y luego la unión de la subunidad grande. El
ribosoma ahora está listo para moverse a lo largo del ARNm:
1)La pequeña subunidad ribosómica identifica el codón de
inicio en un ARNm
2)Un metionil-tRNA se carga en el sitio P del ribosoma, y
los pares de bases con el codón de inicio
3)La gran subunidad ribosómica se une al complejo
Craig et al: Molecular Biology 11.7: Translation Initiation - Shared
Copyright © Oxford University Press 2015 Features in Bacteria and Eukaryotes
El codón iniciador suele ser AUG, decodificado por el ARNt iniciador. Esto
difiere entre eucariotas (tRNAiMet; a) y bacterias (tRNAfMet; a) donde aparece
un grupo formilo.
Diferentes GTPasas están involucradas en la unión de metionil-tRNA al
sitio P en eucariotas y bacterias.
El iniciador bacteriano tRNA tiene bases de wobble C-A en el tallo aceptor.
El iniciador eucariota tiene un par A-U en el tallo aceptor
Ambos tienen tres pares G-C en el tallo anticodón.
Craig et al: Molecular Biology 11.7: Translation Initiation - Shared
Copyright © Oxford University Press 2015 Figure 11-22
Features in Bacteria and Eukaryotes
4.1.-Inicio de la traducción en Bacterias
Los ARNm bacterianos a menudo son policistrónicos, con varios marcos de
lectura abiertos
Cada marco de lectura abierto tiene su propio codón de inicio y parada
Los codones de iniciación generalmente tienen una secuencia Shine-
Dalgarno: generalmente una secuencia de polipurina de 6-8 bases aguas
arriba del iniciador AUG
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.8: Bacterial Translation Initiation Figure 11-23
La secuencia Shine-Dalgarno tiene la secuencia consenso
AGGAGGU, y se empareja con una región de pirimidina en
el extremo 3 'del ARNr bacteriano 16S (la secuencia anti-
Shine-Dalgarno).
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.8: Bacterial Translation Initiation Figure 11-24
Tres factores de iniciación ayudan a guiar
a f-Met-tRNAMet al sitio P: IF1, IF2 e IF3:
a)IF3 e IF1 se unen en las sedes E y A
b)El ARNt iniciador se dirige al sitio
c)IF2 es una GTPasa proporciona la energía
para unir las subunidades ribosómicas
grandes y pequeñas (b)
Los tres factores de iniciación se disocian
una vez formado el ribosoma
“A los 31 vais a ser 2 en casa”
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.8: Bacterial Translation Initiation Figure 11-25
4.2.-Inicio de la traducción en eucariotas
No hay equivalente en eucariotas a las secuencias Shine-
Dalgarno y anti-Shine-Dalgarno
La iniciación generalmente ocurre en el primer AUG en el
ARNm, pero esto a veces es ineficiente y se produce más
iniciación en el segundo o tercer AUG
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.9: Eukaryotic Translation Initiation Figure 11-26
https://www.youtube.com/watch?v=YoyFpumWtHo
“De este video mirar solo el mecanismo. No memoricéis los Factores de Iniciación”
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015
(1)
complejo
cerrado
En los eucariotas el mRNA 5 'cap y 3' poli (A) cola también están involucrados
en la iniciación.
La caperuza interacciona con eI F4E y la cola con PABP con eIF4G. Estos
interactúan entre sí a través de un complejo de otros factores (1) y forman un
complejo cerrado (1) para realizar un control de calidad del ARNm
“En Cuarto el que tiene EGo es PABlo Picazo
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.9: Eukaryotic Translation Initiation Figure 11-27
(2) (3) Identificación AUG
complejo de
preiniciación
La subunidad ribosómica 40S, unida a varios factores de iniciación, está
preparada para escanear el ARNm. Esto se denomina complejo "48S" o complejo
de preiniciación (2):
✓ EIF1 y e1F1A, ortólogos de bacterias IF3 e IF1, se unen en los sitios A y E
✓ El complejo es llevado al circuito cerrado de RNAm mediante interacciones con
eI F3 y eI F4G (2)
✓ IF4A y eIF4B desenrollan la estructura secundaria y permiten que el ARNt
iniciador verifique los codones de un AUG adecuado (3)
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.9: Eukaryotic Translation Initiation Figure 11-27
(4)
Unión subunidad
grande
Los factores de iniciación se disocian y el IF2 eucariota (eIF5B) cataliza la unión
de la subunidad grande (4)
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.9: Eukaryotic Translation Initiation Figure 11-27
5.-ELONGACIÓN
La elongación consiste en la
decodificación, y la
formación de enlaces
peptídicos y translocación.
El ribosoma elige un aminoacil-
ARNt con un anti-codón
complementario al codón de
ARNm. La interacción codón /
anti-codón es afín (totalmente
precisa), casi afín (desajuste
único) y no afín (más de un
desajuste)
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.5: The Translation Cycle: The Ribosome in Action Figure 11-17
Etapas de la elongación
A.-Cargar el siguiente aminoácido (sede A)
El factor de elongación (EF) en bacterias es el EFTu y en eucariotas el
eEF1A en eucariotas. Estos factores de elongación cargan el siguiente
tRNA cargado en la sede A del ribosoma.
Ejemplo: EFTu
Protein translation - Ribosoma - Wikipedia, a enciclopedia libre
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.5: The Translation Cycle: The Ribosome in Action Figure 11-17
B.-Formación de enlaces peptídicos (entre A y P)
La formación de enlaces peptídicos se cataliza entre el aminoácido en la
sede P y el aminoácido en la sede A y transferencia del polipéptido a la
sede A por la peptidil transferasa
La formación de enlaces peptídicos implica la transferencia de la cadena de
polipéptidos al aminoacil-ARNt del sitio A (a). La transferencia consiste en un
ataque nucleofílico del aminoácido que está en A al que está en P.
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.5: The Translation Cycle: The Ribosome in Action Figure 11-17
C.-Movimiento a través del ribosoma
EFG en bacterias; EF2 en eucariotas promueve el movimiento del ARNm-ARNt a
través del ribosoma. Esto mueve el peptidil-tRNA que estaba en la sede A a la sede
P y trae un nuevo codón a la sede A. El ARNt en la sede E sale del ribosoma (a).
EFG puede unirse en el sitio A y parece
promover los reordenamientos
estructurales (b).
Craig et al: Molecular Biology 11.10: Translation Elongation: Decoding,
Copyright © Oxford University Press 2015 Figure 11-31
Peptide Bond Formation, and Translocation
La traducción continúa hasta que el ribosoma encuentra un
codón stop.
1)Los factores de liberación (RF: release factors) de clase 1,
son los que reconocen los codones de parada y no los ARNt.
2)Los factores de liberación (RF) también promueven la
liberación hidrolítica del péptido terminado
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.11: Translation Termination and Reinitiation Figure 11-32
Los RF de clase I en bacterias y eucariotas no están relacionados, pero tienen
el mismo motivo GGQ (Gly-Gly-Gln) necesario para la catálisis (a, b)
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.11: Translation Termination and Reinitiation Figure 11-33
También se necesitan RF de clase II, GTPasas, para la terminación. Por ejemplo,
en bacterias, RF3-GTP promueve la disociación de RF1 / 2 después de la
liberación del péptido (Figure 11-34a)
La eRF3 eucariótica de clase II interactúa con eRF1 antes de asociarse con el
ribosoma. Otro factor AAA+ ATPasa ABCE1, se une a eRF1 y libera el péptido
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015
El reconocimiento del codón stop es muy preciso. Los
errores de decodificación ocurren cuando hay escasez de
alguno de los aminoacil-ARNt. Una falta de coincidencia en la
hélice codon / anti-codon en el sitio P induce a una terminación
temprana. El péptido defectuoso se detecta y luego se
degrada.
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.11: Translation Termination and Reinitiation Figure 11-35
Una vez finalizada la traducción, se debe liberar el ribosoma para poder ser
reutilizado. En bacterias, el factor de reciclaje de ribosomas (RRF) actúa
con EFG y promueve el desmontaje. El ARNt y el ARNm se caen de la
pequeña subunidad, que se estabiliza con IF3
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.11: Translation Termination and Reinitiation Figure 11-36a
En eucariotas, eRF1 permanece unido después de la
liberación del péptido y promueve la disociación. La ATPasa
ABCE1, ayuda a la disociación de los ribosomas. Los
factores de iniciación eIF1, eIF1a y eIF3 se unen y
estabilizan las subunidades ribosómicas disociadas.
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.11: Translation Termination and Reinitiation Figure 11-36b
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.11: Translation Termination and Reinitiation
6.-TERMINACIÓN Y RECICLAJE DE RIBOSOMAS
1) La terminación ocurre cuando el
ribosoma alcanza un codón stop. Los
codones stop son reconocidos por factores
de liberación de clase I, no por ARNt.
En bacterias: RF1 reconoce UAA y UAG,
RF2 - UAA y UGA.
En eucariotas: eRF1 reconoce los tres
codones de parada.
2) Las subunidades grandes y pequeñas
del ribosoma se disocian.
3) El factor de reciclaje RRF y EFG ayudan
a la disociación en bacterias
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.5: The Translation Cycle: The Ribosome in Action Figure 11-17
7.-RESCATE DE LOS RIBOSOMAS
Los ribosomas a veces pueden detenerse y los complejos
parados deben ser rescatados:
I.El ARNm asociado se tiene que degradar
II.La proteína que se sintetiza está destinada a la proteólisis.
III.El ribosoma se recicla.
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.12: Ribosome Rescue in Bacteria and Eukaryotes Figure 11-37
7.1.-Rescate de los ribosomas en bacterias
Debido a que la transcripción y la traducción no están
separadas espacialmente en bacterias, la traducción puede
ocurrir en ARNm truncados (en eucariotas los dos procesos
están separados espacial y temporalmente).
Los ribosomas se estancan cuando alcanza el final de un
ARNm y no encuentran un codón de parada (truncado). En
este momento el ribosoma no puede desmontarse y los
factores de liberación no pueden actuar
Los ARNm bacterianos truncados son tratados por los
“Transfer-messenger RNA” o “tmRNA”. El tmRNA es un
ARN bacteriano con propiedades duales de ARNm y ARNt
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.12: Ribosome Rescue in Bacteria and Eukaryotes Figure 11-38
1) Un tmARN actúa como un ARNt y agrega una alanina al péptido, luego actúa como
un ARNm con un corto ORF y un codón de terminación
2) El “ARNm” corto del tmARN se traduce luego en una “etiqueta” de 11 aminoácidos,
unida al péptido traducido previamente.
3) La "etiqueta" señala la degradación del péptido completo
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.12: Ribosome Rescue in Bacteria and Eukaryotes Figure 11-38
Los “tmRNA” no interfiere con la traducción correcta. La actividad de esta
molécula se debe al propio “tmRNA” y su proteína asociada SmpB (a):
a)SmpB se coloca donde se coloca el bucle anticodón en un tRNA (b)
b)tmRNA-SmpB se une en la sede ribosómico A y la cola de SmpB se inserta en el
canal de ARNm
“La SieMPre Buena”
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.12: Ribosome Rescue in Bacteria and Eukaryotes Figure 11-39
7.2.-Rescate de los ribosomas en Eucariotas
En eucariotas solo los RNAm completos son traducidos por la
presencia de PoliA y la Cap5’, pero los ribosomas se pueden
estancar si hay poca abundancia de tRNA, o el RNA forma una
estructura que impide el avance del ribosoma, en este caso se
activa la ruta de no-go-decay (NGD) que degrada el RNAm
mediante nucleasas y la proteína por ubiquitinación se dirigen
al proteosoma, el ribosoma se rescata mediante factores de
terminación para su reciclaje.
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.12: Ribosome Rescue in Bacteria and Eukaryotes Figure 11-41
8.-ANTIBIÓTICOS CON DIANA EL RIBOSOMA
Pequeñas diferencias en la traducción entre
bacterias y eucariotas IMPLICA que algunos
buenos antibióticos SEAN aquellos que se dirigen
al ribosoma y otras proteínas de traducción.
Este tipo de antibiótico actúa a diferentes niveles:
Ejemplos:
1)Iniciación: kasugamicina
2)Unión de aminoácido a su ARNt: tetraciclina
3)Transferencia peptídica: cloranfenicol
4)Bloquean túnel de salida: eritromicina
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.14: Antibiotics that Target the Ribosome Figure 11-50
Las bacterias pueden desarrollar resistencia a los
antibióticos. Las mutaciones que confieren resistencia a
menudo se encuentran en partes del ribosoma. La ubicación y
la actividad de las mutaciones nos pueden dar más
información sobre cómo funcionan los ribosomas.
Por ejemplo, la estreptomicina actúa como un agente de
codificación errónea, lo que hace que los ribosomas lean mal
el ARNm, por lo que las proteínas están llenas de errores
Las bacterias resistentes a la estreptomicina tienen
mutaciones cerca del sitio de unión a la estreptomicina.
Craig et al: Molecular Biology
Copyright © Oxford University Press 2015 11.14: Antibiotics that Target the Ribosome