Transcriptómica
Paola Alexandra Ramirez Quiroz
Transcriptómica
Estudio de las moléculas de ARN en una célula.
El transcriptoma es el conjunto de moléculas de ARN
mensajero (mARN) y de ARN nocodiicante presente en una
célula o tejido concreto.
¿Que es un
transcriptoma?
El genoma humano está compuesto de ADN,
una molécula larga y serpenteante que
contiene las instrucciones necesarias para
producir y mantener células.
Para que las instrucciones puedan llevarse a la
práctica, el ADN debe transcribirse, en otras
palabras, copiarse para crear ARN.
Un transcriptoma es una colección de todas
las lecturas de genes presentes en una célula.
Análisis de transcriptóma
•Inicialmente se usaban técnicas de bajo
rendimiento, como Southern, Northern y Dot blot,
que sólo permiten el análisis cualitativo o
semicuantitativo de un gen candidato por análisis.
•En estas técnicas se inmoviliza a los objetivos y se
marcaba a un gen.
•Mientras que en los microarrays se inmoviliza al
gen y se marcan los objetivos.
Northern Blot
1
•La transferencia Northern implica el uso de
electroforesis para separar muestras de ARN por
tamaño y la detección con una sonda de hibridación
complementaria a parte o la secuencia diana
completa. Estrictamente hablando, el término
"transferencia del norte" se refiere específicamente
a la transferencia capilar de ARN desde el gel de
electroforesis a la membrana de transferencia. Sin
embargo, todo el proceso se conoce comúnmente
como transferencia Northern. La técnica de
transferencia Northern fue desarrollada en 1977 por
James Alwine, David Kemp y George Stark en la
Universidad de Stanford.
Dot Blot
2
•Es una técnica de biología molecular utilizada
para detectar proteínas. Representa una
simplificación del método western blot, con la
excepción de que las proteínas a detectar no se
separan primero por electroforesis. En cambio, la
muestra se aplica directamente sobre una
membrana en un solo punto y se realiza el
procedimiento de transferencia.
La técnica ofrece importantes ahorros de tiempo,
ya que la cromatografía o la electroforesis en gel, y
no se requieren los complejos procedimientos de
transferencia del gel.
Microarrays
3
•Es un método de alto rendimiento para el
análisis de los perfiles de expresión génica
que permite la caracterización de miles de
transcritos simultáneamente. Consiste en
la hibridación del ARN, transformado a
cADN fluorescente, a un chip que contiene
múltiples sondas de cADN
correspondientes a los genes de interés; la
intensidad de la fluorescencia es
proporcional a los niveles de expresión del
correspondiente transcrito.
Secuenciación de nueva
4 generación (NGS)
•La cual puede detectar tanto genes conocidos
como desconocidos, además de cuantificar su
expresión directa y no indirectamente. La
secuenciación de ARN comienza con la conversión
de las moléculas de ARN a ADN complementario
(cDNA) mediante PCR reversa (RT-PCR). El ADN
complementario es entonces amplificado para
formar una biblioteca de ADN, la cual puede ser
secuenciada.El resultado final es una serie de
secuencias que pueden ser alineadas al genoma o
transcriptoma y después cuantificadas mediante
métodos computacionales.
microARN (miARN o miR)
•Son moléculas de ARN pequeñas no codificantes que
regulan la expresión de muchos genes, la cual se encuentra
alterada en multitud de patologías, siendo potenciales
biomarcadores.
•Son moléculas pequeñas de ARN no-codificante que se
unen por complementariedad al extremo 3’UTR de los
mARN, siendo capaces de regular su expresión a través de
la degradación o inhibición de la traducción.
•Los perfiles de expresión de miR pueden distinguir
entre diferentes tipos de tumores, entre tejido sano
y tejido enfermo, y entre diferentes estados de una
misma enfermedad.
•Los perfiles de expresión tanto de mARN como de
microARN ayudan a distinguir entre diferentes tipos
de tejido, diferentes estados patológicos, y a
predecir el pronóstico y la respuesta al tratamiento.
En el area de farmacia
Identificacion y desarrollo de
farmacos
Aplicaciones
En el area de la salud
Para Diagnostico y prevencion
de enfermedades
Referencias bibliograficas
Applications of New Sequencing Technologies for Transcriptome Analysis Olena Morozova,
Martin Hirst, Marco A. MarraAnnual Review of Genomics and Human Genetics 2009 10:1, 135-
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