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7 Seminario - Biodiversidad

Este documento presenta un seminario sobre la medición de la diversidad alfa a nivel estructural. Explica cuatro modelos paramétricos (serie geométrica, serie logarítmica, distribución log-normal y modelo de vara quebrada) y dos modelos no paramétricos (Chao 1 y estadístico Q) para estimar la riqueza de especies en una comunidad. El seminario fue impartido por un docente de la Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional de Piura para estudiantes de la Escuela Profesional de Ciencias Bioló

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7 Seminario - Biodiversidad

Este documento presenta un seminario sobre la medición de la diversidad alfa a nivel estructural. Explica cuatro modelos paramétricos (serie geométrica, serie logarítmica, distribución log-normal y modelo de vara quebrada) y dos modelos no paramétricos (Chao 1 y estadístico Q) para estimar la riqueza de especies en una comunidad. El seminario fue impartido por un docente de la Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional de Piura para estudiantes de la Escuela Profesional de Ciencias Bioló

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“Año del fortalecimiento de la soberanía nacional”

UNIVERSIDAD NACIONAL DE PIURA


FACULTAD DE CIENCIAS
ESCUELA PROFESIONAL DE CIENCIAS BIOLÓGICAS

Seminario

Diversidad Alfa
Midiendo la Estructura
Biodiversidad
INTEGRANTES:
2021-II
- Chiroque Arévalo Preciosa Alejandra
- Coveñas Morante Johana Milagros
- Fernández Silva Pablo David
- Flores Moscol, Marisel
- Hinojosa Vega Esteban
DOCENTE: Blgo. Robert Barrionuevo García. Dr. - López Palacios Sheyla
- Lozada Ruiz Pierina
Introducción
Introducción
La diversidad alfa es la riqueza de especies de una muestra territorial. Es el número de especies que viven
y están adaptadas a un hábitat homogéneo , cuyo tamaño determina el número de especies por la relación
área-especie,en la cual mayor cantidad de especies.

Para Whittaker (1960) la diversidad alfa es la riqueza en especies de una muestra territorial.

3
Clasificación de diversidad alfa a nivel estructural

4
II. Modelos Paramétricos
Distribuciones estadísticas

6
Distribuciones conocidas en muestras biológicas

(a) La distribución binomial, donde las frecuencias están


representadas por los términos sucesivos del binomio .

(b) La distribución normal, en la que los resultados se distribuyen


simétricamente alrededor del valor medio o promedio, y que es el
caso especial de (a) cuando p y q son iguales.

(c) La distribución de Poisson es discreta y modela eventos


independientes que ocurren al azar, pero durante un período de tiempo
suficientemente largo, la tasa de ocurrencias converge a λ.

7
Gráficos de modelos paramétricos
Gráficas de 4 modelos de abundancia estructural de especies: serie geométrica, serie logarítmica, log-normal y “vara quebrada”.

8
Distribución de abundancia

9
2.1. Serie Geométrica

10
2.1. Serie Geométrica

11
2.1. Serie Geométrica

12
2.1. Serie Geométrica

13
2.1. Serie Geométrica

14
2.1. Serie Geométrica

15
Origen e
2.2. Serie Logarítmica Historia
Primer intento de relacionar S y N con log-series

Ronald Aylmer Fisher


(1890 – 1962)

?
h izo
o lo
óm Describe la distribución logarítmica que se utiliza para modelar la abundancia relativa de especies
¿C
16
Origen e
2.2. Serie Logarítmica Historia
Distribución de Poisson

17
Origen e
2.2. Serie Logarítmica Historia

18
Origen e
2.2. Serie Logarítmica Historia

19
2.2. Serie Logarítmica

20
2.2. Serie Logarítmica

21
2.3. Distribución log-normal

#Spp con 1 individuo = N


#Spp con 2 individuo = N/2
#Spp con 3 individuo = N/3

22
2.3. Distribución log-normal

23
2.3. Distribución log-normal

24
Una distribución normal es una
distribución de probabilidad de
resultados que es simétrica o forma
una curva de campana.

Distribución normal logarítmica es


una distribución de probabilidad
continua de una variable aleatoria
cuyo logaritmo está normalmente
distribuido

25
Para calcular los valores esperados de esta distribución hay que obtener los logaritmos de las abundancias de
las especies y obtener la media y la varianza de estos logaritmos:
Media:
Selva
Especie
Varianza: ni log(ni)

Artibeus jamaicensis Leach, 1821 84 0.170

Artibeus intermedius Allen, 1897 35 0.071

Artibeus lituratus (Olfers, 1818) 9 0.018

Dermanura phaeotis Miller, 1902 50 0.101

Dermanura tolteca (Saussure, 1860) 4 0.008

Dermanura watsoni (Thomas, 1901) 8 0.016

Chiroderma salvini Dobson, 1878 5 0.010

Centurio senex Gray, 1842 15 0.030

Platyrrhinus helleri (Peters, 1866) 8 0.016

Sturnira ludovici Anthony, 1924 265 0.538

Sturnira lilium (Geoffroy, 1810) 10 0.020

Número total de individuos (N) 493

Número total de especies (s) 11


26
El siguiente paso es calcular donde es la línea de velo o el punto de ruptura
de la curva gaussiana debido a que la información es incompleta para las especies raras, esta línea de
velo cae en el log 0.5.

x0 = log 0.5 = -0.30103


γ= 0.294 / (1.257+0.30103) = 0.294 /1.55803 = 0.189


θ= 0.01792

27
Tabla Cohen (Magurran, 1988)
Estimamos µx y Vx (media y varianza) de x usando las siguientes ecuaciones:

Obtenemos la variable normal estandarizada

Estandarización

28
Este valor se utiliza para obtener el número total de especies en la comunidad (S*), a partir
de la ecuación S* = S/(1-P). En el caso de los murciélagos, S* = 11/(1-0.0043) = 11.05

29
2.4. Modelo de vara quebrada

Asume que el nicho se divide como una vara que se fragmenta


simultáneamente al azar en piezas de todos los tamaños. La abundancia
del trozo más frecuente puede obtenerse mediante la expresión
matemática:

30
31
2.4. Modelo de vara quebrada

32
III. Modelos no Paramétricos
3.1. Chao 1
Es un estimador del número de especies en una comunidad basado en el
número de especies raras en la muestra.

Anne Chao Donde:

De todos los modelos S= número de especies en una muestra


que ha desarrollado
a= número de especies representadas por un único individuo (número de
Chao, el más utilizado
desde entonces ha singleton)
sido el propuesto en b= número de especies representadas por dos individuos (número de doubletons)
1984.

34
Derivado de Harris (1959)

Una aproximación de esta expresión


equipara F(x) a G(x):

35
36
Ejemplo:

Número de individuos registrados de cada especie de murciélagos de la subfamilia Stenodermatinae


(Chiroptera: Phyllostomidae) durante 14 muestreos en un cultivo de maíz (datos personales).

37
3.2. Estadístico Q
Un enfoque interesante para la medición de la diversidad que toma en cuenta la distribución de las
abundancias de las especies, pero en realidad no implica ajustar un modelo de distribución estadística,
propuesto por Kempton y Taylor (1976, 1978).

38
Definición gráfica del estadístico Q

c
a

39
Definición de la fórmula del estadístico Q

Donde:
- nr = el número total de especies con
abundancia R.
- S = el número total de especies en la muestra.
- R1 y R2 = son los cuartiles 25% y 75%.
- nR1 = el número de especies en la clase donde
cae R1.
- nR2 = el número de especies en la clase donde
cae R2.
40
EJEMPLO:

41
- Una vez que se seleccionan los cuartiles, es simple
calcular Q usando la ecuación: Por lo tanto en este ejemplo:

Donde:
- ½ nR1= la mitad del número de especies en la
clase donde cae el menor cuartil.
- ∑nr = el número total de especies entre los
cuartiles.
- ½ nR1= la mitad del número de especies en la
clase donde cae la parte superior cuartil.
- R1= el número de individuos en la clase con la
menor cuartilla.
- R2= el número de individuos en la clase con la
parte superior cuartilla.
42
IV. Índices de abundancia
proporcional
Índices de abundancia proporcional

Peet (1974) clasificó estos índices de abundancia en índices de equidad, aquellos que toman en cuenta el valor de
importancia de cada especie, e índices de heterogeneidad, aquellos que además del valor de importancia de cada
especie consideran también el número total de especies en la comunidad.

Simpson
Serie de Hill
Índices de
dominancia Berger Parker
McIntosh
Índices de
abundancia Shannon -Wiener
proporcional
Pielou
Brillouin
Índices de
Bulla
equidad
Equidad de Hill
Alatalo
Molinari
4.1. Índices de Dominancia
4.1.1. Simpson
➔ Índice de Simpson (λ):
Manifiesta la probabilidad de que extrayendo de la comunidad dos individuos al azar, los dos sean de la
misma especie y se representa cómo:

● Cuando la comunidad es infinita: ● Cuando la comunidad es finita:

Edward Hugh Simpson


(1922 – 2019)

El primero de los
índices de
heterogeneidad Donde:
utilizados en Ecología
fue propuesto por n = número total de organismos de una especie en particular.
Simpson. N = número total de organismos de todas las especies
pi= abundancia relativa de la especie

Simpson publicó un artículo sobre la medición de la diversidad en la naturaleza en 1949.


46
➔ Índice de Simpson (λ):

El valor de D oscila entre 0 y 1:


Dominancia
– Si el valor de D da 0, significa diversidad infinita.

– Si el valor de D da 1, significa que no hay diversidad.

➔ Índice de diversidad de Simpson: 1-D

El valor también oscila entre 0 y 1:


Diversidad
– Si el valor de D da 0, significa menor diversidad

– Si el valor de D da 1, significa mayor diversidad.

➔ Índice inverso de Simpson: 1/D


Número de
especies muy
– El valor de este índice comienza con 1 como la cifra más
baja posible.
abundantes
– El valor máximo es el número de especies en la muestra.
47
Cuadro 1. Número de individuos vegetales de la familia Fabaceae registradas en el campo A
● Ejercicios: ni = número de individuos de la especie i; pi = abundancia proporcional de la especie i (pi = ni/N).
Índice de Simpson:
Campo A
Especie
ni pi

Acacia macracantha Humboldt & Bonplan ex Willdenow 1806 25 0.108

Inga feuillei DC. 1825 22 0.095

Erythrina edulis Triana ex Micheli 1892 18 0.078


Para campo A:
Parkinsonia aculeata L. 1753 23 0.100

λ = 0.112 + 0.12 + 0.082 + 0.102 + 0.082 Anadenanthera colubrina (Vell.) Brenan 1835 19 0.082
+ 0.072 + 0.092 + 0.082 + 0.082 + 0.132 Caesalpinia paipai R. & P. 1956 20 0.086
+ 0.082 = 0.094
Caesalpinia pulcherrima (L.) Swartz 1791 21 0.091

Índice de diversidad Simpson: 1-D Phaseolus vulgaris L. 1753 18 0.078

Mimosa albida H. & B. ex Willd. 1806 19 0.082


= 1- 0.094 = 0.906 Prosopis pallida (H. & B. ex Willdenow) Kunth 1823 25 0.108

Prosopis juliflora var. horrida (Kunth) Burrkart 1976 20 0.086


Índice inverso de Simpson: 1/D
Número total de individuos (N) 230

= 1/0.094 = 10.6 Número total de especies (s) 11

El campo A presenta una dominancia baja, su diversidad es alta y presenta aprox, 10.6 especies muy abundantes.. 48
4.1.2. Serie de Hill

Es una serie de números que permiten calcular el número efectivo de especies en una
muestra, es decir, una medida del número de especies cuando cada especie es
ponderada por su abundancia relativa (Hill, 1973; Magurran, 1988).

Donde:

Mark Oliver Hill A= parámetro que determina la sensibilidad de la


(1945 - ) fórmula a las abundancias relativas de las especies.
pI= abundancia relativa de la especie

Hill junto con Hannah


y Kay, .sostenían que
estos cálculos (índice
de Shannon y el de
Simpson) son no N0 = número total de especies (S)
lineales, por lo que N1 = número de especies abundantes = e H’
comparar las N2 = número de especies muy abundantes = 1/λ
proporciones resulta
engañoso.
49
De toda la serie, los más importantes son:

● N0 = número total de especies (S)

N0 = ( (pi0))1/(1-0)

N0= ( 1+1+1+... 1)
“s” veces

50
● N1 = número de especies abundantes = eH’

N1= ( (pi1))1/(1-1)

● N2 = número de especies muy abundantes = 1/λ índice de Shannon

N2= ( (pi2))1/(1-2)
N2= ( 1/ (pi2))
índice de
2 1/(-1)
N2= ( (pi )) Simpson
51
Cuadro 2. Número de individuos vegetales de la familia Fabaceae registradas en campo A
● Ejercicio: ni = número de individuos de la especie i; pi = abundancia proporcional de la especie i (pi = ni/N).
Serie de Hill Campo A
Especie
ni pi

Acacia macracantha Humboldt & Bonplan ex Willdenow 1806 84 0.170

Inga feuillei DC. 1825 35 0.071

Erythrina edulis Triana ex Micheli 1892 9 0.018

Parkinsonia aculeata L. 1753 50 0.101


Para campo A:
Anadenanthera colubrina (Vell.) Brenan 1835 4 0.008

Caesalpinia paipai R. & P. 1956 8 0.016


● N0 = número total de especies (S) =11
● N1 = número de especies abundantes = eH’ Caesalpinia pulcherrima (L.) Swartz 1791 5 0.010
= e 1.53= 4.62 Phaseolus vulgaris L. 1753 15 0.030
● N2 = número de especies muy abundantes
Mimosa albida H. & B. ex Willd. 1806 8 0.016
= 1/λ== 1/0.34 = 2.94
Prosopis pallida (H. & B. ex Willdenow) Kunth 1823 265 0.538

Prosopis juliflora var. horrida (Kunth) Burrkart 1976 10 0.020

Número total de individuos (N) 493

Número total de especies (s) 11

En el campo A con 11 especies, el número de especies abundantes es de 4.62 y el número de especies muy dominantes es de 2.94. 52
N0 = número total de
especies (S)
N1 = número de especies
abundantes = e H’
N2 = número de especies
muy abundantes = 1/λ

Comunidad A: mayor
dominancia
Comunidad B: mayor
equitatividad

Gráfico 1. Perfiles de diversidad de dos comunidades con el mismo número de especies


(s=100) e individuos (n=1.000), pero con diferente equitatividad.
53
4.1.3. Berger - Parker

1970
WOLFGANG H. BERGER
(1937 - 2017)
54
Conceptos

●Es de dominancia y toma en cuenta la representatividad de las especies, con un mayor valor de importancia en la
uniformidad o equidad de la comunidad, sin evaluar la contribución de las otras especies.

●Basado en dos elementos: la densidad máxima presentada por una especie y las sumas de las densidades de todas las
especies. De tal manera que lo que muestras es la proporción que guarda la especie más abundante respecto al resto de
las que componen la comunidad.

●Este índice adquiere valores comprendidos entre 0 y 1 (0 % y 100 %).


●Es indicador de los mismos impactos que el índice de Simpson: polución orgánica, degradación en la morfología y
degradación general, es decir, es un índice de dominancia que varía entre 0 y 1, cuanto más se acerca a 1 significa
que mayor es la dominancia y menor la diversidad.(Magurran, 1988).

55
Fórmula:

Donde:
Nmax: es el número de individuos en la
especie más abundante.
N: es el número total de individuos.

56
Cuadro 01. “DIVERSIDAD DE AVES DEL BOSQUE SECO DENSO INTERANDINO SHUMAYA, HUANCABAMBA, PIURA”

Especie ni

Polioptila plumbea 100 Crotophaga sulcirostris 22

Leucippus taczanowskii 30 Falco sparverius 21

Dives swarcewiczi 40 Metriopelia ceciliae 15

Euscarthmus meloryphus 31 Sporophila nigricollis 15

Forpus coelestis 32 Zenaida auriculata 15

Zonotrichia capensis 37 Camptostoma obsoletum 17

Pipraeidea bonariensis 27 Campylorhynchus fasciatus 16

Sturnella bellicosa 20 Muscigralla brevicauda 16

Troglodytes aedon 20 Atlapetes seebohmi 4

Columbina cruziana 24 Cranioleuca antisiensis 4

Leptotila verreauxi 24 Sporophila luctuosa 4

Myrtis fanny 23 Thraupis cyanocephala 4

Saltator striatipectus 23 Total 606

Coereba flaveola 22
57
Jesus Manuel Charcape Ravelo - UNP, 2019
Índice de Berger- Parker (d ):
d= N máxima/ n d= 100/606 d= 0.16502

Podemos inferir que existe una dominancia baja del


16.5%, por lo que existe una equidad y diversidad alta.

58
4.1.4. McIntosh

59
4.1.4. McIntosh

Trabaja los tamaños de las poblaciones de los distintos taxones, indicando la dominancia de alguno o algunos de
ellos. Es un índice que resulta independiente del número total de individuos.

Es un índice de dominancia que resulta independiente de N (Magurran, 1988; Baev y Penev, 1995).

Su fórmula es:

ni= número de individuos por cada


especie.
60
Un investigador ha contado especies vegetales en 1 Ha de bosque y a encontrando 6 especias con un total de 32
individuos.

Especies Número de individuos (ni) ni 2

Colicodendron scabridum 3 9
Tenemos:
N=32
Prosopis pallida 15 225 U= √340 = 18.439
Aplicando la fórmula
Mirabilis jalapa 1 1

Passiflora peduncularis 1 1

Vallesia glabra 10 100

Oxalis sp. 2 4

N total 32 340
61
Duarte Carlos, 2006.
Especies Selva Cultivo Chiroderma 5 0.010 0.0001 3 0.013 0.000169
salvini

ni Pi ni Pi
Centurio senex 15 0.030 0.0009 0 0.000 0
(Pi)2 (Pi)2

Platyrrhinus 8 0.016 0.000256 0 0.000 0


Artibeus 84 0.170 0.0289 48 0.208 0.043264 helleri
jamaicensis

Sturnira ludovici 265 0.538 0.289444 62 0.270 0.0729


Artibeus 35 0.071 0.0049 56 0.244 0.059536
intermedius

Sturnira lilium 10 0.020 0.0004 2 0.009 0.000081


Artibeus lituratus 9 0.018 0.0001 58 0.252 0.063504

Número total de 493 0.34 230 0.24


individuos
Dermanura 50 0.101 0.010201 0 0.000 0 (N)
phaeotis

Dermanura 4 0.008 0.000064 1 0.004 0.000016


tolteca

Dermanura 8 0.016 0.000256 0 0.000 0


watsoni
62
Índice de Berger- Paker (d):

Índice de Mc Intosh: Selva

Selva d= Nmáxima/ n d= 265/ 493=0.537

D= (N-U) / (N-√N) U =√81581 = 285.62 - Por lo que podemos inferir que existe un 50% de
dominancia debido a la especie Sturnira ludovici en
D = 493- 285.62 / 493 - 22.20 D = 0.44 Selva.

Cultivo

Cultivo d= Nmáxima/ n d= 62/ 230 d=0.270

D= (N-U) / (N-√N) U =√12662 = 112.52 - Por lo que podemos inferir que existe una menor
dominancia de las especies de murciélagos y hay mayor
D = 230 - 112.52 / 230 - 15.16 D = 0.54
diversidad en el cultivo de maíz.

63
V. Aplicación en Software
Prueba de Normalidad
1. Planteamiento de Hipótesis

H0: Los datos tienen distribución normal


H1: Los datos no tienen distribución normal

𝛼 = 0.05

2. Estadístico de prueba

AD = 6.034

3. Decisión

p-valor = 0.005 < 0.05 = 𝛼 ,

Se rechaza la hipótesis nula

4. Conclusión:
Los datos no tienen distribución normal
65
Conclusiones
67

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