FACULTAD DE CIENCIAS Y FILOSOFÍA

DEPARTAMENTO ACADÉMICO DE INGENIERÍA

SÍLABO

I. DATOS GENERALES
1.1 Nombre de la asignatura Molecular Biology for Engineers
1.2 Código C1128
1.3 Carrera(s) Ingeniería Biomédica
1.4 Semestre Académico 2021-II
1.5 Tipo de la asignatura Curso OBLIGATORIO
1.6 Prerrequisitos Bioquímica (1CAY45)
1.7 Créditos 3
Horas teóricas: 2
Horas prácticas: 2
1.8 Duración Del: 23 de agosto
al: 18 de diciembre
1.9 Profesor coordinador Juan Blume La Torre, MSc.
[Link]@[Link]

II. SUMILLA

The aim of this theoretical-practical course, offered in English, is to familiarize the student
with the molecular mechanisms of the information flow that directs the functioning and
evolution of living beings. Emphasis is given on replication and on the role of gene expression
in cellular growth and the development of tissues. The future engineer will also study the
technologies that have been developed based on molecular knowledge, such as functional
genomics, metagenomics, molecular epidemiology, genetic engineering, etc.

II. DESCRIPCIÓN DE LA ASIGNATURA

El curso se ha diseñado para que los estudiantes de las carreras de Ingeniería conozcan los
fundamentos moleculares que rigen la vida, crecimeinto y muerte de las células y tejidos.
Se presentan los conceptos clásicos del flujo de información a partir del ADN hasta las
proteínas y el funcionamiento de la célula eucariótica. Además, se estudian las tecnologías,
tanto de laboratorio como informáticas, que se han desarrollado para generar este
conocimiento y continuar ampliándolo. La parte práctica se basa en ejercicios de
bioinformática que afianzan los conceptos de los textos y lo visto en las clases teóricas, las
cuales se realizan en inglés.

III. RESULTADOS DE APRENDIZAJE

Unidad didáctica 1. Nucleic acids; the flow of genetic information. Al final de la unidad,
el estudiante será capaz de:
Integrar conocimientos de estructura y función de los ácidos nucleicos con respecto a la
expresión y regulación de la información genética.
Aplicar las herramientas bioinformáticas con las que se estudia e investiga en Biología
molecular, particularmente en los campos de salud y biotecnología.
Unidad didáctica 2: Cell growth and development. Al final de la unidad, el estudiante
será capaz de:
Explicar cómo elementos moleculares y celulares claves regulan los procesos
fundamentales para el crecimiento, división, proliferación, supervivencia, envejecimiento
y muerte celular.
Diseñar soluciones a problemas típicos de la investigación en biología molecular y celular
aplicando herramientas bioinformáticas.

IV. CONTENIDOS

UNIDAD 1: Nucleic acids; the flow of genetic information

● The central dogma of Molecular biology
● Gene expression
● Bacterial systems used in biotechnology
● Regulation of gene expression: Engineered proteins
● Recombinant DNA, plasmids
● Virus, molecular diagnostics
● Omics in health; genetic diseases

UNIDAD 2: Cell growth and development

● Transmembrane proteins, cell transport
● Secretion proteins, lectins, glycoproteins
● Cytoskeleton, extracellular matrix
● Cell signaling; proliferation and differentiation
● Cell lines and animal models
● Control of development; homeobox genes
● Cancer

V. ESTRATEGIAS DIDÁCTICAS

La asignatura desarrolla sesiones de aprendizaje no presenciales, haciendo uso del Entorno

Virtual para el Aprendizaje (EVA), herramienta de videoconferencia Zoom y los recursos
tecnológicos.

Las metodologías para las sesiones de aprendizaje en la modalidad no presencial son:

Clases magistrales: El docente encargado dirige sesiones sincrónicas sobre temas basados
en libros de texto interactuando con los estudiantes mediante preguntas y comentarios. Para
fomentar la participación activa de los estudiantes, se los provee previamente de material
seleccionado para el estudio independiente.
Prácticas dirigidas de bioinformática: En una sesión asincrónica se presenta un caso o
problema y se explican los fundamentos de la(s) herramienta(s) bioinformática(s) para
 resolverlo. En una sesión sincrónica, con apoyo de los docentes, los estudiantes trabajarán
en grupos pequeños para ir enriqueciendo un portafolio digital.
Proyecto semestral: Grupos de hasta seis estudiantes presentarán un poster sobre un
problema específico de salud con base en biología molecular.

VI. EVALUACIÓN

Las evaluaciones en la modalidad no presencial se realizan a través del Entorno Virtual para
el Aprendizaje (EVA), herramienta de videoconferencia Zoom y los recursos tecnológicos.

El docente considera actividades para la evaluación formativa y sumativa con la

retroalimentación efectiva de cada evaluación.

Sistema de evaluación
Actividad peso total

3 pasos cortos (pc) 3.0% 9.0%

3 prácticas dirigidas (pd) 3.0% 9.0%

Unidad 1 39%
3 informes en el portafolio (ip) 4.0% 12.0%

Examen I (ExI) 9.0% 9.0%

4 pasos cortos 3.0% 12.0%

4 prácticas dirigidas 3.0% 12.0%

Unidad 2 52%
4 informes en el portafolio 4.0% 16.0%

Examen II (ExII) 12.0.% 12.0%

-- 9% Proyecto semestral (ps) 9.0% 9.0%

Fórmula para el cálculo de la nota final

La nota final (NF) del curso se determina de la siguiente manera:
NF = 7pc*0.03 + 7pd*0.03 + 7ip*0.04 + ExI*0.09 + ExII*0.12 + ps*0.09

▪ ● La asistencia a las prácticas dirigidas de bioinformática es obligatoria.

▪ ● El fraude en cualquier tipo de evaluación no es tolerado e implica nota cero (0). El evento
será registrado en la Jefatura del Departamento.

La normativa que rige la evaluación y calificación se encuentra disponible en el

Reglamento de la Actividad Académica de Pregrado:
 [Link]
52/reglamentos/item/[Link] (Artículos del 111 al 134)

Importante: * En los casos que durante una evaluación en línea se pierda la conectividad
deberá enviar su justificación al coordinador del curso con copia a la Secretaría Académica
de FACIEN [Link]@[Link]

Según acuerdo del Coordinador de especialidad (PUCP) y el Jefe de carrera (UPCH), los
retiros de las asignaturas se realizarán según estipula el Reglamento de Matrícula PUCP -
UPCH, Título VI Retiro de Cursos Art. 32: "Dentro de las primeras ocho semanas de
clase, el estudiante podrá, sin expresión de causa, retirarse de uno o más cursos en los
que se hubiere matriculado vía Campus Virtual PUCP." En el presente semestre, el
estudiante podrá retirarse de la asignatura hasta la semana 8.

VII. BIBLIOGRAFÍA
Básica o Texto de la asignatura
1. Iwasa J Karp. Biología celular y molecular: conceptos y experimentos. Ciudad de
México: McGraw-Hill; 2019. URL

Complementaria:
1. Pinilla Bermúdez G. Biología molecular: ADN recombinante y sus aplicaciones [En
Línea]. Bogotá: Editorial El Manual Moderno Colombia, 2019. URL
2. Pollard TD, Earnshaw WC, Lippincott-Schwartz J y Johnson GT. Cell Biology, 3rd
edition. Elsevier. San Francisco, California 2017. URL
3. Clark D, Pazdernik NJ y McGehee MJ. Molecular Biology, 3rd edition. Academic
Press, Elsevier. Londres, Reino Unido. 2019. URL

Enlaces de interés:
1. Repositorios y herramientas informáticas en National Center for Biotechnology Information
2. Repositorios y herramientas informáticas del European Molecular Biology Laboratory
3. Revista Nature: Artículos de acceso libre sobre Molecular Biology
4. Portal educativo sobre técnicas moleculares en ThermoFisher Scientific

VIII. PROFESORES DEL CURSO E INVITADOS

Grado o
Nombre Apellidos Condición Correo electrónico
Título
Mag. Juan Blume La Torre Prof. DAI [Link]@[Link]
Mag. Jenniffer Espinoza Ramírez Prof. DACCM [Link]@[Link]
Mag. Renzo Gutiérrez Loli Prof. DAI [Link]@[Link]
Dr. rer. nat. Cristina Guerra Giraldez Prof. DAI [Link]@[Link]
PhD Maricarmen Planas Silva Invitada maricarmenplanass@[Link]
Lic. David Castañeda Carpio Invitado [Link].c@[Link]
Lic. José Maravi Jaime Prof. DAI [Link].j@[Link]
Bach. Camila Castillo Vilcahuaman Asistente [Link].v@[Link]
IX PROGRAMACIÓN DE ACTIVIDADES

Horario Actividades de
Sesión Fecha Contenido Docente
aprendizaje

UNIT 1 – Nucleic acids, the flow of genetic information

Clase magistral -
1 27/08 7:00 - 9:00 AM The central dogma of molecular biology 1 J Blume LT
SINCRÓNICA
J Blume LT
J Espinoza R
Práctica dirigida
1 28/08 10:00 - 12:00 M Bases de datos de secuencias R Gutiérrez L
SINCRÓNICA
J Maraví J
C Castillo V
Clase magistral -
2 3/09 7:00 - 9:00 AM The central dogma of molecular biology 2 R Gutiérrez L
SINCRÓNICA
J Blume LT
J Espinoza R
Práctica dirigida
2 4/09 10:00 - 12:00 M Alineamiento de secuencias R Gutiérrez L
SINCRÓNICA
J Maraví J
C Castillo V
Regulation of gene expression, post translational
Clase magistral -
3 10/09 7:00 - 9:00 AM modifications, epigenetics R Gutiérrez L
SINCRÓNICA
Paso Corto #1
J Blume LT
J Espinoza R
Práctica dirigida
3 11/09 10:00 - 12:00 M Diseño de primers R Gutiérrez L
SINCRÓNICA
J Maraví J
C Castillo V
Recombinant DNA, plasmids, biotechnology, engineered Clase magistral -
4 17/09 7:00 - 9:00 AM R Gutiérrez L
proteins SINCRÓNICA
Práctica dirigida J Blume LT
4 11/09 10:00 - 12:00 M Diseño de primers
SINCRÓNICA J Espinoza R
 R Gutiérrez L
J Maraví J
C Castillo V
Biology of viruses; molecular diagnostics Clase magistral -
5 24/09 7:00—9:00 AM J Blume LT
Paso Corto #2 SINCRÓNICA
J Blume LT
J Espinoza R
Práctica dirigida
5 25/09 10:00 - 12:00 M Análisis de datos de qPCR R Gutiérrez L
SINCRÓNICA
J Maraví J
C Castillo V
Clase magistral -
6 1/10 7:00—9:00 AM Omics in health; genetic diseases C Guerra G
SINCRÓNICA
J Blume LT
J Espinoza R
Práctica dirigida
6 2/10 10:00 - 12:00 M Diseño de plásmido I (expresión en bacterias) R Gutiérrez L
SINCRÓNICA
J Maraví J
C Castillo V

UNIT 2 – Cell growth and development

Transmembrane proteins, cell transport Clase grabada

7 8/10 -- C Guerra G
Paso Corto #3 ASINCRÓNICA
J Blume LT
J Espinoza R
Práctica dirigida
7 9/10 10:00 - 12:00 M Diseño de plásmido II (expresión en células de mamífero) R Gutiérrez L
SINCRÓNICA
J Maraví J
C Castillo V
Clase magistral -
8 15/10 7:00—9:00 AM Secretion proteins, lectins, glycoproteins C Guerra G
SINCRÓNICA
J Blume LT
Práctica dirigida
8 16/10 10:00 - 12:00 M Diseño de plásmido III (gen reportero) J Espinoza R
SINCRÓNICA
R Gutiérrez L
 J Maraví J
C Castillo V

9 22/10 Examen I (Unidad I) J Blume LT

Cytoskeleton, extracellular matrix Clase magistral -

10 29/10 7:00—9:00 AM C Guerra G
Paso Corto #4 SINCRÓNICA
J Blume LT
J Espinoza R
Práctica dirigida
10 30/10 10:00 - 12:00 M Sistemas CRISPR R Gutiérrez L
SINCRÓNICA
J Maraví J
C Castillo V
Cell signaling; proliferation and differentiation (planaria Clase magistral -
11 5/11 7:00—9:00 AM J Blume LT
model, germ cells) SINCRÓNICA
J Blume LT
J Espinoza R
Práctica dirigida
11 6/11 10:00 - 12:00 M Sistemas CRISPR R Gutiérrez L
SINCRÓNICA
J Maraví J
C Castillo V
Autophagy and apoptosis Clase magistral -
12 12/11 7:00—9:00 AM D Castañeda C
Paso Corto #5 SINCRÓNICA
J Blume LT
J Espinoza R
Práctica dirigida
12 13/11 10:00 - 12:00 M Modelamiento de proteínas I (por homología) R Gutiérrez L
SINCRÓNICA
J Maraví J
C Castillo V
Clase magistral -
13 19/11 7:00—9:00 AM Cell lines and animal models R Gutiérrez L
SINCRÓNICA
J Blume LT
Práctica dirigida
13 20/11 10:00 - 12:00 M Modelamiento de proteínas II (por threading) J Espinoza R
SINCRÓNICA
R Gutiérrez L
 J Maraví J
C Castillo V
Control of development; homeobox genes Clase magistral -
14 26/11 7:00—9:00 AM J Blume LT
Paso Corto #6 SINCRÓNICA
J Blume LT
J Espinoza R
Procesamiento de imágenes I Práctica dirigida
14 27/11 10:00 - 12:00 M R Gutiérrez L
*Entrega del proyecto (Poster) SINCRÓNICA
J Maraví J
C Castillo V
Cancer Clase magistral -
15 3/12 7:00—9:00 AM Maricarmen Planas
Paso Corto #7 SINCRÓNICA
J Blume LT
J Espinoza R
Práctica dirigida
15 4/12 10:00 - 12:00 M Procesamiento de imágenes II R Gutiérrez L
SINCRÓNICA
J Maraví J
C Castillo V
J Blume LT,
J Espinoza R,
C. Guerra G,
16 10/12 7:00—9:00 AM Examen II (Unidad II)
R Gutiérrez L,
J Maraví J,
C Castillo V
Presentación J Blume LT,
SINCRÓNICA J Espinoza R,
C. Guerra G,
16 11/12 10:00 - 12:00 M Presentación de proyectos (como examen)
R Gutiérrez L,
J Maraví J,
C Castillo V
17 18/12 10:00 - 12:00 M Exámenes sustitutorios Juan Blume LT
X CARGA LECTIVA DE DOCENTES DEL CURSO (HORAS)

TOTAL
Seminario/ Horas
Profesor Teoría Práctica Taller Examen Asesoría Coordinación HORAS
R.R* EVA
CURSO

BLUME LA TORRE, Juan 8 28 0 0 4 0 0 24 64

ESPINOZA RAMÍREZ, Jenniffer 0 28 0 0 4 0 0 0 32

GUERRA GIRALDEZ, Cristina 8 0 0 0 4 0 0 0 12

GUTIERREZ LOLI, Renzo Marcelo 8 28 0 0 0 0 0 0 36

MARAVÍ JAIME, José 0 28 0 0 4 0 0 0 32

CASTILLO VILCAHUAMAN, Camila 0 28 0 0 4 0 0 0 32

CASTAÑEDA CARPIO David 2 0 0 0 0 0 0 0 2

PLANAS SILVA Maricarmen 2 0 0 0 0 0 0 0 2

* RR: revista de revistas