ANDRES FELIPE FLOREZ

Jerarquía Estructural

5 niveles estructurales(0 a 4)

Enlaces fuertes: Iónicos(Dif Electronegatividad mayor a 1,7; un elemento toma el electrón de otro
elemento), Covalente Polar(elementos comparten electrones; Dif electronegatividad entre 0,4 y
1,7), Covalente apolar(elementos comparten electrones; Dif electronegatividad entre 0 y 0,4),
covalente dativo o coordinado(Un elemento comparte dos electrones a otro) y Metálico(uniones
entre electrones π deslocalizados)

Interacciones Débiles: Puentes de hidrogeno(uniones entre H y NOFS), Ion-dipolo, dipolo-dipolo,

Van der Walls(lo poseen todas las moléculas existentes), relaciones hidrofóbicas(entre grupos
apolares).

Conformación: Se refiere a la posición de los elementos(cambio en posición)

Configuración: Se refiere a la organización de los elementos(cambio en organización)

Isómeros: Misma formula molecular diferente posición o organización. Hay varios tipos:
esteroisomeros, diastereomeros y enantiomeros.

Esteroisomeros: hay dos tipos geométrico(cis y trans) y conformacional

Diastereomeros: Son imágenes de espejo

Enantiomeros: No son imágenes especulares.

Metabolismo: Reacciones químicas en las cuales hay un intercambio de energía, sustancia o

información entre una célula u organismo y su ambiente.

Termodinámica

Funciones de estado: Volumen, Temperatura, Masa, Energía, Presion, Potencial Químico, Fuerza
electromotriz y Magnetismo. Las señaladas en negrilla son las mas importantes.

Ley cero: En el estado de equilibrio entre dos sistemas las funciones de estado no dependen del
tiempo.

Ley 1: La energía no se crea ni se destruye solo se transforma

Ley 2: El mundo tiende hacia el caos, los procesos espontáneos aumentan la entropía, es decir el
número de microestados

Sistemas: Aislado(ni energía ni materia), Cerrado(si energía no materia) y Abierto(si energía si

materia)
Energía Interna: Energía cinética y potencial de un sistema se define con la ecuación 𝑈 = 𝑄 + 𝑊

Entalpia: Se refiere al cambio en la energía calórica, en la temperatura; tiene un valor negativo

para las reacciones exotérmicas(liberan calor) y un valor positivo para las reacciones
endotérmicas(absorben calor).

Entropía: Se refiere al desorden del sistema, al número de microestados en el sistema se define

con la ecuación ∆𝑆 = 𝑄/𝑡

Energía libre de gibbs: Se refiere a la energía que libera o absorbe el sistema; tiene signo negativo
para las reacciones exergonicas(liberan calor), y signo positivo para las reacciones
endergonicas(absorben energía) si el signo es negativo significa que la reaccione es espontanea y
por ende la entropía aumenta; se define con la ecuación ∆𝐺 = ∆𝐻 − 𝑇∆𝑆 o ∆𝐺 = −𝑅𝑇𝐿𝑛𝐾𝑒 lo
que indica que a mayor valor de constante de equilibrio mas negativa será le energía libre de
gibbs.

Reacciones endergonicas pueden suceder de manera espontánea si se acoplan a reacciones

exergonicas que generen que la energía libre total presente signo negativo, por ejemplo el uso de
ATP para sintetizar polipéptidos.

Equilibrio Acido.Base

Equilibrio: Momento en que las velocidad de reacción directa e inversa son iguales, y las
concentraciones de productos y reactivos son constantes

Constante de equilibrio: Keq=Concentraciones Productos/Concentraciones reactivos, si es mayor a

uno la reacción es favorable y hay más productos, si es menor a uno pues lo contrario.

El agua es solvente debido a sus carácter parcialmente cargado debido a los dipolos positivo y
negativo, permitiendo disolver toda molécula polar cargada o no cargada.

pH: Potencial de hidrogeniones, de 0 a 14, entre mas alto mas básica la solución, entre más bajo
más acido. Se halla mediante a la ecuación 𝑝𝐻 = −log⁡[𝐻]

Constante de disociación: representa que tanto se disocia o se ioniza un ácido en presencia de

agua, a mayor Ka(constante de disociación) mayor disociación y por ende mayor acides, de puede
hallar el pKa que es el logaritmo negativo de la Ka, entre más grande el pKa menor la acidez.

[𝐴]
Ecuación de Henderson-Hasselbalch: 𝑝𝐻 = 𝑝𝐾𝑎 + log [𝐻𝐴]⁡siendo A

El cuerpo tiene un equilibrio acido básico, que consiste en mantener el pH correspondiente para
cada zona, el sanguíneo por ejemplo debe ser de 7,4±0,2, para mantener este pH hay varios
sistemas buffer que resisten cambios de pH, el más importante es el de bicarbonato que se puede
resumir en la siguiente ecuación: CO2 + H2O <-> H2CO3 <-> HCO3- + H+, siendo el lado derecho el
ácido y el izquierdo el básico, según esta ecuación cuando hay mucho CO2 en la sangre se tender a
formar acido carbónico que se disociara elevando el pH en la sangre, por esto es importante la
inhalación de oxigeno y exhalación de dióxido de carbono.

La Hemoglobina también actúa como buffer, ya que al liberar el oxígeno toma CO2 y H+ evitando
que el pH sanguíneo baje.

Puede haber acidosis respiratoria(fumadores crónicos) y metabólica(Diabetes), de igual manera

poder haber alcalosis respiratoria(Fiebre) y metabólica(fibrosis quística), en el caso de las
respiratorias hay una compensación renal, sea reteniendo o liberando bicarbonato, en el caso
metabólico hay una compensación respiratoria sea hipo o hiperventilando.

Los aminoácidos también actúan como buffer, debido a su carácter anfótero(mas adelante)

También existe un equilibrio Hídrico que hace referencia a mantener un medio isotónico entre la
célula y el exterior, en caso de haber mucha agua afuera habrá un medio hipotónico, en caso
contrario será hipertónico.

Acido: Dador de protones

Base: Aceptor de protones

Titulación: Procedimiento en el cual se neutraliza un ácido con una base con el uso de un indicador
para conocer la cantidad del ácido, además se obtiene el punto de equivalencia donde el pH es
igual al pKa

Carbohidratos

Función: Estructural(celulosa), Energia(glucosa), Comunicación(Glicoproteinas)

Son cadenas carbonadas con grupos hidroxilo y con un grupo carbonilo sea aldehído(terminal) o
cetona(no terminal), lo cual los clasifica en cetosas o hexosas

Los monosacáridos van de 3 a 7 carbonos, y el ultimo carbono asimétrico(carbono con 4 grupos

funcionales distintos) determina si se clasifica en D(derecha) o L(izquierda) dependiendo de la
ubicación del grupo hidroxilo. Solo hay glúcidos D en el cuerpo.

Existen monosacárido lineales y cíclicos, estos últimos provienen de los lineales, donde el grupo
carbonilo se une al último carbono de la cadena generando un enlace hemiacetal, cuando hay
moléculas cicladas se clasifican en beta o cis(arriba) o alfa o trans(abajo) dependiendo de la
ubicación del hidroxilo en el carbono anomerico(el que esta a la derecha del oxigeno.

Los monosacáridos se pueden mediante enlaces O-glucosidicos que se forman en los grupos OH de
el carbono anomerico de un monosacárido con el carbono anomerico de otro carbono(enlace
dicarbonilico), o entre le grupo OH de el carbono anomerico de un carbono un carbono no
anomerico de otro monosacárido(enlace monocarbonilico). El enlace O-glucocidico también se
conoce como acetal.
Cuando se unen entre 2 y 10 monosacárido se determinó oligosacárido, cuando son mas de 10 se
determina polisacárido, existen homopolisacaridos(mismo monosacárido unido muchas veces) y
heteroplisacaridos(diferentes monosacáridos), siendo los heteropolisacaridos los únicos con
carácter informacional.

Los enlaces glicosidicos se clasifican dependiendo de la ubicación del OH del carbono anomerico
del monosacárido de la izquierda y dependiendo del número del carbono que sea el carbono
anomerico y el carbono del otro monosacárido al que se une, por ejemplo en la celulosa ocurren
enlaces beta 1-4 que le da su carácter insoluble, en la glucosa y en el almidón hay enlaces alfa 1-4
que forman cadenas lineales, y hay también enlaces alfa 1-6 que generan ramificaciones, la
glucosa es mas ramificada debido a su mayor presencia de enlaces alfa 1-6.

En los monosacárido cíclicos existe la forma silla(Puntas a diferentes lados) y forma nave(puntas
hacia el mismo lado) es más estable la forma silla.

Existe un fenómeno llamado mutarrotación en el cual en solución los monosacáridos adoptan su

forma D, L y incluso su forma lineal.

Los monosacáridos se caracterizan por ser dulces, solubles, blancos y cristalinos.

Los monosacáridos más importantes son: ribosa, desoxirribosa, glucosa, fructosa, galactosa

Los oligosacáridos más importantes son: Celobiosa, sacarosa, lactosa, maltosa.

Los polisacáridos más importantes son: celulosa, almidón, glucógeno, quitina, pectina y
peptidoglicano.

Los heteropolisacaridos mas importantes: Heparina(anticoagulante) Acido Hialuronico(lubricante

articulaciones) y Condroitin Sulfato(Flexibilidad cartílago)

Otra forma de clasificación se divide en osas(monosacáridos), homoosidos(oligo y polisacáridos)

heteroosidos(glúcido con otra biomolecula).

Existen monosacáridos derivados, donde el OH se reemplaza por otro grupo funcional.

Los glúcidos determinan el grupo sanguíneo.

Lípidos

Biomoléculas que se extraen de los materiales biológicos mediante solventes orgánicos(apolares)

Se organizan en su mayoría de forma anhidra(sin presencia de agua).

Tienen función estructural, protectora, regular temperatura, regular metabolismo, transportadora,

energética.
Saponificable: que se puede precipitar en forma de sal, la mayoría de los lípidos son
saponificables, excepto los esteroides.

Ácidos Grasos: Cadenas hidrocarbonadas que poseen un grupo carboxilo terminal, puede ser
saturado(enlaces simples) o insaturado(enlaces dobles).

Enlace Ester: Unión de un grupo OH con un grupo carboxilo.

Acilglicerido: glicerol esterificado con ácidos grados, puede ser 1(monoacilglicerido),

2(diacilglicerido) y 3(triacilglicerido), este último es el que más se presenta en el tejido adiposo.
Estas esterificaciones le quitan el poco carácter polar a los aminoácidos generando que estas
moléculas sean completamente apolares.

Fosfatidilgliceridos: Glicerol unido a dos ácidos grasos y a un grupo fosfato que se une a otra
molécula polar, esto le da su carácter anfipatico(lado polar y lado apolar, o lado hidrófobo y lado
hidrófilo).

Esfingolipidos: Esfingosina(C18) con un grupo amino al cual se une un ácido graso, y un OH

Terminal al que se uno el fosfato y un grupo polar, o se uno un sacárido formando un
esfingoglucido.

Ceras: Esterificación entre un alcohol y un ácido graso. Esto impermeabiliza las paredes
celulares(función protectora).

Lípidos Derivados: Isoprenoides y Eicosanoides

Isoprenoides: derivados del isopreno; hay terpenos y esteroides, los terpenos son los derivados
lineales tales como las vitaminas; los esteroides son los derivados cíclicos, como el colesterol, los
acidos biliares y un gran número de hormonas, el colesterol además posee derivados como el
cortisol(prepara el cuerpo para estrés) y la aldosterona(controla absorción de agua)

Eicosanoides: Derivados del ácido araquidónico como las prostaglandinas(inflamación), los

tromboxanos(Coagulacion) y Leucotrienos(respuesta anafiláctica).

El ácido araquidónico proviene del ácido linolénico que es esencial, es decir que no se sintetiza en
el cuerpo y debe ser ingerido en la dieta.

El ácido palmítico(C16) es el producto final de la síntesis de ácidos grasos en el cuerpo.

Vitamina D: Absorción calcio y fosfato, crecimiento muscular.

Vitamina A(Retinol): Adaptación ojo a la oscuridad.

Vitamina E: Antioxidante

Vitamina K: Coagulación.
La agrupación de los lípidos antipáticos permita formar micelas(monocapas), membranas
biológicas(bicapas) y Liposoma(bicapas).

Lipoproteina: Forma en que se transportan lípidos en el cuerpo, predominan los

quilomicrones(lipoproteína de mayor tamaño) la VLDL, LDL(muchos colesterol) y HDL(Mucho
colesterol)

Aminoácidos

Tiene un carbono asimétrico(a excepción de la glicina) denominado carbono alfa, al cual se uno un
grupo amino, un grupo carboxilo, un hidrogeno y una cadena lateral R en donde se pueden
presentar diversos grupos funcionales. Existen 20 aminoácidos.

El grupo amino tiene carga positiva, mientras que el grupo carboxilo tiene carga negativa, estas
cargas dependen de si acepta un protón(grupo amino) o dona un protón(grupo carboxilo), por
esto el aminoácido es anfótero ya que puede actuar como base o como acido, lo cual le da su
característica buffer.

Dependiendo de los grupos que posea la cadena lateral el aminoácido puede ser no polar(Glicina,
Alanina, Prolina, Valina, Leucina, Isoleucina, Fenilalanina, Triptofano y Metionina), polar no
cargado(Serina, Treonina, Cisteina, Asparragina; Tirosina y Glutamina) y polar cargado, sea
basico(Histidina, Arginina y Lisina) o acido(Aspartato o Acido Aspartico y Glutamato o Acido
Glutamico). De igual manera los aminoácidos se clasifican en esenciales (Histidina, Isoleucina,
Leucina, Fenilalanina, Metionina, Treonina, Lisina, triptófano y Valina), no esencial(Alanina,
Asparagina, Asapartato, Glutamato, Arginina, Cisteina, Glutamina, Tirosina, Glicina, Ornitina,
Prolina y Serina) o parcialmente esenciales(aminoácidos no esenciales que se sintetizan a partir de
esenciales). Además, se clasifican en D o L, siendo los L los presentes en el cuerpo.

Cisteina es parcialmente esencial, porque para sintetirsarlo se necesita metionina que es

parcialmente esencial

Tirosina precursor de neurotrasmisores exitatorios

Triptófano precursos de la cerotonina

Participan en procesos de señalización. La histidina es el aminoácido que más se relaciona con la

función buffer en el cuerpo ya que su pKa es de 7.

Los aminoácidos tienen 3 estados, Catión(+), Zwiterion(Neutro) y Anión(-).

Los aminoácidos se unen mediante enlaces peptídicos entre el grupo amino y el grupo carboxilo,
dependiendo del número de aminoácidos unidos se clasifican en dipeptidos(2) tripeptidos(3)
olipeptidos(3-10), polipéptidos(10-100) y proteínas (100-infinito)

Proteínas

Tienen funciones de transporte, estructural, regulación metabolismo, unión intercelular etc..

Tienen diferentes niveles estructurales, desde el primario hasta el quinario.

Estructura Primaria: Es la secuencia de aminoácidos, solo se toman en cuenta los enlaces

peptídicos.

Estructura Secundario: Formación de hojas beta o hélices alfa mediante puentes de hidrogeno que
se forman entre los grupos C=O y N-H de aminoácidos diferentes, en el caso de las alfa hélices el
grupo amino apunta para adentro, mientras que en las hojas beta apunta para fuera. Las hojas
beta pueden ser paralelas o antiparalelas.

Se pueden formar ciertas secuencias de hélices o hojas pegadas que se determinan motivos, las
hojas y hélices están pegadas entre si mediante giros que se dan cuando parece el aminoácido
prolina o glicina.

Estructura Terciaria: Es la unión de motivos o de hélices o hojas mediante otro tipo de

interacciones débiles como van der walls, relaciones hidrofóbicas, y un enlace covalente, el puente
disulfuro que se presenta entre dos residuos sulfidrilos de cisteína.

Estructura Cuaternaria: Es la unión de varios polipéptidos mediante cualquiera de las interacciones

que se dan en la estructura secundaria y terciaria. Se pueden formar homopeptidos(mismo
polipéptido) o heteropolipeptidos(diferentes polipéptidos).

Estructura Quinaria: Es la unión de proteínas con otras biomoléculas(Glicoproteínas,

Proteoglucidos, Lipoproteínas).

Las proteínas se pueden clasificar en 2 conformaciones Fibrosas y Globulares.

Proteínas Fibrosas: Son alargadas tienen en su mayoría un mismo tipo de estructura secundaria.

Pretinas Globulares: Tienen combinaciones de motivos generando que adopten una forma
esférica.

Hemoglobina: Proteína conformada por 4 polipéptidos y 4 grupos hemo(no proteínicos) que

mantienen el hierro apto para su unión con el oxigeno, su función es transportar el oxigeno de los
pulmones al resto de tejidos del cuerpo, y devolver el CO2 y los hidrogeniones de los tejidos a los
pulmones.

La hemoglobina a un pH bajo pierde la afinidad por el O2 y aumenta su afinidad por el CO2 y por
los hidrogeniones(efecto Bhor). La hemoglobina a una PO2 alta y una PCO2 baja aumenta su
afinidad por el oxígeno(Efecto Haldane).

La Hemoglobina tiene un estado Tenso o Desoxigenado(T) y un estado Relajado o Oxigenado(R) el

cambio entre estos estados está regulado por el BPG el cual favorece el estado T, ya que actúa
como un inhibidor para la unión del oxígeno.
La desnaturalización se define como la pérdida temporal o permanente de la función de una
proteína debido a un cambio estructural a nivel secundario, terciario, cuaternario o quinario. La
desnaturalización se puede dar por pH, temperatura y agentes químicos como solventes o
detergentes.

Membranas

Función: Aislar, Transporte, Comunicación, Forma, Regulación.

Componentes: Fosfolípidos, Proteínas y Carbohidratos

Bicapa da lipídica con interior hidrofóbico y exterior hidrofilico formada por componente
antipáticos de manera asimétrica.

Capa Externa: Folfatidilcolina, Esfingomielina

Capa Interna: Fostadilinositol, Fosfatidiletanolamina, Fosfatidilserina.

La membrana tiene fluidez debido al movimiento de sus componentes, los fosfolípidos se pueden
mover de manera horizontal, e incluso de manera vertical (flip flop), de igual manera las proteínas
se pueden mover de manera vertical siempre y cuando no estén unidas a el citoesqueleto.

La membrana solo permite el paso de moléculas no polares pequeñas o de moléculas polares no

cargadas de pequeño tamaño.

Hay proteínas integrales(Que atraviesan toda la membrana(transmembranal), que están

embebidas en la membrana o que esta unida a la membrana por un enlace fuerte) y
periféricas(Unidas a un solo lado de la membrana, generalmente a proteínas integrales), estas
proteínas tienen función de transporte, receptores, señalización y adhesión.

Los carbohidratos presentes en la membrana son los oligosacáridos y los heteropolisacaridos,

estos unidos sea a un lípido(glicolipido) o a una proteína(Glicoproteina).

El colesterol también hace parte de las membrana y aporta fluidez si está rodeado por ácidos
grasos saturados, y aporta rigidez si está rodeado por ácidos grasos insaturados. De igual manera
aporta fluidez a bajas temperaturas.

Las balsas lipídicas son dominios moleculares situados en la membrana plasmática, que consisten
en asociaciones estables entre los esfingolípidos, glicolipidos y el colesterol de manera muy rigida,
dándole estabilidad a la membrana.

Transporte

Transporte Pasivo: A favor del gradiente de concentración, y del gradiente electroquímico y no

requiere uso de energía, puede ser difusión simple o difusión facilitada.

Difusión Simple: Paso de moléculas de manera directa a través de la membrana.

Difusión Facilitada: Paso de moléculas mediante el uso de proteínas, sean proteínas de canal(poros
a través de la membrana) o proteínas transportadoras(Proteinas que sufren cambios
conformacionales al unirse al sustrato).

Los canales pueden estar cerrados y se abren por estrés, ligando externo, ligando interno o voltaje.
Además, los canales tienen tres estados: Inactivo(no se abre por mas de recibir el estimulo),
Activo(Canal Abierto, sea porque siempre permanece abierto, o porque a recibido el estimulo) y en
reposo(Canal cerrado porque no ha recibido el estimulo).

Osmosis: Paso de agua a favor del gradiente de concentración, puede darse por difusión simple o
por difusión facilitada mediante el uso de acuaporinas.

Transporte Activo: Transporte en contra del gradiente de concentración que requiere uso de energía.
Se da mediante el uso de proteínas transportadoras sean uniporte(paso de una sola sustancia),
simporte(paso de dos sustancias en la misma dirección) o antiporte(paso de dos sustancias en
direcciones opuestas). Puede ser primario o secundario.

Transporte activo primario: Uso de energía en forma de ATP, el ejemplo principal seria la bomba
sodio potasio, en la cual el P es utilizado como energía para provocar el cambio conformacional que
permite la salida de 3 moléculas de sodio y la entrada de dos moléculas de potasio. Otro ejemplo
son los transportadores ABC que usan toda la molécula de ATP como energía.

Los pacientes con fibrosis quística sufren una afección en los canales CFTR que regulan la
absorción de cloro, generando la acumulación de moco, y la formación de costras saladas.

Transporte Activo secundario: Uso de la energía formada por la creación de un gradiente de una
sustancia distinta a la que se desea transportar. También puede ser el uso de una molécula en el
transportador que permita el funcionamiento del mismo, como en la bomba de glucosa en el
intestino que utiliza la unión de calcio para poder entrar a la célula.

Especializaciones de Membrana

Especialización Apical: Microvellosidades, Estereocilios, Cilios y Flagelos.

Microvellosidad: Proyección de la membrana citoplasmática que aumenta la superficie de

absorción, se presenta en el intestino y en los riñones; son muchas y son parejas, poseen la misma
altura. En el velo terminal(Raiz) posee actina que esta unida entre si por Miosina II y que esta unida
a la membrana por espectrina, en la microvellosidad como tal posee actina unida entre si por
fimbrina y facina, y unida a la membrana por Miosina I; además, posee vilina que ayuda para la
absorción.

Estereocilios: Son huecos por dentro, parecen un mango chupado, tienen ramificaciones, se
presentan en el epidídimo(maduración y nutrición) y en el oído(Mecanoreceptor que convierte
ondas vibratorias en impulsos nerviosos). Se componen por actina que esta unida entre si por
actinina alfa y esta unida a la membrana por erzina.

Cilios y Flagelos: Se componen de microtubulos, tienen un centro con elementos en el axonema y

un centro sin componentes centrales en el cuerpo basal(raíz) son de forma irregular; se pueden
encontrar en los espermatozoides(flagelo) o en el sistema respiratorio(cilios), en las trompas de
Falopio(cilios) y en los embriones(cilios nodales). El cuerpo basal posee 9 tripletas de
tubulina(componente de los microtubulos). El axonema(cilio o flagelo como tal) posee 9 dupletas
de tubulina, un par central de tubulina, ademas de nexina, proteínas radiales y dineina(proteína
motora).

El síndrome de Kartagener afecta la síntesis de la dineina por lo cual los cilios no tienen movilidad.

Especialización Lateral: Zonula Ocludens, Zonula Adherens, Macula Adherens y Union

Comunicante.

Zonula Ocludens: También conocida como unión estrecha o unión oclusiva. Se compone de
Ocludina y Claudina, las cuales se unen a la actina del citoesqueleto mediante las proteínas JAM.
Sirven para pegar, aislar e impermeabilizar.

Zonula Adherens: También conocida como cinturón adesivo, se extiende alrededor de toda la
célula. Se compone de caderinas, las cuales se unen a la actina del citoesqueleto mediante cateninas
y vinculinas. Tienen función estructural de fijación.

Macula Adherens: También conocida como desmosoma. Se da en ciertas ubicaciones de la célula,

se ve como una mancha en la microfotografía. Se compone de caderinas(Desmogleina
principalmente y desmocolina) y de Plaquinas(Desmoplaciona principalmente y placoglobina) que
se encuentran unidas a filamentos de queratina.

Unión Comunicante: También conocida como gap junction. Genera un canal que comunica dos
células adyacentes. Se compone de 2 conexones, los cuales se componen de 6 conexinas cada uno.

Pénfigo: Enfermedad que afecta la caderina(BP230 especificamente) puede ser

eritomatoso(foliáceo), Vegetante(vulgar) o cicatricial(ampollar).

Especializaciones basales: Hemidesmosomas y pliegues basales

Hemidesmosomas: Se componen de Integrina y de plaquina unida a filamentos de queratina. Unen

la celula con la placa basal.

Pliegues basales: Aumenten el área de absorción.

Señalizacion

Una señal es producto de un estimulo que se genera cuando se produce un cambio que llega a
determinado nivel generando diversas respuestas.

Las señales o estímulos pueden ser de diversos tipos: Hormonas, luz, neurotransmisores, feromonas
etc…, estos pueden provenir de una fuente externa o de una fuente interna.

Los estímulos o señales son captados por los receptores en la membrana celular de la célula diana
que inicia una cascada d reacciones enzimáticas que va a depender de la composición enzimática de
la célula, por ejemplo, la insulina tiene un mismo efecto para todos los tejidos que es la glicolisis,
sin embargo tiene otros efectos en diversos tejidos.
Las respuestas se pueden dividir en diversas categorías: Paracrina(Celula central produce señal que
afecta a las células aledañas) Endocrina(Señal producida por el sistema endocrino que se transporta
por el torrente sanguíneo al receptor), Sinapsis(Neurotransmisor de la membrana de la neurona pre
sináptica, a la membrana de la neurona post sináptica) y contacto dependiente, señal en la
membrana de una célula se une al receptor en la membrana de otra célula.

La señalización es específica, ya que hay un receptor para cada señal.

Cuando la señal llega al receptor se produce una amplificación de respuestas generando que una
señal tenga efecto sobre un gran número de moléculas.

Cuando la respuesta necesaria se ha dado los receptores se desensibilizan de la señal sea cambiando
su conformación o retirándose de la membrana manteniendo así al homeostasis.

Hay una integración de respuestas ya que dos señales pueden generar efectos opuestos al mismo
tiempo, y el producto final será una integración de ambas respuestas.

Hay diversos tipos de receptores: Canales, receptores enzimáticos, Receptor Serpentino, Receptor
de esteroides, Receptor con actividad enzimática no intrínseca y Receptor de adhesión.

Canales: Se pueden abrir por voltaje, estrés, ligando interior o ligando exterior.

Receptores enzimáticos: El receptor tiene en su misma estructura la primera enzima que entra en
acción en la cascada de reacciones.

Receptor Serpentino: La señal genera que la proteína G unida al receptor cambie el GDP de su
estructura por GTP el cual se fosforila generando que parte de la proteína(dominio alfa) se mueva y
active la primera enzima de la cascada enzimática.

Receptor de esteroide: La hormona atraviesa la membrana y entra al núcleo donde se una al receptor
que genera la expresión de ciertos genes.

Receptor con actividad enzimática no intrínseca: El receptor al recibir la señal fosforila una enzima
que da inicio a la cascada de reacciones.

Receptor de adhesión: El receptor altera su conformación y este se encuentra unido al citoesquelo.

Insulina: Tiene dos cascadas enzimáticas, la primera consiste en las fosforilacion mediante la tirsoin
quinasa del receptor de la enzima IRS la cual da inicio a la cascada que como ultima enzima tendrá
a la MAPK que fosforilara 2 receptores que generaran la síntesis de proteínas parael crecimiento y
la división celular además de la vaso constricción. La segunda consiste en la fosforilasion de la
PKB que va a inactivar a la GSK permitiendo que la GS sintetice glucógeno, además la PKB
también actuara como señal para abrir los canales GLUT(absorción de glucosa), esta cascada
también tendrá como respuesta la vasodilatación.

Epinefrina: Utiliza un receptor de actividad enzimática no intrínseca, además pose la particularidad

de que el rector es endocitado por la célula y luego se vuelve a ubicar en la membrana.

Ley de Fick
Establece que el flujo es proporcional al gradiente de concentración, y por ende la difusión neta
∆𝐶
también lo será. Se puede resumir en la siguiente ecuación: 𝐽 = −𝐷 donde D es la constante de
∆𝑥
difusión, J es el flujo, C es la concentración y x es la distancia.

El valor de Des único para soluto y se puede ver afectado por el tamaño del soluto de forma inversa,
por la viscosidad de forma inversa, por la presión de forma directa y por la temperatura de forma
directa.

Los factores que afectan la difusión de manera directa son el gradiente de concentración, la
temperatura y la presión, mientras que los la afectan inversamente son el espesor, el tiempo, y el
tamaño del soluto.

La presión osmótica es mayor a medida que hay mayor número de partículas, esta presión detiene el
flujo del solvente.
𝑘𝑇
Otras ecuaciones a tener en cuenta son 𝐷 = y 𝑥 2 = 𝑑 2 = 2𝐷𝑡
6𝜋µ𝑟

Célula

Es la menor unidad de vida que existe, todo ser vivo está compuesto por células o por una célula en
el caso de los organismos unicelulares.

Eucariotas Procariotas
Tienen Núcleo No tiene núcleo
Ribosomas 80s Ribosomas 70s
ADN cubierto por una envoltura nuclear ADN libre en el citoplasma
(núcleo)
Mitocondria No tienen mitocondrias
Más de 10 um Menos de 10 um
Animal Vegetal
Membrana plasmática Pared celular
No tiene Plástidos Tiene cloroplastos
Guarda energía en Guarda la energía en
glucógeno almidón
No hay vacuolas o son Vacuolas grandes y
pequeñas alargadas

Experimento de Stanley y Miller, consistió en hacer de manera artificial una atmosfera con
características similares a las primitivas y agregarles energía, al tiempo se observó que se habían
formado moléculas orgánicas (aminoácidos principalmente).

Autótrofo: Construye su propio alimento a parte de energía inorgánica.

Heterótrofo: Obtiene su alimento a partir de otros organismos

Una célula tiene una membrana que lo aísla del medio, unos ribosomas para sintetizar proteínas y
un material genético.
Hay tres dominios las arachaea las bacterias y las eucariotas, siendo las primeras dos en conjunto
las procariotas. Las archaeas se parecen mas a las eucariotas que las bacterias.

Teoría endosimbiotica: Una bacteria se trago a otras formando las eucariotas.

El origen del núcleo y del retículo plasmático consiste en invaginaciones de la membrana

plasmática.

Caracteristica Archaea Bacteria Eucariota

Ribosomas 70S 70S 80S
Membrana Interna NO NO SI
ADN con proteínas SI NO SI
Pared Celular SI(Glucoproteina) SI(Peptidoglicano) A VECES(Vegetales –
Celulosa)
ADN en Nucleo NO NO SI
Precensia de Intrones SI NO SI
Primer Aminoacido METIONINA FORMILMETIONINA METIONINA
Tamaño HASTA 2NM HASTA 2NM MAS DE 2NM
Atotrofo SI(Quimiautotrofia) SI(Fotosintesis) SI(Fotosintesis)
Genes en operones SI SI NO
Plasmido SI SI NO
RNA Polimerasas MAS DE 1 1 MAS DE 1
Sensibilidad al NO SI NO
Cloranfenicol
ADN CIRCULAR CIRCULAR LINEAL

Transcripción

Dogma central biología molecular: De ADN a ARN a Proteína

Síntesis de una secuencia o cadena de ARN a partir de una molécula o cadena de ADN.

Se transcribe un producto génico funcional

La transcripción se da en dirección 5´-3´es decir que la RNA polimerasa lee en dirección 3´-5´

Existe en el ADN una cadena molde(se transcribe) y una cadena codificadora(igual al transcrito con
T en lugar de U)

Se transcriben los genes, hay varios tipos de genes los I(ARNr 5.8, 18 y 28S)los II(ARNm) y los
III(ARNt y ARNr 5S) lo cuales son transcritos por las RNA polimerasas I II y III respectivamente.

ADN es bicatenaria, tiene bases ATCG y azúcar deoxiribosa; el ARN es monocatenario

generalmente, tiene bases AUGC y azúcar ribosa.

La transcripción es asimétrica ya que solo copia una cadena del ADN

El gen posee una región promotora que no se va a codificar, está compuesta por la caja
GC(GGGCGG) ubicada a -100, la caja CAAT(GCCCAATCT) a -80, y la caja TATA(TATAAA) a -25, estas
son secuencias consenso que se encuentran en la mayoría de las especies y tienen la misma
función, siendo esta última caja la más importante debido a su unión con la TBP(Proteína de unión
a TATA).

En algunas ocasiones, caja TATA no es encuentra presente por lo cual se hace reconocimiento de
otras secuencias como Inr o DPE los cuales son reconocidos por TAFs(Factores asociados a TBP).

El promotor se puede dividir en regiones de control proximal(GC y CAAT) y promotor central (TATA
y Inr)

En procariotas el promotor o región reguladora se compone de la caja TATA y de la caja GCA

ubicadas a -10 y -35 respectivamente.

La transcripción de divide en iniciación terminación y elongación.

Hay dos tipos de factores de transcripción, los generales que se unen entre sí a la polimerasa
formando los complejos, y los de regulación que van a modular o regular la transcripción.

En procariotas la RNA polimerasa posee varias subunidades, de las cuales la sigma se encarga de
reconocer a el promotor y unirse a este juntos con las demás subunidades(complejo promotor
cerrado) posteriormente se abrirá la doble hélice de ADN(Complejo promotor abierto), a partir de
aquí se libera sigma y inicia la transcripción, cuando se llega al final del transcrito se da la
terminación sea independiente de Rho(formación de bucle) o dependiente de Rho.

En eucariotas la iniciación comienza cuando el factor de transcripción TFIID se una al promotor

este factor tiene como subunidad a TBP la cual se une específicamente a la caja TATA, además
tiene otras subunidades denominadas TAFs; este factor se unirá a GC, CAAT y otras regiones como
Inr, DCE, DPC y MTE; posteriormente se une el TFIIA que estabiliza a D y el TFIIB(Complejo TBP
TFIIB) que servirá de puente para la unión de la RNA polimerasa; la polimerasa se una al complejo
TBP TFIIB junto con TFIIF el cual estará junto a la polimerasa hasta el final de la transcripción;
finalmente se unen TFIIE y TFIIH, este ultimo es muy importante ya que tendrá dos subunidades
que actúan como helicasa para abrir el DNA cerca al complejo de iniciación y otra subunidad que
actúa como quinasa para fosforilar al extremo C terminal de la polimerasa(CTD) que consiste de
repetición de siete aminoácidos en las cuales se fosforila la serina, esta fosforilacion da inicio a la
elongación.

La elongación consiste de la síntesis de ARN por parte de la polimerasa, además también trabajan
otras dos proteínas, la girasa que trabaja delante de la polimerasa abriendo la hélice de ADN al
formar los bucles y la topoisomerasa I que va atrás de la polimerasa enrollando nuevamente el
ADN remueve los bucles.

La terminación en eucariotas es dependiente de Rho la cual existe de tres tipos I, II y III, la I y la III
se unen al ADN y la II al ARN, en el ADN va a haber una región rica en T que anuncia la terminación
de la transcripción, la Rho se une al ARN y llega al ADN donde compite con la polimerasa por un
puesto en el ADN, finalmente se desfosforila la CTD y se libera el complejo de replicación, las Rho.

La transcripción produce un pre-RNAm.

Estas condiciones son in vitro, en la realidad se requiere de un complejo mediador en la iniciación

que va a estimular la transcripción, estabilizar el complejo de iniciación y va a permitir la correcta
asociación de los factores de transcripción; ademas CTD se va a pegar a unos factores de
elongación y procesamiento que actuaran en la madruación.

En el caso de los genes I, la iniciación es distinta ya que el UBF(factor de unión corriente arriba)se
uno junto con el SL1(Factor de selectividad 1) para que después se una la RNA polimerasa I, dando
paso a la elongación y terminación que es igual a la del mRNA.

En el caso de los genes III se une el TFIIIC y TFIIIB posteriormente la polimerasa III y se da paso a la
elongación y terminación de igual manera que en los mRNA, esto cuando se transcriben tRNA
cuando se transcribe rRNA 5S también se une en la iniciación el TFIIIA antes que C y B.

Maduración

También llamado proceso post-transcripcional es el proceso mediante el cual el ARN inmadura

mediante una serie de modificaciones se vuelve funcional, mas resistente a nucleasas y
tridimensionalmente mas estables y compactos.

En procariotas se maduran el ARNr y el ARNt el ARNm no ya que los procesos de transcripción y

traducción son simultáneos; mientras que en eucariotas todos maduran a excepción del ARNr 5S.

Dentro de los procesos de la maduración se pueden incluir modificación covalente de nucleótidos,

fraccionamiento, corte o adición de nucleótidos, y splicing o corte y empalme(ayustar: unir dos
piezas por sus extremos; empalmar: unir dos piezas entrelazándolas).

El procesamientos de los ARNr es igual en procariotas y eucariotas, se transcribe un solo pre-RNA

en donde se encuentran las tres subunidades 23, 16 y 5 en procariotas y 28,5.8 y 18 en eucariotas,
este RNA es fraccionado por endonucleasas y pulido por exonucleasas.

La maduración de los ARNt es igual tanto en eucariotas como en procariotas, Se sintetiza una
molécula precursora grande que contiene varios ARNt juntos en un solo pre-RNA, en el extremo
5´la RNAasa P corta, en el extremo 3´las RNAasas E y F cortan mientras que la RNAasa D corta y
agrega la secuencia CCA que reconoce el aminoácido en caso de que esta falte. Después de esto se
dan una modificaciones covalentes de bases(10% de las bases aproximadamente) las cuales le dan
la especificidad, estas modificaciones se dan en zonas donde no hay complementariedad de bases.

Las RNAasas son ribozimas, esto quiere decir que le componente catalítico es el ácido nucleico y
no un elemento proteico.
La maduración del ARNm tiene varios pasos, el primero es el capping que consiste en la adición de
la Caperuza de 7-metilguanosina(CAP) en el extremo 5´, esta se da cuando ya se han transcrito 20-
30 nucleótidos, las enzimas responsables de la unión del CAP al pre-mRNA se encuentran unidas a
la CTD de la polimerasa, esta unión se da por un enlace fosfodiester con la particularidad de que es
5´-5´ en este proceso además se da la metilación no solo del nitrógeno 7 de la guanosina, sino
también del carbono 2 a veces del primer y a veces tanto del primero como del segundo
nucleótido del extremo 5´. La CAP estabiliza el RNA ya que esta no es reconocida por exonucleasas
y además alinea el mRNA durante la traducción impidiendo que se pliegue.

El segundo paso es la poliadenilación que consiste en la adición de la cola poli-a, es importante

tener en cuenta que esta adición se da antes de la terminación de la traducción, existen tres
señales que indican que se debe poner la cola poli-a estas son AAUAAA, CA y GU, las cuales se
reconocen en ese mismo orden. AAUAAA se encuentra aproximadamente 10-30 nucleótidos arriba
del sitio de poliadenilación. La cola de entre 150 y 200 adeninas es puesta por la poli-a polimerasa
que reconoce AAUAAA y CA, la PABP(proteína de unión a la poli-a polimerasa) se une encima de la
poli-a polimerasa formando el complejo de poliadenilación, después de esto otras proteínas se
pegan a los sitios de reconocimiento y una endonuclesa corta por CA, la polimerasa hace la cola y
todas las proteínas se separan a excepción de la PABP que mantendrá la cola unida hasta la
traducción.

El tercer paso es el splicing, que consiste en el corte de intrones(no se expresan) y la unión de

exones(si se expresan), este proceso debe ser muy exacto, la cantidad de intrones pude llegar a
ser del 90% en algunos genes. El splicing es realizado por el spliceosoma el cual es un conjunto de
snRNPs(Ribonucleoproteina pequeña nuclear) que consisten de snRNA más Proteínas, hay de 5
tipos U1, U2, U4, U5, U6; los intrones tienen tres sectores de reconocimiento el GU en 5´, el AG en
3´y el sitio de ramificación( grupo OH 2´de adenina), en el proceso el extremo 5´se corta y se une
al sitio de ramificación formando un lazo posteriormente se corta el extremo 3´y se unen los dos
exones.

La formación del spliceosoma se da de la siguiente manera: U1 se une a GU y luego U2AF se una a

AG; posteriormente U2 se une al sitio de ramificación; llega U4 unido a U6 y se pega a U2 y U5 se
une cerca al exon; U1 y U2 se asociando formando el bucle, después de esto U6 reemplaza a U1
que sale del complejo al igual que U4; a partir de esto las endonucleas cortan los extremos y la
ligasa une los exones.

Existe algo conocido como splicing alternativo, en donde se incluye o se excluye en el ARNm
madura una parte de el pre-mRNA, esto contribuye a la diversidad de las proteínas, dentro de
estas alteraciones se puede encontrar: saltar exón, retener intron, introducir un sitio alternativo
de corte en 5´o 3´, mezcla de exones de diferentes genes(trans splicing), seleccionar promotor
alternativo, seleccionar un sitio poli-a alternativo.

Ejemplos de splicing alternativo: Poliproteína B 100(hígado), poliproteina b 48(Intestino) tienen

diferente función; Hemoglobina y mioglobina; el splicing alternativa también puede servir de
regulación ya que una isoforma puede ser un control negativo mientras que otra uno positivo.
Cuando se termina la maduración la CAP y la cola poli a sirven de señal para indicar a las
exportinas que el ARNm esta maduro y puede salir a ser traducido. Los demás ARNs maduros
también salen del núcleo.

El corte y empalme de los intrones se puede dar de manera espontanea(actividad catalítica ARN)

Traducción

La traducción es el proceso que permite el cambio de lenguaje nucleotidico a lenguaje

aminoácido, ya que se sintetiza una proteína a partir de un ARNm maduro.

En este proceso se relacionan los tres tipos de ARN.

La traducción requiere: Código genético, Ribosoma y ARNt.

El código genético es aquel por el cual a partir de 3 nucleótidos(Codones) se codifica un

aminoácido, existen 64 combinaciones de las 3 codones de parada que no codifican para ningún
aminoácido. El código es universal ya que es el mismo para todas las especies, es degenerado ya
que mas de un codón codifica para un mismo aminoácido, no es ambiguo ya que cada codón
codifica su aminoácido especifico y no otro, es lineal, es ordenado y no es sobrelapante.

Los ARNt tienen una forma de trébol debido a sitios de complementariedad tienen una CCA en el
extremo 3´que reconoce el aminoácido, y tiene el anticodón que se unirá al codón. En ocasiones la
ultima base del anticodon es reemplazada por inosina que va a reconocer C U o A permitiendo que
un transfer reconozca 3 codones diferentes.Existen 20 tipos de ARNt, uno para cada aminoácido.
La función del transfer será reconocer el codón del ARNm y llevar el aminoácido correspondiente a
este codón. En la traducción los aminoácidos deben activarse, esto se da gracias a la aminoacil
ARNt-sintetasa que va a unir el aminoácido a su respectivo transfer mediante un enlace eter. La
función del transfer va a ser la de transportar el aminoácido y reconocer el anticodon.

Los ribosomas se componen de dos subunidades(mayor y menor) en eucariotas va a ser 60S(28S,

5S, 5.8S + 49 proteínas) y 40S(18S + 33 proteínas); en procariotas 50S(5S + 23S + 34 proteínas) y
30S(16S + 21 proteínas), estos van a ser el lugar donde se realiza la transcripción ya que se unen al
ARNm y tienes sitios a donde se unen transfers que van a sintetizar el polipéptido. Los ribosomas
están compuestos por ARNr y proteínas, se cree que la formación del enlace péptido en la síntesis
de proteínas esta dada por actividad catalítica del ARN y no de las proteínas. In vitro, los ARNr son
capaces de autoensamblarse. El ribosoma va a tener tres puntos principales A(aminoacil) E(exit) y
P(peptidil), el primer transfer va a llegar a P sin embargo los demás transfers van a llegar a A. Las
dos subunidades ribosomales únicamente estarán juntadas durante la traducción.

La traducción se da en sentido 5´-3´ y el polipéptido se sintetiza del extremo amino terminal al

carboxilo terminal, esta se divide en 3 pasos: iniciación, elongación y terminación. En eucariotas la
traducción es monocistronica(un solo polipéptido) mientras que en procariotas será
policistronica(varios polipéptidos a partir del mismo mRNA.
El ARNm estará compuesto de una región 5´UTR que no codifica y de una región 3´UTR que
tampoco codifica, en las procariotas habrá una secuencia de iniciación llamada Shine-Delgarno o
SSD, esta precede al codón de iniciación y es reconocida por la subunidad menor del ribosoma; por
otro lado en eucariotas la subunidad menor reconocerá a CAP y luego habrá una secuencia
denominada KOSAK que incluirá al codón de iniciación(AUG).

En la iniciación de procariotas la SSD es reconocida por el ribosoma que posee una secuencia
complementaria a SSD, esta subunidad estará asociada a los factor IF3 e IF1posteriormente el
ARNt con la N-formilmetionina junto con IF2(unido a GTP) se unen al complejo; IF3 e IF1 se liberan
dando paso a la union de la subunidad mayor que generara la hidrolisis de GTP y por ende la
separación de IF2.

En eucariotas la iniciación se da cuando la se forma un complejo donde 40S junto con eIF5, e IF1,
eIF1A y eIF3 se une al metionil ARNt junto con eIF2(unido a GTP), posteriormente el ARNm es
llevado hasta este complejo por eIF4G, eIF4E, eIF4A y eIF4B. A partir de la formación del complejo
se reconoce el codón de iniciación que genera que eIF5 hidrolice el GTP liberando todos los
factores y permitiendo la unión de 60S. eIF4E reconoce CAP mientras que eI4FG reconoce la PABP
y por ende la cola poli-a.

Antes de la unión de la subunidad mayor en eucariotas se da un proceso de circularizacion del ARN

en el cual se verifica el CAP la cola Poli-a y que no hayan codones STOP prematuros(diferencia
clave eucariotas y procariotas)

La elongación es igual para procariotas y eucariotas, la única diferencia que se presenta se debe a
la diferencia en los factores de transcripción, ya que la encargada de llevar el aminoacil ARNt al
sitio A va a ser EF-Tu en procariotas y eEF-1alfa en eucariotas, ambos factores asociados a GTP; la
translocación e procariotas requiere de EF-G mientras que en eucariotas requiere de eEF-2
también acoplados a GTP; La fosforilacion del GDP del primer factor(GDP debido a que ya ha sido
utilizado) se da porEF-Ts en procariotas y eEF-1betagamma.

En la elongación el primer paso va a ser la unión de ARNt aminaciol al sitio A del aminoácido,
posteriormente la subunidad mayor del ribosoma cataliza la formación del enlace peptídico que
une la metionina(eucariota) o N-formilmetionina(procariota) al siguiente aminoácido, dejando dos
aminoácidos pegados al ARNt en A y un ARNt libre en P, en este momento se da la translocación,
donde el ribosoma se corre 3 nucleótidos hacia 3´y el ARNt libre pasa a E mientras que el ARNt con
el polipéptido pasa a P, en este momento un nuevo transfer se une a A induciendo la liberación del
ARNt libre en E, y asi se repite el ciclo hasta la terminación.

En la terminación, se llega a un codón de parada(UAA, UAG, UGA) el cual es reconocido por

factores de liberación; en el caso de las procariotas RF1 va a reconocer a UAA y UAG mientras que
RF2 va a reconocer a UGA, además el RF3 separa a RF1 y RF2 del ribosoma y el RRF separa las
subunidades ribosomales; en eucariotas eRF1 reconoce a los tres codones de parada. Con estos
factores se da la hidrolisis del enlace entre el ARNt y el polipéptido por el extremo carboxilo,
también hay una desfosforilación que inducirá la separación del ribosoma y de los factores.
Hay varios tipos de mutaciones las missense(cambio puntual), las nonsense(codón de terminación
prematuro) y las de marco de lectura o outframe(se lee el RNA desde donde no es)

Núcleo y Ribosomas

El núcleo es el lugar donde se almacena la información genética, su tamaño varía entre 3 y 14um,
su localización no es específica para las células, está compuesto por una membrana interna, una
membrana externa, un espacio perinuclear(espacio intermembranal), lamina nuclear, cromatina,
nucléolo, nucleoplasma o carioplasma, y poros nucleares. Sus funciones son: almacenar
información genética, duplicar el ADN y ensamblarlo con proteínas, transcribir los genes de ARN y
procesarlos, dirigir las actividades citoplasmáticas a través de la expresión de los genes, y la
producción de subunidades ribosomales.

Los complejos de poro(CPN) están compuestos por 8 anillos ensamblas alrededor de un canal
central y tienen 30 veces el tamaño de un ribosoma, las proteínas que lo componen se denominan
proteínas NUP: Los filamentos citoplasmáticos cubren la entrada del poro, en el exterior se
encontrara el ensamblaje radio anillo citoplasmático, en el interior habrá un anillo nuclear y una
cesta nuclear.

La membrana interna y externa tienen la misma permeabilidad(solo pasan pequeñas moléculas

apolares) las moléculas que no puedan pasar por difusión simple tendrán que pasar por los poros
nucleares sea por transporte activo o por transporte pasivo. La membrana externa además va a
estar unida al RE por lo cual su conformación será similar(ribosomas pegados a ella).

El transporte en el núcleo es realizado por las cariofelinas(importinas y exportinas) asociadas con

Ran GTP(salida) o Ran GDP(entrada); es importante tener en cuenta que deberán entrar al núcleo
un gran número de proteínas asociadas a la transcripción y maduración, mientras que lo mas
importante que ha de salir van a ser los diversos ARN maduros; además va a haber un gradiente
de Ran GTP y de Ran GDP, estando el GTP mas abundante en el interior y el GDP en el exterior.

En la importación es importante tener en cuenta que la importina posee una subunidad alfa que
es la mas pequeña y una beta, además de que las proteínas que van a entrar poseen una señal de
localización nuclear(NLS) compuesta por Lys y Arg, se puede dar de manera lineal o de manera
bipartita(fragmentada). Lo primero que sucede es la unión de la importina(se une primero alfa),
esta importina va a estar asociada a RanGDP este complejo entrara al nucelo por transporte
pasivo, dentro del núcleo la RAN GEF va a fosforilar el GDP lo cual generara la separación de las
subunidades de la importina liberando al proteína en el interior del núcleo, después de esto la
subunidad alfa saldrá del nuclea sin gasto de energía mientras que la subunidad beta sale gracias a
su asociación con RANGTP, en el exterior el Ran GTP se hidroliza generando la separación de beta
y Ran.

En la exportación lo que se va a exportar tendrá una señal de exportación nuclear(NES), en este

caso el sustrato se unirá a la exportina que estará asociada a Ran GTP, saldrá todo el complejo por
difusión simple y afuera la Ran GAP hidrolizara el GTP generando que la exportina libere lo que
exporto, la exportina junto con Ran GDP entrara al núcleo nuevamente.

La cromatina es la asociación de ADN con proteínas(histonas), en la célula no mitótica esta se

divide en eucromatina(ADN que se transcribe por ende menos empaquetado) y
heterocromatina(ADN que no se transcribe por ende más empaquetado), además esta última se
puede dividir en facultativa(no codifica en esa célula pero en otras si) y en constitutiva(no codifica
en ninguna célula). La cromatina además se puede clasificar con base en su nivel de
empaquetamiento estando así los nucleosomas(histonas con ADN unidas por linkers),
solenoides(unión cadena de nucleosomas), rosetones, espiral de rosetones y cromosomas, siendo
estos últimos los presentes en la célula mitótica. Hay 140 pares de bases enrolladas alrededor de
una histona.

La lámina nuclear es un conjunto de proteínas que se unen tanto a la membrana nuclear interna
como a la cromatina, esta está compuesta por filamentos intermedios de lámina A, B1, B2 y C. Las
láminas tienen una cabeza un cuerpo y una cola, estas se unirán enrolándose en el cuerpo(alfa
hélices) formando un dímero o bobina en la cual la cabeza de una se une con la lámina de la otra,
los polímeros se unen uno con otro formando polímeros, y los polímeros se superponen formando
los filamentos.

Hay patologías asociadas a fallas en la lámina nuclear, de la más conocidas es la progeria en la cual
se cambia C por T en el nucleótido 1824 generando que parte del exón 11 se considere como
intron, formando una proteína mas pequeña que no se va a poder unir correctamente a la
membrana nuclear, sea porque no se le unió el grupo farmecilo, porque no se metila o porque no
pierde una secuencia que debe perder, esto genera un envejecimiento prematura de todo el
organismo.

Los ribosomas están presentes en la mayoría de las células(no en glóbulos rojos) y se encuentran
en la membrana externa nuclear, en el RER, en el citoplasma(libres) en las mitocondrias y en los
cloroplastos, su traducción y maduración se da en un lugar del núcleo conocido como el nucléolo.

El nucléolo es una zona del núcleo cuyo tamaño es variable entre diferentes tejidos, en este lugar
se encuentran los genes que codifican para los ARNr 5.8S, 28S y 18S en forma de un precursor
grande 45S, a partir de unas modificaciones que también se dan en el nucléolo donde se escinde
este precursor dando paso a las subunidades(esto gracias a las RNPsno) las cuales se asociaran con
proteínas formando las subunidades(el proceso de unión a proteínas continua fuera del núcleo),
además también en el núcleo se cambia la uridina por pseudouridina y se metilan unas ribosas. El
nucléolo se puede dividir en tres zonas, el centro fibrilar(CF) donde van a estar los elementos
necesarios para la traducción de los ARNr(genes, ARN polimerasa I, ADN topoisomerasa I, factor
UBF), el componente fibrilar denso(CFD) donde se va a dar las cadenas hibridas de ARN y ADN y
una gran precensia de fibrilarina(encargada de la metilación de ribosas), y el componente
granular(CG) donde se va a dar la maduración y posterior exportación del ARNr junto con
proteínas, además habrá fosfoproteínas(B23 y NOP 52) que participan en la biogénesis de los
ribosomas.
Además de síntesis y maduración de ARNr, el nucléolo también tiene otras funciones como la
modificación de ARNs pequeños, participa en el transporte de ARNms, sintetiza las proteínas
encargadas del transporte de ARN viral al núcleo(REV, REX, B23, ORF57 etc..), sintetiza la RPS que
lleva los péptidos al RE, almacena proteínas relacionas con el ciclo celular(Cdc14) y con la
degradación de proteínas(Ubiquitin ligasas como MDMe y VHL), participa en la reparación del
ADN(CSB), el ensamblaje de ribonucleoproteinas, el reclutamiento de proteínas reguladoras y el
control del envejecimiento celular.

Se dice que la transcripción ocurre tanto en CF como en el CFD, el corte por RNPs y ciertas
modificaciones de la maduración se da en CFD, y en CG se termina la maduración

En las levaduras se habla de una regulación en el envejecimiento por parte del nucléolo se dice
que favorece la longevidad cuando hay presencia de la proteína SGS1(helicasa), cuando esta está
presente, no se forman círculos de ADN extra-cromosómicos(CEC), y cuando las proteínas SIR se
distribuyen desde los telomeros y los sitios HM al nucléolo inhibiendo la transcripción de ARNr
mutados. Por otro lado, se favorece el envejecimiento cuando la SGS1 falta o es ineficiente lo cual
genera una gran formación de CECs, y cuando los complejos SIR no inhiben la expresión de copias
de ARNr dañado.

En humanos se habla de regulación del envejecimiento en el nucléolo debido a su relación con

dos proteínas principalmente la WRN y la p53, en el caso de la primera proteína esta tiene
actividad de helicasa y se asocia con dos sub-unidades de la ADN polimerasa beta(P50 y P125) con
los que forma un complejo que entran al nucléolo promoviendo la correcta transcripción del ARNr,
cuando hay una mutación en WRN(Síndrome de Werner) esta no se puede asociar a las
subunidades y no entra al nucléolo generan una menor transcripción de ARNr, y favoreciendo la
inestabilidad genómica y las mutaciones ya que se conoce que WRN participa en la reparación.

Por otro lado también se habla de regulación del envejecimiento pro parte del nucléolo debido a
su regulación sobre la p53, esta proteína está directamente relacionada directamente relacionada
con el arresto del ciclo celular, reducción de proliferación de canceres, en la apoptosis y en el
envejecimiento replicativo celular. Cuando la p53 es baja se favorece la longevidad, cuando su
actividad es alta se favorece el envejecimiento prematuro. En los humanos P14ARF se encuentra en
el nucléolo asociada a B23, mientras que en el citoplasma actúa la MDM2(ubiquitin ligasa)
favoreciendo la degradación de la p%# manteniéndola en niveles bajos, cuando hay estrés celular
el nucléolo se desintegra generando que B23 y P14ARF no se asocien, P14ARF se dirige al citoplasma
inhibiendo la MDM2 elevando los niveles de p53, además la B23 se asocia a p53 estabilizándola,
todo esto favorece el envejecimiento.

Se ha demostrado que la p53 se asocia a la WRN participando en la transcripción, por esto cuando
una de estas falla se favorece la inestabilidad genómica y por ende la formación de cáncer, por
otro lado si p53 se reduce se favorece la longevidad, mientras que si WRN se reduce se favorece el
envejecimiento.
Finalmente, se habla de regulación del envejecimiento por parte del nucléolo debido a su
participación en la biogénesis, actividad y tráfico intranuclear de la telomerasa, la cual es una
enzima(ribonucleoproteina con actividad de transcriptasa reversa) que favorece a la longevidad
reduciendo el corte de telomeros(extremos de los cromosomas) durante la transcripción esto
debido a que se ha asociado este corte de los extremos con el envejecimiento. Esta enzima es un
complejo compuesto por múltiples componentes de los cuales varios tienen localización
nucleolar(ARN y subunidad catalítica), además de poseer un dominio H/ACA(característico de lo
ARNs pequeños que se dan en el nucléolo) por lo cual parte del ensamblaje de este complejo se
debe realizar en el nucléolo.

Retículo Endoplasmático

El retículo endoplasmático se puede dividir en rugoso(RER) y liso(REL), estos difieren

principalmente en la presencia de ribosomas en la membrana del RER mientras que en el RL no los
hay, además también difieren en tamaño(RER es más grande). El retículo en general es el organelo
más grande de la célula y el más membranoso, la membrana de este organelo forma una red de
túbulos y cisternas. En microfotografía el RER esta pegado al nucelo y tiene punticos negros,
mientras que el REL será un organelo de membranas distribuidas aletoriamente.

La función del RER va a ser el plegamiento y ensamblaje de proteínas, las modificaciones que se
van a realizar son principalmente 2: N-glicosilación y formación de puentes di-sulfuro.

Las proteínas que se sintetizan en el RER van para la membrana plasmática, vesículas excretoras o
lisosomas, mientras que las que se sintetizas en ribosomas libres van para mitocondria,
cloroplasto, núcleo o peroxisoma. Las proteínas que van al RER pueden ir de manera
cotraduccional o post-traduccional, en cualquiera de los casos habrá un péptido señal(primeros
20-25 aminoácidos) que indicara que la proteína debe ir al RER.

En el caso de la vía cotraduccional cuando se sintetiza el péptido señal, que en este caso es
hidrófobo, la partícula de reconocimiento de la péptido señal(PRS) se va a unir tanto al péptido
como al ribosoma y va a detener la traducción, después de esto lleva todo el complejo al RER
donde un receptor reconoce a la PRS, con este reconocimiento la PRS se suelta y el péptido señal
se une al interior del traslocon(canal del RER) que esta formado por el complejo SEC61, en este
momento se reinicia la traducción y las chaperonas BIP jalan la proteína a la luz del RER,
finalmente la peptidasa señal corta el péptido señal liberando la proteína.

En el caso de la vía post-traduccional lo que sucede es que se sintetiza toda la proteína que es
recogida por las chaperonas HSP70 citosolicas las cuales impiden que esta pliegue y la llevan en su
forma primaria al traslocon, donde SEC62/63 que es acompañante de SEC61 va a reconocer el
péptido señal, el péptido va a entrar por el traslocon y BIP lo jala al interior, finalmente la
peptidasa señal corta el péptido señal. Es importante tener en cuenta que BIP hace parte de la
familia de las HSP70.
La N-glicolisacion consiste en la formación de una glicoproteína, en este caso hay un polisacárido
de 14 azucares(2 N-acetilglucosaminas, 9 manosas y 3 glucosas) unido a un lípido de la membrana
llamado dolicol mediante 2 fosfatos, el sacárido se corta(no el fosfato) y se transfiere a una
asparragina(Asn) gracias a una oligosacárido transferasa, cuando esto sucede empieza un proceso
de modificación donde se van a quitar 3 glucosas y una manosa generando que el glúcido sea de
10 monómeros.

La formación de puentes disulfuro se da en el RER debido a que en el citosol los residuos de

cisteína permanecen reducidos dificultando la formación de estos enlaces, esta formación en el
RER se da gracias a la disulfuro isomerasa la cual va a modificar la organización de estos enlaces
colocando frente a frente los que se necesitan, para esto va a tener la proteína un residuo cisteína
que forma puentes disulfuro con el polipéptido mientras reacomoda el mismo.

Existe otra posibilidad en cuanto a las proteínas y va a ser que estas deban internalizarse en la
membrana del retículo esto se puede dar de 3 formas, la primera va a ser que haya una señal que
reconoce el translocon por ende este se cierra generando que el resto de la proteína se sintetice
en el citosol y finalmente se corta la péptido señal y la proteína se internaliza en la membrana; la
otra posibilidad va a ser que la secuencia señal sea la misma péptido señal o cercana y por ende no
haya escisión y esta se internalice a la membrana; por último, cuando la proteína debe atravesar
varias veces la membrana habrán varias señales que reconoce el translocon formando bucles.

El estrés en el retículo se presenta cuando hay acumulación de proteínas mal plegadas, es decir
hay un desequilibrio entre las proteínas mal plegadas y el número de chaperonas, ante esto se
genera una respuesta conocida como UPR, en esta se va a producir una señal(BIPGRP78) la cual va
a tener tres receptores que actuaran de diferentes maneras. El primer receptor es PERK que se va
a dimerizar y a activar ATF4 que es un factor de transcripción de proteínas de la UPR y va a activar
a eIF2alfa que va a reducir la transcripción; el segundo receptor es ATF6, el cual va a liberar parte
de su estructura y entrara al núcleo activando genes de UPR; el tercer receptor es IRE1alfa que se
dimeriza y va a activar a XBP1 y HAC que son factores de transcripción de UPR.

El RER tiene un control de calidad, en este la calreticulina o la calnexina van a revisar la N-

glicosilación, estas proteínas se pegan cuando se han quitado 2 glucosas y verifica que sea correcto
el plegamiento, en caso de no ser así la UDP glucosil transferasa vuelve a pegar las dos glucosas y
la proteína vuelve a modificarse, si después de varios ciclos sigue estando mal plegada se dejan
solo las 2 N-acetilglucosaminas que indican que la proteína debe ubiquitinarse y enviarse al
proteozoma.

El REL cumple cuatro funciones principales, La síntesis de lípidos, la detoxificacion(volver

sustancias toxicas solubles para que se eliminen por la orina), la gluconeogénesis y la reserva de
calcio(sirve para apoptosis).

El REL va a sintetizar el colesterol y sus derivados, la ceramida, y tres fosfolípidos, para la síntesis
de fosfolípidos el glicerol 3 fosfato se esterifica con un acido graso que trae CoA formando el acido
fosfatidico, a partir de este se sintetiza el fosfatidilnositol o se desfosforila formando diacilglicerol
a partir del cual se sintetiza la fosfatidilserina, la fosfatidilcolina y la fosfatidiletanolamina. Todo
esto sucede en la cara citosolica del REL, debido a esto es necesario el uso de las flipasas para
pasar estos fosfolípidos a la cara del lumen también.(las flopasas sirven para realizar lo contrario.)

Aparato de Golgi

Este organelo es un conjunto de sacos aplanados(cisternas) y vesículas asociadas, estas cisternas

se pueden dividir en tres zonas, la cis(cóncava), la medial y la trans(convexa), siendo la cis la que
apunta hacia el RER y la trans la que apunta hacia la membrana plasmática. Golgi y RER no están
unidos físicamente, las proteínas se transportan a través de vesículas. En microfotografía será un
organelo membraneso con cara convexca y cóncava mas pequeño que el retículo y mass alejado
del nucleo.

Golgi tiene varias funciones regular la vía secretora, modificación de proteínas, síntesis de
glucolipidos y esfingomielina.

La organización de Golgi se da debido a que unos sáculos se apilan(dictiosomas), y va a tener

vesículas asociadas tanto en la cara cis(transición) como en la trans(secreción).

En la cara cis se van a fosforilar las manosas, y se van a remover manosas, en la medial se
remueven manosas y se agregan residuos de N-acetilglucosamina y en la trans se va a añadir
galactosa y residuos de ácido siálico.

La proteínas que tengan manosa-6-fosfato van a ir al lisosoma, las que tengan ácido siálico irán a la
membrana, las demás irán a vesículas excretoras.

Las enzimas en Golgi que quitan glúcidos se llaman glucosidasas, mientras que las que añaden se
denominan glucosiltransferasas.

La modificación de proteína que van al lisosoma ocurre de la siguiente manera: Llega la

glicoproteína del RER, la N-acetilglucosamina transferasa va a poner una N-acetilglucosamina y un
fosfato en la manosa a partir de una UDP-N-acetilglucosamina formando UMP, posteriormente se
quita la N-acetilglucosamina quedando solo el fosfato en la manosa 6. Todo este procesos ocurre
en la cara CIS, después de esto la proteína es reconocida por un receptor de manosa6fosfato que
va a generar una vesícula cubierta de clatrina indicando que debe ir al lisosoma.

La modificación de las proteínas de membrana se da inicialmente por la remoción de 3 manosas,

posteriomente se añade una N-acetilglucosamina, despues se remueven 2 manosas más, además
se agrega 1 fucosa y 2 N-acetilglucosaminas mas, posteriormente se añaden 3 galactosas, sobre los
residuos de N-acetilglucosaminas, a las cuales se van a unir 3 acidos siálicos.

La O glicosilacion en Golgi consiste en la adicion de glúcidos a resiudos de serina treonina. La

síntesis de glicolipidos se va a dar a partir de la ceramida(proveniente del REL) la cual se puede
hidrolizar perdiendo un H y uniéndose a un glúcido, o se puede unir a una fosforilcolina formando
esfingomielina.
La síntesis de los glucolipidos se da en la cara citosolica de Golgi, para esto debe sacarse la
ceramida que esta dentro del mismo.

La cobertura de vesículas por COPII indica que deben ir a Golgi, mientras que el cubrimiento por
COPI indica que de ir al RE.

Lisosomas

Es el lugar de degradación de la célula, tiene un pH acido(5) y esta lleno de hidrolasas acidas que
se envían desde Golgi por vesículas, el pH se da gracias a la presencia de bombas de protones(usan
ATP) las cuales dan ingreso a los protones cuando las enzimas necesitan activarse. Las hidrolasas
no trabajan a pH 7. En microfotografía será una pepa negra.

La formación del lisosoma se da mediante los siguientes pasos, se endocita una

sustancia(endosoma primario o temprano) que posteriormente va a ser el endosoma secundario o
tardio: Las hidrolasas acidas salen de Golgi en una vesícula(lisosoma primario) que se fusiona con
el endosoma secundario generando el lisosoma secundario que va a ser el lisosoma como tal.

Al lisosoma puede llegar el fagosoma(Vesícula generada por fagocitosis) o el

autofagosoma(autofagia). La fagocitos traerá partículas grandes y la endocitosis pequeñas, la
autofagia será la degradación de organelos de la célula que se envuelven en una membrana
proveniente del RE.

Las enfermedades relacionadas al lisosoma generalmente son afecciones en los genes de las
enzimas de este organelo, por lo cual se genera una acumulación de sustrato en el lisosoma, por
ejemplo la enfermedad de gaucher genera la acumulación de glicolipidos; sin embargo existen
otros caso como la enfermedad celular-I que afecta la fosforilacion de la manosa en cis por lo cual
als proteínas no se marcan para ir al lisosoma.

Peroxisoma

Es un organelo que en microfotografías será una pepa negra. Posee menos enzimas que el
lisosoma y va a tener muchas enzimas asociadas a reacciones metabólicas en su membrana. La
enzima principal del peroxisoma va a ser la peroxidasa o catalasa(se dividen en Per1 y Per2) que
transformará peróxido de hidrogeno en agua más oxígeno, o lo convertirán en agua acoplándolo a
otra reacción redox. Sus funciones son descomponer radicales libres de oxigeno(como el H2O2),
síntesis de colesterol y dolicol, síntesis de ácidos biliares(a partir del colesterol), síntesis de
plasmalógenos(Fosfolípidos presentes en corazón y cerebro), beta-oxidación de ácidos grasos, la
oxidación del etanol y catabolismo de poliaminas

En las plantas además de lo mencionado anteriormente el peroxisoma se encarga del ciclo de

glioxilato(análogo al ciclo de Krebs) y en la fotorespiración(uso de oxígeno en la planta).

La formación del peroxisoma se da gracias a la membrana del RE en la cual se sintetizas las

proteínas de membrana del peroxisoma que se van a ir en la formación del mismo. Además las
enzimas que el peroxisoma posee se sintetizan en ribosomas libres y entran al organelo; cuando
muchas proteínas han entrado el peroxisoma es capaz de dividirse formando un nuevo
peroxisoma. La adición de fosfolípidos al peroxisoma se da mediante el uso de las proteínas
transferencia de fosfolípidos que los pasan del RE al peroxisoma.

Ácidos Nucleicos

Los nucleótidos se componen de un azúcar, una base nitrogenada un grupo fosfato, los
nucleosidos no tendrán el fosfato pero si los otros dos elementos. Estos son los monómeros de los
ácidos nucleicos ADN y ARN que son de vital importancia en el cuerpo.

Las bases nitrogenadas se dividen en purinas(Guanina y Adenina) y en pirimidinas(Uracilo, Timina,

Citosina), las cuales tienen 2 anillos y uno en su estructura respectivamente.

Los nucleótidos de una misma cadena se unen entre si mediante un enlace fosfodiester entre el
grupo fosfato y el OH del azúcar, esto en sentido 5´-3´, los nucleótidos de cadenas diferentes se
van a unir entre si mediante los puentes de hidrogeno que se forman entre las bases(2 entre A y T
y 3 entre G y C) y entre relaciones hidrofilicas. La cadena en su extremo 5´siempre tendrá un grupo
fosfato terminal, mientras que en 3´tendra un grupo OH terminal.

Las funciones del ADN van a ser de conservación genética(protección bases nitrogenadas por
empaquetamiento) y la transmisión de la información genética(replicación).

El ADN se va a asociar a proteínas(histonas) debido a que el esqueleto azúcar fosfato es negativo y

las histonas tendrán histidina que estará cargada positivamente.

Se puede hablar de varios niveles estructurales en el ADN: una cadena, cadenas complementarias,
asociación a proteínas(nucleosomas) asociación de nucleosomas(niveles superiores de cromatina).

Hay varias conformaciones helicoidales(A, B y Z, siendo B la más estable) la A se da cuando hay

poca agua, y Z un caso extraño ya que se da un giro levógiro(generalmente es dextrógiro) esta
forma incide en la regulación de la transcripción.

La función del ARN va a ser sintetizar proteínas, el ARNm va a tener la CAP el codón de iniciación,
los demás codones y el codón de terminación que no codifica. El ARNt va a tener varios brazos
compuestos por tallos y asas o bucles(los tallos es donde hay complementariedad, las asas son las
bolitas donde no hay complementariedad), el brazo aminoacil(unión del aminoácido), el brazo
anticodon(reconocimiento codón) el brazo D(tiene dihidrouracilo, unión a la aminoacil ARNt
sintetasa) y el brazo TYC (tiene pseudouridina, unión a la parte 5S de la subunidad mayor del
ribosoma). El ARNr va a tener varias subunidades (28, 5.8 5 y 18) que formaran la subunidad
mayor y menor del ribosoma, la menor reconocerá la CAP, la mayor albergara los ARNt.

Habrán otros nucleótidos que tendrán diferentes funciones en el cuerpo como el ATP y el GTP al
ser monedas energéticas, o el AMPc al ser parte de la señalización celular, o los nucleótidos de
adenina que forman parte de coenzima como CoA NAD y FAD.
Ley de Nernst

Ley que permite establecer el potencial de reposo especifico de un ion en una membrana donde
hay intercambio de solutos. Hablamos de potencial de reposo cuando el flujo másico es igual al
flujo iónico. El transporte másico es le de partículas no cargadas(Na, Cl); el transporte iónico es el
de partículas cargadas(iones).

En las células el pontecial de reposo tiene un valor típico de -65mV(en realidad es un rango entre -
40 y -80), sin embargo en la transmisión del impulso nervioso este se altera llegando a valor de
+60mV, -30mV y -90mV.

En este tema hay tres ecuaciones importantes

𝑅𝑇 𝐶𝑒
𝐸= ∗ ln⁡( ) donde R es la constante universal de los gases(8,318 J/mol*K), F es la constante de
𝑍𝐹 𝐶𝑖
Faraday(96500C/mol), Z es la velencia del ion(carga), Ce es la concentración externa y Ci es la
concentración interna.
𝐾𝐵 𝑇 𝐶𝑒
𝐸= ∗ ln⁡( ) donde Kb es la constan de boltzman(1,38*10-23), T es la temperatura, Z es la
𝑍𝑞 𝐶𝑖
valencia y q es la carga del electrón(1,602*10-14)

−58 𝐶𝑖
𝐸= 𝑙𝑜𝑔 esto para T=20°C.
𝑧 𝐶𝑒

Es importante tener en cuenta que voltios es igual a Joules/Coulumb

Modelo Eléctrico de la Membrana Celular

El potencial es el que se calcula mediante la ecuación de nernst se da en V o mV en el caso de la

membrana plasmática. La capacitancia(C) va a ser el mismo condensador(almacena carga
electirca), La resistencia(R) de da en ohmios y su inverso es la conductancia. La intensidad de
corriente(I) se mide en amperios y el flujo neto de carga(Q) se mide en amperios también.

La técnica de Patch Clamp(inventada por Neher y Sakmann) permite analizar un cultivo de células
en partes por millón, teniendo la posibilidad de medir la capacitancia, la resistencia, la corriente y
el potencial, un cambio en alguno de estos indicara una afección, por ejemplo un cambio en la
resistencia o un cambio en la conductancia.

La corriente eléctrica está asociada a cargas en movimiento se define como 𝐼 = 𝑄/𝑡 donde Q es el
el flujo neto de carga y t es el tiempo, el movimiento de estos iones requiere de un gradiente, es
decir una diferencia de potencial(dad por la diferencia de concentraciones de iones en el interior y
que genere un campo eléctrico que ira del mayor potencial al menor, generando que una carga
positiva se movilice en la dirección del campo, mientras que una negativa en dirección opuesta. En
las células en lugar de Amperios utilizamos pico amperios(1pA=10-12A).

En el condensador se puede medir el potencial mediante la siguiente ecuación: ∆𝑉 = 𝑄/𝐶 siendo

Q la carga y C la capacitancia, esta última es proporcional a la superficie celular, por lo cual un
aumento en esta indica un aumento en el tamaño de la célula. Con Path Clamp podemos hallar C y
V por cual se puede hallar Q despejando. La membrana es análoga a el condensador en el modelo
eléctrico.

La resistencia va a ser análoga a los canales en el modelo, esta indicar la facilidad con la que pasan
los iones por el canal, en este caso el potencial va a dar mayor o menor especificidad al canal. Los
canales además de la resistencia tendrán también el potencial. El R no va a almacenar energía ya
que la disipa

La capacitancia será importante ya que se medirá para modelos de circuitos en serie y en paralelo,
1 1 1
la capacitancia se define como: 𝐶 = 𝑄/𝑉, en serie se puede decir que: = + , mientras que
𝐶𝑒𝑞 𝐶1 𝐶2
en paralelo se puede decir que: 𝐶𝑒𝑞 = 𝐶1 + 𝐶2, siendo los diferentes C las partes de membrana
que hay entre un canal y otro.

En una misma célula servirá un modelo eléctrico en serie, en células contiguas servirá un modelo
en paralelo, que sea en serie o en paralelo lo determina la igualdad de las concentraciones iónicas
internas y externas de las capacitancias, si en ambas tanto la interna como la externa es igual es en
serie, si solo en la externa es igual pero en la interna es diferente será en paralelo.

Enzimas y Vitaminas

Las enzimas son los principales biocatalizadores en el cuerpo, su función catalítica generalmente
se da por grupos proteicos a excepción de las ribozimas(catálisis por ácidos nucleicos). Su función
es acelerar las reacciones metabólicas en el cuerpo al disminuir la energía de activación (energía
mínima necesaria para llevar a cabo una reacción química), estas no hacen parte de los productos
ni de los reactivos, ni se ven modificadas por la reacción, simplemente ofrecen una ruta
metabólica alternativa.

Las enzimas son de vital importancia para el cuerpo, sin ellas no se podrían llevar a cabo gran
parte de las reacciones que ocurren en el cuerpo y otras tardarían mucho tiempo. La ausencia de
una o más enzimas puede llevar a diferentes patologías como la Hepatitis por la ausencia de
transaminasa, además la detección de enzimas también puede ayudar a detectar enfermedades
como el infarto del miocardio por enzimología.

La catálisis de una reacción por una encima tiene varias fases E + S, ES, EP y E + P, siendo E enzima,
S sustrato y P producto, los primeros dos son reversibles, pero los segundos son difícilmente
reversibles. La formación del complejo ES va a liberar energía por lo cual la gráfica de una reacción
catalizada por enzima no tendrá una única subida y una única bajada sino varias.

Las enzimas se pueden clasificar dependiendo de la reacción que catalizan en 6 grandes

categorías: Oxidoreductasas(Reacciones redox, utiliza coenzimas como Nad y FAD),
Transferasas(transfieren grupos funcionales de una molécula a otra, como la metilación o la
fosforilacion estará asociada a coenzima como el ATP o el GTP.), Hidrolasas(rompimiento de
enlaces mediante la adición de agua), Liasas(rompimiento de enlaces de uso de energía como C-C,
C-S o C-N), Isomerasas(Transformación de un isómero a otro), Ligasas(formación de enlaces entre
C, O, S y N, utiliza ATP).

Existen isoenzimas, esto es una misma enzima en diferentes tejidos en los cuales va a actuar de
manera diferente en cuanto a la cinética.

Existen complejos multienzimaticos cuando se deben dar reacciones en línea, los cuales permiten
una mayor eficiencia y rapidez en la catálisis de las reacciones, esto debido a que en el
metabolismo las reacciones son en cadena, es decir el producto de una reacción es el sustrato de
la reacción que sigue.

Las enzimas son específicas para su o sus sustratos, esta especificidad ha sido explicada por dos
modelos el llave cerradura(el sustrato encaja perfectamente en el sitio activo) y el modelo
inducido(el complejo ES se da por la modificación del sitio activo que permite catalizar la reacción)

Las enzimas se pueden ver afectadas por diferentes factores, en el caso de la temperatura su
aumento genera mayor energía cinética y por ende mayor cantidad de colisiones efectivas; sin
embargo la enzima tiene una temperatura óptima después de la cual se empieza a desnaturalizar
por la ruptura de interacciones débiles. En el pH la enzima tendrá un rango de pH optimo fuera de
este trabaja más lento y puede llegar incluso a desnaturalizarse debido a el cambio en las cargas
de los aminoácidos generando la perdida de puentes salinos principalmente. Aumentar la
concentración de la enzima genera un aumento lineal en la velocidad de reacción. Aumentar el
sustrato genera un aumento en la velocidad hasta un punto máximo en el cual se da la velocidad
máxima(punto en el cual todos los sitios activos están trabajando) esta no puede ser calculada por
lo cual se halla la Km(Concentración de sustrato a la cual se alcanza la velocidad semimaxima).

Además de la Km existe la Kcat que se relaciona con el número de sustrato convertido a producto
en una unidad de tiempo, mientras que la Km se relaciona con la afinidad de la enzima por el
sustrato(a mayor afinidad menor Km)

Las enzimas tienes varias formas de regulación fisiológica en el organismo, la principal es la

regulación aloesterica en la cual una sustancia orgánica puede actuar como activador(modulador
positivo) o como inhibidor(modulador negativo), la union de estos moduladores a un sitio distinto
al sitio activo(sitio aloesterico) genera un cambio en la conformación del sitio activo que aumenta
o disminuye la velocidad de reacción mas no la detiene, otro método es la modificación covalente
que se mediante la activación o inactivación de las enzimas mediante la adición de grupos fosfato
a serina o treonina en el sitio activo que altera la conformación del mismo. Además también
puede regularse la actividad por la expresión o inexpresión de lso genes que codifican para la
enzima.

Las enzimas también pueden regularse de manera no fisiológica, aquí habrá una inhibición
competitiva donde el inhibidor se une al sitio activo de la enzima afectan la Vmax y el Km, una
inhibición acompetitiva el inhibidor se une a la enzima€ en un lugar distinto al sitio activo y altera
la conformación de la enzima impidiendo la conversión de S a P, mas no la unión del sustrato a la
enzima, afectando únicamente la Vmax, también habrá la regulación no competitiva que se unirá
al complejo ES afectando la Vmax y la Km, por otro lado habrá una inhibición mixta que puede ser
acompetitiva o no competitiva, finalmente habrá una inhibición suicida en la cual el inhibidor se
camufla de sustrato, se une al sitio activo y este lo transforma en un producto que genera que la
proteína se rompa, un ejemplo de esta última es la pargilina que inhibe la mao
oxidasa(flavoproteina que degrada la penicilina). Es importante tener en cuenta que a diferencia
de la modulación aloesterica, la inhibición no solo va a acelerar o disminuir la velocidad de
reacción sino que puede llegar a detener la reacción.

Además de esto, en los inhibidores no fisiológicos existirán inhibidores reversibles(uniones

débiles) y inhibidores irreversibles(uniones covalentes), de estos últimos son ejemplo los ligandos
metales, los metales pesados, los organofosforicos y los reactivos de grupo sulfidrilo.

Los complejos ES y EI tendrán constantes de disociación Ks y Ki respectivamente.

Algunas enzimas van a requerir de otros elementos para poder trabajar, estos van a ser los
cofactores que pueden ser de tipo inorgánico o de tipo orgánico(coenzimas). Los cofactores
inorgánicos van a ser principalmente iones, mientras que los orgánicos van a ser generalmente
formas activas de las vitaminas. Sin estos cofactores la enzima no puede trabajar por lo cual son
esenciales. Lo que hacen estos facotres va a ser alterar la distribución de cargas, y en ocasiones
van a participar en la catálisis de la reacción.

Ejemplos de cofactores inorgánicos va a ser el hierro en la catalasa, el citocromo C y la

hemoglobina, además del calcio que participa en la contracción, en la coagulación y en la
señalización celular. Los cofactores inorgánicos pueden ser transitorios(uniones débiles) o
permanentes(uniones covalentes)

Cuando las coenzimas permanecen unidas a la proteína por enlaces covalentes(intraenzimaticas)

hablamos de grupos prostéticos, las demás coenzimas estarán unidad temporalmente por uniones
débiles(interenzimaticas).

Las coenzimas pueden ser hidrosolubles o liposolubles, dependiendo de la solubilidad de su

precursor biológico inactivo metabólicamente.

Dentro de las vitaminas hidrosolubles las de mayor importancia serán la Niacina o B3(NAD y
NADP), la riboflavina o B2(FADH y FMN) la tiamina o B1(PPT que transfiere grupos aldehídos), la
biotina o B8(Carboxibiocitina que participa en la carboxilacion) la piridoxina o B6(Fosfato de
piridoxal que participa en la transaminación), la cobalamina o B12(Deoxidenoasilcobalamina,
intercambio grupo alquilo), el ácido fólico o B9(Ácido dihidro o tetrahidrofolico, transferencia de
radicales metilo en la síntesis de nucleótidos), el ácido pantoténico o B5(CoAS que trasnfiere
radicales acetilo), y el ácido lipoico y vitamina C cuyas formas activas son aceptores o donantes de
electrones.
En las vitaminas liposolubles tenemos la A(Retinol, adaptación a la oscuridad, antioxidante) la
E(alfa-tocoferol, antioxidante), la D(Colecalciferol, Absorción calcio y fosfato, crecimiento
muscular) y la K(Naftoquinona, coagulación).

SNPs(Snips)

Los SNPs son los cambios en las bases nitrogenadas de los nucleótidos, cuando estos se
producen en una región codificante, es decir en un gen darán paso a los alelos(isoformas
de los genes).

El conjunto de alelos de un individuo es el haplotipo.

Le estudio de los SNPs y los haplotipos en la especie humana son de importancia ya que
estos son los que dan la variabilidad interindividual entre los individuos de las especies.

Para el estudio de estos es de vital importancia la descripción del genoma humano ya que
se puede identificar como estas variaciones causadas por los SNPs que generan los
alelos afectan los fenotipos o genotipos de la especie.

Para este estudio existe el uso de bases de datos como la SNP en ncbi o la SNPedia,
mediante la primera podemos encontrar cuantos alelos existen de un SNP, si esta en una
región codificante, si altera la conformación de la proteína, que codón afecta, que
aminoácido se cambia por cual y la importancia clínica de un SNP, y mediante la segunda
podemos encontrar que base se cambió por cual, y en que cromosoma se encuentra
ubicado el SNP, para esto es importante saber que los códigos de los SNP son como
este: rs1805007. Lo mencionado en este párrafo es en caso de buscar un SNP como tal,
si se busca un gen en la base de datos SNP de ncbi, se puede determinar cuantos SNPs
tiene un gen y a partir de estos encontrar la información mencionado anteriormente.
Mitocondria

Es el organelo encargado de producir la energía en la celular(a excepción de los eritrocitos que

carecen de este organelo) en forma de ATP, esto a través de la respiración celular que incluye el
ciclo de Krebs y la fosforilación oxidativa, para esto se requiere del acetyl CoA que entra al ciclo de
Krebs, el cual provenir de azucares(glicolisis en el citoplasma produce piruvato que es convertido
en Acetyl CoA al entrar a la mitocondria), aminoácidos(Ciclo de la Urea en la matriz) y lípidos(beta-
oxidación de ácidos grasos en la matriz).
Esta compuesta por una membrana externa, un espacio intermembranal, una membrana interna
que tiene pliegues(crestas) y la matriz mitocondrial.

En la membrana externa habrá una relación 60/40 de proteínas/lípidos, será muy permeable
debido a la presencia de canales no especifico(porinas), en esta membrana tendremos el 5% del
total de las proteínas mitocondriales, además de las porinas las proteínas que encontraremos aquí
son trasportadoras de electrones(reductasa NADH), enzimas degradadoras de lípidos(Acil CoA
sintetasa) y los Bcl-2(inhibidores que participan en apoptosis).

En la membrana interna la permeabilidad será mucho menor(es impermeable a iones), tendrá el

20% de las proteínas mitocondriales a además de una relación proteína/lípido de 80%/20%, no
tendrá colesterol sino cardiolipina(lípido anfipatico con 4 acidos grasos), en las proteínas de estas
membranas encontraremos el complejo TIM el translocon Oxa 1, y los complejos necesarios para
la fosforilación oxidativa.

En el espacio intermembranal tendremos el gradiente protónico, además del citocromo c, es

importante tener en cuenta que las condiciones de este espacio serán similares a las del
citoplasma debido a la permeabilidad de la membrana externa.

En la matriz mitocondrial tendremos el ADN mitocondrial(codifica para 2ARNr, 13 proteínas y para

22ARNt), los ribosomas 70S, proteínas generadas in situ o en al citoplasma en ribosomas libres,
además de las enzimas necesarias para llevar a cabo el ciclo de krebs, el ciclo de la urea, la beta-
oxidación(los ácidos graso se cortan de a 2) y la gluconeogénesis.

La renovación de los fosfolípidos se da por el intercambio del RE a la mitocondria a través de las

proteínas de transferencia de fosfolípidos las cuales van a transferir, fosfatidilcolina y la
fosfatidiletanolamina(a partir de la cual se sintetiza fosfatidilserina en la mitocondria)

En cuando al ADN mitocondrial es importante tener en cuenta que es pequeño en comparación

con el de las bacterias debido a que parte de este se incorpore en el ADN celular, codifica solo
22ARNt que dan abasto para la traducción debido a que la U en los anticodones va a poder
reconocer cualquiera de las 4 bases nitrogenadas. Además el código genético en la mitocondria
varia un poco. Las mutaciones en este generalmente se asocian a enfermedades
neurodegenerativas como la neuropatía óptica hereditaria de Leber. Además es importante saber
que el ADN mitocondrial se hereda exclusivamente de la madre.

La mitocondria da pruebas de la teoría endosimbiotica ya que se divide por fisión binaria, la

traducción y transcripción son simultaneas, tiene ADN circular, ribosomas 70S, doble membrana, y
tiene ADN polimerasas propias.

Las proteínas que van a la mitocondria se sintetizan en su mayoría en ribosomas libres

citoplasmáticos, algunas pocas se sintetizan al interior de la mitocondria, dependiendo del lugar a
donde tengan que ir(membrana externa, espacio intermembranal, membrana interna o matriz)
tendrán diferentes señales de reconocimiento.
Cuando la proteína va a la matriz tendrá una presecuencia(20-35 aminoácidos cargados
positivamente), la proteína es llevada por las HSP70 citosolicas hasta le complejo TOM(22,20,5 y
40, siendo esta ultima el canal como tal y las primeras tres las receptoras de la presecuencia), en el
espacio intermembranal las presecuensia(N-terminal) es reconocida por TOM22 y pasa al
complejo TIM(atraviesan a través de TIM23 gracias a su carga(positiva) que genera que se mueva a
favor del gradiente electroquímico) a medida que la proteína atraviesa TIM la presecuencia es
reconocida por TIM44 que esta asociado a una HSP70, esto en la matriz, que jala la proteína al
interior de la mitocondria donde una MPP escinde la presecuencia y donde la proteína es
procesada por HSP70 o HSP60 mitocondrial. Es importante saber que las chaperonas utilizan ATP
por lo cual para el transporte de proteínas se usa tanto ATP como un gradiente electroquímico.

Cuando deben internalizarse a la membrana interna o externa o deben permanecer en el espacio

intermembrana, hay dos posibilidades, al primera es que no tenga presecuencia, sino secuencias
de internalización razón por la cual cuando se va a internalizar en la membrana externa la
secuencia es reconocida por TOM70 y después se internalizan a la membrana o se translocon al
espacio intermebrana por TOM40, a partir de aquí pueden permanecer en el espacio o
internalizarse en la membrana interna para lo cual las Tiny Tims funcionan como chaperonas que
llevan la proteína a TIM54 que pasa el péptido al canal TIM22 en la cual la proteína se internaliza a
la membrana.

La segunda opción ocurre cuando la proteína tiene tanto presecuencia como secuencia de señal
interna, por lo cual son reconocidas por TOM 20 y TOM 22, posteriormente transferidas a TOM 40
donde se internalizan a la membrana o se translocan al espacio intermembrana donde puedne
permanecer o interaccionar con el canal TIM23 a través del cual atraviesas a la matriz donde son
procesadas para volver por el canal Oxa1 sea para internalizarse ne la membrana interna o para
permanecer en el espacio intermembranal.

Es importante tener en cuenta que los canales no son los que translocan las proteínas son las
chaperonas en todos los casos.

El proceso del ciclo de Krebs va a generar como productos CO2 y ATP que salen de la mitocondria,
y NADH y FADH que pasan a la cadena transportadora de electrones donde ocurre la fosforilacion
oxidativa, este proceso se da gracias a los 4 complejos y a la ATP sintasa que se encuentran en la
membrana interna, el complejo I recibe electrones de NADH los cuales a través de la coenzima
Q(ubiquinona) pasan al complejo III y de ahí al complejo IV mediante el citocromo C; el complejo II
recibe los electrones de FADH2, la coenzima q los pasa al complejo III y el citocromo C al complejo
IV. En el complejo IV los electrones son pasados al Oxigeno permitiendo la formación de agua.

Cuando los electrones se transportan a través de esta cadena generan que protones sean
bombeados a el espacio intermembranal, esto gracias al complejo I, III y IV, los dos primeros
transportan cuatro protones por cada par de electrones, mientras que el ultimo transporta 2 por
cada par de electrones a la vez que trasfiere 2 al oxigeno para formar agua.
Debido a la impermeabilidad de la membrana interna a los iones, los protones solo pueden volver
a la matriz mediante la ATP sintasa la cual se compone de dos subunidades F0 y F1, siendo la
primera la que atraviesa la membrana y la última presente en la matriz, ambas unidas por un
pequeño cuello. Atraves de la F0 los protones fluyen general la fuerza proton-motriz que genera la
rotación de F1 sintetizando ATP aparti de ADP y fosfato inorgánico.

La formación del gradiente de protones genera la formación de un gradiente electroquímico ya

que genera que el pH interno de la matriz sea 8 mientras que el del espacio sea 7, genera que el
espacio sea positivo en comparación con la matriz, razones por las cuales el ADP(menos negativo
que el ATP) entra y el ATP salga, al igual que permite la entrada de el fosfato inorgánico(en forma
de H2PO3-).

En general lo que sale de la mitocondria será CO2 producto de la descarboxilación oxidativa del
ciclo de Krebs, y ATP producto del ciclo de Krebs y de la fosforilacion oxidativa, mientras que lo
que va a entrar va a ser piruvato, ácidos grasos, aminoácidos, proteínas, ADP, P, y oxigeno.

Es importante saber que los procesos de fosforilacion y oxidación en la cadena transportadora de

electrones son separados ya que pueden haber casos donde ocurra la oxidación(paso de
electrones) mas no la fosforilacion(síntesis de ATP) como cuando se consume el tejido adiposo
pardo(presente en bebes y abuelos) en los cuales las termogeninas son los últimos aceptores de
protones en el espacio intermembranal generando calor únicamente. Además existirán
desacopladores(solo afectan uno de los dos procesos como el 2-4 dinitrofenol que afecta la
fosforilación) o inhibidores(afectan los dos procesos como el Cianuro).

Degradación de Proteínas

Hay dos tipos de degradación de proteínas, la proteólisis lisosomica y la ubquitin-proteasoma. La

primera consiste en la degradación de las proteínas por parte de la proteasas del lisosoma, por
esta vía pueden llegar moléculas de 4 formas, la primera es la heteroautofagia que consiste en la
degradación moléculas extracelulares(endocitosis), la macroautofagia que incluye la renovación de
organelos, la microautofagia en donde no hay vesícula sino que el lisosoma integra los péptidos a
degradar y la Autofagia mediada por chaperonas(CMA) donde las HSP70 reconocen la secuencia
KFERQ y llevan el péptido al lisosoma donde KFERQ es reconocido por el canal LAMP2A que
introduce el péptido al lisosoma. Todas estas vías de autofagia están reguladas por la
disponibilidad de nutrientes, aumenta la degradación de proteínas no esenciales cuando los nivel
de nutrientes son bajos.

LA vía de la ubquitin-proteasoma consiste en la adición de varias ubiquitinas a un péptido

señalándolo para su degradación en el proteasoma, esta vía permite la remoción de proteínas
endógenas(Factores de transcripción, ciclinas, proteínas virales o de parásitos y proteínas mal
plegadas) además de otorgar el control de calidad(RE), el control de procesos(transcripción y ciclo
celular) y la diferenciación y morfogénesis.
La ubuquitina es un polipéptido de 76aa presente en eucariotas, posee una estructura globular y
es ubicuo(está en todas partes de la célula) se une al polipéptido a través del grupo carboxilo
terminal de una glicina que posee, con el grupo amino terminal de una lisina del péptido que se va
a degradar, a partir de esta primera ubiquitina se pegan las demás en el proceso de
poliubiquitinación el cual se puede dividir en Lys48(una ubiquitina se pega a otra en el aminoácido
48 que es una lisina, es una señal para la degradación) y en lys63(indicia reparación del ADN).

También existe la multiubiquitinación(endocitosis) y la monoubiquitinación(Sirve para marcaje de

histonas y activación de señalización asociadas y degradación proteínas membrana en el lisosoma
o para activar rutas de señalización.

El proteasoma tiene un núcleo 20S(formado por cuatro anillos heptagonales, 2 alfa con función
estructural y 2 beta con función catalítica)y dos complejos 19S(cada uno formado por una base
con 10 proteínas reguladoras y 6 unfoldasas que despliegan el péptido antes de si entrada al
proteasoma mediante el uso de ATP(ATPasa) y por la cap con 9 proteínas para unirse a la proteína
ubiquitinada), el proteasoma estará presente en el citosol cerca del núcleo y de RER y en el núcleo
como tal. El proteasoma posee un sistema de destrucción reciclable.

Esta vía de degradación funciona así: cuando se la ubiquitincación del péptido este se une al
complejo 19S donde se une a los sitios de reconocimiento en cap liberándose la ubiquitina,
después de esto las unfoldas despliegan el péptido a medida que pasa por 19S, la proteína llega al
núcleo 20S donde hay ruptura de enlaces peptídicos por los anillos beta dando como resultado
péptidos de 8aminacidos.

La ubiquitinacion es el proceso mediante el cual se unen covalentemente moléculas de ubiquitina

a una proteína, de este proceso son participes tres grupos de enzimas las E1(activadoras de ub) las
E2(conjugación de ub) y las E3(ub ligasas) las cuales son dependientes de ATP.

Lo primero que sucede es la activación de la ubiquitina cuando esta se une a un grupo SH de

E1(aquí un ATP pasa a AMP + P +P), posteriormente la ubiquitina es transferida de E1 a un grupo
SH de E2, esta transferencia genera un cambio conformacional en E2 que permite su unión a E3,
con la formación de este complejo la E3 reconoce el degrón o caja de muerte de la proteína que se
piensa degradar, cuando se da el reconocimiento se transfiere la ubiquitina a la proteína la cual se
separa del complejo y se da paso a la poliubiquitinación. Generalmente la ubiquitina pasa de E2 a
E3 y este lo pasa a la proteína sustrato.

La ubiquitinación se puede regular de dos maneras, la primera es con la activación de la enzima E3

mediante la fosforilación, mediante modulación aloesterica por un ligando o mediante modulación
aloesterica por la adición otra proteína. La segunda se da con la modificación de la proteína
sustrato(la que se piensa degradar) generando que se exponga el degrón esto se puede dar
mediante la fosforilación, mediante la disocian de una proteína asociada que cubre el degron, o
mediante la desestabilización por la creación de un dominio N-terminal.

Replicación
Proceso a través del cual se duplica una sola vez toda la información genética, permitiendo la
transmisión de la información genética, la reproducción, el mantenimiento tisular, esto debido a
que es un proceso libre de errores, esto ultimo debido a que tiene una doble lectura(actividad
exonucleasa 3´-5´) y a que discrimina la incorporación de un nucleótido con una base diferente al
que debe unirse.

La replicación es un proceso semi-conservativo ya que a partir de una hebra parental se forma una
hebra hija. Para realizar este proceso se requiere una secuencia de origen, unos
dNTPs(Desoxinucleosidos 5´trifosfato), una serie de enzimas, proteínas adicionales y primers o
cebadores. Este proceso se caracteriza por tener un origen fijo, ser simultaneo, secuencial y
bidireccional. Se divide en iniciación elongación y terminación.

Para llevar a cabo este proceso se requiere de la acción de muchas enzimas, las principales son las
polimerasa de las que existen varios tipos, en procariotas la ADNpol I va a ser la encargada de
rellenar gaps y tendrá actividad de exonucleasa en sentí 5´-3´y 3´-5´; la ADN pol II Se va a encargar
de revisar y reparar además de tener actividad exonucleasa 3´-5´; la ADNpol III va a ser la
encargada de polimerizar y tendrá actividad exonucleasa en dirección 3´-5´. En eucariotas ADNpol
alfa estará en el primosoma(complejo encargado de colocar los primers, específicamente lo hace
una primasa, mientras que en procariotas la ARN primasa va a ser la encargada de colocar los
primers); la ADNpol delta se encargara de la polimerización y de rellenar gaps en la hebra
rezagada; la ADNpol épsilon polimerizara y rellenará gaps en la cadena continua; la ADNpol beta
se encargara de la reparación y la ADNpol gamma estará en la mitocondria; en el caso de
eucariotas todas las polimerasa tendrán actividad exonucleasa en dirección 3´-5´. Las proteínas de
unión al ADN monocatenario van a mantener la horquilla de replicación abierta al impedir que se
vuelva a enrollar en eucariotas estas proteínas serán las RPA mientras que en procariotas serán las
SSB. La helicasa será la que rompa los puentes de hidrogeno abriendo las horquillas de replicación,
y las ligasas serán las encargadas de unir los fragmentos de okasaki(enlace fosfodiester 3´-5´). Los
primers son removidos en eucariotas por las RNAasa H, mientras que en procariotas son la
RNAasaH y la ADNpol I. Habran topisomerasas(I y II) aliviando al tensión generada por al apertura
de la horquilla al generar la rotura reversible del ADN(sea en una o en las dos cadenas) y la unión
de las hebras. Además habrán otras proteínas asociadas que son las proteínas de enganche de
carga(complejo gamma en procariota y RFC en eucariotas) que sitúan la polimerasa en el cebador,
y las proteínas de enganche deslizante(proteína beta en procariotas y PCNA en eucariotas) que
forman un anillo alrededor del DNA molde guiando a la polimerasa. Por último habrán proteínas
encargadas de reconocer el origen(llamado Ori C en procariotas y Ori en eucariotas) en el caso de
las procariotas será la helicasa(DnaA) y en eucariotas serán las proteínas ORC.

Es importante tener en cuenta que la DNA polimerasa solo polimeriza una nueva cadena en
sentido 5´-3´y necesita un primer de ARN de aproximadamente 5 a 10 nucleótidos para funcionar
ya que solo puede unirse a un OH 3´libre. Además las ADN polimerasas están formadas por varias
subunidades.
Para la iniciación en procariotas es importante tener en cuenta que solo hay un punto de
origen(Ori C) y un punto de terminación(ter), la DnaA reconoce el OriC(secuencia de 245bp rica en
A y T) y recluta a la DnaB estas rompen a lado y lado los puentes de hidrogeno generando al
burbuja de replicación con sus dos horquillas, las SSB se unen a las cadenas impidiendo que se
vuelvan a enrollar y la primasa agrega el los cuatro cebadores iniciales(2 en cada horquilla).

La iniciación en eucariotas tendrá muchos sitios de origen(Ori) separados por 50-100kb. A partir de
cada origen se forma un replicón(parte del genoma que se replica a partir de un mismo origen) el
complejo ORC reconoce el Ori y recluta las demás proteínas, las helicasas abren la horquilla de
replicación y las RPA impiden que se cierre, el complejo ADNpoli alfa-primasa coloca los
cebadores.

En la elongación las ADN polimerasas formaran un dímero unido por las proteínas tau, y ambas
ADNpol se moverán hacia el mismo lado debido a un giro que da la cadena rezagada. La
elongación en la hebra líder será continua por lo cual habrá solo un primer, mientras que en la
rezagada habrán múltiples primers debido a que la replicación es discontinua dando como
resultado los fragmentos de okasaki. Para la elongación se formara el replisoma que será la
ADNpol con todas las proteínas asociadas(topoisomeras, proteínas de enganche, primosoma etc..)

En procariotas la terminación se da cuando se llega a ter, donde la RNAasa H y la ADNpol I

remueve los primers y esta última rellena los gaps y la ligasa une los fragmentos de okasaki. En
eucariotas la terminación se da cuando los replicones se unen, la RNAasa H remueve los primers,
la polimerasa delta y épsilon rellena gaps en la hebra rezagada y continua respectivamente y la
ligasa une los fragmentos.

Para la replicación el ADN debe disociarse de las proteínas y a medida que se va formando la
nueva cadena se vuelve a asociar a las histonas.

Con cada replicación los primers de los extremos 5´de las cadenas dejan un espacio no replicado
para lo cual la telomerasa tiene una secuencia de ARN complementaria a la secuencia que tienen
los telomeros(extremos 5´de los cormosomas) además de otras bases nitrogenadas, esta enzima
es una transcriptasa reversa, por lo cual a partir de esta parte que sobra sintetiza ADN generando
un elongamiento de la cadena, a partir del cual se agrega un primer y se replica y ahora cuando se
quita el primer la secuencia que no tiene cadena complementaria pertenece a la que sintetizó la
telomerasa por lo cual no hay perdida de información. Esta enzima solo se encuentra en neonatos
y en fetos, por lo cual con el paso del tiempo después del nacimiento se acortan los telomeros
generando el envejecimiento.

Ciclo Celular

Son los pasos que sigue una célula desde su origen hasta su división, a partir de la cual de esa
célula parental se producen dos células hijas, el ciclo de eucariotas es mas complejo que el de
procariotas, y va a ser un proceso regulado, en el caso de organismos unicelulares únicamente por
quinasas, en el caso de organismos multicelulares tanto por quinasas como por factores de
crecimiento. Lo que sucede a grandes rasgos en el ciclo es el crecimiento celular, la replicación del
ADN, distribución del material genético y la división celular.

El ciclo se puede dividir grosso modo en interfase y en Mitosis, sin embargo la interfase consta de
varias fases la G1, la S y la G2, en la G1 la célula va a ser metabólicamente activa y habrá
crecimiento celular, la cantidad genética será de 2n y dura aproximadamente 6-12 horas; en S se
duplica el ADN pro lo cual se pasa de 2n a 4n y dura aproximadamente 6-8 horas; en G2 va a haber
crecimiento celular y preparación para la mitosis la cantidad genética será 4n y dura
aproximadamente 4 horas; en M o mitosis la célula se va a dividir formando dos células con
cantidad genética 2n y dura aproximadamente 1 hora.

Algunas células tienen arresto(parada) del ciclo celular en G1 y entran en un estado de

quinescencia o de reposo en donde la célula permanece metabólicamente activa pero no sigue
con el ciclo celular, a menos deba volver a dividirse producto de una lesión o de apoptosis. Esto
aplica para células diferenciadas, las células no diferenciadas se dividen constantemente.

La mitosis se puede dividir en cuatro etapas, en la profase se produce la condensación del ADN en
los cromosomas, el traslado de los centrosomas a polos opuesto y la polimerización de los
microtubulos; la metafase consiste en el alineamiento de los cromosomas en el ecuador, el
desvanecimiento de la membrana nuclear y la formación de los husos mitóticos(unión microtubulo
a centrómeros); la anafase es en si la división de las cromatides hermanas hacia los polos opuestos
por la contracción de los microtubulos; la telofase consiste en la formación de las nuevas
envolturas nucleares y el comienzo de la estrangulación de la membrana por los filamentos de
actina y la despolimerización de los microtubulos.

Después de la mitosis se da paso a la citocinesis que es en si la división celular por el

estrangulamiento de los filamentos de actina y miosina II.

En el ciclo celular van a haber varios puntos de control, en G1 hacia el final se revisara que haya
suficiente cantidad de nutrientes, que el ADN sea integro y que el tamaño celular sea el adecuado;
en S más o menos a la mitad se revisa la replicación que el ADN solo se haya replicado una vez; en
G2 hacia el final se revisa que el ADN no este dañado que hayas suficientes nutrientes y que el
tamaño celular sea el adecuado; en M en la metafase se revisa que todos los cromosomas estén
alineados en el ecuador.

El control del ciclo celular se va a dar gracias a la acción de quinasas dependientes de ciclina (CDKs)
y en el caso de organismos multicelulares por la acción de factores de crecimiento.

Las quinasas dependientes de ciclinas, y su asociación con las ciclinas son las que permiten el
progreso del ciclo celular, por lo cual impedir la formación de este complejo es la forma mas eficaz
de regulación del ciclo celular, uno de estos complejos mas importantes es el factor promotor de
maduración o MPF(Cdk1 y Ciclina B) que esta presente desde S hasta el final de M, este complejo
va a estar fosforilado en Thr161, Tyr15 y Thr14, estos dos últimos son removidos activando el
complejo y dando paso a la mitosis.
Es importante tener en cuenta que las CDKs siempre van a estar, lo que varia es la concentración
de las ciclinas.

En el paso de G1 a S son importantes las CDK 4,5 y 6 que se asocian a ciclina D principalmente
además de la CDK2 que se asocia a la ciclina E; en el paso de S a G2 CDK2 con ciclina A se hace
presente; de S a M se presentara CDK1 unida a ciclina B y en ocasiones a ciclina A.

La regulación de las CDKs se puede dar de cuatro maneras la primera es afectando la relación
entre CDK y su ciclina mediante la síntesis y degradación de estas ultimas, la segunda la CDK debe
activarse mediante la fosforilación de Thr 160, la tercera forma es desactivándola al fosforilar
dominios cercanos a amino terminal y por ultimo se puede regular por medio de
inhibidores(CKIs)que eviten la asocian de CDK con la ciclina.

En la regulación con factores de crecimiento, cuando estos no están presentes en la célula esta
entra en la fase G0, si estos están presentes en G1 mediante vías como Ras/Raf/ERK se estimula
producción de ciclina D que se asocia a las diferentes CDKs. Cuando se altera la regulación por
estos factores la posibilidades de desarrollar cáncer aumentan considerablemente.

Un ejemplo muy claro de esto es la mutación en la proteína Rb, la cual es supresora de tumores al
igual que muchas otras como p53 o Ink4, cuando esta proteína es normal altera su estado de
fosforilación entre hiperfosforilado y hipofosforilado dependiendo de lo que requiera la célula,
cuando esta hiperfosforilado(a casua de CDK 4,2 y 6) no se asocia a E2F, mientras que cuando esta
hipofosforilado se asocia a E2F impidiendo que este pueda expresar genes de progresión del ciclo
celular como el que sintetiza la ciclina E, generando el arresto celular.

LA regulación por lo inhibidores se ve claramente en las respuestas a daños en el ADN donde van
a haber dos vías metabólicas dependiendo de la activación de ATM o de ATR(quinasas ambas), las
cuales van a activar CHK2 y CHK1 respectivamente(quinasas ambas), estas quinasas van a fosforilar
a p53 estabilizándola y generando su acumulación que genera la activación de p21 que es un
inhibidor que no permite la activación de una quinasa dependiente de ciclina(esto se da en el paso
de G1 a S) además de inhibir también la replicación como tal al desactivar PCNA; también CH2K y
CH1k pueden inactivar a Cdc25 generando que no pueda activar a una quinasa dependiente de
ciclina(CDK1 con Ciclina B) al desfosforilarla(Se da en el paso de G2 a M). Otro ejemplo de
inhibición se da en las células epiteliales donde TGF-beta se produce debido a la acción de p15
sobre Cdk4,6/D, al no haber Cdk4 no se fosforila Rb arrestando el ciclo en G1.

La mutación en ATM causa la Ataxía Telangiectasa que genera defectos nervioso e inmunológicos.

Que le replicación se de solo una vez se da gracias a las proteínas MCM que actúan como una
licencia para poder llevar a cabo al replicación, estas se asocian a el complejo ORC desde G1 hasta
S, y solo se asocian una vez, por lo cual por más que quiera no se va a poder replicar más de una
vez el ADN.

Citoesqueleto
Es el conjunto de proteínas que otorga la organización celular y participa en múltiples procesos
como la mitosis, endocitosis etc…; tiene 3 componentes principales, microfilamentos de actina,
microtubulos de tubulina, y filamentos intermedios de diversas proteínas.

Los microtubulos son de aproximadamente 25nm, se ubican principalmente cerca al nucleo y se

originan a partir del centrosoma, además también se encuentran en los cilios y flagelos; los
filamentos intermedios varían entre 8 y 12nm y se ubican en el citoplasma en general y en el
núcleo en el caso de las láminas; los microfilamentos son de 7nm y se ubican en la periferia y en
las proyecciones citoplasmáticas como las microvellosidades y los estereocilios.

Los filamentos intermedios tienen función estructural organizando la estructura interna de la

célula(organelos membranosos) y asociando los otros componentes del citoesqueleto dándole
resistencia mecánica a las células y tejidos; los microfilamentos tienen como función proporcionan
soporte mecánico, determinan la forma celular y permite el movimiento de la superficie
celular(migración, endocitosis, citocinesis); los microtubulus participan en la determinación de la
forma celular y en movimientos celulares(locomoción, transporte intracelular de organelos y
separación de cromosomas en mitosis).

Los microfilamentos están formados por actina, los monómeros se denominan actina globular G,
mientras que cuando estos se unen forman la actina filamentosa F, la cual a pesar de ser
monocatenaria tiene un aspecto de bicatenaria debido a que cada monómero tiene una rotación
de 166° al unirse, para pasar de la actina G a la F se debe primero forma un trímero de actina a
partir del cual se da la polimerización a ambos lados, debido a que todos los monómeros se ubican
de manera igual, el microfilamento va a tener una polaridad dada por un lado más y un lado
menos, teniendo el lado más una polimerización de cinco a diez veces más rápida que el lado
menos; además la actina se asocia a ATP y ADP, estando el ATP en el lado más y al ADP en el lado
menos, ATP se disocia más lento que el ADP razón por la cual la disociación por el lado menos es
mucho mayor por lo que se produce lo que se conoce como el intercambio rotatorio, en el cual se
agrega un monómero asociado a ATP en el lado más, este se hidroliza y se va dirigiendo hacia el
lado menos a medida que este se disocia, cuando llega al extremo menos se disocia, se vuelve a
fosforilar y vuelve a entrar al microfilamento por el lado más.

Existen diversas proteínas de unión a la actina que regulan el ensamblaje y desensamblaje de los
microfilamentos, el complejo Arp2/3 consta de siete proteínas que se unen al polímero cerca al
extremo positivo generando una ramificación del mismo; la ADF/cofilina puede actuar de diversas
maneras la primera es favorecer la despolimerización por el lado menos, la segunda es romper el
microfilamento generando más lados positivos favoreciendo la polimerización; sin embargo esta
se una a la actina-ADP impidiendo que se fosforile y vuela a incorporarse al microfilamento; la
profilina favorece la fosforilacion de ADP a ATP y por ende la polimerización del microfilamento.

Algunos fármacos también pueden afectar la polimerización de los microfilamentos las

citocalosinas por ejemplo se unen a los extremos más de estos impidiendo su polimerización, la
faloidina por otro lado se une a los filamentos estabilizándolos e impidiendo su despolimerización.
Los microfilamentos se pueden organizar de diversas formas las haces(hay dos tipos) y las redes,
en las primeras los filamentos se unen de manera estrecha en forma paralela mientras que en la
segunda se de una unión más holgada en disposición ortogonal, que se de una u otra organización
es debido a las proteínas de unión a la actina que participen en el agrupamiento. El primer tipo de
haz se forma debido a la unión de filamentos de actina por monómeros de fimbrina, el segundo
tipo de haz se da debido a la unión de filamentos por dímeros de actinina alfa y las redes se dan
por la formación de puentes cruzados entre filamentos de actina ortogonales que da la filamina(un
dímero también).

Los microfilamentos también se asocian a la membrana plasmática gracias a diversas proteínas, la

principal es la espectrina, la cual se asocia a la actina formando el córtex celular, a la espectrina se
une la anquirina que a su vez se una a la proteína transmembrana banda 3, también se une a la
espectrina la proteína 4.1 que a su vez se une a la proteína transmembrana glicoforina, estas dos
proteínas se dan en el eritrocito, en otras células la espectrina también se denomina fodrina, o
incluso en lugar de espectrina puede haber filamina o distrofina, también puede haber en lugar de
proteína 4.1 una proteína ERM.

La actina también es participe de diversas especializaciones de membrana, las fibras de

estrés(filamentos de actina de gran tamaño) son parte de las adhesiones focales al unirse a la
talina y vinculina, las cuales se unen ala integrina, también la actina hace parte del cinturón
adhesivo, de las microvellosidades, de los estereocilios y de proyecciones citoplasmática
temporales como los psudopodos(fagocitosis), los lamelipodios y las microespinas o filopodios.

Los filamentos intermedios se componen de diversas proteínas que se pueden agrupar en 6 tipos,
los tipos I y II son queratinas acidas y básicas respectivamente y se presentan en las células
epiteliales; en el tipo III está la vimentina(células blancas, musculares, conectivas, nerviosas); en el
tipo IV están los neurofilamentos(NF-L, NF-M, NF-H), además de proteínas previas a la formación
de neurofilamentos(alfa-internexina ); en el tipo V están las laminas nucleares; en el tipo VI esta la
nestina(presente en células madre del sistema nervioso. Todos estos filamentos muestras
características conservadas similares al tener una cabeza(N-terminal) un cuerpo(alfa hélice), estos
monómeros forman dímeros al enrollarse las alfa hélices quedan cabeza unida con cabeza y cola
con cola, sin embargo los dímeros se unen de forma antiparalela formando un tetrámero, los
tetrámeros se asocian extremo con extremo formando protofilamentos, los cuales se asocian
lateralmente formando el filamento(8 protofilamentos); debido a la unión antiparalela de los
tetrámeros los filamentos intermedios no tienen polaridad ni lada mas y lado menos.

Los filamentos intermedios unen componentes del citoesqueleto entre sí como la desmina que
une la actina-miosina a la membrana en los musculos, o los neurofilamentos que unen
microfilmanetos a microtubulos; también algunas protienas como las plaquinas unen los
filamentos intermedios a otros componentes, la plectina por ejemplo une filamentos intermedios
a actina o microtubulos.

Las patología asociadas a fallas en los filamentos intermedios son múltiples, la falla en la síntesis
de la queratina genera la epidermólisis bullosa simple, y se cree que la falla en los neurofilamentos
está asociada con la esclerosis lateral amiotrófica(ELA). Además la identificación de estos puede
ayudar a indicar de donde es originario un cáncer que hizo metástasis, o ayuda en el diagnóstico
de enfermedades prenatales.

Los filamentos intermedios están presentes en los desmosomas y los hemidemosomas.

Los microtubulos estan compuestos por tubulina alfa y beta(son heteropolimeros por esta razón),
además hay otros dos tipos de tubulina presentes en el centrosoma la gamma y la delta. Los
monomeros se asocian en la misma dirección por lo cual estos microtubulos también tiene cierta
polaridad con los lados mas y menos; al igual que la actina la tubulina también tendrá intercambio
rotatorio, la diferencia radica en que la asociación es con GTP y GDP; la concentración de tubulina
asociada a GTP es la que va a determinar si el microtubulo se polimeriza(altas concentraciones) o
se despolimeriza(bajas concentraciones) lo que se conoce como inestabilidad dinámica que otorga
una continua renovación de los microtubulos.

Los microtubulos tienen participación fundamental en la mitosis, al ser los encargados de dividir
las cromatides hermanas hacia polos opuestos, por eso una afección en la polimerización o
despolimerización de los mismos tiene notorios efectos para la célula, este tipo de fármacos son
utilizados para tratar el cáncer(vincistrina y vimblastina que inhiben células de rápida división), o
para experimentar(colchisina y colcemina que inhiben la polimerización) o para ambas(taxol que
estabiliza los microtubulos impidiendo su despolimerización).

In vivo se requiere de Mg2+, 37°C y GTP para la polimerización, puede suceder en al cuerpo algo
conocido como despolimerización catastrófica, en la cual debido a la perdido de la energía de
tensión el microtubulo se curva, y se despolimeriza por ambos lados.

Los microtubulos tienen su origen en el centrosoma que se compone de dos centriolos pegados
perpendicularmente por centrina, lo cuales están compuestos cada uno por 9 tripletas de
tubulina(alfa beta y delta), además en un extremo tendrá prolongaciones(apéndices y satélites)
que organizan la matriz centriolar, y en el centro tubulina gamma a partir de la cual se formaran
los nuevos microtubulos. Los centriolos están rodeos por un material pericentriolar.

En la mitosis los microtubulos se reorganizaran forman el huso mitótico, donde habrán un

centrosoma en cada polo, se aumentara la despolarización de los microtubulos y aumentara la
formación de microtubulos a partir del centrosoma, estos microtubulos serán de 3 tipos, el
cinetocorico(unido a los cromosomas y su centrómeros a los cuales van a separar), el polar(se
sobrelapan uno sobre toro estabilizando la célula) y el astral(de los centrosomas a la periferia) los
dos últimos también tienen participación en la división de las cromatides hermanas, ya que será
los microtubulos cinetocoricos los que separaran las cromatides hermanas, y los astrales y polares
separaran los polos del huso mitótico luego de la separación de los cromosomas.

Debido a su inestabilidad dinámica los microtubulos pueden asociarse a diversas proteínas que
favorecen su despolimerización, o los estabilizan, son ejemplo de esto último las MAPS que
estabilizan a los microtubulos, la MAp-1 MAP-2 y Tau en las neuronas, y la MAP-4 junto con las
anteriores en todas las células no neuronales.

A partir de los microtubulos es que se lleva el trafico intracelular, para esto se requiere de la
presencia de proteínas motoras que lleven lo que se desea transportar por un microtubulo, las
principales proteínas motoras son la dineina(hacia el extremo menos) y la quinesina(hacia el
extremo más), debido a que usualmente le extremo más apunta a la periferia y el menos a el
núcleo se ha establecido que la quinesina transporta elementos del núcleo a la periferia y la
dineina de la periferia al núcleo.

También se ha demostrado la participación de los microtubulos en la organización de los organelos

membranosos en la célula. Los microtubulos también están presentes en los cilios y flagelos.

Hay varios tipos de lámina nuclear en el ser humana las láminas tipo A(A y C) que vienen del gen
LMNA en el cromosoma 1, las láminas B2 y B3 que vienen del gen LMNB2 en el cromosoma 19, y la
lámina B1 viene del gen LMNB1 en el cromosoma 5.

Las laminopatias son enfermedades causas por afecciones en los genes que codifican para las
láminas, usualmente el gen LMNA es el afectado, una de estas enfermedades es la distrofia
muscular de Emery-Dreifuss que casi cardiomiopatía dilatada y afecta los músculos esqueléticos;
otra enfermedad es la lipodistrofia tipo Dunningan en la cual se pierde grasa de las extremidades y
se acumula de manera anormal en otros lugares como la nuca y la cara, además de genera
diabetes; la neuropatía periferica tipo 2 que afecta los nervios de las manos y los pies generando
deformaciones como el pie cavo o la escoliosis; la más grave enfermedad es la progeria ya que es
un fallo multisistemico en el cual se produce un envejecimiento prematuro de todo el cuerpo.

Estas laminopatias generalmente son autosómicas dominantes(a excepción de la neuropatía

periférica) es decir no son ligadas al sexo y con un solo alelo afecta se expresan, estas laminopatias
generalmente se asocian con anormalidades en la estructura nuclear, perdida de heterocromatina,
cerramiento de poros nucleares, la mayoría de las mutaciones que generan estas mutaciones son
missense(puntuales), para corregirlas se han llevado a cabo estudios en los cuales mediante
fármacos se regula la forma del núcleo lo cual se ha correlacionado con mejoras de las patologías
para esto se utilizan fármacos que inhiben las proteínas de prenilación generando que no se
acumule tanta prelamina A farnecilada(esto se usa en la progeria) también se ha propuesto inhibir
alguna vías de señalización causadas por las patologías, para esto se inhiben ciertas quinasas(se
utiliza principalmente en la distrofia muscular).

Trafico Vesicular

Hay varias vías dentro de la célula que implican el trafico vesicular, esta la via secretora(Ribosoma
-> RE -> Golgi) la vía endocítica(Formación endosoma que va al lisosoma o a otro organelo) y la
vía de reciclaje.

El trafico vesicular implica la formación de una vesícula cuya composición va a variar dependiendo
de lo que vaya a transportar(proteína, toxina, virus, ligando, lípido etc..), requiere de GTPasas, la
vesícula estará cubierta por una proteína que varía dependiendo del lugar al que va, se puede
clasificar por el mecanismo de escisión de la vesícula(dependiente o no dependiente de dinamina),
las vesículas se transportan a través del citoesqueleto debido al acción de la dineina y la quinesina.

Dentro de los recubrimientos de vesícula destaca COPI(debe ir a RE desde golgi en la vía

retrograda debido a la secuencia KDEL), COPII(debe ir a Golgi desde RE en la vía anterógrada),
Clatrina(debe ir al lisosoma) esto en la vía secretora.

Debido a que la fusión de laas vesiculas tiene que ser muy selectivo, en el trafico siempre habrá
un compartimento donador del que emerge la vesícula y un compartimento receptor o blanco con
el que se fusiona la vesícula, en el compartimento donador estará la v-Snare que se ira en la
vesícula y se unirá a la t-Snare presente en el compartimento receptor. La acción de abrir la
membrana y fusionar la vesicula es un proceso energeticamente desfavorable, el cual debe ser
acoplado por proteinas de la familia RAB-GTP. Para cada vesicula y compartimiento hay una
proteina RAB unica, que es la que media el reconocimiento entre vesicula  compatimiento,
cuando la vesicula esta horientada al compartimiento las RAB-GTP se hidrloizan a RAB-GDP y
provocan la interacción fuerte entre los dominos v-SANRE y t-SANRE (como dos cuerdas que se
enlazan) creando una estabilidad en ambas mebranas lípidicas que conlleva a la fusión de ambas,
después de esto un complejo NFS/SNAP desenlaza los dominos v-SANRE y t-SANRE con la
hidrólisis de ATP, con el fin de que la V-Snare vuelva al compartimento donador mediante otra
vesícula. Es importante tener en cuenta que estas RAB están asociadas a v-Sanre y t-Snare, no son
las mismas que participan en el recubrimiento de la vesícula.

La formación de las cubiertas de la vesícula implica dos proteínas además de la que recubre, la
primera proteína es una proteína de la familia RAB, Sar1 por ejemplo que está asociada a COPII,
esta proteína tiene una cola hidrófoba que usualmente está escondida cuando está unida a GDP,
cuando se fosforila GDP(debido al factor intercambiador de guanina) la proteína se activa y
muestra la cola hidrófoba que se une a la membrana plasmática, a las Sar1 Se van a pegar unas
proteínas de unión a las cuales se unirá la COPII; es igual para las demás coberturas solo que
cambia la proteína RAB, especificamente ARF1-GDP

La escisión de las vesículas puede ser dependiente o independiente de dinamina, la proteína

encargada(que esta asociada a GTP) sufrirá una hidrolizacion que genera una torsión rompiendo la
membrana en ese punto liberando a la vesícula; cuando se lleva a cabo dicha hidrolización las
proteinas de la familia RAB participes del revestimiento proteico(SAR1- ARF1) se comienzan a
disociar de la membrana debilitando el complejo que recubre las vesículas a medida que esta se
transporta, con el objetivo de poder reutilizar todas las proteinas asociadas en un nuevo viaje
vesicular.

Es muy importante para el tráfico vesicular la endocitosis, además este procesos es también
importante para la respuesta inmune, la comunicación intercelular, la transducción de señales y la
homeostasis. También estará presente la macropinocitosis en donde hay una
evaginación(proyección) temporal de la membrana plasmática debido a la actina permitiendo
absorber líquidos grandes.
Habrán varios tipos de endocitosis, la cubierta por clatrina o caveolina cuya escisión será
dependiente de dinamina, la cubierta por flotilina(proteoglicano) que puede tener una esicion
dependiente o independiente de dinamina y por ultima la independiente clatrina o caveolina que
también tendrá escisión dependiente o independiente de dinamina.

En la endocitosis dependiente de clatrina va a haber un receptor al que se une un ligando, la unión

del ligando genera la fosforilación del receptor por GRK, debido a esto ARR-beta se une al receptor
y empieza la invaginación y el cubrimiento por clatrina del endosoma, finalmente la dinamina hace
la torsión liberando el endosoma al interior para que vaya al lisosoma o a la vía de reciclaje.

La endocitosis dependiente de caveolina se da en las balsas lipídicas y se puede cubrir por

caveolina 1(no muscular) o 3(muscular). En la endocitosis independiente de clatrina y caveolina
puede haber dependencia de dinamina, como en el caso de la internalización de interleucina 2 o
yc, o independiente de dinamina como en el caso de las proteínas ancladas a glicosil-inositol-
fosfato (GPI).

Por las diferentes vías de endocitos pueden entrar diferentes virus de manera enmascarada en
macropinocitosis puede entrar el VIH, por la vía dependiente de clatrina puede entrar la influenza,
el papiloma humano(HPV), por clatrina puede entrar el virus del simio(SV40) o el ecovirus, por
flotilina puede entrar el rotavirus, por la independiente de clatrina o caveolina pero dependiente
de dinamina puede entrar el Norovirus, y por la independiente de dinamina la influenza o el SV40.

Modelo Eléctrico de la Membrana Celular

El potencial es el que se calcula mediante la ecuación de nernst se da en V o mV en el caso de la

membrana plasmática. La capacitancia(C) va a ser el mismo condensador(almacena carga
electirca), La resistencia(R) de da en ohmios y su inverso es la conductancia. La intensidad de
corriente(I) se mide en amperios y el flujo neto de carga(Q) se mide en amperios también.

La técnica de Patch Clamp(inventada por Neher y Sakmann) permite analizar un cultivo de células
en partes por millón, teniendo la posibilidad de medir la capacitancia, la resistencia, la corriente y
el potencial, un cambio en alguno de estos indicara una afección, por ejemplo un cambio en la
resistencia o un cambio en la conductancia.

La corriente eléctrica está asociada a cargas en movimiento se define como 𝐼 = 𝑄/𝑡 donde Q es el
el flujo neto de carga y t es el tiempo, el movimiento de estos iones requiere de un gradiente, es
decir una diferencia de potencial(dad por la diferencia de concentraciones de iones en el interior y
que genere un campo eléctrico que ira del mayor potencial al menor, generando que una carga
positiva se movilice en la dirección del campo, mientras que una negativa en dirección opuesta. En
las células en lugar de Amperios utilizamos pico amperios(1pA=10 -12A).

En el condensador se puede medir el potencial mediante la siguiente ecuación: ∆𝑉 = 𝑄/𝐶 siendo

Q la carga y C la capacitancia, esta última es proporcional a la superficie celular, por lo cual un
aumento en esta indica un aumento en el tamaño de la célula. Con Path Clamp podemos hallar C y
V por cual se puede hallar Q despejando. La membrana es análoga a el condensador en el modelo
eléctrico.

La resistencia va a ser análoga a los canales en el modelo, esta indicar la facilidad con la que pasan
los iones por el canal, en este caso el potencial va a dar mayor o menor especificidad al canal. Los
canales además de la resistencia tendrán también el potencial. El R no va a almacenar energía ya
que la disipa

La capacitancia será importante ya que se medirá para modelos de circuitos en serie y en paralelo,
1 1 1
la capacitancia se define como: 𝐶 = 𝑄/𝑉, en serie se puede decir que: = + , mientras que
𝐶𝑒𝑞 𝐶1 𝐶2
en paralelo se puede decir que: 𝐶𝑒𝑞 = 𝐶1 + 𝐶2, siendo los diferentes C las partes de membrana
que hay entre un canal y otro.

En una misma célula servirá un modelo eléctrico en serie, en células contiguas servirá un modelo
en paralelo, que sea en serie o en paralelo lo determina la igualdad de las concentraciones iónicas
internas y externas de las capacitancias, si en ambas tanto la interna como la externa es igual es en
serie, si solo en la externa es igual pero en la interna es diferente será en paralelo.

Transmisión del impulso Nervioso

Existen células excitables(capaces de producir un potencial de acción) como las excretoras, las
musculares y las neuronales, en estas células la membrana es un bipolo eléctrico, en el cual el
ptencial es procoporcional a la carga.

El impulso nervisoso se transmite de la siguiente forma, llega un estimulo que abre unos canales
de sodio, la entrada de esodio por estos canales genera una leve subida en el voltaje hasta que
llega al umbral, en este punto se abren todos los canales de sodio y se produce la
despolarización(pico del voltaje), cuando se llega al potencial máximo se cierran los canales de
sodio y se abren los de potasio repolarización(bajada) despues de esto se produce la
hiperopolarización por la acción de la bomba sodio-potasio volviendo al potencial de reposo.

El impulso nervioso tiene una retroalimentación positiva, el tiempo de abertura de los canales
dependiendtes de voltas es independiente de la intensidad del impulso, razón por la cual
magnitud del impulso no afecta la despolarización.

La temperatura puede afectar el cambio en el potencial de reposo

Ecuacion: 𝑉 = 𝐴 ∗ 𝑞 donde A es la constante de proporcionalidad y q es la carga.

Modelo del Cable

En este modelo se hace una analogía de un cable con el axón de una neurona, sirve para estudiar
diversas enfermedades como la eplipesia, la esquizofrenia, el alzheimer y el sindorme de down.
Para este modelo se debe tener un campo magnético 1000 veces menor que el campo eléctrico,
las varciaciones de los iones son despreciables, el diámetro debe ser mucho mas pequeño que la
longitud del cable, la membrana debe ser impermeable a la corriente(a excepción de los canales),
la carga eléctrica en el citoplasma se relaja en cuestión de microsegundos(Citoplasma = Rsistencia)
y el potencial extracelular es pequeño y decae a distancias mas grandes que el diámetro de la
celula.

El estimulo que de inicio al impulso eléctrico puede ser eléctrico, quimico, de presión, térmico o
lumínico.

La mielina se ademeja a un blindaje de un cable que no permite que se disperse la señal o la

energía, la mielina no permite que la energía del impulso se pierda sino que siga conduciendo por
el cable, esto debido a su gran resistencia.

A mayor diámetro del cable se tiene una mayor velocidad de propagación, y a menor resistencia
interna es menor la caída del impulso con la distancia.

La perdida de la energía se da manera exponecial y se puede calcular por medio de la ecuación del
−𝑥
receptor potencial: 𝑉𝑅𝑃 = 𝑉0 𝑒 𝑇 siendo V0 el voltaje inicial, x la distancia y T(Tau) la constante
típica del axón.

Mediante esta ecuación se puede saber que a una distancia de 5T aproximadamente se pierde el
99% de la magnitud incial, meintras que a 1T se pierde el 64%

Respiración Celular

La respiración celular es el conjunto de procesos a partir de los cuales se genera la mayor cantidad
d energía en el cuerpo, consta de tres procesos: el ciclo de Krebs, la cadena transportadora de
electrones y la formación de ATP o fosforilación(el ATP se considera moneda energética ya puede
tanto recibir como donar grupos fosfato). Todo este proceso ocurre en la mitocondria lo cual da
una mayor efectividad. En este proceso se genera energía a partir de carbohidratos, aminoácidos y
lípidos, ya que el catabolismo de estos tres culmina con la molécula de acetyl-CoA que entra al
ciclo de Krebs.

Los procesos anabólicos forman moléculas complejas a partir de moléculas simples, utilizan ATP(o
otra forma de energía) y cofactores reducidos ya que son procesos reductores; por el contrario los
procesos catabólicos producen ATP y son procesos oxidantes que reducen cofactores, además no
solo son productos los monómeros de las moléculas que se degradan sino también CO2, NH3 y
H2O.

Antes de empezar el ciclo de Krebs debe formarse el acetyl-CoA en el caso de la glucosa esta por la
glicolisis pasa a ser 2 moléculas de piruvato, las cuales al entrar a la mitocondria sufren una
descarboxilación oxidativa por la acción de la piruvato deshidrogenasa(PDH) la cual es complejo
multienzimatica que lleva a cabo diversas reacciones en secuencia formando no solo acetyl-CoA
sino también NADH, este complejo enzimática(3 enzimas) está asociado a 5 coenzimas.
El ciclo de Krebs consta de 8 pasos los cuales inician con el oxalacetato, y terminan con este mismo
compuesto(razón por la cual se le denomina ciclo) se ha establecido como primera reacción del
ciclo la condensación de oxalacetato con citrato, se dice que este ciclo es anfibolico, debido a que
a pesar de parecer principalmente catabólico, los compuestos intermedios del ciclo pueden en
ocasiones salir del mismo para participar en la síntesis de moléculas más complejas.

La primera reacción del ciclo es una condensación o deshidrogenación, en esta la enzima citrato
sintasa une el acetyl-CoA con el oxalacetato formando citril-CoA que se separa rápidamente
formando el citrato y liberando el CoA que va a unirse nuevamente a un acetato en la PDH, esta
reacción a pesar de aparentemente no aumentar la entropía es muy exergonica debido a la
ruptura del enlace tioester(entre el acetato y el grupo sulfidrihilo del CoA) que libera tanta energía
como la hidrolisis de un ATP. Para esta reacción ∆G = -32.

La segunda reacción del ciclo es una isomerización e hidratación, en esta la enzima aconitasa
transforma el citrato en isocitrato de manera reversible; sin embargo, el rápido consumo del
isocitrato genera que el equilibrio este hacia la derecha. Para esta reacción ∆G = 13,3

La tercera reacción es una descarboxilación oxidativa o deshidrogenación, en esta la enzima

isocitrato deshidrogenasa(asociada con Mn2+) convierte el isocitrato en alfa-cetoglutarato, debido
a que es una reacción redox, se utiliza NAD como aceptor de electrones reduciéndose a NADH; en
algunos casos esta enzima utiliza el NADPH en reacciones anabólicas fuera del mitocondria. Para
esta reacción ∆G = -20,9

La cuarta reacción del ciclo es nuevamente una descarboxilación oxidativa o deshidrogenación, en

esta el complejo enzimático de la alfa-cetoglutarato deshidrogenasa convierte el alfa-
cetoglutarato en succinil-CoA, el NAD se utiliza como aceptor de electrones y debido a unión de
acetyl-CoA se forma un enlace tioester. Para esta reacción ∆G = -33,5

La quinta reacción del ciclo es una fosforilación a nivel de sustrato, en esta la enzima succinil-CoA
sintasa convierte succinil-CoA en succinato, en esta debido a que es favorable la ruptura del enlace
tioester se utiliza en la formación de ATP a partir de ADP, o de GTP a partir de GDO; sin embargo
cuando se forma GTP este rápidamente transfiere su grupo fosfato al ADP formando ATP. Para
esta reacción ∆G = -2,9

La sexta reacción es una deshidrogenación, en esta la enzima succinato deshidrogenasa convierte

el succinato en fumarato, en este caso la enzima se encuentra en la membrana interna, y los
electrones son aceptados por un FAD que esta unido covalentemente a la enzima. Para esta
reacción ∆G = 0

La séptima reacción es una hidratación, en esta la enzima fumarasa convierte el fumarato en

L-malato, esta enzima únicamente reconoce como sustrato el trans-fumarato no el cis, esta
reacción es reversible. Para esta reacción ∆G = -3,8

La octava reacción es una deshidrogenación, en esta la malato deshidrogenasa, convierte el

malato en oxalacetato, en esta caso NAD se reduce al aceptar los electrones, esta reacción es
reversible pero el constante uso de oxalacetato genera una baja concentración del mismo llevando
el equilibrio a la derecha. Para esta reacción ∆G = 29,7

De esta forma el producto final por una molécula de acetyl-CoA va a ser 1ATP, 3NADH y 1FADH2.

El ciclo de Krebs a pesar de parecer una forma innecesaria de catabolismo es la mas eficiente
posible debido a su carácter anfibólico, el alfa-cetoglutarato y el oxalacetato pueden servir como
precursores del aspartato y el glutamato, a partir de los cuales se pueden sintetizar diversos
aminoácidos y nucleótidos(purinas y pirimidias), el oxalcetato también puede convertirse en
glucosa en la gluconeogénesis, el succinil CoA participa en la síntesis de porfirinas y grupos
hemo(transporta oxigeno en hemo y mioglobina, transporta electrones en citocromos) y el citrato
sirve como precursor de ácidos grasos. Esto sucede cuando el nivel energético de la célula es alto o
cuando alguno de estos compuestos se acumula. Para reponer la perdida de los componentes del
ciclo de Krebs existen las reacciones anapleróticas.

Después de que ha pasado el ciclo de Krebs, los electrones presentes en las formas reducidas
NADH y FADH2 entregan sus electrones en la cadena transportadora de electrones, en esta cadena
hay cuatro complejos proteicos además de la ATP sintasa, todos presentes en la membrana
interna de la mitocondria.

El complejo I posee una NADH deshidrogenasa, que le quita los electrones a NADH, los cuales son
recibidos por metales del complejo, además bombea 4 protones al espacio intermembranal, estos
electrones se pasan a la coenzima Q que los transporta al complejo III; el complejo II tiene a la
succinato deshidrogenasa del ciclo de Krebs que tiene el FAD unido de manera covalente, los
electrones del FADH2 son removidos por una FADH2 deshidrogenasa del complejo, nuevamente
es la coenzima Q la que lleva los electrones al complejo III; en el complejo 3 al captar los
electrones de la coenzima Q se libera suficiente energía para bombear 4 protones al espacio
intermembranal, estos electrones son aceptados por el citocromo C, que se encuentra en el
espacio intermembranal, el cual lleva estos electrones al complejo IV; el complejo IV posee una
citocromo oxidasa que oxida el citocromo quitándole los electrones, estos electrones generan
suficiente energía para subir dos protones, después estos electrones se unen al oxigeno el cual se
une a 2 protones formando agua. Esto es la parte referente a la oxidación en lo que es la
fosforilación oxidativa.

La ATP sintasa, es una proteína con dos subunidades(F0 y F1), la F0 es la encargada de de devolver
los protones a la matriz, además de que genera la fuerza proton-motris encargada de generar la
rotación de la F1 que tiene como resultado la síntesis de ATP al unir ADP con fosforo inorgánico.
Esto es lo referente a la fosforilación.

Hay varias formas de mantener las concentraciones necesarias para las concentraciones de
metabolitos necesarias para llevar a cabo la respiración celular, la adenina nucleótido translocasa
es un antiporte que saca ATP y ingresa ADP, la ATP sintasa devuelve los protones a la matriz, la
fosfato translocasa es un simporte que ingres protones y H2PO4-, que es el que dota el fosfato
inorgánico para la síntesis de ATP.
Los electrones que llegan a la cadena transportadora de electrones no viene únicamente del ciclo
de Krebs también pueden llegar de la glicolisis y de la beta-oxidación de ácidos grasos.

Hay proteínas que no tienen mitocondrias(eritrocitos, cornea y cristalino) las cuales obtienen su
energía a partir de procesos anaerobios(sin participación de oxigeno) como la glicolisis

Regulación de la Respiración celular

La respiración celular tiene diversas formas de regularse, esta regulación se puede dar en la
conversión de piruvato a acetyl CoA, en el ciclo de Krebs o en la fosforilación oxidativa. Sin
embargo en general se puede decir que el principal modulador aloesterico va a ser la
concentración de ATP/ADP cuando la carga energética de la célula es alta(concentración elevada
de ATP) se desfavorece la respiración celular, cuando la carga energética es baja(concentración
elevada de ADP + P) se favorece la respiración celular.

La regulación de PDH se puede dar de dos maneras la primera es por modulación aloesterica
donde el ATP, NADH, Acetil-CoA y Ácidos grasos lo inhiben y AMP, CoA, NAD y Ca2+ lo activan; la
segunda forma es la modificación covalente ya que este complejo tiene una subunidad quinasa y
una fosfatas, la subunidad quinasa fosforila PDH y lo inactiva, esto sucede a grandes
concentraciones de ATP; sin embargo, cuando la concentración de ATP es baja la fosfatasa puede
trabajar y desfosforila PDH activándolo.

El ciclo de Krebs se regula en tres puntos al modular la actividad de tres enzimas(citrato sintasa,
isocitrato deshidrogenasa y alfa-cetoglutarato deshidrogenasa), estas tres enzimas se pueden ver
afectadas por tres razones: disponibilidad de sustratos, inhibición por acumulación de productos y
retroinhibicion aloesterica. En el caso de la citrato sintasa la acumulación de productos(NADH,
Citrato, Succinil CoA y ATP) la inhiben, mientras que el ADP la activa, en el caso de la isocitrato
deshidrogenasa el ATP la inhibe mientras que el Ca2+ y el ADP la activan; la alfa-cetoglutarato
deshidrogenasa se inhibe por succinil-CoA y por NADH y se activa por Ca2+.

Es importante tener en cuenta que si hay gran concentración de productos inhibiendo la actividad
enzimática implica que hay una baja concentración de sustratos, por lo cual también se afrima que
la baja concentración de sustratos afecta al actividad enzimática.

En el caso de la fosforilación oxidativa la regulación se da principalmente por la concentración de

ATP y ADP en el cuerpo, sin embargo este proceso se asocia mucho con el funcionamiento de
inhibidores o desacopladores no fisiológicos, se denominan inhibidores cuando afectan tanto la
fosforilación como la oxidación, mientras que se denominan desacopladores cuando solo se afecta
la fosforilación mas no la oxidación. Dentro de los inhibidores se encuentra la rotenona y el amital
afectando el paso de electrones a la coenzima q, la antimicina A impide el paso de electrones al
complejo III, el cianuro, la azida y el CO que inhiben el paso de electrones del citocromo C al
complejo IV. Dentro de los desacopladores(aceptores electrónicos artificiales, tenemos el azul de
metileno, el metosulfato de fenazina, el 2,6-diclorofenol, el indofenol, el tetrametil p-
fenilendiamina y el ferrocianuro.
El 2,6-diclorofenol actúa afectando la impermeabilidad de la membrana a los iones, generando
que los protones vuelvan a la matriz por la membrana y no por la ATP sintasa, afectando así la
fosforilación mas no la oxidación.

Otros factores que pueden afectar la respiración celular son la concentración de la enzima, la
concentración del sustrato, el pH(altera cargas) y la temperatura.

De la succinato deshidrogenasa el más conocido es el malonato, mientras que del citrocomo C el

más conocido es el cianuro de potasio, estas inhibiciones se pueden comprobar manera
experimental utilizando indicadores como el azul de metileno(en el caso del malonato, entre más
azul menos electrones recibió, entre mas transparente mas electrones recibió) o el buffer
fosfato(entre más oscuro más electrones aceptó).

La diferencia entre el NAD y el FAD, además de su procedencia de vitaminas diferentes(B3 NAD, B2

FAD) y la cantidad de hidrógenos que capta, radica en que el NAD se acopla a reacciones de
deshidrogenación sobre un mismo carbono, mientras que FAD se acopla a esta misma reacción
pero en carbonos adyacentes, además también se diferencian en que por cada para de electrones
de NAD se forman 2,5 ATPs mientras que por cada par electrónico de FADH2 se forma 1,5 ATPs.

Alineamientos múltiples: ClustalW

Los alineamientos múltiples son la comparación de secuencias sea nucleotidicas o aminoácidicas

permitiendo establecer las semejanzas y diferencias entre secuencias, además sirven para
determinar mutaciones puntuales y para profundizar en temas como la evaluación del
plegamiento de ARN, regulación génica y relaciones función-estructura de las proteínas.

Para los alineamientos múltiples se debe usar el formato FASTA, el cual además de las secuencias
incluye una forma de nombrar con le uso del signo >.

En clustal(que no esta en ncbi) se puede escoger ADN o Proteína, en el caos del ADN al comparar
secuencias se utilizan asteriscos para mostrar las bases que se parean perfectamente y líneas para
las bases que no tienen correspondencia, a partir de esto se puede deducir la cantidad de exones e
intrones de un gen y la cantidad de pares de bases del mismo en caso de que se utilice toda la
secuencia de un gen y un transcrito del mismo, por otro lado si se utilizan solo 2 o más transcritos
se puede determinar si vienen del mismo gen, en caso de ser así la variedad en transcritos se debe
al splicing.

En el caso de la proteína en clustal al comparar secuencias se utilizan 2 puntos para indicar un

cambio en un aminoácido en 2 o más especies, un punto para indicar un cambio en una sola
especie y un asterisco para indicar que el aminoácido se conserva en todas las especies, y el guion
se utiliza cuando las secuencias son de diferente longitud y en ese lugar no hay correspondencia.

Las mutaciones sinónimas generan cambios en un aminoácido, las no sinónimas no.

Alineamiento múltiples: Blast

En blast(que está en ncbi) se puede realizar alineamientos de nucleótido a nucleótido(nucleotide
blast), proteian a proteína(protein blast), nucleótido trnascrito a proteína(blastx), proteína a
nucleótido(tblastn) y nucleótido transcrito a nucleótido transcrito(tblastx), en este caso ya no se
coparan secuencias que uno establece, sino que la secuencia problema se compara con las
secuencias de la base de datos.

En las comparaciones se dan diferentes datos, Max Ident se refiere al porcentaje de nucleótidos
comparados, Query Coverage se refiere al porcentaje de nucleótidos que se pudieron comparar, el
Max Score y el total escore se refiere al puntaje que da el algoritmo a la comparación(a mayor
puntaje mayor similitud) y el E-value se refiere a la posibilidad de obtener un mejor resultado
fuera de blast. A partir de la comparación de nucleótido con nucleótido se puede hallar a que gen
puede llegar a corresponder la secuencia y que proteína va a codificar en caso de pertenecer a
región codificante.

Cuando se realiza alineamiento de nucleótido a proteína, a partir de la secuencia problema se

pueden determinar las proteínas que podría llegar a codificar esta secuencia en diferentes
especies se utilizan los mismo valores mencionados anteriormente, y nuevamente se puede
encontrar aquí el gen al que puede corresponder la secuencia.

Mapviewer y Genome Browser.

Genome browser es una base de datos de la universidad de California en la cual se encuentra de

manera gráfica el genoma de diversas especies incluyendo el ser humano, para buscar ene l
genoma un gene se debe inserta la ubicación del mismo de esta manera 22q11, siendo 22 el
cromosoma, la letra el brazo(q cola(queue) y p pequeño(petit)), el primer número después de la
letra indica la región y el siguiente numero la banda.

Cuando se encuentra el gen de forma grafica en genome browser habrán muchos hipervínculos en
los cuales se puede obtener información del gen, enfermedades y relacionadas a este. A partir de
la gráfica se puede disminuir el zoom y identificar los genes cercanos al que se buscó y determinar
si las patologías relacionadas a afecciones en estos genes próximos están relacionadas con la del
gen de estudio.

Mapview es una base de datos de NCBI que contiene información acerca del genoma de diversas
especies, aquí se puede determinar cuántos cromosomas tiene una especie sean sexuales, no
sexuales o mitocondriales, además también se puede realizar una búsqueda de un gen del cual la
base de datos brinda características.

Metabolismo de Carbohidratos

El metabolismo se da gracias a la acción de diversos órganos, el intestino delgado es el lugar de

digestión y absorción de los nutrientes mediante la acción de enzimas hidrolasas y transporte
tanto pasivo como activo; la vena porta es la encargada de transportar los nutrientes del intestino
al hígado(circulación portal); el hígado procesa los diversos nutrientes o metabolitos, distribuye
lípidos, cuerpos cetónicos y glucosa y convierte nitrógeno en urea; el páncreas secreta insulina y
glucagón que regulan los diversos procesos del metabolismo; el sistema linfático transporta los
lípidos al hígado; el tejido adiposo sintetiza, guarda y moviliza triglicéridos, otorga mantenimiento
de la temperatura corporal y secreta hormonas que regulan la ingesta como la leptina.

En el metabolismo de carbohidratos es muy importante tanto el hígado como el musculo y el

sistema nervioso, el primero obtiene su energía principalmente de la beta oxidación de ácidos
grasos, por lo cual su función es almacenar la glucosa y distribuirla a los órganos que lo necesitan
(empezando por el sistema nervioso) cuando estos la requieren.

La insulina y el glucagón son muy importantes ya que la primera activa los procesos que ocurren
en la post-ingesta, mientras que la segunda activa los procesos que ocurren en los periodos inter-
alimentarios, de actividad física, de ayuno y de sueño. Esta es una regulación coordinada es decir
que la activación de unos procesos inactivan los otros.

Para hablar de metabolismo de los carbohidratos es importante hablar de su digestión, los

principales polisacáridos que ingerimos son almidón y glucógeno, los principales disacáridos son
sacarasa, lactosa y los principales monosacaridos son glucosa, fructosa y galactosa. La digestión de
estos polisacáridos se da inicialmente en la boca por la amilasa salivas(Actúa sobre el almidón) ya
que trabaja a un pH cercano a 7, esta enzima se desactiva en el estómago, y la digestión vuelve a
darse en el intestino delgado(duodeno) mediante la acción de la amilasa pancreática que hidroliza
almidón a maltosa, isomaltosa y glucosa, esta digestión tiene como producto final
disacáridos(como la maltosa) y monosacáridos, estos últimos son absorbidos de diversas maneras
y los disacáridos son hidrolizados por disacaridasas embebida en la membrana plasmática de los
enterocitos finalmente los monosacáridos entran al enterocito. La lactosa y sacarosa se digieren
por la lactasa y sacarasa.

Cuando entra la glucosa a la sangre generando una hiperglicemia fisiológica esta debe entrar a los
tejidos para que sea procesada por las diferentes rutas existentes, esto se da gracias a los diversos
canales(generalmente denominados GLUT) que pueden transportar la glucosa, estos canales
tienen una característica muy interesante y es que existen de diversos tipos estrechamente
relacionados con el órgano en el que se encuentran y además los GLUT son parcialmente
saturables. La glucosa entra del lumen al enterocito por transporte activo secundario mediante el
uso del gradiente electroquímico del sodio, esto mediante el simporte SGLT1, debido a la entrada
de sodio en la parte basal del enterocito habrá una bomba sodio potasio para mantener el
gradiente, SLGT1 también transportara glucosa; del torrente sanguíneo al resto de los órganos
entra por difusión facilitada mediante los GLUT a excepción del riñon(SGLT2).

Hay 5 tipos de GLUT, los cuales se pueden clasificar de muchas formas(por su km por su ubicación,
por su dependencia de insulina etc..) sin embargo la más importante es la clasificación por la
dependencia o no dependencia de insulina, esto estará dado por el órgano en el cual se
encuentren, si el glut se encuentra en un órgano no insulino dependiente(eritrocito, cerebro,
glándula supra-renal) o en un órgano regulador de glicemia(hígado, intestino riñón y panceras)
será no insulinodependiente; mientras que el glut será insulino dependiente si es esta un tejido
insulino dependiente(adipocito, miocito, corazón). El Glut 5 será el encargado de pasar fructosa
del lumen al enterocito, tendrá una km baja; el glut 1 y 3 estarán en todos los órganos, sin
embargo en mayor medida en los tejidos no insulino dependientes, tendrán una km baja; el glut 4
estará en los tejidos insulino dependientes tendrá una km baja; el glut 2 estará en los tejidos
reguladores(principalmente hígado) y en la parte basal del enterocito, tendrá una km alta.

Teniendo en cuenta que los glut 1 y 3 siempre están activos ya que los tejidos que los contienen
requieren todo el tiempo de glucosa(principalmente el cerebro) se entiende su baja km; sin
embargo la del glut 4 no es tan clara, ya que esta en tejidos que no requieren de glucosa
permanentemente y pueden utilizar otros combustibles, la km baja se explica debido a que estos
están en endosomas dentro de la célula cuando los endosomas se fusionan con la
membrana(producto de la acción de la insulina) y deben tener una baja km para regular la
hiperglicemia fisiológica causada por la post-ingesta; por otro lado los glut 2 tienen km alta ya que
los tejidos reguladores de glicemia no deben absorber más glucosa que los noinsulino
dependientes ya que son estos últimos los que requieren de glucosa de manera primordial.

En la post-ingesta se secreta insulina para permitir la entrada de glucosa a los diferentes tejidos, y
se favorecen tres procesos la glicolisis, la glucogénesis y la vía de las pentosa fosfato. Lo primero
que debe suceder es la activación de la glucosa, para eso esta debe fosforilarse mediante la acción
de una hexoquinasa en su carbono 6, esta activación tiene diversos efectos, el primero es que la
glucosa se vuelve metabólicamente activa pro lo cual podrá realizar cualquiera de los 3 procesos
que puede realizar; por otro lado, la glucosa-6-fosfato(G6P) no es reconocida por los glut por lo
cual no va a salir de la célula. Los tres pasos que puede tomar la g6p es la glicolisis, la vía de las
pentosa fosfato y la glucogénesis.

Existen varios tipos de hexoquinasas(I, II, III y IV) siendo la I y la IV las más importantes, la I se
encuentra presente en todos los órganos y tiene una km baja(trabaja en condición de
hipoglicemia), además es saturable, por otro lado la IV(también llamada glucoquinasa) tiene una
km alta por lo cual trabaja a concentraciones de glucosa elevadas y sirve de soporte para la I
cuando esta se encuentra saturada

La glicolisis es un proceso catabólico irreversible que consta de 10 reacciones, 5 de las cuales

pertenecen a la fase de preparación(nombrada así debido a que consume ATP) y otras 5
pertenecientes a la fase de producción(se produce ATP). La primera reacción es la activación de la
glucosa por medio de la hexoquinasa pasando de glucosa a g6p(fosforilación), esto mediante el
uso de una molécula de ATP. La segunda reacción es una isomerización por parte de la
fosfohexosa isomerasa pasando a fructosa-6-fosfato. La tercera reacción es una fosforilación por
parte de la fosfofructoquinasa que genera fructosa-1,6-bifosfato, para esto se usa una molécula
de ATP. La cuarta reacción es un desdoblamiento o rompimiento por parte de la aldolasa que
genera dos moléculas de tres carbonos: gliceraldehido-3-fosfato y dihidroxicetona fosfato de las
cuales solo el gliceraldehido-3-fosfato es el único que puede seguir la via de la glicolisis mientras
que la dihidroxicetona se va a la lipogenesis, por esto la quinta reacción es una isomerización entre
estos dos compuestos por parte de la triosa fosfato isomerasa. La sexta reacción es una oxidación
y fosforilación por parte de la gliceraldehido-3-fosfato deshidrogenasa generando 1,3-
bifosfoglicertato y un NADH, para esto se obtiene el grupo fosfato de fosforo inorgánico. La
séptima reacción es una fosforilación a nivel de sustrato por parte de la fosfoglicerato quinasa
generando 3-fosfoglicerato y ATP, esta reacción es importante además de generar ATP ya que su
negativa energía libre se acopla a lo positiva de la sexta reacción. La octava reacción es una
isomerización por parte de la fosfoglicerato mutasa generando 2-fosfoglicerato. La novena
reacción es una deshidratación por parte de la enolasa que genera fosfoenolpiruvato y una
molécula de H2O. La décima reacción es una fosforilación a nivel de sustrato por parte de la
piruvato quinasa generando piruvato y una molécula de ATP. Este proceso va a ocurrir en todos
los tejidos.

Es importante tener en cuenta que de la reacción 6 para adelante son dos los compuestos
generados por cada reacción por lo cual en global se utilizarían 2 ATP y se producirían 2 NADH y 4
ATP. También es importante saber que debido al valor tan negativo de la energía libre de gibbs son
reacciones irreversibles, mientras que las demás tiene un valor cercano a uno o altamente
positivo, en el caso de estas últimas(valor altamente positivo) se pueden llevar a cabo debido a
que los productos se utilizan de manera rápida generando que a nivel fisiológico el equilibrio se
torne hacia la izquierda generando un valor de energía cercano a 0 o incluso negativo.

El piruvato producido en la glicolisis puede tener tres vías que se escogen según los
requerimientos metabólicos de la célula, en caso de esta requerir energía el piruvato pasa a la
respiración celular(oxidación), en caso de estar en condiciones anaerobias el piruvato pasa a la
formación de lactato lo cual es importante ya que es paso oxida el NADH a NAD permitiendo que
la glicolisis no se detenga, además el lactato vuelvo a convertirse en glucosa mediante el ciclo de
cori, finalmente el piruvato puede dirigirse a la síntesis de aminoácidos (alanina específicamente).

La glicolisis se alimenta por la glucosa que ingerimos, por la gluconeogénesis, por la glucogenolisis
y por la entrada de los demás azucares de la dieta en el proceso aquí la fructosa pasa a fructosa-6-
fosfato, la manosa también sufre este mismo cambio, y la galactosa pasa a glucosa-6-fosfato
integrándose así en la glicolisis.

En la vía de las pentosa fosfato se puede dividir en su fase oxidativa(g6p a pentosas) y no

oxidativa(pentosas a g6p), la glucosa-6-fosfato sufre diversas reacciones: la primera reacción es el
paso de g6p a 6-fosfogluconato por la glucosa-6-fosfato deshidrogenasa(G6PDH) liberando una
molécula de NADPH; la segunda reacción es una descarboxilación oxidativa mediada por la 6-
fosfogluconato deshidrogenasa que genera ribulosa-5-fosfato y una molécula de NADPH; la
tercera reacción es una isomerización pro parte de la fosfopentosa isomerasa que genera ribosa-5-
fosfato. El NADPH se utiliza para la síntesis de ácidos grasos y para mantener elevada la
concentración de glutatión reducido(mediante la acción de la glutatión reductasa) que es un
importante anti-oxidantee del cuerpo. La ribosa se puede utilizar como precursora de coenzimas y
nucleótidos. La ribulosa-5-fosfato en lugar de convertirse en ribosa, puede volver a ser g6p
mediante la acción de una transaldolasa y una transcetolasa de manera no oxidativa, en esta vía 6
pentosas se convierten en 5 hexosas. Que la g6p tome la vía de las pentosas fosfato o la glicolisis
depende de la concentración de NADP en la célula y de los requerimientos de esta. Este proceso
va a ocurrir en todos los tejidos pero la importancia de sus productos variara entre los tejidos.

La glucogénesis es la síntesis de glucógeno para esto la gulocosa-6-fosfato debe sufrir ciertas

modificaciones que le permitan polimerizarse en glucógeno. La primera reacción es una
isomerización pro parte de la fosfoglucomutasa que genera glucosa-1-fosfato, posteriormente
esta glucosa se una a un uridin difosfato(UDP) que proviene de UTP mediante la acción de la UDP-
glucosa pirofosforilasa que además genera un pirofosfato(Fosfato del UTP y de la glucosa-1-
fosfato) que es hidrolizado en una reacción altamente exergonica que vuelve favorable el proceso
de glucogénesis. La UDP-glucosa va a ser el sustrato de la glucógeno sintasa que va a generar
enlaces alfa-1,4 entre las glucosas, además la enzima ramificante también actúa en el proceso
formando enlaces alfa-1,6, ara esto la enzima ramificante toma 6 o 7 residuos de glucosa de una
cadena en crecimiento y los pega más atrás de la misma cadena o en otra generando una nueva
ramificación; estas ramificaciones son importantes ya que aumenta la solubilidad del glucógeno y
aumenta la cantidad de extremos no reductores por los cuales va a romper la glucógeno
fosforilasa en la glucogenolisis o por lo cuales va a apolimerizar la misma glucógeno sintasa. Esta
síntesis de glucógeno no se da de novo, se requiere de una cebador que en este caso es la proteína
glucogenina que es la proteína encargada de generar una cadena de 8 glucosas a partir de las
cuales la glucógeno sintasa toma el mando y empieza la glucogénesis, la glucogenina queda
inmersa en la molécula de glucógeno(unida al único extremo reductor de la misma) por lo cual en
la glucogenolisis estas vuelven a quedar habilitadas para cuando se requiera nuevamente realizar
glucogénesis. Este proceso ocurre principalmente en el hígado(donde el glucógeno llega a ser el
10% del peso del órgano) y en los músculos esqueléticos.

En los periodos inter-alimentarios, el ayuno, el sueño y la actividad física se favorece la

gluconeogénesis y la glucogenolisis y la glicolisis(dando paso a la respiración celular en los tejidos
donde no ocurre la gluconeogenesis), en este caso se secretan diversas hormonas tales como el
glucagón, la adrenalina, la noradrenalina y el cortisol que favorecen estos procesos catabólicos.

La glucogenolisis es la degradación de glucógeno a glucosa-6-fosfato en el musculo y a glucosa en

el hígado, en este caso la glucógeno fosforilasa rompe los enlaces alfa-1,4 generando glucosa-1-
fosfato, cuando la glucógeno fosforilasa está a 4 glucosas de una ramificación se detiene y la
enzima desramificante rompe la ramificación y la pega a la cadena mediante un enlace alfa 1,4
generando que la glucógeno fosforilasa pueda continuar, la glucógeno-1-fosfato es convertida en
glucosa-6-fosfato por la fosfoglucomutasa que pasa a vía glicolitica en el musculo y en el hígado la
glucógeno-6-fosfatasa la convierte en glucosa que sale a la sangre elevando los niveles de glucosa
sanguínea(aliviando la hipoglicemia fisiológica), es importante tener en cuanto que el hígado
obtiene su energía principalmente a partir de la beta-oxidación de ácidos grasos por lo cual su
función con la glucosa es almacenarla y repartirla, además de por si todos lo que digerimos va al
hígado y este se encarga de su distribución.

La gluconeogénesis es como realizar el inverso de la glicolisis, se define como la formación de

glucosa a partir de compuestos no glucidicos como el piruvato(y muchos otros intermediarios del
ciclo de Krebs que pueden pasar a oxalacetato), lactato, glicerol y aminoácidos. En este proceso las
reacciones que eran irreversibles en la glicolisis se revierten mediante los conocidos rodeos, en los
cuales una enzima diferente realiza la reacción contraria de manera igualmente irreversible; en el
caso de la piruvato quinasa, la piruvato carboxilasa y la fofoenolpiruvato carboxiquinasa realizan
la reacción opuesta mediante le uso de 2 ATP y 2 GTP; en el caso de la fosfofructoquinasa la
fructosa 1,6-bifosfatasa cataliza la reacción inversa; en el caso de la hexoquinasa la glucosa-6-
fosfatasa cataliza la reacción inversa. Este proceso se da en hígado principalmente, y en menor
medida en riñón y mucosa intestinal, esto debido a que son estos los tejidos que poseen glucosa-
6-fosfatasa, a partir de aquí esta glucosa se libera en el torrente sanguíneo y viaja a los lugares que
la requieren debido a la hipoglicemia ya que la glucosa es su única o principal fuente de energía
como el cerebro, los eritrocitos, las gonadas, la medula renal y los tejidos embironarios. Este
proceso es metabólicamente costoso(consume 4 ATP, 2 GTP y 2 NADH) sin embargo es necesario
para los tejidos mencionados anteriormente además de ser de vital importancia para los pacientes
diabéticos.

El lactato pasa a gluconeogénesis por el ciclo de cori mediante el cual se convierte en piruvato y
pasa a g6p; el glicerol pasa a dihidroxicetona que posteriormente se convierte en gliceraldehido-3-
fosfato entrando en la gluconeogénesis; el piruvato se convierte en oxalacetato dentro de la
mitocondria este se convierte en malato por la malato deshidrogenasa, el malato sale de la
mitocondria donde se reoxida a oxalcetato, aquí la PEP carboxiquinasa lo convierte en fosfoenol
piruvato; los aminoácidos se convierte en piruvato mediante las reacciones de transaminación.

La regulación del metabolismo de carbohidratos se da en enzimas especificas en cada proceso, en

el caso de la gluconeogénesis y la glucolisis son las 3 enzimas de cada proceso que lo hacen ser
irreversibles las que participan en los rodeos, en el caso de la glucogenolisis y la glucogeneisis es la
glucógeno sintasa y la glucógeno fosforilasa respectivamente, en la vía de las pentosa fosfato es la
G6PDH, estas se pueden regular por modulación covalente(fosforilación activa en procesos
catabólicos, desfoforilación en procesos anabólicos) generalmente dada por señalización
celular(hormonas) por modulación aloesterica y por modulación de la síntesis y degradación de las
enzimas(también generalmente bajo señalización hormonal).

Las hormona que regulan estos procesos en el caso de la post-ingesta es la insulina que actúa
principalmente por modulación covalente de las enzimas como de factores de transcripción que
activan o inhiben la transcripción de ciertos genes, esta hormona activa procesos anabólicos a
excepción de la glucolisis que, junto con la beta oxidación de grasos, otorga la energía necesaria
para estos procesos. En el caso de los periodos inter-alimentarios y demás se secreta
principalmente glucagón que actúa inactivando lo que activa la insulina y activando lo que esta
misma inactiva, de igual manera la adrenalina y la noradrenalina favorecen los proceso
anabólicos(principalmente mediante el aumento en la concentración de AMPc), además el cortisol
también actúa en estos periodos de manera crónica, es decir que su acción es más lenta pero más
duradera(ya que tiene una vida media más larga) esto debido a que actúa a nivel nuclear no a nivel
citosolico.
La glicolisis y la gluconeogénesis están reguladas de manera coordinada, es decir que cuando una
se activa la otra se inactiva. La hexoquinasase inhibe por la glucosa-6-fosfato, el acetyl-CoA y el
ATP mientras que se activa por ADP y la insulina aumenta su síntesis; la glucosa-6-fosfatasa se
activa por el AMPc y su síntesis se ve activada por el glucagón y disminuida por la insulina. La
fosfofructoquinasa(PFK1) y la fructosa 1,6-bifosfatasa(FBasa1) se regulan recíprocamente, la PFK1
se activa por el AMP, ADP, fructosa-2,6-bifosfato(cantidad regulada por insulina y glucagón) e
insulina, mientras que la inhiben los ácidos grasos de cadena larga, el ATP, el citrato, el
glucagón(modulación covalente); la FBasa1 se activa por el citrato y el glucagón, y se inhibe por la
fructosa-2,6-fbiosfato y por la insulina(a nivel se síntesis). La piruvato quinasa se inhibe por los
ácidos grasos de cadena larga, la alanina y el glucagón(modulación covalente) mientras que se
activa por fosfoenolpiruvato y por fructosa-1,6-bifosfato; la piruvato carboxilasa se inhibe por ADP
y se activa por Acetyl CoA; la PEP carboxiquinasa se activa por la insulina y se inhibe por el
glucagón por modulación covalente en ambos casos.

La glucogénesis y glucogenolisis están regulados manera recíproca también principalmente por

acción hormonal, ya que tanto la fosforilasa como la sintasa tienen una forma activa(a) y una
forma inactiva(b) que se da por la fosforilación o desfosforilacion de estas proteínas. En el caso de
la glucógeno sintasa esta se encuentra inactiva debido a la fosforilación debida a la GSK3, la
insulina inactiva la GSK3 permitiendo que la glucógeno sintasa se desfosforile por la PP1 y pueda
realizar su actividad, además la PP1 también se ve activada por la glucosa-6-fosfato y por la
glucosa. En el caso de la glucógeno fosforilasa esta se encuentra fosforilada en su forma activa(a)
esta activación se da por una quinasa dependiente de AMPc(PKA) la PKA se activa a altas
concentraciones de AMPc y de inactiva a bajas concentraciones de AMPc; además la PP1 es la
encargada de desfosforilar a la fosforilasa por lo cual el glucagón la inactiva, mientras que la
insulina la activa.

La G6PDH se regula de manera covalente por la carga energética y por el requerimiento de NADPH
de la célula por lo cual esta enzima se activa por el ATP y por el NADP mientras que se inactiva por
el NADPH y por el ADP y AMP.

Lipidos

El metabolismo de lípidos es muy importante en el hígado y en el corazón ya que esta es su

principal fuente de energía, en el musculo en reposo sucede lo mismo, o cuando se está en
inanición donde la glucosa a nivel muscular es baja y se obtiene energía a partir de los lípidos, de
igual forma en la corteza suprarrenal es muy importante. En este caso los adipocitos van a ser los
principales encargados de almacenar los lípidos y en menor medida la corteza adrenal y las
gónadas.

La insulina y el glucagón son muy importantes ya que la primera activa varios de los procesos que
ocurren en la post-ingesta, mientras que la segunda activa varios de los procesos que ocurren en
los periodos inter-alimentarios, de actividad física, de ayuno y de sueño. Esta es una regulación
coordinada es decir que la activación de unos procesos inactivan los otros.
La digestión de los lípidos empieza en la boca mediante la acción de la lipasa lingual,
posteriormente en el estómago actúa la lipasa gástrica, cuando el quilo acido entra al duodeno se
secreta la hormona secretina que favorece la secreción de jugo pancreático con gran cantidad de
bicarbonato para neutralizar el pH además este jugo gástrico viene con las enzimas pancreáticas
como la lipasa pancreática(que requiere de la colipasa para poder actuar ya que esta le permite
atravesar la capa de las sales biliares), colesterol esterasa y fosfolipasas(Fosfolipasa A2,
lisofosfolipasa), posterior a la neutralización se secreta la hormona colecistina que genera la
secreción de sales biliares(almacenadas en la vesículas biliar) y la secreción de más jugo
pancreático con las enzimas además de enlentecer el paso de material del estómago al duodeno
permitiendo un mayor tiempo de digestión. En este punto actúan las sales biliares
emulsificando(haciendo soluble) las grasas actuando como jabones, esto genera pequeñas gotas
lípidos que son digeridos por las enzimas; simultáneamente inicia la formación de
micelas(monocapas lipídicas) que favorecen la absorción de los lípidos en el enterocito ya que este
está recubierto por una capa de agua por lo cual se requiere del recubrimiento polar para la
entrada de las micelas. Al entrar al enterocito los productos de la digestión(ácidos grasos,
monoacilgliceroles, colesterol y glicerol) vuelven a esterificarse, sea en triacilgliceridos o en
esteres de colesterol, esta resterificacion esta catalizada por las acyl transferasas, a medida que se
forman estos compuestos junto con el colesterol libre y las apolipoproteinas se van formando los
quilomicrones(lipoproteína corporal con la más baja densidad cuyo principal componente son los
triacilgliceroles) los cuales viajan por los canales quilíferos hasta el sistema linfático donde son
transportados a la vena subclavia izquierda entrando así al torrente sanguíneo para dirigirse a los
capilares de los musculos(y mamario en épocas de lactancia) y el tejido adiposo, en estos capilares
se encuentra la lipoproteína lipasa que se activa por la apoCII(apolipoproteina del quilomicrón
activada por la insulina) digieren los triacilgliceridos y los esteres de colesterol liberando ácidos
grasos y glicerol, los ácidos grasos en el musculo entran a la B-oxidación mientras que en el tejido
adiposo entran a la litogénesis, el glicerol por su parte se dirige al hígado donde es utilizado para la
litogénesis. Después de la digestión de estos componentes del quilomicrón quedan las
apolipoproteinas y el colesterol tanto libre como esterificado, esto es el remanente de quilomicrón
que se dirige al hígado donde es endocitado para reciclar sus componentes. Cuando hay fallas en
la digestión o absorción de lípidos se produce la esteatorrea(heces con grasa).

Es importante saber que las enzimas utilizadas en el momento en que van en los conductos hacia
el duodeno están inactivas, es decir son zimogenos, y mediante el pH óptimo de las mismas se
activan. También cabe resaltar que en el caso del colesterol el libre no sufre digestión alguna son
los esteres de colesterol los que se hidrolizan. También en caso de que la ingesta de
triacilgliceridos sea mayor a la necesaria estos no se hidrolizan completamente por la lipoproteína
lipasa, dirigiéndose al hígado sea para lipogenesis, beta oxidación o cetogenesis. Por otro lado, los
lípidos se pueden obtener de forma exógena(dieta) y endógena(síntesis de novo) en la forma
exógena es muy importante consumir los ácidos grasos esenciales(linoleico y alfa-linoleico) que
son aquellos ácidos grasos poliinsaturados que no podemos producir de forma endógena.
Finalmente es importante saber que los lípidos son al forma más eficiente(en cuanto a cantidad)
de almacenamiento de energía(3800J/g) esto debido a que a diferencia del glucógeno se almacena
de forma anhidra(deshidratada).

Los procesos que predominan en la post-ingesta son la lipogenesis y la esteroido génesis. La

lipogenesis se resume en la generación de todos aquellos compuestos que contienen ácidos grasos
por lo cual aquí se incluye la síntesis de triacilgliceridos para cual inicialmente se sintetizan sus
precursores(ácidos grasos y glicerol), la síntesis de fosfolípidos y esfingolipidos. Por otro lado la
esteroido génesis es la síntesis de novo de colesterol y derivados del mismo (tromboxanos,
prostaglandinas, prostaciclinas, leucotrienos y hormonas esteroideas). Es importante saber que
para la producción endógena de lípidos el esqueleto del carbono proviene principalmente de la
glucosa.

La síntesis de novo de grasos, consiste en la generación de acidos grasos apartir de acetyl CoA,este
proceso se da cuando la carga energética esta elevada y la glucogénesis esta lenta, por lo cual el
acetyl CoA se dirige hacia vías alternativas a la glicolisis en este caso la lipogenesis. Lo primero que
debe recurrir en este caso es que el acetyl-CoA salga de la mitocondria, para esto este se condensa
con oxalacetato dando citrato, el citrato sale de la mitocondria donde la citrato liasa(que utiliza
ATP) lo rompe en Acetyl CoA y en oxalacetato. Este acetyl coa entra a la síntesis de novo de ácido
graso donde participan 2 enzimas la acetyl CoA carboxilasa(ACC) y la ácido graso sintasa(FASI),
esta última es muy importante ya que es una única cadena de aminoácidos que contiene muchas
subunidades que llevan a cabo reacciones de este proceso, entre estas la más importante es la
proteína transportadora de acilo(ACP) ya que es sobre la cual se sintetiza el ácido graso. El acetyl
CoA(C2) se convierte en malonil CoA(C3) por la ACC que utiliza biotina como coenzima para pasar
el carbono del CO2 en forma de HCO3- al acetil, después de esto el grupo acetil de un acetyl CoA
se une a la β-cetoacetil ACP sintasa de igual forma el grupo malonil del malonil CoA se une a la
ACP, ambas reacciones están catalizadas por la malonil/acetil CoA-ACP transferasa. En este punto
se da inicio a las 4 fases de la síntesis de novo de ácidos graso, la primer fase es una condensación
entre el grupo acilo y el grupo malonil formando acetoacetyl-ACP(C4) por la acción de la enzima β-
cetoacetil-ACP sintsa, que libera una molécula de CO2(el acetyl CoA(C2) pasa a malonil(C3) ya que
esta descarboxilación junto con el uso de ATP hace favorable este proceso). El segundo paso es
una reducción que produce β-hidroxibutiril-ACP por la acción de la enzima β-cetoacetil reductasa
oxidando el NADPH. El tercer paso es una deshidratación que genera butenoil-ACP por la enzima
β-hidroxiacil-ACP deshidratasa que produce H2O. El cuarto paso es una reducción(saturación) de
doble enlace que forma butiril-ACP por la enzima enoil-ACP reductasa oxidando el NADPH. Así el
producto final es un ácido graso de 4 carbono el ácido butírico que se encuentra en la ACP, este es
transferido a la β-cetoacetil-ACP sintasa dejando libre la ACP para que se una otro malonil CoA
proveniente de la ACC, cuando se une el malonil se repiten los 4 pasos alargando de a 2 carbonos
el nuevo ácido graso, estos ciclos se repiten hasta que se forma el ácido palmítico(C16). El
oxalacetato que quedo en el citosol pasa a malato por acción de la malato
deshidrogenasa(Consume un NADH) y a partir de aquí el malato puede tomar 2 vías, la primera es
entrar la mitocondria y volver a oxalacetato por la malato deshidrogenasa(produce NADH) esta
vía se toma en condiciones energéticas bajas; la segunda vía es convertirse en piruvato por la
enzima malica(produce NADPH) este piruvato entra a la mitocondria y se introduce en la
mitocondria convirtiéndose en oxalacetato por la piruvato carboxilasa(consume ATP), el NADPH
producido por la enzima málica es utilizado para la síntesis de ácidos grasos, ya que le NADPH que
produce las vías de las pentosa fosfato se dirige principalmente al glutatión reducido (es
interesante ver como NADPH parece ser el cofactor de procesos anabólicos, mientras que NADH el
de catabólicos).

Este producto final(ácido palmítico) puede dirigirse directamente a los demás procesos de la
lipogenesis o puede sufrir una elongación(sistemas de elongación en REL y mitocondria) y
desaturacion(acil graso-CoA desaturasa) generando ácidos grasos de cadena larga, o ácidos grasos
monoinsaturados(doble enclace en el C9). Debido a que no se pueden introducir insaturaciónes en
carbonos más allá del C9 el ácido linoleico y alfa-linoleico son esenciales, a partir de estos se
pueden producir otro ácidos grasos poliinsaturados o se puede producir el ácido araquidónico de
gran importancia biológica. A partir del ácido araquidónico se puede formar la prostaglandina
H2(PGH2) mediante la acción de la enzimas COX(tiene actividad ciclooxigenasa(produce PGG2) y
peroxidasa(produce PGH2 a partir de PGG2)) a partir de la PGH2 se pueden sintetizar otras
prostaglandinas o los tromboxanos(tromboxano sintasa) esta vía se conoce como ruta cíclica,
existe otra ruta, la lineal, que convierte el araquidonato en leucotrienos(lipooxigenasas). Es
importante tener en cuenta que el ácido palmítico puede venir de fosfolípidos para entrar en estas
vías, para esto se utiliza la fosfolipasa A2 que lo separa del fosfolípido.

Una vez se han formado los ácidos grasos estos pueden participar de la lipogenesis en la formación
de triacilglicaroles o de fosfatidilgliceroles, sea cual sea la ruta se requiere de ácidos grasos y de
glicerol-3-fosfato, este último puede provenir de dos lugares, (1) de la dihidroxicetona fosfato de
la glicolisis que se convierte en glicerol-3-fosfato por la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa, (2) del
glicerol que entro al hígado y al riñón después de la digestión del quilomicrón se fosforila por la
glicerol quinasa. El glicerol-3-fosfato se esterifica con dos ácidos grasos(en C1 y C2) generando el
ácido fosfatidico, a partir de este compuesto se toman 2 vías, la primera es hidrolizar el grupo
fosfato mediante la ácido fosfatidico fosfatasa formando 1,2-diacilglicerol que esterifica con otro
ácido graso formando los triacil glicéridos; la segunda vía es la síntesis de fosfolípidos, para esto se
utiliza CDP que se une al ácido fosfatidico generando CDP-diacilglicerol o a al grupo polar(en este
caso el ácido fosfatido pasa a diacilglicerol), sea cual sea el que se una al CDP se condensa con el
otro dando lugar a los diferentes glicerofosfolipidos(fosfatidilcolina, Fostadiletanolamina y
cardiolipina, la fosfatidilserina se obtiene a partir de los dos primeros). Los plasmalogenos toman
una ruta similar pero su enlace doble es introducido por una oxidasa de función mixta. Una ruta
alternativa que pueden tomar los ácidos grasos en litogénesis va a ser el condensarse con serina y
sufrir ciertas reacciones para formar ceramida(que contiene esfingosina) para sintetizar la
esfingomielina y los glucolipidos(Como los cerebrosidos).

La esteroidogenesis consiste en la síntesis endógena de colesterol este proceso consta 4 fases. La

primera fase consta de tres pasos, el primero consiste en la condensación de dos acetyl CoA
formando que forman acetoacetyl CoA(tiolasa), a este se le une otro acetyl CoA generado HMG-
CoA(HMG-CoA sintasa), finalmente se produce mevalonato(C6) por la HMG-CoA reductasa. La
segunda fase consiste en la formación de 2 isoprenos activados(C5) a partir de una seria de
reacciones(tres fosforilaciones, una desfosforilación y una descarboxilación) se forma isopentenil
pirofosfato, el cual se isomeriza para formar dimetilali pirofosfato. La tercera fase consiste en una
serie de condensaciónes, la primera es una condensación cabeza-cola de los dos isoprenos
activados formando el geranil pirofosfato(C10), posteriormente el geranil se condensa cola-cabeza
con un isopentenil pirofosfato formando el farnesil pirofosfato(C15). Finalmente se condensan
cabeza con cabeza(eliminan grupos pirofosfato) dos farnesil pirofosfato formando el
escualeno(C30). La 4 fase consiste en la ciclación del escualeno formando lanosterol, el cual
mediante 20 reacciones(que incluyen 3 descarboxilaciónes sucesivas) forma finalmente el
colesterol(C27). Este colesterol puede dirigirse a la membrana plasmática, a la síntesis de ácidos
biliares, a la síntesis de Vitamina D3, se puede esterificar por medio de la acil-CoA acil
transferasa(ACAT) permitiendo su almacenamiento y transporte, o se puede convertir en
hormonas(esteroides) mediante la rotura de la cadena lateral y la oxidación del colesterol(las
principales hormonas son los glucocorticoides(cortisol), mineralocorticoides(aldosterona) y
hormonas sexuales).

En los periodos de inanición(inter alimentarios, ayuno, actividad física) predomina la lipolisis, en

este caso los ácidos grasos que se oxidan se pueden obtener de tres fuentes, de la dieta, de las
grasa almacenadas y de las grasas sintetizadas en órganos que van a otro. Es decir en periodos de
inanición los sistemas utilizaran sus propias reservas de triacilgiceridos sin embargo esta no es
mucha por lo cual se empiezan a hidrolizar los triacligliceridos de los adipocitos y estos ácidos
grasos se dirigen a las células que lo requieran. El glicerol resultante también puede fosforilarse
por la glicerol quinasa y convertirse en dihidroxicetona que al isomerizarse en gliceradehido-3-
fosfato entra en la glucolisis generando energía.

Lo primero que ocurre en el ácido graso es la activación de la lipasa sensible a hormonas por parte
de las hormonas de la inanición(glucagón, adrenalina y cortisol), además de la fosforilación de la
peilipina(proteínas que recobren las gotas de lípidos impidiendo el acceso a estas gotas pro partes
de las enzimas) que generan su separación; esta enzima hidroliza los triacilgliceridos de los
adipocitos, los ácidos grasos que se producen salen del adipocito al torrente sanguíneo donde son
transportados a diversos tejidos por la albumina sérica. Cuando los acidos grasos entran a las
células diana son activados por la acil-CoA sintetasa que utiliza ATP generando el acil-CoA, sin
embargo este compuesto no puede entrar a la mitocondria debido a la impermeabilidad de las
misma a compuestos con CoA, para esto se utiliza la carnitina, lo ´primero que sucede es la
transferencia del acil a la carnitina por la carnitina acil transferasa I en la membrana externa, la
carnitina entra al espacio intermembranal por difusión simple y entra a la matriz por un
transportador de carnitina, en la matriz la carnitina acil transferasa II transfiere el grupo acilo de la
carnitina a un CoA volviendo a formar el acil CoA. Ya dentro de la mitocondria empieza el proceso
de la beta-oxidación que consta de 4 pasos, se utiizara palmiotil-CoA como ejemplo ya que este es
el más común que se use. El primer paso consiste en pasar de palmiotil CoA a enoyl CoA por acción
de la acyl-CoA deshidrogenasa que genera un FADH2, esta enzima tiene tres isoenzimas que
actúan dependiendo de la longitud del acil-CoA y esta embebida en la membrana interna de la
mitocondria. El segundo paso consiste en una hidratación por parte de la enoyl CoA hidratasa que
genera β-hidroxiacil-CoA. El tercer paso es una deshidrogenación que genera β-cetoacetil-CoA por
acción de la β-hidroxiacil-CoA deshidrogenasa que genera NADH. El último paso es una tiolisis
donde el β-cetoacetil-CoA pierde dos carbonos en forma de Acetyl CoA por la acción de la acyl-
CoA acetil transferasa o tiolasa. Los productos finales de este ciclo son un ácido graso de 14
carbonos y un acetyl CoA, el ácido graso vuelve a entrar al ciclo perdiendo cada vez 2 carbonos
finalmente mediante la acción de 7 ciclos el ácido palmítico se convierte en 8 acetyl-CoA que
puede tomar diferentes vías, pero en el caso de la inanición se oxidara en la respiración celular a
menos de que esta se encuentre lenta por lo cual la acumulación de Acetyl-CoA se dirige a la
cetogenesis. Para realizar las cuentas de cuanta energía produce algo se debe tener en cuenta que
los FADH2 y los NADH se dirigen a la cadena transportadora de electrones produciendo 2ATP y
3ATP respectivamente, además el Acetyl-CoA genera 1 ATP en el ciclo de Krebs por lo cual se debe
sumar este ATP por cada acetyl CoA que se utiliza. Cada acetyl CoA produce 3 NADH y 1 FADH2 en
la respiración celular. En el caso de los ácidos graos insaturados se requieren dos reacciones
previas a la beta oxidación una isomerización y una reducción. Cuando el ácido graso tiene un
número impar de carbonos el último ciclo producirá acetil CoA y propionil CoA(C3) el cual
mediante una serie de reacciones formara succinil-CoA entrando al ciclo de krebs. La beta-
oxidación también se puede llevar a cabo en menor medida en los peroxisomas. El ATP producido
por la este proceso en inanición se utiliza en gran medida para la gluconeogénesis.

El metabolismo de cuerpos cetónicos ya que el cuerpo en todas las condiciones energéticas genera
cuerpo cetónicos, sin embargo su producción se ve aumentado en momentos de inanición como
una actividad física intensa o un ayuno muy prolongado, estos cuerpos cetónicos pueden ser
utilizados como combustible energético(cetolisis) en todos los tejidos diferentes al hígado(no
posee tioforasa), en periodos de inanición principalmente en el cerebro, musculo cardiaco, corteza
renal, gónadas, corteza adrenal se da la cetolisis; sin embargo, cuando la cetogenesis es superior a
la cantidad de cetolisis estos cuerpos se acumulan en sangre y al tener naturaleza acida
disminuyen el pH sanguíneo causando una acidosis metabólica.

La cetogenesis se da por la acumulación de acteyl-CoA, la formación de cuerpos cetonicos

comienza con la condensación de 2 acetil CoA genrenado acetoacetil CoA por acción de la tiolasa,
posteriormente este se condensa con otro acetil CoA formando HMG-CoA por la HMG-CoA
sintasa, posteriormente este compuesto se rompe formando acetoacetato(primer cuerpo
cetónico) y acetyl CoA por la HMG CoA liasa, el acetoacetato se puede convertir en
acetona(segundo cuerpo) por descarboxilación(acetoacetato descarboxilasa) la cual es eliminada
por vía respiratoria, el acetoacetato también puede convertirse(de manera reversible) en β-
hidroxibutirato por reducción(β-hidroxibutirato deshidrogenasa) oxidando un NADH. El β-
hidroxibutirato se dirige a tejidos extra hepáticos donde es internalizado y se da la cetolisis, en
esta se oxida el β-hidroxibutirato a acetoacetato(β-hidroxibutirato hidrogenasa) este compuesto
se activó uniéndose a CoA formando acetoacetil-CoA(β-cetoacil-CoA transferasa o tioforasa) el
CoA se obtiene del succinil-CoA del ácido cítrico, finalmente al acetoacetil-CoA por acción de la
tiolasa se convierte en 2 acetyl-CoA que entran al ciclo de Krebs.
En periodos de inanición prolongada los compuestos del ciclo de Krebs pasan a la gluconeogénesis,
por lo cual el acetyl-CoA generando una sobreproducción de cuerpos cetónicos; en los diabéticos
no se capta la glucosa disminuyendo la concentración de malonil-CoA(síntesis de ácidos grasos)
generando que se active el sistema de transporte de la carnitina, los ácidos grasos entran a la
mitocondria y el actyl-CoA se acumula porque los componentes del ácido cítrico se dirigieron ala
gluconeogénesis, favoreciendo la formación de cuerpos cetónicos. La acidosis está dada por el β-
hidroxibutirato y por el acetoacetato ya que a pH fisiológico está ionizado su grupo carboxilo
liberando protones.

La regulación de la lipogenesis y la lipolisis es en su mayoría reciproca(sobre todo a nivel

hormonal), en cuanto a la lipogenesis la ACC es la que regula todo el proceso esta enzima se activa
por la insulina y por la acumulación de citrato, mientras que se inhibe por los ácidos grasos de
cadena larga, por el glucagón y por el AMP(activa la AMPK que fosforila la ACC inhibiéndola), la
lipolisis por su parte está regulada por la lipasa sensible a hormonas en este caso el glucagón, la
adrenalina, el cortisol y el ACTH la activan al aumentar la concentración de AMPc que activa la PKA
que fosforila la lipasa activándola. También hay otra forma de regular estos procesos ya que los
acidos grasos en una celula pueden o dirigirse a lipolisis o a la lipogenesis, este proceso es la
activación o inactivación del sistema de transporte de la carnitina, este transporte está activado
cuando la concentración de malonil CoA es baja mientras que se inhibe cuando la concentración
de malonil CoA es alta, en resumidas cuentas depende de la actividad de la ACC. En cuanto al
metabolismo de cuerpos cetónicos su regulación está dada por la concentración de Acteyl CoA.
Por su parte la esteroidogénesis está regulada por la HMG-CoA reductasa principalmente, esta se
puede regular a nivel de transcripción por parte de la concentración de colesterol y nivel hormonal
ya que la insulina favorece su desfosforilación(activa) y el glucagón su fosforilación(inactiva),
además el colesterol activa la ACAT aumentando la esterificación del mismo para su
almacenamiento.

El transporte de ácidos grasos producto de la lipolisis como ya vimos se da por la albumina sérica,
sin embargo la mayoría de lípidos se transportan en las lipoproteínas, ya vimos el quilomicrón que
se genera en el enterocito y libera ácido graso y glicerol en tejidos extra hepáticos y su remanente
de colesterol se dirige al hígado. Las polipoproteinas se componen principalmente de
tracilgliceridos, colesterol libre y colesterol esterificado unido a apolipoproteinas, son estas
apolipoproteinas las que le dan la especificidad a las polipoproteinas ya que son estas las que son
reconocidas por los receptores de las células a donde se dirigen. Cuando la dieta contiene mas
ácidos grasos de los necesarios se convierten en triacilgliceridos en el higado y se almacena en
VLDL, de igual forma el exceso de glúcidos se dirigirá a la formación de estos compuesto, estas
polipoproteinas llevan estos lípidos del hígado al tejido adiposo y muscular donde se digieren de
igual forma que los quilomicrones, los remanentes de VLDL son las IDL que se dirigen al hígado y
se cargan de colesterol hepático salen del hígado en forma de LDL que contienen apoB 100, esta
apolipoproteina es reconocida en el tejido extra hepático y genera la endocitosis de la LDL, el
endosoma se dirige al lisosoma donde se degrada generando aminoácidos, ácidos y colesterol,
parte de los esteres de colesterol se dirigen al núcleo disminuyendo la expresión de los genes que
codifican para la síntesis de los receptores de LDL. Las HDL por su parte se sintetizan como
partículas discoidales(muchas proteínas pocos lípidos) en el hígado y estas se cargan de colesterol
extra hepático, no solo del interior de los tejidos sino también de los ateromas pegados a las
paredes de las arterias, formando las HDL a nivel plasmático, estas HDL se dirigen al hígado donde
el colesterol es liberado en forma de sales biliares. Cuando la concentración de LDL es muy alta el
nivel de colesterol absorbido es alto y la síntesis de receptores esta disminuida, por lo cual la LDL
se acumula en sangre y los macrófagos las reconocen como antígenos y las endocitan formando
una especie de jabón de difícil circulación que se paga a las paredes de las arterias dando paso a la
aterogenesis. Es importante saber que la apoCII(presente en quilomicrón y VLDL) son las que
activan la liproteina la lipasa, que la apolipoproteina E(presente en quilomicrón, IDL, y HDL) es la
que indica que las polipoproteinas deben ir al higado y que la apoB100(presente en LDL) es la que
se reconoce en la membrana de las células para ser endocitada, además en la LDL estará la LCAT
que es la encarga de transferir el colesterol a la lipoproteína.

ADN recombinante

Un clon es conjunto de organismos genéticamente idénticos que provienen de una única célula
progenitora a partir de reproducción asexual. Es importante que sea asexual ya que si es sexual
implica la combinación de materiales genéticos de dos organismos lo cual generaría organismos
con ADN diferente al progenitor. Para clonar un fragmento de ADN se puede utilizar la PCR, para
clonar fragmentos grandes como un gen utilizo bacterias grandes, y para clonar un organismo
entero se utiliza otra técnica como la que se uso con la oveja Dolly(reproductiva), también existe
una clonación terapéutica.

Hay varias formas en las cuales una información puede entrar a una bacteria: Conjugación que es
paso de ADN de una bacteria a otra(siendo estas dos de la misma especie y a través de los pili tipo
F) esta forma no se utiliza en clonación ya que esto implica combinación de 2 materiales genéticos,
además esta forma es la principal encargada de generar la resistencia a antibióticos, ya que
generalmente se transfieren elementos del plásmido, y es en este lugar donde se genera la
resistencia; Transformación que es captar ADN del medio(usualmente en condiciones fisiológicas
el ADN proviene de otra bacteria de la misma especie que sufrió lisis); transducción que es
transmitir la información genética por un bacteriófago(virus de bacteria), cuando un virus infecta
la bacteria pueden ocurrir dos cosas (1) el ciclo lisogenico en el cual el ADN viral se internaliza en el
de la bacteria y la bacteria al hacer fisión binaria duplica el ADN viral permitiendo la producción de
mas viruses(puede llegar a terminar en lisis), (2) el ciclo lítico en el cual ADN viral no se internaliza
en el de la bacteria sino que se queda aparte y utiliza la maquinaria de reproducción de la bacteria
para producir de manera rápida muchos virus causando inevitablemente lisis.

Para la clonación es necesario el uso de enzimas de restricción(endonucleasas de restricción tipo II

específicamente), estas son enzimas que cortan el ADN en secuencias palindromicas(se leen igual
en sentido 5´-3´ en ambas hebras), es corte se puede dar de manera lineal o de manera no lineal,
el primer corte genera extremos rombos mientras que le segundo genera extremos cohesivos. L
nomenclatura de las enzimas se da la siguiente forma: primera letra en mayúscula(genero del cual
proviene) siguientes dos letras en minúscula(especie de la que proviene) siguientes números y
letras(numero o tipo de enzima dentro de esa especie). Estas enzimas no están presentes en
humanos y hacen parte de un mecanismo de defensa de las bacterias contra los virus.

La digestión del ADN es el proceso mediante el cual se forma el ADN recombinante, el primer paso
en este proceso es que una misma enzima me corte tanto el inserto(ADN que pienso introducir)
como el vector(ADN en el cual voy a introducir el inserto), el segundo paso es el alineamiento de
los extremos mediante la formación de puentes de hidrogeno(este paso aplica para el ADN que
tenga extremos cohesivos no extremos rombos ya que estos ya están alineados) y el último paso
es la unión del inserto con el vector o llenado de nicks por parte de las ligasa. De esta forma se
genera el ADN recombinante o el ADN quimera.

El ADN recombinante ahora ha de amplificarse para lo cual se utilizan a las bacterias, para
introducir el ADN recombinante a las bacterias se realiza por transformación(plásmido) o por
transducción(fago), en el caso de la primera se replica y en el caso de la segunda se inicia el ciclo
lítico.

Hay ciertas características que debe cumplir la relación inserto-vector, la primera claramente es
que sean compatibles, la segunda es que el vector solo debe tener un OriC o Ori, otra es que
ambos fragmentos sean cortados por la misma enzima y que el corte en el vector no se en el
origen, la ultima es que no importa cuántos insertos se tenga solo debe haber uno de interés los
otros se pueden utilizar como reporteros. Es importante tener en cuenta que no siempre se da la
característica deseada por lo cual se deben realizar varias muestras o cultivos y seleccionar los que
cumplan con lo deseado.

La clonación se lleva a cabo en 6 pasos(nótese que estamos hablando de clonación de fragmentos

grandes de ADN o genes, mas no de un organismo que conllevaría pasos diferentes). El primer
paso es la selección del inserto, aquí se ha de determinar la especie de donde proviene el inserto,
determino que parte quiero clonar del ADN de esta especie, se debe conocer el tamaño del inserto
y se debe conocer la secuencias limitante del gen en ambos extremos(esto para poder seleccionar
las enzimas de restricción). El segundo paso es la elección del vector para esto debe seleccionar un
vector que se prolifere de la manera que deseo, y que puede soportar un inserto de la magnitud
del inserto que se escogió en el primer paso, además debo escoger un vector que se pueda cortar
una sola vez con la misma enzima de restricción que corta al inserto y este corte no puede darse
en el origen; es importante saber que los vectores son especie específicos por lo cual al escoger un
vector escojo que especie voy a utilizar para amplificarlo. El tercer paso es la digestión del ADN
que se da como se explicó arriba. El cuarto paso es insertar el vector a la célula por transformación
o transducción. El quinto paso es cultivar las células, es decir permitir que crezca el cultivo o que
las células se lisen(dependiendo del vector escogido). El sexto paso es la selección de los cultivos
con la característica deseada.

Existen diversos vectores, cuando pienso amplificar mi ADN recombinante en una bacteria puedo
utilizar un plásmido o un fago, en el caso de los plásmidos es conveniente que este tenga dos
marcadores(características que la célula huésped no presenta) y que el inserto me afecte una de
estas; en los fagos se utilizan aquellos del ciclo lítico por lo cual al seleccionar no se seleccionan
células sino calvas(círculos de lisis), estos vectores son muy útiles para insertos grandes. Existen
una especie de vectores llamados de vectores de expresión y otros de clonación, los vectores de
clonación son aquellos que tienen un inserto que lo único deseado es que se clone, mientras que
en los vectores de expresión lo deseado es observar la expresión del inserto permitiendo así
purificar proteínas, analizar la estructura de proteínas, producir grandes cantidades de proteínas
de importancia clínica, cultivar proteínas de parasito y virus para desarrollar vacunas.

En ocasiones se utiliza a la levadura como célula huésped ya que a pesar de ser eucariota tiene un
tipo de reproducción asexual, la gemación; además, la Saccharomyces cerevisiae es una levadura
que se utiliza en gran medida en la investigación razón por la cual se conoce todo su genoma(es
haploide tiene 17 cromosomas), no se conoce virus alguna que la infecte(por lo cual no va a haber
cambios en el ADN a causa de una infección), presentan plásmidos de un único tipo, además
permite generar transformaciones de sitio especifico permanentes. Al utilizar levadura se utilizan
diferentes vectores el primero es el plásmido bicatenario(50% se usa para replicación 50% para el
inserto), se utilizan secuencias de replicación autónoma ARS(fragmento de ADN con origen de
replicación de levadura) y se pueden usar también minicromosomas(se replican una vez por ciclo
celular) el cual es un ARS con el inserto unido a centrómero funcional.

Para la selección de los cultivos que tienen la característica deseada se pueden realizar diversos
procedimientos. El primero es sobre la caja de Petri, el cual se usa principalmente para comprobar
el efecto de un antibiótico sobre una bacteria. El segundo es la electroforesis que al analizar el
número y tamaño de los fragmentos permite identificar si se dio o no la característica deseada. El
tercero es por medio de sondas, lo que genera esto es una fluorescencia sobre el inserto o sobre la
característica deseada. El cuarto es la complementación funcional en el cual se ve si el cultivo
presenta la característica al analizar el fenotipo de los organismos. El último son las etiquetas. Este
proceso de clonación aquí explicado es el que se define como clonación molecular.

Este procesos de clonación permite crear organismos genéticamente modificados(OGM), o los

transgénicos, en las plantas se han hecho varios transgénicos(las frutas modificadas por ejemplo)
para las plantas no existen plásmidos que se conozcan por lo cual se utilizan virus y bacterias como
vectores. Esta técnica también se puede realizar en animales, generalmente para saber si funciono
o no la modificación genética se utilizan los llamados genes reporteros, que son genes pegados al
inserto de interés que otorgan un fenotipo fácilmente reconocible, por ende si este fenotipo se
observa indica que le inserto también se acoplo perfectamente y está produciendo la
característica deseada.

Al conocer donde cortan las enzimas de restricción y conocer la longitud del fragmento se pueden
realizar mapas de restricción, en estos se toma el fragmento como si fuera un circulo y se colocan
líneas entre donde estarían los cortes de restricción también rotulando la longitud que tiene cada
fragmento producto del corte. Estos mapas también se pueden realizar a partir de una
electroforesis donde se indique qué fragmento es producido por cada enzima y de cuantas kb es el
fragmento.
PCR

Es una técnica molecular que permite amplificar pequeños fragmentos de ADN, sus siglas
significan reacción en cadena de la polimerasa, ya que esto es exactamente lo que hace genera
muchas copias(aproximadamente mil millones en 30 ciclos). Esta técnica se lleva a cabo en
termociclador que varía las temperaturas permitiendo los diferentes pasos del ciclo.

Para llevar a cabo esta técnica se utiliza la Taq(Termus Aquaticus) polimerasa ya que esta tiene su
actividad optima en temperaturas elevadas. También es necesario conocer las secuencias finales
del fragmento que se desea replicar para diseñar los primers(oligonucleótidos de 15 nucleótidos
de ADN) se generan dos primers forward(3´-5´) y reverse(5´-3´), se necesita agregar elementos
necesarios para la acción de la polimerasa como los dNTPs, MgCl2(debido a que el Mg2+ es un
cofacotr esencial para la Taq), un buffer para no variar el pH ni las condiciones salinas y
dideoxinucleotidos(se agregan cuando se quiere detener la PCR ya que al no tener un OH en 3´no
permiten polimerizar o elongar).

Un ciclo consiste en elevar inicialmente la temperatura a 94°C para romper los puentes de
hidrogeno y separar las hebras(desnaturalización), posteriormente se baja la temperatura a 65°C
permitiendo la unión de los primers(hibridación) finalmente se sube la temperatura nuevamente a
72°C permitiendo la actividad optima de la Taq polimerasa(extensión). Estos ciclos se repiten para
amplificar el número de cadenas de manera exponencial. Aproximadamente a partir del tercer
ciclo esta el fragmento deseado en caso de no utilizar enzimas de restricción.

Hay varios tipos de PCR, la PCR en tiempo real me permite analizar la velocidad a la cual se replica
un fragmento determinado si hay hiper o hipoexpresión, la RT-PCR consiste en amplificar una
cadena de ARN, para esto se utiliza una transciptasa inversa que convierte el ARN en ADN y
posteriormente se dan los ciclos de la PCR regular.

Electroforesis.

La electroforesis es la técnica molecular a partir de la cual se separan fragmentos dependiendo de

su tamaño, estos pueden ser tanto proteínas como ácidos nucleicos, en caso de ser ácidos
nucleicos esta técnica este precedida por la PCR. Esta técnica(y en general otras técnicas
moleculares) permite establecer relaciones evolutivas e interindividuales, y permite establecer la
incidencia de un polimorfismo en una población, además de lo mencionado en mutación.

La electroforesis consiste en la división de los fragmentos que se generan debido a los cortes de
las enzimas de restricción(endonucleasas tipo II específicamente que utilizan Mg2+ como
cofactor), por esto es que la electroforesis permite analizar los RFLPs(polimorfismos de la longitud
de los fragmentos de restricción) ya que los fragmentos van a variar en número(dependiendo del
número de cortes) y en tamaño(dependiendo de en donde se realicen los cortes). Es importante
tener en cuenta que 1 corte genera 2 fragmentos(a menos de que le ADN sea circular donde 1
corte genera 1 fragmento).
Después de que se ha realizado la digestión mediante el uso de un gel insoluble (agarosa o
poliacrilamida) que favorece la movimiento de los fragmentos se someten los fragmentos a un
campo electromagnético donde el ADN migra del polo negativo al positivo(ya que el esqueleto
azúcar-fosfato es negativo). Posteriormente se generado el revelado electroforético(donde se ven
las bandas) mediante el uso de tinción(azul de coomasie o nitrato de plata) o mediante agentes
intercalantes(bromuro de etidio). Además se utiliza un marcador de peso molecular para
determinar el tamaño de los fragmentos, y se utiliza un buffer para que cambios en las cargas no
me afecten la muestra.

Cuando se realiza una electroforesis con agarosa se realiza de forma horizontal, mientras que la
poliacrilamida se realiza de forma vertical, además la poliacrilamida permite variar su densidad
pero no se utiliza con mucha frecuencia debido a que es un neurotóxico muy potente, por otro
lado la agarosa permite variar su concentración generalmente se utiliza una concentración del 2%
que genera unos poros mas pequeños y por una ende un menor desplazamiento. Además de la
electroforesis con gel se puede realizar electroforesis en medio sólido y en medio líquido.

En el caso de las células diploides, si el gen que se está analizando tiene un solo punto de corte
podemos tener los siguientes caso: Homocigoto para corte(2 bandas), homocigoto para no corte(1
banda) y heterocigoto(3 bandas). En caso de hacer electroforesis sin enzimas de restricción lo que
se busca determinar es la presencia de un alelo en este caso el homocigoto del alelo que no se
corta no me genera fragmento, el heterocigoto me genera un fragmento, y el homocigoto del alelo
deseado si se corta genera igualmente un fragmento.

Es importante tener en cuenta que la electroforesis también se puede realizar sin enzimas de
restricción al realizar una amplificación de cierta secuencia(como un alelo enfermo) permitiendo
identificar una enfermedad, en este caso no se analizan RFLPs, además en este caso si los dos
alelos son sanos no hay fragmento, si es heterocigoto, o homocigoto para el alelo enfermo, hay
una banda.

En la electroforesis también se hace uso de buffers, se utiliza TBE para agarosa, y se utiliza TAE
tanto para agarosa como para poliacrilamida, este buffer resiste cambios mayores de pH.

Torques y Palancas

La estática es el estudio físico de los cuerpos en reposo aquí se hace estudio de los torques las
palancas y las fuerzas en equilibrio. La luz se demora en llegar a la tierra aproximadamente 8min,
la tierra tiene 13,000km de diámetro, la velocidad de la luz es 𝑐 = 3 ∗ 108 𝑚/𝑠 por lo cual a esta
velocidad en un segundo se atrivesas 23 tierras.

Cuando un cuerpo esta quieto va a tener un centro de masa, el extremo mas corte del centro de
masa va a tener mas masa que el extremo largo.

En las palancas vamos a tener un pivote, una resistencia(objetivo lo que se quiere hacer) una
potencia(la fuerza que se aplica para lograr el objetivo) y unos brazos(distancia del pivote a la
resistencia y a la presión). Existen varios tipos de palanca, la de primer grado tiene el pivote en la
mitad y la resistencia y la potencia a lados opuestos(tijeras), la de segundo grado tiene el pivote en
un extremo la potencia en otro y la resistencia en el medio(carretilla), y la de tercer grado tiene el
pivote en un extremo la resistencia en el otro extremo y la potencia en el medio(pinzas).

En el cuerpo un pivote es una articulación, y aquí entra la ergonomía haciendo analogía del cuerpo
con palancas, ya que segundo la amplitud de las fuerzas y el momento que se aplican se puede
producri dolor, lesiones etc..

El torque es el momento de una fuerza. Se defiene como: 𝑇 = 𝑟𝐹 ∗ 𝑠𝑒𝑛∅ siendo r la longitud del
brazo, F la fuerza aplicada, y ∅ el angulo entre la fuerza y la distancia. Hay ciertas ocasiones en las
cuales puede haber fuerza pero no torque, estas son cuando la fuerza se aplica en el pivote,
cuando no hay fuerza o cuando la fuerza es paralela o exactamente opuesta en dirección al brazo,
es decir cuando ∅ = ⁡0⁡𝑜⁡180. Como se esta estudiando estatica la sumatoria de fuerzas y la
sumatoria de otrques debe dar 0.

La fuerza se puede expresar en Newtons, dinas y KgF(1KgF = 10N), mientras que los torques se
pueden expresear en Nm, Ncm, KgFm, Kgfcm.

Mitosis

La mitosis se puede dividir en cuatro etapas, en la profase se produce la condensación del ADN en
los cromosomas, el traslado de los centrosomas a polos opuesto y la polimerización de los
microtubulos, en microfotografía se ve como un plato de espaguettis; la metafase consiste en el
alineamiento de los cromosomas en el ecuador, el desvanecimiento de la membrana nuclear y la
formación de los husos mitóticos(unión microtubulo a centrómeros gracias al cinetocoro que es el
anillo proteico que recubre los centromeros), en microfotogrofia sedeben ver todos los
cromosomas alineados sobre una misma línea imaginaria(ecuador); la anafase es en si la división
de las cromatides hermanas hacia los polos opuestos por la contracción de los
microtubulos(específicamente por la acción de la dineina) en esta fase se deben ver los
cromosomas como unas manos y todavía se ve el huso mitótico(microtubulos); la telofase consiste
en la formación de las nuevas envolturas nucleares y el comienzo de la estrangulación de la
membrana por los filamentos de actina y la despolimerización de los microtubulos, en
microfotografía ya no se ve el huso mitótico y no se ven cromosomas se ve el ADN no tan
condensado. Después de la mitosis se da paso a la citocinesis que es en si la división celular por el
estrangulamiento de los filamentos de actina y miosina II.

Se habla de una 5ta fase en la mitosis, la prometafase en la cual se da el desvanecimiento de la

envoltura nuclear por la fosforilación de la misma y se da el inicio d ela formación del huso
mitotico. Los cariotipos es la forma en la cual se organizan los cromosomas de acuerdo a su
número y a su tamaño(se organiza en cromosomas homologos), en caso de utilizar mitosis se ven
dos cromosomas cada uno compuesto por dos cromatides hermanas, en caso de utilizar una célula
somática que está en interfase.

Mapviewer y Genome Browser.

Genome browser es una base de datos de la universidad de California en la cual se encuentra de
manera gráfica el genoma de diversas especies incluyendo el ser humano, para buscar ene l
genoma un gene se debe inserta la ubicación del mismo de esta manera 22q11, siendo 22 el
cromosoma, la letra el brazo(q cola(queue) y p pequeño(petit)), el primer número después de la
letra indica la región y el siguiente numero la banda.

Cuando se encuentra el gen de forma grafica en genome browser habrán muchos hipervínculos en
los cuales se puede obtener información del gen, enfermedades y relacionadas a este. A partir de
la gráfica se puede disminuir el zoom y identificar los genes cercanos al que se buscó y determinar
si las patologías relacionadas a afecciones en estos genes próximos están relacionadas con la del
gen de estudio.

Mapview es una base de datos de NCBI que contiene información acerca del genoma de diversas
especies, aquí se puede determinar cuántos cromosomas tiene una especie sean sexuales, no
sexuales o mitocondriales, además también se puede realizar una búsqueda de un gen del cual la
base de datos brinda características.

OMIM

Online Mendelian Inhertitance in Man (OMIM) es una base de datos de genes humanos, rasgos y
enfermedades de origen genético, con un énfasis particular entre la relación existente entre
variación genética y la expresión fenotípica.

Hasta el momento se encuentran más de 21000 enfermedades.

En esta base de datos se puede buscar información sea por una enfermedad en específico como
por un gen. En el caso de la enfermedad se puede identificar que gen es el que se asocia con esta
enfermedad, y cuál es la proteína que se me afecta, también se puede determinar cuál es el tipo
de herencia, si hay diagnóstico prenatal, y si existe información relevante en cuanto a pruebas
diagnósticas.

Al analizar un gen omim me ofrece información general del gen como su ubicación cromosómica,
me ofrece información acerca del gen, las variaciones alélicas del gen, los efectos que tiene sobre
el fenotipo, y me indica en un recuadro las enfermedades o(fenotipos) que están asociados a
afecciones en este gen.

Structure 3D

Tal como su nombre lo indica lo que permite esta base de datos es analizar la proteína de manera
tridimensional, es decir que me permite analizar la estructura terciaria de la proteína en las cuales
los dominios de hojas plegadas y alfa hélices se unen formando la estructura de la proteína.

En la página de internet como tal me permite conocer los dominios de la proteína y la técnica
mediante la cual fue obtenida su estructura(cristalografía o resonancia magnética), además se
muestra un esquema muy reducido en donde se muestra los elementos que se incluyen en la
estructura, en la caso de la utilizada en el laboratorio estaba la proteína con 2 cofactores de
magnesio, con su sustrato Adnilil Imidodifosfato y con una proteína que se inhibía, elementos
como los cofactores o el sustrato se presentan en cuadros, mientras que las proteínas se
presentan en círculos.

A partir de esta página y mediante el uso del programa Cn3D se puede explorar la estructura por
todos los ángulos posibles, en este grafico se puede observar el número de
subunidades(estructura secundaria) que hay y el número de proteínas en el gráfico.

En el recuadro de abajo del programa se observa la secuencia aminoacidica de cada aminoácido,

mediante herramientas como coloring shortgun(teñir la proteína conforme a diferentes
parámetros como subunidades) o mediante rendering shortcuts(modificar la proteína generando
bolas u otras formas geométricas que señalen ciertas zonas) se puede determinar cuáles son los
aminoácidos que están en contado con los cofactores, como el sustrato o con la otra proteína.

Los cambios en aminoácidos(cambios no sinónimos) pueden generan afecciones si este cambio

representa un cambio en la estructura, sea por una diferente polaridad, o porque se cambió por
una prolina o glicina(ambas generan giros en la estructura secundaria de la proteína.

ADN Mitocondrial

Las mitocondrias se encuentran en gran medida en el tejido nervioso y muscular, por lo cual una
afección en el ADN de este organelo causa principalmente enfermedades asociadas con estos dos
tejidos(más que todo neurodegenerativas).

En la célula hay una dinámica mitocondrial donde las mitocondrias se están fusionando y
fragmentando, la fusión es la unión de mitocondrias donde comparten el ADN y se replican, la
fisión es el procesos por e cual estas mitocondrias se separan. Nótese que debido a que en la
fusión el ADN se replicó en la fisión van a producirse más mitocondrias de las que se fusionaron.
Cuando el ADNmt está dañado la fusión genera que este ADN se comparta lo cual no es
recomendable para la célula , por lo cual la fisión en es el proceso mediante el cual la célula busca
evitar que este ADNmt mutado se esparza. Es decir, la fisión es la respuesta a un desequilibrio en
la fusión.

El proceso de la fusión requiere de diferentes proteínas, inicialmente tenemos la Mfn 1 o 2 que

posee una GTPasa en el extremo amino terminal que se encuentra en la membrana externa,
también posee unos dominios hidrofóbicos y un domino transmembrana(ambos dominios
cercanos al extremos carboxilo terminal); también esta presenta la OPA1(proteína de atrofia
óptica 1) que tiene una GTPasa en membrana interna mitocondrial. En el proceso de la fusión
estas proteínas se unen formando un complejo, donde la OPA1 con su GTPasa está en la
membrana interna y en el espacio intermembranal en los extremos que se van a fusionar; esta
OPA se una a la Mfn en su dominio transmembrana, y las Mfn se unen en el citosol por sus
dominios hidrofóbicos, mientras la GTPasas de las Mfn también están en el citosol; este complejo
ancla las dos mitocondrias y permite la fusión de las membranas lo cual sucede rápido(razón por la
cual los dominios hidrófobos pueden unirse en el citosol). Estos complejos pueden ser
homotipicos(un solo tipo de Mfn) o heterotipicios(Mfn 1 y 2). Cuando se fusionan las mitocondrial
el complejo se separa y las proteínas vuelven a la periferia para realizar otra fusión.

La fisión va a utilizar dos proteínas principales y unos adaptadores. Las proteínas son la
dinamina(DRP1) que va a tener una GTPasa y la fisina I(FisI) que esta en la membrana mitocondrial
externa. Los adaptadores son el Mdv1 y Caf4 y sirven para permitir el correcto anclaje de la FisI a
la membrana. El proceso se da la siguiente manera, las FisI a costados expuestos de la mitocondria
generan una contracción inicial, las mismas FisI favorecen la llegada y anclaje de la dinamina que
genera la torsión liberando las dos mitocondrias.

Estos dos procesos deben estar balanceados ya que una fisión no balanceada me genera mucha
fragmentación, mientras que una fusión no balanceada me genera mucha elongación. Como
dijimos anteriormente la fusión favorece el esparcimiento del ADNmt mutado, existen muchas
enfermedades asociadas a mutaciones en este ADNmt como la MERF(epilepsia mioclónica) que se
produce por una mutación missense en el nucleótido 8344 de la cadena pesada afectando una
proteína del complejo 5(ATP sintasa); o la MELAS que genera una encefalopatía y acidosis láctica
por una disfunción en el complejo I a causa de una mutación missense en el nucleótido 3243 de la
cadena pesada; por último la neuropatía óptica de lever(LHON) que se da por un problema en la
NADH deshidrogenasa.

La mitocondria tiene un genoma mofiletico, es decir que proviene de un único ancestro, mediante
estudios se ha determinado que todas las mitocondrias no solo de los humanos sino de todas las
especies que poseen mitocondrias vienen de un mismo ancestro(eva mitocondrial) que proviene
de África.

Las características del ADNmt es que es circular, es un solo cromosoma, dsDNA(bicatenario).

Posee 16569pb y hay muchas copias por célula lo cual es ventajoso para estudios de herencia pero
desventajoso porque una mutación prolifera muy rápido. Codifica para 37 genes(2ARNr 16S y 12S,
22ARNt y 13 proteínas: 7 del complejo I, 1 del III, 3 del IV y 2 del V). Tiene una cadena pesada(28
genes) y una cadena liviana(9 genes) a pesar de que amabas tiene el mismo nuero de nucleótidos
esto se debe a una mayor presencia de purinas en la pesada mientras que la liviana tiene mas
pirimidinas. Los genes no tienen intrones y al las dos cadenas tener genes ambas deben comportar
como molde y como codificadora por lo cual al transcribir un fragmento de ADN se realizan dos
transcripciones de la cual una va a ser funcional y la otra no.

Para llevar a cabo sus proceso de replicación transcripción y traducción la mitocondria requiere
que muchas enzimas entren a la matriz mitocondrial, en el caso de la replicación se requiere de la
polimerasa las SSB las helicasas etc.., en el caso de la transcripción se necesitan los factores de
transcripción y la RNA polimerasa, en el caso de la traducción se requiere de factores de iniciación,
proteínas ribosomales y aminoacil ARNt sintetasa. Para la cadena respiratoria también requiere de
las proteínas de los complejos que no se sintetizan a nivel mitocondrial.
El ADNmt tiene un región conocida como D-Loop, esta región no es codificante tiene el origen de
transcripción de ambas hebras y el origen de replicación de la hebra pesada, tiene también la
secuencia de terminación y es la encargada de desplazarse en el ADNmt, además tiene las
CBSs(Conserved block sequences). Es importante tener en cuenta que la replicación de las dos
hebras se da por separado. Esta región es muy importante ya que es la que mayor cantidad de
mutaciones sufre generando los polimorfismos, es decir es hipervariable.

A partir de una célula madre que puede tener el 20% de su ADNmt mutado pueden surgir tres
células una con el 80% del ADNmt mutado, otra con el 50% y otra con el 20%, el feto que adquiera
estas células con base el porcentaje será sano(20%) puede ser enfermo(50%) o será
enfermo(80%). Teniendo en cuenta esta cantidad de mutaciones del ADNmt se han desarrollado
diversas técnicas: la heteroplasmia es cuando hay una alta proporción de ADN mutado que
permite predecir si va a producirse o no una enfermedad, es en si el porcentaje de ADN dañado,
mientras que la homoplasmia es una alta proporción de ADN sano, se mira el porcentaje de ADN
sano.

Se habla de que el ADNmt no es recombinante, es decir únicamente proviene de la madre y el

padre no aporta en el ADNmt,sin embargo se ha demostrado en algunos casos que la
recombinación es posible aunque muy extraña por lo cual se ha hablado de 3 posibilidades, la
primera es que no haya recombinación, la segunda es que haya pero se indetectable, y la tercera
es que haya y que sea detectable.

El proceso de replicación tiene muchas similitudes con el del ADNn como el uso de
polimerasa(gamma en este caso) de SSBmt, de topisomerasas I y II, de helicasas(Twinkle en este
caso) sin embargo también hay diferencias como que la replicación de las dos hebras sea
independiente lo cual genera que sea una replicación unidireccional en lugar de bidireccional y
que sea asimétrica, que hallan dos puntos de origen, que tenga puntos de terminación(Ter) y que
el primer lo coloque una RNA primasa que no esta asociada a un complejo.

El proceso de transcripción es semejante en el hecho que hay dos factores de transcripción(A y B

en este caso), tiene RNA polimerasa, va a tener una RNAasa asociada a la polimerasa y tiene un
factor de terminación que es el mTERF y la terminación es independiente de Rho. La RNA
polimerasa es de 1189aa y tiene 140kDa.

La traducción es igual lo que difiere un poco es la maduración, los ARNr se escinden por endo y
exonucleasas, loas ARNt re escinden por las RNAasas P D y E, y el ARNm también tiene una cola
poli-A y tiene una protección en 5´que no es en sí una caperuza pero es algo semejante a esto que
la protege. Otra diferencia en la maduración del ARNr es que las subunidades finales van a ser 39S
y 28S, y es importante tener en cuenta que tanto el ARNr 16S como el 12S vienen en un solo
paquete que se escinde.

El ADNmt está regido por el código genético; sin embargo tiene varias excepciones para las reglas
del mismo ya que tiene tres codones de iniciación AUA(met), AUU(Ile) y AUG(met), tiene dos
codones de parada alternativos AGA y AGG, y el UGA que usualmente es stop codifica para Trp. Y
por último, AUA que usualmente codifica para Ile ahora codifica para Met. Estos cambios son
permisibles debido a la poca cantidad proteínas que codifica el genoma.

El ADNmt se puede utilizar en estudios evolutivos, al analizar el ADNmt de mujeres se puede

determinar cuáles contienen se colonizaron primero(a mayor mutación de ADNmt mayor
antigüedad) lo cual ha permitido concluir que las poblaciones africanas son las más antiguas, este
ADNmt sirve tanto para estos estudios debido a que no es recombinante solo proviene de la
madre. Estos estudios se llevan a cabo sobre la región D-Loop.

Mutación del ADN

Una mutación es cualquier cambio en la secuencia de ADN, estas mutaciones se pueden clasificar
de diversas maneras. En primer lugar se pueden clasificar por el tipo de célula que afecta, es decir,
puede ser a nivel somático o germinal(células sexuales) si la mutación se da a nivel somático va a
repercutir en el individuo mas no será traspasada a la herencia, estas mutaciónes se asocian
principalmente con el cáncer, mientras que una mutación a nivel germinal puede estar o no
presente en el individuo pero puede pasar a la siguiente generación, si es puntual se asocia con
enfermedades de herencia monogénica o mendeliana. Por otro lado se pueden clasificar por su
origen o etiología( factores biológicos, físicos o químicos). Finalmente se pueden clasificar en la
cantidad de genoma afectado(puntual(mutación de un único gen) y cromosómica).

Las etiologías biológicas pueden ser múltiples, puede ser por errores de replicación en esta
categoría entra lo que es la fidelidad de la polimerasa(errores en reparación de la actividad
exonucleasa 3´-5´) la tautomería de las bases(modificación de las bases, sucede aproximadamente
en el 5% de las bases del genoma, en ocasiones genera apareamientos incorrectos(A con G), en
estos procesos se pasa de la forma amino a la imino y de la forma ceto a la enol, esta
modificaciones no permiten un correcto apareamiento por más de que se una A con una T
modificada) y el slippage(confusión al replicar secuencias altamente repetitivas que genera un
alargamiento o acortamiento del material genético) otras etiologías biológicas incluyen: crossing
over desigual, puede ser también secuencias transponibles(presencia o no presencia de una
secuencia en el genoma), retrovirus(inserta su ADN en el de la célula huésped),
despurinizacion(Perdida de purinas que genera un cambio en el diámetro de la doble hélice y
genera que la polimeraza inserte nucleótidos incorrectos), desaminación(perdida de grupos
amino, citosina se convierte en uracilo generan en la replicación una incorporación de timina) y
finalmente por ROS(radicales libres de oxigeno debido a la gran reactividad de este elemento
oxidan las bases impidiendo su correcta lectura por la polimerasa agregando nucleótidos
incorrectos).

Las etiologías físicas son las radiaciones de altas energías, esto se debe a que al excitar los
electrones estos saltan a niveles energéticos más altos en el átomo, y en caso de llegar al último
nivel pueden llegar a formar un enlace generando dímeros de pirimidinas(específicamente los
rayos UV generan esto) en este caso el doble enlace de las pirimidinas se excita y se forma un
dímero. Por otro lado las radiaciones, específicamente los rayos gamma, rayos x y cósmicos,
pueden llegar a romper enlaces, en caso de que se rompan las dos hebras esta mutación no podrá
repararse.

Las etiologías químicas pueden ser análogos de bases(se insertan al ADN cuando este se intenta
reparar de una despurinización, son químicos que se asemejan a las bases), agentes
alquilantes(modifican las bases alterando la estructura y diámetro del ADN, como una metilación),
agentes intercalantes(se introducen entre las dos hebras y no permiten la replicación de las
mismas) un ejemplo de este último es el benzopireno que viene con el humo del cigarrillo.

Las mutaciones puntuales son cambios pequeños en el ADN estos pueden ser una inserción,
deleción, y sustitución(se puede dividir en transición(purina por purina o pirimidina por pirimidina)
en transversion(purina por pirimidina o viceversa) siendo más grave la trasnversión). Estas
mutaciones se pueden clasificar dependiendo del efecto que tengan, puede ser silenciosa(no
cambio el aminoácido que se codifica generalmente porque el cambio fue en la tercera base),
missense(Cambia el aminoácido), nonsense(codón de terminación prematuro) y frameshift o
outframe(cambio en el marco de lectura) esta última generalmente genera patologías muy graves
y se da por una sustitución o deleción; se habla en ocasiones de un tipo de mutación neutral que
es cuando se cambia un aminoácido por otro de igual función biológica, esto seria un tipo de
missense. Un ejemplo de este tipo de mutaciones es la transversion missense que cambio el
glutamato por la valina en la hemoglobina dando paso a la anemia falciforme (eritrocitos en forma
de oz con poca capacidad de cargar oxigeno), esta enfermedad tiene herencia autosómica
recesiva. Las inserciones o deleciones pueden generar una mutación inframe o outframe
dependiendo del número de bases que se agreguen o se quiten, si es un múltiplo de 3 la mutación
es inframe y no se corre el marco de lectura, si no es múltiplo de tres se produce una mutación
outframe que corre el marco de lectura.. Otro ejemplo es la distrofia muscular que hay de dos
tipos la de duschene y la de Becker, ambas causadas por deleciones, sin embargo la primera es
una delecion en el exón 40 que genera una mutación outframe por lo cual hay una ausencia de
distrofina, mientras que la segunda es una serie de deleciones en los exones 47 y 48 que generan
una mutación inframe por lo cual se genera distrofina pero poco funcional.

Las mutaciones cromosómicas se dividen en las mutaciones de número y en las mutaciones

estructurales. En el caso de las de numero estas se pueden dividir en poliploidas y aneuploidas, las
primeras son un cambio en el número de copias de todos los cromosomas generando triploidias o
tetraploidas, en loa mamíferos este tipo de mutación es incompatible con la vida, sin embargo en
algunas especies es viable como en las papas o los bananos; por otro lado la aneuploidia es el
cambio en el número de copias de un solo cromosoma, un ejemplo de esto es el síndrome de
down(trisomía 21) o el síndrome de Edwards(trisomía 18); la única monosomia compatible con la
vida es el síndrome de Turner(un solo cromosoma X).

En las mutaciones estructurales podemos tener rearreglos, duplicación génica (duplicación de una
región del cromosoma), elementos(genes saltarines) y recombinación(intercambio entre regiones
homologas de los cromosomas, se puede dar en dirección tanto vertical como horizontal). En el
caso de los rearreglos podemos tener varios tipos dependiendo de su origen(repapración por
recombinación no homologa, crossing over desigual y separación anómala de cromatides
hermanas). Si surgen de errores en la reparación por recombinación no homologa(sistema para
reparar rupturas en hebras, el error se da en G1) se pueden dar deleciones que se pueden dar por
doble ruptura(intersticial) o por una sola ruptura(terminal), inversiones que pueden ser
paracentricas(no involucra el centrómero) o pericentrica(involucra el centrómero), inserciones(un
cormosoma sufre doble ruptura y se inserta en otro) que también se pueden considerar como
translocación no recíproca, anillos(circularización del cromosoma por ruptura de los telomeros) y
trnaslocaciones que puede ser reciproca balanceada(intercambio genético entre dos cromosomas)
o robertosoniana, esta última se da en cromosomas acrocentricos(pequeños el brazo p no codifica
solo produce ARN r y ARNt que puede suplirse por otro cromosoma) donde se translocan los
satélites(brazo p); un ejemplo de translocación reciproca es el caso del cromosoma
filadelfia(cromosoma 22 alterado) en este caso el cromosoma 22 y el 9 intercambian regiones,
este intercambio se ha identificado como el causante de la leucemia mielogena crónica. Si se da
por crossing over desigual(meiosis I) se genera una delecion y una duplicación entre cromosomas
homologos, un ejemplo de esto es el síndrome de cri-du-chat por un crossing over desigual en el
cromosoma 5. Si se da por separación anómala de cromatides hermanas(meiosis II, en lugar de
separarse brazo p y q de brazo p y q, se separan brazo p y p de brazo q y q) se genera un
cromosoma de doble brazo largo o de doble brazo corto. En el caso de la mutación por elementos
se presentan los denominados genes saltarines, estos se caracterizan por estar presentar un
fenotipo o genotipo en unas generaciones y en otras no, sin ningún patrón genético lógico, lo que
sucede en estos casos es que existe una secuencia transponible que se inserta en la mitad de un
gen evitando su expresión, esta inserción se presenta en algunas generaciones y en otras no.

Es importante tener en cuenta que es mutaciones cromosómicas que alteran partes de los
cromosomas se pueden dar en una región donde hay un gen funcional como no, por lo cual no
todas van a generar patologías, de igual manera muchas mutaciones puntuales tampoco están
asociadas a patologías sea porque son silenciosas o porque se presentan en una región no
codificante.

Existen otro tipo de mutaciones llamadas las mutaciones dinámicas causadas por los VNTRs, los
VNTRs son pequeñas secuencias que se repiten en tándem, lo que sucede con estas secuencias es
que confunden a la polimerasa(slippage) generando que esta no sepa en que numero de
repetición va y decía acortar o alargar la secuencias, en ocasiones realiza la acción correcta en
otras no generando un acortamiento o un alargamiento del material genético, además de las
VNTRs también las SSR, STR y los microsatelites. Un ejemplo de estas mutaciones la enfermedad
de huttington en la cual se presenta un mayor número de repeticiones de una tripleta de bases
que se encuentra normalmente en la región 5´UTR sin embargo al reptirse tantas veces afecta el
primer exón, este mayor numero genera que la proteína huttingitina se plegue mal y se acumule
en el RER debido a su difícil degradación, el estrés del RER induce la apoptosis en las células
generando unos “huecos” en el cerebro principalmente, además la huttingtina esta asociada con
la neurogenesis y su affecion afecta el nucleo caudado y el putamen encargados de la movilidad
cerebral. Generalmente las affeciones en VNTRs de tres nucleótidos se asocian a enfermedades
neurodegenerativas.

Las mutaciones se siguen presentando por varios motivos, generalmente las que generan
patologías son pocas en relación con la cantidad de mutaciones que hay en el cuerpo(las puntuales
se presentan una cada 1000000000 pares de bases, una mutación cromosómica de error en
segregación se da 1 vez cada 100 veces que se divide una célula, una mutación cromosómica por
rearreglos se presenta 6 veces cada 10,000 celulas que se dividen), por el contrario muchas no
producen efecto alguno y en otras ocasiones producen un efecto positivo para los organismos,
además las mutaciones dan la variabilidad en las especies que general la evolución y la
supervivencia de la misma.

La mutagenesis es el introducir una variación ene l genoma de una célula y mirar que efecto
produce esta variación, para esto se realizan pruebas con controles y con las células mutadas,
estas mutaciones se logran gracias a mutagenos(agentes químicos que favorecen las mutaciones),
la mutagenicidad se puede probar mediante los micronucleos(prueba en al cual las mutaciones
carecen de centrómeros debido a que se desenrollan por lo cual en la mitosis no participan del
huso mitótico quedando fuera de los nuevos núcleos y formando micronucleos).

La forma de diagnosticar las mutaciones en el cuerpo son muchas, las más utilizadas son las
pruebas de diagnóstico molecular debido a que estas tiene mayor sensibilidad, especificidad,
rapidez y se pueden realizar con una muestra muy pequeña, además otorgan la ventaja de realizar
diagnósticos tempranos. A partir de estas técnicas pueden realizar reconocimientos,
secuenciaciones entre otras.

Dentro de estas técnicas la RT-PCR que permite amplificar una parte especifica del gen y después
mediante el uso de la electroforesis determinar la cantidad de esta secuencia y de las bandas que
esta genera permitiendo determinar enfermedades, y servir en medica forense para ayudar a
esclarecer posibles culpables y para pruebas de paternidad. Otra tecina es el blott que permite el
reconocimiento de una partícula con otra, el western blott(utilizado en el SIDA) es un
reconocimiento proteína-proteína(anticuerpo específicamente), el northern es RNA DNA, el
southern es el DNA DNA, y el southwestern es proteína DNA; para esta técnica después de haber
realizado la electroforesis los fragmentos son unidos a una membrana que posee las partículas de
reconocimiento que espues vanan genrar ciertas bandas(no se producen bandas en el caso del
sida). Es importante tener claro que al decir reconocimiento proteína. Anticuerpo nos referimos a
que en la membrana tenemos la proteína que reconoce el anticuerpo que se introduce en la
misma. La ultima técnica son los microarreglos(microarrays) en los cuales se utiliza una célula
control y una célula experimental y mediante marcación fluorescente se puede determinar la
respuesta que tiene la célula experimental ante cierto medicamento.

Metabolismo de Compuestos Nitrogenados.

El metabolismo de compuestos nitrogenados es importante para todas las células, principalmente

porque de aquí se generan las proteínas que son esenciales para cualquier proceso corporal,
además aquí se incluye la formación de nucleótidos que pueden servir para la formación de ácidos
nucleicos, o coenzimas o monedas energéticas(todos necesarios en todas las células); por otro
lado también incluye compuestos que ya no son tan importantes a nivel general pero si particular
como la creatina a nivel del musculo, o la porfirina a nivel de las hemoproteinas.

La digestión de compuestos nitrogenados se da a nivel del estómago y a nivel, esta digestión se da

en mayor medida a nivel proteico y menor medida a nivel de los ácidos nucleicos. En cuanto a las
proteínas cuando estas llegan al estómago se secreta la hormona gástrica que induce la liberación
del jugo gástrico(HCl) y de pepsinogeno(zimógeno de la pepsina) que se activa por el pH ácido
volviendose pepsina que empieza a degradar los péptidos. Cuando entra el quilo acido al duodeno
la secretina genera que se libere HCO3- que neutraliza el pH, posterimente la colecistoquina
induce la liberación de los zimógenos desde el páncreas y algunas enzimas secretadas por los
enterocitos. En primer lugar se sintetiza la enteroquinasa por los enterocitos mientras que le
páncreas secreta el tripsinogeno, la primera activa el tripsinogeno convirtiéndolo en tripsina,
posteriormente se secreta procarboxipeptidasa y el quimiotripsionogeno, ambos zimógenos se
activan gracias a la acción de la tripsina en carboxipeptidasa y quimiotripsina respectivamente.
Finalmente el enterocito secreta la proaminopeptidas que se activa convirtiéndose en
aminopeptidasa. La mayoría de los aminoácidos se absorben gracias a transporte activo
secundario(utiliza sodio). Estas peptidasas se pueden clasificar en endopeptidasas y exopeptidas,
las primes se refiere a aquellas enzimas que cortan el péptido en lugares cercanos al medio del
mismo(tripsina y quimiotripsina), las exopeptidas son aquellas que cortan cerca al extremo
carboxilo(carboxipeptidasa) o amino(aminopeptidasa) terminal. Además de todas estas enzimas
existe una dipeptidasa a nivel intestinal. Los aminoácidos ebsrovidos entran a la circulación portal
y se dirigen al hígado. La digestión de los nucleótidos se da a nivel intestinal donde diversas
enzimas pancreáticas los digieren, en primer lugar las ribonucleasas y desoxiribonucleasas pasan
los ácidos nucleicos a oligonucleótidos, posteriormente las fosfodiesterasas producen
mononucleotidos, las nucleotidasas pasan a nucleosidos y las nucleosidasas pasan a ribosa o
desoxirribosa y bases nitrogenadas. En este caso tanto las nuleosidos(difusión facilitada) como las
bases nitrogenadas(difusión simple) individuales son absorbidos, y aquí las purinas absorbidas se
dirigen a formar ácido úrico. La utilización de zimógenos evita que las péptidasas generen una
autodigestion de los lugares donde se sintetiza y los canales por donde se transporta hasta llegar a
su sitio de acción.

Existe algo conocido como el balance del nitrógeno que es la proporción entre el nitrógeno que
utilizamos y el que desechamos a través de la orina, este balance es altamente positivo en las
etapas de crecimiento, en la adultez es equilibrado y en la vejes es negativo. Una afección en este
balance está asociado con patologías o con una dieta muy rica en proteínas. En la orina
encontramos urea, ácido úrico, creatinina, amonio, bilirrubina, y otros compuestos.

Es importante tener en cuenta que no existe forma alguna de producir nitrógeno orgánico de
manera endógena por lo cual todo el nitrógeno que tenemos es exógeno por lo cual todas las
moléculas compuestas por nitrógeno son parcialmente esenciales debido a esto el nitrógeno es
tan importante y este llega a nosotros de la siguiente manera: las bacterias fijadores captan el
nitrógeno atmosférico y lo convierten en compuestos como nitrato o nitrito que es utilizado por
las plantas para sintetizar aminoácidos, estas plantas son consumidas sea por nosotros o por
animales que nosotros posteriormente consumimos. Posteriormente el nitrógeno se devuelve a la
tierra sea por desechos o por descomposición de los cuerpos fallecidos acá las bacterias lo
devuelven a la atmosfera o las plantas y otras bacterias los vuelven a utilizar entrando a la dieta
nuevamente. Todo esto es el famoso ciclo del nitrógeno.

Existe en el cuerpo algo conocido como el pool de aminoácidos, estos es el conjunto de

aminoácidos libres que se encuentran el espacio intersticial (matriz extracelular), en las células o
en la sangre. Este pool aumenta por tres factores: aminoácidos de la dieta, biosíntesis de
aminoácidos y catabolismo de proteínas, por otro lado el pool disminuye por otros tres factores:
biosíntesis de proteínas, catabolismo de aminoácidos y biosíntesis de otros compuestos
nitrogenados. Es importante tener en cuenta que los compuestos nitrogenados se clasifican en
aquellos de alto peso molecular(ácidos nucleicos y proteínas) y aquellos de bajo peso
molecular(porfirinas, nucleótidos, aminoácidos y creatina). Este pool es muy dinámico ya que no
solo se ve modificado en condiciones postprandiales o de inanición, sino que de por si el cuerpo
siempre está degradando y sintetizando proteínas(ya que estas tienen una vida media corta).

Las proteínas se pueden clasificar conforme a su valor biológico, esta clasificación toma en cuenta
la cantidad de aminoácidos esenciales en una proteína y la digestibilidad de los mismos(el
colágeno y las proteínas cárnicas tienen una muy baja digestibilidad). A partir de esta clasificación
se creó una proteína hipotética que sería la de mayor valor biológico a esta proteína se le llamo la
proteína de la FAO, las proteínas que más se acercan a la de la FAO son la caseína de la leche y la
albumina(cocida) del huevo. Además de esto se ha encontrado un compuesto con un mayor valor
biológico que la FAO este compuesto es la leche materna.

Es importante tener en cuenta dos cosas, en primer lugar los aminoácidos son los precursores de
todos los compuestos nitrogenados, por otro lado los aminoácidos no son compuestos que
puedan ser utilizados como combustible por la célula de manera directa, estos tiene que sufrir
reacción de transaminación para poder incorporarse a los procesos productores de energía en la
célula. Existen aminoácidos glucogénicos(aquellos que se pueden llegar a convertirse en glucosa) y
los cetogenicos(aquellos que llegan a convertirse en cuerpos cetonicos).

En la post-ingesta se favorecen tres procesos, el primero es el aumento del pool por la dieta
mediante toda la digestión explicando anteriormente, el segundo es la biosíntesis de
proteínas(para lo cual se requiere de la biosíntesis de aminoácidos) y el tercero es la biosíntesis de
compuestos nitrogenados de bajo peso molecular. Estos procesos se llevan a cabo en todas las
células, pero su mayor importancia se da en el tejido muscular y en el hígado. En periodos de
inanición los aminoácidos son utilizados como fuentes de energía por lo cual se favorece
catabolismo de aminoácidos y catabolismo de proteínas. Debido a que los productos nitrogenados
no están estrictamente regulados por la post-ingesta y la inanición es mejor tratar el metabolismo
de cada compuesto en su síntesis y su catabolismo viendo su regulación.
Al hablar de la síntesis de aminoácidos nos referimos a los aminoácidos no esenciales, ya que los
esenciales se adquieren únicamente de manera exógena, es importante tener en cuenta que los
aminoácidos de manera endógena provienen de compuestos del ciclo del ácido cítrico y de la vía
de las pentosas fosfato, esto debido a que estos compuestos son los cetoacidos homólogos de los
aminoácidos, por ejemplo el cetoacido homólogo de la alanina es el piruvato, del glutamato el
alfa-cetoglutarato, y del aspartato el oxalacetato entre otros. Los aminoácidos se pueden convertir
en sus cetoacidos homologos a través de reacciones catalizadas por aminotranferasas o
transaminasas, La glutamato transaminasa está presente en todos los tejidos por lo cual el
glutamato es un aminoácido para la síntesis de los demás aminoácidos, ya que en las reacciones
de transaminación un aminoácido pierde su grupo amino(convirtiéndose en su cetoacido
homologo) y este es transferido a otro cetoacido convirtiéndolo en un aminoácido, de esta forma
mediante reacciones de transaminacion el glutamato puede utilizarse para formar alanina a partir
de piruvato o aspartato a partir de oxalacetato. Es importante saber que todas estas transminasas
utilizan el fosfato de piridoxal(grupo prostético) como coenzima, esta se encarga de captar el
grupo amino del primer aminoácido(formando piridoxamina) y pasarlo al cetoacido. Existe otro
tipo de reacciones involucradas en este proceso llama desaminación oxidativa, en esta un
aminoácido pierde su grupo amino en forma de NH4+(amonio) en el caso del glutamato, la
glutamato deshidrogenasa(utiliza NADPH o NADH) cataliza la pérdida del grupo amino formando
alfa-cetoglutarato y amonio, sin embargo en la post-ingesta esta enzima esta catalizando la
reacción inversa formando glutamato así este glutamato puede formar otros aminoácidos
mediante las reacciones de transaminación, cuando sucede esto donde se une la desaminación
oxidativa con la transaminación se denomina transdesaminación. Existen muchas reacciones
encargadas de la biosíntesis de aminoácidos sin embargo esta en la que esta involucrado el
glutamato es la mas importante. Grosso modo se puede decir que del alfa-cetoglutarato previene
el glutamato, glutamina, prolina y arginina(además de la alinana y el aspartato que vienen del
piruvato y el oxalcetato respectivamente). La serina se síntesis a partir del 3-fosfoglicerato, y a
partir de esta se sintetiza la glicina. La cisteína se sintetiza a partir de la metionina y la serina. Para
todas estas reacciones de biosíntesis se requieren un gran número de coenzimas, las más
importantes son el pridoxal bifosfato(para transaminación) y la S-adenosilmetionina y
tetrahidrofolato(para transferencias de carbonos).

En el caso del catabolismo de aminoácidos las reacciones planteadas en la biosíntesis son las
mismas que participan en el catabolismo solo que el equilibrio se encuentra dirigido hacia el otro
lado, es decir ahora un aminoácido por transaminación pasara a glutamato formándose un
cetoacido, mientras que el glutamato pasara a alfa cetoglutarato y amonio por desaminación
oxidativa, no solo se v aa usar el glutamato sin embargo, al igual que en la biosíntesis es el más
importante. La alanina que viene del musculo por transaminacion va a producir piruvato y
glutamato, este piruvato se va a convertir en glucosa que se dirige nuevamente al musculo a
convertirse en piruvato que vuelve a formar alanina que se dirige al hígado, este proceso se
conoce como el ciclo alanina-glucosa o ciclo de cahill, de igual forma el aspartato y la asparrigina
se convertirán en oxalacetato por reacciones de transdesaminacion. Los niveles de glutamato y
alfa-cetoglutarato se mantienen elevados ya que la mayoría de estos catabolismos ocurren en el
hígado, los demás tejidos envían el amonio que han producido en glutamina gracias a la acción de
la glutamino sintasa(a excepción del musculo que además de glutamina envía alanina) el cual en la
mitocondria por la glutamaninasa se convierte en glutamato. El destino de los cetoacidos
producidos depende del aminoácido que se haya catabolizado, estos cetoacidos pueden dirigirse a
la oxidación en el ciclo de Krebs, a la formación de glucosa por gluconeogénesis(aminoácidos
glucogénicos) o a la formación de cuerpos cetogenicos(aminoácidos cetogenicos). El hecho de que
los cetoacidos se dirijan a gluconeogénesis o cetogenesis explica porque el catabolismo se lleva a
cabo en su mayoría en el hígado. Los únicos aminoácidos que no se catabolizan en el hígado son
los tres aminoácidos de cadena ramificada debido a la ausencia de una transminasa(alfa-cetoacido
de cadena ramificada deshidrogenasa) en el hígado.

El catabolismo de aminoácidos produce amonio sea dentro o fuera del hepatocito, cuando se
produce fuera del hepatocito se transporta mediante la glutamina que se forma pro la glutamina
sintasa, esta glutamina entra a la mitocondria del hepatocito donde la glutaminasa la convierte en
glutamato + NH4+, el NH4+ además llega al hepatocito por la vena porta de la ingesta. El amonio
por acción de carbamil fosfato sintetasa I(utiliza ATP) se une al CO2 de la respiración celular
formando carbamil fosfato, posteriormente la ornitina transcarbamilasa condensa el carbamil con
la ornitina formando citrulina que va a salir de la mitocondria, en el citosol el grupo ureido de la
citrulina se condensa con el grupo amino del aspartato formando argininosuccinato gracias a la
acción de al argininosuccinato sintetasa(usa ATP), posteriormente la argininosuccinasa(única
enzima que cataliza una reacción reversible) rompe el argininosuccinato formando arginina libre y
fumarato(este entra a la mitocondria como intermediario del ciclo de Krebs), la arginina se corta
formando ornitina y urea por acción de la arginasa. La urea pasa a la sangre siendo absorbida en el
riñón y excretada en la urea. Nótese que el ciclo del ácido cítrico y del ciclo de Krebs se conectan
en el argininosuccinato.

La regulación del metabolismo y catabolismo de ácidos grasos está dada por la acción de la
glutamato deshidrogenasa que se activa por el ADP, GDP y NADP+, mientras que se inhibe por el
GTP, ATP y NADPH esto para la dirección de la reacción d glutamato a alfa-cetoglutarato y NH4+.
Por otro lado el ciclo de la urea se encuentra regulado a nivel de síntesis(cuando se ingieren
muchas proteínas o en periodos de inanición se aumenta la síntesis), y por modulación aloesterica
en la carbamil fosfato sintasa I, ya que se activa por el N-acetil glutamato que se sintetiza a partir
de acetyl-CoA y glutamato. Es importante notar que el glutamato y la glutamina son los
transportadores más importantes de amoniaco, el primer a nivel intracelular y el segundo a nivel
intercelular. Es fácil identificar que la biosíntesis de aminoácidos grasos estará elevada en la post-
ingesta, mientras que el catabolismo de aminoácidos estará aumentado en la inanición cuando ya
se a utilizado la glucosa y se utilizando lípidos y proteínas como fuentes energéticas.

Existen además de los aminoácidos esenciales(aquellos que no podemos sintetizar) aminoácidos

clave(aminoácidos que requerimos para formar compuestos importantes en el cuerpo) ejemplo de
estos segundos aminoácidos son el triptófano(precursor serotonina), la histidina(precursor
histamina), tirosina(precursor de catecolaminas como adrenalina y noradrenilana),
glutamato(precursor de GABA un importante neurotransmisor) y el glutamato(junto con la cisteína
y la glicina son precursores del glutatión, un importante antioxidante).

Dentro del metabolismo de otros compuestos nitrogenados podemos incluir las porfirinas y la
creatina. La síntesis de porfirinas se da por la glicina principalmente la cual se une con el succinil-
CoA formando alfa-amino-beta-cetoadipato que se descarboxila formando delta-aminolevulinato,
dos de este último compuesto se fusión formando la protoporfirina. El hierro se incorpora a la
protoporfirina mediante la acción de la ferroquetalasa. La síntesis de la creatina se da por la unión
de parte de la cadena lateral de la arginina a la glicina(amidinotranferasa) formando
guanidinoacetato, al cual se le une un carbono (metiltranferasa) formando la creatina, esta se
fosforila(creatina quinasa) formando la fosfocreatina que será la primera fuente de energía del
musculo, por lo cual la concentración de creatina en el musculo es muy elevada.

El catabolismo de los grupos hemo(porfirinas) se da en los macrófagos por la acción de oxigenasa y

una reductasa que forman bilirribuna, esta se transporta por la albumina al hígado donde se une
con el ácido glucurónico formando el diglucurónido de bilirrubina que se excreta en la bilis, en el
intestino se convierte en estercobilina(habiéndose convertido antes en urobilinogeno) saliendo en
las heces(vía directa). Existe una vía indirecta en la que el urbilinogeno se transporta el riñón
donde se elimina por la orina en forma de urobilina. El catabolismo de la fosfocreatina consiste
únicamente en su fosforilación que genera creatinina que se elimina por vía renal.

La regulación de la síntesis de grupos hemo se da por la concentración de los mismos que actúa
como retroinhibidor(inhibición del producto final) de los primeros pasos de su biosíntesis. Los
grupos hemo no se regularan por la post-ingesta o por la inanición, sin embargo la creatina si se
sintetizara en la post-ingesta y se catabolizara en actividad física.

En el metabolismo de ácidos nucleicos se habla es de la formación y degradación principalmente

de las bases nitrogenadas. Para la síntesis existe la síntesis de novo y la vía de
recuperación(consume menos energía). Es importante tener en cuenta que en si las bases
nitrogenadas no son intermediarios de la síntesis de nucleótidos ya que estas se construyen sobre
la ribosa en formas de otros compuestos, esto para la síntesis de novo, en la vía de recuperación
las bases como tal si son precursores. En la síntesis de novo, la glicina aporta el esqueleto
carbonado para las purinas, mientras que el aspartato para las pirimidinas; en ambos casos la
glutamina es el donador de los grupos amino.

La síntesis de novo de purina utilizan a la forma activa de la ribosa-5-fosfato la fosforibosil

pirofosfato(PRPP), en primer lugar un grupo amino(glutamina) se una a PRPP por la
fosforribosilamina por acción de la glutamina-PRPP amidotransferasa, posteriomente se unen tres
átomos de glicina(uso de ATP) que después se formilan y captan un nitrógeno(glutamina), después
hay una deshidratación y ciclación que generan el 5-aminoimidazol ribonucleotido el cual se
carboxila formando carboxiaminoimidazol ribonucleotido, después de esto el aspartato, mediante
la formación de un enlace amida y la eliminación de su esqueleto carbonado, cede su grupo amino
finalmente se capta un último carbón y se produce la segunda ciclación formando los dos anillos
del inosinato(IMP) que es el precursor de las demás purinas, en el caso del AMP se incorpora un
grupo amino del aspartato mediante el uso de GTP(el adenilosuccinato es un intermediario en esta
vía por acción de la la adenilosuccinato sintetasa), en el caso del GMP se produce una oxidación y
captación de un grupo amino de la glutamina mediante el uso de ATP(el xantilato es un
intermediario en esta vía por acción de la IMP deshidrogenasa). En el caso de las pirrimidinas
también se utiliza PRPP pero también se utiliza carbamil fosfato, en este caso el anillo no se
sintetiza sobre el PRPP sino que se une después, el carbamil fosfato aquí utilizado se forma a partir
de la carbamil fosfato sintasa II(distina a la mitocondrial), en el primer paso el carbamil reacción
con el aspartato formando N-carbamilaspartato por la aspartato transcarbamilasa, posteriormente
este se deshidrata y se cicla por la dihidroorotasa formando dihidrootorato, el cual se oxida
formando orotato, este se une a la PRPP formando orotidilato que se convertirá en UMP por
descarboxilación, este se puede fosforilar a UTP a partir del cual se genera CMP a partir de la
citidilato sintetasa(usa ATP y un grupo amino de la glutamina). Estos nucleosidos monofasto se
convierten nucleosidos trifosfato, en el caso de AMP el mismo ATP le cede el fosfato generando
2AMP gracias a la adenilato quinasa, el ATP también va a fosforilar a los demás nucleosidos
monofosfato mediante las nucleosido monofosfato quinasas formando nucleosidos difosfato que
se pueden convertir en nucleosidos trifosfato por la acción de la nucleosido difosfato quinasa, el
ADP no requiere de esta enzima que las enzimas de la oxidación de la glucosa y la ATP sintasa lo
convierten en ATP. Hasta aquí solo se han formado ribonucleotidos, los desoxiribonucleotidos se
forman a partir de estos por acción de la ribonuleotido reductasa, la cual utiliza los hidrógenos
provenientes de la tiorredoxina(que se redujo por acción de la tiorredoxina reductasa) también
puede utilizar los hidrógenos del glutatión reducido(se redujo por acción de la glutarredoxina).
Después de tener los desoxiribonucleotidos solo queda sintetizar el dTMP que se puede formar a
partir de dCMP y cUMP, cuando se utiliza cUMP la timidilato sintasa que transfiere un grupo
carbono que posteriormente se oxida formando un grupo metilo(los hidrógenos viene del
dihidrofolato reducido).

En la vía de recuperación se sabe que la por acción de la adenosina fosforibosiltransferasa se

puede generar AMP a partir de una adenosina resultante de la degradación de nucleótidos, por
otro lado mediante la hipoxantina-guanina-fosforribosiltransferasa se puede producir GMP a partir
de guanina y AMP a partir de la hipoxantina(producto de la desaminación de la adenina).

En la degradación de nucleótidos las purinas producen ácido úrico mientras que las pirimidinas
producen urea. En el caso de el AMP la 5´-nucleotidasa los desfosforila, posteriormente la
adenosina desaminasa produce inosina que se hidroliza dejando libre la base llamada hipoxantina,
la cual se oxida a xantina y posteriormente a ácido úrico por la xantina oxidasa. El GMP por su
parte se hidroliza dando guanosina que posteriormente se descompone dando guanina libre, a la
guanina se le quita un grupo amino que la convierte en xantina que se oxida a ácido úrico. Por otro
lado la timina se degrada a metilmalonilsemialdehido que se degrada hasta succinil CoA, en este
proceso produce amonio que se dirige a la síntesis de urea, además el catabolismo de pirimidinas
también produce NH3, CO2 y beta-alanina.

El metabolismo de nucleótidos está regulado por retroinhibicion, es decir que el producto final(el
nucleótido) inhibe a las enzimas de la ruta metabólica, esto se evidencia principalmente en la
síntesis de purinas, donde hay varios puntos de regulación el primero se da en la glutamina-PRPP
amido transferasa que es inhibida por el AMP, GMP y IMP; el segundo se da en la adenilosuccinato
sintetasa donde el AMP la inhibe; el tercero se da en la IMP deshidrogenasa conde el GMP lo
inhibe; un cuarto punto se en la activación de la ribosa-5-fosfato por acción de la PRPP sintetasa
que se inhibe por el ADP.

Regulación Génica

La función de la regulación génica es activar los genes que necesita e inactivar los que no necesita,
sin embargo exciten otras formas por las que las células eliminan lo que no quieren tener, tales
como no activar el gen, degradar el ARNm, degradar la proteína o no activar la proteína, entre
otras muchas cosas que puede hacer.

En cuanto a la transcripción los reguladores se pueden dividir en cis y en trans siendo los primeros
las secuencias reguladoras en el ADN y los segundos las proteínas o ARNs no codificantes que se
unen a estas secuencias cis. Para entenderlo mejor un buen ejemplo es el operon Lac en bacterias,
este operon tiene una secuencia cis reguladora(operador) y tiene un regulador trans, cuando la
lactosa no esta presente en la bacteria el regulador se pega al operador impidiendo la
transcripción del operador, por el contrario si la lactosa se encuentra presente en la célula esta se
une al regulador impidiendo que se una al operador, permitiendo la transcripción del operon, este
ejemplo en el cual el sustrato, por asi decirlo, es el que inactiva el inhibidor va a ser regulación
positiva, en caso de que el producto active al inhibidor se llama regulación negativa, estos dos
tipos de regulación aplican para bacterias.

En las bacterias como se vio en el ejemplo la regulación se da para producir lo que se necesita e
inhibir lo que no, sin embargo en eucariotas la regulación tiene funciones más complejas como la
diferenciación celular y tisular, y la respuesta a estímulos ambientales(internos y externos). Es
importante tener en cuenta que los genes eucariotas están constitutivamente inactivos por lo cual
el esfuerzo celular es para activarlos. Al activar ciertos genes y dejar inactivos genes se da la
diferenciación celular, esto se comprobar con un microarray que muestra con verde y rojo los
genes activos e inactivos. El hecho que un se exprese cuando no debe suele ser patológico.

Existen diversos niveles de regulación, hay control pre-transcripcional(metilación, condensación

ADN) de transcripción(frecuencia y velocidad de transcripción), de procesamiento(velocidad,
maduración alternativa), de transporte(selección ARN que se quieren transportar), de
degradación(estabilidad), de traducción(frecuencia y velocidad), de procesamiento de proteína y
de funcionalidad de proteínas.

En este curso vemos dos regulaciones pre-trasncripcionales la acetilación de histonas y la

metilación del ADN. En el caso de la acetilación esta se da en una lisina del extremo amino
terminal de las histonas reduciendo la carga positiva y por lo tanto debilitando su unión con el
ADN, esto permite una movilidad de las histonas por el complejo remodelador de la cromatina que
expone al promotor del gen que se desea activar, entre más se acetilen las histonas más fácil es su
movilización, este proceso se da por enzimas acetiladoras y desacetiladoras que responden a
señalización celular, este mecanismos de activación es reversible(temporal).

La metilación a diferencia de la acetilación es un proceso que inactiva los genes, esta es una
modificación que se da después de la replicación en las islas CpG(zona reguladora del gen con
muchas gauninas y citosinas) específicamente en las citosinas, esta metilación modifica la unión de
proteínas al ADN, ya que las citosinas metiladas son reconocidas por la MeCP1 y MeCP2 que
llaman a proteínas desacetiladoras volviendo aun mas inactivo el gen. A mayor metilación hay una
menor expresión del gen, este proceso es mediante el cual las mujeres suprimen un cromosoma X.

La metilación de la mayoría de los genes se debe quitar en la gametogénesis(ya que cerca del 5%
del genoma esta metilado) sin embargo hay ciertas metilaciones que no se quitan, por lo cual
ciertos genes siempre se expresaran por la herencia paterna o materna dependiendo del alelo que
venga metilado, un ejemplo de esto es el gen H19, el cual viene metilado en el esperma pero no
en el ovulo por lo cual siempre se expresa el gen de la madre si es una enfermedad recesiva no
importa si el padre tiene el alelo dominante y la mama recesivo por la metilación se presentara la
enfermedad, este proceso de metilar el gen de un progenitor y no del otro se conoce como
imprinting.

Esta regulación de metilación es necesaria(a pesar de los genes ser constitutivamente inactivos, ya
que un factor de transcripción sirve para muchos genes, por lo cual se debe impedir la unión de los
mismos a los genes que no se deben expresar.

Ahora pasaremos a explicar los reguladores en cis y en trans que tienen los genes, en primer lugar
esta el promotor que se encuentra cercano al gen y sirve para la unión de los factores de
transcripción que permiten la acoplacion de la ADN pol y la iniciación de la transcripción, en este
promotor encontramos la caja TATA a -30pb que esta rodeado de secuencias GC y es reconocida
por la TBP, la caja CAAT a -60pb que la reconoce la Sp1, y la caja GC a -120pb que la reconoce la
CTF, estas secuencias cercanas al gen se conocen como basales, mientras que van a haber otras
secuencias reguladoras muy lejos del gen sea upstream o downstream que se conocen como
elementos distales. Es importante saber que los factores son más grandes que la secuencia por
ejemplo TBP es más grande que la caja TATA por lo cual modificaciones en la zonas aledañas GC de
la caja TATA pueden afectar la unión de TBP con TATA.

Es importante tener en cuenta que estas secuencias cercanas al gen se pueden dividir en promotor
basal(TATA) y en elementos proximales(GC y CAAT), a los primeros se unirán factores generales y a
los segundos factores proximales, sin embargo para efectos de la clase se toma como que todas
las secuencias cercanas se reconocen por factores generales.

Hay que recordar que habían factores de transcripción generales(daban inicio a la replicación) y
reguladores(determinan la velocidad y frecuencia de la transcripción) que son trans, los generales
se unirán a las secuencias basales mientras que los reguladores se unirán a elementos distales.
Estos elementos distales reciben el nombre de estimuladores o enhancers, a los cuales se les van a
unir factores de transcripción que se unen a un mediador que unirá a el complejo de iniciación al
cual van a a acoplar mejor o al cual van a jalar enlenteciendo la transcripción. Estos enhancers
pueden regular estando tan lejos debido a que le ADN forma bucles en el núcleo, cada enhancer
puede afectar muchos genes ya que a el se pueden unir diversos factores que lo reconozcan, sin
embargo, la actividad del enhancer sobre cada gen es especifica gracias a la presencia de las
secuencias entre genes o insulators(IBP) que generan un bucle en el cual el enhancer solo va a
afectar al gen del bucle. Es importante tener en cuenta que los enhancers no activan o apagan un
gen simplemente regulan la velocidad y el número de repeticiones de la transcripciones.

Los represores son los elementos trans que se van a unir a los silencers que son elementos cis que
pueden estar upstream o downstream, estos tienen diversos mecanismos de acción, pero todos
actúan a nivel del promotor, algunos interfieran con la interacción de los factores de transcripción
con el ADN, otros se unen como tal a las secuencias del promotor impidiendo la unión de los
factores de iniciación y otros actúan haciendo relaciones proteína-proteína. Estos si pueden llegar
a inhibir la traducción como tal.

Un ejemplo de la metilación y el fenotipo que genera lo da la gata rainbow que presentaba

coloración tanto naranja como gris y esta coloración se da por el eje x, en el desarrollo
embrionario las células en un momento determinado inactivan el cromosoma x, pero no lo hacen
de manera homologa es decir unas inactivan uno y otras el otro por lo cual se genera esta
diversidad coloración, sin embargo al clonar a rainbow el clon solo presento coloración gris, esto
debido a que la metilación en x es muy estable y la célula somática que se escogió tenía inactivo el
cromosoma x con la coloración naranja.

Existen unas secuencias reguladoras en medio de los genes a las que se unen factores, estas
secuencias pueden ser tanto activadoras como reprimidoras.

Diferenciación Celular

Las células madres son aquellas que no están diferenciadas y se pueden dividir en células
diferenciadas, estas células tienes una proliferación muy alta, y tienen una plasticidad(se dividen
en diversas células conforme al ambiente), tiene un potencial de autorenovación(este proceso es
permanente) y tiene el potencial de diferenciarse en diversos tejidos o linajes.

Estas células tiene muchas formas de aplicarse a la medicina y a la ciencia tales como la ingeniería
de tejidos(por la autorenovación), la terapia y curación de enfermedades como algunos tipos de
cancer(este elemento es muy difícil de manejar ya que las respuestas a los tratameintos depende
del individuo) y transplantes.

La autorenovación de las células se da debido a que estas al dividirse generan una célula madre
nueva y otra que se dirige a la diferenciación por lo cual se crean los llamados reservorios de
células madre en diferentes lugares del cuerpo que pueden generar células diferenciadas en el
momento en que se necesiten.
Las células diferenciadas pierden la capacidad de replicarse, se arrestan en el ciclo celular, cuando
esta falta de proliferación se altera sea en una célula diferenciada o en una célula madre se genera
cáncer.

Las células madre se pueden dividir conforme a su capacidad de regeneración, a su potencial de

diferenciación y al origen que tienen. En cuanto a la capacidad de regeneración estas se dividen en
corto y largo plazo, las de corto plazo se mantienen por un tiempo determinado en el individuo
como las ovogonias que en cierta etapa de la vida de la mujer se acaban o las que generan el
desarrollo embrionario, las de largo plazo son aquellas que se mantienen presentes durante toda
la vida como la mayoría de las células madre de la medula osea.

En cuanto a el potencial de diferenciación existen 4 tipos de células madre totipotenciales,

pluripotenciales, multipotenciales, y unipotenciales. Las totipotenciales son aquellas que tienen la
capacidad de generar todo un organismo completo y el tejido extraembrionario, estas solo se
presentan en cigoto y mórula. Las células pluri potenciales son aquellas que pueden dividirse en
las capas embrionarias y en las células germinales, estas son las células en el blastocisto que tiene
dos capas, la externa formara la placenta y la interna formara al feto como tal. Las células
multipotenciales son las capas embrionarias(endodermo, mesodermo y ectodermo) que tienen la
capacidad de generar diversos tejidos, el endodermo se dirige a todo lo gastrointestinal y al
hígado, el ectodermo se dirige a neurogenesis y piel, el mesodermo se dirige a medula osea y
musculo. Las células unipotenciales son aquellas que solo pueden dividirse en un linaje un ejemplo
de esto es las células germinales que en hombre solo se dividen a espermatozoide(4 por cada
meiosis) y en mujeres a óvulos(1 y 3 cuerpos polares por cada meiosis.

Las fuentes de origen de las células madre son muchas, la primera fuente es la embrionaria(se
obtienen generalmente células toti o pluri potenciales) que se obtiene principalmente de
blastocito o antes alrededor de esta fuente hay un gran dilema bioético ya que se realiza in vitro y
se asesinan seres vivos según la percepción de ciertas religiones, cuando se han obtenido estas
células se modifican las condiciones de su cultivo para generar la diferenciación deseado, la
segunda fuente son las adultas(se obtienen células multi o unipotenciales) que tienen una gran
ventaja de aplicación ya que le dilema bioético es muy bajo y la forma de obtenerlas es viable y en
cierto modo rápida, estas células se pueden obtener de diversos lugares como los mioblastos,
osteoblastos, condroblastos, medula osea, testiculas etc.., en general estas adultas se pueden
clasificar en tres grupos generales epiteliales, mezenquimaticas y hematopoyéticas. Las células
epiteliales son las que dan origen a queratinocitos espinosos, granulosos, lucidos y corneos, su
obtención se da principalmente de la capa basal de el epitelio principalmente de la piel(celula
unipotencial). Las células madre mezenquimaticas son las del mesodermo, es decir aquellas que
me genera osteogenesis, asipogenesis y condrogenesis(cartílago), estas células se pueden obtener
de muchas fuentes como la medula osea, tejido adiposo, sangre periférica, músculo esquelético,
tejido alveolar etc…. Las células hematopoyéticas(multipotenciales) son las que generan todas las
células sanguíneas, estas pueden tomar dos vías la linfoide(linfocitos) o la mieloide(esta madura
en la medula ósea y genera eritrocitos, plaquetas y células blancas diferentes a linfocitos). La
ultima fuente de obtención de células madre es el cordón umbilical, esta vía de obtenciones muy
útil cuando no hay donantes ya que pueden servir a la misma persona(si las recolecto cuando
nacio) o para familiares, están disponibles rápidamente, tienen una probabilidad muy baja de
transmitir enfermedades genéticas de la madre; sin embargo tiene diversas desventajas como que
la cantidad de células madre es menor que las que se obtienen en las mezenquimaticas o
hematopoyéticas en adultos, además el transplante requiere un mayor tiempo de “agarre”
diferencia de las obtenidas de medula osea, por último para los adultos se requiere más de un
donante debido a la baja proporción. La recolección de células madre de cordones ha genera la
creación de bancos privados y públicos de células madre.

Las aplicaciones terapéuticas de estas células se han ampliado en los últimos años, se ha utilizado
en diversas enfermedades. En la diabetes tipo I, se generan transplantes de células que se
diferencias en islotes B pancreáticos sanos que producen la insulina. En el parkinson se
implementan células que se diferencias en las células de la sustancia nigra(productora de
dopamina) se ha probado en ratones y muestran una notoria mejoría. El infarto del miocardio se
utilizan células madre para reparar el tejido que se murió por el infarto mediante diversos
métodos de aplicación como la inyección intravenosa, infusión intracoronaria y pared ventricular.

Existen diversos genes que me regulan la pluripotencialidad en el desarrollo embrionario, entre

estos está el Oct4(regula autorenovación) Cdx2(está en el núcleo de células intestinales, regula
embriogenesis y formación de placenta) Nanog(mantenimiento pluripotencialidad) y
GATAG(organogénesis).

La diferenciación celular es mediante la cual una célula se especializa en su función para esto
expresa solo ciertos genes y cambia su conformación morfológica y fisiológica, este genera que las
células sean más eficientes pero genera también que sean dependientes. La diferenciación sigue
cierto proceso el cual comienza con la determinación o compromiso que sufren las células madre
en su cambio desde pluripotenciales hasta unipotenciales, para posteiromente generas las células
diferenciadas. Cuando las células se diferencian pierden su capacidad de proliferación

Existe un proceso conocido como dediferenciación en la cual la célula se “reprograma”, esta puede
ocurrir como respuesta a disminución en la densidad celular, ocurre en células malignas o se
puede dar en cultivo(in vitro). Cuando se dediferencia una célula maligna puede proliferar
generando cáncer, al dediferenciarse se vuelve más resistente a la muerte celular, puede tener
respuestas adaptativas(generar aneuploidias o poliploidias) y genera la perdida de las
características fenotípicas.

Para realizar las terapias con células se ha desarrollado una técnica mediante la cual se pueden
obtener células madre pluripotenciales a partir de una célula somática, para esto se pueden
realizar tres técnicas, la primera es la SCNT en la cual a un ovocito se le extrae el núcleo y se le
introduce el núcleo de la celula somatica y los factores citoplasmáticos del oocito dediferencian el
el ADN. La segunda técnica es la fusión celular donde fusiono el oocito con la célula somática y
nuevamente los factores lo reprograman. La tercera técnica es la introducción de factores
reprogramadores la célula que la dediferencian.
Para llevar a cabo esta ultima técnica se pueden utilizar multiples técnicas, la primera es el uso de
retrovirus o lentivirus que son las mas efectivas, sin embargo estan muy asociadas con la
activación de oncogenes o transgenes que favorecen el cáncer, también se puede utilizar un
adenovirus que no inserte su ADN en el ADN nucelar, todos estos son vectores virales, también
existen vectores no virales como los plasmidos(PiggyBAC, Cre-IoxP). Otra técnica es el uso de
proteínas reporgramadaroas como Oct4, Sox2, Klf4 y C-Myc que generan la reprogramación. Otra
técnica es el uso de ARNm sintetico que genera los facotres de transcripción mencionados en la
anterior técnica, esta técnica tiene el riesgo de generar una sobreexpresión de estos facotres que
llegan a actuares como protooncogenes. En el caso de este ARN o proteínas se pueden insertar
mediante liposomas(vesículas que inserta lo que se desea).

Muerte Celular

La muerte celular se da cuando una célula no es metabólicamente activa, esta muerte se puede
dar de manera programada(apoptosis generalmente aunque existen muchas otras vías) y de
manera no programada(necrosis). Es importante tener en cuenta que la célula puede tomar varias
direcciones: diferenciación, muerte celular, quiescencia/senescencia.

La muerte celular programada se da para la autodestrucción celular, eliminación de células no

deseadas, protector contra enfermedades etc… La apoptosis se da cuando a la célula no le bastan
los sistemas de reparación para corregir un daño en el ADN, usualmente es un daño significante ya
que de ser un daño pequeño la célula entra en senescencia.

La apoptosis interviene en varios procesos fisiológicos como la renovación celular(principalmente

en tejido epitelial), para el desarrollo de los órganos(separación de dedos, neurogenesis ya que se
tienen el doble de neuronas con las que se debe nacer, tubo digestivo y respiratorio etc..),
remodelación tisular, metamorfosis, eliminación de células malignas, involución tejidos hormono
dependientes. Este proceso esta mediado por caspasas y por la familia de proteínas Bcl2, las
caspasas se sintetizan en forma de procaspasas que se activan cuando llega una señal, y la familia
de las Bcl2 pueden ser proapoptoticas(BID) o antiapoptoticas(Bcl2), estas Bcl2 antiapoptoticas van
a servir de tapón en la membrana externa mitocondrial, además la apoptosis utiliza ATP, la célula
se ve contraída y con un núcleo muy grande, los organelos están intactos(para su posterior
reciclamiento) y la apoptosis no genera inflamación alguna.

Grosso modo la apoptosis se da de la siguiente manera: Hay una contracción celular que genera
una deformación de la célula generando una pérdida de comunicaciones intercelulares y
aumentado las conexiones con la matriz extracelular; se presenta un condensamiento de la
cromatina y una posterior fragmentación de la misma; se generan unas vesículas llamadas cuerpos
apoptoticos que contienen citosol y componentes del mismo en su interior como organelos; los
macrófagos fagocitan los cuerpos apoptoticos. La apoptosis se puede dividir en tres fases:
inducción, ejecución y degradación.

La inducción de la apoptosis se puede dar por vía extrínseca o intrínseca. La vía extrínseca se da
por la acción de ligando(que puede ser un receptor de otra célula o un ligando presente en el
medio) que se unen a receptores de muerte(FAS por ejemplo) a estos receptores de muerte se le
van a unir unas proteínas activadores(FADD) por ejemplo, a estas proteínas se unen las
procaspasas que se van a autoescindir activándose, estas primeras caspasas(inductoras) van a
activar otras procaspasas escindiéndolas generando las caspasas, estas segundas
caspasas(ejecutoras) van a empezar a escindir proteínas y ADN además de activar otra serie de
proteínas. La vía intrínseca se da a nivel interno en este caso por diferentes estimulos(ROS, daño
mitocondrial, toxinas, radiaciones, shock térmico, aumento Ca2+ etc…), en esta via lo primero que
sucede es el estimulo de las Bcl2 proapoptoticas que alteran la permeabilidad de la membrana
externa mitocondrial permitiendo la salida de el citocromo c(esta salida se da por la Bax
específicamente), este va a formar un complejo con Apaf-1 y con la procaspasa9(que se activa a
caspasa 9 al unirse), mediante la formación de 7 complejos se forma un apoptosoma, en este
punto se libera el Smac-Diablo que inhibe la IAP(inhibidor de apoptosis) esto permite que la
caspasa 9(inductora) me active a las caspasas ejecutoras que generan la apoptosis.

El mecanismo de activación de caspasas es en si la ejecución y la degradación es la formación de

los cuerpos apoptoticos que posteriormente se fagocitan. Es importante tener en cuenta que en la
vía extrínseca la caspa 8 y 10 son inductoras mientras que la 3,6 y 7 son ejecutoras; mientras que
en la vía extrínseca la caspasa 9 es la inductora, y la 3,6 y 7 son ejecutoras. Nótese que ambas vías
se unen en las caspasas ejecutoras razón por la cual tienen el mismo resultado. Es importante
tener en cuenta que las caspasas son cistein proteasas(su dominio cisteína catalítica reconoce los
dominios de aspartato y escinde en ese punto)

Existen varios tipos de apoptosis, la autofagia es un proceso conservado en eucariotas en el cual

se forma una doble o múltiple membrana sobre lo que se desee consumir estos van a lisosoma
donde son digeridos, puede haber macro o microautofagia. Otros tipos son catástrofe
mitótica(fallas en checkpoint y mitosis aberrante), piroapoptosis(no-apoptotica se da por caspasa
1), parapoptosis(vacuaolización), Entosis(no apoptotica, se da por celulas epitaliales que se han
desprendido), Anoikis(separación células no epiteliales de la matriz extracelular).

Necrosis

La necrosis es la muerte celular no programada, tiene diversas características entre las que se
incluyen: tumefacción(hinchazón) de la célula debida a un desequilibrio osmótico(aumento de
Ca2+ a nivel intracelular), ruptura de la membrana(pérdida progresiva de fosfolípidos),
vacuolizacion de mitocondrias, hinchazón de los lisosomas y aumento en el número de los
mismos, derramamiento de contenido intracelular, los organelos se degradan, es producto de un
daño o injuria, es un procesos violento sin requerimiento de ATP, además genera un perdida de
función y no solo afecta a una célula como la apoptosis sino que afecta a un tejido. En cuanto a la
morfología nuclear existen tres posibilidades , cariorrexis(dfesintegracion nuclear y de cromatina),
picnosis(retracción nuclear y condensación) y cariolisis(disolución del núcleo pero pérdida gradual
de cromatina).
La necrosis se puede dar por múltiples factores: agentes físicos(radiaciones UV), agentes químicos
o fármacos(tóxicos), agentes infecciosos(virus o bacterias), reacciones inmunológicas, defectos
genéticos y desequilibrio nutricional.

En la necrosis es muy común la entra masiva de Ca2+ a la célula, también se caracteriza por
anomalías en el citoesqueleto, además puede estar causa por los radicales libres de oxigeno(ROS)
los cuales generan afecciones en el ADN, peroxidación de los lípidos(alterando al membrana
celular) etc..

Existen varios tipo de necrosis. Coagulación se genera una muerte por hipoxia(poca llegada de
oxígeno a un tejido generando isquemia), se da principalmente en el riñón corazón y suprarrenal,
la arquitectura celular no se ve muy afectada, se da una pérdida del núcleo y una fragmentación
de los organelos, las células en este tipo de necrosis se conocen como lapida acidófica. Colicuativa,
se da por autolisis o heterolisis(debido a una desnaturalización), se da principalmente en el
cerebro y se generan unos quistes. La necrosis grasa, se da en el tejido adiposo(principalmente en
glándulas mamarias debido a traumatismos severos) debido a la perdida de acción de las lipasas,
también se presenta en el páncreas. La Caseosa se caracteriza por una infección tuberculosa a
nivel pulmonar o de los riñones, en este caso si se presenta una destrucción de la arquitectura
celular. La gangrenosa se presenta en los miembros(principalmente en los inferiores en
enfermedades como la diabetes) debido a una interrupción en el flujo sanguíneo, esta necrosis se
puede clasificar como una necrosis de coagulación modificada por acción colicuativa de bacterias y
leucocitos. La licuefactiva se en el cerebro y la piel, aquí predomina un factor enzimático y se da
por bacterias y hongos hay pus y se da principalmente por una perforación en el tejido.

Senescencia

La célula puede entrar en un estado de quiescencia o senescencia la diferencia principal entre

estos dos es que la quiescencia es reversible mientras que la senescencia es irreversible, la
primera se da en células sanas mientras que cuando una célula sufre un daño pero no lo suficiente
como para inducir apoptosis. La senescencia se interpreta como un envejecimiento a nivel celular,
mientras que el envejecimiento como tal se considere a nivel del organismo o sistémico.

La senescencia se define como un estado irreversible de detención de crecimiento o del ciclo

celular alterando el fenotipo y la función celular. Este estado se genera por daños en la célula que
se identifican en G1 S o en G2, si se identifica un daño en M la célula se va a apoptosis. Es
importante tener en cuenta que estas células son metabolicamente activas es decir son viables
pero no proliferan, pero su acumulación aumenta al predisposición hacia el cáncer.

Las características de las células senescentes son que están aplanadas y estrelladas, se presenta
una acumulación de lisosomas debido a la falta de acción de las proteasas, presenta una
acumulación de beta-galactosidasa, hay unos focos de heterocromatina, la célula no responde a
estímulos mitóticos, presenta una disminución en la adhesión intercelular generada por un
aumento en la adhesión con la matriz extracelular, cambio en la expresión de los genes supresores
de tumores, además estas células presentan un fenotipo secretor en el cual debido a su alteración
funcional empieza a secretar componentes que no debe como citosinas proinflamatorias,
metaloproteinas(consumen matriz extracelular), factores de crecimiento etc..

Se habla de la senescencia como una proceso con carácter pleiotropico ya que cuando se es joven
la senescencia es un mecanismo de prevención para la células malignas, mientras que la vejes la
acumulación de células senescentes genera una predisposición al cáncer(es pro-tumorigenico),
esto se debe a que estas células acumulan mutaciones y pueden llegar a dediferenciarse y
empezar a proliferar con todas las mutaciones que tienen generando cáncer.

La senescencia se da por múltiples causas: activación de proto-oncogenes(convirtiéndose en

oncogenes generando que los supresores arresten la celula), activación supresores tumorales,
pérdida del casquete telomerico(límite de hayfick que se define como el número de veces que una
célula puede llegar a dividirse), estrés oxidativo(ROS) , carencia de nutrientes y contactos celulares
inapropiados .

La via central para activar la senescencia es cuando se genera un daño de una o de doble cadena
que activen atm o atr las cuales a su vez activan chk1/chk2 estas aumentan la presencia de P53 y
P21, que inhiben la unión de Ciclina E con Cdk2 generando que Rb se hipofosforile y inhibe a
E2F(factor de transcripción que activa genes para continuación del ciclo celular) arrestando así la
célula. Otra vía de señalización se da cuando el estrés celular activa P19arf y P16, la P19arf inhibe a
Mdm2(ubiquitin ligasa E3 que se encarga de la ubiquitinacion de p53) el consecuente aumento en
la concentración de p53 que sigue la ruta anteriormente mencionada, mientras que p16 inactiva la
unión de Cdk 4 y 6 con la ciclina D favoreciendo la hipofosforilacion de Rb.

La mayoría de los tumores están asociados con fallos en p53, cuando p53(guardián del genoma)
no logra arrestar las células dañadas estas proliferan de manera descontrolada generando el
cáncer.

Cáncer

Un tumor se considera benigno cuando sus adhesiones no están afectadas, es decir cuando el
crecimiento es lento y no se propaga a otros tejidos, por el contrario un tumor maligno(cáncer)
presenta un crecimiento rápido que se propaga a otros tejidos.

El cáncer se define como un grupo de enfermedades que generan una proliferación acelerada,
crecimiento celular un crecimiento celular y una destrucción del tejido y de adhesiones generando
metástasis.

La causa principal del cáncer se da debido a que una célula mutada en senescencia se dediferencia
proliferando de manera descontrolada con estas mutaciones. Estas mutaciones se llevan a cabo
sobre los proto-oncogenes o sobre los genes supresores de tumores.

Las causas del cáncer son muchas y se pueden dividir en dos grandes categorías: mutación de ADN
y agentes infecciosos(también generan una mutación pero por una etiología infecciosa). En el caso
de la mutación del ADN esta se puede dar por una radiación ionizante, por factores
medioambientales(mutagenos como el tabaco, alcohol, nitrito, benzeno, tolueno etc..), por
mutaciones aleatorias en las células somáticas(errores en la replicación) y por mutaciones
heredadas(nótese que no se hereda el cáncer sino la predisposición debido a mutaciones
heredadas en los proto-oncogenes o en los genes supresores). En el caso de los agentes infeccioso
tenemos los virus(HPV que causa cáncer cervical o Hepatitis B y C que causa cáncer hepático o
Herpes que causa linfomas) y las bacterias(H. Pyrolli que causa cáncer gástrico), en el caso de los
virus la introducción de su genoma en el nuestro es lo que puede llegar a causar mutaciones
mientras que en las bacterias la hostilidad ambiental que generan puede inducir mutaciones en la
célula.

En los factores asociados a la generación del cáncer encontramos que un 30-35% se debe a una
dieta no balanceada(muchos carbohidratos), 30% a alcohol y tabaco, 18-20% a infecciones
crónicas, 18-20% a hormonas(la terapia con estrógeno por ejemplo genera cáncer mamario), 2% a
la ocupación(fabricas de vidrio, baterías pinturas y demás compuestos que tienen mutagenos).

Las células cancerosas son células inútiles que migran por la linfa o torrente sanguíneo hasta otros
tejidos, estas células pierden los complejos de unión y adquieren una morfología estrellada en la
cual pierden la polaridad(no se identifica una ubicación apical, basal y lateral), tienen una
autosuficiencia de señales de crecimiento(e.g. Aumento gen H-Ras), insensibilidad a supresores de
crecimiento(perdida de Rb), evasión de la apoptosis(Produce sus propios factores de crecimiento),
angiogénesis sostenida(sobreexpresión de factores endoteliales vasculares, generando formación
de vasos sanguíneos), invasión tisular y metástasis(afección de la E-caherina), desregulación del
metabolismo(Anaerobias), reproducción ilimitada(se activan las telomerasas) y evitan la
destrucción por el sistema inmune.

Hay varios tipos de cáncer. El cáncer en células epiteliales es el que se presenta con mayor
frecuencia(80% de los casos) se genera principalmente sobre mucosas y glándulas y se le conoce
como carcinoma, es importante tener en cuenta que el epitelio no tiene vasos sanguíneos y
inicialmente un tumor en esta fase es benigno hasta que se presenta el inicio de la transición
epitelial-mezenquimatica. El cáncer solido(2% de los casos) es el que se presenta en tejido
conectivo, huesos, cartílagos, músculos, vasos sanguíneos etc.. y se les conoce como sarcomas. Los
hematológicos son los derivados de célula hematopoyéticas, linfoides o mieloides se denominan
linfomas y leucemia. Cuando el tumor se presenta en el tejido nervioso se conoce como glioma.

La transición epitelio-mezenquimatica es la explicación de por qué las células cancerígenas migran

generando metástasis. En esta transición ocurre lo siguiente: se genera un crecimiento local
exagerado que genera la invasión de las células epiteliales afectadas al tejido mezenquimatico(que
si posee vasos sanguíneos a diferencia del tejido epitelial), posteriormente se da perdida de
cadherina que genera una morfología estrellada en la célula perdiéndose la polaridad(extremos
apical basal y lateral) debido a la separación con las células vecinas, se genera una reorganización
de la actina que favorece la migración, se da una pérdida de queratinas que genera separación con
la membrana basal, y aumento de vimentina que favorece la migración, por último se da una
síntesis de metaloproteinas que degradan las proteínas de la matriz extracelular. Cuando la célula
cancerígena llega al tejido blanco se genera una transición mezenquimatica-epitelial aferrándose
así a este tejido generando una micro metástasis y posteriormente una macrometastasis y
proliferando generando un nuevo tumor. Es importante tener en cuenta que esta transición en
células no malignas es un proceso natural en el desarrollo embrionario o en la cicatrización.

En el cáncer se habla de una selección clonal ya que una célula tiene una mutación y prolifera
generando una población clonal, después se generan unas mutaciones adicionales que generan
una ventaja selectiva(las que mas proliferan) dándose la selección clonal de la célula cancerosa.
Aproximadamente 7 mutaciones de diferentes genes son requeridas para que se genere el cáncer.

Los genes que se mutan son los proto-oncogenes(hay cerca de 100) o los supresores de tumores,
los primeros cuando no están mutados son los encargados de sintetizar principalmente las ciclinas
y quinasas para generar la continuación del ciclo celular, por ejemplo RAS, WNT, ERK, p53,
mientras que los segundos son los que actúan para arrestar el ciclo celular y generar senescencia o
apoptosis, por ejemplo p53 y Rb. Cuando se da una mutación en un proto-oncogen este se
convierte en un oncogen adquiriendo una función, mientras que cuando se muta un supresor de
tumores este pierde su función y no arresta el ciclo.

Los proto-oncogenes son mutantes en su mayoría por lo cual una mutación de un alelo genera la
enfermedad, es importante tener en cuenta que la mayoría de proto-oncogenes codifican para
factores de transcripción de las proteínas que permiten la continuación del ciclo celular por lo cual
su sobre-expresión genera cáncer. Para activar un proto-oncogen y convertirle en oncogen se
requiere la coactivación de otros oncogenes o de ciertos factores medioambientales que me
afecten el proto-oncogen. Ejemplos claros pueden ser el Ras que participa en la transducción de
señales y se asocia con cáncer de vejiga, o el c-Myc que es un factor de transcripción que se asocia
con los linfomas.

Los supresores de tumores son proteínas que actúan en la regulación de la transcripción,

reparación del ADN, comunicación intercelular, ciclo celular etc.. estos son los encargados de
arrestar la célula y dirigirla a senescencia o apoptosis, por lo cual su mutación permite la
continuación del ciclo a pesar de haber daños en el ADN. Estos genes se pueden inactivar por
mutaciones puntuales, deleciones de fragmentos de cromosomas o metilación del promotor. El
Rb(Retino blastoma) es un gen supresor de tumores que hipofosforilado se une a E2F arrestando
el ciclo celular ya que E2F es un factor que codifica para las ciclinas y quinasas necesarias,
mutaciones en este gen se asocian con el cáncer ocular originario en células de la retina. p53 se
conoce como el guardián del genoma, su afección se relacione con el 85% de los casos de cáncer,
este supresor puede arrestar a la celula en G1(senescencia) o en M(apoptosis) puede activar genes
proapoptoticos, reprimir genes antiapoptoticos, permitir la liberación del citocromo c etc.., el
síndrome de Li-Frau-Meni se da por una mutación hereditaria en p53 generando múltiples tipos de
cáncer desde la niñez.

El p53 además de supresor también ha sido considerado como un proto-oncogen ya que se

identificó una mutación en el gen que lo codifica en la cual cambiaba su actividad al favorecer la
proliferación en lugar de inhibirla.
El cáncer se puede dividir en esporádico y hereditario. El esporádico se da por las mutaciones
aleatorias que ocurren a lo largo de la vida concluyendo finalmente en el cáncer, esta se da en una
etapa tardía de la vida y representa el 90% de los casos de cáncer, se caracteriza por ser unilateral
en órganos pares. El hereditario se da por mutaciones heredades en supresores o proto-
oncogenes generando cáncer a temprana edad y de carácter bilateral en órganos pares,
representa el 10% de los casos.

La terapia que se ha generado para el cáncer es múltiple, se debe tener en cuenta que cura como
tal no se ha encontrado para el cáncer. El primer tratamiento es la cirugía en al cual se extirpa el
tumor, esta generalmente está precedida de radio terapia o quimioterapia. El segundo
tratamiento es la radiación ionizante: se afecta el ADN induciendo apoptosis. El tercero es por
medio de los fármacos antineoplásicos que afectan la síntesis de ácidos nucleicos o de proteínas
de división. La terapia hormonal lo que hace es inhibir un receptor de la célula maligna. La quinta
opción es inhibir la angiogénesis al inhibir el factor de crecimiento vascular VGRF1 mediante el
uso de un receptor engañador. Por ultimo esta la inmunoterapia en la cual se introduce un
péptido antigénico que estaría en la membrana tumoral en una célula reticular dendrítica que se
inyecta en la persona esta célula es reconocida como un antígeno y las células de memoria
aprenden que deben matar las células con este péptido membrana(este procedimiento
evidentemente sirve para cuando no se tiene el cáncer y todavía está en periodo de prueba)

Integración del metabolismo

La integración del metabolismo se da debido a las asociaciones que presentan ciertos órganos con
otros, y debido a las hormonas que regulan los procesos en los diferentes tejidos de importancia
en el metabolismo, estos tejidos son: Páncreas, Hígado, cerebro, endotelio, tejido adiposo y tejido
muscular. En la integración es importante tener en cuenta que en periodos postprandiales
tendremos un exceso de nutrientes en nuestro organismo razón por la cual estos se dirigen hacia
su almacenamiento para posterior uso en los periodos de inanición.

El páncreas tiene una función secretora tanto endocrina(hormonas como insulina y glucagón por
parte de los islotes de Langerhans) como exocrina(enzimas pancreáticas que salen a la luz
intestinal por parte de los acinos). El páncreas se conecta con el intestino delgado y con el árbol
biliar razón por la cual cuando hay una afección pancreática se afecta la secreción biliar por parte
del hígado, por ejemplo en el cáncer de páncreas uno de los primeros signos es la ictericia debido
a la incapacidad de desechar la bilirrubina por parte del páncreas. En cuanto a las hormonas la
insulina es una hormona anabólica, es decir favorece los procesos de lipogenesis(ACC) y
glucogénesis(glucógeno sintasa), únicamente favorece un proceso catabólico que es el de la
glicolisis debido a que este es el que provee energía para los procesos catabólicos, a nivel
sanguíneo su acción es disminuir la lipemia y la glicemia. Por su parte el glucagón es una hormona
catalítica que favorece la glucogenolisis(glucógeno fosforilasa) y la gluconeogénesis y inhibe la
glicolisis(principalmente a nivel hepático), a nivel sanguíneo aumenta la glicemia y la lipemia.
Además de secretar enzimas y hormonas el páncreas junto con el hígado se encargan de secretar
bicarbonato para neutralizar el quimo acido que viene del estómago.
El hígado además de tener los hepatocitos va a tener la llegada de la vena porta(le trae los
nutrientes absorbidos por la circulación portal), la arteria hepática(trae los metabolitos enviados
por otros tejidos) y la vena hepática(lleva los metabolitos enviados por el hígado), además de por
si el tejido hepático es altamente ramificando en cuanto a términos vasculares. El hígado tiene un
papel central en el metabolismo debido a que en el ocurren gran parte de los procesos de el
metabolismo y ciertos procesos únicos(cetogenesis y gluconeogénesis) su función es de enviar
metabolitos a las células que lo necesitan sea en post-ingesta(musculo, adipocito, cerebro) o en
inanición(musculo y cerebro), razón por la cual en el hígado la carga energética siempre esta
elevada para poder realizar estos procesos anabólicos.

En periodos de post-ingesta debido al alto nivel de glucosa sanguíneo la glucoquinasa del

hígado(Km alta) empieza a actuar favoreciendo la glucogénesis, cuando se llega al límite de
producción de glucógeno se favorecen también la vía de las pentosa fosfato para la producción de
NADPH(G6PDH) y la glicolisis cuyos productos se dirigen a la formación de glicerol y de ácidos
grasos que se almacenan en las VLDL que se dirigen al musculo y al adipocito para que le primero
los utilice como energía en reposo y el segundo los utilizo en la lipogenesis. Además se favorece el
proceso de la esteroidogenesis que se une no solo a las LDL sino también se dirige principalmente
a la formación de ácidos biliares. Por otro lado también se favorece la síntesis de novo de
aminoácidos(transdesaminación) y la ureogenesis(en caso de que la dieta sea rica en proteínas y
se catabolicen los aminoácidos ingeridos). También se favorece la síntesis de nucleótidos por la vía
de recuperación principalmente(las bases vienen de la digestión).

En periodos de inanición en el hígado se favorece la glucogenolisis y la gluconeogénesis, la primera

genera glucosa que sale a la sangre(glucosa-6-fosfatasa) mientras que la segunda capta los
productos que vienen de otros órganos como la alanina(ciclo de cahill) o el lactato(ciclo de cori)
del musculo convirtiéndolos en glucosa y enviándolos nuevamente al musculo. Además debido a
que en el tejido adiposo se está dando lipolisis el hígado utiliza los ácidos grasos como
energía(beta-oxidación) para poder enviar la glucosa a los demás tejidos y no consumirla in situ.
Además el glicerol producto de la lipolisis es utilizado también en gluconeogénesis. Por otro lado,
debido a que los aminoácidos se están utilizando como energía en estos periodos el amoniaco
llega la hígado(en forma de glutamato o glutamina) y favorece la ureogenesis(detoxificación
amoniacal) Además se está favoreciendo la cetogenesis(debido a la acumulación de Acetyl-CoA)
que se dirige a tejidos como el nervioso a servir de energía en cetolisis convirtiéndose en acetyl-
CoA.

Por otro lado en el hígado también se lleva a cabo los procesos de detoxificacion no solo
amoniacal, también la síntesis y catabolismo de porfirinas(debido a que le hígado almacena hierro)
produce la bilirrubina que ha de ser excretada, también se da en el hígado el catabolismo de
hormonas(muchas contienen nitrógeno ureogenesis consecuentemente), estos proceso no se
regulan como tal por la ingesta o no de alimentos de manera tan directa.

En el tejido adiposo tiene su principal función en el almacenamiento de lípidos para cuando estos
se necesiten en la inanición, es decir en periodos postprandiales se va a favorecer la
lipogenesis(aciltranferasas) mientras que en inanición se va a favorecer la lipolisis(lipasa sensible a
hormonas), sin embargo esta es más función del tejido adiposo blanco(el que tenemos todos
nosotros) sin embargo existe otro tejido adiposo, el pardo(presente únicamente en neonatos) que
va a estar lleno de mitocondrias(el blanco tienen pocas) y va a generar mucha respiración celular
pero en lugar de utilizar el oxígeno como aceptor de electrones va a utilizar la termogenina
produciendo calor. El tejido adiposo también se encarga de secretar diversas hormonas como la
leptina(inhibe el sentimiento del hambre la inhibir la PYY-36 de el hipotálamo que es una hormona
que tiene el mismo efecto de la insulina además de que genera hambre) y como la
adiponectina(favorece a la insulina y es anti-inflamatoria), además de esto también va a sintetizar
moléculas pro-inflamatorias.

En personas obesas hay un exceso de tejido adiposo que empieza a ubicarse en zonas que no
debería formando el tejido adiposo ectópico o viceral, este tejido adiposo se afecta
funcionalmente y generando resistencia a la leptina y una baja producción de adiponectina(se
pierde sensibilidad a la insulina por ende), además el tener tanto tejido adiposo genera que se
sobre produzca la citoquina pro-inflamatoria que oxidan a las LDL generando que las consumas los
macrófagos dando paso a la aterogenesis. Es importante tener en cuenta que los ateromas tienen
tanto LDL(colesterol) como triacilgliceridos que les da el HDL.

El tejido nervioso es importante e nivel metabólico ya que es el principal consumidor de oxígeno y

glucosa en el cuerpo, seguido del tejido muscular. Este tejido se divide en periférico y central y
tiene células muy especializadas(la especialización la da la dotación enzimática) que forman
diferentes neurotransmisores por lo cual se pueden clasificar en dopamineticas, GABAemicas,
etc… Debido a que este tejido no almacena casi nada(solo un poco de glucógeno) es dependiente
de la glucosa que le envía el hígado, y de la circulación. Utiliza una hexoquinasa con una km muy
baja para poder trabajar eficientemente en periodos de inanición. Además este tejido hace
cetolisis en la inanición para obtener energía, es decir sus procesos principales son catabólicos en
periodos postprandiales y de inanición, sin embargo se han identificado ciertas células de este
tejido denominadas los astrocitos que además de generar una integridad en la función de las
neuronas también lleva a cabo la gluconeogénesis formando un “mini ciclo de cori”. Además de
esto el tejido nervioso también utiliza mucho los aminoácidos como neurotransmisores o como
precursores de los mismos, además de para la producción de proteínas; esto junto con los
procesos catabólicos mencionados anteriormente generan una gran cantidad de tóxicos que han
de llevarse al hígado(glutamina) o que han de eliminarse in situ(glutatión). Es importante tener en
cuenta que este tejido consume tanta energía debido a que la transmisión del impulso nervioso
requiere una inmensa cantidad de bombas Na/K que consumen ATP.

Existe en este tejido algo conocido como la barrera hematoencefalica que es un tejido
membranosos asociado con el endotelio y el tejido cerebral, este tejido es altamente selectivo en
cuanto lo que deja entrar y deja salir, un transportador muy particular permite la entrada de
aminoácidos(aromáticos y de cadena ramificada) a la vez que permite la salida de glutamina. Fallos
en esta barrera genera una entrada desmedida de metabolitos a l cerbero generando meningitis.
En el tejido muscular en periodos postprandiales cuando se está en reposo se favorece la
betaoxidación, glucogénesis y síntesis de creatina. Posteriormente en inanición se consume el ATP
presente en el musculo(mediante la defosforilación de la creatina) posteriormente se da pazo a la
gulogenolisis y la glucosa entra a la glicolisis que otorga el ATP mientras se produce el ATP por la
fosforilacion oxidativa. Si la actividad física es muy prolongada se empieza a utilizar los ácidos
grasos y los aminoácidos como fuentes de energía, y se da un metabolismo anaerobio, estas
condiciones generan lactato y piruvato que se dirigen al hígado a gluconeogénesis, además el
catabolismo de aminoácidos produce amonio que es transportado por la glutamina al hígado. En
este tejido es muy importante la acumulación de malonil-CoA como inhibidor del transportador de
carnitina, por lo cual la glucosa mediante el aumento del AMP activa la AMPK que inhibe a ACC
favoreciendo la beta oxidación. En los obesos los ácidos graso en forman diacilglicerol que genera
la perdida de la sensibilidad a la insulina al inhibir la cascada de señalización de la misma,
causando diabetes tipo II.

Existen tres tipos de tejido muscular, el esquelético, liso y cardiaco. Sin embargo dentro de estos
pueden existir tres tipos de fibra muscular la I, la IIA y la IIB. La fibra muscular tipo I tiene un
metabolismo aerobio generando una contracción más lenta razón por la cual esta presenta en las
personas con actividad aeróbica, no requiere de un pulso cardiaco tan elevado, se conoce como
fibra roja. La tipo IIA tiene metabolismo tanto aerobio como anaerobio generando una contracción
rápida, esta se encuentra presente en las personas que no hacemos ejercicio recurrentemente. La
tipo IIB tiene un metabolismo anaerobio producción una contracción extremadamente rápida,
esta se encuentra presente en los velocistas(aunque también presentan la tipo I), esta es la fibra
blanca.

En la glándula suprarrenal se produce el cortisol(corteza) y la adrenalina(medula), esta

segunda(que proviene de la tirosina) es muy importante en periodos de inanición sobre todo de
actividad física ya que contiene receptores en hígado, musculo y adipocito. A nivel fisiológico
genera un aumento de la frecuencia cardiaca y una dilatación de los bronquios, a nivel metabólico
activa la glucogenolisis, gluconeogénesis y la glicolisis(esta última no se activa en el hígado ya que
este debido a su permanente carga energética elevada la inhibe a pesar del efecto de la
adrenalina), favorece la movilización de ácidos grasos y la secreción de glucagón.

El tejido endotelial es el tejido de mayor presencia en el cuerpo, recubre todos los vaso
sanguíneos y tiene diversas funciones en los mismos que permiten el correcto transporte de
metabolitos a los tejidos. En primer lugar la sangre siempre genera una fuerza de fricción(fuerza
de cizalla) que puede dañar la pared de los vasos sanguíneos esto genera la secreción de Oxido
Nitrico Sintasa por parte del endotelio que va a favorecer la vasodilatación, esta enzima secreta
óxido nítrico que aumenta la concentración de guaniliato ciclasa(GMPc) que genera la dilatación
de los vaso sanguíneos. Por otro lado la secreción de óxido nítrico sintasa también se ve
estimulada por la hipoxia, sin embargo si la hipoxia es muy prolongada implica que están llegando
ROS en la sangre los cuales al reaccionar con el óxido nítrico genera peroxinitritos que son muy
dañinos para el tejido vascular. Además de lo mencionado anteriormente la otra función
importante del endotelio a nivel vascular es la sintetizar moléculas tanto antitrombogenicas como
prototrombogenicas regulando así la coagulación sanguínea.

Ensemble

ENSEMBLE constituye un recurso centralizado de información biológica, de dominio público, que

permite la anotación y consulta de múltiples genomas eucariotas, sin embargo debido al gran
número de especies solo algunas(las de mayor utilidad) han sido estudias ampliamente como el
humano claramente, el ratón, el pez cebra y la rana xenopus.

Mediante esta base de datos al seleccionar una especie y seleccionar view kariotype, podemos
conocer el número de cromosomas, de genes(codificantes o no codificantes) y la cantidad de
pares de bases que tiene el genoma de una especie.

Al estar dentro de una especie se puede buscar la información acerca de un gen presente en esta
especie, así se puede conocer la proteína que codifica el gen, la cantidad de genes
ortólogos(semejante en otra especie) y de genes parálogos(semejantes en la misma especie) que
se han encontrado, además de indicar el número de transcritos que tiene este gen.

Al ver la tabla de los transcritos del gen se puede ingresar al ID del transcrito o proteína y conocer
la longitud(tanto nucleotidica como aminoacidica del transcrito). Por otro lado si en la tabla se
selecciona el CCDS se puede conocer la secuencia del gen en la cual los intrones estarán de negro y
los exones de azul, de igual manera en el transcrito(proteína) estarán de azul los que se codifican
por el intron y por el exón permitiendo conocer cada codón a que aminoácido corresponde.

Genómica Comparada

Antes de que se realizara la secuenciación del ADN los genomas de los organismos se comparaban
mediante el uso de cariotipos, de este modo se determinó que el chimpancé compartía un 99% de
la información genética con nosotros, esta comparación se conoce como sintenia en la cual se
compara el orden de los genes en los cromosomas. El chimpancé tiene un haplotipo de 24
cromosomas por lo cual una reproducción entre hombre y chimpancé no es viable.

También se puede analizar la similitud de los cromosomas mediante la hibridación de un

cromosoma con el genoma de otro, en este caso el cromosoma insertado se hibrida en diversos
lugares del genoma mostrando las secuencias similares entre los mismos.

La genómica comparada aparece cuando se realiza la secuenciación del genoma humano,

mediante este estudio se puede entender que hace un gen en una especie a partir de su ortólogo,
o a partir de un paralogo. Para llevar a cabo estos estudios se requiere de los genomas que se
desean comparar y de otros datos biológicos como si lo que busco comparar es un ARN, ADN, una
proteína etc..

La genómica comparada tiene diversas funciones entre estas esta conocer la historia evolutiva, el
uso de especies modelo(utilizar ratones por ejemplo para llevar estudios o simulaciones de lo que
puede pasar en humanos) generando una mayor comodidad(más fácil de estudiar debido a que
genera una mayor descendencia, los ratones pueden reproducirse a las 3 semanas, y el embarazo
dura otras 4) un menor precio y menos problemas éticos. Para buscar candidatos de estas especies
modelos se usan las diversas bases de datos.

A la hora de comparar dos genomas es importante tener en cuenta la similitud de las

secuencias(longitud del gen, exones e intrones, patrones o dominios conservados y regiones
reguladoras(cajas)), la localización del gen(genes vecinos y localización en el cromosoma), que la
alineación de secuencias muy largas(por regiones no codificantes) se dan muy lentas en blast por
lo cual es bueno utilizar otras herramientas, los patrones evolutivos(ver la evolución de la
secuencias(transiciones o transversiones) y si los sistemas de repetición son semejantes), los
procesos similares entre las especies(usualmente procesos similares implican proteínas similares
codificadas por genes similares), y la identificación de regiones reguladoras y funcionales
conservadas.

Los órganos o estructuras homologas son aquellos que tienes función similar pero no vienen de
genes ortólogos como las alas por ejemplo. Los órganos análogos comparten el origen y en
algunos casos la función(brazo humano y ala murciélago) son similares estructuralmente. Dentro
de los genes que dan orígenes a las cosas análogas entre especies y en una misma especie
encontramos los genes ortólogos y paralogos, los ortólogos son aquellos que tienen una función
muy similar en diferentes especies, los paralogos son que tienen una función diferente en la
misma especie(se da generalmente por duplicaciones de una sección del genoma que genera
secuencias similares que producen proteínas funcionalmente diferentes.

La hibridación genómica comparada es un proceso de hibridación con sondas cortas mediante le

cual se puede identificar ganancias o pérdidas netas(no identifica translocaciones), en estos casos
se genera una hibridación en las secuencias complementarias mientras que las no
complementarias o las que no tienen con qué hibridarse(porque hay una perdida en la muestra
problema) quedan sueltas y mediante microarrays se puede determinar que secuencias no se
hibridaron.

En el alineamiento de un genoma completo se alinean los genes ortólogos(de manera local o

global) y genes de longitud diferente(a los que se les asignan ciertos puntajes) o secuencias no
ortólogas. Al observar los gráficos las secuencias ortólogas se ven en negro y los puntajes se
muestran mediante la formación de unas líneas hacia arriba que entre más altas sean más
similares son y entre más gruesas más grandes son las secuencias; mientras que las regiones
blancas o transparentes son aquellos no ortólogas.

Mediante la genómica comparada se puede realizar la predicción de la función de los genes, para
esto se realiza una comparación con genes ortólogos(ortólogos debido a que son los que me
generan un fenotipo similar en otras especies), para esto puedo analizar organismos con un
genoma muy parecido o muy distante, en el caos de escoger un organismo similar es porque
quiero analizar secuencias similares, mientras que si analizo organismos muy lejanos
evolutivamente voy a analizar la conservación de características. Para realizar esto debo saber si
quiero analizar una diferencia o una similitud entre los organismos.

Existen diversas fuerzas evolutivas, la primera es la fuerza de selección que es la cual permite que
solo organismo adaptados(que se reproducen) sean los que transmitan sus mutaciones a las
siguientes generaciones, la segunda es la fuerza de mutación que es la que genera todas esas
mutaciones aleatorias en un organismo, la última fuerza es la proporción de mutaciones
silenciosas y las mutaciones con sentido.

La genómica comparada permite además identificar motivos, es decir secuencias reguladoras en

cis similares entre dos especies, permite determinar por ejemplo la conservación en eucariotas de
las cajas del promotor(secuencias consenso).

El proceso en general es determinar genes que realizan algo en una especie mediante el uso de las
diversas bases de datos o microarrays, posteriormente ver cuáles de estos genes son ortólogos
con el humano y ver cuales no tienen una función definida, posteriormente analizar cuales
mutaciones en estos genes afectan a la especie modelo, y analizar si los humanos con estas
mismas afecciones presentan en el mismo problema con el gen.

Mecánica de Fluidos

En los líquidos cuando se aplica una fuerza esta se dispersa de manera equitativa hacia todas las
direcciones(razón por la cual el encéfalo está en un líquido o el bebe está en la placenta). Al aplicar
una fuerza se va a generar una presión.

La presión se puede dar en pascales(Pa) 1 pascal es 1N/m2 que es una unidad pequeña de presión,
atmosferas(atm) 1 atm es casi 101kPa, bar, milímetros de mercurio(mmHg), libra*pulada 2(PSI), o
centímetro*agua(cmH2O). La presión se define como fuerza por unidad de área(P=F/A).

La energía mecánica es la energía potencial suman a la energía cinética, se puede realizar una
analogía con la presión donde se tiene en cuenta la presión interna y la presión atmosférica.

Al hablar de presión de fluidos podemos tener presión hidrostática(líquidos en reposo) y presión

cinética(líquidos en movimiento), la presión hidroestatica es muy importante al analizar la presión
generada por la profundidad ya que a mayor profundidad mayor presión, mientras que la cinética
para la velocidad ya que a mayor velocidad menor presión.

Es importante tener en cuenta que el aire se considera como un fluido sobre todo en lo que es la
presión hidrostática. En la presión hidrostática a mayor profundidad mayor presión, la presión es
igual en puntos distantes pero a la misma profundidad, y el fluido debe estar en reposo. La
ecuación de la presión hidrostática es la siguiente: 𝑃 = 𝑃𝑎 + 𝑝𝑔ℎ siendo Pa la presión
atmosférica, p la densidad, g la gravedad y h la profundidad.

En la presión hidrostática es muy importante el principio de pascal en el cual hay dos áreas a la
misma profundidad y se aplica fuerza en una que es pasada a la otra por el líquido. Un área es más
pequeña(en la que se aplica la fuerza) mientras que un área es más grande. De esta forma la
presión en el pequeño seria Fp/Sp siendo s el área, mientras que en el grande seria Fg/Sg. Estas
dos presiones serán iguales ya que están a la misma profundidad por lo cual se puede concluir
esto: 𝐹𝑝𝑆𝑔 = 𝐹𝑔𝑆𝑝, al despejar Fp se puede concluir que este es menor que Fg.

La presión manomerica es la presión hidroestatica sin tener en cuenta la presión atmosférica, en el

caso de la presión arterial se asume que la sangre esta en reposo y a la presión manomerica se le
suma la presión arterial media(generada por el bombee del corazón que es de 100mmHg). Por lo
cual la presión arterial del pie se puede calcular mediante la siguiente ecuación: 𝑃𝑝𝑖𝑒 = 𝑃𝑎 + 𝑝𝑔ℎ
siendo h la distancia entre el corazón y el pie, nótese que si se tomara la presión arriba del corazón
el signo de la manomeria sería negativo y por ende habría una presión menor que la arterial
media. Esta diferencia de presiones que se expresa como ∆P = P2 – P1, es muy importante ya que
los fluidos siempre van a ir de mayor a menor presión.

En general en la presión hidrostatica lo más importante a tener en cuenta es que a mayor

profundidad mayor presión y a mayor área menor presión. Y que en el caso de la ley de pascal el
área pequeña se le aplica una fuerza pequeña mientras que le área grande se le aplica una fuerza
mayor pero ambas presiones son iguales.

En la presión cinética las condiciones cambian, en este caso la velocidad va a ser inversamente
proporcional mientras que el área va a ser directamente proporcional. Es decir al disminuir el área
disminuye la presión pero aumenta la velocidad de flujo o del caudal.

Para analizar el flujo se debe considerar un tubo con una entrada pequeña y una salida más
grande, el flujo en la entrada a de ser igual al flujo en la salida teniendo en cuenta que flujo se
define como 𝑄 = 𝐴𝑣 = 𝑚3 /𝑠. Debido a que el flujo debe ser igual se planteó la ecuación de la
continuidad: 𝐴1𝑣1 = 𝐴2𝑣2, como el flujo es igual la presion a lo largo del tubo debe ser constante
a partir de lo cual se planteo la ecuación de Bernoulli: 𝑃 = 𝑃 + 𝑝𝑔ℎ + 1/2𝑝𝑣 2 siendo P+pgh la
hidrostática y pv2la cinética sumadas, por lo cual a una mayor presión hidrostática menor presión
cinética y viceversa.

Esto último aplica exclusivamente para fluidos ideales, pero los fluidos reales tienen viscosidad
que generan una fricción con la pared del tubo por lo cual la ecuación de flujo para los fluidos
(∆𝑃)𝜋𝑟 4
reales se da por la ley de Poiseville: 𝑄 = Siendo n el coeficiente de viscosidad y L la
8𝑛𝐿
longitud del tubo, nótese que un cambio en el radio implica una multiplicación por 16 en el flujo,
mientras que un cambio en la viscosidad o la longitud me genera una disminución de 1/8, y un
cambio en la presión me genera un aumento equivalente.

Si se tiene en cuenta un aneurisma en este una vaso se dilata al dilatarse aumenta su área, al
aumentar su área aumenta la presión cinética al punto que puede llegar a romperse la pared del
vaso sanguíneo.