Ácidos Nucleicos
1. Ácidos nucleicos:
Estructura General:
Los ácidos nucleicos constituyen la segunda macromolécula de importancia biológica
después de las proteínas, y sus funciones estan muy relacionadas con estas últimas. Como
macromoléculas, presentan las características estructurales comunes a todas ellas.
Las funciones de los ácidos nucleicos están relacionadas con el funcionamiento del aparato
genético celular, o sea, con el conjunto de moléculas y mecanismos que garantizan la
trasmisión y expresión de los caracteres hereditarios de generación en generación y, por
tanto, son de un gran valor en la perpetuación de las especies.
El descubrimiento de su estructura fue uno de los más importantes hitos de la biología
contemporánea, y de ello hace apenas algo más de 40 años. Desde entonces, muchos son
los datos que han enriquecido el conocimiento de la estructura y las funciones de estos
compuestos, de forma tal, que en nuestros días existe una imagen bastante aproximada de
ellas.
Dos son los tipos principales de ácidos nucleicos que se diferencian, tanto estructural como
funcionalmente: los ácidos desoxirribonucleicos (ADN) y los ácidos ribonucleicos (ARN). De
cada uno de ellos existen diferentes subtipos. Ambos surgen como consecuencia de la
polimerización de unidades estructurales más sencillas, denominadas nucleótidos.
Presentan estructuras tridimensionales complejas muy relacionadas con las funciones que
realizan y son portadores de información molecular.
Tipos principales: ADN Y ARN
Desde el punto de vista funcional los ADN cumplen solo la función de ser los reservorios
celulares de la información genética, en tanto los ARN pueden realizar funciones diferentes,
aunque todas ellas relacionadas con la síntesis y procesamiento de proteínas. Entre estas
funciones tenemos:
1. Dirigen la síntesis de proteínas en el proceso de la traducción.
2. Forman parte de la estructura de los ribosomas y parecen tener allí una participación
funcional importante.
3. Preparan a los aminoácidos para la síntesis de las proteínas y los transfieren al
ribosoma.
4. Algunos ARN participan en el procesamiento de otros ARN.
5. Participan en el proceso de secreción de proteínas.
6. Algunos ARN presentan cierta actividad catalítica por sí y otros contribuyen a la
actividad catalítica de las proteínas.
7. Actúan como "chaperonas" moleculares en el procesamiento de algunos ARN
transcritos primarios.
8. En algunos organismos (virus) son los portadores de la información genética.
ADN Y ARN
2.- ADN:
El ácido desoxirribonucleico (ADN) es la molécula que transporta información genética para
el desarrollo y el funcionamiento de un organismo. El ADN está compuesto por dos cadenas
complementarias que se enrollan entre sí y parecen una escalera de caracol; esa forma se
conoce como doble hélice. Cada hebra tiene una estructura principal compuesta por
grupos alternados de azúcar (desoxirribosa) y fosfato.
Unida a cada azúcar hay una de cuatro bases:
Adenina (A),
Citosina (C),
Guanina (G)
Timina (T).
Las dos hebras se conectan por enlaces químicos entre las bases: enlaces de adenina con
timina y enlaces de citosina con guanina. La secuencia de las bases a lo largo de la
estructura principal del ADN codifica información biológica, por ejemplo, las instrucciones
para producir una proteína o molécula de ARN.
El ADN, o ácido desoxirribonucleico, es la molécula que contiene la información genética de
todos los seres vivos, incluso algunos virus. El nombre viene de su estructura. El ADN tiene
una parte central con un azúcar y un fosfato, a la que se enlazan unas moléculas llamadas
bases. La desoxirribosa se refiere al azúcar, y el nucleico es el ácido formado por el fosfato
y la base nitrogenada. Estas bases pueden ser de 4 tipos: Adenina, citosina, timina y
guanina, nombradas normalmente como A, C, T, G. Y el orden en que se combinen una
después de la otra, es lo que codifica la información genética.
El ADN se organiza estructuralmente en cromosomas. A nivel funcional se organiza en
genes, que son piezas de ADN que generan características físicas específicas. Estas
características no vienen directamente del propio ADN, sino de una molécula llamada ARN,
formada a partir del ADN, y codifica una proteína. Esto es lo que se llama el dogma central
de la biología molecular: en el ADN hay genes que generan ARNs mensajeros, y estos
generan proteínas. Y esto es lo que da las diferentes características físicas que observamos
en individuos, como el color de ojos, o la altura. También se ha visto que algunas veces
estas instrucciones estan almacenadas directamente en el ARN, sin necesidad de pasar a
proteínas, como en el caso de los micro ARNs. Pero estos suelen ser una excepción.
Funciones del ADN:
Las funciones biológicas del ADN incluyen:
Almacenamiento: El almacenamiento de información (genes y genoma)
Replicación ó Autoduplicación: La capacidad de hacer copias de sí mismo permite
que la información genética se transfiera de una célula a las células hijas y de
generación en generación durante la división celular.
Codificación: La codificación de las proteínas adecuadas para cada célula se realiza
gracias a la información que provee el ADN.
Metabolismo celular: Intervienen en el control del metabolismo celular mediante la
ayuda del ARN y mediante la síntesis de proteínas y hormonas.
Mutación: Nuestra evolución como especie está determinada por la función de
mutación del ADN. También la diversidad biológica responde a esta capacidad.
Estructura primaria y secundaria del ADN:
La estructura molecular del ADN (o simplemente la estructura del ADN) es el modo en que
está compuesto bioquímicamente, o sea, es la forma de organización específica de
las proteínas y biomoléculas que constituyen la molécula de ADN.
Para empezar, recordemos que ADN son las siglas del Ácido DesoxirriboNucleico. El ADN
es un biopolímero de nucleótidos, o sea, una larga estructura molecular compuesta por
segmentos (nucleótidos) compuestos a su vez por un azúcar (ribosa) y una base
nitrogenada.
Las bases nitrogenadas del ADN pueden ser de cuatro tipos: adenina (A), citosina (C), timina
(T) o guanina (G), junto a un grupo fosfato. En la secuencia de este compuesto se almacena
toda la información genética de un ser vivo, indispensable para la síntesis de proteínas y
para la herencia reproductiva, es decir, que sin ADN no habría transmisión de
caracteres genéticos.
En los seres vivos procariotas, el ADN suele ser lineal y circular. Pero en los eucariotas, la
estructura del ADN tiene forma de doble hélice. En ambos casos, es una biomolécula
bicatenaria, o sea, compuesta por dos largas cadenas dispuestas de forma antiparalela
(apuntando en direcciones opuestas): sus bases nitrogenadas quedan enfrentadas unas a
otras.
Entre estas dos cadenas hay puentes de hidrógeno que las mantienen juntas y en forma de
doble hélice. Tradicionalmente se distinguen tres niveles de esta estructura:
Estructura primaria. Se compone de la secuencia de nucleótidos encadenados,
cuya secuencia específica y puntual codifica la información genética de cada
individuo que existe.
Estructura secundaria. La mencionada doble hélice de cadenas
complementarias, en las que se unen las bases nitrogenadas siguiendo un orden
estricto: adenina con timina, y citosina con guanina. Esta estructura varía
dependiendo del tipo de ADN.
Estructura terciaria. Se refiere a la manera de almacenar el ADN dentro de
estructuras llamadas cromosomas, en el interior de la célula. Estas moléculas
deben plegarse y ordenarse en un espacio finito, por lo que en el caso de los
organismos procariotas suelen hacerlo en forma de superhélice, mientras que
en el caso de los eucariotas se lleva a cabo un compactamiento más complejo,
dado el mayor tamaño del ADN, lo cual requiere de la intervención de otras
proteínas.
Estructura cuaternaria. Hace alusión a la cromatina presente en el núcleo de
las células eucariotas, de donde se forman los cromosomas durante la división
celular.
Estructura Primaria:
En el estudio de las macromoléculas el concepto de estructura primaria se refiere al orden
o sucesión de los precursores en la cadena polimérica. Estos precursores se unen por
medio de enlaces covalentes que suelen ser los más fuertes entre todas las interacciones
que contribuyen a mantener la estructura tridimensional de las macromoléculas. La
estructura primaria de los ADN se define como el orden o sucesión de los
desoxinucleótidos a lo largo de la cadena polinucleotídica. Ahora bien, como quiera que de
los 3 componentes del desoxinucleótido solo existe variación en la base nitrogenada, se
acostumbra hablar de la sucesión de las bases y no de los desoxinucleotidos. Los
desoxinucleótidos se unen por los hidroxilos de C3' y C5' mediante un grupo fosfato; este
grupo se esterifica hacia ambas posiciones, por lo que el enlace recibe el nombre de 3, 5-
fosfodiéster, con lo cual se origina una cadena lineal, osea, carente de ramificaciones, una
característica que es común a casi todas las macromoléculas.
Estructura Secundaria:
Cuando en 1953 Watson y Crick dieron a conocer el modelo molecular del ADN, resumieron
en apenas una página de Nature, más de una década de trabajos de varios laboratorios, y
dieron explicación a numerosos resultados obtenidos previamente por otros grupos.
Basado fundamentalmente en el método de difracción de rayos X el modelo consta de las
características siguientes:
1. La molécula está formada por 2 cadenas poliméricas de desoxinucleótidos,
enrolladas alrededor de un eje común con un giro hacia la derecha que adopta la forma de
una doble hélice. Las cadenas enfrentadas son antiparalelas y se envuelven la una a la otra
de manera que para separarlas hay que desenrollar la hélice
2. Las bases nitrogenadas están orientadas hacia el interior de la hélice, en tanto el
eje pentosa-fosfato está hacia el exterior. Cada base de una cadena se parea con una de la
cadena opuesta, formando pares que se disponen casi perpendicularmente al eje de la
hélice.
3. El modelo ideal tiene 2 nm de diámetro con 10 pares de bases (pb) por cada
vuelta de la hélice (n), lo que representa un ángulo de rotación de 36" entre pares de bases
vecinos. Como las bases nitrogenadas presentan un espesor de Van der Waals de 0,34 nm
(d), la hélice tiene un avance (p) de 3,40 nm por cada vuelta.
El hecho más sobresaliente de la estructura de Watson y Crick es que acomoda sólo 2 tipos
de pares de bases, los formados por A y T y los de C y G, son los llamados apareamientos
de Watson y Crick.
Modelo de Watson y Crick
La forma molecular específica del ADN fue descubierta en 1950, a pesar de que la
existencia de este tipo de compuestos biológicos ya se conocía desde 1869.
En 1953, su descubrimiento se le atribuye principalmente a los científicos James Watson,
estadounidense, y Francis Crick, de Gran Bretaña, quienes propusieron el modelo de doble
hélice de la estructura del ADN. Estos publicaron la famosa estructura de la doble hélice del
ADN, en un artículo de apenas una página, en la revista Nature.
“De ahí salió la explicación para entender la reproducción de los seres vivos, la información
hereditaria de padres a hijos, de qué manera puede cambiar esa información por
mutaciones y dar origen a enfermedades hereditarias, cómo participa en la evolución
biológica y por qué todos los seres vivos evolucionamos a partir de un ancestro común”,
resumió Velázquez Arellano, médico y doctor en genética humana.
En 1962, Watson y Crick recibieron el Premio Nobel de Medicina y Fisiología. Lo
compartieron con Maurice Wilkins, científico de Nueva Zelanda, quien con su discípula
Rosalind Franklin (que falleció cuatro años antes de la entrega del máximo galardón),
experta en la cristalografía de rayos x, aportó muchas de las imágenes sobre las que se
basaron para desarrollar la estructura. Gracias a una imagen particularmente nítida
Franklin obtuvo mediante esta técnica (la célebre “Fotografía 51”), Watson y Crick pudieron
deducir y formular un modelo tridimensional para el ADN.
“Rosalind Franklin, alumna de Wilkins, fue quien tomó las mejores fotos, las que
permitieron armar el modelo que Watson y Crick construyeron de una forma original, como
un lego o un rompecabezas. En ciencia, a diferencia del arte, el trabajo siempre es colectivo,
aunque no lo parezca”.
Como escalera de caracol
Se sabía ya que el ADN tiene tres tipos de componentes: fosfatos, azúcares (desoxirribosa)
y cuatro bases nitrogenadas (adenina, timina, citosina y guanina, abreviadas como A, T, C y
G), y su hallazgo consistió en encontrarles un acomodo específico, que resultó en lo que
postularon.
Descubrieron que tiene una estructura semejante a una doble escalera de caracol, o doble
helicoidal, donde a ambos lados están los fosfatos y los azúcares, mientras que cada
“peldaño de la escalera metafórica” está compuesto de dos de las cuatro bases
nitrogenadas, según las reglas de su apareamiento: la A con la T y la G con la C.
La magia del apareamiento de las “letras”
Desde su publicación, Watson y Crick estaban conscientes del impacto que tendría su
hallazgo. “Con claridad postularon no sólo que la estructura del ADN era la base física de la
información para la existencia y el funcionamiento de los seres vivos sino que, debido a las
reglas de apareamiento de las bases nitrogenadas que ellos descubrieron (la A – adenina,
sólo se aparea con la T – timina, y la G – guanina, sólo se aparea con la C – citosina), era
posible la reproducción genética de padres a hijos, de una generación a la siguiente”.
La última frase del artículo dice “no ha pasado desapercibido para nosotros que el
apareamiento específico que hemos postulado sugiere inmediatamente un posible
mecanismo de copiado para el material genético”, y este proceso era el resultado del
modelo de la doble hélice. “Era evidente que su hallazgo representaba una revolución, un
hito histórico”.
Tipos de ADN:
Al estudiar su estructura, o sea, su conformación específica tridimensional, es posible
identificar tres tipos de ADN observados en seres vivientes, que son:
ADN-B. Este es el tipo de ADN más abundante en los seres vivos y el único que
sigue el modelo de doble hélice propuesto por Watson y Crick. Su estructura es
regular, dado que cada par de bases tiene el mismo tamaño, aunque dejando
surcos (mayores y menores sucesivamente) con variación de 35° respecto al
anterior, para permitir el acceso a las bases nitrogenadas desde el exterior.
ADN-A. Este tipo de ADN aparece en condiciones de escasa humedad y
menor temperatura, como las que hay en muchos laboratorios. Presenta, al igual
que la B, surcos recurrentes aunque de proporciones distintas (más amplias y
menos profundas para el surco menor), además de una estructura más abierta,
con las bases nitrogenadas más lejanas al eje de la doble hélice, más inclinadas
respecto a la horizontal y más simétricamente en el centro.
ADN-Z. Se distingue de las anteriores en que se trata de una doble hélice con
giro a la izquierda (levógira) en un esqueleto en zigzag, y es común en secuencias
de ADN que alternan purinas y pirimidinas (GCGCGC), por lo que requiere de una
concentración de cationes mayor a la del ADN-B. Es una doble hélice más
estrecha y alargada que las anteriores.
Categorías del ADN:
El ADN se puede dividir en dos grandes categorías: ADN no codificante y ADN codificante:
1. El ADN codificante:
No podemos hablar de ADN codificante sin hablar de genes. Un gen es una sección de ADN
que influye en un rasgo o característica de un organismo, como el color de los ojos o el
grupo sanguíneo. Los genes tienen regiones de codificación llamadas marcos de lectura
abiertos, así como secciones de control llamadas potenciadores y promotores que influyen
en la región de codificación que se va a transcribir. La cantidad total de información
contenida en el genoma de un organismo se denomina genotipo.
El ADN tiene la información para la fabricación de proteínas, que son denominadas las
obreras del organismo, y que cumplen con multitud de funciones; algunas proteínas son
estructurales, como las proteínas del cabello o del cartílago, mientras que otras son
funcionales, como las enzimas.
El cuerpo utiliza 20 aminoácidos distintos para producir aproximadamente 30.000
proteínas diferentes. La molécula de ADN tiene que decirle a la célula el orden en que
deben unirse los aminoácidos.
La herencia determina qué proteínas se producirán, utilizando el ADN como modelo para
construirlas. Algunas veces, los cambios en el código del ADN (mutaciones) harán que las
proteínas no funcionen correctamente, causando enfermedades. Sin embargo, en otras
ocasiones los cambios de código provocarán alteraciones beneficiosas en los individuos,
quienes entonces podrán adaptarse mejor a su entorno.
Un gen tiene ADN que se lee y se convierte en una sustancia mensajera de ARN. Este ARN
transmite la información entre el ADN del gen y la maquinaria responsable de
fabricar las proteínas. El ARN actúa como modelo para la maquinaria de producción, de
modo que los aminoácidos se colocan y conectan en el orden correcto para producir una
proteína.
Aunque la transcripción a proteínas es el papel básico del ADN. Se ha demostrado que el
dogma central de la biología ADN → ARN → proteína es erróneo y, de hecho, existen
múltiples procesos que influyen y transfieren información. Algunos virus utilizan el ARN
como material original (virus de ARN), y el proceso de información que fluye del ARN al
ADN se conoce como transcripción inversa o ADN de transcripción inversa. También
hay secuencias de ARN no codificantes que se crean transfiriendo secuencias de ADN a
ARN, y estas pueden tener una función sin convertirse en proteínas.
2. ADN no codificante
Aproximadamente el 90% del genoma de una persona no codifica proteínas. Esta parte
del ADN se llama ADN no codificante. El ADN se puede dividir conceptualmente en dos
categorías, los genes que codifican proteínas y los no genes. En muchas especies, solo una
pequeña porción del ADN codifica proteínas -los exones- y solo constituyen
aproximadamente un 1,5% del genoma humano.
El ADN no codificante, también conocido como ADN junk o basura, es ADN que no codifica
una proteína: secuencias como intrones, recombinaciones de virus, etc. Hasta hace poco se
pensaba que este ADN era inútil hasta que estudios recientes demostraron que no es así.
Estas secuencias pueden regular la expresión de genes, ya que tienen afinidad por
proteínas que pueden unirse al ADN y se denominan secuencias reguladoras.
Los científicos solo han identificado un pequeño porcentaje del total de secuencias
reguladoras existentes. El por qué de la presencia de grandes cantidades de ADN no
codificante en los genomas eucariotas y las diferencias en el tamaño del genoma entre
diferentes especies sigue siendo un enigma en la actualidad. Aunque cada vez se conocen
más funciones de ADN no codificante, como:
2.1. Los elementos repetitivos
Los elementos repetitivos en un genoma también son partes funcionales de un
genoma, forman más de la mitad del total de nucleótidos. Un grupo de científicos de la
Universidad de Yale encontró recientemente una secuencia de ADN no codificante que
supuestamente tiene un papel en permitir que los humanos desarrollen la capacidad de
utilizar herramientas.
2.2. Telómeros y Centrómeros
Además, algunas secuencias de ADN son responsables de la estructura de los cromosomas.
Los telómeros y centrómeros contienen pocos genes codificantes o ninguno, pero son
cruciales para mantener unida la estructura cromosómica.
2.3. ADN a ARN
Algunos genes no codifican proteínas, sino que se transcriben en moléculas de ARN: ARN
ribosómico, ARN de transferencia y ARN de interferencia (ARNi).
2.4. Empalme alternativo
La disposición de los intrones y los exones en algunas secuencias de genes es importante
porque permite el empalme alternativo del ARN pre-mensajero, creando diferentes
proteínas a partir del mismo gen. Sin esta capacidad, el sistema inmunológico no existiría.
2.5. Pseudogenes
Algunas secuencias de ADN no codificantes provienen de genes que se han perdido en el
curso de la evolución. Estos pseudogenes pueden ser útiles porque pueden dar lugar a
nuevos genes con nuevas funciones.
2.6. Pequeñas secciones de ADN
Otras secuencias de ADN no codificantes provienen de la replicación de pequeñas
secciones de ADN, lo que también es útil porque el seguimiento de estas secciones
repetitivas de ADN puede ayudar con los estudios de filogenia.
El ARN o ácido ribonucleico es una molécula que, al igual que el ADN, se compone de
sucesiones de nucleótidos unidos por enlaces fosfodiéster. Los nucleótidos están
formados por una base nitrogenada y un azúcar.
En el ARN el azúcar es una ribosa y las bases nitrogenadas son:
Adenina (A),
Citosina (C),
Guanina (G)
Uracilo (U). Este último sustituye a la timina (T) del ADN.
El ARN se produce en el núcleo, donde comparte habitación con el ADN. De hecho, es el
ADN el que, durante la transcripción, sirve como molde para sintetizar nuevas cadenas de
ARN. Una vez sintetizado, las nuevas cadenas salen del núcleo y hacen vida (y cumplen
muchas de sus funciones) en el citoplasma con sus otros compañeros de piso.
Dentro de la familia del ácido ribonucleico, que es inmensamente numerosa, cada
miembro tiene una personalidad única y ha optado por una profesión diferente.
Tipos:
Como en todas las familias, algunos de ellos son los favoritos por excelencia: el ARNm, el
ARNt y el ARNr.
El ARNm o ARN mensajero es una molécula de cadena simple que se sintetiza
usando como molde una de las hebras del ADN de un gen. Su función es transmitir
la información contenida en ese gen al citoplasma, donde será traducida a proteínas
en los ribosomas.
o Se encarga de transcribir una cadena de ARN mensajero, saca el mensaje del
núcleo y lo lleva al citoplasma de la celula,allí el ARN Ribosómico traducirá
este mensaje y lo transformara en Aminoácido para posteriormente formar
proteínas.
o El ARN mensajero se puede unir al ARN Ribosómico gracias al ARNt(ARN de
transferencia)
Aquí es donde entra el ARNt o ARN de transferencia, una pequeña molécula de ARN
que contiene una región de trinucleótidos denominada “anticodón”, que es
complementaria a un triplete del ARNm y una región donde se une un aminoácido.
Cada codón del ARNm, formado por tres nucleótidos, es reconocido por un ARNt
concreto que va acompañado de un aminoácido.
o Tiene la función de reconocer cada triplete o grupo de 3 nucleótidos del ARN
mensajero de manera complementaria, en grupos de ARNt por cada triplete
de ARNm que le enlaza un Aminoácido. De esta manera, como el ARNm,
gracias al ARNt y dentro del Ribosoma, consigue transformar una cadena
entera de nucleótidos en una cadena de Aminoácidos.
El tercer tipo de ARN, el ARNr (ARN ribosomal), es el más abundante de toda la
célula. Es el componente estructural más importante de los ribosomas, los
orgánulos encargados de leer la secuencia del ARNm para llevar a cabo el proceso
de traducción y la síntesis proteica.
o Se encuentran en los Ribosomas, tanto en células eucariotas y Procariotas
que poseen ribosomas.
El ARNn(ARN nucleolar): Viene del nucléolo. Es un corpúsculo que hay dentro del
núcleo de la celula del ARN nucleolar voy a obtener el ARN ribosómico.
ARN dirige la síntesis de aminoácido a diferencia del ADN no almacena la información sino
que la pasa para formar de una cadena de ácidos nucleicos a una cadena de aminoácidos.
Los ácidos nucleicos en el ARN se enlazan con Enlaces Fosfodiester. Esto tiene como
resultado que 3 ácidos nucleicos de ADN forman 3 ácidos nucleicos de ARN y estos se
transforman en un aminoácido.
Características estructurales y funcionales de cada tipo
El ADN por sí solo no puede dar cuenta de la expresión de los genes. Se necesita
ARN para ayudar a realizar las instrucciones en el ADN.
Igual que el ADN, el ARN está formado de nucleótidos que constan de una ribosa de
5 carbonos, un grupo fosfato y una base nitrogenada. Sin embargo, hay tres
diferencias principales entre el ADN y el ARN:
El ARN usa el azúcar ribosa en lugar de la desoxirribosa.
El ARN generalmente es monocatenario en lugar de bicatenario.
El ARN contiene uracilo en lugar de timina.
Estas diferencias ayudan a las enzimas en la célula a distinguir el ADN del ARN.
1.- ARN de transferencia : Los ARNt constituyen una familia de especies moleculares cuya
función es la de transportar los aminoácidos hacia los ribosomas durante la síntesis de
proteínas, por lo que deben existir tantos ARNt como aminoácidos diferentes contengan las
proteínas; todos ellos presentan regularidades estructurales que permiten generalizar una
estructura relacionada con su función.
Estructura Primaria: Los ARNt son polinucleótidos pequeños que contienen de 60 a
95 nucleótidos, aunque la mayoría tiene 76. Lo más sobresaliente en su composición de
bases es la presenciade numerosas bases modificadas que llegan a constituir hasta el 20 %
de la molécula. La razón de esta elevada proporción se desconoce, pero pudiera de alguna
manera contribuir a la formación de estructuras tridimensionales, unas veces en función
favorable y otras impidiendo la formación de interacciones entre las bases.
El estudio de la secuencia de bases de ARNt fue realizado por primera vez en 1965 por
Robert Holley, en el ARNt de la alanina procedente de levaduras. Para este trabajo Holley
tuvo que vencer numerosas dificultades técnicas, pero a partir de él se ha desarrollado una
tecnología que permite realizar ese trabajo en pocos días, lo cual ha hecho que ya se
conozca la secuencia de bases de más de 300 ARNt de diferentes especies.
El estudio comparativo de estas secuencias ha permitido llegar a conclusiones importantes.
En todos ellos existen 13 bases invariantes, es decir, todos tienen la misma base en
posiciones equivalentes y hay 8 bases semiinvariantes, es decir, en posiciones equivalentes
siempre hay una purina o una pirimidina. En el extremo 3' siempre aparece el trío CCA.
Estructura Secundaria: Holley estableció la estructura secundaria del ARNt de la
alanina y vio que el grado máximo de apareamiento se lograba cuando la cadena
polinucleotídica se representaba en forma de una hoja de trébol.
También supuso que si todos los ARNt cumplían la misma función debían poseer
estructuras muy similares, lo cual ha sido confirmado posteriormente con el estudio de
numerosos ARNt. Según el modelo la cadena se pliega formando 4 sectores de
apareamiento de bases llamados tallos, 3 de esos tallos terminan en zonas ensanchadas no
apareadas llamadas asas. Un tallo y su asa correspondiente forman un brazo: cada brazo
tiene una disposición y longitud características. Existe un quinto brazo que es variable en su
longitud y composición, éste hace que el número de nucleótidos en los distintos ARNt varíe
de 60 a 95 nucleótidos.
Estructura Terciaria: Después de numerosos esfuerzos infructuosos por
determinar la estructura tridimensional de los ARNt, en 1974 Alexander Ric11 y Sung Hou
Kin por una parte y Aaron Klug por otra, mediante estudios de difracción de rayos X,
lograron dilucidar la estructura del ARNt de fenilalanina de levadura, con una resolución de
025 nm.
Los resultados mostraron que la molécula adopta la forma de una letra L invertida
c); el lado vertical se forma por el brazo D y el anticodón, en tanto el lado horizontal lo
forman el brazo Q C y el tallo aceptor. En ambos lados la mol4cula forma una doble hélice
similar al ADN A, pero con apareamientos menos estrictos. Cada lado tiene una longitud de
6 nm y un ancho de 2 a 2,s nm. Los 2 extremos de la L formados por el anticodon y el CCA
del aceptor están separados unos 7,6 nm.
El hecho de que la estructura se establece principalmente por las bases invariantes y
semiinvariantes sugiere que todos los ARNt tienen la misma estructura tridimensional. Esta
forma tridimensional del ARN se adapta perfectamente a su función de transferir
aminoácidos a los ribosomas durante la síntesis de proteínas.
2.- ARN de transferencia : El ARN ribosomal (ARNr) se encuentra formando parte de los
ribosomas donde está muy relacionado con proteínas. Estas partículas citoplasmáticas
pueden disociarse en 2 subunidades desiguales, la mayor denominada L (large) y la menor
S (small). El ARNr representa del 50 al 60 % del peso de la partícula y cada subunidad
contiene moléculas de ARN que le son características. En los procariontes estas moléculas
se refieren de acuerdo con su coeficiente de sedimentación como ARNr de 5, 16 y 23 S, lo
cual significa que contienen alrededor de 120, 1540 y 2900 nucleótidos respectivamente. En
los eucariontes estas especies principales se refieren como de S, 18 y 28 S y existe una
adicional de 5,8 S que contiene unos 160 nucleótidos. Por lo general la subunidad menor
sólo contiene una especie molecular (16 ó 18 S), mientras las otras se encuentran en la
mayor. A continuación, se revisarán los aspectos más sobresalientes de sus estructuras.
Estructura Primaria: Al igual que los ARNt, los ARNr presentan bases modificadas,
pero en menor proporción, pues apenas da cuenta del 1 % del total de bases. La
modificación más frecuente es la metilación, aunque puede haber otras. Las bases
modificadas están por lo general agrupadas en pequeños sectores de la estructura
primaria. A diferenciade los ARNt, los ARNr presentan grupos metilos en el C2' -0Hdela
ribosa y estas modificaciones se encuentran muy distribuidas en la molécula. El análisis
comparativo de la secuencia de bases de los ARNr de diferentes especies ha mostrado un
elevado grado de conservación evolutiva. Existen secuencias de 10 a 20 nucleótidos que
son esencialmente invariantes en todas las especies estudiadas; esto sugiere que dichas
secuencias están involucradas en las funciones de los ARNr y no en la estructura. Se ha
comprobado que las secuencias conservadas se I localizan hacia la superficie del ribosoma,
lo cual apoya su carácter funcional.
Estructura Secundaria: Con el conocimiento de la estructura primaria, así como
diferentes aproximaciones experimentales y teóricas se han construido modelos de
estructuras secundarias de los tipos principales de ARNr. Estos modelos contemplan el
establecimiento del mayor número de bases apareadas y "empalizadas" con lo cual
disminuye considerablemente el contenido energético de la molécula. No obstante, se
debe tener presente que estas moléculas existen en asociación con proteínas, y es posible
que esas interacciones influyan en la estructura de los ARNr. Por otra parte, la estructura
terciaria que aún es desconocida puede implicar la existencia de otro tipo de interacciones
que podrían contribuir a la estabilidad de la molécula en mayor grado que las secundarias
3.- ARN mensajero: Poco se sabe de las estructuras de orden superior de los ARN
mensajeros (ARNm) de eucariontes; esto se debe en parte a que la cantidad de ARNm
específicos en la célula es muy baja, lo cual dificulta su purificación, y, por otra, al igual que
los ARNr, se encuentra en el citoplasma en compleja unión con proteínas. Los ARNm suelen
ser moléculas con metabolismo inestables, o sea, son degradados con rapidez y de ahí que
presenten un tiempo de vida media muy corto en comparación con los ARNr y los ARNt.
Algunos detalles estructurales son característicos de los ARNm de los eucariontes. Todos
presentan modificado el extremo 5' por la adición de un nucleótido de 7-inetil-guanina
mediante un enlace fosfoanhídrido; esta estructura recibe el nombre de casquete y suele
abreviarse por su equivalente en inglés, cap; en ocasiones la estructura se completa con la
metilación del C2 -0H del primer nucleótido (cap 1) y del (cap 2). Otra característica
importante se observa hacia el extremo 3' donde muchos ARNm presentan una larga cola
de poliadenina, poli(A), que puede tener más de 200 nucleótidos. La modificación en 5
parece estar relacionada con la unión del ARNm al ribosoma, en tanto la de 3 parece
incrementar la estabilidad metabólica.
En su proceso de síntesis el ARNm se forma de moléculas mucho mayores, que se
encuentran en el núcleo y han recibido el nombre de ARN heterogéneo nuclear (ARNhn). El
ARNhn ya presenta el cap y la cola de poli(A) y se va acortando por un p-0 de maduración.
4.- ARN pequeños: Son moléculas de ARN que contienen de 90 a 400 nucleótidos, de una
elevada estabilidad metabólica y que están presentes en las células por decenas de miles
de copias cada uno; pueden estar localizados en el núcleo y se les denomina ARN pequeños
nucleares (ARNsn del inglés small nuclear) o en el citoplasma como ARN pequeños
citoplasmáticns (ARNsc del inglés small cytoplasmic).
El subtipo más conocido está formado por 6 especies moleculares diferentes, pero todas
ellas con un elevado contenido en uridina, por lo que se les ha denominado como ARN-U y
se designan del U1 al U6. Todos los ARN-U presentan modificado el extremo 5' con una
estructura tipo cap, que del U1 al U5 es la trimetilguanina pero que en el U6 es diferente.
Los ARNsn se presentan asociados con más de 10 proteínas diferentes, formando
partículas de ribonucleoproteínas (RNPsn) que participan en el proceso de maduración de
los ARNhn para originar los ARNm y del pmARNr.
Los ARNscse presentan en 3 tipos denominados Y1, Y2 y Y3 y al contrario de los U se
encuentran en el citoplasma. Entre los ARNsc merece la pena destacar el ARN 7SL, que se
encuentra unido a 6 proteínas, formando las partículas de reconocimiento del péptido
señal (SRP) que participa en la translocación de las proteínas, las que deben ser procesadas
en el retículo endoplásmatico rugoso. Este ARN está formado por aproximadamente 300
nucleótidos y tiene tanto hacia el extremo $ como hacia el 3' una secuencia de tipo Alu,
llamada así por ser el sitio reconocido por la enzima de restricción Alu 1. La zona central
formada por 150 nucleótidos recibe el nombre de dominio S. Esta molécula se encuentra
plegada como lo demuestra el hecho de que el tratamiento con nucleasas da lugar a la
formación de 2 subpartículas, una que contiene el dominio S y la otra los 2 extremos.
4.- ESTUDIO COMPARATIVO DE MACROMOLÉCULAS:
Diferencias entre ADN y ARN
ADN: Está formando por una pentosa Desoxirribosa (hidrogeno)
ARN: Está formado por una pentosa Ribosa (grupo hidroxilo)
Se diferencian en el número de cadenas
ADN: Bicatenario (Doble cadena) Mas diversos y frecuentes.
ARN: Monocatenario (Significa que tiene cadena simple)
Procesos:
ADN: Replicación. Hacer más ADN
ARN: Transcripción: Pasa de ADN a ARN mensajero.
Traducción: Pasa de ARN mensajero a Aminoácido.
Replicación de ADN: Auto replicación de sí mismo.