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Lógica Molecular en Organismos Vivos

Este documento describe la lógica molecular de los organismos vivos. Explica que aunque los seres vivos están compuestos de moléculas inanimadas, poseen atributos como complejidad, capacidad de extraer y transformar energía, y capacidad de reproducirse. Describe que las biomoléculas como proteínas y ácidos nucleicos están formadas por pocos tipos de unidades básicas ordenadas de diferentes maneras. También explica cómo los organismos vivos crean y mantienen orden a expensas de su entorno, actuando como sistemas ab
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Lógica Molecular en Organismos Vivos

Este documento describe la lógica molecular de los organismos vivos. Explica que aunque los seres vivos están compuestos de moléculas inanimadas, poseen atributos como complejidad, capacidad de extraer y transformar energía, y capacidad de reproducirse. Describe que las biomoléculas como proteínas y ácidos nucleicos están formadas por pocos tipos de unidades básicas ordenadas de diferentes maneras. También explica cómo los organismos vivos crean y mantienen orden a expensas de su entorno, actuando como sistemas ab
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LA  LOGICA  MOLECULAR  DE  LOS  ORGANISMOS  


VIVOS  
Resumido de "Curso breve de Bioquímica" - Albert L. Lehninger- Ed. Omega S.A.  

Los  seres  vivos  están  integrados  por  moléculas  inanimadas  que  se  ajustan  a  todas  
las  leyes  físicas  y  químicas  que  rigen  el  comportamiento  de  la  materia  inerte.  Sin  
embargo  los  organismos  vivos  poseen  unos  atributos  que  no  se  encuentran  en  la  
materia  inanimada  como  son:  

Complejidad  y  organización:  
No
se
pude
 

Poseen  estructuras  internas  complejas  formadas  por  numerosas  moléculas  


complejas.  

Cada  una  de  las  partes  que  componen  la  materia  viva  cumple  un  rol  específico:  
No
se
pude
 

Esto  se  cumple  no  sólo  para  las  estructuras  intracelulares,  sino  también  para  
los  compuestos  químicos  de  la  célula  (lípidos,  proteínas  y  ácidos  nucleicos).  

Son  capaces  de  extraer  y  transformar  la  energía  de  su  entorno:  
No
se
pude
 

El   ser   vivo   utiliza   materias   primas   sencillas   para   producir   o   transformar  


energía,  la  cual  es  utilizada  para  edificar  y  mantener  sus  propias  e  intrincadas  
estructuras.  

Poseen  la  capacidad  de  duplicarse:  


No
se
pude
 

El  ser  vivo  posee  la  capacidad  de  reproducirse,  elaborando  copias  exactas  
de  si  mismo,  logrando  así  la  persistencia  de  sí  mismo    en  nuestro  planeta.  
   
   

BIOQUIMICA  DEL  ESTADO  VITAL  

¿A  qué  se  debe  que  moléculas  inanimadas  den  origen  a  seres  vivos?  

Los   filósofos   medievales   hubieran   apelado   al   vitalismo,   doctrina   sin   basamento  


científico.   La   bioquímica   actual   estudia   de   que   modo   el   conjunto   de   materias  
inanimadas   que   constituyen   los   organismos   vivos   se   influyen   mutuamente   para  
mantener  y  perpetuar  el  estado  de  vida.  Como  los  seres  vivos  están  constituidos  
por  moléculas  que  ejercen  entre  sí  interacciones  específicas,  debemos  considerar  
el  concepto  de  que  la  biología  es  química.  La  biología  es  una  “superquímica”  que  
comprende   pero   al   mismo   tiempo   trasciende,   los   campos   tradicionales   de   la  
química.  

Las  moléculas  que  integran  los  organismos  vivos  no  solamente  se  rigen  por  todos  
los  principios  físicos  y  químicos  familiares  que  gobiernan  el  comportamiento  de  la  
materia  inanimada,  sino  que,  además  ejercen  acciones  mutuas  de  acuerdo  con  otro  
modo  colectivo  como  la  lógica  molecular  de  la  vida.  

Existe   un   conjunto   de   "Reglas   Fundamentales"   o   axiomas,   que   gobiernan   la  


naturaleza,  la  función  y  las  interacciones  de  los  tipos  específicos  de  las  moléculas  
presentes  en  los  organismos  vivos,  y  les  dotan  de  la  capacidad  de  organizarse  y  
replicarse  por  si  mismos.  

BIOMOLECULAS:  

La  composición  química  de  los  seres  vivos  es,  cualitativamente,  muy  diferente  de  la  
del  entorno  físico  en  que  viven.  

La  mayor  parte  de  los  componentes  químicos  de  los  organismos  son  compuestos  
orgánicos   de   carbono   en   los   que   el   elemento   se   halla   relativamente   reducido   o  
hidrogenado.  Muchas  biomoléculas  orgánicas  contienen  también  nitrógeno.  Por  el  
contrario,  los  elementos  nitrógeno  y  carbono  no  son  abundantes  en  la  materia  inerte  
y   se   encuentran   en   la   atmósfera   y   en   la   corteza   terrestre   en   formas   inorgánicas  
sencillas,   tales   como,   dióxido   de   carbono,   nitrógeno   molecular,   carbonatos   y  
nitratos.  

Los  compuestos  orgánicos  presentes  en  la  materia  viva  muestran  enorme  variedad  
y  la  mayor  parte  de  ellos  son  extraordinariamente  complejos;;  las  mas  sencillas  de  
las  células,  las  bacterias  contienen  gran  número  de  distintas  moléculas  orgánicas.  
Las   proteínas   y   los   ácidos   nucleicos   son   moléculas   complejas   y   solamente   se  
conoce  la  estructura  de  unas  pocas.  

Si   consideramos   ahora   organismos   mayores   y   más   complejos   como   son   los  


animales   y   las   plantas   superiores   hallaremos   que   también   contienen   proteínas   y  
ácidos  nucleicos  y  en  mucha  mayor  variedad;;  cada  especie  de  organismos  posee  
su   propio   conjunto   de   moléculas   proteicas   y   de   ácidos   nucleicos   químicamente  
diferentes.  

Parecería   una   empresa   sin   esperanza   que   los   bioquímicos   intentaran   aislar,  
identificar   y   sintetizar   todas   las   diferentes   moléculas   orgánicas   presentes   en   la  
materia  viva.  Constituye  una  paradoja,  sin  embargo,  que  la  inmensa  diversidad  de  
moléculas  orgánicas  de  los  organismos  vivos  se  puede  reducir  en  último  término,  a  
una  casi  absurda  simplicidad.  

Sabemos   ahora   que   las   macromoléculas   de   la   célula   se   hallan   formadas   por  


muchas  moléculas  sencillas,  pequeñas  unidades  estructurales  que  se  hallan  ligadas  
constituyendo  largas  cadenas.  

En  las  proteínas  sólo  se  encuentran  20  tipos  de  aminoácidos  diferentes,  pero  están  
ordenados  en  muchas  secuencias  distintas,  de  modo  que  forman  numerosos  tipos  
de  proteínas.  

Además,  los  20  aminoácidos  distintos  constituyentes  de  las  proteínas  y  los  cinco  
nucleótidos  diferentes  que  integran  los  ácidos  nucleicos  son  idénticos  en  todas  las  
especies  vivientes.  El  reducido  número  de  moléculas  sencillas,  sillares  estructurales  
con   que   están   construidas   todas   las   macromoléculas,   poseen   otra   sorprendente  
característica:   cada   una   de   ellas   desempeña   diversas   funciones   en   las   células  
vivientes  y  algunas  son  extremadamente  versátiles  que  realizan  buen  número  de  
funciones.   Los   aminoácidos   no   sólo   actúan   como   sillares   de   construcción   de   las  
moléculas   proteicas,   sino   también   como   precursores   de   las   hormonas,   los  
alcaloides,   las   porfirinas,   los   pigmentos   y   otras   muchas   biomoléculas.   Las  
mononucleótidos   no   sólo   constituyen   las   unidades   fundamentales   de   los   ácidos  
nucleicos  sino  que  actúan  también  como  coenzimas  y  moléculas  transportadoras  
de  energía.  Podemos  ver  que  en  la  organización  molecular  de  la  célula  existe  una  
simplicidad   fundamental:   los   millares   de   macromoléculas   diferentes   que   la   forma  
están   constituidas   por   sólo   unas   pocas   moléculas   sencillas.   Podemos   ver   que   la  
identidad   de   cada   una   de   las   especies   de   organismos   está   preservada   por   su  
posesión  de  un  conjunto  distintivos  de  ácidos  nucleicos  y  de  proteínas.  

TRANSFORMACIONES  ENERGETICAS  EN  LAS  CELULAS  VIVAS  

La  complejidad  molecular  y  la  ordenación  estructural  de  los  organismos  vivos,  en  
contraposición   al   azar   que   reina   en   la   materia   inerte,   tiene   unas   implicaciones  
profundas  para  el  físico  científico.  La  segunda  ley  de  la  termodinámica  establece  
que  los  procesos  físicos  y  químicos  tienden  a  aumentar  el  desorden  o  el  caos  en  el  
mundo,  es  decir  su  entropía.  

La  primera  Ley  de  la  Termodinámica  establece  que  la  energía  no  puede  crearse  ni  
destruirse.  Los  organismos  vivos  absorben  una  forma  de  energía  que  le  es  útil  en  
las   condiciones   especiales   de   temperatura   y   presión   en   que   viven   y   entonces  
devuelven   al   ambiente   una   cantidad   equivalente   de   energía.   La   energía   útil   que  
toman   las   células   se   denomina   energía   libre   y   se   define   como   el   tipo   de   energía  
capaz  de  realizar  trabajos  a  temperatura  y  presión  constante.  

Los  organismos  vivos  crean  y  mantienen  su  ordenación  esencial,  a  expensas  de  su  
entorno,   al   que   transforman   haciéndolo   cada   vez   más   desordenado   y   caótico.  
Utilizando  el  lenguaje  termodinámico,  los  organismos  vivos  son  sistemas  abiertos  
porque   intercambian   materia   y   energía   con   su   entorno.   La   característica   de   los  
sistemas  abiertos  es  que  no  se  hallan  en  equilibrio  con  su  entorno.  

Los  organismos  vivos  se  hallan  en  estado  estacionario  que  es  cuando  un  sistema  
abierto   la   velocidad   de   transferencia   de   materia   y   energía   desde   el   entorno   al  
sistema  se  halla  compensado  por  la  velocidad  de  transferencia  de  materia  y  energía  
hacia  el  exterior  del  sistema.  

Las  células  vivas  son  muy  eficaces  en  la  manipulación  de  la  energía  y  de  la  materia.  

La  maquinaria  de  transformación  de  energía  de  las  células  vivas  está  construida  por  
entero  con  moléculas  orgánicas  relativamente  frágiles  e  inestables,  incapaces  de  
resistir   temperaturas   elevadas,   corrientes   eléctricas   intensas   o   concentraciones  
extremas   de   ácidos   o   de   bases.   La   célula   viva   es,   por   tanto,   esencialmente  
isotérmica;;   en   un   instante   determinado   todas   sus   partes   tienen   prácticamente   la  
misma  temperatura.  La  célula  viva  es  una  máquina  química  isotérmica.  

REACCIONES  QUIMICAS  EN  LAS  CELULAS  VIVAS  

Las   células   pueden   actuar   como   máquinas   químicas,   porque   poseen   enzimas,  
catalizadoras   capaces   de   aumentar   mucho   la   velocidad   de   reacciones   químicas  
específicas.  Las  enzimas  son  moléculas  proteicas  muy  especializadas  elaboradas  
por   las   células   a   partir   de   aminoácidos   sencillos.   Cada   enzima   solamente   puede  
catalizar  un  tipo  específico  de  reacción  química.  En  milésimas  de  segundo  pueden  
catalizar   secuencias   de   reacciones   muy   complejas,   las   cuales   requerirían   días,  
semanas  o  meses  de  funcionamiento  en  el  laboratorio  químico.  

Las   reacciones   catalizadas   enzimaticamente   tienen   lugar   con   un   rendimiento   del  


100%  y  no  hay  subproductos.  

Los   organismos   vivos   pueden   llevar   a   cabo   de   modo   simultáneo,   muchas  


reacciones  individuales  diferentes  sin  perderse  en  un  mar  de  subproductos  inútiles.  

EL  PRINCIPIO  DE  LA  COMPLEMENTARIDAD  ESTRUCTURAL  


Las  moléculas  enzimáticas  tienen  que  combinarse  con  sus  sustratos  durante  el  ciclo  
catalítico,  y  el  centro  activo  de  la  molécula  de  la  enzima  solamente  aceptará  como  
sustratos  aquellas  moléculas  que  se  adapten  a  él,  con  una  complementariedad  casi  
perfecta.  Los  centenares  de  reacciones  químicas,  catalizadas  enzimáticamente  no  
se  realizan  de  modo  independiente  unas  de  otras  sino  que  están  relacionadas  entre  
sí   y   constituyen   muchas   secuencias   diferentes   de   reacciones   consecutivas   que  
poseen  intermediarios  comunes,  de  modo  que  el  producto  de  la  primera  reacción  
se   convierte   en   el   sustrato   o   reactante   de   la   segunda   y   así   sucesivamente.   Esta  
ordenación  determina  diversas  consecuencias  biológicas  importantes.  

Una  de  ellas  consiste  en  que  tales  sistemas  de  reacciones  químicas  se  canalicen  
por   rutas   específicas;;   otra   es   que   las   reacciones   secuenciales   hacen   posible   la  
transferencia  de  energía  química  en  condiciones  isotérmicas.  

Las  células  vivas  pueden  dividirse  en  dos  grandes  clases  según  el  tipo  de  energía  
que   obtienen   de   su   entorno.   Las   células   fotosintéticas   utilizan   la   luz   solar   como  
principal  fuente  de  energía:  la  energía  radiante  es  absorbida  por  el  pigmento  clorofila  
y   transformada   en   energía   química.   Las   células   heterotróficas   aprovechan   la  
energía  de  las  moléculas  orgánicas  muy  reducidas,  ricas  en  energía,  que  obtienen  
de  su  entorno,  como  la  glucosa.  

El   trifosfato   de   adenosina   o   ATP,   actúa   como   el   transportador   de   energía   más  


importante   en   las   células   de   todas   las   especies   vivientes.   La   función   biológica  
específica  del  sistema  ATP-­ADP  como  nexo  de  unión  entre  dos  grandes  redes  de  
reacciones  enzimáticas  en  la  célula,  es  posible  gracias  a  una  serie  consecutiva  de  
reacciones  químicas.  

AUTORREGULACION  DE  LAS  REACCIONES  CELULARES  

La  conexión  de  reacciones  catalizadas  por  enzimas,  en  secuencias  de  reacciones  
consecutivas,   hace   posible   canalizar   ordenadamente   los   millones   de   reacciones  
químicas  que  se  suceden  en  las  células,  de  modo  que  las  biomóleculas  específicas  
necesarias   para   la   estructura   y   función   celulares   tengan   lugar   en   cantidades   y  
velocidades  adecuadas  para  mantener  el  estado  estacionario  normal.  La  velocidad  
de   una   reacción   específica   en   una   porción   de   la   compleja   red   de   reacciones  
enzimáticas  de  la  célula  puede  ser  controlada  o  modulada  por  las  velocidades  de  
las  reacciones  de  otra  parte  de  la  red.  Algunas  enzimas  de  la  célula,  especialmente  
las  que  se  hallan  al  comienzo  de  una  secuencia  de  reacciones  o  en  un  punto  de  
ramificación  de  la  secuencia,  actúan  como  enzimas  "reguladores";;  son  inhibidas  por  
el  producto  final  de  la  secuencia  de  reacciones  

Las  células  vivas  poseen,  además,  la  capacidad  de  regular  la  síntesis  de  sus  propios  
catalizadores.  

Tales   propiedades   de   autoajuste   y   autoregulación   son   fundamentales   para  


mantener  el  estado  estacionario  de  la  célula  viva  y  son  esenciales  para  su  eficacia  
en  la  transformación  de  la  energía.  

AUTOREPLICA  DE  LOS  ORGANISMOS  VIVOS  

La  propiedad  más  notable  de  las  células  vivas  es  su  capacidad  de  reproducirse  con  
fidelidad   casi   perfecta,   no   solamente   una   o   diversas,   lo   que   ya   sería   bastante  
notable  sino  por  centenares  y  millares  de  generaciones.  Los  símbolos  en  que  está  
codificada  la  información  poseen  las  dimensiones  de  partes  de  simples  moléculas  
de  A.D.N.  

La  notable  capacidad  de  las  células  vivas  para  preservar  su  información  genética  
es  el  resultado  de  la  complementariedad  estructural.  

Una  hebra  de  A.D.N.  actúa  como  patrón  par  ala  réplica  enzimática  de  otra  hebra  de  
A.D.N.  estructuralmente  complementaria.  

La  molécula  de  A.D.N.    escindirse  con  frecuencia,  pero  es  reparada  con  rapidez  y  
automáticamente.  No  es  frecuente  que  se  produzcan  errores  o  mutaciones.  
La   información   unidimensional   del   A.D.N.   es   transferida   a   la   información  
tridimensional  inherente  a  los  componentes  macromoleculares  de  los  organismos,  
gracias  a  la  traslación  de  la  estructura  del  A.D.N.  a  la  estructura  proteica.    

Una   célula   es   un   sistema   abierto   isotérmico   que   se   ensambla,   ajusta   y  


perpetua   por   si   misma.   El   sistema   está   constituido   por   muchas   reacciones  
orgánicas   consecutivas   y   ligadas,   promovidas   por   unos   catalizadores  
orgánicos   producidos   por   la   célula;;   opera   según   el   principio   de   máxima  
economía  de  partes  y  procesos,  asegurando  su  precisa  autorréplica  mediante  
un  código  molecular  lineal    

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