Enzimas
Son moléculas proteicas que tienen la función de catalizadores biológicos.
Aspectos:
• Mantienen su estructura intacta al final de la reacción (se reutilizan).
• Sólo afecta a la velocidad de la reacción, no a la Kte de equilibrio.
Características: diferentes a los catalizadores químicos.
• Velocidades de reacción muy elevadas (106-1012 veces > químicos).
• Suaves condiciones de reacción (baja temperatura y pH neutros).
• Elevado grado de especificidad: sólo catalizan reacciones muy concretas.
• Capacidad de regulación: facilitan o impiden una reacción y regulan y controlan
el metabolismo.
Distribución: muy distribuidas, desde las bacterias hasta los organismos más
evolucionados. Suelen tener forma de proteína globular y son solubles.
• En un tipo de células (pepsina) o en múltiples células.
• Asociadas a orgánulos del interior o de la membrana (fosforilación oxidativa).
• Fracción soluble (glucolisis).
• Asociadas a estructuras (ATPasa).
Componentes físicos: centro activo (sitio de unión al sustrato y sitio catalítico,
donde se produce la reacción) y sitio alostérico (se unirán los efectores
modificando la actividad de la enzima: activadores e inhibidores).
Centro activo: es una hendidura tridimensional en forma de hueco (generalmente
hidrófoba), donde actúan las cadenas laterales de los amioácidos con poder catalítico;
es una zona pequeña de la enzima y tiene unas propiedades especiales para la unión y
para la catálisis del sustrato. Sustrato y centro activo tienen formas complementarias.
Componentes moleculares: una enzima puede ser pura (una o varias cadenas
polipeptídicas) o una holoenzima (parte proteica más parte no proteica o cofactor).
Enlace no covalente
Enlace covalente
P NP P
P NP NP
Cofactor metálico
Apoenzima
o molécula Grupo prostético Coenzima
orgánica compleja
El cofactor es el componente no protéico y puede ser un ion metálico positivo
divalente (normalmente), valencia de dos o una molécula orgánica, que se unirá con
mediante un enlace débil (coenzima) o un enlace covalente (grupo prostético).
Especificidad enzimática: capacidad de la enzima para reconocer un determinado
sustrato. Característica clave en el control metabólico. Hay dos tipos:
• De acción: cuando intervienen en una única reacción.
• Esteroespecificidad: capacidad de reconocer isómeros.
• Especificidad geométrica: reconoce grupos funcionales.
Grado de especificidad:
• Especificidad absoluta: reconoce una molécula (muy habitual).
• Especificidad de grupo: reconoce un determinado grupo de moléculas.
• Especificidad de clase: es la menos específica, dado que la actuación de la
enzima no depende del tipo de moléculas, sino del tipo de enlace.
Unión del sustrato al centro activo:
• Modelo llave-cerradura: la molécula encaja en el centro activo, siendo los dos
complementarios. Sólo para la especificidad absoluta.
• Ajuste inducido: el sustrato provoca un cambio en la conformación de la
enzima.
Al llegar al estado de transición, el complejo ES puede volver al inicio o formar
los productos.
E+S↔ES→E+P
reactante
Se necesitará una Eaa inferior en presencia de una enzima. Los catalizadores
bioquímicos (enzimas) son millones de veces más eficaces que los químicos.
Gracias a la enzima, la reacción pasa de ser no espontánea a ser espontánea.
El complejo ES está perfectamente orientado para que S pase a ser P.
La interacción ES destruye la solvatación (unión de moléculas de agua al S en
vez de a la E) de S.
Interacción débil ES compensa una redistribución electrónica desfavorable.
Nomenclatura de las enzimas
Antes se nombraban a gusto de sus descubridores, en ocasiones el nombre no daba
ninguna clave de la función desempeñada y se utilizaban diferentes nombres para la
misma enzima o el mismo para varias; posteriormente se añadía el sufijo “asa” a la
reacción que catalizaban y ahora se utiliza una nomenclatura sistemática.
• Nombre sistemático (transferasa) grupo transferido
donador ATP: hexosa fosfotranserasa
aceptor función de la enzima
• Número sistemático
subgrupo
enzima
Enzyme Commission number EC [Link]
sub-subgrupo
familia o grupo (sustrato que
utilizan)
• Nombre común: hexoquinasa (primera reacción de la glucólisis).
Grupo 1: oxidorreductasas
Catalizan reacciones de oxidorreacción. En reacciones redox siempre tienen que estar
presentes el aceptor y el dador electrónico.
Ared+Box→Aox+Bred
A: es el agente reductor o dador electrónico; en el
curso de la reacción se oxida (pierde electrones)
B: es el agente oxidante o aceptor electrónico; en el
curso de la reacción se reduce (gana electrones)
Oxidación: pérdida de electrones, adicción de
un oxígeno y pérdida de un hidrógeno
Reducción: ganancia de electrones, eliminación
de un oxígeno o adicción de un hidrógeno
Es muy común en los seres vivos y se dividen en seis tipos.
• Deshidrogenasas: capaces de catalizar la oxidación o reducción de un sustrato
por sustracción o adición de dos átomos de hidrógeno (deshidrogenación).
Emplean un par de coenzimas que actúan como aceptores o como donadores
de electrones y de protones. Los principales son NAD y NADH+. La lactato
deshidrogenasa está presente en la fermentación láctica.
• Oxidasas: cataliza una reacción de redox empleando oxígeno molecular (O2)
como aceptor de electrones. En estas reacciones el oxígeno se reduce a agua
(H2O) o a peróxido de hidrógeno (H2O2).
• Peroxidasas: catalizan reacciones bisustrato de carácter redox, utilizando un
peróxido como oxidante y un segundo sustrato de características reductoras
que es oxidado por el peróxido.
• Oxigenasas: oxida un sustrato mediante la transferencia de oxígeno presente
en el oxígeno molecular (O2). Existen dos tipos: las monooxigenasas
(transfieren un átomo de oxígeno al sustrato, y reducen el otro oxígeno a agua)
y las dioxigenasas u oxígeno transferasas (que transfieren al sustrato ambos
átomos de oxígeno de la molécula).
• Hidroxilasas: introducen un grupo hidroxilo (OH) en un compuesto
reemplazando un átomo de hidrógeno, oxidando al compuesto.
• Reductasas: reduce al sustrato.
Grupo 2: transferasas
Transfieren de un sustrato a otro radicales diferentes al oxígeno.
AX+B→A+BX
Grupos que transfieren: grupos de un átomo de C, grupos aldehídos o cetónicos,
grupos acilos, grupos glucosilos, grupos fosfato y grupos con azufre.
Grupo 3: hidrolasas
Catalizan reacciones de hidrólisis introduciendo grupos OH e hidrógenos. Las
hidroxilasas pueden ser hidrolasas.
AB+H2O→A-OH+H-B
No suelen llevar nombres sistemáticos, esto es, conservan el primitivo: tripsina,
pepsina, papaína, etc (enzimas peptídicos).
Los enlaces que rompen son: esteres, enlaces glucosídicos, enlaces peptídicos, otros enlaces
C–N y anhídridos de ácido.
Grupo 4: liasas
Catalizan reacciones de rotura o soldadura de sustratos en las que se eliminan grupos
H2O, CO2 y NH3. Actúan sobre enlaces -C=C-, -C=O y -C=N y -C=S.
A=B+X→A-X-B
Grupo 5: isomerasas
Catalizan reacciones de isomeración.
Algunas reacciones isomerásicas: racemasas (mezcla racémica: igualar cantidad de
estereoisómeros dextrógiros y levógiros), oxidorreductasas intramoleculares, mutasas
o transferasas intramoleculares y epimerasas.
Grupo 6: ligasas
Catalizan la unión de dos grupos químicos a expensas de la hidrólisis de un enlace de
alta energía (formación de enlaces entre C y O, C y S, C y N y C y C) mediante la
hidrólisis del ATP. Pi: fosfato inorgánico.
A+B+ATP→A-B+ADP+Pi
C+D+ATP→C-D+AMP+PPi
Algunas reacciones ligásicas: aminoacil-tRNA sintetasa, glutamina sintetasa y
carboxilasa (necesitan ATP para incorporar C a la molécula).
Unidades enzimáticas
La concentración de las enzimas se valora en función de la cantidad de producto que
genera.
Unidad enzimática: cantidad de enzima que produce la transformación de una
cantidad (mol) de sustrato en producto en la unidad de tiempo (minutos, segundos…)
en condiciones definidas.
Actividad específica: número de unidades por unidad de peso de proteína
(miligramos).
Actividad total: número total de unidades enzimáticas. Se calcula en función de la
cantidad de producto generado en un tiempo determinado.
Cinética enzimática
Estudia la velocidad a la que una molécula (S) se convierte en otra (P) y los factores
que la modifican.
Velocidad de reacción: cambio de concentración de sustrato y producto en la unidad
de tiempo (cantidad de producto generado en la unidad de tiempo).
El incremento de la
La velocidad máxima es
velocidad de
distinta dependiendo de la
reacción es distinto
concentración de sustrato.
Incremento de velocidad de reacción≠generación de producto
La velocidad enzimática también depende de otros factores: factores extrínsecos e
intrínsecos.
• Factores extrínsecos: como el pH, la temperatura, los catalizadores, los iones
metálicos…
➢ pH: el pH del medio es el responsable de que los grupos enzimáticos
puedan estar cargados o sean neutros. Una pequeña variación en el pH
puede ocasionar un cambio en la estructura tridimensional de la
enzima, lo que puede afectar a su actividad e incluso llegando a
desnaturalizarse. Las enzimas tienen dos valores límite en el pH entre
los cuales pueden actuar. Las variaciones en el pH también afectan al
grado de ionización de los radicales que forman el centro activo de la
enzima y en el de los radicales del sustrato. Existe un pH óptimo en el
que la actividad enzimática es máxima.
➢ Temperatura: al suministrar calor a las enzimas su actividad enzimática
aumenta, ya que es transformado en energía cinética. La Ley de Van´t
Hoff establece que cada 10⁰C de aumento de temperatura se produce
un aumento en la velocidad de 2 a 4 veces. A pesar de esto, si la
temperatura es excesiva, la enzima se desnaturaliza. Existe una
temperatura óptima en la que la actividad enzimática es máxima.
➢ Cofactores o activadores: iones que favorecen la unión ES potenciando
su actividad catalítica. Suelen ser cationes metálicos, coenzimas o
grupos prostéticos.
➢ Proenzimas o zimógenos: enzimas sintetizadas en forma inactiva para
transformarse posteriormente en activas por la acción de otros enzimas
o iones. Esto ocurre porque si s sintetizan de forma activa destruirían la
célula.
➢ Inhibidores: los inhibidores son sustancias que disminuyen la actividad y
la eficacia de la enzima o bien impiden su total actividad. Funcionan
como un mecanismo de control de las reacciones metabólicas. Existen
dos, la irreversible (la enzima se une covalentemente al inhibidor de
forma temporal o permanente) y la reversible (no se inutiliza el centro
activo, hay dos formas: competitivo, en el que es semejante al sustrato
y si se aumenta su concentración la velocidad de reacción aumenta; y
no competitivo, en el que el inhibidor se une a otra parte de la enzima,
el llamado sitio alostérico, provocando un descenso de la velocidad).
• Factores intrínsecos: concentración de enzima, concentración sustrato y
afinidad de la enzima por el sustrato (número de interacciones por unidad de
tiempo en que la enzima se une al sustrato).
Afinidad: número de interacciones por unidad de tiempo en que la enzima se une al
sustrato.
Especificidad: la enzima solo cataliza una de las posibles reacciones que puede seguir
un substrato.
A mayor afinidad al
Afinidad≠especifidad sustrato, mayor
velocidad de reacción
