Curso – Taller
INTRODUCCIÓN A LA SECUENCIACIÓN DE GENOMAS
BACTERIANOS:
ENSAMBLAJE, ANOTACIÓN Y FILOGENIA.
Expositor: PhD Blga.Sabela Balboa Méndez
Fecha: Del 16 al 20 de Setiembre 2019 Lugar: Auditorio principal de SANIPES
Hora: 08:30 a 17:00 hrs. Dirección: Av. Domingo Orué N°165 – Piso 6
Programa:
Lunes 16 de Setiembre 2019
8:30 – 9:00 hrs Registro y apertura del Curso Taller
SANIPES
9:00 – 10:30 hrs Introducción a la secuenciación
10:30-10:50 hrs Coffee break
10:50- 12:00 hrs Diferentes métodos de secuenciación: de Sanger a PacBio
Sequencing e Illumina. / Metagenómica / Next Generation
Sequencing.
14:00-15:00 hrs Enfoque shotgun y el enfoque jerárquico.
15:00-16:00 hrs Análisis del genoma: información útil contenida en un
genoma.
16:00-16:20 hrs Coffee break
16:20-17:00 hrs Diseño de primers y su aplicación
Práctica.
Curso – Taller
INTRODUCCIÓN A LA SECUENCIACIÓN DE GENOMAS
BACTERIANOS:
ENSAMBLAJE, ANOTACIÓN Y FILOGENIA.
Expositor: PhD Blga.Sabela Balboa Méndez
Fecha: Del 16 al 20 de Setiembre 2019 Lugar: Auditorio principal de SANIPES
Hora: 09:00 a 17:00 hrs. Dirección: Av. Domingo Orué N°165 – Piso 6
Programa:
Martes 17 de Setiembre 2019
9:00 – 10:00 hrs Introducción al trabajo vía línea de comandos.
10:00-10:20 hrs Coffee break
10:20-12:30 hrs Limpieza de las secuencias por Illumina.
Práctica
14:00-14:30 hrs Conceptos básicos de montaje de secuencia
14:30–15:30 hrs Mapeo, base calling, ensamblaje de genomas por
diferentes métodos y comparación de genomas
15:30-15:50 hrs Coffee break
15:50- 17:00 hrs Análisis de calidad de los montajes
Práctica
Curso – Taller
INTRODUCCIÓN A LA SECUENCIACIÓN DE GENOMAS
BACTERIANOS:
ENSAMBLAJE, ANOTACIÓN Y FILOGENIA.
PhD Blga.Sabela Balboa Méndez
Fecha: Del 16 al 20 de Setiembre 2019 Lugar: Auditorio principal de SANIPES
Hora: 09:00 a 17:00 hrs. Dirección: Av. Domingo Orué N°165 – Piso 6
Programa:
Miércoles 18 de Setiembre 2019
9:00 – 10:00 hrs Anotación de genomas ensamblados
10:00 -12:00 hrs Estudio filogenético (construcción de árboles filogenéticos:
Distancia, parsimonia, máxima verosimilitud y bayesianos),
pan-genoma y genoma central.
Práctica
14:00-16:00 hrs Análisis de secuencias multilocus (MLSA) para
identificación de bacterias del género Vibrio.
16:00-16:20 hrs Coffee break
16:20- 17:00 hrs. Práctica
Curso – Taller
INTRODUCCIÓN A LA SECUENCIACIÓN DE GENOMAS
BACTERIANOS:
ENSAMBLAJE, ANOTACIÓN Y FILOGENIA.
PhD Blga.Sabela Balboa Méndez
Fecha: Del 16 al 20 de Setiembre 2019 Lugar: Auditorio principal de SANIPES
Hora: 09:00 a 17:00 hrs. Dirección: Av. Domingo Orué N°165 – Piso 6
Programa:
Jueves 19 de Setiembre 2019
9:00 – 10: 40 hrs Búsqueda de genes de resistencia
Práctica
10:40-11:20 hrs Coffee break
11:20 – 12:00 hrs Búsqueda de islas de patogenicidad
Práctica
14:00-15:00 hrs Búsqueda otras secuencias de interés: profagos, CRISPR
15:00-15:20 hrs Coffee break
15:20- 17:00 hrs. Ensamblaje de genomas virales y fagos.
Práctica
Curso – Taller
INTRODUCCIÓN A LA SECUENCIACIÓN DE GENOMAS
BACTERIANOS:
ENSAMBLAJE, ANOTACIÓN Y FILOGENIA.
Fecha: Del 16 al 20 de Setiembre 2019 Lugar: Auditorio principal de SANIPES
Hora: 09:00 a 12:30 hrs. Dirección: Av. Domingo Orué N°165 – Piso 6
Programa:
Viernes 20 de Setiembre 2019
9:00 – 10:00 hrs Tema 1
IMARPE
10:00 - 10:30 hrs Tema 2
Gen Lab del Perú S.A.C.
10:30-12:00 hrs Búsqueda de mutaciones en el ADN y proteínas
(Deleciones y/o inserciones de genes Pir A Pir B
involucrados en AHPND)
Práctica
PhD Blga.Sabela Balboa Méndez
12:00- 12:30 hrs. Clausura y entrega de certificados
Muriel Gómez Sánchez Orezolli
Subdirectora SDSNA- SANIPES
