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Programa Bioquímica

El documento presenta el programa del curso de Bioquímica del Instituto Politécnico Nacional, que abarca desde la introducción a la bioquímica hasta el metabolismo de proteínas, incluyendo temas como la estructura y función de biomoléculas, bioenergética, y prácticas de laboratorio. Se detalla la evaluación del curso, que incluye exámenes teóricos y prácticas, así como requisitos de asistencia. Además, se proporciona una bibliografía relevante para el estudio del curso.
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El documento presenta el programa del curso de Bioquímica del Instituto Politécnico Nacional, que abarca desde la introducción a la bioquímica hasta el metabolismo de proteínas, incluyendo temas como la estructura y función de biomoléculas, bioenergética, y prácticas de laboratorio. Se detalla la evaluación del curso, que incluye exámenes teóricos y prácticas, así como requisitos de asistencia. Además, se proporciona una bibliografía relevante para el estudio del curso.
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INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONAL

ESCUELA NACIONAL DE CIENCIAS BIOLÓGICAS


DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA
PROGRAMA DEL CURSO TEÓRICO Y PRÁCTICO DE BIOQUÍMICA
(Agosto 2022 - febrero 2023)

1. Introducción. Concepto y antecedentes de la bioquímica. Objetivos y contenidos del


curso. Alcances y limitaciones. Lugar que ocupa dentro del plan de estudios.
Presentación del programa de estudios. Procedimientos de evaluación. Presentación y
discusión de la bibliografía pertinente.
2. Composición química de la materia viva. Bioelementos. Niveles de organización de
los bioelementos, hasta la formación celular. Estructura celular: Células procariontes y
eucariontes.
3. Agua. Importancia biológica. Propiedades generales. La molécula del agua y su
carácter dipolar. Importancia de los enlaces intermoleculares por puente de hidrógeno.
Estructura del hielo e hipótesis de la estructura del agua líquida. Importancia de las
interacciones del agua con las macromoléculas en relación con su estructura y función.
Disociación del agua. pH y su importancia biológica.
4. Aminoácidos y proteínas. Definición e importancia de las proteínas. Estructura dipolar
de los a-aminoácidos. Propiedades físicas de los aminoácidos. Curvas de titulación.
Punto isoeléctrico. Estructura de las proteínas. Estructuras de las proteínas (primaria,
secundaria, terciaria y cuaternaria). Clasificación de las proteínas por su composición,
por su conformación, por su solubilidad. Propiedades físicas y químicas de las
proteínas. Tamaño, pI, solubilidad, propiedades espectrofotométricas, propiedades
ácido-base. Reacciones químicas de las proteínas. Desnaturalización por metales
pesados, solventes orgánicos, detergentes, agentes caotrópicos, agentes físicos,
ácidos y bases, temperatura.
Práctica No. 1. Propiedades de aminoácidos y proteínas. (jueves 20 de oct)
1º Examen. (jueves 27 de oct)
5. Bioenergética. El cambio de energía libre como parámetro de espontaneidad. Cambio
de energía libre en condiciones estándar. Equilibrio químico y cambios de energía.
Compuestos ricos de energía.
6. Enzimas. Generalidades, definición e importancia. Naturaleza química, composición,
cofactores, coenzimas, grupos prostéticos, apoenzima, holoenzima, ribozimas.
Estructura de las enzimas: especificidad enzimática y sitio activo. Teorías de Fischer y
Koshland. Reglas de nomenclatura y clasificación. Regulación de la actividad
enzimática: Enzimas alostéricas, isoenzimas, zimógenos y reguladas covalentemente.
Cinética enzimática: efecto de la concentración de enzima, efecto del pH y la
temperatura, efecto de la concentración de sustrato e inhibidores reversibles,
(competitivo, no competitivo e in-competitivo). Inhibidores irreversibles.
Prácticas No. 2 y 3. Curva tipo y Efecto de pH. (jueves 3 de nov)
Práctica No. 4. Temperatura sobre la actividad enzimática. (jueves 10 de nov)
Prácticas No. 5 y 6. Efecto de concentración de sustratos e inhibidores sobre la
actividad enzimática. (jueves 17 de nov)
7. Carbohidratos. Introducción. Clasificación. Monosacáridos: estructura, fórmulas
cíclicas y conformación, esteroisomería series D y L, mutarrotación. Formas
anoméricas. Enlace glicosídico. Oligosacáridos: Clasificación propiedades y estructura
de los principales oligosacáridos. Polisacáridos: Clasificación, propiedades, estructura
de los principales polisacáridos.
Práctica No. 7. Reacciones de carbohidratos. (jueves 24 de nov)
2º Examen. (jueves 1 de dic)
8. Metabolismo anaeróbico de los carbohidratos. Glicólisis: aspectos importantes de
la glicólisis, secuencia de reacciones y enzimas. Fermentación ácido láctica y
alcohólica. Estequiometría y balance energético de la vía, regulación, utilización de
otros carbohidratos. Gluconeogénesis. Glucogenogénesis y glucogenolisis.
Importancia y características principales. Ruta de las pentosas fosfato: secuencia de
reacciones y enzimas que intervienen, significado energético.
9. Ciclo de Krebs. Formación de acetil coenzima A, a partir de piruvato. Aspectos
importantes del ciclo de Krebs. Secuencia de reacciones y enzimas del ciclo de Krebs.
Estequiometría, balance energético y su naturaleza anfibólica.
10. Cadena respiratoria y fosforilación oxidativa. Cadena respiratoria: Cambio de
energía libre en procesos de óxido–reducción. Componentes, esquema general,
inhibidores. Fosforilación oxidativa: Sitios de acoplamiento en la cadena de transporte
de electrones, hipótesis sobre la fosforilación oxidativa: química, quimiosmótica y
conformacional. Integración metabólica.
Prácticas No. 8, 9 y 10. Reacciones de óx-red LDH, SDH y citocromos. (jueves 15
de dic)
3º Examen. (jueves 22 de dic)
11. Lípidos. Definición. Clasificación de los ácidos grasos. Propiedades y estructura.
Clasificación general de los lípidos: Estructura e importancia biológica (derivados del
glicerol y fosfatidato). Catabolismo de los triacilglicéridos: Introducción reacciones y
esquemas de la b-oxidación de los ácidos grasos, papel de la carnitina, oxidación de
los ácidos grasos monoinsaturados, comparación desde el punto de vista energético
entre la b-oxidación y la glicólisis su convergencia hacia el ciclo de Krebs. Balance
energético. Biosíntesis de lípidos: reacciones, esquemas del mecanismo de síntesis de
ácidos grasos, biosíntesis de triglicéridos.
12. Ácidos nucleicos. Introducción. Bases, nucleósidos y nucleótidos. Nomenclatura,
estructura, propiedades ópticas. Ácidos nucleicos: estructura, composición, reglas de
Chargaff. Ácido desoxirribonucléico: modelo de Watson y Crick. Desnaturalización del
DNA, efecto de agentes físicos y químicos sobre el DNA. Ácido ribonucleico, estructura
del RNA, mRNA, tRNA y rRNA.
13. Metabolismo de ácidos nucleicos. Replicación de la información genética:
experimento de Messelson y Stahl, esquema de la biosíntesis del DNA. Transcripción
de la información genética. Estructura de la RNA polimerasa, esquema de la
transcripción, diferencias entre transcripción y replicación. Código genético.
14. Metabolismo de Proteínas. Biosíntesis de proteínas: introducción. Activación de los
aminoácidos, componentes de la síntesis de proteínas, ribosomas, iniciación,
alargamiento y terminación de la cadena polipeptídica. Mutaciones.
Práctica No. 11. Obtención de DNA. (jueves 12 de enero)
4º Examen. (jueves 19 de enero)

Inicio de Semestre: 15 de agosto del 2022. PROFESORES DEL GRUPO:


Entrega de calificaciones: 23 de enero del 2023. M. en C. Karina Martínez Guzmán
Examen extraordinario: 26 de enero del 2023. Dra. Doris Neri Cortés
ETS: 3 al 10 de febrero del 2023. Dra. Claudia Albany Reséndiz Mora
Dr. Carlos Wong Baeza

Join Zoom Meeting:


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Meeting ID: 892 3960 5089
Passcode: 956913
ASISTENCIA:
1- Se pasará lista de asistencia al inicio de la clase con una tolerancia de 10 minutos.
2- Se deberá tener un mínimo del 80% de asistencia para tener derecho a una
calificación aprobatoria, de lo contrario no se acreditará la materia.
3- Queda prohibido el uso de distractores durante las clases.

EVALUACIÓN:
Para tener derecho a una calificación final aprobatoria se debe tener aprobado el 50%
de las evaluaciones más una. En caso de reprobar el laboratorio se reprobará todo el
curso.
La evaluación del curso se realizará de la siguiente manera:
1.-Se realizarán 4 exámenes parciales de teoría y su promedio contará el 65% de la
calificación final del curso.
2.-En el laboratorio se evaluarán 11 prácticas, cuyo promedio cuenta el 35% de la
calificación final del curso. En cada práctica se evaluarán, con los siguientes porcentajes:

a) Protocolo de práctica (introducción y diagrama de flujo) 15%


b) Discusión de resultados 15%
c) Informe 30%
d) Examen 40%

Nota: Para tener derecho a exámenes extraordinarios o ETS del laboratorio se deberá
haber cumplido con el 80% de asistencia al mismo y haber presentado los informes.

BIBLIOGRAFÍA:

Alberts, B., Heald, R., Johnson, A., Morgan, D.O., Raff, M.C., Roberts, K., Walter, P.,
Wilson, J.H. & Hunt, T. (2022) Molecular biology of the cell. W.W. Norton and
Company, New York.

Krebs, J.E., Lewin, B., Goldstein, E.S. & Kilpatrick, S.T. (2018) Lewin's genes XII. Jones &
Bartlett Learning, Burlington, Massachusetts.

McKee, T. & McKee, J.R. (2021) Biochemistry : the molecular basis of life. Oxford
University Press, New York.

Moran, L.A., Horton, H.R., Scrimgeour, K.G. & Perry, M.D. (2014) Principles of
biochemistry. Pearson Education, Harlow.

Nelson, D.L., Lehninger, A.L., Cox, M.M. & Hoskins, A.A. (2021) Lehninger Principles of
biochemistry. Macmillan International Higher Education, New York.

Voet, D., Voet, J.G. & Pratt, C.W. (2016) Fundamentals of biochemistry : life at the
molecular level. Wiley, Hoboken, New Jersey.

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