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Tutorial Func - Basic Gauss - View

Este documento proporciona instrucciones para utilizar el software Gauss View para diseñar estructuras químicas. Explica tres métodos para diseñar propan-1-ol e incluye pasos para insertar átomos, fragmentos y grupos funcionales, formar enlaces, agregar etiquetas y medir propiedades geométricas como longitudes de enlace, ángulos de torsión y ángulos diedros. El documento ofrece detalles completos sobre cómo utilizar las funciones básicas de Gauss View.
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Tutorial Func - Basic Gauss - View

Este documento proporciona instrucciones para utilizar el software Gauss View para diseñar estructuras químicas. Explica tres métodos para diseñar propan-1-ol e incluye pasos para insertar átomos, fragmentos y grupos funcionales, formar enlaces, agregar etiquetas y medir propiedades geométricas como longitudes de enlace, ángulos de torsión y ángulos diedros. El documento ofrece detalles completos sobre cómo utilizar las funciones básicas de Gauss View.
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Funciones Básicas para la Utilización de Gauss View

Para iniciar el software


Gauss View. Tres opciones…

1. Doble clic sobre el


icono del escritorio

2. Clic sobre el icono de


la barra de tareas.

3. Inicio… Todos los programas… Carpeta


Gauss View 5.0… Clic sobre el icono

Ventana de
Barras de
herramientas y
menús

Ventana: Área
de diseño de
estructuras
Para insertar
elementos
químicos

En átomo azul
activo para
formar enlace

Se escoge el
tipo de
hibridación
del átomo

Para insertar
fragmentos de
anillos
Para insertar
fragmentos de
grupos
funcionales

Para insertar
fragmentos
biológicos

Tipos de
Fragmentos:
Aminoácidos,
nucleósido…
Para Diseñar una Estructura en Gauss View
Diseñar Propen-1-ol (Método 1)

Insertando átomos individualmente….

1. Clic en icono
elementos
químicos

2. Clic en
botón de
elementos

3. Clic sobre
el elemento a
insertar

4. Clic sobre
el átomo
individual

Cada clic sobre el área de diseño inserta un átomo…

5. Clic sobre
el botón de
elementos
para insertar
el átomo de
oxigeno.
Ahora se inserta el átomo de oxigeno…

6. Clic sobre
el elemento a
insertar

7. Clic sobre
el átomo
individual

Para la formación de los enlaces de la cadena principal….

8. Clic en el icono
modificar enlace
10. Escoger el tipo de
enlace.

11. Clic ok.

9. Clic sobre cada átomo


a enlazar (sólo dos).

13. Escoger el tipo de


enlace (doble).

14. Clic ok.

12. Clic sobre cada átomo


a enlazar (sólo dos).

Repetir procedimiento para enlazar el átomo de carbono con el oxigeno…


15. Clic en el icono para
adicionar hidrógenos

Precaución:
Tener en cuenta
hibridación del átomo

16. Dar varios clic de acuerdo al No


de hidrógenos que van a adicionar

17. Dar varios clic de acuerdo al No


de hidrógenos que van a adicionar
18. Dar zoom a la
molécula: Clic derecho
sostenido y mover cursor

19. Girar molécula: Clic


izquierdo sostenido y
mover cursor

20. Menú View… Center…


Para centrar la molécula
21. Clic en Clean…
Para mejorar configuración geométrica
espacial de la molécula.

22. Molécula lista.


Para Diseñar una Estructura en Gauss View
Diseñar Propen-1-ol (Método 2)

Insertando un fragmento de grupos funcionales….

1. Clic en icono
fragmentos de
grupos
funcionales

2. Clic en
botón de
grupos.

3. Clic sobre
el grupo a
insertar

4. Clic sobre
el área de
diseño para
insertar el
fragmento

5. Centrar
molécula.

6. Darle
zoom a la
molécula
Para insertar el átomo de oxigeno…

7. Clic en icono
elementos
químicos

8. Clic en
botón de
elementos

9. Clic sobre
el elemento a
insertar

10. Clic sobre


el átomo de
Oxigeno
tetravalente

11. Clic sobre


un átomo de
hidrógeno para
sustituirlo con
el oxigeno
12. Clic en el icono para
eliminar átomos

13. Clic sobre átomos


a eliminar

14. Clic en el icono


modificar enlace

15. Clic sobre cada


átomo a enlazar
(enlace doble).
16. Clic sobre el
enlace doble.

17. Clic en ok.

18. Clic en Clean…


Para mejorar configuración geométrica
espacial de la molécula.

19. Molécula lista.


Para Diseñar una Estructura en Gauss View
Diseñar Propen-1-ol (Método 3)

Insertando elementos individualmente con su respectiva hibridación….

1. Clic en icono
elementos
químicos

2. Clic en
botón de
elementos

3. Clic sobre
el elemento a
insertar

4. Clic sobre el
átomo con su
hibridación

5. Clic sobre el
área de diseño

6. Clic en
botón de
elementos

7. Clic sobre
el elemento a
insertar

8. Clic sobre el
átomo con su
hibridación

9. Clic sobre el
átomo de
hidrógeno para
seguir la cadena
10. Como el
siguiente átomo
tiene la misma
hibridación se
da clic al final del
doble enlace
incompleto

11. Clic en
botón de
elementos

12. Clic sobre


el elemento a
insertar

13. Clic sobre


el átomo con
su hibridación

14. Clic sobre el


átomo de
hidrógeno para
seguir la cadena
15. Clic en Clean…
Para mejorar configuración
geométrica espacial de la molécula.

16. Centrar
molécula y listo.

En el diseño de estas estructuras es importante identificar cada átomo,


por tanto, se deben adicionar las etiquetas….

1. Clic derecho
sobre el área de
diseño

3. Clic en labels.
Repetir y después
2. Deslizar cursor en Symbols
a View..
4. Asigna un
número y el
símbolo.
Y molécula
lista.

Para Medir Propiedades Geométricas en Gauss View

Después de diseñada y ajustada la configuración geométrica espacial de la


molécula….

 Medición de longitudes de enlace…. 1. Clic sobre el icono de modificar


enlace.
(Nota: Dos átomos consecutivos)

2. Dar clic independientemente


sobre dos átomos consecutivos.
3. El valor que se muestra
indica la distancia de enlace y
se expresa en angstrom (Å)

4. Clic en Ok.
Y así se puede medir la
distancia entre dos átomos
cualesquiera.

 Medición de ángulos de torsión….


(Nota: Tres átomos consecutivos) 1. Clic sobre el icono de modificar
ángulo.

2. Dar clic
independientemente
sobre tres átomos
consecutivos.
3. El valor que se muestra
indica el ángulo de torsión y
se expresa en grados (°)

4. Clic en Ok.
Y así se puede medir el
ángulo de torsión entre
tres átomos cualesquiera.

 Medición de ángulos de diedros….


(Nota: Cuatro átomos consecutivos)
1. Clic sobre el icono de modificar
diedro.

2. Dar clic
independientemente
sobre cuatro átomos
consecutivos.
3. El valor que se muestra
indica el ángulo diedro y se
expresa en grados (°)

4. Clic en Ok.
Y así se puede medir el
ángulo diedro entre cuatro
átomos cualesquiera.

Diferentes Visualizaciones de las Moléculas en Gauss View

1. Clic derecho
sobre el área de
diseño

3. Clic en Display
Format.

2. Deslizar cursor
a View..
4. Clic en el menú
Molécula

5. Clic en la viñeta

6. Cuadro
visualizaciones

7. Clic en Ok.
Repetir para cada
visualización.

Ball and Stick

Ball and Bond type

Tube

Wireframe
Ejercicio de Práctica

Diseñar esta estructura en Gauss View… Tener en cuenta la hibridación de


cada átomo.

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