Estructuras Moleculares y Enlaces Químicos
Estructuras Moleculares y Enlaces Químicos
1. Describir la estructura atómica y determinar las estructuras electrónicas y de Lewis de los 20 elementos más ligeros.
2. Por qué la mayoría de los elementos químicos establecen enlaces con otros, cuáles no lo hacen y por qué, y cuántos enlaces
teóricamente es capaz de establecer cualquiera de los 20 elementos más ligeros.
3. Cómo, y en base a qué, se forma un enlace iónico en vez de uno covalente (o viceversa).
4. Enumerar y explicar razonadamente las propiedades de los compuestos iónicos y de los compuestos moleculares.
6. Determinar la geometría de moléculas sencillas utilizando la TRePEV y predecir el valor de los ángulos entre sus enlaces.
8. Determinar el acrónimo AXnEm TRePEV para el átomo central de una molécula sencilla, o para un átomo que elijas como central en una
molécula más compleja y determinar su nº estérico mediante la TRePEV.
9. Predecir el nº y tipo de ohs que generará un átomo central según sean sus necesidades para adoptar una determinada geometría de
enlace TRePEV.
10. (En los orbitales híbridos (ohs) de enlace)…la proporción (%) de sus características s ó p de los distintos tipos (sp3, sp2, sp)
11. Explicar razonadamente cómo se forman y qué diferencias presentan los enlaces sigma (σ) y Pi (Π) y ser capaz de identificarlos en
una molécula.
12. Explicar razonadamente cómo se forma un enlace covalente coordinado poniendo un ejemplo (a nivel de ohs).
13. Utilizar todas las herramientas anteriores para determinar cuantas características seas capaz de desvelar de una molécula orgánica,
que no conoces previamente, basándote únicamente en su estructura y composición.
-Hemos visto que los procesos químicos son aquellos en los que se produce un cambio en la
composición de la materia y que siempre se encuentran asociados a intercambios de energía.
-Durante los procesos metabólicos -llevados a cabo por los seres vivos- también se producen
cambios en la composición de la materia que están asociados a intercambios de energía.
-Los seres vivos necesitamos un flujo continuo de energía que obtenemos durante la
transformación química de los nutrientes. Sin ese flujo incesante de energía no podríamos realizar
trabajo, ni movimientos, ni crear o mantener gradientes...ni sintetizar componentes, tareas –todas
ellas- necesarias para mantenerse con vida.
-Una comprensión de la vida requiere una comprensión de las claves fisicoquímicas que determinan
la reactividad química y el comportamiento de las biomoléculas en entornos biológicos.
-Para ello precisamos comprender la estructura de las biomoléculas, de qué átomos están hechas y
qué propiedades fisicoquímicas les proporciona su composición y estructura.
C O
H
N C H
-La figura de la izquierda nos muestra que una célula puede ser deconstruida en H C H
varios subniveles, el último de los cuales está constituido por biomoléculas (se
utilizan como ejemplos los sillares estructurales –o monómeros- del DNA, las
proteínas y la celulosa –un polisacárido-) y que dichas moléculas se hallan
constituidas por átomos enlazados en un orden concreto. H
-La imagen de la derecha representa uno de los monómeros representados en la figura
anterior, en concreto el aminoácido que se utiliza a modo de ejemplo: la alanina.
-Esa imagen de la alanina contiene mucha información sobre sus propiedades fisicoquímicas, sólo hace falta saber
utilizar algunas herramientas -que muchos ya tenéis- para deducirlas.
-El objetivo general de los temas 2-7 es proporcionar, a quien no las tenga, dichas herramientas y a quien ya las
tenga animarle a utilizarlas para deducir la información implícita en esas imágenes.
Biomoléculas
-Son las moléculas presentes en los seres vivos
J. Dalton Por razones químicas Dalton también llegó a la conclusión de que la materia estaba compuesta por
(1805) unidades indivisibles “átomos”. Los átomos eran para él partículas sólidas. Pensaba que los átomos de un
mismo elemento tenían todos la misma masa y propiedades, mientras que los átomos de ese elemento se
distinguían de los de otros elementos por tener distinta masa y propiedades. Pensaba que los átomos de
diferentes elementos pueden reaccionar en proporciones definidas dando lugar a la aparición de
sustancias químicas y que 2 elementos puede reaccionar en diferentes reacciones en proporciones
diferentes dando lugar así a sustancias diferentes. Aportó el concepto de peso atómico relativo.
J.J. Thomson Descubrió el electrón y se imaginó los átomos tan sólidos como los de Dalton pero con carga
(1897; 1904) positiva y en el que se encontraban incrustados los electrones como las pasas en un pancake.
E. Rutherford Realizó un experimento crucial. Bombardeó una lámina de oro muy fina con “partículas α”
(1909; 1911) (núcleos de helio) y se sorprendió al observar que la mayoría de éstas atravesaban la lámina sin
rebotar ni desviarse (aunque unas pocas sí lo hacían). Concluyó que la lámina de oro estaba
constituida mayoritariamente por “vacío” y que la materia estaba concentrada en lugares
discretos y pequeños. El átomo que imaginó Rutherford estaba constituido por un núcleo
central que contenía su carga positiva y su masa (protones y neutrones) y una corteza,
esencialmente vacía ocupada por electrones con carga negativa girando alrededor del núcleo.
N. Böhr Böhr se percató de que los electrones no giraban en torno al núcleo a “cualquier distancia” sino
(1913) que debían hacerlo en órbitas o capas que se hallaban cuantizadas. Su modelo atómico
(también conocido como de Böhr-Rutherford) era similar a un sistema estelar en el que los
electrones (planetas) giran en torno al núcleo (estrella).
Átomo
El modelo de átomo más sofisticado que utilizaremos difiere del
de Böhr-Rutherford en que los electrones no se localizan en
órbitas sino en regiones definidas que se denominan orbitales y
que presentan formas diversas y complejas.
Los orbitales son regiones del espacio, alrededor del núcleo, donde
existe una mayor probabilidad (≥90%) de que se encuentre un
electrón.
-La identidad química de un átomo (su alma) está determinada por el nº de protones que
contiene su núcleo (el nº atómico “z”).
-Por ejemplo, todos los átomos de fósforo (P) poseen 15 protones. En la naturaleza distintos
átomos de P pueden diferir en nº de neutrones dando lugar a isótopos del P, pero si un átomo
de P pierde o gana un protón se convertirá en otro elemento (en silicio Si o en azufre S
respectivamente en nuestro ejemplo).
-Aunque un átomo no posee carga en su estado fundamental (nºp+ = nºe-), puede adquirirla
perdiendo electrones (adquiere carga +) o ganándolos (adquiere carga -). Este proceso se
denomina ionización.
Estructura del átomo z
La imagen de la derecha nos muestra la compleja organización
estructural de un átomo. Podemos observar su núcleo -esfera oscura central-
y los primeros orbitales en orden creciente energéticamente que constituyen y
su corteza (el 1s –de menor energía- es esférico, el siguiente 2s es también
esférico, los 3 orbitales bilobulados siguientes pertenecen al nivel 2p y están
dirigidos hacia las 3 direcciones del espacio -2px, 2py y 2pz- y, por último, el
orbital 3s esférico que es el de mayor energía representado en esta figura).
x
Cada uno de los orbitales representado (1s, 2s, 2px, 2py, 2pz y 3s) pueden
contener un máximo de 2 electrones, lo que quiere decir que utilizando ade-
cuadamente los orbitales que se precisen, de entre los 6 representados, po-
dríamos reconstruir la estructura atómica de los 12 elementos primeros de la tabla periódica (es decir, hasta el
magnesio Mg). Para representar elementos mayores necesitaremos más orbitales.
Clases, nº y geometrías de los orbitales
s(1) (sharp = nítido): Los orbitales s son esféricos y hay solamente 1 orbital en cada nivel (desde el 1s al 8s)
p(3) (principal): los 3 orbitales p (derecha), situados en los 3 ejes del espacio, son bilobulados y tienen un
nodo central, donde está el núcleo, que indica que un electrón situado en ese orbital tiene una nula
probabilidad de estar en esa región.
d(5) (difuse = difuso): los 5 orbitales d (izquierda), orientados en distintos planos, tienen geometrías aún
más complicadas.
f(7) (fundamental): por último tendríamos los orbitales f (no representados)
de los que hay 7 en los niveles que los tienen.
-Principio de Aufbau (o principio de construcción): los electrones ocupan siempre los orbitales de
menor energía disponibles. Ver orden de llenado de orbitales (Carta de Aufbau) en la figura siguiente.
-Regla de Hund (o de máxima multiplicidad): cuando existen orbitales del mismo nivel energético
disponibles los electrones los van ocupando individualmente, y sólo se ocupan completamente si existen
más electrones disponibles.
Instrucciones para determinar la configuración electrónica (CE) de un elemento
1º. En una tabla periódica se localiza el nº atómico del elemento (nº de protones) que se desea
construir. En el estado fundamental el nº de electrones del elemento será el mismo que de protones.
2º. Se van alojando los electrones en orbitales por parejas
desde los niveles de menor energía hacia los más altos, según
el orden indicado por las flechas en la carta de Aufbau (a la
Carta de Aufbau
derecha)
3º. Cuando sea necesario se utiliza la regla de Hund. Esta regla nos
dice que cuando se dispone de varios orbitales del mismo nivel 8s
energético para distribuir electrones (por ejemplo, cuando estamos
llenando los 3 orbitales p de un determinado nivel) los electrones se 7s 7p
distribuyen de uno en uno hasta que todos los orbitales equivalentes
disponen de 1 electrón y sólo a partir de entonces reciben su segundo 6s 6p 6d
electrón. Normalmente no haremos mucho uso de esta regla pues no
afecta en gran medida a nuestras necesidades. 5s 5p 5d 5f
A continuación, como ejemplo, determinamos la configuración 4s 4p 4d 4f
electrónica del C cuyo nº atómico es 6. En (a) sin tener en cuenta la 8º
regla de Hund y en (b) teniéndola en cuenta. Ambas notaciones son
correctas y nos dicen que el C dispone de 4 electrones en su capa más
3s 3p 3d
7º
externa.
6C a) 1s ; 2s 2p 2s 2p
2 2 2
6º
b) 1s2; 2s2 2px1 2py1 2pz0 5º
1s 4º
Los electrones situados en la capa más externa de un átomo (en este
3º
caso la 2) se denominan electrones de valencia y determinan la
capacidad del elemento para formar enlaces con otros elementos. 2º
1º
Estructuras electrónicas de puntos (EEP). Estructuras de Lewis
Las estructuras de Lewis (EEP: abajo columna del centro) se utilizan para representar la configuración
electrónica (CE) de un elemento –resaltando los electrones de su capa de valencia- y son útiles para
determinar los enlaces que normalmente establecerá el elemento con otros átomos.
En éste modelo el símbolo químico del elemento (en azul en la EEP) representa el núcleo y los orbitales
completos de niveles inferiores y alrededor de éste se disponen tantos puntos como electrones de valencia
tenga el elemento en su última capa (en color fucsia en las CEs). En las EEPs los 4 primeros e- de la capa de
valencia se van situando en solitario en los 4 vértices de un tetraedro imaginario (sólo representado en el C en
el ejemplo) y los demás (si los hay) se van utilizando para formar parejas con los anteriores hasta que nos
quedemos sin electrones. Para evitar problemas conviene seguir un orden al disponer los electrones en los
vértices del tetraedro (ej. agujas del reloj). Ambas representaciones de la EEP del oxígeno están bien, pero
la 2ª puede conducir a errores de interpretación sobre la polaridad molecular (ver más tarde)
Configuración electrónica CE Estructura electrónica de puntos (EEP) Enlaces
H 1
1H 1s1
7N N
1s2; 2s2 2p3 3
O O 2
8O 1s2; 2s2 2p4
15P P
1s2; 2s2 2p6; 3s2 3p3 3
Las EEPs nos informan del nº de enlaces que normalmente podrá establecer un elemento (tantos como
e- desapareados posee en su EEP)
Origen del enlace químico
Los únicos elementos que tienen la capa más externa completa son los gases nobles. En consecuencia no
establecen enlaces normalmente. Los gases nobles son los únicos elementos que son estables en estado
monoatómico (es decir en soledad).
Por el contrario la última capa de todos los demás elementos se encuentra incompleta, en mayor o
menor medida. Al parecer esta situación les crea una inestabilidad que tratan de remediar.
Para lograr estabilidad los elementos intentan alcanzar la configuración electrónica del gas noble más
cercano en la tabla periódica y lo hacen estableciendo enlaces químicos.
Puesto que los gases nobles tienen 8 e- en su última capa (excepto el helio que tiene 2) esta tendencia
a completar la última capa con 8e- se conoce como regla del octeto.
Los tipos de enlace químico de más interés en los seres vivos son:
1. Enlace iónico:
2. Enlace covalente:
…y, como veremos a continuación, estos 2 diferentes tipos de enlaces parecen tener su origen en las
diferencias de electronegatividad existentes entre los elementos que establezcan el enlace.
Tabla de electronegatividades de los elementos
La “electronegatividad” es una medida relativa de la fuerza con que un elemento atrae a los electrones de enlace en
una molécula (Es un concepto desarrollado por el químico L. Pauling).
La siguiente tabla periódica contiene los valores de electronegatividad de los elementos, excepto para los gases
nobles que, como sabemos, no forman moléculas y dicho termino no es de aplicabilidad. Si estudiamos los valores de
EN se observa una tendencia de esta magnitud a aumentar de abajo a arriba y de izquierda a derecha
EN EN
He
Ne
Ar
Kr
Xe
Rn
En la tabla de electronegatividades se han resaltado en rojo aquellos elementos que son “metales” y en azul los “no
metales”. Vemos que los “no metales” tienen valores de EN elevados mientras que los “metales” tienen valores de EN
bajos.
El tipo de enlace químico depende de las ΔEN entre los elementos enlazados
Los tipos de enlace químico de más interés en los seres vivos son:
1. El enlace iónico:
En su establecimiento se ceden y captan electrones entre los átomos enlazados.
Na+ Cl-
3. Un átomo cede y el otro capta electrones.
e-
4. No se forman verdaderas moléculas.
0.9 3.0
- + -
+ - + + - +
- + - - + -
+ - + + - +
- + - - + -
Enlace covalente: compuestos moleculares
1. Reacción entre dos no-metales.
2. Los dos átomos son electronegativos (ΔEN<1.8)
3. Se comparten electrones. O N C H
4. Se forman moléculas verdaderas.
3.5 3.0 2.5 2.1
Fórmula
H2 Hidrógeno molecular
H2O Agua
NH3 Amoniaco
CH4 Metano
En las moléculas representadas como estructuras de Lewis vemos que los distintos elementos –al establecer enlaces y
y compartir electrones- se estabilizan porque “creen parecerse al gas noble más cercano” (regla del octeto excepto
para el H). También os llamo la atención sobre el hecho de que a medida que simplificamos la representación de las
moléculas vamos olvidándonos de información que –a menudo- conocemos y que es de utilidad para poder apreciar sus
comportamientos fisicoquímicos.
Propiedades de los compuestos moleculares (sustancias moleculares)
-El enlace covalente origina moléculas verdaderas en las que átomos concretos se enlazan con
otros átomos individuales en un orden específico.
-En estado sólido o cristalino las S.M suelen ser blandas.
-Suelen tener puntos de fusión bajos
-En general las moléculas no suelen estar cargadas y por tanto no suelen conducir la
electricidad.
En los compuestos moleculares, las fuerzas de atracción entre distintas moléculas son
débiles y por ello, a temperatura ambiente, existen compuestos moleculares en los tres
estados de la materia:
-Sólido
-Líquido
-Gaseoso
Polaridad del enlace covalente
Cuando existen diferencias de EN entre los átomos enlazados dicha diferencia puede representarse
como un vector (proporcional a dicho valor) con su origen en el elemento de menor EN y final sobre el
que mayor EN posee.
Geometría de las moléculas
Teoría de la repulsión de pares de electrones de valencia (TRePEV) .
Esta teoría permite una buena aproximación para determinar la geometría molecular. Postula que
los electrones de la capa de valencia de un átomo adquieren una disposición en el espacio que
trata de minimizar las fuerzas de repulsión entre ellos (se disponen en el espacio lo más alejados
que pueden).
-Se consideran los efectos de todos los electrones de la capa de valencia tanto los pares de
e- de los enlaces covalentes como los de electrones no enlazantes (pares de electrones
solitarios E) que rodean al átomo central (A).
-Cuando existen pares de electrones solitarios (E) en el átomo central, estos repelen con
mayor fuerza (ocupan más espacio) a los pares de electrones que forman parte de los
enlaces, por lo que su presencia tiende a disminuir los ángulos entre los enlaces covalentes.
-A efectos de repulsión los enlaces múltiples (dobles y triples) son equivalentes a los enlaces
sencillos (es decir los 4 ó 6 electrones de un enlace múltiple repelen con la misma fuerza que
lo hacen los 2e- de un enlace sencillo).
-El nº estérico es la suma del nº de sustituyentes (Xn) del átomo central (A) (nº de átomos
enlazados a éste) más el nº de pares de electrones solitarios E (m) del átomo central. Para
definir la situación electrónica alrededor del átomo central se utiliza el acrónimo AXnEm; nº
estérico = n + m.
Geometría de las moléculas
Teoría de la repulsión de pares de electrones de valencia (TRePEV) .
CH4 NH3
H AX4E0 AX3E1
nº estérico 4 nº estérico 4
C
H H N H
H C H
N H
H
O
H O
C
H O R1 C R2 O C O
H H
polar apolar
apolar
H
H N H O C O
H C H polar
apolar H
H apolar
Polaridad de las moléculas
Un error que puede darse al determinar la polaridad de una molécula se produce como resultado de la
suma de vectores en 2 dimensiones si las EEP de los elementos no se han realizado siguiendo un orden
riguroso al disponer los electrones. Veamos como ejemplo la molécula de H2O. A continuación os
muestro 2EEP para el oxígeno –ambas correctas- la de la izquierda depositando los electrones
siguiendo el sentido de las agujas del reloj y la de la derecha depositando los electrones sin seguir
ningún orden especial. También muestro la del hidrógeno con su electrón.
H O O
Si utilizo las EEP de H y O para representar la estructura de la molécula de H2O obtendría:
H
H O H O H
Ambas estructuras son correctas, pero al determinar su polaridad sumando los vectores en 2D obtendré
lo siguiente:
en el caso de la izquierda la suma lleva a un punto distinto del que se ha partido: la molécula es polar.
en el caso de la derecha la suma de vectores nos devuelve al punto de partida: la molécula es apolar.
Por eso os aconsejo seguir un orden al distribuir los electrones en las EEP (agujas del reloj).
Otra manera de evitar la conclusión errónea es acordarse de que el acrónimo para la geometría de esa
molécula AX2E2 indica geometría angular (104,5º) : los vectores no se oponen a 180º y la resultante no es 0.
Hibridación de orbitales (Orbitales híbridos de enlace)
Requisito de partida: para poder establecer un enlace covalente un átomo debe compartir
con otro elemento un electrón solitario localizado en un orbital incompleto de su capa de
valencia.
¿Qué puede hacer un pobre átomo de C para satisfacer sus necesidades de enlace?
Hibridación de orbitales (Orbitales híbridos de enlace)
P: ¿Qué puede hacer un pobre átomo de C para satisfacer sus necesidades de enlace?
Configuración electrónica Estructura atómica
2 enlaces a 90º
1 2 3
3 oh sp2
1 4
+1 sp2
Para predecir la hibridación de los átomos externos se procede del mismo modo. El único elemento que
no utiliza ohs en sus enlaces es el H (sólo dispone de un orbital y no puede hibridarlo).
Enlaces Sigma (σ) y enlaces Pi (π)
Los enlaces covalentes se establecen cuando los orbitales incompletos de dos átomos se solapan.
Se pueden formar 2 tipos de enlaces según el solapamiento de orbitales se establezca en el espacio entre
los núcleos de los átomos implicados o fuera de dicho espacio:
Enlaces Sigma: Son los enlaces sencillos. El solapamiento de orbitales se establece en una región situada
entre los núcleos de los átomos implicados (ej. H-H, C-H, C-C). Permite libertad de giro:
H-H Solapamiento de 2 oas s
Enlaces Pi: Forman parte de los enlaces múltiples (dobles y triples). El solapamiento de orbitales (siempre
tipo P) se establece fuera de la región situada entre los núcleos de los átomos. Imposibilita la rotación.
π Enlace doble constituido por un enlace
sigma (solapamiento de 2 ohs; sp2 en este
σ caso) y un enlace Pi (por solapamiento de 2
C=C oas p). Obsérvese que el enlace Pi se halla
constituido por 2 solapamientos (en
azul/gris) entre orbitales p implicados (uno
por encima y otro por debajo del eje
π nuclear) que posibilitan compartir los 2 e-.
Enlace covalente coordinado
En un enlace covalente coordinado sólo uno de los átomos aporta los electrones del enlace,
mientras que el otro elemento no aporta ninguno.
Una vez formado, el enlace covalente coordinado es indistinguible de un enlace covalente
normal.
Un ejemplo de establecimiento de este tipo de enlace es la formación de ión amonio a partir
de amoniaco y un protón.
H H + H
.
H N + H+ H N H H N+ H
H H H
+
+
Aunque hemos utilizado la narrativa de que mediante el establecimiento de enlaces químicos los elementos
alcanzan la estabilidad (cuando se imaginan ser gases nobles), lo cierto es que en cada familia de átomos (lo
que viene a ser una molécula) no reina la armonía. Por el contrario, existen tensiones originadas por el
comportamiento de los elementos que la forman y son dichas tensiones las que propician las reacciones
químicas –o transformaciones de la materia- que hacen posible –con sus intercambios energéticos- la vida. En
particular, dichas reacciones entre moléculas suelen iniciarse mediante el establecimiento de un enlace
covalente coordinado entre dos elementos de moléculas distintas y a partir de ahí ambas moléculas deberán
reestructurar los enlaces que tenían previamente.
A la izquierda he vuelto a representar la alanina del inicio de este tema, pero
representando la distribución de los electrones de valencia de los elementos que la
componen y distribuidos de acuerdo a la influencia de la EN de los elementos
implicados. ¿Qué se puede apreciar?:
1
-Se ven átomos enriquecidos en electrones (los oxígenos y el nitrógeno)...
-…átomos empobrecidos en electrones (C1 y C2 por estar unidos a átomos
2 muy electronegativos y también los hidrógenos unidos a N y O).
-Se observan enlaces polares y apolares, σ y π…
-Los átomos empobrecidos en electrones presentarán densidades de carga
parcial positiva (δ+) y los enriquecidos en electrones la tendrán negativa
3
(δ-), por lo que dichas regiones serán polares (hidrofílicas).
-La ausencia de tensiones entre elementos ligados a C3 (enlaces apolares) y
diferencias de EN pequeñas entre elementos enlazados a C3 no generarán
cargas parciales y dicha región será apolar (hidrofóbica).
-Presencia de pares de electrones solitarios sobre algunos elementos
(Oxígenos y Nitrógeno) que les permiten utilizarlos para establecer enlaces
covalentes coordinados con otros elementos externos (ahí radica, por
ejemplo, el carácter básico del grupo amino y el potencial de iniciar una
reacción con otras moléculas).
-Los átomos empobrecidos en electrones (como C2, pero sobre todo C1)
estarán dispuestos a enlazarse con cualquier elemento que disponga de 2
electrones y les proponga “una aventura” (i.e. establecer un enlace
covalente coordinado…) y entonces se liará parda entre las familias
implicadas, que hasta entonces parecían bien avenidas…
En fin, se aprecian muchas más cosas interesantes sobre el potencial fisicoquímico,
biológico y hasta energético (nutricional) de los carbonos de la alanina...pero ya lo
veremos más adelante….