EXTREMOFILOS

El termino extremo filo fue usado por Macelroy en 1974 hace tres décadas.
Ambiente extremo es un término relativo ya que los ambientes que pueden ser
extremos para un organismo, pueden ser esenciales para la supervivencia de otro
organismo. Los extremofilos se desarrollan bajo condiciones que podrían matar a
la mayoría de las criaturas y muchos no pueden vivir en ambientes considerados
globalmente normales. Los ambientes extremos incluyen temperaturas muy
elevadas (55-121°C) o bajas (-2-20°C), alta salinidad (NaCl 2- 5M) y alta
alcalinidad (pH arriba de 8) o alta acidez (pH menor de 4).
Los extremofilos presentan un interés científico diversificado, en un principio, son
frecuentemente taxones no descritos con anterioridad, que en el momento de su
descubrimiento vinieron a completar el conocimiento filogénico de los seres vivos,
y a enriquecer debates relativos al origen y los límites de la vida. El
descubrimiento de microorganismos que habitan en ambientes de temperaturas
extremas, pH extremos, altas presiones barométricas, y alta salinidad, han
despertado interés desde el punto de vista biotecnológico, debido a las
características de estos microorganismos ya que sus biomolecular son resistentes
a las condiciones agresivas del entorno, lo que genera intensos trabajos para
comprender los mecanismos íntimos de resistencia, pero también estudiarlos de la
perspectiva de desarrollo de aplicaciones industriales, debido a sus enzimas,
catalizadores biológicos que aceleran las reacciones químicas de la célula, como
en el caso de las arqueas extremofilas le permite colonizar los ambientes más
inhóspitos. Aunque numerosos procesos industriales requieren el uso de
aceleradores químicos, tal es el caso de las enzimas que participan en la
producción de edulcorantes, papel, síntesis de detergentes, elaboración de
alimentos como pan y vino, tratamiento de residuos, extracción de petróleo,
obtención de biochips para la identificación de personas y el diagnóstico de
enfermedades.
EXTREMOFILO (De extremo y la palabra filo: afecto, amor ´amante de
condiciones extremas).el que vive en condiciones extremas diferentes a aquellas
donde vive la mayoría de las formas de vida.
 ORGANISMOS EXTREMOFILOS EUCARIOTAS Y PROCARIOTAS
Existe gran diversidad de organismos extremofilos que pueden vivir en
condiciones extremas, como en el caso de organismos multicelulares, eucariotas
(más de una célula, con núcleo definido), ejemplo son los flamencos que viven en
agua salada, los pingüinos que viven a altas temperaturas, las algas que viven en
agua con alta salinidad, microorganismos unicelulares, procariotas (tienen una
célula, carecen de núcleo definido) como las bacterias y las arqueas.

El REINO ARCHAEA
Constituye la diversidad de microorganismos unicelulares procariotas, que al igual
que las bacterias tienen morfología (sin núcleo, ni orgánulos membranosos) de tal
manera que dominan su propio dominio y reino, separado dentro del sistema de
tres dominios: Archaea, Bacteria y Eukarya.
Las arqueas son un dominio y también un reino que se divide en cinco filos
reconocidos, de estos grupos Crenarchaeota y Euryarchaeota. Inicialmente las
arqueas eran consideradas metanogenos o extremofilas que vivían en ambientes
hostiles tales como aguas termales, lagos salados, pero actualmente se
encuentran arqueas en los más diversas hábitats tales como el suelo, océanos,
pantanos y en el colon humano. Ejemplos de arqueas metanogenas que viven en
el intestino de los humanos y rumiantes, donde están presentes en grandes
cantidades y contribuyen a digerir alimento. Las arqueas tienen sus importancia en
la tecnología, hay metanogenas que son utilizadas para producir biogás y como
parte del proceso de depuración de aguas, y la enzimas extremofilas son capaces
de resistir altas temperaturas elevadas y disolventes orgánicos para su uso en la
biotecnología.
 CARACTERISTICAS DE LOS EXTREMOFILOS
De acuerdo a la característica del medio en donde ellos viven.

Caracteristicas geoquimicas Caracteristicas fisicas

pH y salinidad temperatura, radiacion,
presion

Termofilos (altas temperaturas)

Acidofilos (Ambientes acidos) hipertemofilos( ambientes bajos)
Alcalofilos (Ambientes con pH psicrofilos (temperaturas bajas)
basico) barofilos (presion)
Halofilos (Ambientes salados) resistentes a la radiacion.
hiperalofilos (Ambientes con
mayor grado de salinidad)

EXTREMOFILOS EN SUS AMBIENTES EXTREMOS

Encontramos organismos que resisten altas temperaturas, entre los cuales
encontramos los termófilos, que crecen a temperaturas por encima de 65 °C, la
temperatura para un desarrollo óptimo se encuentra entre 70- 80 °C y la máxima
entre de la cual encontramos los hipertermofilos 80- 113 °C. También las
bacterias mesofilas crecen rápidamente entre 25 y 40 °C, aunque no se han
encontrado plantas y animales multicelulares que vivan por arriba de los 50 °C, el
límite de temperatura a la que se pueden encontrar organismos no se conoce aún,
aunque se cree que por encima de 150°C ninguna forma de vida podría evitar la
ruptura de enlaces químicos que forman el ADN y otras moléculas esenciales. En
función a la temperatura los organismos se clasifican de la siguiente forma.
TERMÓFILOS
Estos organismos tienen un crecimiento óptimo en temperaturas entre los 70-80
°C.
Hábitats comunes: Fuentes termales volcánicas terrestres, termales submarinas,
etc.

La adaptabilidad de estos organismos se debe a la alta estabilidad térmica de sus

enzimas, esta alta estabilidad se debe a las redes de interacciones iónicas y
modificaciones de la membrana plasmática. En una bacteria se presenta
alargamiento de las cadenas de los ácidos grasos, incremento de ácidos grasos
saturados y presencia de ramificaciones.

Ejemplos:
 Bacterias Thermus acuaticus crecen a
temperaturas mayores de 70°C
 Bacterias Sulfolobus acidocaldarius
crecen a partir de 85 °C
 Bacterias Pyrolobus fumari temperatura
optima de crecimiento es de 105°C

PSICROFILOS
También encontramos extremofilos que viven a bajas temperaturas en el que se
menciona los psicrofilos desde los 20 ºC hasta los -5 ºC. Las proteínas de los
psicrofilos muestran disminución de interacciones iónicas y enlaces del hidrogeno,
poseen menos grupos hidrofobicos y grupos cargados en su superficie, esto
permite que las proteínas pierdan su rigidez y ganan flexibilidad en su estructura
para la realización de sus funciones catalíticas. Las membranas contienen mayor
proporción de ácidos grasos no saturados, es asi como su fluidez y capacidad de
transporte se mantiene bajo condiciones muy frías.
Ejemplos:
 Bacterias Gram negativas: Moraxella,
Psychrobacter, Polaribacter, Moritella,
Vibrio y Pseudonomas.
 Bacterias Gram positivas: Arthrobacter,
Bacillus y Micrococcus.
 Arqueas: Methanogenium,
Methanococcoides y Halorubrum.
 Hongos y levaduras: Penicillium,
Cladosporium, Candida y
Cryptocococcus.
ALCALOFILOS

Organismos que viven con un pH por encima de 9.

El hábitat de estos organismos son los lagos sódicos y suelos carbonatados. Estos
organismos necesitan aislar el interior de la célula del medio alcalino exterior, ya
que algunas moléculas especialmente hechas de ARN se rompen superior a 8. Un
gradiente de Na es el que suministra la energía para el transporte y movilidad.
Además tienen pared celular polímeros cargado negativamente, los cuales pueden
reducir la densidad de la carga en la superficie de la célula y estabilizar
membrana.

Ejemplos:
 Bacterias aeróbicas marinas, muchas especies
de Bacillus Spirulina (cianobacterias) Arqueas.
 Algunos alcalofilos son también halófilos, la
mayor parte de estos pertenecen al dominio
Archaea.

HALOFILOS
Se refiere a los organismos que habitan en medio con presencia de abundante de
sales, sus hábitats: zonas litorales, salinas y lagunas salobres. Uno de los
mecanismos que han desarrollado, es albergar en el interior de sus tejidos,
concentraciones de un soluto compatible a las sales (como ácido
polihidroxibutirico o PHB) mayor que en el exterior. Asi el agua penetra por
osmosis. La mayoría pertenece al dominio Archaea.

ACIDOFILOS
Organismos que viven en medio de un pH menor de 5. Para soportar el bajo pH,
estos organismos emplean una gama de mecanismos, como una superficie de
membrana cargada positivamente, con una alta capacidad reguladora interna y
sistemas únicos de transporte.

Ejemplos:
  Cyanidium Caldariuym, capaz de vivir en pH cercano a cero manteniendo
el interior de la célula en un nivel casi neutro
 Ferroplasma acidarmanus, crece en ambientes de pH cercano a cero.
.Acontium cylatium, Cephalosporium sp y Trichosporon cerebriae (eucariotas del
reino fungí)

CLASIFICACION DE LOS MICROORGANISMOS EN FUNCION A SU

TEMPERATURA

¿CÓMO SOBREVIVEN LOS EXTREMOFILOS EN TEMPERATURAS ALTAS?

Los extremofilos donde la variable es la temperatura: altas y bajas temperaturas
sobreviven de acuerdo a dos mecanismos funciona dentro de los límites químicos
y físicos de su ambiente, se adapta a su ambiente de 90 °C y se baja la
temperatura este muere, o sea que vive al límite. En el caso de los extremofilos
con PH, mantienen unos mecanismos diferentes tienen capacidad para mantener
las condiciones normales intracelulares, libres de presiones extremas.
De
acuerdo a este termómetro de la vida, expuesto la científica Linnie Roché de la
Universidad de Stanford nos muestra un termómetro, en donde podemos
observar, temperaturas bajas por debajo de 0 C o temperaturas muy altas, los
mesofilos que viven en temperaturas entre 15-45 C, por encima de 45 termófilos
tolerantes, y a medida que va aumentado la temperatura se va relacionando su
categoría hasta llegar a hipertermofilo.

SOBREVIVENCIA A TEMPERATURAS EXTREMAS

Los termófilos de acuerdo a su variable temperatura sobreviven dentro de los
límites físicos-químicos, en el caso de los termofilicos tienen unas enzimas
resistentes a altas temperatura, ya en psicrofilos poseen enzimas eficientes. La
membrana celular es importante para todos los seres vivos, porque nos permite
aislar procesos y aislar procesos del ambiente, esta capa protege lo que esta
internamente, de ahí ese mecanismo de resistencia o adaptación lo encontramos
en las membranas celulares, dependiendo de cómo sean esas membranas
celulares será más o menos resistente un organismo a un alta temperatura o baja
temperatura. La estructura celular de esta compuesta por acido grasos, en todos
los seres vivos, pero cuando estos ácidos grasos presentan una serie de
ramificaciones son los más resistentes a altas temperaturas. La membrana celular
contiene una bicapa lipídica.
En los termófilos e hipertermofilos la membrana presenta una capa ácidos
grasos muy complejos, con ramificaciones lo cual la hace muy resistente a altas
temperaturas a 100 C donde el agua está hirviendo. Los extremofilos las
secuencias de los aminoácidos de sus proteínas son parecidas a las secuencias
de las proteínas de los organismos mesofilos solamente que hay unos pequeños
cambios puntuales en las cadenas de aminoácidos, en ciertas posiciones que
han hecho la diferencia, lo cual hace que sea adaptable a ese ambiente extremo.
EXTREMOFILOS Y SU ADN
Estos ácidos nucleicos contienen la información o material genético, en altas
temperaturas el DNA se va a desnaturalizar esa doble hélice que tiene el ADN,
deja de ser doble, para ser dos hebras sencillas, en ese caso ya no va a funcionar
ese DNA, cualquier bacteria mesofilo, la sometemos a altas temperaturas se va a
desnaturalizar si se daña su DNA, no hay reproducción. ¿Cómo viven los
organismos extremofilos que viven 100 C sin dañar su DNA? Los termófilos y
los hipertermofilos, en su DNA, contienen bases nitrogenadas, adenina, guanina,
citosina, tiamina, en la medida que en su organismo tenga más enlaces guanina,
citosina, va a ser más estable el DNA, porque tienen tres enlaces de hidrogeno,
que la pareja adenina, timina que solamente tiene dos enlaces de hidrogeno. Lo
cual quiere decir que los termófilos son ricos con estos tipos de enlaces lo cual
hace que a mayor temperatura, halla mayor resistencia a la desnaturalización o
daño del DNA.

Cuando tenemos esa doble hebra de DNA, y se altera en los extremofilos como
los termófilos estos tienen la capacidad de reparar el DNA que es muy eficiente, y
detectar las alteraciones, y hace las correcciones a través de todas las proteínas
que ellos presentan por lo cual se tiene un ADN reparado. Esto quiere decir que
tienen mecanismos para corregir un error que se ha producido por esas altas
temperaturas e inmediatamente corregirlo, por lo cual son los mecanismos
adaptativos que tienen estos extremofilos. También tienen otro tipo de proteínas
que la tiene todo ser vivo, pero estas girasas diversas que tienen los extremofilos
tienen una particularidad funcionan al revés de cómo funcionan las girasas
reversas de organismos mesofilos. Estas girasas que funcionan al revés en los
termófilos les sirven para contrarrestar el efecto que puede tener el DNA por la
alta temperatura. Todos estos mecanismos son los que le permiten tener esa
capacidad adaptiva en cada uno de sus ambientes y pueda vivir de acuerdo a los
niveles de temperatura.
Si analizamos en particular las proteínas, vamos a tener de que cuando hay alta
temperatura, o sea mayor temperatura vamos a tener esa desnaturalización de la
proteína, es decir la ruptura de la proteína, que es lo que sucede cuando tomamos
un huevo y lo ponemos a freír, tenemos proteínas alteradas, en la conformación
estructural de la proteína, esto sucede siempre que aumentemos la temperatura.
Entonces como hace una bacteria que vive a 100 °C, para que no ocurra la
alteración de sus proteínas.
A nivel de proteínas hay muchas interacciones hidrofobicas entre aminoácidos, y
esas interacciones hacen que la misma proteína (sus elementos constituyentes de
aminoácidos) se protejan para enfrentarse a las altas temperaturas, también
tenemos en factores externos la presencia de otras proteínas chaperonas (cuidan
a alguien) su función es cuidar las proteínas cuando hay un choque térmico.
Entonces son respuestas que tienen las células para enfrentarse a esas altas
temperatura que requiere el mismo organismo para vivir.

¿CÓMO SOBREVIVEN LOS EXTREMOFILOS A TEMPERATURAS BAJAS?

Temperatura promedio de las aguas oceánicas de todo el planeta es de 5°C,y la
temperatura de las aguas marinas en zonas profundas del océano puede estar
entre 1 y 3 °C.

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