BIOQUIMICA

Clase1
Un aminoácido es la unidad estructural de las proteínas. Está formado por un carbono quiral. Posee un grupo amino y un
ácido carboxílico.
El medio ambiente de las proteínas, es el medio interno nuestro, llámese las células, la sangre, líquido extracelular,
líquido intracelular o dentro de las mitocondrias. Pero la mayoría de este medio que estamos hablando, es acuoso. Las
proteínas están mayoritariamente en un medio acuoso.

Si yo tengo una proteína a la cual llamaremos proteína 1 (las proteínas tienen muchos aminoácidos, por lo menos 50).

P1: NH2 aa1 – aa2 –aa3 –aa4 – aa5COOH

R1 R2 R3 R4 R5

El guion simboliza el enlace peptídico, el enlace peptídico es un enlace que se forma entre el carboxilo del aminoácido y
el amino del grupo que sigue. Queda un grupo amino libre, el cual sería el aminoácido amino terminal, el aminoácido
primero, el número uno, tiene un grupo amino libre, porque el carboxilo de él va a participar con el grupo amino del que
sigue y el ultimo queda un grupo carboxilo libre, el cual será el aminoácido carboxilo terminar. Este es un pentapeptido,
porque tiene 5 aminoácidos. Este pentapeptido tiene 4 enlaces peptídicos. Cada uno de estos aminoácidos tiene una
cadena lateral, al que llamaremos radical.

En el caso de otra proteína, formada por los mismos aminoácidos, pero ordenados de la siguiente forma:

P2: NH2 aa3 – aa5 –aa4 –aa1 – aa2COOH

R1 R2 R3 R4 R5

Ahora cambió el aminoácido amino terminal, ahora seríe el 3, mientras el aminoácido 2 sería el aminoácido carboxilo
terminal.

¿Qué quiero mostrar con esto? Que la proteína 1, comparada con la proteína 2, la cual tiene los mismos aminoácidos en
igual cantidad y tipo, son proteínas distintas. Lo que importa es la secuencia de aminoácidos ya que influyen los
radicales, la interacción entre ellos. La proteína 1 va a tener una forma, mientras que la proteína 2 tendrá otra forma, ya
que influye la interacción entre radicales que están vecinos o lejanos.

Los aminoácidos unidos por enlaces peptídicos van a dar para determinar la forma de la proteína en el especio. Esto
determinado por el ADN, es decir, la secuencia nucleotidica en el gen, el cual se va a transformar en un ARNm y ese irá a
la maquinaria de la síntesis de proteínas.

Entonces, la forma de la proteína está determinada genéticamente ¿Por qué? Porque las proteínas tienen distintas
funciones.

Para hacer cada función, la proteína requiere una estructura particular. Una enzima tendrá que ser globular, para que
entre una molécula y se transforme, pero una proteína estructural como colágeno tendrá que ser alargada, tendrá que
soportar fuerza porque va a unir el tendón con el hueso, por lo tanto requiere otra forma ¿Quién determina la forma? La
estructura primaria ¿Y quién determina la estructura primaria? El gen. Algunas enfermedades serias que se producen
porque falta la acción de una enzima por ejemplo, esa enzima puede que esté, pero en vez de ser de esa forma que se
necesitaba por causa que tiene un aminoácido distinto ahora es de otra forma y no funciona. Entonces una mutación en
el gen puede llevar a que la proteína cambie.

No todos los aminoácidos sirven para sintetizar proteínas, los que sintetizan proteínas son 20 α aminoácidos.

H2N – C α – COOH

Un aminoácido se llama así porque este es el carbono α ¿Cuál es el grupo jerárquico más importante, el amino o el
carboxilo? El carboxilo. Por eso se llama derivado amino del ácido, no se llama acido amino. Un aminoácido α que tiene
unido a un mismo carbono el carboxilo y el amino y un hidrogeno y un radical, por lo tanto este carbono tiene 4
sustituyentes diferentes y por lo tanto es un carbono quiral. Solo los aminoácidos α L aminoácidos forman las proteínas.
L se refiere a isómeros (¿?)

PRETEINAS

Las proteínas son hétero polímeros de aminoácidos ¿Por qué hétero? Porque los monómeros pueden ser entre 20
distintos monómeros, de acuerdo al código genético y deben estar unidos por enlace peptídico. Los demás aminoácidos
(en la naturaleza hay 300 o más) tienen otras funciones, por ejemplo en a bacterias y plantas. También hay aminoácidos
que son neurotransmisores, mientras otros ayudan a formar la urea. De la gran cantidad de aminoácidos solo 20 forman
las proteínas.

Las proteínas son lineales. Es como un tren con posibilidades de tener 20 carros diferentes, en el depósito de trenes hay
de 20 tipos de carros, pero hay una proteína que tiene solo carros amarillos por ejemplo; o tiene 20 amarillos y 50
verdes, etc. Pero solo puede elegir entre 20 y uno tras de otro. Entonces, si el polímero tiene hasta 50 aminoácidos es
una proteína chica que se llama péptido. No hay que despreciarlas ya que hay hormonas que son péptidos como el
glucagón.

Si sacamos el peso promedio de un aminoácido equivale a 110 ¿Cuándo peso una molécula en qué unidad se expresa?
En uma (unidad de masa atómica) o Dalton.

En 1 dipéptido, o sea 2 aminoácidos, pero el segundo no tiene el carboxilo libre ¿Cómo se llama esta función orgánica?
Como se llama el carboxilo al cual se le ha unido eso que se formó porque reaccionó un carboxilo con una ****. Si es un
dipéptido tiene un enlace peptídico. En enlace peptídico se formó porque reaccionó el carboxilo de ese aminoácido con
el amino de este ¿Cómo se llama la función orgánica cuando reacciona un carboxilo con una amina? Amida. El enlace
peptídico es un enlace amida.

Si tenemos distintas proteínas variadas en peso molecular, por ejemplo una que pesa 3 millones y otra de 13 mil, la que
pesa 13 tiene 104 aminoácidos, mientras la otra tiene 27 mil aminoácidos. Si cada aminoácido tiene el carbono quiral,
ese carbono quiral ¿Ese carbono quiral que forma tiene? Si tiene 4 sustituyentes distintos ¿Qué hibridación tiene? tiene
hibridación sp3 y su forma espacial es tetraédrica. Ya no es plana la molécula. Imagínense con 27 mil aminoácidos y esto
es solo la unión por enlace peptídico, ya iremos viendo como ser forma la proteína en el espacio.

Hay alguna que tiene solo una cadena peptídica, mientras otras tienen varias. Cuando tienen varias quiere decir que
tiene una estructura superior.
¿Cuantos grupos amino libre tiene esta? considerando solo el amino terminal. Dos porque tiene dos cadenas peptídicas.
Y otra inmensamente grande con 27 mil aminoácidos ¿Cuántos grupos amino tiene libres si consideramos solo el amino
terminal? 1. Porque cada subunidad es una cadena peptídica y cada cadena peptídica y cada cadena péptida tiene un
amino y un carboxilo terminal, aparte de lo que pueda haber en el radical.

Cuando estamos formando una proteína, a los aminoácidos formando la proteína se le llama residuo de aminoácidos,
porque perdieron algo para formar el enlace peptídico.

Entonces los aminoacidos eran 20 L α aminoácidos ¿Qué significa α? Significa que el amino y el carboxilo está unido al
carbono que esta inmediatamente al lado de los grupos funcionales más importantes. Solo los α y los estereoisómeros
son los que sirven para sintetizar proteínas, las enzimas no reconocen a los otros. Cuando el aminoácido está puesto en
la proteína, o sea es un residuo de aminoácidos, puede sufrir alguna modificación química, por ejemplo se le puede
agregar un fosfato, entonces la proteína sabe que tiene que hacer algo porque fue modificada. Se pueden fosforilar, se
le puede agregar un OH, etc.

Otras funciones, igual importantes que no son para formar proteínas. Para formar la urea (una molécula con la cual
nosotros excretamos el nitrógeno que no ocupamos para que sea de una forma no toxica. Esto se hace en el hígado, el
hígado lo manda a la sangre y ahí el riñón lo excreta a la orina.

Otra función importante es que algunos son neurotransmisores.

Otras funciones como la de la hormona de la tiroides, no es una proteína es una molécula formada por aminoácidos
yodados, sin embargo si no tenemos hormona tiroidea tenemos un desbalance en todo el cuerpo y no es proteína, es
una hormona.

En síntesis, solo L α aminoácidos sirven para formar proteínas, los otros aminoácidos tienen otras funciones que no son
formar proteínas pero son igual de importantes.

Si acaso un aminoácido pierde su grupo carboxilo ¿Cuál es el grupo funcional que queda? Por lo tanto este que tenía dos
grupos funcionales y podía actuar como acido o como base, ahora va a ser una base, una amina. Si se pierde el grupo
amina, se transforma en una molécula acida.

El carbono α se distingue porque tiene unido un amino y un carboxilo. Si el radical tiene a su vez un grupo amino, el
radical o cadena lateral es el que le da la característica al aminoácido. Por ejemplo, un aminoácido básico, su radical
tendría un grupo amino. Porque todos los demás tienen un grupo amino unido al carbono α, todos son iguales, pero este
adicionalmente tiene otro.

En solución a pH neutro son iones dipolares. Esto significa que a pH neutro va a tener una carga negativa y una carga
positiva. Si es un grupo básico ¿Qué característica tiene el grupo amino? ¿Qué hace una base? Recibe protones.
Entonces a pH 7 este va a estar así ¿?, mientras que el carboxilo por ser grupo acido, entrega protones, entonces este va
a estar así ¿? Se le llama ion dipolar o zwitterion

 Características Estructurales
 Tetraedro por el carbono quiral. El único que no es quiral de los 20 aminoácidos proteicos es el más
chico que se llama glicina, en que la glicina el radical es lo más chico que puede ser, es un hidrogeno.
 Por ser quiral, tienen un esteroisómero que es la imagen especular, una imagen al espejo, una no se
puede transformar en la otra a menos que se rompa el enlace(por eso que la enzima necesita el L y no el
D)

En el caso de la alanina, segundo aminoácidos que sigue en tamaño, el R de la alanina es un CH3 (metil).
Los glúcidos tienen aldehído o cetona más dos alcoholes por lo menos

CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOACIDOS

Existen muchas clasificaciones y todas son arbitrarias, lo importante es comprender las propiedades de los aminoácidos.

 Aminoácidos con Carga

(VER IMAGEN 1)
La diferencia entre los 3 primeros y los 2 últimos son las cargas. Las del lado izquierdo tienen carga positiva, captaron un
protón, entonces tiene una carga positiva en su radical, en cambio los del lado derecho tienen una carga negativa en el
radical y son ácidos porque son un carboxilo que perdió el hidrogeno. Los tres aminoácidos básicos son arginina,
histidina y lisina y los dos que son ácidos que son muy parecidos, es el ácido aspártico y el ácido glutámico. ¿Ese será
realmente el ácido aspártico o se llamará de otra manera? ¿Cómo se llama el ácido orgánico? Ácido acético o ácido
etanonico, es un ácido débil porque tiene un carboxilo, al ionizarse el COOH queda ácido acético y acetato. Por lo tanto
ahí ¿Esta escrito el ácido aspártico o el aspartato? Aspartato, porque perdió ya el protón el carboxilo, sino estaría como
acido.

Estos son los únicos aminoácidos que tienen carga en el radical. Tres aminoácidos básicos y dos aminoácidos ácidos.

La proteína va adquiriendo la forma de acuerdo a las interacciones.

 Aminoácidos con cadenas laterales polares pero sin carga .

Serina: tiene como grupo funcional un alcohol en su cadena lateral, es un alcohol primario, por lo tanto en el R libre va a
haber un alcohol el cual puede reaccionar como alcohol y por eso las proteínas pueden realizar tantas funciones

Treonina: tiene otro grupo funcional alcohol, pero alcohol secundario

Asparagina y glutamina: tienen en común que en el radical tienen el grupo funcional amida, las asparagina es la amida
del ácido aspártico y la glutamina es la amida del ácido glutámico

 Casos de Aminoácidos Especiales

(VER IMAGEN 3)
El azufre tiene características parecidas al oxígeno, está en el mismo grupo, entonces este que se llama tiol, tiene
características parecidas al alcohol ¿Qué pasaba cuando un alcohol reaccionaba con un ácido? Se forma un éster.
Cuando un ácido con un tiol, se produce un tioester. El “tiol” significa azufre.

Este grupo tiene de especial que la cisteína es un aminoácido…por ejemplo, ese péptido que escribí de 5 aminoácidos,
ahora lo escribiré de 100 aminoácidos, está el extremo amino y el extremo carboxilo. Resulta que el aminoácido 51 es
una cisteína, por lo tanto hay un tiol, mientras que el aminoácido 57 es otra cisteína, entonces estos reaccionan y se
forma un enlace covalente que se llama puente de disulfuro y esta proteína va a ser mantenida mejor en esa forma,
porque las proteínas se pueden desnaturalizar, la proteína se puede abrir y ahí ya no hace su función, pero cuando hay
un puente disulfuro cuesta más que se desnaturalice.

La glicina, es la más pequeña y no es quiral.

Otro caso especial es la prolina, tiene el amino formando parte de un ciclo, no tiene el amino tan libre como los otros,
entonces cuando tengo una proteína que estaba más o menos lineal, de repente dobló, entonces hay una prolina. Cada
vez que hay un giro, casi siempre hay una prolina.

 Aminoácidos con cadenas hidrofóbicas

Hay aminoácidos aromáticos que son los que le dan la absorbancia en ciertas longitudes de onda (los que tienen
benceno; pueden absorber luz en ciertas longitudes de onda). Los otros son alifáticos como la alanina.
¿Cómo se llamaba este grupo funcional? Eter. Tioeter.
En la medida que una proteína tenga más fenilalanina, más tirosina, etc., va absorber alta longitud de onda.
Otra clasificación, distinta de la ya vista, aunque en realidad no vimos ninguna clasificación, los dividimos en:
 Con carga
 Polares sin carga
 Casos especiales
 Hidrofóbicos
 Polares que no tienen carga

Independiente de esa clasificación estructural, existe una clasificación según si podemos sintetizar o no los aminoácidos
 Esenciales: los aminoácidos que no podemos sintetizar
No significa que los otros no los necesitemos, pero algunos necesitamos incluirlos hechos y los otros los
podemos hacer.
 No esenciales

En un adulto, la mayoría de aminoácidos que son alifáticos son esenciales. Los niños en crecimiento además de todos
esos, necesitan otros porque todavía no está maduro el sistema.

Clase2
Escribiré un aminoácido pequeño y sencillo: la alanina.
H

H3N – C – COOH

CH3

Carbono α, α carboxilo, α amino, radical. Este aminoácido esta así acaso están en un pH acido, ya vamos a entender por
qué. Si a este aminoácido que está en solución le empiezo a subir el pH ¿Con qué se sube el pH a una solución?
Hidróxido. Primera cosa química que tenemos que tener claro, mientras más bajo el pH quiere decir que hay más H+,
mientras más alto el pH quiere decir que hay más OH-.

Yo voy a agregar OH- por lo tanto voy a subir el pH, de la proteína mencionada ¿Cuáles grupos podrían perder el
proton? El ácido carboxílico y el amino que esta aprotonado porque aquí también puede actuar como acido pero es
menos acido que el carboxilo. Entonces entraremos al siguiente concepto, escribiré un ácido carboxílico cualquiera, un
ácido orgánico cualquiera, por lo tanto es un ácido débil ¿Cómo mediamos la fuerza de un ácido? Con su constante de
disociación. A mayor constante de disociación o Ka mayor acidez tenía ese acido, más fuerte es. Si tengo un ácido débil:

(Se ioniza) R – COOH R – COO- + H+

Esto también es así porque es un ácido débil ¿Me pueden indicar como constante de disociación acida o Ka (constante
de equilibrio de acido) se puede escribir también? ¿Cómo la indicábamos?:

Ka= [RCOO-][H+]
[R COOH]

Concentraciones de los productos multiplicadas entre si y elevadas al coeficiente estequiometrico (que este caso es 1) y
abajo la concentración del reactante. A mayor Ka indica mayor acidez. Por ejemplo, si hay un ácido que tiene una Ka de
1 x 10^-7 y hay otro acido que es 1 x 10^-3 ¿Cuál es más fuerte como ácido? El elevado a menos 3 porque es mayor el
número. Otro ejemplo, el ácido clorhídrico es un ácido fuerte porque es un ácido orgánico, él no tiene equilibrio, está
totalmente disociado, Ka es indeterminado, porque si escribiera la Ka, sería así ¿? Y tendría abajo ácido clorhídrico sin
disorciar y esto es 0 y todo número dividido por 0 es indeterminado. O sea, será más grande el numero mientras más
chico sea el ¿?

Ahora introduciré otro concepto. Otra forma de expresar la fuerza de un ácido, que es el pKa. Este se expresa como:

pKa = -logKa

Es una función logarítmica con signo negativo. Entonces, a mayor pKa hay menor acidez. Igual como el pH, a mayor pH
menor concentración de protones. A menor pKa mayor acidez.

Entonces aquí ¿Cuántos grupos acidos tenemos? Dos, porque este lo reconocemos como acido, pero este es el ácido
conjugado de una base. Entonces esta alanina va a tener dos pKa, el pKa del α carboxilo y el pKa del α amino. Cuando
digo Ka o pKa, son constantes, por lo tanto a una determinada temperatura las busco en un libro, no las tengo para qué
aprender.

q= +1 q= 0 q= -1

H OH- H H

H3N – C – COOH  H3N – C – COO-  H3N- – C – COO-

CH3 CH3 CH3

Si yo le voy subiendo el pH, el cual subíamos agregando OH-, este es más acido que este, por lo tanto se va a perder
primero el protón del carboxilo y va a quedar así ¿Qué carga tenía el aminoácido? La carga sería +1, mientras que en el
segundo es neutra (0). Si le sigo subiendo el pH agregando OH- ¿Cuál es el protón que se va a perder después? El del
grupo amino ¿Qué carga tiene ahí el aminoácido? -1

¿Qué estamos concluyendo aquí? Que el pH cambia la carga del aminoácido. Aquí estamos hablando de un aminoácido
suelto, imaginen una proteína que tenga 1000 aminoácidos. Va a estar influida por el pH.

El pH va cambiando la carga del aminoácido. El aminoácido es el mismo, la misma molécula, pero va perdiendo o
ganando protones debido al pH que hay en el medio.

Todo aminoácido tiene por lo menos dos grupos que van a estar teniendo pKa, el grupo α amino y el α carboxilo, pero
también podría haber otro grupo en el radical ¿Qué aminoácido conocen ustedes que tenga un grupo que pueda perder
protones en el radical? Que tenga una amina como la glicina o que tenga un carboxilo ¿Cuáles eran los aminoácidos
ácidos? Glutámico y aspártico.
¿Reconocen los aminoácidos ácidos ahí? Glutámico y aspártico, tienen 3 pKa: α carboxilo, α amino. Si ustedes se fijan en
los valores pKa de los carboxilo, son parecidos en acidez, a pesar de ser ácidos débiles son harto más ácidos que el
amino terminal. Dependiendo de qué tipo de radical sea habrá un tercer pKa.

ALANINA
pKa α COOH= 2.3
pKa α NH3+ = 9.9

En el esquema de arriba ¿Dónde está la especie que tiene carga 0? La de al medio. Entonces introduzco un segundo
concepto nuevo: Punto Isoeléctrico.

El punto isoeléctrico es un pH en el cual el aminoácido está con carga 0. Se obtiene ubicando la especie que tiene carga 0
y después haciendo el promedio de los dos pKa de las especies que están a ambos lados.

CALCULO DE PUNTO ISOLECTRICO

PUNTO ISOLECTRICO = 2,3 +9,9 = 6,1

2

Eso significa que si a la alanina la pongo a un pH 6,1, va a tener carga 0. No va a tener carga ¿Eso qué significa? Que por
ejemplo si tengo una mezcla de aminoácidos y la pongo en un campo eléctrico si la alanina se encuentra un pH 6,1 no va
a emigrar porque no tiene carga eléctrica, pero los otros sí.

¿Qué más va a significar? Un aminoácido que está en su punto isoeléctrico ¿Va ser más soluble o menos soluble? Menos
soluble porque es apolar. Recuerden que el agua disuelve lo polar y lo cargado, pero no lo hidrofóbico, es decir no que
está cargado.

Primero, a un aminoácido, si le cambio el pH va a ir cambiando su carga. Imagínense en una proteína ¿Por qué ustedes
como enfermeras van a correr si le empieza a bajar el pH? Porque se va a morir. Si se le baja el pH se le van a alterar
todas las cosas de la célula, entre ellas las proteínas, porque sus cargas van a ir cambiando y si cambia va a ir cambiando
la interacción; y la proteína en vez de tener una forma va a tener otra.

Otro ejemplo de cálculo de punto isoeléctrico

Ácido Aspártico:

H3N – C – COOH

CH2

COOH

OH-

+ 0  + -  + -  0 -

0 pKa=2,0 0 pKa=3,9 - pKa=10,0 -

q = +1 q=0 q = -1 q = -2
¿Cuantos grupos tiene que son susceptibles de perder el protón? Tres. Por lo tanto vamos a tener 3 pKa. Lo simbolizaré
así para no escribir la estructura completa ¿Qué carga tendría a un pH muy acido el grupo amino? Positivo. ¿El grupo
carboxilo? Cero ¿El carboxilo del radical? Cero ¿Qué carga tendría el aminoácido? +1

Voy a subir el pH hasta llegar al primer pKa. Para el ácido aspártico sería 2,0 y 3,9.

Tengo el ácido aspártico pero lo voy a escribir así. Aquí ¿Cuál de los 3 grupos es más fuerte como ácido? El α carboxilo
¿Qué pKa tiene el α carboxilo? 2,0. Y se va ionizar el α carboxilo, va a perder el protón.

¿Cuál de los grupos que quedan se va a ionizar primero? El radical por el valor de pKa. Entonces ahora continúa el
carboxilo del radical.

¿Cómo saco el punto isoeléctrico del aspartato? Promediando el 2,0 con el 3,9. Siempre es un promedio de 2, no se
promedian todos. Entonces:

PUNTO ISOELECTRICO = 2,0 + 3,9 = 3 aprox.

2

Si parto de 0 o 1 en pH y le voy a gregando OH- voy a pasar del 0 hasta el 14, cuando pasa por el pH 2,0, estoy pasando
por el pH que necesita el carboxilo para perder su proton. Si sigo subiendo el pH, primero voy a pasar por 3,9 y no por
10. Entonces veo cual pKa sigue en la acidez y al último, el menos acido.

En todo grafico para poder inferir algo, primero tengo que entender lo que estoy graficando. Aquí estoy graficando
variación de pH v/s los equivalentes de OH- que agrego, por lo tanto, parto de un pH 1 hasta un pH 3. O sea, la variable
independiente es la cantidad de OH- que agrego porque de eso va a depender el pKa. Si varío la independiente, la otra
cambio. Es causa y efecto.

Cuando esta con un pH muy acido, no se ha perdido ningún protón. Aquí estamos hablando de la alanina, pero esto es
cualquier aminoácido porque ahí dice R, no dice metilo. Si estoy en un pH muy acido el aminoácido no ha perdido
ningun proton. Entonces, empezaré a agregar el OH- y voy a ir cambiando el pH. Pero si ustedes observan, aquí el pH
cambia super poco aunque yo agregue harto OH. En cambio aquí cambia super harto y yo agrego poquito OH-. Y aquí de
nuevo hay una meseta, que significa el pH cambia poco, a pesar de que agrego harto OH-.

Entonces mi pregunta ¿Cómo se llamaban las especies para servían para que amortiguaran el pH? Buffer.

Aquí podemos ver que los aminoácidos son buffer. Entonces las proteínas que están formadas por aminoácidos sirven
para que no nos varíe mucho el pH dentro de nuestro organismo. Todos los aminoácidos y todas las proteínas

¿En qué sector es buen buffer la proteína? En 2,3. En las cercanías del pKa del carboxilo y en las cercanías del pKa de la
amina. Pero aquí, en las cercanías del punto isoeléctrico es pésimo buffer.

Aquí tenemos solo esta especia. Empiezo a agregar OH- ¿Qué especie va a ir apareciendo?

pH = pKa + log [base]

[acido]

¿Cuál sería en este caso, si vamos a ver que actúa como tampón aquí, la especie ácida de estas dos? ¿Cuál es la base de
estas dos? La de arriba es el ácido y el de abajo es la base, porque estoy viendo la ionización de este no más.
 1
H

pH= pKa + log [H3N – C – COO-]

[H3N – C – COOH]

R
Entonces qué va a pasar cuando el pH es igual a pKa, esta concentración de la base es igual a la concentración del ácido.
Esto sería igual a logaritmo de 1, que equivale a 0.

Entonces el pH es igual al pKa. En el único punto en que son iguales es en el pKa. Después yo sigo agregando OH- y ¿Cuál
va desapareciendo? Va desapareciendo esta y va aumentando esta. Hasta que llegamos aquí y aquí hay sola esta, por
eso es que es mal buffer ahí, porque no está la combinación acido/base, está solamente la base.

Después, si sigo aumentando el pH ¿Cuál va ir apareciendo ahora? La de abajo. Y va a ir desapareciendo la de arriba.

Hasta que en un punto van a ser iguales las concentraciones entre si y por eso el pH va a ser igual al pKa, ahora del grupo
amino.

Y arriba después solamente hay especie que perdió todos los protones, por lo tanto ¿será buen tampón? No.

¿Qué estamos graficando acá? La proporción que existe entre las diferentes especies de glicina. Llamamos “diferentes
especies” a si esta aprotonada, no está aprotonada, etc. Eso es lo que estamos graficando: proporción de glicina en
determinada forma.

Nuestra variable independiente es ahora el pH. Tengo una gran variación en el pH. Es el mismo aminoácido, solo que va
cambiando el pH. Cuando estoy en un pH 0, la glicina está totalmente aprotonada, está positiva aun. Entonces le voy
subiendo el pH agregando OH-.
¿Qué va a ir pasando con esa especie? Va disminuyendo la roja, mientras que la negra va a aumentando. La negra es la
que perdió el protón del carboxilo ¿Y qué va a suceder aquí? Va estar 0,5 cada una, iguales. Por lo tanto, este pH es igual
al pKa del carboxilo.

Seguimos aumentando el pH, hasta que a pH 6 hay solo neutra y por lo tanto ese es el punto isoeléctrico.

Continuamos aumentando el pH ¿Cuál va a bajar? Va bajar la neutra ¿Y cuál va a empezar a aparecer? La que esta con
carga negativa. Hasta que aquí, son igual esa con esa y si yo hago cuál pH le corresponde será pKa del grupo amino.

Entonces ustedes me dirán ¿Dónde es buen tampón la glicina?

Estamos hablando de un aminoácido ¿Cuáles son los grupos que van a determinar el punto isoeléctrico de una proteína?
¿Todos los α amino? ¿Todos los α carboxilo? ¿Cuál? Los de los extremos y los de radicales que tengan amino y carboxilo.

NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE PROTEINAS

Pasamos a niveles de organización de proteínas. Estamos en los bloques estructurales recién. Si los unimos van a ser la
secuencia de aminoácidos que sería la estructura primera. Esa estructura primaria se enrolla y puede adquirir distintas
formas.

 α hélice
 Hoja β plegada

Luego, esta estructura secundaria se sobre enrolla. Todas las proteínas tienen primaria, secundaria y terciaria, algunas
además tienen cuaternaria, como la hemoglobina, que es más de una subunidad.

 ESTRUCTURA PRIMARIA
Es a secuencia de los aminoácidos que forman la proteína y quiere decir que los aminoácidos están unidos por enlace
peptídico. El enlace peptídico es un grupo funcional amida.
La insulina es una proteína chica que tiene 51 aminoácidos y tres puentes disulfuro. Dos que son intercadena y 1 que
está dentro de la misma cadena.
La cisteína puede formar puentes de hidrogeno cuyo grupo funcional es diol.

Entonces tengo la insulina. Supongamos aquí que el aminoácido que el aminoácido 5 de la cadena A es un glutamato.
Supongamos que por mala suerte tiene una mutación en el gen para la insulina y en vez de glutamato se pone otra
valina. El glutamato era acido, quedaría con carga negativa, va interaccionar con el agua y ahora se le puso un
hidrofóbico. Se va esconder del agua y eso va a hacer que la proteína, la insulina, tenga una forma distinta de la insulina
normal y puede ser que no interaccione muy bien con el receptor y esa persona quizás va mostrar síntomas de diabetes
aunque tenga insulina. No la tiene buena. O para mala suerte de otra persona, puede tener la insulina buena y el
receptor malo, que es otra proteína.

Por otra parte, puede haber buena suerte de alguien que tenga una mutación en un aminoácido que no se va a notar. Se
cambia un glutamato por un aspartato. Los dos son ácidos, por lo tanto no se va a notar tanto porque la forma que va a
tener para interaccionar con el receptor va a ser la misma.

La estructura tridimensional permite realizar las funciones.

La estructura primaria no es que influya en la tridimensional, la determina. La estructura tridimensional está

determinada por los enlaces covalentes de las interacciones débiles que van a ir forman la estructura.
Enlace peptídico

¿Cuál de los grupos carboxilos va a formar el enlace

peptídico? El αcarboxilo, por lo tanto vamos a ver este es
el grupo que va a formar el enlace peptídico. Este va a
estar aquí dependiendo del pH, este ya perdió el protón
pero podría estar protonado si estuviera a un pH acido,
pero la síntesis de proteínas en nuestro organismo
ocurre a un pH alrededor de 7.

¿Entre que grupos se va a formar el enlace peptídico o

grupo funcional amida? Entre estos dos y va a haber
perdida de moléculas de agua, por lo tanto es una
perdida por deshidratación, entonces ahí se pierde la
molécula de agua y se forma el enlace amida. El agua se
sale antes de que se forme el enlace peptídico.

Enlace amida, ese es un dipeptido ¿por qué está en gris

esto? Cuando la flecha señala el enlace péptido? Porque estos 4 átomos están en un mismo plano. La proteína tiene
muchos enlaces sobre los cuales puede girar, pero cuando llega a un enlace péptido, ahí hay un plano donde están estos
átomos en un mismo plano. Vamos a ver que el enlace peptídico tiene características de doble enlace.

La longitud del enlace peptídico se parece más a los enlaces dobles. Por lo tanto el enlace peptídico tiene características
generales de doble enlace. Por eso que no puede girar a proteína. Eso le restringe las posibilidades de ir formando una
estructura. Recuerden que cada carbono α era tetraédrico. Tetraédrico, plano, tetraédrico, plano.

El enlace peptídico es un enlace covalente fuerte. Si en laboratorio quieren romper un enlace covalente, tienen que
dejar 24 horas en caliente y en ácido clorhídrico concentrado. Así de fuerte es el enlace peptídico.

El enlace peptídico tiene una configuración trans. El hidrogeno es trans respecto al hidrogeno del carbonilo porque así es
más estable energéticamente. Si estuviera cis tendría que gastar todo el ATP que gasto en el día.

El enlace peptídico es polar sin carga. Va a ser capaz de formar puentes de hidrogeno.

 ESTRUCTURA SECUNDARIA
La estructura primaria, que ya vimos cómo se formó, se va a plegar a través de puentes de hidrógeno. Los puentes de
hidrogeno son interacciones débiles, pero muchos débiles hacen una estructura fuerte.
Está dada por enlaces de hidrógeno entre residuos de aminoácidos próximos entre sí en la cadena lineal, pero son a
través de puentes de hidrogeno entre componentes del enlace peptídico, no entre radicales. ¿Cuáles eran los
componentes del enlace peptídico? Había un hidrogeno y un oxigeno del carbonilo. Entonces la estructura secundaria α
hélice se ocasiona porque un hidrógeno de este aminoácido que está 4 lugares de aminoácido más acá interacciona con
ese que está allá y la va a apretar. Así se forma el espiral.

En cambio en la Hoja β plegada también es por puentes de hidrógeno entre componentes del enlace peptídico, pero de
los que están al frente. Por eso la hoja β plegada es estirada, no es compacta, es más extendida. Entonces quedamos en
que estas son las principales estructuras secundarías. Sin embargo, además están:

 Hélice de colágeno
 Irregularmente estructurada
 Clase3

 α Hélice: la fuerza que da origen a la α hélice son los puente de hidrógeno entre componentes del enlace
peptídico. Las proteínas tienen, la mayoría, una parte de estructura secundaria de un tipo y otra de otro tipo.
Hay muy pocas proteínas que tienen un solo tipo de estructura secundaria. Por ejemplo, la fibrolina de la seda
no tiene nada de α hélice y tiene todo como hoja β plegada y eso le da las características. Mientras, otras tienen
más de α hélice, por ejemplo, la mioglobina y la hemoglobina. Pero en general, las proteínas son mezclas.
Excepto el colágeno, que la mayoría es hélice de colágeno.
La queratina que es la proteína que hace al cabello es casi 100% α hélice y después se sobreenrolla y forma
súper helicoides de α porque es una proteína fibrosa.
Los puentes de hidrogeno que se establecen en la α hélice son entre componentes del enlace peptídico, por lo
tanto hay un carbonilo y hay un NH. Este puente de hidrogeno se establece entre el carbonilo de cierto enlace
peptídico con un hidrogeno que está en el enlace peptídico que está 4 más adelante.
La α hélice es una estructura secundaria que compacta la proteína, la aprieta. Por eso se hacen puentes de
hidrógeno con enlaces peptídicos que están más adelante.

La mioglobina tiene 75% de α hélice y otra parte que es irregularmente estructurada, porque no es alfa hélice y
hoja beta plegada.

 Hoja β plegada: Hoja β plegada también se origina por inter-acción de puentes de hidrogeno entre
componentes del enlace peptídico, pero ahora con uno que al frente, es decir, el carbonilo está en cierta parte y
el hidrogeno de la amida está al frente, entonces no se aprieta, no tiene que ir 4 para adelante, por eso que se
forma una superficie y no una pelotita. Por eso también que las proteínas tienen mezcla de esta estructura, no
significa que va a tener solo Hoja β plegada, excepto la de la seda, que por eso es tan preciada, porque no se
rompe.
 Está estabilizada por puentes de hidrogeno de entre los grupo NH y carbonilo de todos los enlaces
peptídicos, en cambio el otro era de algunos
 Difiere de la α Hélice en que es una lámina, la otra es cilíndrica (la α Hélice)
 La cadena peptídica está estirada, extendida
 Las cadenas adyacentes se pueden orientar en una misma dirección o en dirección opuesta.
 Es un zigzag, por eso tiene la capacidad de estirarse

 Hélice de Colágeno: es una hélice que tienen un diámetro pequeño respecto al largo. Diámetro pequeño v/s una
gran longitud. El colágeno es la proteína más abundante de los mamíferos. La forma de esta proteína es
adecuada a su función. Está muy enrollada, lo que le da una gran fortaleza. Tiene tanta firmeza como un cable
de acero. El colágeno es el que hace la unión del tendón al hueso.

 Irregularmente estructurada: es como una estructura de cuerda, un hilo que une aminoácidos lineales, que no
forman una estructura particular, Sin embargo, no es al azar. Si tengo una molécula que tiene una parte de Hoja
β plegada y otra de alfa hélice, el que una esas dos, esa sería una estructura de cuerda. Pero siempre va a ser
igual, en esa proteína si es que tiene esos aminoácidos que necesita.

 ESTRUCTURA TERCIARIA
Se refiere a las relaciones especiales entre elementos de la estructura secundaria. Ahora vamos a enrollar la secundaria
para formar la terciaria. Estas estructuras se pueden organizar en pedacitos que son bien definidos, a eso se le llama
“dominios”. Los dominios son pedazos definidos de la estructura terciaria. Las interacciones que dan origen a esta
estructura son (interacciones entre los aminoácidos):

o Covalente:
 Puentes disulfuro
 o No Covalentes:
 Interacciones hidrofóbicas: ¿Qué aminoácidos podría interaccionar en forma hidrofóbica? Aminoácidos
apolares como la leucina e isoleucina. Se unirán por interacción hidrofóbica y por afuera queda el agua,
la proteína internamente tiene muchos aminoácidos apolares y eso le va dando forma. Todos los
aromáticos y alifáticos van a hacer interaccion hidrofobica
 Interacciones iónicas: de atracción, el que tenga en su radical un carboxilo con el que tenga un amino
 Puentes de Hidrogeno: puede ser entre componentes del enlace peptídico o que no estén forman la alfa
hélice o hoja beta plegada o de los radicales.
 Fuerzas de Van de Waals

 ESTRUCTURA CUATERNARIA
Es un conjunto de estructuras terciarias. Tienen más de una cadena peptídica a la cual le llamamos subunidad. No todas
las proteínas tienen estructura cuaternaria. A cada cadena peptídica se le llama subunidad o monómero. Está
estabilizada por las mismas fuerzas que estabilizan a la estructura terciaria.

Desnaturalización: es la perdida de la estructura nativa (estructura natural), aquella que tiene la función. Si se pierde la
estructura natural, esa proteína va a seguir con la misma estructura primaria, pero esta desenrollada y ya no va a poder
funcionar como estaba programada. Generalmente son irreversibles. La desnaturalización se debe a diferentes factores,
como por ejemplo:
 Golpe metálico
 pH
 Calor
 Algunos iones
 Solventes orgánicos
La proteína se forma de una manera porque es termodinámicamente más estable porque es de esa manera. Sin
embargo, que para llegar a su estructura tridimensional necesitan ayuda: Las chaperonas o chaperoninas. En la
desnaturalización no se rompe ningún enlace peptídico

Hidrolisis: consiste en la ruptura del enlace peptídico, lo cual puede ser ocasionado por métodos químicos o enzimáticos.

CLASIFICACION DE LAS PROTEINAS

 Según composición:
 Simples: formada solo por aminoácidos
 Complejas: tienen una parte de la molécula que pertenece a otra biomolécula, por ejemplo glucoproteínas.
 Según forma:
 Globulares
 Fibrosas
 Según tengan o no estructura cuaternaria:
 Monómeras: cuando tienen solo una subunidad
 Oligomeras: tienen más de una subunidad
 Según función

Albumina
Mioglobina
Hemoglobina Proteínas globulares
Insulina
Enzimas

Colágeno Proteína fibrosa

ALBUMINA
La albumina, en los seres humanos, se encuentra en la sangre. La sangre tiene una parte liquida y una parte con células.
La parte liquida se llama plasma y la parte celular lleva los leucocitos, eritrocitos y las plaquetas; cuando esa sangre se
deja coagular fuera del organismo, se llama suero porque se coaguló. Dentro de nuestros vasos sanguíneos no tenemos
ni plasma ni suero, porque tenemos la sangre entera, que son las células suspendidas en el plasma. Esta sangre viaja
completa dentro de los vasos, el líquido que tiene esta sangre es mayoritariamente agua, pero tiene una gran cantidad
de moléculas disueltas como sodio, potasio (electrolitos en general), hormonas, glucosa, lípidos (emulsionados) y un
montón de otras cosas.
Una de esas proteínas que hay en la sangre es la albumina, la cual es una proteína chica. Esta albumina hace una presión
con el agua que está en la sangre, permite que la sangre se mantenga dentro del vaso. Hay una presión osmótica
(también llamada presión oncotica) efectuada por la albumina, esta es la principal función de la albumina.
Otra funciona de la albumina es transportar ciertas sustancias; transporta sustancias que son hidrofóbicas, por ejemplo
ácidos grasos, bilirrubina, algunas drogas, fármacos.
La albumina es la proteína que se produce en mayor cantidad en el día en el hígado. Se sintetiza en el hígado. Esta
disminuida su síntesis en ciertas enfermedad hepáticas y en desnutrición. Se sintetiza como pre pro albumina.
A la pre pro albumina hay que hacerle una proteólisis limitada, es decir cortar un enlace peptídico y cortar un pedazo,
quedando pro albumina, se le realiza otro corte para terminar finalmente en albúmina.

Proteolisis: es una hidrolisis de una proteína. Ruptura de algunos enlaces peptídicos

 Funciones
 Transporta ciertas moléculas
 Contribuye a la osmolaridad

 Utilidad diagnostica
 Albuminemia: Determinación de albumina en sangre. Baja albumina puede significar enfermedades
hepáticas o desnutrición
 Albuminuria: albumina en a orina. Normalmente no debería haber albumina en la orina. El riñón puede
pasar albumina a la orina. Sirve para detectar daño en el riñón

MIOGLOBINA Y HEMOGLOBINA
Las globinas transportan oxígeno. La hemoglobina está dentro del eritrocito y la mioglobina está dentro del miocito
(celula muscular). No hay ninguna globina que ande en la sangre. Estas le dan el color a los glóbulos rojos, pero no es la
globina, sino que el grupo que tiene que es el grupo Hem. Tanto la mioglobina como la hemoglobina son proteínas
complejas ya que tienen un grupo que no es aminoácido que es el grupo Hem.
Se llama grupo prostético cuando esta porción está pegada firmemente a la proteína, no se sale a ratos, sino que forma
parte de la proteína, en este caso el grupo Hem.

El grupo Hem, no son aminoácidos, es una molécula orgánica, lo importante es que tiene un catión ferroso, el cual es el
que une el oxígeno. Tiene que estar como ferroso (+2), si pasa a férrico tiene estado de oxidación +3.

El oxígeno que va a los pulmones va a la sangre arterial, el cual es captado por los glóbulos rojos (y dentro del glóbulo
rojo la hemoglobina, y dentro de la hemoglobina el grupo Hem). Cada grupo Hem se une a una molécula de oxígeno,
esta oxihemoglobina es la que lleva a los tejidos llevando el oxígeno dentro del glóbulo rojo, allí lo entrega. Si esta célula
es una célula de musculo, una de las células que más consume oxígeno, allí habrá mioglobina que es una forma de
reserva de oxígeno en el músculo. Este oxigeno puede ser entregado directamente a la mitocondria o puede ser
entregado a la mioglobina (específicamente al grupo Hem). Posteriormente, esta célula ocupó el oxígeno y se produjo
CO2 y tendrá que ir de nuevo al alveolo para hacer el intercambio por oxígeno. El CO2 es llevado como bicarbonato
disuelto en la sangre o como CO2 unido a la hemoglobina. Llega en una vena y en el pulmón es excretado como CO2,
producto de deshecho de nuestro metabolismo.
Entonces:
 La hemoglobina transporta oxígeno, CO2 y protones. Tetrámero (cuatro subunidades)
 La mioglobina capta oxigeno o capta oxigena. Es monomerica (una sola cadena peptídica, una sola subunidad)

¿Por qué al estar el Hem solo se oxida al unir oxígeno, pero al estar formando parte de la globina no se oxida?
Porque la globina le da las condiciones para que se __________ pueda el oxígeno y para que esa unión no exide al fierro.
Gastamos todo ese entorno de globina para que pueda funcionar la proteína. Si estuviese el grupo Hem solo, serviría
solo para una vez.

Grupo Hem:
 Componente no aminoácido.
 De este grupo depende la capacidad para unir oxígeno.
 Le confiere el color característico rojo al musculo y a la sangre.
 Está formado por una molécula orgánica (heterociclo)

Mioglobina:
 Facilita el transporte y almacena el oxígeno en el músculo

Clase4

Hay fenómenos que sufre las peotínas que tienen más de una subunidad, por lo tanto en el caso de la hemoglobina y
mioglobina, solo lo sufre la hemoglobina. Un fenómeno se llama cooperatividad y el otro se llama alosterismo.

Aquí vamos a graficar concentración de oxígeno, como

es un gas, ponemos presión de oxígeno, aquí vamos a ver
cuánto oxigeno se va uniendo tanto a la hemoglobina
como a la mioglobina, por lo tanto le vamos a poner
porcentaje de saturación por oxígeno, expresado en
unidades de presión mmHg. Si tenemos 10 mmHg y mido
cuanta mioglobina está saturada, va a decir que un 10%
más o menos. Si aumento el oxígeno, va aumentar la
saturación, formándose una curva. Esto significa que
cuando voy a aumentando el oxígeno, mi % de
saturación de la mioglobina va aumentando hasta un
máximo en que ya no puede tomar más oxígeno y eso
será un 100% se saturación. La curva de saturación que
corresponde a la mioglobina tiene forma de hipérbole.

Con la hemoglobina sucede lo mismo, pero cuando hay poco oxigeno se satura muy poco, entonces describe otra curva
y de repente sube. Esta curva se llama sigmoidea, porque describe una S.

Si tenemos poco oxígeno, la mioglobina estará más saturada. Sin embargo, la hemoglobina sube de repente con poco
cambio de oxígeno, lo cual no hace la mioglobina.

La diferencia en la estructura cuaternaria es la que hace esta diferencia en la saturación.

Función de la mioglobina:
 Transporte y almacenamiento de oxígeno en el músculo
 Es una proteína que tiene un solo grupo Hem, por lo tanto puede unirse una sola molécula de oxígeno.
Función de la hemoglobina:
 Transportar oxigeno desde el pulmón a los tejidos
 Transporta CO2 y protones desde los tejidos hacia los pulmones.

Cuando un tejido está metabólicamente activo, mientras más activo está más CO2 produce y mientras más CO2
produce, más protones producen, porque el CO2 producido se disuelve en el agua que está en todos los líquidos
biológicos y se produce el oxácido (tienen un anión y protones). En este caso se produce ácido carbónico, este acido es
muy inestable y se transforma en protones y bicarbonato y son estos los que van en la sangre, el que es transportado
por la hemoglobina.

Las sombras indicadas en el gráfico indican la presión de oxigeno que hay en los tejidos, es baja, entre 20 y 40 mmHg,
mientras que la otra es el nivel de presión que hay en los tejidos ¿Cuál de las dos moléculas está más saturada? La
mioglobina.

A presiones bajas la hemoglobina tiene menos afinidad por oxígeno que la mioglobina.

Cooperatividad: Una subunidad le ayuda a la otra a hacer su trabajo. El trabajo de la hemoglobina es unir oxígeno. Si
tenemos una molécula de hemoglobina ocupando solo un grupo hem, le cuesta mucho que entre el primero, pero entra
el primero dificultosamente y hace cambiar al segundo en la estructura tridimensional, lo que hace que la segunda
molécula de oxigeno entre hace más fácil. La segunda induce a la tercera y eso hace que el tercero entre mucho más
fácil, mientras que el cuarto entre muy fácil. En la medida que se unen los oxígenos va aumentando la afinidad por
oxígeno, a eso se refiere la cooperitividad. Por supuesto que la sufre solo proteínas que tienen estructura oligomérica

Estos cambios no son cambios que no sean cambios químicos. Estos cambios son sutiles
Relajada: cuando esta como oxihemoglobina
Estado denso: cuando todavía no une el oxigeno

La unión de un oxigeno empieza a cambiar la estructura tridimensional/química de la proteína, haciendo que sea más
fácil la entrada de los subsiguientes. Eso explica la forma sigmoidal de la curva. No es igual la entrada del primer oxígeno
que el del ultimo oxígeno.

La hemoglobina es una proteína alostérica.

El grafico indica la saturación de oxigeno v/s presión de

oxígeno. La presión de oxigeno es la variable
independiente. Tenemos la mioglobina en negro y
tenemos 3 curvas de saturación para la hemoglobina a
distintos pH.
La mioglobina tendría la misma curva si está hecha a
cualquiera de esos pH. La mioglobina no es afectada ni
por los protones y ni el CO2 que este en el medio
porque no es una proteína alosterica.
La palabra alosterica significa “en otro sitio”, en otro
sitio de la proteína, comparando con el sitio donde
sucede la acción de la proteína. La acción de la
hemoglobina es transportar oxígeno, entonces a esta
proteína alosterica cuando se le une una molécula que
va a actuar en otro sitio, modifica la unión. El trabajo
de la hemoglobina era unir oxígeno. Hay moléculas
que se llaman efectores alostericos que van a cambiar esa unión, la van a hacer mejor o peor. Si la hacen mejor son
efectores positivos o activadores. Si la hacen peor, serán efectores negativos o inhibidores
Una enzima que está formada por varias subunidades, pero en la cual entra el sustrato, si se le une una molecula en otro
sitio, específicamente en el sitio alosterico, podría cambiar el sitio y el sustrato podría no entrar ahora. En ese caso sería
un inhibidor de la acción de la enzima.

La hemoglobina une enzima. Ella no es una enzima, es una proteína transportadora, pero es una proteína alosterica, lo
cual significa que se le puedan unir otras moléculas que puede hacer que se una peor o mejor al oxígeno.

Si tenemos muchas moléculas de CO2 que van a hacer que el pH baje, la curva de saturación de la hemoglobina se corre
a la derecha, lo cual quiere decir que menos fuerte al oxígeno. Si se corre a la derecha cada vez necesitará más oxígeno
para alcanzar la misma saturación de la mitad de las moléculas. A 6,8 yo necesito tener una presión de más de 40 para
saturar la mitad. A 7,2 necesito una presión de 30 para saturar la mitad. Y a 7,6 necesito una presión de menos 10 para
saturar la mitad.

Esto esta totalmente de acuerdo con la función que tiene la hemoglobina, entregar oxígeno a los tejidos. En los tejidos,
cuando un tejido necesita más oxígeno, es cuando ha hecho más metabolismo y cuando ha hecho más metabolismo se
produce más CO2 y más protones. Entonces la hemoglobina en vez de tomar el oxígeno, que es lo que hacen los
protones, aquí le cuesta saturarse con el oxígeno, entonces quiere decir que lo tiene más suelto, entonces lo entrega.

A esto se le llama “Efecto Bohr”, el desplazamiento de la curva de saturación de la hemoglobina hacia a la derecha
cuando aumenta la cantidad de protones, o sea bajando el pH.

Alosterismo: efecto de una molécula sobre la función de un proteína al unirse en un lugar diferente al sitio donde tiene
su función. Efectores alostericos de la hemoglobina:
 Protones
 Presión de CO2
 2-3 difosfoglicerato: Son efectores negativos, es decir que liberen oxígeno, porque esos están presentes en los
tejidos, indica que esa célula está trabajando. Se produce a partir de una molécula que está en la glicolisis, pero
esta hace que la hemoglobina entregue oxígeno, a que le cambia la estructura tridimensional.

Efectos combinados del CO2 y del 2-3 difosfoglicerato (BPG)

 Hemoglobina desnuda
 Hemoblogina + CO2
 Hemoglobina + 2-3 difosfoglicerato
 Hemoglobina + CO2 + 2-3 difosfoglicerato
Esta es la curva de saturación que hay en la sangre.

El CO2 se transforma, una parte como bicarbonato, y otra parte unido a los extremos amino de la hemoglobina

¿Cuántos extremos amino libre tiene la hemoglobina? Cuatro.

Cuando tiene unido CO2 la hemoglobina se disminuye la afinidad por oxígeno, ya que hay un intercambio, el tejido le
entrega CO2 y capta el oxígeno y en el pulmón es al revés.

El monóxido de carbono CO, en que el carbono tiene estado de oxidación + 4. El monóxido de carbono no tiene nada
que ver con el dióxido de carbono. El monóxido de carbono se une fuertemente al grupo Hem en el mismo lugar donde
se une oxígeno, pero se une en forma reversible, pero mucho más fuerte que el oxígeno y le cambia la forma a la curva
de saturación a la hemoglobina y la deja de la misma forma que la curva de saturación de la mioglobina. Cambia su
forma de sigmoidea a hiperbólica. Esto trae como consecuencia la dificultad del intercambio gaseoso, porque vamos a
llegar un tejido donde hay muchos protones y CO2 y la hemoglobina sigue aferrada firmemente al oxígeno, no lo
entrega. Solo un monóxido se puede unir a una de las subunidades y le cambia la curva a la otra para unir a la otra.
Entonces, dificulta la entrega de oxígeno a los tejidos y la persona muere por hipoxia.

No es un efector alosterico, porque se une en el mismo lugar.

INSULINA
La insulina para poder ser hipoglucemiante, es una hormona proteica. Los que vemos en el examen, es que la glicemia se
mantuvo o no se mantuvo dentro de los valores de referencia. Estos valores de referencia son de 70 a 100 mg/dl. Para
que la insulina mantenga la glicemia en ese rango debe hacer un montón de cosas.
 Características de la Insulina:
 Es una proteína globular pequeña, está en el límite entre péptido y proteína
 Tiene 51 aminoácidos
 Para poder funcionar tiene que sufrir un procesamiento porque se sintetiza como pre-pro-insulina
 Su función metabólica es muy amplia y compleja, dando como resultado la regulación de los niveles de
glicemia (glucosa plasmática o glucosa sanguínea)
 Se produce en el páncreas. En los islotes de Langerhans. Se llaman islotes porque son islotes de células
endocrinas en un mar de células exocrinas. Las células exocrinas van a producir las enzimas digestivas
que el páncreas vierte al intestino, mientras que las células exocrinas producen hormonas.
 Está formada por dos cadenas unidas por puentes disulfuro y además puentes disulfuro intracatenario
La insulina recién salida del ribosoma pancreático de la célula beta, tiene una forma que no tiene nada que ver como la
necesito, si no tiene esta forma la persona es diabética porque no tiene insulina o si tiene, no es la forma adecuada, se le
cambió algún aminoácido, se cortó mal, etc. La insulina necesita ser vertida a la sangre, pero se sintetiza en los
ribosomas pancreáticos.
Entonces esa es la pre pro insulina. Se corta el péptido del sector del amino terminal y quedaría la pro insulina, pero
todavía no está lista, hay que sacar el péptido conector y recién esa es la insulina madura. Si acaso de cortara en otra
parte, no tendría esa conformación o si tuviese un pedazo de péptido conector este interferiría en su función.

COLAGENO
Es la proteína más abundante de los mamíferos. Hay distintos tipos de colágeno, pero hablaremos del que tiene la
estructura más resistente.
Si se unen 3 hélices de colágeno se forma la triple hélice de colágeno o tropocolágeno. A esto ya se le ha cortado el
extremo amino y el extremo carboxilo, es decir también sufre una proteólisis limitada.
La estructura primaria, tiene una secuencia en que se repite la glicina cada tercer aminoácido. Recordemos que la glicina
es un aminoacido no quiral, porque en el radical tiene un hidrogeno, entonces es muy pequeño la parte del radical y
decíamos que puede caber en cualquier parte.
También, tiene muchas prolinas, las cuales tienen la característica de tener un ciclo, lo cual le va a dando la forma a la
hélice de colágeno. (Impedimento esteril/Por espacio. Ejemplo: globos)
 Tiene 3 cadenas peptídicas en que se sintetiza como precursor
 Tiene muchas glicinas
 Tiene muchas prolinas
 Tienen algunos aminoácidos modificados, estos son la hidroxiprolina y la hidroxiglicina, son glicinas a las cuales
se les agrego un OH- y ese OH- hace que se produzca un entrecruzamiento entre las 3 hebras de tropocolageno.
Cuando uno va aumentando en edad se van produciendo entrecruzamientos mayores, más que la firmeza se va
perdiendo la funcionalidad del colágeno.
Los entrecruzamientos que se formaron por esos aminoácidos modificados son importantes porque le dan firmeza al
colágeno, entonces esas enzimas que agregaron los OH-, necesita vitamina C.
Escorbuto: enfermedad producida por déficit de vitamina C debido a un colágeno de mala calidad. El colágeno que se
sintetiza sin vitamina C no tiene entrecruzamientos por lo tanto es un colágeno laxo.
 CLASE 6

ENZIMOLOGÍA

¿Qué es una enzima?

Es un catalizador. Es una proteína que puede acelerar una reacción

Existen catalizadores inorgánicos y orgánicos (enzimas). Aumentan la velocidad de la reacción millones de veces. Existen
unas pocas enzimas que no son proteínas, son ácidos ribonucleicos, las cuales reciben el nombre de ribonucleótidos,
trabajan catalizando acciones en los complejos desoxirribonucleicos.

Sin enzimas no habría vida.

Las enzimas se unen a una molécula que es el sustrato, el sustrato de una enzima es el reactante, estos reactantes
reaccionan dentro de la enzima. La enzima es mucho más grande que el sustrato y forma un complejo enzima-sustrato,
el cual luego se transforma en enzima-producto. Para formar este producto a una velocidad compatible con la vida,
tiene que haber una enzima.

En el metabolismo hay ciertas reacciones en que una es la opuesta de la otra. Por ejemplo, cuando hemos comido
hartos, sobre todo glúcidos, vamos a sintetizar glucógeno para guardar, pero en la noche no estoy comiendo, por lo
tanto vamos a ir degradando ese glucógeno. Cuando está activa la síntesis, esta mucho menos activa la degradación y
cuando está activa la degradación, esta menos activa la síntesis ¿Cómo sabe la celula que cuando está activa una, tiene
que inhibir a la otra? Eso lo hace la enzima mediante modificación covalente reversible, eso significa que se le agrega un
grupo amino a la enzima y sabe que tiene que enlentecer o apurar esa reacción

A+B  C +D  E+F
Enzima A Enzima B

Esta es una secuencia de reacciones que esta catalizada por dos enzimas diferentes, las vías metabólicas que vamos a
ver son secuencias que pueden ser muy largas o más cortas de reacciones en que cada una está catalizada por una
enzima diferente, en que los productos de la primera enzima son los sustratos de la que sigue. Reacciones en cadena
pero que tiene como finalidad hacer el resultado de esa vía.

Sustrato = sustancia sobre la cual actúa la enzima

Producto = la molécula e la cual se transforma el sustrato

A diferencia de las reacciones no enzimáticas, aquí hay formación de un complejo enzima-sustrato, que es el que facilita
la reacción.

¿Por qué las enzimas hacen que una reacción sea mucho más rápida?
 Generan el ambiente apropiado y con eso disminuyen la energía de activación.
 Las enzimas no son capaces de apurar una reacción que es imposible de hacer que ocurra en la naturaleza. Las
enzimas apuran velocidad de reacciones que son termodinámicamente posibles
 Las enzimas no cambian el equilibrio de las reacciones. Si tengo una reacción:

A+B C+D

Ka = [C] x [D]
[A]x [B]
Si Ka es la constante, quiere decir que es un número fijo a una temperatura dada. Supongamos que Ka es 0,5 ¿Qué hay
más? ¿Reactantes o productos? Hay más reactantes.

Esta relación en el equilibrio es 0,5. Si yo pongo la enzima en este medio de reacción que estaba sin enzima, la enzima lo
único que va a hacer es que va a alcanzar más rápido la relación entre las concentraciones, pero la relación entre las
concentraciones seguirá siendo 0,5. Las enzimas entonces, no cambian el equilibrio de una reacción, solo acortan el
tiempo en que alcanzan dicho equilibrio.

Características de la acción enzimática. Formación de un complejo enzima-sustrato.

Fíjense en este lápiz, supongamos que este sea el sustrato y estos son los productos, como un hidrolisis, se rompió, se
abrió. Este lápiz es posible que se destape, pero si lo dejo solo ahí, podrán pasar generaciones, se empieza a oxidar, el
plástico se derrite, etc. el hecho es que solo va a costar demasiado. Si yo soy la enzima, mucho más grande que el
sustrato; miren todos los grupos funcionales que hay en la enzima, recuerden que están libres todos los R y los grupos
amino y carboxilo terminal, entonces vana haber grupos hidrofóbicos, hidrofóbicos, etc. que van a interaccionar con el
sustrato de alguna manera y lo van a obligar a adoptar una conformación, ese es el complejo enzima-sustrato, que le va
a costar muy poquito sacar la tapa, hasta que yo tengo casi sacada la tapa, ese es el complejo de transición. Es decir,
está activado y le falta muy poco para hacer la situación final.

La enzima toma al sustrato mediante sus distintos radicales que van a depender de la enzima y del sustrato. No tiene por
qué ser siempre los que sean hidrofóbicos o polares, no, porque depende de con que sustrato está actuando. Tienen
que tener en mente que se trata de algo tridimensional, que tiene muchos grupos químicos y que el sustrato es mucho
más chico que la enzima.

Las enzimas catalizadas por las enzimas pueden corresponder a reacciones que son parte de las vías metabólicas y a
reacciones aisladas, pero casi todas corresponden a vías metabólicas.

Vías Metabólicas: Es una secuencia de reacciones que ocurre en un sistema vivo, cuya función es permitir que ciertos
sustratos se transformen en productos.

 Lineales

 Con bifurcaciones: El metabolito A se transforma en B, pero ese B puede ir a C o transformarse en E

 Cíclica: Entra un metabolito, se junta con otro y al final de la vía se recupera ese otro. Ejemplo: el ciclo de Krebs.

 En cascada: Se va a activar una enzima, esa enzima activa a otra, esa activa a otra y al final el resultado es por la
acción conjunta de todas las enzimas: Ejemplo: factores de la coagulación, el producto es la formación del
coagulo.

Las reacciones irreversibles son catalizadas por enzimas que son regulables, porque al decirle a esta enzima que se
apure, se apuran todas. Al decirle a esta enzima que se detenga, la vía se detiene. Entonces, las enzimas que son
regulables, catalizan reacciones irreversibles, la mayoría de las veces.

Lo que se va a ver la energía inicial y la energía final del producto, pero para que el sustrato se transforme en producto,
no es directo, tienen que activarse las moléculas de sustrato y para que eso suceda se necesita la energía de activación,
la cual después no se ve, no queda registrado.

En un gráfico la curva baja si la reacción es catalizada. Lo que baja es la energía de activación. La energía inicial y final del
producto es la misma.
Entonces, la energía de activación es la inversión inicial de energía para iniciar una reacción, si no hay esa energía no se
puede efectuar la transformación en producto.

PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS

 Aumentan la velocidad de las reacciones, pero no modifican el equilibrio.

 Son muy específicas
 Pueden ser reguladas
 No se consumen durante la reacción. Se reocupan pero no son eternas.
 Como todo catalizador se ocupan en cantidades muy pequeñas

AUMENTO DE VELOCIDAD
 Gran eficiencia catalítica: aumentan la velocidad de la reacción hasta un millón de veces, sin cambiar la
constante de equilibrio de la reacción.
Aquí vamos a entrar a un concepto:
 Numero de recambio: número de moléculas de sustrato que se convierte en producto en cada segundo y por
cada molécula de enzima.
Si yo tengo un número de recambio que sea 17 mil de una enzima 1 y el número de recambio de la enzima 2 sea 108 mil.
Ahora llevándolo a datos duros, con esto quiere decir que la enzima 1 es capaz de transformar 17 mil moléculas de
sustrato en un segundo y por cada molécula de enzima. Y esta, es capaz de transformar 108 mil en producto por cada
segundo y por cada molécula de enzima ¿Cuál sería más eficiente? La 2, porque tiene un alto número de recambio.

Después vamos a ver el concepto de constante catalítica, la cual también se refiere a la eficiencia catalítica

¿Cómo la enzima hace que el equilibrio se logre más rápido?

Generando el medio adecuado. Disminuye la energía necesaria para llevar a un estado de transición.
Entonces, actúan como catalizadores porque bajan la energía de activación.

ESPECIFICIDAD
Tienen una característica exclusiva o propia. Las enzimas actúan solo con un sustrato. Son específicas respecto al
sustrato y reacción.
 Especificidad de sustrato: trabaja con una sola molécula o con una muy parecida
 Especificidad de reacción: quiere decir que si una enzima es una hidrolasa, va a ser siempre hidrolasa.

El sitio activo es una porción pequeña de la proteína, muy pequeña, que está formada por unos pocos radicales de
aminoácidos que pueden estar lejos del sitio activo. Estos radicales crean un espacio tridimensional, que no es verdad
esto de que sea complementario al sustrato, sino que es por encaje inducido. El sustrato puede acomodarse en este sitio
activo y los radicales también en la acción católica (formar o romper enlaces)

Si solo unos pocos radicales de aminoácidos forman el sitio activo ¿Para qué sirve el resto de aminoácidos de la
proteína? Todos los aminoácidos en determinada secuencia son NECESARIOS para que la proteína cumpla su función. La
función de las enzimas es catalizar, para poder catalizar tienen que tener un sitio activo, para tener un sitio activo deben
tener una secuencia determinada de aminoácidos que hagan que en la estructura tridimensional aparezcan juntos esos
que se necesitan para formar el sitio activo.

Los mismo que pasaba con la hemoglobina, si nosotros tenemos el grupo HEM suelto, libre, y le uno oxígeno,
inmediatamente se oxida el Fe+2 a Fe+3, se acabó la unión con oxígeno, entonces ¿Cuál es la labor de la globina? Era
mantener esa estructura tridimensional que protegía al grupo Hem para que no se oxidara.

Entonces aquí, la estructura tridimensional hace que se forme ese determinado sitio activo.
El sitio activo es el sitio que une a la Coenzima y el que une al sustrato. Si ustedes ven también puede unir al grupo
prostético (un grupo funcional o un grupo que no es proteico, una parte no proteica de una proteína que está unida
firmemente no siempre por enlace covalente).

El sustrato no tiene un sitio pre-hecho, eso era lo que antes se llamaba teoría del modelo de llave y cerradura, en cambio
se ha comprobado que lo real es que la enzima cambia de forma y también el sustrato, eso se llama Encaje inducido. Eso
es como cuando uno se pone un guante, uno hace que el guante se deforme y siga la forma de la mano. La enzima sufre
un cambio de forma y también el sustrato que se va haciendo más parecido a los productos. La clave de la acción
enzimática es que se forma un complejo enzima-sustrato

Tenemos una enzima que trabaja con la glucosa, ahí está el sitio activo, ya sabemos que está formado por radicales que
pueden estar muy alejados, entra la glucosa ¿y que hace la enzima? Se cierra, entonces ahí se deformó la enzima, pero
también se deforma el sustrato.

Algunas enzimas no necesitan nada más que aminoácidos, son las enzimas que no tienen grupos protéticos, enzimas
simples, que no tienen coenzima. En cambio hay otras enzimas que para poder efectuar su acción catalítica necesitan
otra molécula:
 Coenzima: si es una molécula orgánica pequeña
 Cofactor: si es un catión metálico
Pueden estar unidos muy fuertes, cualquiera de los dos, ahí se llamaría grupo prostético. O si acaso se sale hacia el
medio ahí se llama coenzima o cofactor.

Esas enzimas que usan coenzimas y/o cofactor se llaman Holoenzimas. Estas holoenzimas o cofactores, ayudan al
trabajo catalítico, sujetando por un momento, por ejemplo, electrones; Ese sería el trabajo de una coenzima: ayudar en
el trabajo enzimático.

 COENZIMAS: Corresponden a moléculas orgánicas o no tan orgánicas que trabajan con una
enzima, ya sea dando o aceptando electrones transitoriamente (por un momento) o
transportando un grupo de atamos transitoriamente. En su mayoría derivan de las vitaminas
hidrosolubles

 COFACTOR: Iones inorgánicos, generalmente cationes metálicos.

Una holoenzima es una enzima que necesitando cofactor, coenzima o grupo prostético, lo tiene, a eso se le llama
holoenzima. La holoenzima está formada por la parte proteica que sería apoenzima más la coenzima o el cofactor o el
grupo prostético. Para definir apoenzima es una holoenzima sin la coenzima o sin el cofactor o grupo prostético. Hay
enzimas que no necesitan eso

Enzimas simples: enzimas que no tienen otra parte que no es aminoácido.

CLASE 7
Decíamos que algunas enzimas necesitan coenzimas o cofactores para funcionar. La coenzimas son moléculas orgánicas
derivan de vitaminas hidrosolubles. Las vitaminas son moléculas orgánicas también, pero son esenciales (no las
podemos sintetizar) por lo tanto necesitamos ingerirlas en nuestra dieta.

Las vitaminas son importantes porque de ellas nuestro cuerpo puede sintetizar coenzimas. Y que son las coenzimas:
moléculas que me ayudan en el trabajo enzimático. Decíamos que coenzimas y/o cofactores si acaso estaban unidas
muy firmemente a la proteína enzimática se llama grupo prostético.

Entonces aquí tenemos vitaminas hidrosolubles que dan enzimas a las coenzimas que son derivadas de esas vitaminas,
que hay muchas, pero quisiera que ahora centralizaran su atención en dos, una que es derivada de la riboflavina y que
se llama FAD. Y otra, que es la nicotinamida que da origen al NAD (nitocin adenin dinucleotido). Son moléculas
nucleotidicas, que derivan de los nucleótidos, peor que nosotros solo las podemos sintetizar si es que consumimos la
estructura básica para poder hacer la coenzima. Entonces la estructura base es la riboflavina y la nicotinamida ¿Qué
importancia tienen estas coenzimas? El NAD debería tener un signo positivo. El NAD y el FAD.

El NAD y el FAD se necesitan en reacciones de óxido-reducción. Si yo quiero oxidar a este sustrato. Va a estar reducido y
yo lo quiero tener como sustrato oxidado, os ea ese va a ser el producto, el sustrato oxidado. Para que este se pueda
oxidar ¿Qué tendrá que perder? Electrones. Para que se pueda oxidar debe perder electrones.

Cuando hay una reacción de oxidación ¿Qué debe haber simultáneamente? Tiene que haber otra molecula que se
reduce ¿Quién se reduce aquí? Se reduce el NAD+ por ejemplo. Ese es el segundo sustrato o coenzima ¿Y qué va a hacer
el NAD+? Va a recibir los electrones que perdió este. Entonces, el NAD+ se va a convertir en NAD reducido que es el que
debe recibir los electrones. Se convierte en NADH. Ya explicaré por qué queda asi.

Resumiendo, el NAD y el FAD derivan de vitaminas hidrosolubles. NAD+ va a actuar como coenzima y esta sería la forma
oxidada y esta sería la forma reducida. Y la otra molécula derivada de las vitaminas hidrosolubles que participa de las
reacciones redox, el FAD, que deriva de la riboflavina. Entonces si yo pongo aquí lo mismo, sustrato reducido más FAD
(sin signo más) el sustrato se va a oxidar y el FAD recibe los electrones que vienen en dos hidrógenos.

Si ustedes quieren que la enzima catalice reduciendo el sustrato ¿Cómo debe estar la coenzima? Tendrá que estar
reducida para que la coenzima ahora se oxide. Entonces si quiero reducir el sustrato tendré que agregarle electrones
¿Con que le agrego? Con coenzimas reducidas. Si yo quiero oxidar un sustrato tengo que quitarle electrones, por lo
tanto que poner una coenzima que sea capaz de recibir electrones ¿Cómo los va a recibir? Cuando está oxidado.

La mayoría de las coenzimas y grupos prostéticos derivan de las vitaminas hidrosolubles. Existen dos tipos tipos de
vitaminas:
 Hidrosolubles que son polares
 Liposolubles: apolares o hidrofóbicas

De las vitaminas liposolubles, solo una actúa como coenzima, la vitamina K. La A, la D y la E, no quiere decir que no sean
importantes, sin la vitamina A no podemos ver correctamente, la vitamina E tiene función antioxidante, mientras que la
vitamina D tiene relación con el metabolismo del calcio. Sin embargo, no tienen función de coenzimas.

REGULACIÓN
Las enzimas pueden ser reguladas ya sea por alosterismo o por otro mecanismo que aún no sabemos cuál es. Lo
importante es que sabemos que pueden ser reguladas ¿Todas las enzimas son reguladas? Las reacciones irreversibles
son las reacciones regulables. Es decir, la enzima es regulada.

RECUPERACIÓN
Las enzimas no se consumen durante la reacción, las puedo reutilizar ¿Cómo se llamaba el concepto que tenía que ver
con el número de moléculas de sustrato que se convierten el producto por unidad de tiempo y por mol de enzima?
Numero de recambio. También se le llama constante catalítica.

NOMENCLATURA
 CLASE 1. OXIDO-REDUCTASAS: Catalizan reacciones de óxido reducción. Transfieren hidrogeno o electrones de
un sustrato a otro. Todas las enzimas que son deshidrogenasas son oxido-reductasas. Entonces todas las que
terminen con DH son oxidoreductasas.
 CLASE 2. TRANSFERASAS: Transfieren un grupo químico que no sea hidrógeno porque o si no sería la oxido
reductasa, de un sustrato a otro. Ejemplo: Glucoquinasa. La glucosa muchas veces la vamos a simbolizar con un
G para abreviarla, si reacciona en presencia de una enzima que se llama glucoquinasa, este ATP pierde un
fosfato (en realidad uno de los 3 fosfatos se transfiere a la glucosa) y se forma la glucosa-6-fosfato, lo cual
significa que la glucosa tiene un fosfato en el carbono 6 ¿Entonces cuál será el otro producto? ADP. Esa sería una
transferasa.
  CLASE 3. HIDROLASAS: Ejemplo: Lactasa. Encargada de la hidrolisis de la lactosa ¿Qué es la lactosa?
Estructuralmente es un carbohidrato. Es un disacárido que por acción de la maltasa se va a separar en glucosa y
galactosa. Una hidrolisis conlleva a la ruptura de un enlace y la división de los componentes de la molécula de
agua. La molécula de agua se rompe y se produce la ruptura de un enlace por esa acción.
 CLASE 4. LIASAS: Reacciones de ruptura o de unión de moléculas pero en que está involucrado un doble enlace.
Se adicionan al doble enlace o se forma un doble enlace.
 CLASE 5. ISOMERASAS: Catalizan la interconversión de isómeros.
 CLASE 6. LIGASAS: Permiten la unión de dos moléculas para formar un producto pero que necesitan energía
proporcionada por la hidrolisis del ATP. Las enzimas que trabajan como ligasas, no producen productos que
tienen fosfato al final, sino que una molécula que resulta de la unión de otras dos, pero que para poder unirse
necesitaron la energía de la hidrolisis del ATP.

Esta enzima que se llama glucoquinasa, tiene el siguiente numerito de la comisión enzimática 2711. Por lo tanto ¿Qué
clase de enzima es? Transferasa. Pero para un entendido en la materia al leer el 7 va a decir que es un fosfato el que se
transfiere y al leer el 1 va a decir que ese fosfato se entrega a un OH y al leer el otro 1 va a decir que ese OH era de la
glucosa. Cada número significa lo que hace la enzima.

CINETICA ENZIMATICA

¿Cómo se mide la velocidad de una enzima?

¿Cómo sé que una enzima actúa?

Tiene que haber un producto. Genera un cambio.

Si yo tengo un tubo en que quiero que una enzima actúe ¿Qué tiene que tener el tubo? Sustrato ¿Lo voy a echar seco?
¿Qué tendrá que tener¡ Las enzimas son proteínas tienen grupos polares, hidrofílicos. Agua ¿Agua sola a cualquier pH?
Un pH adecuado, porque no todas las enzimas trabajan a pH 7 ¿Con que mantengo un pH adecuado? Con un buffer.
Cierta fuerza iónica. Falta la enzima ¿Quién está en mayor cantidad? El sustrato ¿Esto lo puedo hacer a a cualquier
temperatura? Depende, depende de la enzima con que esté trabajando.

Entonces vamos a poner todo eso aca y lo vamos a poner en un bañito que tiene temperatura adecuada, entonces se va
a producir un producto. Supongamos que el producto sea coloreado, entonces yo voy a sacar un poquito de este tubo a
un tiempo determinado y voy a parar la reacción ¿A alguien se le ocurre como podríamos detener la reacción?
Cambiando el pH o cambiando la temperatura, por ejemplo ponerla en hielo.

Mido el color que se desarrolló.

Entonces yo voy a graficar color desarrollado, que esto es una situación particular, puede haber otra que no produzca
color, el color desarrollado yo lo puedo ir mirando al ojo, pero no es muy exacto, entonces eso lo mido con un espectro
fotómetro, un instrumento que puede medir la intensidad del color. Entonces les decía, saqué en un tubito y aquí había
un poquito de color en el tiempo 1 y esto tenía una coloración poquitita. Pasó el tiempo y saqué otro tubito al 2 ahora,
igual pero ahora tiene un poquito más de color porque se produjo más producto y se va a formar otro punto en el
gráfico y así sucesivamente si yo saco en los distintos tiempos ¿Qué pasa aquí? Yo sigo acá, el 3 aquí, el 4 acá, el 5 acá y
el 6 por acá. Yo hago esta curva y se forma esta curva ¿Cómo se llama esta curva? Hiperbólica o como una hipérbole.
Pero ojo con esto, esto era una absorbancia que fue medida a una determinada longitud de onda, depende del color.
Esto se llama CURVA DE PROGRESO DE LA REACCIÓN. Progreso porque vamos en tiempo, el tiempo va transcurriendo.

Primero es proporcional al tiempo, pero luego no, porque yo puedo seguir 50 minutos y va a ser siempre así. Entonces,
esta parte de acá, que es proporcional, recibe el nombre de VELOCIDAD INICIAL.
En el eje Y tengo el color y en el eje X tengo el tiempo. ¿Cuál es la velocidad? La pendiente. La pendiente de esa curva
está dada por la diferencia de color dividido por la diferencia del tiempo. La pendiente es la velocidad.

La curva que les voy a mostrar a continuación está hecha con velocidades iniciales ¿Qué significa velocidad incial?
Cuando es proporcional. O sea si yo ocupo 1, 2 o 3 minutos la velocidad va a ser velocidad inicial, pero si ocupo 4, 5, 6 ya
no es velocidad inicial porque no es proporcional la aparición de producto al tiempo transcurrido.

Entonces está pendiente, al tomar estos tiempos, se trata de velocidad inicial.

CINETICA ENZIMATICA:

 Es el estudio de las velocidades que son catalizadas por las enzimas. La velocidad se puede medir con relativa
facilidad. Imaginen que aquí la enzima no estuviera pura, pero si le pongo un sustrato determinado va a actuar
solo la enzima que reconoce a ese sustrato, porque son específicos

 La medición se efectúa en condiciones óptimas. De pH, t°, fuerza iónica, etc.

 La velocidad inicial se denomina V0 o Vi.

 Las reacciones enzimáticas se miden en tiempos muy breves para medir velocidad inicial.

¿Cuáles son los factores que afectan la velocidad de una reacción?

Distintos factores. Qué pasa si en este tubito que tengo acá estoy midiendo aparición de producto ¿Qué pasa si en vez
de colocarle 10 moléculas de enzima, coloco 20? ¿Cómo será la velocidad? Mayor, porque tengo más enzima. La
velocidad de una reacción es proporcional a la cantidad de enzima, o sea a mayor cantidad de enzima mayor velocidad.
Entonces esto indica la proporcionalidad a una misma concentración de sustrato.

o Concentración de Enzima
o Concentración de sustrato
o Temperatura
o pH
o Efectores positivos o negativos.

Tengo una gradilla a una temperatura adecuada, pH adecuado, enzima adecuada y constante

¿Cuál va a ser mi variable independiente?

La cantidad de sustrato

¿Qué es lo que voy a medir?

Velocidad.

Entonces aquí ¿qué es lo que voy a dejar constante? El tiempo. Si yo quiero medir velocidad inicial ¿qué tiempo le voy a
poner para que asegure velocidad inicial? (1-3, 05-3; etc. no desde 0). Tomemos 3 minutos. Constante 3 minutos.

Detenemos la reacción al mismo tiempo: 3 minutos. Y veo cual coloración se desarrolló. Entonces me va a salir un
gráfico pero ahora ¿Qué voy a estar graficando en los ejes? La variable independiente sería la concentración de sustrato
y en el eje Y, la velocidad ¿Qué velocidad si acaso yo use 3 minutos? Velocidad inicial.

Entonces voy haciendo lo mismo. El tubo uno que ya lo detuve y vi el color y me salía una velocidad en ese tiempo, el
color porque está hecho a 3 minutos. Me va a dar acá v/s 1, entonces va a ser ese puntito. Después, en la concentración
de sustrato 2, me va a salir esta otra coloración que va a dar eso.
¿En qué unidades está la concentración de sustrato? Molar, milimolar, micromolar, una unidad de concentración.

Vamos avanzando en esto, pero llegamos a lo mismo, pero no es una curva de progreso, a esta curva se le llama CURVA
DE MICHAELIS MENDER. Es una hipérbole, es la curva que siguen las enzimas más sencillas. Las enzimas que son
alostéricas no siguen una hipérbole. La curva de las enzimas alostéricas es sigmoidea. Estas enzimas, que siguen esta
curva se llaman enzimas de michaelis o enzimas michaelianas. Nunca me vayan a decir que una enzima es hiperbólica,
porque la curva que describe la velocidad v/s la concentración de sustrato es hiperbólica. No me vayan a decir que una
enzima es sigmoidea, porque eso no existe.

Aquí ¿Por qué se aplanó? Porque ya no hay más enzima que este libre. En todo momento la enzima total es constante,
pero la azul, aquí ¿Cómo está la enzima? ¿Libre o unida? Libre. La enzima total será siempre enzima libre + enzima
sustrato.

Aquí ¿Cómo está la enzima total? Saturada y entonces que significa que este saturada ¿Qué está libre o es enzima
sustrato? Enzima-sustrato. Aquí la enzima total esta toda como enzima sustrato y formó entonces una hipérbola porque
ya no hay linealidad con la concentración de sustrato.

¿Qué es lo que está constante? La concentración de sustrato. Y ese va variando en los distintos puntos de la curva.
¿Qué es lo que habrá en el tubo en A? Harta enzima en A y poco sustrato. No necesariamente poco sustrato, pero si
suficiente enzima que si yo agrego más sustrato lo va a tomar. Yo agrego más sustrato y va aumentar la velocidad. Acá,
también agrego sustrato pero ya no es proporcional se está doblando la curva, la velocidad no aumenta el doble si yo
aumento al doble el sustrato, aumenta un poquito.

¿Y qué va a pasar donde está saturada la enzima? Yo aumenté mucho el sustrato ¿Qué pasó con la velocidad? Se
mantuvo, siguió igual, a esa velocidad se le llama velocidad máxima.

La velocidad máxima es una velocidad inicial porque estábamos igual a un tiempo corto.

¿Cómo cambia la velocidad de las reacciones catalizadas?

¿Qué pasa en una reacción si aumenta la temperatura? Aumenta la velocidad por la termodinámica. Eso mismo sucede
en las reacciones enzimáticas ¿Seguirá aumentando la velocidad siempre que yo aumente la temperatura? No ¿Hasta
cuándo va a aumentar? Hasta que se desnaturalice la enzima.

Entonces todos claros la forma de la curva que vamos a ver ahora. Haré un gráfico v/s temperatura, la velocidad
aumenta y después disminuye. La temperatura juega así con la enzima.

Si miramos acá esta es la curva de una enzima humana ¿Cuale es la temperatura optima de una enzima humana?
Alrededor de 37.

El pH afecta la estructura de la proteína, pero recordemos que aquí estamos viendo una interacción entre la enzima y el
sustrato, el sustrato también puede ser afectado por el pH.

Tenemos dos enzimas humanas que tienen distinto pH óptimo. Distinto pH donde trabajan. Esta la pepsina es una
enzima del estómago, el cual tiene un pH muy acido entre 1 y 2. En cambio, la tripsina es que una enzima intestinal
donde se ha vestido el jugo pancreático que tiene bicarbonato, por lo tanto el pH es alcalino, un poquito básico y lo
óptimo será a es pH. El pH depende de cada enzima en particular.

Tenemos una deshidrogenasa. Succinato deshidrogenasa. Oxido reductasa (CLASE 1). A un pH 7 ¿Cómo va a estar el
sustrato? Tal como está ahí, perdió los protones ya porque el pKa es más bajo ¿Cómo estará el centro activo?
Protonado ¿Cómo será la interacción? Buena.
Ahora, a un pH acido ¿Cómo va a estar? El carboxilo, si acaso es a pH dos por ejemplo, todavía no se pierde, está a punto
de perderse ¿Cómo estará la enzima? ¿En centro activo? ¿Cómo estarán los aminoácidos del centro activo? Protonados
¿Cómo será la interacción enzima-sustrato? Mala, porque este tiene carga 0 y este tiene 2, o sea positiva. Imagínense lo
que pasa a pH 14. Se desprotonaron ambos ¿Cómo será la interacción? Mala ¿Dónde fue la mejor interacción? En el 7
¿Cuál será el pH óptimo? Alrededor de 7.

MICHAELIS Y MENTEN.
Dijeron que la enzima forma un complejo con el sustrato. Complejo enzima-sustrato. La velocidad con que se forma es
igual a la velocidad con que se transforma en enzima producto. Se mantiene constante durante toda la reacción. Eso
hace que si nosotros graficamos los cambios de velocidad v/s concentración de sustrato, la forma de la curva es una
hipérbole y toda curva tiene una ecuación:

V = Vmax [S]
Km + [S]

Km (Constante de Michaelis): Relaciona la velocidad con la concentración de sustrato y que podemos determinar una
velocidad máxima y una constante que se llama la constante de michaelis.

Km  La concentración de sustrato necesaria para lograr ½ Vmax.

CLASE 8

Hubo algunos autores que intentaron linealizar la ecuación de Michaelis-Menten para hacerla más exacta.

Km  En algunas ocasiones Km se considera como una medida de la afinidad de la enzima por el sustrato ¿Acaso una
enzima tiene un Km más bajo que otra? Una tiene un Km 2 milimolar y otra un Km de 4 milimolar ¿Qué significa eso?
¿Cuál enzima trabaja mejor con su sustrato? La de 2, porque necesita menos sustrato para alcanza la mitad de su
velocidad máxima. No es necesario que sean iguales las velocidades máximas, pero se está refiriendo a la mitad de SU
velocidad máxima.

Entonces:

Si la Km es alta  Tiene baja afinidad por su sustrato

Si la Km es baja  Tiene alta afinidad por su sustrato

Este Km es propio de cada par enzima-sustrato y está definido, por eso se llama K (constante). Por ejemplo, la enzima
hexoquinasa trabaja con dos sustratos, con un ATP y con un monosacárido. Puede ser la glucosa o la fructosa, por
ejemplo ¿Con cuál de los dos monosacáridos actúa mejor esa enzima y por qué? Con la glucosa, porque con 0,05 milimol
de glucosa alcanza la mita de su velocidad máxima. En cambio, la fructosa necesita 1,5 milimolar, varias veces más.

Cada complejo enzimático y la otra enzima con otro sustrato es otro Km, pero es constante para esa enzima con ese
sustrato. Esto lo busco en una tabla, es una constante. Se mide en unidades de concentración porque está en el eje x en
el gráfico de michaelis.

La constante catalítica o número de recambio, en el fondo mide la velocidad con que trabaja la enzima. Numero de
moléculas de sustrato que se convierten en producto en cada unidad de tiempo y por cada mol de enzima.

Por otra parte, sabemos que Km es la cantidad de sustrato necesario para alcanzar ½ Vmax
Estas dos cosas se define “Eficiencia de una enzima”,e en que la K (catalítica) me va a decir cuan rápida es la enzima y la
Km cuan afín es la enzima. Entonces mientras más grande sea Kcat/Km esto me va a marcar la eficiencia. A mayor
cociente mayor eficiencia.

Relaciones entre la velocidad y concentraciones de sustrato respecto a Km:

o [S] << Km Vi= K [S]

o [S] >> Km Vi = Vmax
o [S] = Km Vi = Vmax/2

Si el sustrato es mucho menos que el Km, a velocidad es proporcional a la concentración de sustrato. Si yo aumento el
sustrato aumenta la velocidad, si disminuyo el sustrato, disminuye la velocidad. Pero solo aquí. En valores de
concentración de sustrato que son menores que el valor de Km. En la situación de verdad, viva, metabólica, nuestras
enzimas trabajan con concentraciones que son menores que los Km, para que si aumenta el sustrato la enzima aumenta
la velocidad. Si disminuye el sustrato, disminuye la velocidad. Cuando las concentraciones de sustrato de son más chicas
que el Km la velocidad es proporcional. En la medida que hay más sustrato aumenta. En la medida que hay menos
sustrato, disminuye.

Si el sustrato es mucho mayor que el Km, la velocidad no es proporcional a la concentración de sustrato. La velocidad se
transforma en constante y es una Vmax, lo máximo que va a alcanzar.

Cuando el sustrato es igual al Km, la velocidad es la mitad de la velocidad máxima.

Entonces, como esto no es exacto, porque decimos que la velocidad tiende a ese valor, hubo dos autores que
transformaron este gráfico de hipérbole en una línea recta, el cual es mucho más exacto. Estos autores se llaman
Linewaever Bunk

LINEALIZACIÓN DE LA ECUACIÓN DE MICHAELIS-MENTEN

Vi -1 = 1
Vi

Y 1 = Km + [S] = Km + [S]
Vi Vmax [S] Vmax[S] Vmax[S]

1= Km x 1 + [S]
Vi Vmax [S] [S] Vmax

“Y” “m” “X” n”

Si yo grafico como Linewaeber Bunk ¿Qué pongo como variable independiente? 1/[S] ¿Cómo lo hago? Digo, si el sustrato
es 1 milimolar, el 1/[S] es 1. Si digo que es 2 será ½, etc. Y eso va a estar v/s un valor de 1/Vi. Si yo grafico esto me va a
dar una recta.

No puede haber una Km que sea negativa, el -1/Km es menos una concentración de sustrato, pero en realidad yo no
puedo tener una concentración -5 milimolar. Tiene que dar positivo.

La pendiente sería Km/Vmax.

INHIBICIÓN ENZIMATICA

Es cualquier molécula que pueda disminuir o detener la velocidad de una reacción catalizada por una enzima. Estos
inhibidores pueden actuar de dos formas:
 Reversibles: se unen a la enzima pero se pueden salir de la enzima también
 Irreversible: se unen covalentemente a la enzima y le impiden hacer su acción. “Matan” a la enzima. Impiden
que el sitio activo pueda hacer su acción, la deja fuera de servicio.
Dentro de los inhibidores que hay en el metabolismo, todos (la mayoría) son reversibles, a nosotros no nos sirve que nos
dejen inhabilitada una enzima para siempre.

INHIBIDORES REVERSIBLES

 Se unen a la enzima a través de enlaces

no covalentes
 Se puede recuperar la actividad
enzimática
Hay de dos tipos:
 Competitiva: El sustrato y el
inhibidor compiten por el mismo
sitio activo. El inhibidor tiene que
parecerse al sustrato, sino no
podría entrar al sitio activo. La
inhibición competitiva se termina si
aumento el sustrato. El inhibidor
entra al mismo lugar que el
sustrato pero el inhibidor no
produce producto, porque no es el
sustrato de la enzima, solamente le
quita el lado, pero si yo aumentara
la cantidad de sustrato, el sustrato
tiene más posibilidades de entrar.
 Efecto sobre la Vmax: el efecto inhibidor se revierte al aumentar la concentración del
sustrato alcanzándose igual Vmax
 Efecto sobre Km: aumenta la Km aparente. Se necesita más concentración de sustrato para
lograr la Vmax, si está en presencia un inhibidor competitivo.
Se llama Km
aparente
porque ya no
solo estoy con
el sustrato y la
enzima, tengo
además un
inhibidor. Por
eso se llama
Km aparente,
se necesita
más
 concentración de sustrato para lograr la Vmax o 1/Vmax si está en presencia de un inhibidor
competitivo.

 No competitiva: Se une a otro sitio distinto al sitio activo y por lo tanto no se parecen estructuralmente el
sustrato con el inhibidor no competitivo. Como se une a un sitio distinto, se une tanto a la enzima libre como
a la enzima que este con el sustrato. De las dos formas, le cambia la concentración a la enzima, entonces
hace a la enzima inactiva. Si se fijan, la enzima con el sustrato puede igual unir al inhibidor, pero esto es
inactivo, no da producto y a la enzima libre se le une el inhibidor y este por supuesto no da producto.
Entonces, no se parece estructuralmente.
 Efecto sobre la Vmax: El efecto inhibidor no se puede revertir al aumentar la concentración
del sustrato, por lo que Vmax será menor
 Efecto sobre Km: Se mantiene.

INHIBIDORES IRREVERSIBLES
El inhibidor se une de forma covalente e inhibe de forma permanente a la enzima. Nunca más deja entrar al sustrato.
Por ejemplo:
 La penicilina: inhibe de forma irreversible a una enzima bacteriana que fabrica el péptidoglicano que es la pared
de la bacteria.
 Gases neurotóxicos.

REGULACIÓN ENZIMÁTICA

¿Por qué necesitamos regular las enzimas? Para mantener la homeostasis de mi cuerpo. Que algunas reacciones curran
más rápido y otras más lentas de acuerdo a lo que necesite el organismo.

La regulación de la velocidad de las reacciones enzimáticas es esencial para coordinar los numerosos procesos
metabólicos.
Las enzimas regulables pueden aumentar o disminuir su actividad de acuerdo a lo que se les pida

Principales mecanismos de regulación:

 Regulación alostérica. Es la regulación de una enzima porque se le une una molécula en un sitio que no es el sitio
activo y a ese le llamamos sitio alostérico. La mayoría de las que sufre regulación alostérica tiene más de una
subunidad pero hay algunas que tienen una sola subunidad. Por lo tanto si yo quisiera graficar la gráfica de
velocidad inicial v/s concentración de sustrato ¿Qué forma tendría esa grafica para las enzimas alostéricas?
Sigmoidea. Los efectores alostéricos pueden ser positivos o activadores; o negativos o inhibidores
 Efector positivo: actúa en un sitio diferente del sitio activo, pero modifica la afinidad del sitio activo con
su sustrato
 Efecto negativo: transforma el sitio activo en algo más difícil para el sustrato.
¿Qué va a pasar si acaso yo pongo un activador alosterico? ¿Hacia dónde se desplaza la curva y por qué? Hacia la
izquierda. El Km disminuye porque se hace más afín la enzima con su sustrato ¿Qué pasa si agrego un inhibidor?
La curva se desplaza hacia la derecha, porque ahora vamos a aumentar el Km ya que el sitio activo se hizo menos
afín con el sustrato.
 Efectores homotrópicos: cuando el efector es igual al sustrato
 Efector heterotrópico: efecto es un metabolito diferente al sustrato

 Regulación por modificación covalente reversible: Se agrega un grupo químico a una enzima.
Si tengo dos enzimas 1, una con fosfato y otra sin fosfato ¿Qué grupo libres tiene la proteína? Todos los radicales y
dentro de esos radicales hay varios aminoácidos que tienen un alcohol y a ese OH se le puede agregar. Entonces esta
activa puede que se activa con el fosfato puesto y la otra enzima que perdió el fosfato, es inactiva. O sea, la adhesión de
fosfato hizo como un interruptor para activar la enzima.
Pero puede haber otra enzima, que es la enzima 2 y que también puede modificarse covalentemente reversible.
Tenemos una con fosfato y otra sin fosfato, pero esta es otra enzima diferente a la enzima 1. Sin embargo, esta enzima
cuando esta con el fosfato es inactiva y cuando pierde el fosfato es activa. Entonces, primera cosa, que sea activa o
inactiva depende de la enzima, no siempre con el fosfato van a ser activas.

¿Por qué reversible? Porque este fosfato se puede sacar y se puede poner, pero no son reversibles con la misma enzima
Entonces la que coloca el fosfato es una proteinquinasa (transferasa), mientras que la saca el fosfato es
preteinfosfatasa(hidrolasa).

La actividad enzimática es modulada por una modificación covalente reversible. Las modificaciones covalentes incluyen
la adición de muchos grupos químicos. La más común es la adición y salida de fosfato. La adición y la remoción son
catalizadas por proteínas diferentes. La modificación más común consiste en la adición o remoción de un grupo fosforil,
el cual se agrega a una serina, treonina o triosina (polares sin carga) y la enzima se llamará fosforilada o desfosforilada.

¿A qué biomolécula pertenece el ATP? Es un nucleótido. Es un ribonucleótido. Tiene un fosfato alfa, beta y gama. Las
quinasas sacan el gama, pero sacan el fosforilo y como lo pegan a un OH se forma el fosfato pegado a la enzima.

Entonces, las proteinquinasas agregan el fosfato a la enzima y lo sacan del ATP, por eso son unas transferasas.

La glucosa se trnasfor a en glucógeno, entonces esta enzima se llama enzima que sintetiza glucosa (después vamos a ver
los nombre correctos), pero cuando yo estoy por ejemplo haciendo ejercicio, gasto glucógeno que tengo guardado y la la
enzima transforma el glucógeno en N glucógeno y esta enzima se llamaría enzima que degrada el glucógeno. Estas dos
vías son opuestas, entonces cuando estoy sintetizando glucógeno, puedo estar degradándolo simultáneamente.
Entonces, cuando estoy sintetizando glucógeno, no se degrada, y cuando estoy degradando glucógeno, no se sintetiza.
Eso recibe el nombre de regulación de actividad enzimática de vías opuestas.

Esta enzima cuando tiene el fosfato es inactiva y esta enzima cuando tiene el fosfato es activa. Entonces la célula hace
una sola cosa, actúan las quinasas. La proteinquinasa lo único que sabe hacer es poner quinasa a las proteínas y quedan
las proteínas con fosfato. Unas quedaran activas y otras quedaran inactivas. Este es un ejemplo de dos vías opuestas en
que si acaso se activan las quinasas va a quedar activa la degradación de glucógeno y va a quedar inactiva la síntesis.

La modificación covalente reversible es otra forma de regular la actividad de las enzimas, consiste en agregar un grupo
químico a una enzima. Con la agregada de este grupo algunas enzimas se hacen más activas y otras se hacen menos
activas.

 Proteólisis limitada

Algunas enzimas se activan o se inhiben si se les une proteínas regulatorias. Otras, deben sufrir proteólisis limitada. Hay
un cambio conformacional para que el sustrato entre. Esto es modificación covalente irreversible.

*Las enzimas se llaman zimógenos cuando están inactivas, enzimas que para activarse necesitan una proteólisis limitada.

Cascada de Coagulación: se activa por proteólisis limitada, son puros zimógenos que se van activando en cadena,
cortando un pedacito y haciendo que funcione la cadena. Eso solo se va a activar si hay ruptura de un vaso, sino están
como zimógenos. Si los busco en la sangre, a estos factores de coagulación, los voy a encontrar como zimógenos.

 Separar las enzimas en compartimentos

 Existencia de complejos multienzimaticos.

Agrupación de enzimas que trabajan juntas. Nunca sale el producto de la primera enzima al medio, sino que es altiro
sustrato de la que sigue y así sucesivamente hasta que al final ese es el recién el que sale al medio. Estan dentro de una
complejo multienzimatico. Una cadena.
  Cambio en la cantidad de enzima
o Inducción si es una síntesis de nueva enzima
o Represión si se deja de sintetizar una enzima.
Hay enzimas que siempre tienen que estar en una misma concentración, a esas enzimas se les enzimas constituidas, no
pueden faltar. Esas enzimas siempre están. Sin embargo hay enzimas que se necesitan solo algunas veces y esas se
llaman inducibles, si después no se necesitan, se dice que se van a reprimir.

¿Qué cambio será más rápido? ¿Un cambio alosterico o un cambio de inducción? Alostérico
¿Qué cambio será más rápido? ¿Una modificación covalente reversible o una represión? Modificación covalente
reversible

Alostérico  más rápido de todos

Modificación covalente  inmediato o minutos
Inducción o represión  Horas, días o meses, sobre todo los asociados a hormonas

ENZIMAS DE UTILIDAD CLÍNICA

 Uso de enzimas como reactivos analíticos.
 Uso de enzimas como agentes terapéuticos. Por ejemplo si ha habido un infarto porque se formó un coagulo,
ese coagulo se puede disolver utilizando un medicamento que es una enzima.

En la sangre existen enzimas que siempre trabajan en la sangre, por ejemplo los factores de la coagulación qu están
inactivos porque no han sufrido la proteólisis limitada, pero si encuentro un zimógeno será normal, lo anormal sería no
encontrarlo. Sin embargo hay enzimas que podemos encontrar que nos son propias de la sangre sino que son propias de
los órganos como el hígado, cerebro, páncreas, corazón, etc. ya que esas células van muriendo y un poquito de esas
enzimas salen a la sangre, pero es un poco y esos son los valores normales. Si yo me saco una muestra de sangre y
analizo enzimas hepáticas en la sangre, tendrían que haber muy pocas porque se supone que mi hígado está normal y
solo deberían estar las células que se van muriendo. Pero si acaso he tenido un accidente, yo busco las enzimas
hepáticas en la sangre ahora y por supuesto que ese examen va a salir alterado. Lo mismo pasa con la hepatitis, porque
el virus de la hepatitis va a estar necrosando las células.

Las enzimas plasmáticas las dividimos en:

 Activamente secretado al plasma pero es sintetizado en otro lugar. Por ejemplos los factores de la coagulación
son sintetizados en el hígado.
 Grupo en pequeñas cantidad que provienen del recambio celular normal propias de los tejidos.

Patrón enzimático de un órgano: enzimas que son propias de ese órgano y no de otro

HIGADO
Tiene unas enzimas que se llaman aminotransferasas
 ALT (TGP o GTP) y AST (TGO o GOT)
Glutamico pirúvico y glutámico oxal acético. Estos están dentro de la célula, por lo tanto si las encuentro en la
sangre quiere decir que hay un daño del hígado.
 GGT  en membranas. Obstrucción de los conductos. Colestasia.

CORAZON
 Creatin Kinasa (CK o CPK)
 Lactatodeshidrogenasa (LHD)
 Troponinas

Isoenzimas: catalizan la misma reacción, pero tienen pequeñas diferencias en su estructura. Se pueden separar y son
propias de un órgano en particular.

CK-MB  propia del corazón

 CLASE 9
UNIDAD N°3
METABOLISMO

¿Para qué comemos? Para obtener nutrientes, los cuales nos entregan las proteínas y energía necesaria para realizar
movimientos y poder vivir. Para permitir la homeostasis (mantención del equilibrio interno)

¿Qué le hago a los nutrientes cuando los cómo? Primero los separo, moléculas grandes, las vamos a separar, las glucosas
que comemos en el pan que venían en un almidón, que era un polímero de glucosa, la voy a separar en glucosa, las
proteínas las voy a separar en aminoácidos

¿Cómo se llama la reacción de separación que hacemos en el tubo digestivo? Hidrolisis. Hidrolizamos los nutrientes en el
tubo digestivo para obtener moléculas pequeñas que sean capaces de absorberse. Sin embargo esto no basta para
obtener energía. Hay que hacer un ruptura de enlaces ¿Qué tipo de reacciones son las de catabolismo o degradación de
los nutrientes? ¿Qué significa catabólica? Significa que oxidamos los nutrientes. Si oxidamos los nutrientes alguien tiene
que reducirse ¿Quién tiene que reducirse? Las coenzimas (el agente oxidante), que quedaran como coenzimas
reducidas. Mencionamos anteriormente que hay ciertas coenzimas que participan con las enzimas de óxido-reducción:
NAD y FAD, por lo tanto, para que un nutriente se oxida, las coenzimas se tiene que reducir. Pero en último término en
nuestro organismo ¿Quién queda reducido? ¿Las coenzimas? ¿Qué otra cosa necesitamos para vivir? Oxígeno. ¿Qué
hace el oxígeno? Es el agente oxidante, que en último término va a recibir los electrones.

¿En que se transforma el oxígeno? Por una parte en Dióxido de carbono y por otra parte en agua.

¿Qué estado de oxidación tiene el oxígeno en el aire? (oxigeno gaseoso). Tiene estado de oxidación 0

Nosotros necesitamos nutrientes para oxidarlos, sacar la energía que están en estos enlaces, para poder oxidarlo
necesitamos que alguien se reduzca, el que se reduce es el oxígeno. Esa energía que traían los enlaces de los nutriente
que fueron oxidados vana a ayudarnos a formar otros enlaces, por ejemplo a formar ATP a partir de ADP + Fosfato.

Muchas veces contestan que la glucosa se transforma en ATP, eso no es cierto. El ATP es un nucleótido, por lo tanto
tiene nitrógeno en la adenina, tiene fosfato, la glucosa no tiene ninguna de esas cosas. Entonces la glucosa al oxidarse
nos libera energía que la célula tiene una forma de captar esa energía y permitir transformar en la energía para juntar
ADP + fosfato.

Nosotros hacemos el mismo proceso de combustión de la glucosa. Si yo le prendo un fosforo a esta hoja ¿En que se
transforma? CO2 y agua. El pan del desayuno lo transformo en CO2 y agua.

¿Qué cosa es el metabolismo? La sumatoria de todas las reacciones que ocurren en la celula. Esas reacciones no están
ordenadas, son miles de reacciones que se interceptan y ocurren a la velocidad que el organismo requiere en un
momento determinado. Se efectúan transformaciones químicas y energéticas para mantener la vida, el equilibrio del
medio interno.

VIA METABOLICA
Una vía metabólica es una secuencia de reacciones en que el producto de una sirve de sustrato a la que le sigue y si
acaso no libera el producto al medio, trabajaba al tiro la otra enzima, eso era un complejo enzimático

Cada una tiene su finalidad y su regulación.

La vía directa y la inversa nunca son iguales. Hablamos de una regulación, para que cuando ocurriera una que era la
opuesta de la otra, no fuera un ciclo inútil. El ejemplo que dimos fue la síntesis de glucógeno, cuando ocurría la síntesis
de glucógeno estaba disminuida la degradación y al revés, cuando estaba aumentada la regulación, estaba inhibida la
síntesis. Eso se podía regular por modificación covalente reversible y por regulación alostérica. Aquí tenemos la
glucógeno lisis, es la degradación de glucógeno y la glucogenogenisis es la síntesis de glucógeno. Acá arriba tenemos la
glicolisis es la oxidación de la glucosa y la gluconeogénesis es la síntesis de nueva glucosa.

Metabolismo se divide en:

 Catabolismo: Comprende las vías metabólicas que permiten convertir la energía de los combustibles que
comemos en energía necesaria para sintetizar moléculas. La vida va a depender de si mi enzima se
desnaturalizó, yo tenga capacidad de sintetizar otra, eso será anabolismo y para eso necesito la energía que me
dan las reacciones catabólicas

 Anabolismo: vía metabólicas que necesitan energía para la síntesis de moléculas para construir moléculas
complejas. Así como la glucosa no se puede transformar en ATP, tampoco la energía se puede producir, la
energía se transforma. Si yo como algo, esa energía se transformar, pero no es que se va a crear la energía.

La principal molécula que comemos es la glucosa, es el principal combustible humano. No comemos glucosa libre
¿Dónde hay glucosa libre? En la miel, en los jugos de frutas, en las frutas. Pero la mayoría está formando polímeros que
se llama almidón. El almidón de trigo, de papa, de arroz, pero al fin es un polímero de glucosa, solo glucosa tiene el
almidón. El almidón como todos sabemos, es el polímero de reserva de los vegetales, en nosotros el polímero de reserva
se llama glucógeno. Entonces existen organismos que tiene la facultad de poder sintetizar glucosa, que son los vegetales,
a partir de CO2 y agua y con la energía luminosa que es captada por la clorofila. Nosotros no somos capaces de hacer
eso. Nosotros comemos la glucosa pre-hecha por un organismo vegetal o comemos glucosa de un organismo animal que
él ya la hizo, por eso somos heterótrofos. Los organismos vegetales se llaman autótrofos.

Entonces aquí tenemos un autótrofos fotosintéticos, hay otros que son quimisinteticos y acá tenemos un heterótrofo,
un niño que tiene que comer un vegetal o carne de un animal que ya ha consumido un vegetal.

CATABOLISMO
 La primera parte del catabolismo son reacciones de degradación de las moléculas de la dieta o de la reserva.
Esas reacciones son reacciones de hidrolisis. Ahí todavía no hay oxidación.

 Luego de que se rompen estas moléculas, esas moléculas dentro de la célula se van a oxidar. Estas reacciones de
oxidación liberan energía, por eso se llaman exergónicas.

 Estas rutas metabólicas son rutas convergentes. Varias rutas distintas, llegan a una ruta común. Y más aún,
varias rutas diferentes llegan a un intermediario común.

La glucosa u otro nutriente se oxida a CO2 ¿Qué estado de oxidación tiene el carbono aquí? +4. El oxígeno gaseoso tiene
estado de oxidación 0. Este como es el agente oxidante se transforma en agua, ¿Qué estado de oxidación tiene aquí el
oxígeno? -2. Por lo tanto la glucosa se oxida y el oxígeno se reduce. Ese es el resultado final, eso no ocurre de una sola
vez, los electrones van a ser entregados al oxígeno, pero a través de una serie de otras moléculas.

Decíamos que llamamos convergente porque hay varias vías. Supongamos que acá están los glúcidos, supongamos que
acá están los lípidos que son los principales combustibles estos dos. Pero también las proteínas si es que pierden el
grupo amino pueden ser convergentes en una molécula. Esta molécula es una molécula central en el metabolismo, la
cual se llama acetil coenzimo A: AcetilCoA. Ahora vamos a entender qué es esto. Esta molécula esta parte que se llama
acetil ¿Cuántos carbonos tiene? 2, porque viene del ácido acético. Y esta parte sería esta. Estos dos carbonos, pueden
provenir de las proteínas, de los glúcidos o de los lípidos. Y está pegado este acetilo a un derivado de vitamina, a una
coenzima ¿Cuáles eran las vitaminas que daban origen a la mayoría de las coenzimas? Las hidrosolubles. Por lo tanto
esta deriva de una vitamina hidrosoluble que es el ácido pantoténico. Ahora, esta coenzima tiene final (la coenzima A),
tiene un grupo tiol (era equivalente a un alcohol pero que en vez de oxigeno tenia azufre), por lo tanto para acá, cuando
yo hago reaccionar un ácido carboxílico más un alcohol ¿qué da? Un ester. Si hago reaccionar un ácido carboxílico más
un tiol ¿qué me dará? Un tioester. Entonces este enlace que está aquí, es un enlace tioester. En otras palabras el
acetilcoenzimaA es un tioester y esta es la molecula central del catabolismo, la cual entra al ciclo de Krebs.
¿Para qué entra al ciclo de Krebs? Que se transforma en moléculas energéticas. Se sigue oxidando y se transforma en
CO2. Si acaso se siguió oxidando ¿Quién se redujo? Se reducen las coenzimas, para que s epoda seguir oxidando el
acetilCoA.

Entonces, el acetilCoA que derivaba de los glúcidos de las proteínas o de los lípidos, entró al ciclo de Krebs para que se
siga oxidando alguien tiene que quitarle los electrones ¿Quién se los quita? Las enzimas ayudadas por sus coenzimas o
grupos prostéticos ¿Cuáles coenzimas? NAD+ y FAD, los cuales se reducen para que este se haya oxidado.

Entonces, los electrones del pancito del desayuno están aquí ahora ¿a quién se lo vamos a entregar en último término?
A la cadena transportadora. Y la cadena transportadora ¿a quién se los va a entregar en último término? Al oxígeno. Y el
oxígeno se va a transformar en agua. Y ahí están las dos cosas que necesitamos para vivir. Comer y respirar.

ETAPAS DEL CATABOLISMO

 Hidrolisis. Aquí no hay oxidación todavía.
 Formación de intermediarios más sencillos como AcetilCoenzimaA. Aquí hay un poco de oxidación, pero la
oxidaciój completa da CO2 y agua (acuérdense de la hoja de papel, es una combustión)
 Los electrones son transportados a través de coenzimas reducidas las que trabajan con las oxido-reductasas
¿cuáles son? El NAD+ que se transformará en NADH y el FAD se transformó en FADH2. Eso después son
traspasados al oxígeno y esa energía del traspaso permite sintetizar ATP. Para que yo pueda sintetizar ATP,
tengo que tener ADP y fosfato.

Aquí tenemos el catabolismo ¿ En

qué se transforman las proteínas
con la hidrolisis? Aminoácidos ¿Los
polisacáridos? Monosacáridos. Los
lípidos aún no sabemos.
Aquí hay una vía que va a ser
convergente ¿A qué molécula?
AceilCoenzimaA. Los aminoácidos
que tuvieron que perder primero?
El amoniaco, sino no se pueden
transformar en acetilCoA. Este
amoniaco en nosotros, los
humanos se transforma en urea,
otros lo botan como amoniaco. El
aceiltCoanzimaA entra al ciclo de
Krebs y el acetilCoenzimaAse sigue
oxidando, por lo tanto hay
moléculas que se deben reducir
¿Cuáles son las moléculas que se
reducen? El NAD que se reduce a
NADH más un protón y el FADH2 y
por supuesto los carbonos se convirtieron en CO2. Aquí van los electrones ¿A dónde son entregados los electrones? En
un conjunto de moléculas que están en la membrana interna de la mitocondria que se llaman transportadores
electrónicos, cadena transportadora o cadena respiratoria. Van pasándose los electrones hasta ser entregados al
oxidante mejor de todos que es el oxígeno. Esa energía que se le sacó se usa en juntar ADP + fosfato. Entonces la síntesis
de ATP, asociada al transporte electrónico se llama fosforilación oxidativa.
Fíjense en algo, aquí decimos que se producían los coenzimas reducidas, pero aquí ya hay una producción de coenzimas
reducidas, unas poquitas. Entonces esto va a ser otra cosa, porque esto sucede en la mitocondria.

Si no hay traspaso de electrones, no se sintetiza ATP.

ANABOLISMO
 Reacciones de síntesis de macromoléculas.
 Son reacciones de reducción
 Son reacciones que necesitan energía ¿De dónde proviene esa energía? De las reacciones catabólicas. No ocurre
anabolismo si no ocurre catabolismo. No ocurre catabolismo si no necesito anabolismo.
 Son rutas divergentes (partiendo de unos pocos productos, se pueden obtener varias moléculas diferentes, es lo
opuesto del catabolismo)

Aquí tenemos el catabolismo a la

izquierda (flechas rojas) y el
anabolismo a la derecha (flechas
azules). Ahí dice que en el
catabolismo hay una energía neta
que se libera, en cambio en el
anabolismo dice que hay una
energía neta que se necesita para
poder sintetizar las moléculas
grandes. Esa es la unión del
anabolismo con el catabolismo.

Traten de ubicarse aquí ¿Cuál

sería el catabolismo ahí? ¿En que
molécula convergen?
AcetilCoenzima A. ¿De qué color
son las flechas catabólicas? Rojas.
Ustedes ven que las proteínas,
ácidos nucleicos, polisacáridos y
lípidos convergen en la molécula
central. Otra cosa que vemos es
que se le tuvo que sacar el grupo
amino a las proteínas para que
pudiera conectar con acetilCoA.
Las flechas azules son anabólicas,
si ustedes ven la primera parte del
anabolismo, lo hacen solamente
las plantas. En el anterior, aquí
dice que a partir de agua, CO2 y
amoniaco, yo puedo sintetizar
estas moléculas. Nosotros no
podemos hacerlo, en eso nos
ganan las plantas.
Entonces aquí tenemos los
productos de deshecho: Agua y
CO2, las plantas lo aprovechan
porque tienen clorofila y porque
pueden transformar en un
movimiento electrónico, la luz del sol, con eso vana a formar los primeros azucares. Nosotros de ahí para arriba
podemos agrandarlos y para eso necesitamos energía.
Las flechas rojas finas, representan a los electrones ¿Los electrones andan volando? No, andan a bordo del NADH y
FADH2. Entonces cada vez que haya oxidación tiene que haber producción de coenzimas reducidas. Esas coenzimas
reducidas, le entregan los electrones a la cadena transportadora de electrones y en último termino se lo entregan al
oxígeno y forman agua. El producto agua es un producto pero lo principal es que el oxígeno se redujo. La cadena
transportadora tiene por objetivo reducir al oxígeno. El propósito es que alguien reciba los electrones. Por eso es que
morimos si no tenemos oxígeno para respirar, porque mis coenzimas quedaran para siempre reducidas, no se van a
poder re-oxidar y se van de nuevo a buscar electrones.

Por mientras se traspasan los electrones, aquí se genera, se transforma sa energía en energía para juntar el ADP + el
fosfato y eso lo hace una enzima que está en la membrana interna mitocondrial para producir fosforilación oxidativa.

Existen vías que son solo catabólicas, o sea vías de oxidación. Los ácidos grasos aquí nos sirven muy de ejemplo. En
cambio la síntesis de azúcar (¿) es una vía anabólica.

Y hay otras vías que son de las dos: Anfibolicas, por ejemplo el ciclo de Krebs. El acetilCoA se oxidó, pero además del
ciclo de Krebs se pueden sacar cosas, no se imaginen que es un círculo, es un ciclo, entran cosas y salen cosas. Salen
cosas para sintetizar otras, por ejemplo el grupo Hem, se necesita a partir un intermediario del ciclo de Krebs, sin
embargo también sirve para oxidar al AcetilCoenzimaA. Por lo tanto será anfibólico: catabólico y anabólico.

Como están conectados el anabolismo y el catabolismo. El catabolismo va a producir moléculas energéticas ¿Cómo que
moléculas se producen por fosforilación oxidativa? ATP. ¿Qué otras moléculas se van produciendo si yo quiero ir
oxidando moléculas. NADH y FADH2, o sea coenzimas reducidas. Eso también es una forma de energía reducida, porque
los electrones van a ahí. Entonces la energía liberada en las reacciones catabólicas, se transfiere a dos tipos de
moléculas:
 Nucleótidos GTP, ATP.
 Coenzimas reducidas.
Pero hay una coenzima reducida que hace la conexión entre el catabolismo y anabolismo: NADPH. El NADPH también
deriva de la nicotinamida, eso igual da origen al NADP, que es un NAD pero que tiene un fosfato adicional. Entonces se
conectan mediante la energía y el poder reductor. La energía ATP, es el que va a necesitar ser las anabólicas y poder
reductor, que decíamos que el anabolismo era para sintetizar cosas y eran reacciones de reducción, tiene que recibir
electrones.

Yo voy a sintetizar ácidos grasos a partir del acetilCoA. Entonces esta es una reacción de reducción, porque aquí voy a
tener que perder oxígeno y cambiarlos por hidrogeno, y eso necesita una coenzima que me de los electrones y esa
coenzima va a ser NADPH.

RELACIÓN ENTRE CATABOLISMO Y ANABOLISMO

A la izquierda ¿Qué proceso ven? Catabolismo. Se tiene claro que partimos de nutrientes que son dadores de energía ¿y
cuáles son? Glúcidos, grasas y proteínas. Y mediante el catabolismo que son muchas reacciones van a producirse
productos que son pobres en energía, estos son los productos que devolvemos al medio: CO2, agua, amoniaco.

Entonces después en estas reacciones catabólicas, se sacó energía química en forma de ATP y en forma de NADPH, las
que se necesitaron en el anabolismo porque el anabolismo necesita energía y poder reductor. Poder reductor significa
electrones, los cuales vienen a bordo de NADPH.

Los procesos metabólicos están estrictamente regulados. Por la regulación de la actividad catalítica, podíamos
modificarlos alosterismo, por modificación covalente reversible, decíamos que las enzimas trabajan en las cercanías de
los Km, si yo aumento el sustrato la velocidad aumenta, si disminuyo el sustrato la velocidad disminuye.

Dependiendo del estado energético en que este la célula, predominará el catabolismo o el anabolismo. Un ejemplo,
tengo una célula rica en energía, tiene mucha ATP ¿qué va a hacer la célula? ¿Anabolismo o catabolismo? Anabolismo.
Entonces ¿Cómo puedo saber qué estado tiene la célula de acuerdo a la cantidad de ATP que hay? Si hay mucho ATP,
quiere decir que va a predominar el anabolismo, si falta ATP va a predominar el catabolismo. Todo esto tiene que estar
regulado.

Ahí les muestro una célula un poco artificial, pero para ver que las vías no suceden todas como revueltas, sino que las
vías están en determinado compartimentos. Si yo se que la glicolisis ocurre en el citoplasma, vamos a ver que algunas
coenzimas que se producen en la glicolisis están afuera de la mitocondria, por ejemplo. Entonces

En el citosol ocurre:
 Glicolisis
 Síntesis de ácidos grasos
 Vía de las pentosas.

En la membrana mitocondrial, en la mitocondria, en nosotros reviste mucha importancia, por lo tanto tenemos que
entender su anatomía: tiene un compartimento interno, que sería la matriz y tiene un doble membrana y por lo tanto
una membrana interna, un espacio intermembrana y una membrana externa.
 Membrana interna ocurre la cadena transportadora de electrones y en esa misma membrana ocurre la
fosforilación oxidativa.
 La matriz, es como un coloide, como un citoplasma pero dentro de la mitocondria. Aquí ocurre el ciclo de Krebs,
ahí ocurre la oxidación de los ácidos grasos.

Hay dos vías, la primera reacción ocurre en la mitocondria y luego continúa en el citosol.
 La gluconeogénesis
 Ciclo de la urea: como nosotros eliminamos el amoniaco
La primera reacción en la mitocondria y las otras en el citosol, es decir, sale el producto al citosol

BIOENERGETICA
Vamos a ver como los organismo vivos transformamos la energía y como permitimos que algunas reacciones ocurran
espontáneamente y otras no.

La parte de la energía libre es la que nos permite hacer trabajo. Nosotros siempre asociamos el trabajo con la fuerza
muscular, pero aquí nosotros estamos haciendo miles de trabajos en estos momentos. Por ejemplo: respirar, para poder
mover los músculos respiratorios tenemos que hacer sinapsis, para hacer sinapsis necesitamos trasladar electrones de
un lado a otro de la membrana, tenemos que estar bombeando sodio hacia el exterior de la celula, todo el rato, eso
requiere energía. Tenemos que estar manteniendo los compartimentos enteros que también requiere reparar y eso
requiere energía.

O sea, toda la vida requiere energía. La única vez que no necesitamos energía es cuando morimos porque ahí se arma un
desorden porque no podemos mantener los distintos sistemas ordenados.

Entonces veamos lo que es la bioenergética:

 Estudio de los cambios de energía que acompañan a las reacciones que ocurren
 La energía es una capacidad de efectuar trabajo

¿Cuál es la importancia en la bioquímica?

Nosotros para poder seguir vivos, tenemos que desarrollar distintos tipos de trabajo. Nuestra vida depende de estos
trabajos químicos.

Recordando entonces, los organismos vivos utilizamos la energía que proviene de sustancias químicas. Nosotros no
podemos utilizar energía calóricas porque somos isotérmicos (mantenemos la misma temperatura).
Leyes de la termodinámica

1°Ley
La energía solo se transforma, no podemos crear energía.

Cualquier ser vivo es un sistema, todo lo que lo rodea será su entorno. En mí, yo puedo aumentar la energía sacándole
energía al entorno, pero la suma del entorno más sistema se mantiene. El entorno pierde energía cuando nosotros le
sacamos un bistec, pero la suma se mantiene constante. Entonces la cantidad de energía total del universo es constante,
podemos llamar universo al entorno más un sistema.

La energía no puede crearse ni destruirse, solo se transforma. Pude cambiar en un sistema dado, pero la suma se
mantiene.

2°Ley
Los procesos químicos o físicos se producen solo si aumenta el desorden, se producen en forma espontánea. Imaginen
un bidón de gas licuado ¿cómo lo pusieron para que se licuara adentro del bidón? Redujimos el volumen porque
aumentamos la presión. Si abro la válvula de gas salen hasta alcanzar el máximo de desorden lo más lejos una de otra,
eso sería aumentar la entropía (grado de desorden de un sistema). Díganme ustedes ¿nosotros somos seres ordenados o
desordenados? Ordenados, la única vez que nos desordenamos es cuando morimos.

Para mantener el orden, nos cuesta ATP.

CLASE 10

Entonces hay reacciones que liberan energía que se llaman exergónicas y otras que necesitan energía que se llaman
endergónicas. No suceden espontáneamente las reacciones endergónicas, tengo que acoplarle una reacción exergónica,
para que la suma me dé un valor de ΔG negativo. El ΔG me permite predecir si acaso la reacción va a ocurrir tal como
está escrita, si es que el símbolo es negativo. Si el símbolo es positivo, la reacción no va a ocurrir tal como está escrita,
sino que va a ocurrir al revés. Entonces ΔG considera dos cosas, el calor que se pueda liberar y el desorden que se pueda
aumentar o disminuir. Si esta diferencia de calor es pequeña (diferencia entre los productos menos los reactantes) y
esto es muy grande, la tendencia al desorden, entonces ¿qué signo va a tener ΔG? Negativo. Pero si esto es muy chico y
la necesidad de calor es muy grande ¿qué signo va a tener? Positivo y la reacción no va a ocurrir.

Entonces ΔG considera las dos cosas, la variación de calor y la variación en el desorden entre los productos menos los
reactantes. El ΔG es el G de los productos menos el G de los sustratos o reactantes.

El signo entonces nos va decir si una reacción es espontanea o no. Entendiendo como espontanea que ocurre tal como
está escrita y eso tiene una relación con la constante de equilibrio.

Cuando yo tenía esta reacción

A+B C+D

Keq: [C] x [D]

[A] x [B]

Entonces aquí hay varias posibilidades, hay 3 posibilidades:

  Keq > 1  ΔG = - En el equilibrio hay las productos que reactantes. Va a suceder tal como está escrita. Si lo
relacionamos con ΔG ¿Qué ΔG tendría una reacción que tiene Keq menor a 0? Tendría una ΔG negativo
 Keq < 1  ΔG = + Significa que en el equilibrio, cuando las velocidades de la directa y la opuesta son iguales
¿Ahora de cual hay más? De los reactantes o sustratos. Por lo tanto la reacción no ocurre fácil como está ahí y
¿qué ΔG tendría? Positiva.
 Keq = 1 ΔG = 0 En el único caso en que ΔG es igual a 0 es cuando Keq es igual a 1. ¿Qué significa que sea igual
a 1? Que hay igual cantidad de esto que de esto. Esto implica que ΔG es igual a 0. Pero siempre en el equilibrio,
sea cual sea el valor de Keq la velocidad hacia ya es la misma que la velocidad hacia acá. Entonces las
concentraciones ya no cambian, pero no significa que las concentraciones sean iguales.

Si acaso acá tenemos:

X + Y  Z tiene un ΔG de +8 Kcal/Mol

¿Qué significa? ¿Qué la reacción ocurre tal como está escrita? No. ¿Que Keq tendría? Keq < 1.

Y que significa si esta misma reacción ahora tiene un ΔG de -8 Kcal/Mol. Keq > 1. Pero lo que quiero decir es que este
ΔG de la reacción directa, en comparación al ΔG de la reacción opuesta son iguales en valor absoluto, pero tiene signo
distinto. Opuesto.

El metabolismo hace varias reacciones que tienen un ΔG positivo, pero eso no significa que nosotros vayamos en contra
de las leyes de la termodinámica, sino que yo le voy a acoplar una reacción que le entregue.

A + B C +3 Kcal/mol
C + D  E -8 Kcal/mol
A + B +C  E -5 Kcal/mol

Estas son dos reacciones de una vía metabólica (reacciones secuenciales). Y resulta que A + B  C tiene +3 kcal/mol que
ΔG ¿Sucederá espontáneamente? No. Sin embargo, la reacción que tiene, porque le esta sacando el producto de la de
arriba, tiene -8 kcal/mol ¿Qué pasa si yo a este estoy sacando este producto, la enzima que sigue? Es lo mismo que tener
la 3 ecuación ¿qué hago con los ΔG? También se suman. Entonces el ΔG resultante sería -5 kcal/mol ¿Resultaría esta
ecuación? Sí. Esto es lo que pasa en muchas vías metabólicas, la suma final es una ΔG negativo, sin embargo, entre
medio hay reacciones que tienen ΔG positivo, pero yo las tengo que acoplar a una que tenga un ΔG negativo en valor
absoluto más grande.

Una de las reaccione que tiene un ΔG negativo es la hidrolisis de ATP. Si yo le acoplo la hidrolisis de ATP a una reacción,
la suma me va a dar negativo, pero si no se la acoplo esa reacción es termodinámicamente imposible.

Si nosotros queremos mantener la diferencia entre el sodio que está dentro de la célula y el sodio que está afuera, yo
normalmente estoy sacando el sodio que entra para que se mantenga esa diferencia y lo estoy haciendo en contra de la
termodinámica, porque voy en contra de la concentración, el sodio lo que tienda a hacer es entrar porque va de más
concentrado a menos, sin embargo nosotros lo hacemos a revés. Eso no podría resultar espontáneamente, por eso es
que tenemos que gastar ATP y existe la bomba Na+/K+, significa que hay una hidrolisis de ATP. Ese es un ejemplo muy
notorio, pero esto, que yo pueda moverme, va en contra si es que no le acoplo energía. Si acaso yo quiero hacer un
transporte de una neurona a otra, tengo que acoplarle energía.

Entonces, la vida depende de que yo sintetice moléculas energéticas que me permiten liberar energía para que se le
acople energía.
Ahí tenemos la energía libre que nosotros ya lo vimos con las enzimas, pero ahora estamos hablando de ΔG por lo tanto
entre productos y reactantes ¿Esa reacción es espontanea o no es espontanea? Es espontanea. El producto tiene menos
energía libre que los reactantes, por lo tanto ΔG tendrá signo negativo, por lo tanto será espontanea.

¿Cuándo no sería espontanea? Si acaso esto saliera allá arriba, porque entonces los productos tendrían más energía que
los reactantes y eso no ocurriría.

Exergonica entonces, se libera energía. Aquí está el nivel de energía, los productos tienen menos que los reactantes. Ahí
los reactivos tienen menos que los productos y esa sería una endergonica, necesito acoplarle algo que me entregue esa
energía o sino esta no va a ocurrir ¿Que Keq tendrá esta? Keq < a 1.

Acá tenemos algo que es vital entender también. La glucosa 6 fosfato, eso significa que a la glucosa se le colocó un
fosfato en el carbono 6 ¿Cómo se llamaban las enzimas que colocaban fosfato? Kinasa. Protein-kinasa si se la colocamos
a una enzima; esta se llama kinasa porque se la colocamos a una glucosa. Pero aquí que le estamos haciendo a esta
glucosa, está perdiendo el fosfato ¿Cómo se llamaban las enzimas que hidrolizaban los fosfatos? Fosfatasas. ¿Qué dice
este gráfico? Significa que los sustratos o reactantes tienen más energía que los productos ¿será espontanea? Sí. Pero
¿Qué significa? Que hay dos caminos que puede seguir la reacción:
 1.- Que la glucosa pase a un producto A que tiene más energía y que de ahí baje a B y de ahí a glucosa
 2.- Puede ir a uno que tiene menos pero después tiene que subir a esto

No importa cualquiera de los dos caminos, lo que importa es la diferencia de ΔG que va a ser el mismo. Va a ser negativo
en este caso. Por eso la energía libre de Gibbs se llama función de estados. Depende del estado inicial y el final pero no
de lo del medio ¿Por qué les muestro esto? ¿Con que objetivo? Para que entendamos esto

Aquí tengo una hoja de papel quemándose ¿en que se transforma la glucosa de la celulosa? CO2, agua y un poco de
ceniza. O sea la glucosa se oxidó, se combustionó hasta CO2 y agua. Nosotros hacemos exactamente lo mismo, pero en
la respiración celular, pero no en una sola reacción sino que en muchas ¿pero que importa? Lo inicial y lo final. Por lo
tanto, ahí debería estar todo más abajo, porque es negativa y es -686 kcal/mol libera energía la oxidación de la glucosa.
Y va a ser lo mismo que yo la queme dentro de la celula que yo la queme como papel. Lo mismo en liberación de
energía, nosotros no podemos aumentar la t° ni tampoco es así de rápido, yo lo voy haciendo en muchas reacciones
hasta alcanzar el nivel de energía libre que tengan los productos, en cambio, la combustión directa pasa muy rápido a
productos.

Función de estado depende de la energía final menos la energía inicial. Ambas en este caso, como son lo mismo son
exergonicas.

La ecuación que relaciona la diferencia de energía libre con la Keq:

ΔG °= -RT Ln * Keq
Ln: logaritmo natural. Su base no es 10.

Mientras Ln sea positivo, ΔG será negativo.

Volviendo a esto, si es mayor que 1, el ln será positivo y ΔG será negativo. Si acaso la Keq es muy chica, el ln de un
número menor que 1 es negativo ¿Cómo me va a dar ΔG? Positivo.

Entonces resumiendo:
 Keq > 1 ΔG = negativo (eacción ocurre tal como está escrita
 Keq < 1 ΔG positivo (reacción ocurre hacia el otro lado, no como está escrita)
 Keq = 1 Cuando es igual la concentración de los productos respecto de los reactantes y ΔG ln de 1 es 0 y 0 x RT
va ser 0.
ΔG de dos reacciones consecutivas se suman y el ΔG de la reacción directa es igual al ΔG de la reacción opuesta pero con
signo distinto.

¿Para qué sirve el catabolismo? Sirve para que la energía que le saqué a los nutrientes, la convierta en energía para
sintetizar ATP ¿Para qué me sirve el ATP? La hidrolisis del ATP es muy negativa, es exergonica, entonces puedo acopla
reacciones que son endergonicas y el resultado va a ser negativo el ΔG y por el ello va a poder ocurrir la reacción sin que
este infringiendo una regla de la electrodinámica.

Entonces las células asocian reacciones endergonicas utilizando la energía que se libera.

El catabolismo permite sintetizar moléculas energéticas cuya hidrolisis va a permitir que esto ocurra

No todas las reacciones exergonicas son hidrolisis de ATP. Puede haber hidrolisis de otros compuestos de alta energía, la
mayoría llevan fosfato, pero no todas. Por ejemplo, hay un compuesto que tiene un grupo funcional que lo tiene la
acetilCoA: tioester. Ese tioester cuando se hidroliza también libera energía, también le puedo acoplar reacciones que no
ocurrirían espontáneamente.

En reposo necesitamos 40 kilos de ATP. Entonces se va sintetizando a medida que se va necesitando, por eso tenemos
que respirar y oxidar continuamente, porque ahí se está produciendo la energía para que yo junte el ATP más el fosfato.
Los nutrientes sirven para entregar la energía que traían sus enlaces y esa energía mediante las transformaciones de
energía que nosotros hacemos, las convertimos en energía para juntar el ATP más el fosfato. Si yo necesito más ATP,
respiro más rápido, porque necesito que el oxígeno me reciba más electrones. Si estoy en reposo, respiro mesurado,
pero eso me basta para generar 40 kilos de ATP al día, porque tengo muchas reacciones endergonicas que necesitan que
se hidrolice ATP.

Hay moléculas que liberan más energía que otras. El ATP está en intermedio. Los que están más arriba liberan más y
esos son capaces de entregarle fosfato al ADP y formar ATP. En cambio, el ATP es capaz de entregarle fosfato a los que
están más abajo (glucosa, etc. etc.). Aquí se le llama escala de valores de ΔG de hidrolisis, pero también se le llama
transferencia de fosforilo. Las moléculas que están más arriba ¿Tienen mayor o menor facilidad para entregar su
fosforilo? Mayor facilidad. Vamos a ver después que en ciertas vías metabólicas se producen de esas moléculas, para
sintetizar ATP en otras vías que no es la de la mitocondria.

¿Por qué los compuestos que tiene fosfato liberan tanta energía? Porque cuando están con el fosfato puesto son muy
inestables. Tomemos como ejemplo el ATP: Tiene 3 fosfatos que son 4 cargas negativas, que las tenemos juntas ¿estarán
cómodas? No. Lo único que quieren es solarlo. Al soltarlo esos fosfatos se estabilizan por resonancia y se hidratan. Por
eso ΔG es negativo porque es mucho más espontaneo eso a que se le agregue.

Entonces, hay moléculas que transfieren el fosfato más fácil que el ATP. Hay moléculas que transfieren el fosfato más
difícil que el ATP. El ATP está al medio. La forma en que lo libera también es distinta. Si el ATP se transforma al tiro en
AMP libera muchas más energía.

Glucosa + H  Glucosa-6-fosfato + H2O ΔG=+3,3

ATP + H2O ADP + Pi ΔG=-7,3
Glucosa + ATP  Glucosa-6-fosfato + ATP ΔG=-4,0
(Hexoquinasa)

Esa reacción n ocurriría espontáneamente si yo lo hicieran como está arriba, sin embargo la hidrolisis del ATP, ya
sabemos que libera 7,3 kcal/mol. El fosfato y el agua se puede simplificar y la encima quinasa combina las dos
reacciones: una que es endergonica con la energía que le proporciona la hidrolisis del ATP que es exergonica.

Si yo estoy lo hago en un tubo de ensayo no ocurre, porque tengo que tener una enzima que conecte ambas reacciones.
Este es un ejemplo de reacción acoplada a la hidrolisis del ATP. No siempre el fosfato va a quedar unido, a veces hay
hidrolisis de ATP y no queda unido al fosfato (ligasas).
Ahora tenemos que ver como se sintetiza el ATP. Para ello tenemos que ver cosas muy básicas, como que nosotros
somos una máquina de óxido-reducción y que la energía de la oxidación de los nutrientes se utiliza para sintetizar ATP.
Ahora vamos a ver como se acopla.

OXIDACIONES BIOLOGICAS

El flujo de electrones significa que hay un proceso de oxidación, para que una molécula se oxide le tengo que sacar
electrones. El flujo de electrones puede realizar un trabajo biológico (trabajo osmótico, conducción nerviosa,
movimiento, etc.). El flujo de electrones en las reacciones de óxido-reducción será el responsable directo e
indirectamente de todo el trabajo que nosotros hagamos, se para la oxidación y nosotros nos morimos. Por eso ingerir
nutrientes es una necesidad vital.

¿Cuáles son los transductores moleculares? (transformadores)

Tenemos una batería química que permite un trabajo químico que va a hacer que fluyan electrones, eso se conecta por
ejemplo a un motor, el motor va a hacer girar un vástago que puede tener acoplado engranajes. Si hago girar este
vástago y hago que este unido a una cuerda, esta cuerda se va a recoger y puede recoger ese objeto. He transformado
un trabajo eléctrico en un trabajo mecánico

Hagamos nuestra analogía ¿Cuál es nuestra batería? ¿Quién va a producir nuestros electrones? La comida, pero la
comida porque yo la voy a oxidar, si no la oxido no le voy a sacar electrones. Entonces en la medida que yo coma
alimentos estoy comiendo compuestos que tienen hidrógenos y que se los puedo sacar. Recuerden un compuesto esta
reducido si tiene hidrogeno. En la medida que haya más hidrogeno más reducidos son, por eso que las grasas nos dan
tanta energía, porque son mucho más reducidas que los glúcidos. Con mi metabolismo le voy a sacar los electrones y en
último término se los voy a entregar al oxígeno. El oxígeno recibe estos electrones.

¿Quién es el transductor? ¿Quién transforma la energía? La mitocondria, porque la energía que traen estos electrones
se transforma en energía necesaria para juntar el ADP más el fosfato.

Se produjo el ATP, el ATP es el que se necesita para poder hacer una reacción endergónica que es una contracción
muscular.

El circuito biológico análogo a la batería es la fuente de electrones que es un compuesto relativamente reducido que
nosotros ingerimos; o glúcidos o ácidos grasos.

La producción de electrones, que no se produce sino que se transfiere desde los nutrientes a las coenzimas reducidas y
de ahí al oxígeno. A medida que se oxida enzimáticamente el compuesto libera electrones que fluyen espontáneamente,
o sea con un ΔG negativo a través de la membrana interna mitocondrial para ser entregado al oxígeno. Eso tiene un ΔG
fuertemente negativo que permite sintetizar ATP que es una reacción endergonica.

Las reacciones de óxido-reducción como ustedes se deben acordar, las podemos dividir cada una en media reacción.
Una media reacción de oxidación y una media reacción de reducción.

Entonces, una reacción de óxido-reducción:

Fe2+ + Cu2+  Fe3+ + Cu+

SR Oxi. Fe2+  Fe3+ + e-
SR Red. Cu2+ + e-  Cu+

El catión ferroso, se va a oxidar a catión férrico, solo sucede esto si es que el catión cúprico recibe el electrón que está
perdiendo el catión ferroso y por eso es que aquí el ferroso sería el reductor y el cúprico sería el oxidante.
Entonces, aquí están las dos semi-reacciones y el Fe+2 junto con el Fe+3 sería el par conjugado de óxido-reducción. Igual
cosa el Cu+2 con el Cu+.

Aquí entramos en materia de química orgánica ¿Cómo describirían esa imagen? Distintos grupos funcionales del
carbono ¿Cuál tiene más hidrógeno?
Por lo tanto mientras más hidrógenos tengan, más reducido está el compuesto, quiere decir que tengo más electrones.
¿Cuál es que está más oxidado de todos? El dióxido de carbono.

Los electrones son sacados paulatinamente. Vamos a ver reacciones en que un alcohol se convierte en un aldehído, se
está oxidando. En que un ácido carboxílico se convierte en un aldehído. Es tenemos que tenerlo claro, porque nosotros
somos reacciones de óxido-reducción.

OXIDACIONES BIOLOGICAS Y TRANSFERENCIA DE ELECTRONES

El carbono tiene distintos estado de oxidación en las células, mientras más reducidos estén, o sea más hidrógenos, más
electrones tiene. En los compuestos más oxidados un átomo de carbono está unido a más oxígenos y a menos
hidrogeno, por eso decíamos que el carboxílico es súper oxidado, pero es más oxidado el CO2 que no tiene ningún
hidrogeno. Recordemos que una oxidación es una pérdida de hidrogeno.

¿Cuáles eran las coenzimas que trabajaban con oxido reductasas que llamábamos deshidrogenasas? El NAD y el FAD,
que puede trabajar una como coenzima y otra como grupo prostético.

¿Cuáles son las formas de transferir electrones de una molécula a otra? Hay varias, por ejemplo, el que nosotros
transferimos del Fierro al Cobre eral el electrón directamente, en una reacción inorgánica (en una pila por ejemplo).
Pero también se pueden transferir en forma de hidrógenos porque estos dos hidrógenos tienen dos protones y dos
electrones y esto es lo que nos va a permitir ir oxidando, si yo le aco los dos electrones. Y este sería un par conjujado,
reducido-oxidado. Pero los electrones tienen que estar en algún lado. Los electrones no andan sueltos en una reacción,
andan a bordo de moléculas: FADH2, porque tiene dos electrones y dos protones o NADH que trae un hidrogeno con dos
electrones. ¿Cuáles eran los transportadores electrónicos que conectaban el catabolismo y el anabolismo? NADPH, pero
también puede ser NADH porque da origen a NADPH.

Entonces estas son formas de transferencia:

 Transferencia directa como electrones (cuando se oxida un elemento inorgánico)
 Transferencia en forma de átomos de hidrogeno
 Transferencia en forma de hidruro.
El H tiene 1 electrón y un 1 protón
El H+ tiene 1 protón y 0 electrones
El H- tiene 2 electrones y 1 protón.
Todos son formas de hidrogeno porque tienen Z = 1.
Un hidruro es un protón con dos electrones. Ahí tenemos nuestro conocido NAD+, el cual deriva de la
nicotinamida ¿por qué más? El NAD+ para transformarse en NADH recibe 2 electrones, un H-, pero que vienen
un solo hidrogeno. Por eso el NADH no tiene el signo +, porque se neutralizó con el H-.
 Uniendo directamente el oxigeno

Cualquier de estas transferencias electrónicas las podemos encontrar en las distintas reacciones metabólicas. El término
equivalente de reducción es para designar un equivalente electrónico simple. Por ejemplo, el NADH, tiene dos
equivalentes de reducción porque recibió dos electrones. El FADH2 tiene dos equivalentes reductores porque recibió
dos electrones que tenían dos hidrógenos.

POTENCIALES DE REDUCCIÓN Y AFINIDAD HACIA LOS ELECTRONES

El flujo de electrones no ocurre al azar. Si ustedes ven tiene que cumplirse, en la reacción que vimos acá. Si ustedes ven,
aquí, el Fe se oxida y el Cu se reduce ¿por qué no se puede oxidar el Cu a Cu2+ y reducir el Fe de catión férrico a ferroso?
¿Por qué la dirección es el Fe+2 pierde un electrón? ¿Por qué no Cu2+ pierde un electrón? ¿En que se fijaban para decir
que una reacción ocurría en una dirección? El estado de oxidación, pero había una fuerza, una fuerza que se llamaba
potencial de oxidación.

La transferencia de electrones ocurre espontáneamente solo en una dirección, desde el que tiene menos afinidad por
los electrones hasta el que tiene más afinidad por los electrones. Eso se puede medir, eso se llama potencial de
reducción. El potencial de reducción que se denomina con la letra Eo es una medida que está en voltios de la afinidad de
los electrones. El que tiene más afinidad por los electrones, se le pone un potencial de reducción mayor, más grande.
Entonces, con este ejemplo ¿Cuál era dentro de los que reciben electrones en nuestro organismo el que no lo soltamos,
el que tenía más afinidad por los electrones? ¿Quién se quedaba con los electrones que le sacábamos al pan? El agua. El
oxígeno del agua. El oxígeno es el que tiene más afinidad por los electrones, por eso no los sigue entregando, se quedan
con él.

CLASE 11
Estábamos viendo que para vivir necesitamos nutrientes y oxígeno. Durante el metabolismo, específicamente durante la
parte metabólica, oxidamos a los nutrientes y ¿Qué significa eso? Retirarles electrones. Esos electrones se podían retirar
como parte de hidrogeno, como parte de un hidruro, como electrones como tal y también se podían retirar si acaso yo le
ponía oxígeno a la molécula directamente. Estas formas coexisten con el objetivo de que esos electrones puedan
entregar su energía.

¿Cuál es el destino de los electrones? Formar agua porque van a ser entregados al oxígeno. Pero el objetivo no es formar
agua, el objetivo es sacarle la energía y con esa energía transformarla de tal manera de que me sirva para sintetizar ATP.
Ya sabemos que la energía se ocupa en juntar ATP más el fosfato.

Entonces teníamos el NAD+ en su forma oxidada y en su forma reducida, o sea ya recibió dos electrones que venían con
un hidruro. Cada vez que se produce NADH, colocamos también un protón, que es el que quedó del otro hidrogeno. Un
hidrogeno se llevó los dos electrones.

Ahí tenemos el FAD oxidado, el que si se reduce se le agrega un hidrogeno acá y acá. Cada hidrógeno lleva un electrón,
por lo tanto el FADH2 es la forma reducida de FAD, que de alguna parte sacó dos electrones a borde de dos hidrógenos.

La 4° forma, el oxígeno se incorpora covalente mente a una molécula. Este sería como un alcano, y este un alcohol. Si yo
lo siguiera oxidando ¿Qué me daría acá? Aldehído. Y si lo sigo oxidando ¿Qué me daría? Un ácido carboxílico. Esa es la
secuencia de oxidación. Alcano, alcohol primario y aldehído, acido carboxílico. Alcano, alcohol secundario, cetona. Hasta
ahí llego.

En la celula se dan todos esos tipos de óxido-reducción, claro que las reacciones no se llaman ni de reducción ni de
oxidación, porque las reacciones tienen que ser en simultaneo. No hay oxidación si no hay una reducción acompañando.

POTENCIALES DE REDUCCIÓN Y AFINIDAD HACIA LOS ELECTRONES

Hay moléculas o átomos que tienen más tendencias que otras para atraer los electrones, en la medida que un átomo o
molécula tenga más capacidad para atraer los electrones, se dice que tiene más capacidad de reducción, en el fondo es
un oxidante, porque se va a querer reducir. Entonces la capacidad de reducirse se mide con el potencial de reducción
que eso se hace en una pila con un electrodo de referencia. Eso se puede medir con un número que es una cantidad en
volt. En la medida que es más grande ese número significa que los electrones van hacia él, porque tiene más afinidad
electrónica.

Aquí hay una tabla de potenciales de reducción qu va desde los más chicos hasta los más grandes, de ahí conocemos
unas pocas moléculas. Conocemos el NAD+, FAD, oxigeno ¿Qué significa este ordenamiento? Significa que las moléculas
que están más arriba en su forma reducida, le entregan los electrones a los que están más abajo. De esta tabla, que
están ordenados en orden creciente de potenciales de reducción ¿Cuál es la molécula que atrae más a los electrones? El
oxígeno. Por eso que el aceptor final en la cadena transportadora es el oxígeno. Por eso es que podemos re-oxidar el
NADH, porque está más arriba que el oxígeno.
¿Cuál será más oxidante? ¿FADH2 o NADH? FAD porque está más abajo, más oxidante. ¿Cuál sería más reductor? El
NADH. Esta idea por ahora entendamos que están ordenados, pero la vamos a seguir trabajando.

Organismo aeróbicos necesitan oxígeno y nutrientes. Los nutrientes los oxidamos. ¿Quiénes se van a reducir? Las
coenzimas. NAD+ a NADH, el FAD a FADH2. Por lo tanto, para recibir electrones tiene que estar como NAD+ o FAD.

Como resultado de la oxidación de los nutrientes se producen compuestos reducidos como NADH, FADH2, y otros que
aún no conocemos. En último término estos compuestos reducidos, no directamente, pero a través de una serie de
transportadores que están ubicados en la membrana interna mitocondrial y que se llama cadena transportadora de
electrones, le van a entregar los electrones al oxigeno; y ya sabemos que el oxígeno es el último aceptor de electrones.

Esta energía que traen los electrones, cada vez se va perdiendo un poco de energía. Permite transformarla en la energía
necesaria para sintetizar ATP. En el fondo la energía electrónica es la que nos permite sintetizar ATP.

Aquí vemos que el catabolismo es convergente. Vemos que la acetilCoenzimaA se oxida dentro del ciclo de Krebs ¿por
qué? Porque va perdiendo electrones. Hay 4 salidas de electrones durante el ciclo de Krebs. Los electrones no andan
volando, el ciclo de Krebs está ocurriendo en la matriz mitocondrial. No quedan los electrones ahí en la matriz.

¿Qué le pasa los transportadores cuando entregan los electrones? Se re-oxidan ¿Para qué? Para ir a buscar más
electrones y volver en este ciclo y así respiramos. Vamos a buscar electrones, significa que estamos oxidando los
nutrientes. Si yo pudiera marcar con rojo o radiactivamente un electrón que estaba en la glucosa que estaba en el cereal
que comí en la mañana. Ese electrón lo encontraría en el oxígeno del agua que estoy botando. No nos damos cuenta,
pero eso está sucediendo.

 En la oxidación de los sustratos, los electrones son donados a las coenzimas oxidadas, las que se transforman en
coenzimas reducidas. El FADH2 sabemos que es un grupo prostético, una coenzima unida fuertemente.

 Las coenzimas unidas donan a su vez electrones a un conjunto especializado de electrones.

Una representación de la mitocondria:

Aquí adentro está el ciclo de Krebs. Hay miles de ciclos de Krebs. En este organoide hay dos membranas. Hay un espacio
intermembrana. Entonces, hay dos compartimentos:
 Compartimento intermembrana
 Matriz

La cadena transportadora está ubicada en la membrana interna, recibiendo las coenzimas reducidas del ciclo de Krebs.
El objetivo es traspasar los electrones que venían del ciclo de Krebs como coenzimas reducidas y entregárselos al
oxígeno para dar agua.

Complejos multienzimaticos (multiproteicos): regulables y mucho más eficientes que enzimas sueltas. No hay perdida
de enzima 1 hacia el medio.
Adicionalmente cuando los electrones van siendo transportados se genera una posibilidad de que pasen protones al
espacio intermembrana. Por todos los complejo van a pasar protones al espacio intermembrana. Si pasan protones al
espacio intermembrana, este lado de la membrana será más positivo y más básico que el otro lado. Por lo tanto, aquí va
a haber una diferencia de pH y de carga. Eso se llama gradiente electroquímico, en está más ácido y más cargado
positivamente el lado que está mirando al espacio intermembrana.

Los protones que son bombeados hacia el espacio intermembrana están incomodos porque todos son de la misma carga
y todos están bajando el pH, lo único que quieren es salir de ahí y liberar energía. A eso se le llama fuerza protón-motriz.
Estos protones vuelven al espacio intermembrana y con eso liberan energía y esa energía se usa para sintetizar ATP.

Cada vez que pasan electrones por la cadena transportadora se bombean protones en contra de su gradiente, porque
están más concentrados en el espacio que en la matriz. Es algo que hace haya una energía potencial.

Nosotros no somos una maquina muy eficiente, porque no toda la energía la transformamos ene energía para sintetizar
ATP. Una parte importante la perdemos porque estamos irradiando calor, ya que necesitamos mantener los 37°.

En la medida que los electrones van pasando por la cadena transportadora van perdiendo parte de su energía libre, la
que va haciendo que se pueda sintetizar ATP.

Aquí se re-oxidan las coenzimas. Si no hay re-oxidación la respiración se para, porque no tengo quien reciba los
electrones. Si no tengo quien reciba los electrones, van a quedar todos como reducidos y no va a poder sintetizar ATP. Si
me quedan reducidas las coenzimas los electrones quedan frenados. Hay venenos que hacen eso, como el cianuro. Estoy
respirando pero no puedo utilizar el oxígeno. Eso lo mismo que si yo me ahogara, porque en ese caso tengo los
pulmones llenos de agua.

COMPLEJOS MULTIENZIMATICOS DE LA MEMBRANA INTERNA

Son 4 complejos multiproteicos para transportar los electrones y son dos que no son complejos multienzimaticos, son
moléculas chicas: la coenzima Q y el citocromo C que son moléculas móviles, se mueven recibiendo los electrones y los
van a entregar al otro complejo.

Pero que estoy estableciendo. Hasta aquí llegan los electrones no más, en que el complejo 3 se los entrega al oxígeno.
Pero hay otro complejo, que se llama complejo 5, que no recibe electrones, sin embargo esa es la ATP-sintasa, la que
sintetiza el ATP.

Entonces decimos que se produce un gradiente de pH, gradiente eléctrico, síntesis producida por la fuerza protón-
motriz. Esas dos cosas hacen que se sintetice ATP.

 Reacciones sucesivas de óxido-reducción que permiten formar ATP

 Intermediarios claves como el FADH2 y NADH son los responsables de transferir el poder reductor desde las
moléculas biológicas (glúcidos, ácidos grasos, proteínas) hasta los complejos enzimáticos de las mitocondrias.

 En el proceso participan proteínas transmembrana que son los complejos ubicadas en la membrana interna de la
mitocondria

 El propósito de las reducciones sucesivas (del traspaso de electrones sucesivo) es crear una fuerza protón-
motriz. Más que crear es transformar.

Aquí se ve la membrana externa, la membrana interna, que esta invaginada para aumentar la superficie, esta membrana
es que a que tiene más proteínas de todo el organismo, porque tiene muchos complejos respiratorios y mucho ATP-
sintasa. Y ahí se ven unas pelotitas que aún no sabemos que son.
En la mitocondria los transductores (transformadores de energía) ligados a la membrana, acoplan el flujo de electrones a
la producción de una diferencia de pH transmembrana y eso hace que este gradiente de protones pueda transformarlo a
través de la enzima ATP-sintasa en energía para sintetizar ATP

La transferencia de electrones hacia el oxígeno como ya vimos que iba a favor de que el oxígeno los tomara, eso es
espontaneo, por lo tanto será una reacción exergonica, la transferencia. Pero en cambio la síntesis de ATP es
endergonica. Entonces, tengo que acoplar la transferencia de electrones a la síntesis de ATP.
Cuando yo transfiero desde el NADH o de uno que está más arriba del oxígeno a una que este más abajo o al oxígeno,
esta diferencia de potencial de reducción es positivo. Si esta diferencia es positiva ¿Cómo será ΔG? Negativo. Entonces
de la única manera de que haya una transferencia electrónica es de tal manera que la diferencia de los potenciales de
reducción sea positiva, para que la reacción sea exergonica y sea espontanea. Diciéndolo de otra manera no puede
haber transferencia desde el agua al NAD+, porque ahí me saldría una diferencia de potencial negativa y el ΔG me daría
positivo y la reacción no ocurriría. Solo ocurre si esta diferencia es positiva. Esa ecuación se llama la ecuación de Nernst.

ΔG° = -nF ΔE°

n = número de electrones que se van transfiriendo
ΔE° = diferencia de potencial de reducción
F = constante de Fahrenheit

Entonces, ΔE° tiene que ser positivo para que la reacción ocurra, porque o si no ΔG da positivo.

Dentro de los complejos hay distintos de estos Fe, Cu también. Estos están ordenados de una manera en que sus
potenciales de reducción van aumentando cada vez hasta llegar al oxígeno que es el que está más positivo. Los
electrones fluyen espontáneamente. Por ejemplo, si pones un plato con una gotita de agua y pones la punta de una
servilleta, hay una fuerza de absorción, el oxígeno por supuesto no tiene fuerza de absorción, pero sí de atracción de
electrones al final de la cadena, por lo tanto la gota no pasa de la servilleta a la gota. Tiene una sola dirección posible
termodinámicamente.

Recordar que solo ocurren espontáneamente las exergonicas y para que sea exergonica va a tener que ser positiva la
diferencia de potencial de reducción.

¿Qué es esa diferencia de potencial? Para eso tengo un ordenamiento en la tabla. La diferencia se saca así. El potencial
de reducción tal como está escrito en la tabla de la semi-reacción de reducción, si yo tengo oxígeno y tengo NADH
¿Quién es el aceptor de electrones? El oxígeno. Y aquí tendríamos que poner el NADH, pero busco el potencial de
reducción que está en la tabla escrito como potencial de reducción aunque se esté oxidando el NADH.

Acetaldehído + 2H+ + 2 e-  Etanol

Los vamos a reducir a etanol, sabemos que el aldehído era más oxidado que el etanol, por lo tanto ¿Qué recibió el etanol
para reducirse? Electrones entregados por el NADH. Tengo una reacción de reducción y el NADH al entregar los
electrones se va a re-oxidar. Se va a re-oxidar el NADH y se va a reducir el etanol ¿Cómo sacamos ΔE (diferencia de
potencial de reducción del aceptor)? ¿Cuál sería el aceptor? El acetaldehído. Entonces nos vamos a la tabla. Dice -0,2.
Eso menos el potencial de reducción del dador ¿Quién era el dador? El NADH. Busco el NADH, es -0,32. Escrito como
potencial de reducción sería:

ΔE° = -0,2 - -0,32 = +0,12

¿La reacción es espontanea o no? Sí, porque el ΔE° es positva, por lo tanto ΔG es negativo. Sin embargo no puedo
hacerlo al revés, que el etanol que reduzca al NAD+. Eso está dado termodinámicamente, eso significa que hay algunas
reacciones posibles y otras no, pero esta transferencia de electrones hacia el oxígeno es posible. Es exergonica.
Entonces aquí recordar que los potenciales de la semi-reacción siempre se miden en el sentido de la reducción, aunque
aquí vimos que este se estaba oxidando (NADH).

Me permite sacar, si yo se la constante, este tremendo valor. Entonces, esta energía se libera. Exergonica. Y de aquí saco
una parte para mantener calor y una parte para sintetizar ATP.

La transferencia de electrones es responsable directa e indirectamente de que nosotros vivamos, porque vivimos porque
trabajamos. Todo requiere ATP.

Las reacciones de deshidrogenación son oxidación, por lo tanto las deshidrogenasa son oxido-reducción.

CADENA TRANSPORTADORA DE LA ELECTRONES

Conjunto de transportadores electrónicos situados en la membrana interna mitocondrial. Están ordenados en orden
creciente de potencial de reducción. Los electrones van bajando en energía hacia el oxígeno y no puede ser la
transferencial revés porque no cumpliría la ley que tenemos que cumplir todos.

Hay sucesivas reacciones de óxido-reducción, desde los compuestos con menor potencial de reducción hasta el oxígeno.
En la tabla se indican los potenciales de reducción de algunos. El oxígeno es el más oxidante de todos, que no es un
complejo, es un gas.

Los citocromos son proteínas que tiene un grupo protético Hem ¿Qué catión tenía el grupo hem? Ferroso. La
hemoglobina transporta oxigeno solo si el Fe está como Fe+2. El Fe+2 es capaz de unir oxígeno, por eso que yo me moría
si el Fe+2 pasa a Fe+3, por eso que la globina protegía de la oxidación al catión ferroso. Pero estas otras hemoproteínas
tienen otra función: transportar electrones. Por lo tanto su función depende que el Fe cambie de estado de oxidación
porque el catión férrico que estaba oxidado, va a recibir un electrón y se transformará en Fe+2. El férrico recibe un
electrón y se transforma en ferroso, el ferroso entrega el electrón y se transforma en férrico, entonces está
continuamente transitando por esos dos estados de oxidación. Porque recibe electrones se reduce, entrega el electrón
al otro que sigue y se oxida. Fluctúa el estado de oxidación. Esos son los citocromos. Hemoproteínas. Entonces el
transporte electrónico ocurre solo cuando está presente el oxígeno.

¿Qué pasará con las coenzimas si no estoy respirando? No se re-oxidan. Quedan reducidas. Por lo tanto no hay entrega
de electrones, si no hay entrega de electrones no se puede sintetizar ATP y por eso que no morimos.

Fosforilación Oxidativa

Es la síntesis de ATP acoplada a la cadena transportadora de electrones. La síntesis es la reacción endergonica. La

reacción exergonica es la transferencia de electrones acoplada al transporte electrónica en la cadena respiratoria.

Esta es la principal, la más grande cantidad de ATP. No es la única, después vamos a ver que hay otra síntesis de ATP que
no requiere que haya oxígeno. No todas las células tienen mitocondria. Es una paradoja, porque la célula que transporta
oxigeno no tiene mitocondria, los glóbulos rojos no tienen mitocondria, pero tiene que vivir, por lo tanto va a tener otra
forma de síntesis de ATP, no fosforilación oxidativa. Se llama oxidativa porque depende de la reducción del oxígeno.

Síntesis de ATP acoplada al transporte. La síntesis de ATP es endergonica. El transporte electrónico es exergonico. Ahí
tenemos el acoplamiento. Esto funciona mientras estén acoplados.

La síntesis de ATP es catalizado por el complejo ATP-sintasa que es el complejo 5.

Teoría de Mitchell  consiste en un gradiente electroquímico a través de la membrana interna

Estos protones que salieron al espacio intermembrana solo porque hubo transferencia electrónica se van a aumentando
aquí, por lo tanto acá habrá mayor carga positiva y menor pH que adentro. Es hace que los protones vuelvan a la matriz.
Acá tenemos los complejos de la cadena transportadora que son complejos multienzimaticos. El 1, el 2, el 3 y el 4. Son
muchas proteínas cada uno. El 4 le entrega los electrones al oxígeno. No es la proteína el que le entrega el electrón, sino
que hay cationes, hay coenzimas adentro (recuerden que esas eran las ayudadoras de las enzimas). Entonces los
electrones que están aca.

Hay 2 que no son complejos, que son los móviles que serían la ubiquinona o coenzima Q, que esta aquí entre el
complejo 1 y el 3; y el citocromo C que es una proteína chiquitita en comparación a estos complejos que atraviesan la
membrana.

En la medida que los electrones van pasando

por estos complejos, se van bombeando
protones al espacio intermembrana. Se dice
bombeando porque van contra el gradiente.
Los complejos que bombean protones son el
1, 3 y 4. El 2 no. El 2 es un complejo que es
común a la cadena respiratoria y al ciclo de
Krebs. Entonces el complejo 2, tiene un
grupo protético que ya les digo cual, veamos
por orden primero.

Si los electrones venían como NADH, entran

a nivel del complejo 1 ¿Cuál es la trayectoria
que siguen? Complejo 1, coenzima Q,
complejo 3, citocromo C, complejo 4,
oxigeno. Y eso me permitió bombear una
determina cantidad de protones.

Si entra como FADH2, FADH2 es parte de

este complejo, por lo tanto entra a nivel de acá, de acá se va al coenzima Q y después sigue la misma trayectoria.

Si los electrones vienen a bordo del NADH, comparado con los que viene a bordo de FADH2 ¿Cuáles electrones permiten
bombear más protones? Se bombean protones en el complejo 1, 3 y 4. El NADH entra al 1, por lo tanto va a aprovechar
esta bombeada, esta y esta. Si entran como FADH2, entra acá, por lo tanto se pierde la primera, por lo tanto si los
electrones vienen a bordo de NADH se genera mayor fuerza protón-motriz y se sintetiza más ATP.

Veamos cómo se sintetiza. Yo tengo los protones en el espacio intermembrana, ahí está la energía potencial. ¿Cómo la
vamos a bajar para que libere energía? Estos protones pasan al espacio de la matriz por medio de la ATP-sintasa. Por
dentro de la proteína hay un canal para que entren los protones y se libere la energía para sintetiza ATP. Entran los
protones y está rota, por un lado entra ADP + fosfato y por el otro lado sale ATP. Se movió la enzima. Esto se llama
catálisis rotatoria. Esto resulta solo si están acoplados y solo si esta membrana interna esta entera; si yo le pongo un
detergente que le haga hoyos a la membrana interna, esta mitocondria no me va s servir para nada, porque los protones
se van a escapar por cualquier lado y se va a disipar esa energía, no se va a concentrar en hacer girar a la enzima.