METABOLISMO DE PROTEINAS Y AMINOÁCIDOS
Introducción El metabolismo de proteínas y aminoácidos constituye enel organismo humano lo que se
describe como el ciclo global del nitrógeno. La forma más primitiva de entrada de nitrógeno en el
organismo es como ion amonio NH4+. La forma de excreción, a través del ciclo de la urea, característico
de mamíferos. Asimismo se prestará atención al catabolismo de aminoácidos (importante como fuente
energética, pero sobre todo como fuente neoglucogénica) y a su biosíntesis. En este último caso, en
referencia a la síntesis de aminoácidos esenciales, a pesar de que se trata de rutas no presentes en el
metabolismo humano. Antes de entrar en el metabolismo de aminoácidos se deben tener presente los
principales mecanismos de degradación de proteínas. Este proceso tiene una importancia creciente no
sólo como proceso catabólico, sino también como un importante punto de regulación de la biología y
funcionalidad celular.
Degradación de proteínas
Dependiendo de diversos factores, las proteínas se degradan a sus aminoácidos constituyentes,
procedentes de la dieta o las proteínas intracelulares. Se constituye así un reservorio de aminoácidos en
un equilibrio extraordinariamente dinámico, tanto en lo que se refiere a su contenido en nitrógeno como
en el destino metabólico de sus esqueletos carbonados, o como punto de partida para la síntesis de las
proteínas propias. Se consideran cuatro mecanismos de degradación proteica:
1. La degradación digestiva de proteínas; (
2. La degradación lisosómica;
3. la degradación mediada por ubicuitina/proteasoma y
4. La degradación apoptótica.
Las dos primeras tienen por objeto únicamente proveer el reservorio de aminoácidos, a nivel orgánico o a
nivel celular, respectivamente; la tercera tiene un significado altamente funcional, pues la degradación
selectiva de proteínas es un mecanismo de control de las distintas actividades de la célula; la cuarta
corresponde al proceso de apoptosis o muerte celular programada, y está también relacionada con la
actividad ubicuitina/proteasoma.
Degradación y absorción digestiva de las proteínas
En la degradación digestiva de las proteínas, consideraremos dos fases:
a) la digestión gástrica y
b) la digestión intestinal.
DIGESTIÓN GÁSTRICA El contenido gástrico se caracteriza por ser muy ácido (pH 1-2) debido a la
secreción de ácido clorhídrico, por parte de las células de la mucosa. Existe en estas células una bomba
protónica que transporta hacia la luz gástrica contra gradiente iones H+ procedentes de la reacción de
hidratación del CO2 catalizada por la anhidrasa carbónica.
CO2 + H2O → HCO3- + H+
De esta manera, por cada protón bombeado, ingresa un anión bicarbonato HCO3- en el medio orgánico,
que es responsable de la llamada alcalosis postprandial. Por su parte, las células principales de la mucosa
gástrica son productoras del zimógeno pepsinógeno (pepsinógeno A) que es activado precisamente por el
pH ácido del interior gástrico.
Esta activación tiene lugar gracias a que la proteína se despliega en parte ante el pH ácido, dejando
expuesto el centro activo que entonces elimina de su propia molécula unos 40 aminoácidos N-terminales,
dando lugar a la enzima pepsina.
La pepsina tiene un pH óptimo de 2, y deja de actuar por encima de pH 6.5. Tiene preferencia por enlaces
peptídicos entre aminoácidos hidrofóbicos, preferentemente aromáticos. Su centro activo consiste en dos
residuos de ácido aspártico, por lo que pertenece a las llamadas aspartil-proteasas. Las células principales
de la mucosa gástrica producen asimismo otras enzimas proteolíticas. Una de ellas es la gastrina
(pepsinógeno C, EC 3.4.23.3), de gran similitud secuencial y enzimática con la pepsina, se diferencia por
tener una mayor especificidad hacia enlaces peptídicos que impliquen aminoácidos aromáticos. Es
asimismo una aspartil-proteasa.
DIGESTIÓN INTESTINAL
Los oligopéptidos y proteínas parcialmente digeridas en el estómago pasan a la luz intestinal siguiendo el
tránsito digestivo. Aquí el pH se acerca a la neutralidad y las proteínas van a ser degradadas por una serie
de enzimas que en su mayor parte proceden del páncreas exocrino y que, al igual que la pepsina, son
segregadas en forma de zimógenos. La tripsina (EC 3.4.21.4) es producida como tripsinógeno por las
células acinares del páncreas desde donde es segregado a la luz intestinal a nivel del duodeno. Atacado
por la enzima enteropeptidasa (EC 3.4.21.9) produce la enzima activa. La tripsina es una serin-proteinasa
que específicamente ataca los enlaces peptídicos establecidos entre Arg o Lys y cualquier otro
aminoácido (excepto Pro). La enteropeptidasa es producida por las glándulas duodenales. La
quimotripsina (EC 3.4.21.1) es también una enzima pancreática del grupo de las serin-proteinasas. El
zimógeno (quimotripsinógeno) es activado por la tripsina, dando lugar a la enzima activa, en un proceso
que termina con la molécula primitiva dividida en tres cadenas polipeptídicas unidas por disulfuros (γ-
quimotripsina). Esta enzima ataca preferentemente los enlaces peptídicos constituidos por un aminoácido
aromático (Phe, Tyr, Trp), Leu o Met y cualquier otro aminoácido.
Otras enzimas proteolíticas producidas por el páncreas como zimógenos son la elastasa pancreática (EC
3.4.21.36, producida como proelastasa) y la carboxipeptidasa pancreática (EC 3.4.17.3), producida como
procarboxipeptidasa). La primera hidroliza preferentemente enlaces Ala-X. La segunda elimina
aminoácidos del extremo carboxiterminal de las proteínas, particularmente cuando se trata de
aminoácidos dibásicos como Lys o Arg; es una metaloproteinasa que contiene Zn.
ABSORCIÓN DIGESTIVA DE AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
Por regla general las proteínas no son nunca absorbidas como tales por el aparato digestivo; deben en
primer lugar ser degradadas por las enzimas digestivas mencionadas. La absorción de aminoácidos por
parte del intestino delgado sigue un patrón similar a la absorción de glucosa (transporte sodio-
dependiente). El gradiente electroquímico creado por la bomba de sodio de la membrana luminal del
enterocito permite la absorción de aminoácidos por la membrana apical al menos por cuatro sistemas
distintos selectivos para las diferentes clases de aminoácidos (ácidos, básicos, aromáticos, neutros).
Por el contrario, en la membrana basolateral del enterocito se encuentran sistemas que transportan
aminoácidos hacia el medio interno sin necesidad de gradiente de sodio. El enterocito es asimismo capaz
de absorber oligopéptidos de menos de cuatro aminoácidos, gracias a un cotransporte con protones H+.
REACCIONES GENERALES DE AMINOÁCIDOS
Los aminoácidos no pueden almacenarse como ocurre con los ácidos grasos y la glucosa, una vez que
satisfacen las necesidades metabólicas para sintetizar nuevas proteínas y otras biomoléculas por lo tanto
son catabolizados. El nitrógeno que contienen es en su mayoría excretado, el resto de la estructura es
utilizado como fuente de energía y por último, parte del nitrógeno de los aminoácidos degradados es
utilizado para sintetizar las bases púricas y pirimidínicas.
Al tratar del metabolismo de aminoácidos, distinguimos por lo general
Metabolismo del nitrógeno: El nitrógeno es un elemento sumamente importante para los organismos ya
que forma parte de los aminoácidos y los ácidos nucleicos, por lo que su utilización debe ser optimizada.
íntimamente relacionado con el metabolismo de dos aminoácidos concretos, glutamato y glutamina, y
con el metabolismo del ion amonio NH4+; en cuanto a este último, la importancia que tienen las
reacciones que proceden a su asimilación o a su eliminación. Se puede utilizar indistintamente las
denominaciones amoníaco NH3 e ion amonio NH4+ para referirse a la misma molécula. Al pH=7.4(medios
corporales), la mayor parte de la molécula (pKa = 9.26) está en forma de ion amonio.
Metabolismo del esqueleto carbonado de los mismos.
Puntualmente, la fracción de energía metabólica obtenida de los aminoácidos, ya sea que se deriven de la
proteína de la dieta o de la proteína del tejido, varía mucho según el tipo de organismo y las condiciones
metabólicas. Los carnívoros pueden obtener (inmediatamente después de una comida) hasta el 90% de
sus requerimientos de energía de la oxidación de aminoácidos, mientras que los herbívoros pueden llenar
solo una pequeña fracción de sus necesidades de energía por esta ruta.
La mayoría de los microorganismos pueden eliminar los aminoácidos de su entorno y usarlos como
combustible cuando lo requieren las condiciones metabólicas. Sin embargo, las plantas rara vez oxidan los
aminoácidos para proporcionar energía. Las concentraciones de aminoácidos en los tejidos vegetales se
regulan cuidadosamente para cumplir con los requisitos de biosíntesis de proteínas, ácidos nucleicos y
otras moléculas necesarias para apoyar el crecimiento. El catabolismo de aminoácidos ocurre en las
plantas, para producir metabolitos para otras vías biosintéticas.
Preguntas para afirmación de conceptos teóricos
1. Mediante una lectura comprensiva del texto anterior sumado la lectura de la bibliografía, sobre el
catabolismo de aminoácidos, intente describir cómo se lleva a cabo el proceso de digestión (es decir
cómo llegan los aminoácidos proveniente de los alimentos o de la proteína intracelular), dónde comienza
este proceso y las enzimas que participan.
2. Los aminoácidos (aa) atraviesan las membranas a través de mecanismos de transportadores
específicos. Con la ayuda del libro de texto, y de los conceptos comprendidos sobre transporte celular,
razonar mediante un dibujo como se transporta los tripéptidos, dipéptidos y aa.
3. Una vez absorbidos, los aa tienen diferentes alternativas metabólicas. Describir destinos posibles de
los aminoácidos absorbidos.
Los aa en los tejidos, procedentes de la degradación de proteínas, pierden el grupo amino, que se traslada
(pero nunca libre) hasta el hígado para su eliminación, allí se separa de la cadena carbonada, mediante
diferentes reacciones: transaminación y desaminación oxidativa.
4. El primer paso en el catabolismo de la mayoría de los L-aminoácidos, una vez que han llegado al
hígado, es la eliminación de los grupos amino, promovidos por enzimas llamadas aminotransferasas o
transaminasas. Definir el mecanismo de las reacciones de transaminación, y plantear tres ecuaciones
como ejemplo.
5. Todas las enzimas aminotransferasas tienen el mismo grupo protético y el mismo mecanismo de
reacción. El grupo protético es el fosfato de piridoxal (PPL), la forma de coenzima de la piridoxina o la
vitamina B6. Describir cómo funciona esta coenzima en las reacciones de transaminación.
6. Como hemos visto, los grupos amino de muchos de los aminoácidos se recogen en el hígado en
forma del grupo amino de las moléculas de L-glutamato. A continuación, estos grupos amino deben
eliminarse del glutamato para prepararlos para su excreción, por ser tóxicos para el organismo. En los
hepatocitos, el glutamato se transporta desde el citosol a la mitocondria, donde se somete a la
desaminación oxidativa catalizada por la deshidrogenasa de L-glutamato. Sobre desaminación oxidativa,
responder:
a. ¿Quá aa pueden participar en este tipo de reacción? Plantear las ecuaciones.
b. ¿Qué moléculas se oxidan y cuales se reducen en la reacción?
c. ¿Qué enzima participa? Clasificar.
d. ¿ Por qué puede utilizar NAD+ o NADP+?
e. ¿Qué moléculas regulan alostéricamente esta reacción?
f. ¿De dónde puede provenir la glutamina?
7. Los aa además de perder su grupo amino mediante transaminaciones o desaminaciones oxidativas,
también pueden descarboxilan, es decir perder su grupo carboxilo) y formar aminas biógenas, ellas o sus
derivados tienen muy importantes funciones biológicas (hormonas, neurotransmisores,
inmunomoduladores, etc): histamina, etanolamina, serotonina, feniletilamina, etc. Por ejemplo, desde la
tirosina, por descarboxilación y otras reacciones, se producen la familia de las catecolaminas: dopamina,
noradrenalina y adrenalina. Plantear tres ejemplos de reacciones de descarboxilación.
8. La alanina desempeña un papel especial en el transporte de grupos amino al hígado en una forma no
tóxica, a través de una vía llamada ciclo de glucosa-alanina. Describir el Ciclo de la glucosa-alanina
mediante un esquema que permita comprender estas reacciones.
9. La producción catabólica de amoníaco plantea un grave problema bioquímico, porque el amoníaco es
muy tóxico. Las etapas terminales de la intoxicación por amoníaco en humanos se caracterizan por la
aparición de un estado comatoso acompañado de edema cerebral (un aumento en el contenido de agua
del cerebro) y un aumento de la presión craneal, por lo que la investigación y la especulación sobre la
toxicidad del amoníaco se han centrado en este tejido. A través de una lectura comprensiva, enumerar las
posibles causas de toxicidad del amoníaco e indicar cómo pueden excretar los diferentes organismos el
amoníaco. Dibujar las estructuras.
10. Nombrar y describir las vías de elimiminación del amoníaco de los oragnismos ureotélicos.
11. En los organismos ureotélicos, el amoníaco depositado en las mitocondrias de los hepatocitos se
convierte en urea en el Ciclo de la urea. Explicar con la ayuda del libro y del siguiente video
(https://youtu.be/MhWOWLzZYQc) dónde se produce esta ruta cíclica, qué moléculas y enzimas
intervienen y realizar la ecuación general que resume el Ciclo.
11. La actividad del Ciclo de la urea se regula mediante dos niveles. Describir como es cada una de esas
regulaciones.
12. Una vez que hemos estudiado el destino metabólico del nitrógeno en los aa, tenemos que considerar
el metabolismo del esqueleto carbonado de los distintos aa. Para ello es útil la distinción entre
aminoácidos glucogénicos y cetogénicos. Dar al menos cuatro ejemplos de aa glucogénicos y cetogénicos
y Justificar.
13. El ciclo de Krebs (ácidos tricarboxílicos) y el Ciclo de la urea están íntimamente relacionados mediante
el intermediario citosólico arginosuccinato, describir mediante un esquema el compartimento celular
donde se producen, que moléculas y enzimas intervienen y los intermediarios en común que tienen.
ACTIVIDADES DE AUTOEVALUACIÓN
1. El siguiente esquema resume los pasos de la digestión de las proteínas, sobre este proceso,
responder:
a. ¿Dónde comienza la
digestión?
b. ¿Qué enzimas
participan y como actúan
los zimógenos?
c. Enumerar las etapas
de este proceso.
d. ¿Qué transporte
utilizan los aa?
2. Nombrar y dibujar la estructura del α-cetoácido resultante cuando cada uno de los siguientes
aminoácidos se somete a la transaminación con α-cetoglutarato: (a) aspartato, (b) glutamato, (c) alanina,
(d) fenilalanina.
3. Establecer la correspondencia entre los aminoácidos y los cetoácidos formulados. ¿Qué criterio
utiliza para establecer la correspondencia?
4. Escribir una ecuación balanceada para la conversión de aspartato en glucosa a través del
oxaloacetato intermedio. ¿Qué coenzimas participan en esta transformación? (b) Formular una ecuación
equilibrada para la conversión de aspartato en oxaloacetato a través del fumarato intermedio.
5. Dadas las siguientes reacciones, completar e indicar si son transaminaciones o desaminaciones
oxidativas. Justificar.
(a)
(b)
(c)
(d)
(e)
6. Analizar el esquema que aparece a continuación y responder:
a. ¿A qué ruta catabólica
corresponde?
b. ¿Qué función cumple?
c. ¿Dónde sucede a nivel
celular?
d. Formular la ecuación de
formación de la molécula que
comienza el ciclo
e. Indicar la cantidad de enlaces
de alta energía que se consumen
en la eliminación de cada amonio.
Expresar en ATP.
f. ¿ Cuales de lso intermediarios
son aminoácidos?
g. El aspartato es un metabolito
necesario para el ciclo. Explicar
brevemente como se regenera.
h. ¿De dónde proviene el NH4+
que forma del carbamil P?
i. ¿Cómo es regulado?
j. ¿Cuál es el producto final.
Formular su estructura.
k. ¿De donde proviene el primer
aminoácido? ¿Y el segundo?
7. El glutamato es un importante neurotransmisor cuyos niveles deben regularse cuidadosamente en el
cerebro. Explique cómo una alta concentración de amoníaco podría alterar esta regulación. ¿Cómo podría
una alta concentración de amoníaco alterar el ciclo del ácido cítrico?
8. Formular tres ejemplos de aminoácidos que se degradan a acetil-CoA y a piruvato. Justificar.
9. En el siguiente esquema se observa la relación entre el ciclo de Krebs y el de la Urea. Indicar las
enzimas que perticipan y las moléculas que los interconectan.
10. ¿Qué relación existe entre las rutas anpleróticas del Ciclo de Krebs y el catabolismo de los
aminoácidos?
11. El siguiente esquema representa el Ciclo de Glucosa-Alanina, completar e intrepretar esta ruta.
¿Qué relación tiene con el proceso de la gluconeogénesis?
