Historia
La enzimonología tiene sus raices en los comienzos de la bioquímica; ambas disciplinas evolucionaron
juntas a partir de las investigaciones del siglo xix sobre la fermentación y digestión. En un inicio, la
incapacidad de reproducir la mayoría de reacciones bioquimicas en un laboratorio llevó a luis pasteur y a
otros a suponer que los sitemas vivos estaban dotados de una “fuerza vital” que les permitía evadir las
leyes de la naturaleza que gobernaban la materia no animada. sin embargo, algunos investigadores, en
especial Justus von Liebig, propusieron que los procesos biologicos estaban causados por la acción de
sustancias químicas que se denominaron fermentos. El nombre de enzima se acuñó en 1878 en un
esfuerzo por enfatizar que hay algo en las levaduras, que no es la levadura en sí misma, que cataliza las
reacciones de la fermentación. Por último, Eduard Buchner demostró que un extracto acelular de
levaduras, de hecho, podia llevar a cabo la síntesis de etanol a partir de glucosa.
Estructuras y mecanismos
Las actividades de las enzimas vienen determinadas por su estructura tridimensional, la cual viene a su
vez determinada por la secuencia de aminoácidos. 22 Sin embargo, aunque la estructura determina la
función, predecir una nueva actividad enzimática basándose únicamente en la estructura de una proteína
es muy difícil, y un problema aún no resuelto.23
Casi todas las enzimas son mucho más grandes que los sustratos sobre los que actúan, y solo una pequeña
parte de la enzima (alrededor de 3 a 4 aminoácidos) está directamente involucrada en la catálisis. 24 La
región que contiene estos residuos encargados de catalizar la reacción es denominada centro activo.
Las enzimas también pueden contener sitios con la capacidad de unir cofactores, necesarios a veces en el
proceso de catálisis, o de unir pequeñas moléculas, como los sustratos o productos (directos o indirectos)
de la reacción catalizada. Estas uniones de la enzima con sus propios sustratos o productos pueden
incrementar o disminuir la actividad enzimática, dando lugar así a una regulación por retroalimentación
positiva o negativa, según el caso.
Al igual que las demás proteínas, las enzimas se componen de una cadena lineal de aminoácidos que se
pliegan durante el proceso de traducción para dar lugar a una estructura terciaria tridimensional de la
enzima, susceptible de presentar actividad. Cada secuencia de aminoácidos es única y por tanto da lugar a
una estructura única, con propiedades únicas. En ocasiones, proteínas individuales pueden unirse a otras
proteínas para formar complejos, en lo que se denomina estructura cuaternaria de las proteínas.
estereoespecificidad:la estereoespecificidad deriva del mecanismo de la reacción.
regioselectividad: preferencia que tiene una reacción para romper o crear un enlace en una
dirección en particular por encima de todas las demás posibles.
quimioselectividad:es la preferencia de un reactivo para reaccionar en particular con uno de entre
dos o más grupos funcionales diferentes.
la enzima y su sustrato, poseen complementariedad geométrica, es decir, sus estructuras encajan
exactamente una en la otra,32 por lo que este modelo ha sido denominado como modelo de la «llave-
cerradura», refiriéndose a la enzima como a una especie de cerradura y al sustrato como a una llave que
encaja de forma perfecta en dicha cerradura. Una llave sólo funciona en su cerradura y no en otras
cerraduras.
encaje inducido: sugiere una modificación al modelo de la llave-cerradura: las enzimas son estructuras
bastante flexibles y así el sitio activo podría cambiar su conformación estructural por la interacción con el
sustrato.33 Como resultado de ello, la cadena aminoacídica que compone el sitio activo es moldeada en
posiciones precisas, lo que permite a la enzima llevar a cabo su función catalítica.
Cofactores y coenzimas
el cofactor se une a una estructura proteica denominada apoenzima, y a este complejo se le llama
holoenzima (figura)
El sustrato es una molécula sobre la cual actúa una enzima. este sustrato se va a unir al sitio activo de la
enzima, y se forma un complejo enzima-sustrato. el sustrato por la acción de la enzima es transformado
en producto y es liberado del sitio activo, quedando libre para recibir otro sustrato.
las coenzimas son pequeñas moléculas orgánicas no proteicas que transportan grupos químicos entre
enzimas. Estas moléculas son sutratos de las enzimas y no forman parte permanente de la estructura
enzimática. las coenzimas pertenencen al grupo de los cofactores. En el metabolismo, las coenzimas están
involucradas en reacciones de transferencia de grupos(coenzima A y ATP) y las reacciones redox
(coenzima q10 y NAD+)
Termodinámica
Una reacción química es un: “Proceso durante el cual se producen reacomodos de los electrones de
enlace de los átomos”
Para que se lleven a cabo dichos reacomodos, es necesario que tenga lugar un intercambio de energía.
Los intercambios de energía durante las reacciones químicas los estudia la Termodinámica Química.
La Termodinámica se encarga del estudio de los intercambios de energía que acompañan a todos los
procesos. A partir de un modelo básico del mundo real y un conjunto de leyes que rigen su
comportamiento, la Termodinámica deduce relaciones que describen los cambios de energía y la
dirección de los procesos físicos y químicos a escala macroscópica. Como no hace ninguna consideración
respecto de las propiedades microscópicas de la materia, no puede decir nada sobre el universo atómico.
Es básicamente estática pues se ocupa sólo del inicio y el final de los cambios y jamás de su velocidad,
aunque si puede predecir su dirección y punto de equilibrio.
Cinética
Por otro lado, los reacomodos electrónicos se efectúan a velocidades, y a través de caminos específicos
que son estudiados por la Cinética Química.
La velocidad de una reacción catalizada por un enzima puede medirse con relativa facilidad, ya que en
muchos casos no es necesario purificar o aislar el enzima
La medida se realiza siempre en las condiciones óptimas de pH, temperatura, presencia de cofactores,
etc, y se utilizan concentraciones saturantes de sustrato.
En estas condiciones, la velocidad de reacción observada es la velocidad máxima (V max). La velocidad
puede determinarse bien midiendo la aparición de los productos o la desaparición de los reactivos.
Inhibición
Los inhibidores son moléculas que regulan la actividad enzimática, inhibiendo su actividad. A grandes
rasgos, pueden clasificarse en reversibles e irreversibles. Las irreversibles se unen covalentemente a la
enzima sin posibilidad de revertir la modificación, siendo útiles en farmacología.
Las reversibles se unen de forma reversible a la enzima, pudiendo clasificarse a su vez, según la forma en
que intervienen en la reacción, en competitivas, acompetitivas y mixtas.
En la inhibición competitiva, el sustrato y el inhibidor no se pueden unir a la misma enzima al mismo
tiempo, como se muestra en la figura de la derecha. 72 Esto generalmente ocurre cuando el inhibidor tiene
afinidad por el sitio activo de una enzima en el cual también se une el sustrato; el sustrato y el inhibidor
compiten para el acceso al sitio activo de la enzima.
En la inhibición acompetitiva el inhibidor no puede unirse a la enzima libre, sino únicamente al
complejo enzima-sustrato (ES). Una vez formado el complejo con el inhibidor (EIS) la enzima queda
inactiva. Este tipo de inhibición es poco común, pero puede darse en enzimas multiméticas.
La inhibición no competitiva es una forma de inhibición mixta donde la unión del inhibidor con la
enzima reduce su actividad pero no afecta la unión con el sustrato. Como resultado, el grado de inhibición
depende solamente de la concentración de inhibidor, independientemente de la concentración de sustrato,
con lo que varía el valor de la Vmax aparente. Sin embargo, como el sustrato aún puede unirse a la enzima,
el valor de Km no varía.
En muchos organismos, los inhibidores pueden actuar como parte de un mecanismo de realimentación. Si
una enzima produce una sustancia en demasiada cantidad en el organismo, esta misma sustancia podría
actuar como un inhibidor de la enzima al inicio de la ruta que lo produce, deteniendo así dicha producción
cuando haya una cantidad suficiente de la sustancia en cuestión. Este sería una forma de realimentación
negativa.
Función biológica
Las enzimas presentan una amplia variedad de funciones en los organismos vivos. Son indispensables en
la transducción de señales y en procesos de regulación, normalmente por medio de quinasas y
fosfatasas.74 También son capaces de producir movimiento, como es el caso de la miosina al hidrolizar
ATP para generar la contracción muscular o el movimiento de vesículas por medio del citoesqueleto.75
Otro tipo de ATPasas en la membrana celular son las bombas de iones implicadas en procesos de
transporte activo. Además, las enzimas también están implicadas en funciones mucho más exóticas, como
la producción de luz por la luciferasa en las luciérnagas.76 Los virus también pueden contener enzimas
implicadas en la infección celular, como es el caso de la integrasa del virus HIV y de la transcriptasa
inversa, o en la liberación viral, como la neuraminidasa del virus de la gripe.
Una importante función de las enzimas es la que presentan en el sistema digestivo de los animales.
Enzimas tales como las amilasas y las proteasas son capaces de degradar moléculas grandes (almidón o
proteínas, respectivamente) en otras más pequeñas, de forma que puedan ser absorbidas en el intestino.
Las moléculas de almidón, por ejemplo, que son demasiado grandes para ser absorbidas, son degradadas
por diversas enzimas a moléculas más pequeñas como la maltosa, y finalmente a glucosa, la cual sí puede
ser absorbida a través de las células del intestino. Diferentes enzimas digestivas son capaces de degradar
diferentes tipos de alimentos. Los rumiantes que tienen una dieta herbívora, poseen en sus intestinos una
serie de microorganismos que producen otra enzima, la celulasa, capaz de degradar la celulosa presente
en la pared celular de las plantas.77
Varias enzimas pueden actuar conjuntamente en un orden específico, creando así una ruta metabólica. En
una ruta metabólica, una enzima toma como sustrato el producto de otra enzima. Tras la reacción
catalítica, el producto se transfiere a la siguiente enzima y así sucesivamente. En ocasiones, existe más de
una enzima capaz de catalizar la misma reacción en paralelo, lo que permite establecer una regulación
más sofisticada: por ejemplo, en el caso en que una enzima presenta una actividad constitutiva pero con
una baja constante de actividad y una segunda enzima cuya actividad es inducible, pero presenta una
mayor constante de actividad.
Las enzimas determinan los pasos que siguen estas rutas metabólicas. Sin las enzimas, el metabolismo no
se produciría a través de los mismos pasos, ni sería lo suficientemente rápido para atender las necesidades
de la célula. De hecho, una ruta metabólica como la glucólisis no podría existir sin enzimas. La glucosa,
por ejemplo, puede reaccionar directamente con el ATP de forma que quede fosforilada en uno o más
carbonos. En ausencia de enzimas, esta reacción se produciría tan lentamente que sería insignificante. Sin
embargo, si se añade la enzima hexoquinasa que fosforila el carbono 6 de la glucosa y se mide la
concentración de la mezcla en un breve espacio de tiempo se podrá encontrar únicamente glucosa-6-
fosfato a niveles significativos. Por tanto, las redes de rutas metabólicas dentro de la célula dependen del
conjunto de enzimas funcionales que presenten.
Control de la actividad enzimática
ph: Como la conformación de las proteínas depende, en parte, de sus cargas eléctricas, habrá un pH en el
cual la conformación será la más adecuada para la actividad catalítica . Este es el llamado pH óptimo.
temperatura:En general, los aumentos de temperatura aceleran las reacciones químicas: por cada 10ºC de
incremento, la velocidad de reacción se duplica. Las reacciones catalizadas por enzimas siguen esta ley
general. Sin embargo, al ser proteínas, a partir de cierta temperatura, se empiezan a desnaturalizar por el
calor. La temperatura a la cual la actividad catalítica es máxima se llama temperatura óptima .
cofactores: si no hay presencia de cofactores, no se va a formar la holoenzima.
concentraiones: La velocidad de una reacción enzimática depende de la concentración de sustrato
inhibidores: pueden ocupar temporalmente el centro activo por semejanza estructural con el sustrato
original(competitivos) ó bien alteran la conformación espacial del enzima, impidiendo su unión al
sustrato (no competitivo)
modulación alostérica:
modificación covalente: Otros enzimas pasan de una forma menos activa a otra más activa uniéndose
covalentemente a un grupo químico de pequeño tamaño como el P i o el AMP.
proteólisis: Algunos enzimas no se sintetizan como tales, sino como proteínas precursoras sin actividad
enzimática. Estas proteínas se llaman proenzimas o zimógenos. Para activarse, los zimógenos sufren un
ataque hidrolítico que origina la liberación de uno o varios péptidos
isoenzimas: Estas diferencias de estructura se traducen en ligeros cambios en sus propiedades, de forma
que cada isozima se adapta perfectamente a la función que debe realizar.
