QFB Eva Aurora Hernández Sánchez
Microbiota Normal
Microbiota
Conjunto de MICROORGANISMOS
que residen tanto sobre la superficie como en las diferentes
cavidades del cuerpo, la piel, la boca, los oídos, la vagina o el
tracto gastrointestinal, entre otras.
Microbioma
Conjunto de los GENES presentes en todas las células
microbianas residentes en el ser humano. A menudo se
confunde con el término microbiota.
Sin embargo, cada vez es más frecuente ver el uso del término
microbioma como sinónimo de microbiota. La razón es que con el
desarrollo de los métodos de secuenciación de ADN de última
generación (secuenciación masiva ó NGS) la microbiota de un nicho se
define a partir del microbioma.
MICROBIOTA NORMAL
Existen trillones de
microorganismos comensales
que conforman a la microbiota,
donde se encuentran bacterias
principalmente, pero también
virus, hongos y protozoarios,
los cuales habitan en las
superficies del cuerpo
expuestas hacia el exterior,
como son las mucosas y la piel.
Requisitos para ser parte de la microbiota
normal de forma estable:
• Vivir extracelularmente
• Adherirse específicamente a células de los sitios anatómicos
que ocupan.
• Adaptarse a las condiciones físicas y nutritivas existentes en
esos lugares (humedad, temperatura, pH, tensión de O2 y
nutrientes)
• No ser erradicados activamente por el huésped.
Actividades microbianas que contribuyen
con la colonización del huésped
-Supervivencia contra condiciones medioambientales
Localización en áreas húmedas
Protección dentro de detritus ingeridos o inhalados
Expresión de características metabólicas específicas (tolerancia a
las sales)
-Unión y Adherencia a las superficies celulares del Huésped
Pili
Protección de Adhesión
Películas biológicas
Diversas adhesinas protéicas
-Movilidad
-Producción de sustancias que compiten con el huésped para la
adquisición de nutrientes escenciales, (sideróforos)
-Capacidad para coexistir con otros microorganismos
colonizadores
IMPORTANCIA DE LA MICROBIOTA NORMAL
Efectos directos Efectos indirectos
Producción de bacteriocinas Aumento de la producción de
Producción de metabolitos anticuerpos
tóxicos Estimulo de la fagocitosis
Reducción de nutrientes Aumento de la producción de
esenciales interferón
Competencia por receptores Deconjugación de ácidos
Interferencia bacteriana biliares
Producción de nutrientes
esenciales y contribución en la
digestión de los alimentos
Mecanismos de competencia de la biota normal
ante la invasión de otros patógenos
TIPOS DE MICROBIOTA
• Microbiota residente: Tiempo indefinido
• Microbiota transitoria: Periodo breve
• Estado de portador: Presencia de microorganismos con
potencial patógeno. Ejemplo: Neumococo o meningococo
se encuentran en garganta entre 5 al 40% de personas
sanas.
MICROBIOTA NORMAL
Microbiota Normal
Es la población de microorganismos que habitan la
piel y mucosas de las personas sanas
Microbiota Normal Residente
Consta de tipos relativamente fijos de
microorganismos presentes con regularidad en
cierta región a una edad determinada, cuando se
altera, se reestablece por si misma con prontitud
Microbiota Normal Transitoria
Consiste en microorganismos no patógenos o
potencialmente patógenos que habitan la piel o
las membranas mucosas durante horas, días o
semanas. Se deriva del ambiente y no produce
enfermedad, tampoco se establece por si misma
de manera permanente sobre la superficie
Microflora normal transitoria
estómago
Helicobacter pylori
Lactobacillus
Streptococcus
Estado de portador
Nasofaringe
• Streptococus pneumoniae:
Niños preescolares 25 a 50%
Niños de 6 a 11 años de edad 30 a 35 %
Adultos 5 a 7 %
• Neisseria meningitidis:
Adultos 1 a 33%
Según población en estudio: 10 a 15 %
Estado de portador
nasofaringe
Haemophilus influenzae tipo b capsulado
3a5%
Haemophilus influenzae (sin capsula)
50 a 80 %
Estado de portador
Portadores crónicos:infectados hasta
por dos años
Portadores intermitentes:infectados
por periodos menos prolongados
meses o semanas
Portadores transitorios:periodos
breves de infección días
Relación de anaerobios/aerobios
SITIO ANATOMICO BACTERIAS RELACION ANAEROBIOS
TOTALES/ml o gramo AEROBIOS
Vías aéreas superiores
Lavados nasales 103 - 104 3 – 5 :1
Saliva 108 - 109 1:1
Superficie dental 1010 - 1011 1:1
Hendiduras gingival es 1011 - 1012 1000 : 1
Tubo digestivo
Estomago 102 - 105 1:1
Intestino delgado 102 - 104 1:1
Ileon 104 - 107 1:1
Colon 1011 - 1012 1000 : 1
Aparato genital femenino
Endocervix 108 - 109 3–5:1
Vagina 108 - 109 3–5:1
Microbiota de la nasofaringe
La nasofaringe es un nicho ecológico que sirve de reservorio
natural a numerosos microorganismos. La mayoría que
componen este nicho son comensales, pero un porcentaje
variable lo componen bacterias potencialmente patógenas
como:
Streptococcus pneumoniae,
cepas no tipificables de Haemophilus influenzae,
Moraxella catarrhalis,
Staphylococcus aureus
Streptococcus del grupo A.
Microbiota de la nasofaringe
El microbioma nasofaríngeo durante el primer año de
vida está dominado por 6 géneros bacterianos:
Haemophilus,
Streptococcus,
Moraxella (más frecuentes en las infecciones respiratorias
agudas),
Staphylococcus,
Alloiococcus y
Corynebacterium (más frecuentes en niños sanos)
MICROBIOTA NASAL MICROBIOTA NASOFARINGEA
Staphylococcus 40.8% Moraxella 30.7%
Corynebacterium 10.4% Streptococcus 30.5%
Moraxella 9.3% Haemophilus 19.7%
Haemophilus 7.4%
Dolosigranulum 5.2%
Streptococcus 5%
Enterobacter 4.7%
,
El predominio de Haemophilus presentan
un mayor riesgo de admisión en la UCI o
de hospitalización, en comparación con
predominio de Moraxella parecen estar
menos expuestos.
Microbiota oral
Los Firmicutes como Streptococcus, Veillonella y Lactobacillus están
presentes en una microbiota oral sana. A los Firmicutes les siguen las
Proteobacterias, los Bacteroides y los Actinomyces, siendo más escasas
las Fusobacteria
Area Microbiota
SALIVA Bacterias en fase planctónica
no organizada
PALADAR, DORSO DE LENGUA AMIGDALAS Streptococcus, Veillonella
PALATINAS, GARGANTA Y MUCOSA YUGAL Prevotella, Pasteurellaceae
TEJIDOS DUROS Streptococcus
BIOFILM SUBGINGIVAL Fusobacterium
Capnocytophaga
BIOFILM SUPRAGINGIVAL Capnocytophaga
Corynebacterium
ENCIA QUERATINIZADA Streptococcus
Pasteurellaceae
Formación del biofilm
Los colonizadores bacterianos
establecen microcolonias sobre
la película de glucoproteínas y
exopolisacáridos incrustadas en
la matriz extracelular.
Cuando hay cambios en el
equilibrio de las especies, con
aparición de microorganismos
con funciones metabólicas
determinadas y elevado
potencial virulento, se genera un
biofilm patogénico que da lugar
a patologías como la
periodontitis o la caries dental.
Microbiota gastrointestinal
La composición de la flora bacteriana varía a lo largo de la vida del
ser humano.
Mecanismo del eje intestino microbiota cerebro
La ausencia de microbiota altera
el sistema nervioso central y
determinadas cepas bacterianas
provocan alteraciones del
comportamiento, esto demuestra
la existencia también de una
comunicación entre la microbiota
y el cerebro.Todo esto ha
permitido acuñar un concepto: el
eje-intestino-microbiota-cerebro.
Mecanismo del eje intestino microbiota cerebro
REGULADOR DEL ESTADO DE
ÁNIMO:
En el intestino se produce el 80
al 95% de la serotonina. Los
hábitos alimenticios pueden
favorecer la reducción en la
absorción de TRPTOFANO en la
sangre que está directamente
relacionado con la producción
de SEROTONINA. Los bajos
niveles de serotonina ocasiona
depresión, la cual favorece a
una hipersensibilidad visceral
(dispepsia funcional, colon
irritable, síndrome intestino
irritable…).
•Factores negativos: contaminantes y productos farmacéuticos.
•Factores positivos: una dieta rica en prebióticos y probióticos, y la práctica de
ejercicio.
Diferencias en la microbiota en niños de Europa y África.2010
La diferencia entre la microbiota de niños sanos de África, donde la dieta
es a base de fibra vegetal, y la de niños sanos en Italia, con mayor
contenido de proteína animal y carbohidratos. También se encontró una
cantidad mucho mayor de ácidos grasos de cadena corta en los niños de
Africa y una cantidad casi indetectable de enterobacterias (Shigella y E.
coli)
Colonización por Clostridium difficile y
microbiota intestinal
Microbiota vaginal
Vaginosis bacteriana
LOS LACTOBACILOS IMPORTANTES EN LA
MODULACIÓN DEL SISTEMA INMUNOLÓGICO
La microbiota lactobacilar presente en la cavidad vaginal participa en la
estimulación del sistema inmunológico ya que es capaz de inducir la
producción de citocinas, moléculas pro-inflamatorias y anti-inflamatorias
para el mantenimiento de la homeostasis de la mucosa vaginal, que regulan
las vías de señalización desencadenadas por la unión de los PMAM (LPS,
flagelo, etc.) a los receptores tipo Toll
La pared celular de los lactobacilos está
compuesta por diferentes macromoléculas
que se reconocen como los patrones
moleculares asociados a microorganismos
(PAMPs), los cuales son reconocidos por el
sistema inmune mediante los receptores de
patrones de reconocimiento (PRR) como los
TLRs.
Microbiota Residente de la Uretra
Staphylococcus coagulasa negativo (S. saprophyticus)
Streptococcus viridans y streptococcus no hemolíticos
Lactobacillus
Difteroides (especies de Corynebacterium)
Especies de Neisseria no patógena (saprófita)
Cocos anaerobios
Especies de Propionibacterium
Bacilos gram negativos anaerobios
Especies de Mycobacterium comensales
Especies de Mycoplasmas comensales
Microbiota de piel
Acinetobacter Staphylococus coagulasa
Aerococus negativa
Bacillus Staphylococus aureus
Clostridium
Streptococus
Corynebacterium
Hongos
Micrococus
Peptoestreptococus
Candida
Propionibacterium Malassezia
Microorganismos que colonizan con
mayor frecuencia la piel húmeda
BACTERIAS
Staphylococcus capitis
(glándulas sebacéas de la
frente)
Staphylococcus haemolyticus
Staphylococcus hominis (
ambos colonizan glándulas
aprócrinas de la axila)
Colonización transitoria de los pliegues
cutáneos húmedos con S. aureus
• Neonatos
• Ombligo
• Región perianal
LA EPIDERMIS ES UN ELEMENTO ESENCIAL DE
NUESTRAS DEFENSAS
Los queratinocitos
reconocen moléculas
bacterianas a través de los
receptores TLR (Toll-Like
Receptors) y producen
péptidos antiimicrobianos
naturales y mediadores
proinflamatorios
S epidermidis induce la
producción de peptidos
antimicrobinanos
naturales que interfieren
con la colonizacion de S
aureus
Microorganismos que colonizan con mayor
frecuencia oído externo
Staphylococus coagulasa
negativa
Streptococcus pneumoniae
Enterobacterias
Pseudomonas
Microrganismos que colonizan con mayor
frecuencia los ojos
Staphylococus coagulasa negativa
Haemophilus
BIOTA NORMAL
FRECUENCIA DE CAUSANTE DE
SITIO ANATOMICO MICROORGANISMO AISLAMIENTO ENFERMEDAD
SCN 3 M
Corynebacterium 3 B
PIEL Propionibacterium 3 B
S. aureus 1 A
Clostridium 1 B
SCN 3 B
Str. viridans 2 B
Haemophilus 1 B
NASOFARINGE
Neisseria 1 B
S. aureus 1 M
S. pneumoniae 1 M
SCN 3 B
OIDO EXTERNO S. pneumoniae 1 M
Pseudomonas 1 M
Enterobacterias 1 M
OJO
SCN 3 B
Haemophilus 1 B
3: Muy frecuente, 2: Frecuente, 1: Raro, A: Alto, M: Moderado, B: Bajo
BIOTA NORMAL
FRECUENCIA DE CAUSANTE DE
SITIO ANATOMICO MICROORGANISMO AISLAMIENTO ENFERMEDAD
Fusobacterium 3 M
Str. viridans 3 B
Str. Β hemolítico no A 3 B
SCN 3 B
Neisseria 3 B
Haemophilus 3 B
Peptostreptococcus 3 B
Str. pyogenes 2 A
S. pneumoniae 2 M
S. aureus 2 M
Actinomyces 2 M
Moraxella catarralis 2 M
OROFARINGE
Capnocytofaga 2 B
Corynebacterium 2 B
Treponema 2 B
Veionella 2 B
Porphyromonas 2 B
Bacteroides 2 B
Haemophilus influenzae 1 M
Cardiobacterium hominis 1 M
Kingella 1 M
Enterobacterias 1 B
Moraxella 1 B
Eikenella corrodens 1 B
Mycoplasmas 1 B
Lactobacillus 1 B
3: Muy frecuente, 2: Frecuente, 1: Raro, A: Alto, M: Moderado, B: Bajo
BIOTA NORMAL
FRECUENCIA DE CAUSANTE DE
SITIO ANATOMICO MICROORGANISMO AISLAMIENTO ENFERMEDAD
Helicobacter pylori 1 A
ESTOMAGO Lactobacillus 1 B
Streptococcus 1 B
Lactobacillus 3 B
Bacteroides 2 M
Enterococcus 2 M
Prevotella 2 B
Porphyromonas 2 B
INTESTINO DELGADO
Fusobacterium 2 B
Peptostreptococcus 2 B
Streptococcus 2 B
Clostridium 1 M
Enterobacterias 1 M
3: Muy frecuente, 2: Frecuente, 1: Raro, A: Alto, M: Moderado, B: Bajo
BIOTA NORMAL
FRECUENCIA DE CAUSANTE DE
SITIO ANATOMICO MICROORGANISMO AISLAMIENTO ENFERMEDAD
Bacteroides 3 A
Clostridium 3 M
Prevotella 3 M
Phorphyromonas 3 M
Fusobacterium 3 M
Peptostreptococcus 3 M
Enterococcus 3 M
Enterobacterias 3 M
INTESTINO GRUESO Bifidobacterium 3 B
Lactobacillus 2 B
Eubacterium 2 B
Veionella 2 B
Pseudomonas 1 M
Staphylococcus 1 B
Streptococcus 1 B
Aeromonas 1 B
Corynebacterium 1 B
Mycobacterium 1 B
3: Muy frecuente, 2: Frecuente, 1: Raro, A: Alto, M: Moderado, B: Bajo
BIOTA NORMAL
FRECUENCIA DE CAUSANTE DE
SITIO ANATOMICO MICROORGANISMO AISLAMIENTO ENFERMEDAD
Lactobacillus 3 B
Staphylococcus 3 B
Garderella vaginalis 3 B
Mobiluncus 2 A
Enterococcus 2 B
Streptococcus 2 B
Neisseria No
Patógena 2 B
VAGINA
Porphyromonas 2 B
Prevotella 2 B
Mycoplasma 2 M
Ureplasma 2 M
Enterobacterias 2 M
Actinomyces 2 M
Bacteroides 2 M
Fusobacterium 2 M
Clostridium 1 M
3: Muy frecuente, 2: Frecuente, 1: Raro, A: Alto, M: Moderado, B: Bajo
BIOTA NORMAL
SITIO FRECUENCIA DE CAUSANTE DE
ANATOMICO MICROORGANISMO AISLAMIENTO ENFERMEDAD
Lactobacillus 3 B
Corynebacterium 3 B
URETRA SCN 2 B
ANTERIOR Mycoplasmas 1 M
Ureaplasmas 1 M
Enterobacterias 1 M
Streptococcus 1 B
Enterobacterias 1 B
Neisserias No
Patógenas 1 B
Garderella vaginalis 1 B
3: Muy frecuente, 2: Frecuente, 1: Raro, A: Alto, M: Moderado, B: Bajo
Para determinar la biodiversidad existente en una comunidad microbianana
presente en una muestra y las interacciones entre los diferentes organismos que la
componen, para ello, se puede o bien secuenciar el genoma completo de forma
conjunta o secuenciar de forma más dirigida el gen específico de bacterias 16S.
Gracias