ENZIMAS
ENZIMAS
Las enzimas
Benjamin Franklin
Capítulo I. Las enzimas
Las enzimas
69
CREMOSI, P., L’uso degli enzimi nella pulitura di oprer policrome, Ed. Il prato, Padova, 2002, p.
15.
70
Los catalizadores son sustancias que aumentan la velocidad o proporción de las reacciones químicas
sin que ellas cambien en el proceso (ni el enzima ni la reacción).
71
CREMOSI, P., L’uso degli enzimi nella pulitura di oprer policrome, Ed. Il prato, Padova, 2002, p.
25.
72
LEHNINGER, A., NELSON, D., COX, M., Principios de Bioquímica 4º Edición, Ed. Omega,
Barcelona, 2006, p. 190.
41
Tesis Doctoral 2011. Capítulo I
Para comprender cómo funcionan las enzimas, es necesario saber qué son y conocer
la importancia de su estructura.
Las enzimas son proteínas globulares
formadas por una o más cadenas
polipeptídicas[74] plegadas, creando una
“hondonada” donde encaja el sustrato y tiene
lugar la reacción. Esta zona de la enzima se
denomina centro activo y sólo unos pocos
aminoácidos están implicados en él.
[75]
La proximidad de los aminoácidos en el
centro activo está determinada por la
Figura 1[73]. Enzima con un sustrato (azul)
estructura terciaria, aunque también pueden
unido al centro activo (hondonada) con un
ocupar posiciones adyacentes en la estructura
amino ácido clave del sitio activo (rojo).
primaria. En una enzima con estructura
cuaternaria, los aminoácidos del centro activo pueden encontrarse incluso en
diferentes cadenas.
La configuración tridimensional del centro activo es complementaria a la del sustrato
y posee una distribución complementaria de sus cargas sobre la superficie de unión.
Es decir, si una región del sustrato tiene una carga negativa, la zona correspondiente
del centro activo tendrá una carga positiva y viceversa.
En 1894, Emil Fischer, un químico alemán, comparó la especificidad de la enzima
[76]
con una llave y su cerradura . Pero, estudios posteriores sugirieron que el centro
activo es más flexible que el ojo de una cerradura: la unión entre la enzima y el
sustrato altera la conformación de la enzima, ajustando el centro activo al sustrato. Se
73
Fotografía del libro Principios de bioquímica. Muchos de los datos mencionados en este capítulo
están extraídos de este libro. LEHNINGER, NELSON, COX, Principios de Bioquímica, 2º Edición,
Ed. Omega, Barcelona, 1995, p. 191.
74
Los polipéptidos (péptidos grandes) están formados por aminoácidos (más de 10 amino ácidos por
péptido). Cuando los polipéptidos son lo suficientemente grandes y tienen estructuras tridimensionales
estables podemos hablar de proteínas.
75
Un aminoácido está formado por un amino (-NH2) y un grupo carboxílico (-COOH ácido)
76
ALDABE, J., HUETO, A., JUNI, J., LÓPEZ, P., Biología, Ed. Erein, 1998, p. 125.
42
Capítulo I. Las enzimas
piensa que este cambio inducido puede crear cierta tensión en las moléculas reactivas
y facilitar de esta manera la reacción.
I.2.2 El catalizador
43
Tesis Doctoral 2011. Capítulo I
80
Grafico del libro LEHNINGER, NELSON, COX, Principios de Bioquímica, 2º Edición, Ed.
Omega, Barcelona, 1995.
81
En algunas ocasiones el producto inhibe la enzima, regulando de esta forma la actividad enzimática.
82
LEHNINGER, A., NELSON, D., COX, M., Principios de Bioquímica, 4º Edición, Ed. Omega,
Barcelona, 2006, p. 193.
44
Capítulo I. Las enzimas
83
Esquema similar al que encontramos en el libro LEHNINGER, A., NELSON, D., COX, M.,
Principios de Bioquímica 4º Edición Ed. Omega Barcelona 2006, p198.
84
LEHNINGER, A., NELSON, D., COX, M., Principios de Bioquímica, 4º Edición, Ed. Omega,
Barcelona, 2006, p. 195.
45
Tesis Doctoral 2011. Capítulo I
En los seres vivos, las maneras para regular la actividad enzimática son diversas.
Existen rutas metabólicas que están formadas por grupos de enzimas que actúan
conjuntamente en el metabolismo celular. Las enzimas trabajan en serie, formando
vías enzimáticas, de forma que el producto de una enzima constituye el sustrato de la
siguiente.
Todas las rutas metabólicas pueden ser controladas por enzimas reguladoras. Éstas
varían su actividad dependiendo de ciertas señales y normalmente la primera enzima
de la ruta es la reguladora. Ésta se llama el punto de compromiso de la vía.
La actividad de estas enzimas se modula por diferentes moléculas señal, que
generalmente son metabolitos de poco peso molecular o cofactores.
85
ALDABE, J., HUETO, A., JUNI, J., LÓPEZ, P., Biología, Ed. Erein, 1998, p. 126.
46
Capítulo I. Las enzimas
1. Cofactores
2. Coenzimas
Las moléculas orgánicas que actúan como cofactores se denominan coenzimas. Éstas
se unen de manera temporal o permanente a la enzima en una zona bastante próxima
al centro activo.
86
LEHNINGER, A., NELSON, D., COX, M., Principios de Bioquímica, 4º Edición, Ed. Omega,
Barcelona, 2006, pp. 191-192.
87
CREMOSI, P., L’uso degli enzimi nella pulitura di oprer policrome, Ed. Il prato, Padova, 2002, p.
25.
47
Tesis Doctoral 2011. Capítulo I
La actividad enzimática viene limitada por diferentes factores como puede ser la
concentración de enzimas, de sustrato y la disponibilidad de cofactores.
88
Vmax: velocidad máxima. ALDABE, J., HUETO, A., JUNI, J., LÓPEZ, P., Biología, Ed. Erein,
1998, p. 126.
89
LEHNINGER, A., NELSON, D., COX, M., Principios de Bioquímica, 4º Edición, Ed. Omega,
Barcelona, 2006, p. 203.
48
Capítulo I. Las enzimas
1. La temperatura
2. El pH
90
Grafico obtenido del libro ALDABE, J., HUETO, A., JUNI, J., LÓPEZ, P., Biología, Ed. Erein,
1998, p. 128.
91
LEHNINGER, A., NELSON, D., COX, M., Principios de Bioquímica, 4º Edición, Ed. Omega,
Barcelona, 2006, p. 212.
49
Tesis Doctoral 2011. Capítulo I
I.3.5 Inhibición
Los inhibidores son sustancias que disminuyen, o incluso anulan, la velocidad de las
reacciones catalizadas por enzimas.
50
Capítulo I. Las enzimas
92
Figura inspirada en esquemas del libro LEHNINGER, A., NELSON, D., COX, M., Principios de
Bioquímica, 4º Edición, Ed. Omega, Barcelona, 2006, pp. 209-212.
51
Capítulo I. Las enzimas
96
Mucha de la información expuesta en este capítulo, ha sido extraída del libro de CREMONESI, P.,
L’uso degli enzimi nella pulitura di opere policrome, Ed. Il prato, Padova, 2002.
57
Tesis Doctoral 2011. Capítulo I
Proteasas
R R O R O
H H
N N
H2N OH
N N
O H O H O O
R R
Figura 9. Endopeptidas
a. La tripsina (EC.[Link])
97
Esta información y figuras han sido extraídas del libro de CREMONESI, P., L’uso degli enzimi
nella pulitura di opere policrome, Ed. Il prato, Padova, 2002.
98
BANIK, G., CREMONESI, P., LA CHAPELLE, A., MONTALBANO, L., Nuove metodologie nel
restauro del materiale cartaceo, Ed. Il Prato, Padova, 2003, p.43-44
58
Capítulo I. Las enzimas
Por lo tanto, las proteasas son enzimas de la clase 3.4 y podemos encontrar a parte de
las mencionadas anteriormente, las siguientes enzimas [101] proteolíticas:
99
BANIK, G., CREMONESI, P., LA CHAPELLE, A., MONTALBANO, L., Nuove metodologie nel
restauro del materiale cartaceo, Ed. Il Prato, Padova, 2003, p. 43.
100
Estas tres enzimas proteolíticas tienen un pH neutro o básico, sin embargo existen enzimas como la
pepsina que necesitan un pH ácido 5-6 para conseguir la actividad enzimática óptima.
101
En el libro de CREMONESI, P., L’uso degli enzimi nella pulitura di oprer policrome, Ed. Il prato,
Padova, 2002 p. 34, existe una tabla resumen con las principales hidrolasas.
59
Tesis Doctoral 2011. Capítulo I
Estas enzimas lipolíticas, tienen como función principal catalizar la hidrólisis de los
triglicéridos, liberando gliceroles. Es decir que, al hidrolizar las uniones de los
esteres de los triglicéridos, provocan que los productos creados puedan ser
eliminados en un medio acuoso al ser más solubles [figura 11]. Los productos
creados son monoglicéridos, diglicéridos o gliceroles. Estas enzimas suelen requerir
un pH neutro o alcalino de 7-7,5 a 9.
La lipasa más empleada en el mundo de la restauración es la lipasa proveniente de
[102] [103]
candida cylindracea. Wolbers y Cremonesi entre otros, emplean esta lipasa
para la limpieza de lienzos o la eliminación de Paraloid® B-72 [104].
60
Capítulo I. Las enzimas
Las amilasas, enzimas glucolíticas, hidrolizan los enlaces éter (glucosídicos) de las
cadenas de los polisacáridos de las sustancias amiláceas, degradándolas a
oligosacáridos, disacáridos y monosacáridos, que son más solubles en medios
[106 y 107]
acuosos [Figura 12] . De esta manera conseguiremos eliminar el almidón de
forma más sencilla.
Al igual que las proteasas, las amilasas pueden hidrolizar las uniones glucosídicas
internas de los polisacáridos (endo-amilasas) y las que se encuentran en las
extremidades de las cadenas (exo-amilasas). Siendo las terminales más fáciles de
degradar para las amilasas que las interiores.
También, se encuentran unas enzimas muy específicas llamadas glucoamilasas. Estas
proteínas pueden degradar las uniones glucosídicas de las cadenas lineares que
poseen uniones 1,4 glucosídicas y las uniones de las ramificaciones laterales con
uniones 1,6 glucosídica.
Estas enzimas que hidrolizan enlaces glucosídicos son de la clase 3.2.1 y podemos
encontrar diferentes tipos de amilasas:
106
CREMOSI, P., L’uso degli enzimi nella pulitura di oprer policrome, Ed. Il prato, Padova, 2002,
pp. 36-37.
107
BANIK, G., CREMONESI, P., LA CHAPELLE, A., MONTALBANO, L., Nuove metodologie nel
restauro del materiale cartaceo, Ed. Il Prato, Padova, 2003, pp. 39-40.
61
Tesis Doctoral 2011. Capítulo I
Las amilasas necesitan normalmente una temperatura de 30-39 ºC, una concentración
[108]
de 0,5 % peso/volumen y un pH neutro de 6,5 a 7,5. No obstante, encontramos
diferencias dependiendo del origen de la enzima. Por ejemplo la amilasa derivada de
A. oryzae necesita un pH de 5 a 7 mientras que la extraída de la cebada su pH varía
de 4,7 a 5,8.
Por otro lado, es importante saber que las amilasas necesitan en general iones de
calcio para tener una actividad enzimática correcta.
Las amilasas derivadas de B subtilis (necesitan 150 ppm Ca2+) y las de B.
licheniformis (precisan 5 ppm Ca2+) requieren además iones de sodio.
Las proteasas pueden ser sintetizadas de diferentes maneras y tener una procedencia:
108
Este porcentaje aparece en el artículo de GUPTA, C.B, “Recent development in the treatment of
water damaged documents” Conservation of manuscripts and documents: problems and prospects.
Proceedings of the National Seminar held at Bharat Kala Bhawan, Varanasi, December 14 to 16,
1990 / Agrawal, O.P., Ed. INTACH, Lucknow, India, 1992, pp. 69-73.
62
Capítulo I. Las enzimas
[109]
Se obtienen de tres formas diferentes, como el resto de las enzimas . En las
enzimas lipolíticas encontramos:
- Lipasas
- Esterasas
109
CREMOSI, P., L’uso degli enzimi nella pulitura di oprer policrome, Ed. Il prato, Padova, 2002,
p. 33.
63
Tesis Doctoral 2011. Capítulo I
1. De origen animal:
La amilasa salival o ptialina se obtiene de la saliva.
La amilasa pancreática se extrae de tejidos del páncreas.
No se debe emplear las enzimas producidas en el estomago porque necesitan
mucha acidez para activarse y pueden provocar que los protoenzimas se
activen.
2. De origen vegetal: existen amilasas que podemos conseguir de los tubérculos.
3. De origen microbiana:
La α-amilasa y β-amilasa se obtienen de diferentes microorganismos y
hongos; de diversas bacterias sobre todo del Bacillus y de hongos, en
particular el Aspergillus.
Para utilizar las enzimas sin ningún temor, se debe conocer de antemano la
naturaleza química del estrato a eliminar y de los estratos subyacentes. Para ello es
conveniente hacer un estudio estratigráfico para averiguar si el estrato que deseamos
suprimir, posee o no la misma naturaleza que un estrato original subyacente, y si este
110
BANIK, G., CREMONESI, P., LA CHAPELLE, A., MONTALBANO, L., Nuove metodologie nel
restauro del materiale cartaceo, Il Prato, Padova, 2003, pp. 39-40.
64
Capítulo I. Las enzimas
último está protegido por otro estrato (como un barniz) que le pudiese preservar de la
actividad enzimática.
Por otro lado, en el caso de que la superficie pictórica no admitiese ser mojada, por
diferentes causas, las enzimas pueden ser aplicadas en geles o en microgotas
disueltas en algún disolvente. Y si por el contrario, lo que sucede es que la capa
pictórica es hidrófuga, el empleo de enzimas se realiza con un surfactante no iónico.
111
FELLER, R., STOLOW, N., JONES E., Picture Varnishes and Their Solvents, Ed. Natiolnal
Gallery of Art, Washintong D.C., 1985.
112
GARABELLI, G., “Unità di metodologia e applicazione di prodotti biologici nelle operazioni di
restauro di sculture policrome”, OPD restauro N. 10, 1998, p. 47, 112-120, 132-133
65
Tesis Doctoral 2011. Capítulo I
[113]
El siguiente esquema, nos indica los pasos que debemos seguir para elegir un
tipo de enzima específica [Tabla 4].
Como podemos ver en el esquema, la naturaleza del sustrato a eliminar así como los
materiales que constituyen la obra de arte, determinan el tipo de hidrolasa que
debemos escoger. Es necesario e importante realizar este diagnóstico preliminar
antes de la limpieza, aunque a la hora de la verdad, por motivos económicos, los
restauradores no lo efectúen.
Una vez escogida la clase de hidrolasa, se elige el tipo comercial de la enzima
compatible con las características de la obra. Esto dependerá las condiciones óptimas
para la actividad enzimática de la proteína escogida.
113
Estos datos han sido recopilados del libro realizado por CREMONESI P., L’uso del solventi
organici nella pulitura di opere policrome. Il prato. Saonara, seconda edizione, 2004
114
CREMOSI, Paolo, L’uso degli enzimi nella pulitura di oprer policrome, Ed. Il prato, Padova, 2002
66
Capítulo I. Las enzimas
1. Temperatura
2. Actividad específica
67
Tesis Doctoral 2011. Capítulo I
3. El pH óptimo
4. El coste
1 2
3 4
6
8
7
9
10
Figura 13. Fotografía de la página SIGMA-ALDRICH con la información de la celulasa
115
[Link]
CH_CONCAT_PNO|BRAND_KEY&F=SPEC
68
Capítulo I. Las enzimas
1- Nombre de la enzima
2- Fuente biológica (origen animal, vegetal o microbiano)
3- Código del producto (en el catálogo)
4- Forma física y pureza del producto comercializado.
5- Precio de esta enzima. Cuanto más difíciles son de conseguir más caras son.
6- Sinónimos del nombre de la enzima.
7- Nomenclatura EC específica para cada tipo de enzima. Pinchando sobre
BRENDA o UBMB encontramos más información sobre esta enzima.
8- Numero CAS: es el código para la clasificación internacional de las
sustancias químicas/ bioquímicas según el “Chemical Abstract Registry
Number”. Sirve para identificar y buscar cada producto en bibliografía
especializada.
9- Numero EC: Es el numero EINECS (European Inventory of Existing
Comercial Chemicals) o numero ELINCS (European List of Notified
Chemical Substances).
10- Número MDL. Es un número de identificación de cada reacción.
M indica la reacción, FCD es la base de datos que recopila la reacción. Los
ocho dígitos son el número del producto.
11- Actividad especifica
Una vez escogida y comprada la enzima, tenemos en los botes donde viene la
enzima, toda la información relativa para el buen uso y rendimiento de esta enzima.
A continuación vamos a mostrar la fotografía de un bote, donde podemos ver
diferentes datos [Figura14].
69
Tesis Doctoral 2011.
1. Capítulo I
Nombre de la enzima
Nomenclatura de la enzima. Indica la clase.
Procedencia
Forma física del producto e indicaciones sobre su pureza
Actividad específica de la enzima
pH y temperatura óptimos
Temperatura de almacenaje
Actividad específica
Advertencias
Origen
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