ISCN The Universal Language - En.es
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com
Capítulo 8
8.1 Introducción
Este capítulo se ha basado en los estándares recomendados por el comité internacional permanente sobre nomenclatura de citogenómica
humana, incluida una nueva nomenclatura citogenómica basada en secuencias desarrollada en colaboración con el grupo de trabajo de
descripción de variantes de secuencia de la Sociedad de Variación del Genoma Humano (HGVS), como se define en el ISCN2016: Un sistema
internacional de nomenclatura citogenómica humana (2016) informe publicado en 2016 [1]. Se hará referencia a las ubicaciones de las secciones
para ayudar al lector en una mayor investigación. Cualquier regla o estándar que haya cambiado en una publicación ISCN posterior a 2016
reemplazará cualquier regla o estándar que se haya descrito en este capítulo. La política del laboratorio que difiera de cualquier tema descrito en
este capítulo también sustituirá a la recomendación de este capítulo.
Debido a que este capítulo se ha desarrollado como una introducción a la nomenclatura, no se han cubierto todos los temas
incluidos en ISCN 2016 [1]. Entre los que no se incluyen se encuentran la nomenclatura meiótica [1, Capítulo 12], la rotura de
cromosomas [1, Capítulo 10], la hibridación in situ en metafase subtelomérica [1, sección 13.2.2], la hibridación in situ en fibras
extendidas de cromatina / ADN [1, sección 13.4], hibridación in situ inversa [1, sección 13.5], hibridación genómica comparativa de
cromosomas [1, sección 13.6], ensayos específicos de región [1, capítulo 15], ensayos basados en secuencias [1, capítulo 16] y varios
otros temas relacionados con reordenamientos complicados o pruebas especializadas.
El énfasis principal de este capítulo está en la escritura de cariotipos para citogenética convencional e informes FISH (hibridación in situ de
fluorescencia) en metafase / interfase. Al demostrar un evento específico en un ejemplo de cariotipo en este capítulo, podemos poner en negrita
el símbolo o evento para llamar la atención; sin embargo, el lector debe saber que ningún símbolo o carácter aparecerá en negrita en un cariotipo
real. Consulte el Capítulo 9, Anomalías cromosómicas constitucionales, para conocer cómo se forma cada anomalía estructural presentada en
este capítulo.
8.2 Idioma
Para un estudiante del siglo XXI, es difícil imaginar un mundo sin teléfonos celulares y computadoras
personales, pero para los genetistas de las décadas de 1960 y 1970, la comunicación entre laboratorios en
otros estados y países dependía de costosas llamadas telefónicas de larga distancia o de tiempo. ‐Correo
postal retrasado. Fue una época en la que pipetear con la boca con las manos sin guantes era la norma,
cuando la esterilidad se controlaba con la llama de un mechero Bunsen en un banco abierto, y cuando el
rito de iniciación como tecnólogo en un laboratorio de citogenética era dolorosamente inevitable,
ampollado con ácido. impresión del pulgar; sin embargo, los descubrimientos de estos tiempos difíciles
todavía influyen en los procesos básicos de hoy.
La nomenclatura de los cariotipos de base citogenética se originó en una conferencia en Denver en 1960 [2], donde un grupo selecto de participantes
estableció un estándar para la nomenclatura cromosómica humana, que sigue siendo la piedra angular de la citogenómica humana en la actualidad. Los
avances posteriores se incorporaron a las conferencias celebradas en 1963 (Londres) [3], 1966 (Chicago) [4], 1971 (París; introducido
El Manual de laboratorio de AGTCytogenetics, Cuarta edición. Editado por Marilyn S. Arsham, Margaret J. Barch y Helen J. Lawce.
© 2017 La Asociación de Tecnólogos Genéticos. Publicado en 2017 por JohnWiley & Sons, Inc.
360 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
bandas) [5], 1978 (consolidado en una publicación ISCN) [6], 1981 (bandas de alta resolución) [7], 1985 [8], 1991 (neoplasia)
[9], 1995 (FISH) [10], 2005 (idiogramas de nivel de banda de 300 y 700) [11], 2009 (idiograma redibujado, microarreglo) [12] y 2013 (ensayos
específicos de la región) [13]. Se proporciona una historia de estas conferencias al comienzo de cada publicación del ISCN.
Este sistema internacional para la nomenclatura citogenómica humana (ISCN), que se desarrolló inicialmente con el generoso
apoyo de la Fundación March of Dimes, se diseñó para ser tan simple y, sin embargo, tan flexible, que su estructura básica todavía se
practica en la actualidad. Reconocer los símbolos que definen las partes de un cromosoma y los eventos que afectan a estas partes,
junto con cómo se combinan, es el corazón y el núcleo de ISCN y lo que se discutirá en este capítulo.
8.2.1 Centrómero
La estructura crítica para mantener el equilibrio cromosómico de un organismo es el centrómero (cen). También conocida como
constricción primaria, a veces puede verse como una pequeña esfera incolora en la unión constreñida de los brazos duplicados de un
cromosoma. Los cromosomas humanos tienen solo un centrómero (monocéntrico), ubicado cerca del centro (metacéntrico), hacia el
final (acrocéntrico) o en algún lugar entre esos dos puntos (submetacéntrico) (ver Figura 8.1). Las posiciones telocéntricas (al final)
pueden existir en otras especies, pero no en los humanos.
Cuando funciona correctamente, el centrómero ordena la división celular al anclar cada brazo cromosómico idéntico hacia los polos
opuestos, asegurando así una migración equilibrada a las dos células hijas (consulte el Capítulo 6, Tinciones cromosómicas, para
obtener una explicación y los protocolos de las tinciones específicas). que se puede utilizar para distinguir estructuras centroméricas).
Sin embargo, esta estabilidad puede verse alterada cuando hay más de un centrómero presente (ver 8.5.2, Dicéntrico), a menos que el
cromosoma pueda compensar el centrómero sobrante o faltante (ver 8.5.2, Pseudodicéntrico, y 8.6.5, Derivado del neocentrómero ), o
los centrómeros están tan juntos que funcionan en concierto (ver 8.6.7, Derivadas acrocéntricas).
Además de su influencia en la supervivencia celular, el centrómero también es fundamental para casi todos los aspectos de la nomenclatura
ISCN. En términos generales, el número de estructuras centroméricas independientes en una célula determinará el recuento total de
cromosomas de la célula; por lo tanto, una estructura que parezca tener dos centrómeros (ver 8.5.2, Dicentric) aún se contará como un
cromosoma. El origen del centrómero determinará la ubicación del cromosoma tanto en la disposición pictórica de los cromosomas (ver 8.2.4,
Cariograma) como en la descripción simbólica de sus anomalías (ver 8.3, Cariotipo). Se presume que la presencia aleatoria única de un fragmento
cromosómico no centromérico (es decir, acéntrico, abreviado as) es el resultado de un artefacto cultural y, por lo tanto, no se incluiría en el
recuento total de cromosomas. tampoco se definiría dentro de la descripción de la celda simbólica (cario-tipo); sin embargo, se registrará si la
muestra se está evaluando para estudios de rotura [1, sección 10.3]. Por otro lado, un fragmento que demuestra estabilidad mitótica a través de
su presencia recurrente estaría incluido en el cariotipo, pero puede (ver
8.6.5, derivado del neocentrómero) o no pueden incluirse en el recuento de cromosomas (véase 8.7.8, doble minuto).
La tercera influencia es la separación visual del centrómero de un cromosoma en metafase en dos longitudes de brazo, lo que se conoce como la p más
corta (por petit) y brazo q más largo (algunos citogenetistas recuerdan una discusión de que los brazos corto y largo fueron designados p y q, porque, en
términos matemáticos, p + q = 1). Los genetistas de la Conferencia de Denver de 1960 [2] utilizaron estas proporciones de brazos para
a
(parte superior del brazo) pag
ht)
tida (c
B
cromá
C
p10
Centrómero (cen)
q10
q (antebrazo)
cromátida (ch
t)
Figura 8.1 posiciones del centrómero humano. Las cromátidas hermanas duplicadas se mantienen unidas mediante un centrómero. (a)Metacéntrico: centrómero
está ubicado en el centro; los brazos tienen casi la misma longitud. (B)Submetacéntrico: centrómero descentrado, creando brazos superiores e inferiores de
diferentes longitudes. el brazo más corto (en los cromosomas normales) es el brazo superior op, y el brazo más largo es el brazo q. (C)Acrocéntrico: centrómero
cerca del final, con solo un pequeño brazo p. el tallo heredado (pstk) que conecta el satélite (ps) al brazo p es una región organizadora de nucleolo (NOr).
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 361
proponen la clasificación de los grupos A a G, ordenando pares homólogos, llamados autosomas, en tamaño decreciente y
posicionamiento centromérico similar, y luego numerando secuencialmente cada par de 1 (más grande) a 22 (más pequeño) con fines
de identificación. Se suponía que los dos restantes eran los cromosomas sexuales, X e Y. Los autosomas ahora se denominan por su
número, en lugar de la letra del grupo original, pero algunos laboratorios aún pueden separar espacialmente los siete grupos
autosómicos para la orientación visual en el cariograma.
Finalmente, pero de gran importancia para ISCN, es el papel fundamental del centrómero en la numeración de bandas, que comienza en el centrómero
(p10, pronunciado p-uno-cero, para el brazo corto y q10 para el brazo largo) y avanza en direcciones opuestas hacia sus respectivos telómeros, o extremos
terminales (pter, pronunciado "p-ter", para el brazo corto y qter para el brazo largo). Al describir la relación de las posiciones de las bandas en un brazo
cromosómico, una dirección distal se aleja del centrómero, hacia el extremo terminal del brazo, y una dirección proximal se mueve hacia el centrómero (ver
Figura 8.2). Por ejemplo, una banda descrita como más distal a otra indica que está más lejos del centrómero, lo que también significa que está más cerca
del extremo terminal, en relación con la otra banda. Debido a que la numeración de bandas comienza en el centrómero, una banda distal también tendrá un
número de bandas más alto que una banda más proximal en el mismo brazo cromosómico. El centrómero es tan fundamental para la supervivencia de una
célula que no es de extrañar que los creadores de este lenguaje citogenético utilizaran estas estructuras esenciales como "zona cero", es decir, p10 y q10,
para la numeración de bandas.
8.2.2 Homólogo
Una célula en metafase mitótica normal mostrará veintidós pares de autosomas, es decir, 22 pares de homólogos que coinciden visualmente
(también deletreados homólogos) y dos cromosomas sexuales, en el entendimiento de que la variación heteromórfica (ver 8.8.2, Variaciones
heteromórficas) puede contribuir con algunas diferencias visuales entre cada par coincidente. Asimismo, la discordancia de condensación entre
cromosomas homólogos, que resulta de la replicación asincrónica del par durante la síntesis, se ha informado de hasta un 14% [14], lo que
también puede aumentar las diferencias visuales entre homólogos normales. La única "pareja realmente extraña" son los cromosomas sexuales X
e Y en los machos; sin embargo, también son un par genético, como lo demuestra su asociación única cara a cara durante el cruce en la meiosis
[1, Capítulo 12]. De hecho, un error en esta asociación meiótica puede resultar en la transferencia de laSRY locus de genessex determinante
región de la Y cromosoma) al cromosoma sexual X, lo que lleva a la reversión sexual de los hombres XX y las mujeres XY [15].
pter
pter
Proximal dirección
Distal dirección
Banda 1p22
qter
Figura 8.2 Distal vs. proximal. Las bandas se numeran secuencialmente en undistal dirección; por lo tanto, los números aumentarán a medida
que se alejen del centrómero y se acerquen al extremo terminal de ese mismo brazo. La banda 1p22 es proximal a la banda 1p32, porque está
más cerca del centrómero, pero es distal a la banda 1p13, que está más cerca del centrómero.
Diagrama ISCN del cromosoma humano 1 a nivel de 400 bandas (© 2009 Nicole Chia) utilizado con permiso del artista. reproducido deISCN 2013: Un
sistema internacional de nomenclatura citogenética humana 2013. Shaffer LG, McGowan-Jordan J, Schmid M, eds. Editores S. Karger, Basilea.
362 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
Cada homólogo mitótico, a su vez, está compuesto por dos cromátidas (cht) que se mantienen unidas por el centrómero. Hablando
genéticamente, estas cromátidas son dos cromosomas idénticos que esperan la separación de las células hijas opuestas. Sin embargo, aunque se
mantienen unidas por el centrómero, se las conoce como cromátidas hermanas (sc), y la unidad que crean es el cromosoma en metafase (Figura
8.1).
Tres ayudas citogenéticas, el idiograma, el cariograma y el cariotipo, son herramientas esenciales para identificar a cada homólogo,
comparar sus apariencias y comunicar estos resultados a otros profesionales en el campo. ISCN 2016 (1, sección 2.2.1) recomienda que
el término idiograma se utilice para referirse a la "representación esquemática de un cariotipo". El término cariotipo se refiere al
"complemento cromosómico normal o anormal, constitucional o adquirido de un individuo, tejido o línea celular", y el término
cariograma se usa para hacer referencia a una "matriz sistematizada de los cromosomas preparada mediante dibujo, imágenes
digitalizadas, o por fotografía, con la extensión en el sentido de que los cromosomas de una sola célula pueden tipificar los
cromosomas de un individuo o incluso de una especie ”[1, sección 2.2.1, p. 7]. Debido a que un idioma no puede existir sin un alfabeto,
comenzamos esta trilogía con el idiograma.
8.2.3 Idiograma
El idiograma es la hoja de ruta de nuestro lenguaje genético, una representación esquemática de las bandas que uno esperaría ver en un cromosoma
normal. El informe de la Conferencia de París (1971) [5] introdujo un patrón de identificación único para cada uno de los 24 cromosomas somáticos humanos
distintos mediante el uso de bandas Q de replicación tardía, ricas en AT y teñidas intensamente (reveladas mediante fluorescencia usandoqtinción de
mostaza uinacrina) y bandas G (producidas por digestión con tripsina y teñidas con GRAMOiemsa o tinción de color similar), junto con rbandas R continuas
para verificar las bandas de luz G ricas en CG, replicación temprana, ricas en genes [1, secciones 2.3.1,
2.5]. Este nuevo nivel de definición proporcionó a los genetistas no solo la capacidad de señalar la ubicación de una ruptura y comparar los
efectos del gen o los genes en esa región con el cuadro clínico, sino también la capacidad de explicar esa información a cualquier persona del
entorno. mundo.
Las regiones y bandas de los hitos originales siguieron un patrón de numeración específico para todos los cromosomas (ver Figura 8.3). Las
áreas sombreadas dentro de los brazos pyq se numeraron secuencialmente en una dirección distal, moviéndose desde el centrómero (p10 o q10)
hasta sus respectivos extremos terminales (pter y qter). Estas regiones históricas originales (es decir, el primer dígito de una notación de banda,
p. Ej., Q1) cambiaron en el borde proximal de una banda G intensamente teñida. Las bandas de referencia, o el segundo dígito de la notación de
banda (por ejemplo, q11), a su vez, aumentaron en la interfaz del sombreado intermedio dentro de su región de referencia. A medida que
mejoraba la resolución, las bandas de puntos de referencia se diferenciaban aún más. Estos se convirtieron en subbandas, que se numeraron de
manera similar después de un “punto” decimal (como se pronuncia), por ejemplo, 17p11.2 (ver Figura 8.4).ISCN 2016 [1, capítulo 19].
ISCN 2016 [1, Figura 5] define cinco idiogramas de nivel de banda para cada cromosoma: en las bandas 300, 400, 550, 700 y 850.
resoluciones. Estos niveles representan el número total estimado de bandas visibles que se pueden ver en varias etapas del ciclo mitótico, y las
que están en profase muestran la definición más alta (es decir, nivel de 850 bandas). Algunos cromosomas profase pueden incluso revelar sub-
bandas más allá de la definición de 850 bandas (ver Figura 8.5), pero para propósitos prácticos, los niveles de 550 a 850 bandas se consideran
suficientes para el análisis citogenético [1, sección 2.4]. Debido a que cada brazo cromosómico está numerado secuencialmente desde el
centrómero hasta el extremo terminal, los números por sí mismos no son únicos, incluso entre los brazos pyq del mismo cromosoma; por lo
tanto, el brazo siempre se incluye en una notación de banda, por ejemplo, q11, y el número de cromosoma, por ejemplo, 7q11, puede preceder al
brazo, si es necesario para mayor claridad.
8.2.4 Cariograma
Un cariograma es la alineación pictórica de los 22 pares de autosomas homólogos de una célula en metafase, numerados
secuencialmente del 1 al 22 (de mayor a menor) por sus patrones de bandas únicos, y los dos cromosomas sexuales, XX (hembra) o XY
(macho) (1, sección 2.2.1). La alineación de los homólogos normales se centra con el centrómero para que las bandas se puedan
comparar por igual entre los dos brazos del par homólogo. Sin embargo, algunas reordenaciones pueden beneficiarse visualmente de
una alineación alternativa. Por lo tanto, la convención del laboratorio determina en última instancia la ubicación y orientación del
cariograma.
Los reordenamientos generalmente se colocan en el cariograma según el origen de su centrómero (Figura 8.6). Ciertos reordenamientos, sin
embargo, especialmente los reordenamientos de todo el brazo (ver Figura 8.7), no pueden distinguir qué socio retuvo su centrómero; por lo
tanto, la ubicación del cariograma dependerá de otros factores, por ejemplo, qué brazo está involucrado (p antes de q) y qué cromosoma
involucrado tiene la mayor prioridad de orden de cariotipo, generalmente, X antes de Y antes del autosoma en orden numérico creciente. Las
estructuras no identificables, por ejemplo, marcadores y anillos céntricos (véase 8.7, Símbolos de incertidumbre), se colocan en una sección
separada del cariograma; por ejemplo, algunos sistemas analíticos de software usarán una fila adicional debajo de los autosomas en el
cariograma para estas estructuras.
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 363
22
región p2 21
intensamente
tinción
p2 p22
borde proximal p21
p15.3
p15.2
15
p15.1 Cromosoma
dirección distal
14 p1 p14
Brazo
Región de referencia
13 Banda de referencia
p13
Subbanda
12 p12
Nivel dentro de la subbanda
región de banda p1 p11.2
11 p10 p11.1
cen q10 1..121
región de banda q1 11,1 qq111
7q11. 21
q11,22
q1 7q11. 22
11,2
dirección distal
q11.23
7q11. 23
proximal q21.1
borde
21 Intensamente
a partir de
tinción q21.2
región q2 q21.3
q2 q22
22
q31.1
proximal
q31.2
borde
31 Intensamente q31.3
a partir de tinción
región q3
q32
32
q3 q33
33–35 q34
q35
q36
36
Cromosoma 7
Figura 8.3 Derivación de banda. Los primeros genetistas utilizaron patrones de bandas G y Q para identificar 86 regiones de tinción, 66 de las cuales
estaban marcadas por bandas teñidas intensamente. estos segmentos intensos subdividieron un brazo cromosómico en regiones "emblemáticas", que
todavía es hoy el primer dígito del número de banda después de la designación del brazo. En esta figura, el cromosoma 7 tiene una región de tinción
intensa en el brazo corto, que dividirá el brazo p en regiones p1 y p2. el brazo largo muestra dos bandas intensas, formando así tres regiones (q1, q2,
q3) [1, tabla 3]. La banda 7q11.2 demuestra el desglose de una subbanda en tres niveles de banda adicionales: q11.21, q11.22 y q11.23 en el nivel de
550 bandas para este cromosoma. Consulte el inserto para ver la representación del color de esta figura.
Diagrama ISCN del cromosoma 7 humano a nivel de bandas 300 y 550 (© 2009 Nicole Chia) utilizado con permiso del artista. reproducido deISCN 2013:
Un sistema internacional de nomenclatura citogenética humana 2013. Shaffer LG, McGowan-Jordan J, Schmid M, eds. Editores S. Karger, Basilea.
17pag11.2
Figura 8.4 Notación de banda. Al leer una notación de banda, cada dígito después del número de cromosoma (o letra) se pronuncia por separado
para enfatizar su independencia numérica, por ejemplo, "diecisiete, p, uno, uno, punto, dos". El brazo del cromosoma siempre se incluye en una
notación de banda; El número de cromosomas se utiliza cuando se necesita aclaración.
Históricamente hablando, el cariograma no siempre fue tan informativo como lo es hoy. Para la década de 1960, las técnicas de
bandas aún no eran un protocolo estándar y la tinción sólida revelaba detalles mínimos. Cualquiera que haya trabajado con
cromosomas sin bandas puede apreciar la limitación obvia de estos primeros cariogramas (que en ese momento se llamaban
cariotipos). Los homólogos sin bandas se emparejaron por tamaño y posición de centrómero similar en siete grupos autosómicos, A –
G, y dos cromosomas sexuales, X e Y, pero su identidad precisa dentro de cada grupo fue una conjetura, excepto para el A (cromosomas
1-3) y los grupos E (cromosomas 16-18), que tienen diferencias más exageradas en las posiciones del centrómero. La selección del
cromosoma sexual X también fue un desafío sin la ayuda de patrones de bandas visuales,
364 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
Figura 8.5 Determinación de niveles de banda. Para determinar el nivel de la banda para el análisis, las subbandas se comparan con el idiograma. El
cromosoma 10 debe mostrar la banda q22.2 para verificar que se alcanzó el nivel de 550 bandas y la banda p12.32 para alcanzar el nivel de 850 bandas
(alta resolución). La definición de tono adicional en todo este cromosoma en el nivel de 850 bandas demuestra que a veces se puede lograr un mayor
nivel de resolución.
Diagramas ISCN del cromosoma humano 10 a niveles de 300, 400, 550, 700 y 850 bandas (© 2009 Nicole Chia) utilizados con permiso del artista. reproducido de
ISCN 2013: Un sistema internacional de nomenclatura citogenética humana 2013. Shaffer LG, McGowan-Jordan J, Schmid M, eds. Editores S. Karger, Basilea.
De hecho, no era raro en aquellos días distinguir el sexo por el número de cromosomas de los grupos C y G que estaban presentes, por
ejemplo, 15 del grupo C y cinco del grupo G eran hombres; 16 del grupo C y cuatro del grupo G eran mujeres.
Esta confianza en la suposición condujo a un dilema interesante después del descubrimiento de las bandas, cuando los genetistas
descubrieron que el autosoma del grupo G más pequeño, por definición el cromosoma 22, era en realidad responsable del síndrome de Down. El
nombre del síndrome ya se estableció como Trisomía 21; por lo tanto, se cambiaron los números de cromosomas y la ubicación en el cariograma,
en lugar de cambiar el nombre del síndrome. Por lo tanto, el cromosoma 21 sigue siendo hoy en día el autosoma humano más pequeño.
[16], y también el único autosoma (en su forma normal y excluyendo los polimorfismos normales) dentro del cariograma humano que
es más pequeño que su cromosoma sucesivo.
Pasamos ahora al último segmento de nuestra trilogía y al resto de nuestro capítulo: el cariotipo.
8.3 Cariotipo
El lenguaje único de la citogenética que traduce lo que se observa analíticamente de múltiples células de un espécimen en una cadena de
símbolos alfanuméricos entendidos universalmente es el cariotipo. En otras palabras, el cariotipo es para la constitución cromosómica como el
grupo sanguíneo es para la sangre; es una forma para que los genetistas expliquen la composición cromosómica en fórmulas breves y
simbólicas. Por tanto, se considera una de las herramientas de comunicación más importantes de nuestro campo. Un cariotipo humano normal
incluye el número total de cromosomas céntricos por célula y el complemento sexual, es decir, 46, XX (mujer normal) o 46, XY (normal
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 365
1 2 3 4 5
6 7 8 9 10 11 12
13 14 15 dieciséis 17 18
19 20 21 22 X Y
Figura 8.6 cariograma anormal. Los cromosomas de una célula se emparejan en un cariograma mediante patrones de bandas en 22 grupos
autosómicos (1 a 22) y dos cromosomas sexuales (X e Y). En términos generales, los cromosomas están alineados en el centrómero; sin embargo,
algunas inversiones pericéntricas pueden compararse más fácilmente si se alinean por sus extremos terminales. se usa una flecha para señalar
cualquier estructura anormal, que en este cariograma es un isocromosoma adicional para los brazos cortos del cromosoma 12.
masculino), separados por coma, sin espacios. No es necesaria una descripción adicional a menos que haya ocurrido un cambio notificable (ver
8.8, Aleatorio versus notificable).
El lector también debe tener en cuenta que la definición de "normal" en términos citogenéticos está limitada por la resolución en la que se
puede visualizar un cambio; para la citogenética de rutina, esto se traduce en un tamaño de banda de aproximadamente 5-10 megabases (Mb) de
ADN [1, sección 2.5]. Por lo tanto, no todos los cariogramas de apariencia "normal" son genéticamente normales, pero se consideran normales al
nivel de detección que puede proporcionar el análisis cromosómico de rutina.
Excluyendo aquellos eventos que califican el recuento de cromosomas de un cariotipo (ver más adelante), el número total de estructuras clonales,
independientes y céntricas en una célula o línea celular es generalmente el primer elemento descrito en un cariotipo, seguido de una coma y el
complemento de cromosomas sexuales. Las ganancias o pérdidas aleatorias, no clonales de estructuras céntricas, o la presencia de fragmentos
acéntricos, no cambiarán el recuento, ni se describirán en el cariotipo, a menos que cumplan con los estándares notificables (ver 8.8, Aleatorio
versus notificable). El reemplazo de un homólogo normal con una copia reordenada del mismo cromosoma tampoco cambiará el recuento, ni el
cariotipo mostrará ninguna pérdida o ganancia, aparte de lo que se puede interpretar a partir de la descripción del cariotipo de su reemplazo
anormal. "Cuando los cromosomas normales son reemplazados por cromosomas estructuralmente alterados, las normales no deben registrarse
como perdidas ". [1, sección 9.1].
366 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
17 20 17 20
(a) (B)
6 7 8 9 10 11 12
13 14 15 dieciséis 17 18
19 20 21 22 X Y
(C)
Figura 8.7 Colocación de cariograma con translocaciones de todo el brazo. Debido a que cualquiera de los miembros (o ambos) podría haber contribuido
potencialmente con su centrómero en una translocación de todo el brazo (ver 8.6.7, Derivados no acrocéntricos de todo el brazo), el cromosoma con los
brazos cortos de mayor prioridad de orden de cariotipo, es decir, X antes de Y antes de los autosomas en orden numérico ascendente, se colocará
primero en el cariograma. (a) En este reordenamiento del brazo p ‐ a ‐ q entre los cromosomas 17 y 20, el cromosoma que contiene 17p (unido a 20q) se
coloca junto al homólogo normal 17, y su pareja 20p / 17q se coloca junto al homólogo normal del cromosoma
20. (b) Si se produce un reordenamiento del brazo ap ‐ to ‐ p, 17p (unido a 20p) se colocará junto al homólogo normal 17. Su
compañero 17q / 20q se colocará junto al homólogo 20 normal, con la alineación con los dos brazos largos de cromosoma
20. (c) Si uno de los dos compañeros de translocación se pierde, creando una situación de desequilibrio, el reordenamiento se convierte en un
cromosoma derivado y se coloca en el cariograma siguiendo el orden de mayor prioridad de cariotipo, independientemente del brazo
presente. Por ejemplo, si solo está presente el cromosoma derivado 17q / 20p, se colocará junto al homólogo 17 normal, paralelo a los brazos
17q. las flechas apuntarán tanto a la derivaday la posición vacía. el desequilibrio resultante en este cariograma es la pérdida de una copia de
17p y 20q.
Al igual que al equilibrar una ecuación, uno podría esperar que todas las ventajas y desventajas descritas en un cariotipo se sumen al
recuento de cromosomas (por ejemplo, 46 + # ganancias - # pérdidas = recuento de cromosomas), y para la mayoría, lo hace. Por ejemplo, un
+21 descrito en el cariotipo reflejaría una ganancia de un cromosoma: 47, XX, + 21. Sin embargo, no todas las ganancias o pérdidas utilizan un
signo más o menos. Algunos ejemplos son:
■ La ganancia o pérdida de un cromosoma sexual en estudios constitucionales no mostrará un signo más o menos para justificar el recuento de
cromosomas 47, XXY o 45, X (ver 8.4.4, Aneuploidía de cromosomas sexuales).
■ Los minutos dobles no se cuentan pero se informan en el informe final, se describen en el cariotipo sin signos más, y se
incluyen dentro del cariograma (ver 8.7, Símbolos de incertidumbre).
■ Los reordenamientos acrocéntricos “equilibrados” que involucran puntos de ruptura centroméricos tampoco usarán un signo menos, pero nuevamente,
el recuento de 45 cromosomas en el cariotipo aún indicaría la pérdida (ver 8.6.7, Derivado acrocéntrico para una explicación más completa).
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 367
■ Asimismo, un cariotipo compuesto, por definición, combina eventos clonales que se han visto en algunas pero no en todas las
células descritas dentro del compuesto (ver 8.7.10, Cariotipo compuesto); por lo tanto, a menudo está desequilibrado con el
recuento de cromosomas.
Por estas razones, es posible que no siempre funcione la verificación del recuento de cromosomas mediante el equilibrio de la suma de los eventos descritos
sin comprender la naturaleza descriptiva de los eventos que se están contando; por lo tanto, el escritor o lector de cariotipo debe comprender las
excepciones.
Aunque el recuento de cromosomas suele ser el primero en un cariotipo, ciertos eventos que califican este recuento requerirán que
su símbolo se coloque antes del recuento, como en mos para mosaicismo, chi para quimerismo y fin para endorreduplicación. Un
espacio separará el símbolo alfabético del recuento numérico. Los símbolos no alfabéticos, como la línea oblicua doble (//) para clones
quiméricos [1, sección 4.1], que se utiliza en cariotipos de estudios de transfusión de médula ósea donante-receptor, no requerirían un
espacio, por ejemplo, // 46, XY (ver 8.9.1, mosaicismo constitucional, 8.4.1, poliploidía y endorreduplicación, y
8.10.12, quimerismo del trasplante de médula ósea).
Para simplificar nuestra discusión a lo largo de este capítulo, estamos usando el término "evento" para representar cualquier cambio independiente en el
Descripción 46, XX o 46, XY, ya sea numérica o estructural, equilibrada o desequilibrada, intercromosómica o intracromosómica,
adquirida o constitucional, variación anormal o normal, y notificable o no notificable. Los símbolos de eventos pueden ser alfabéticos,
matemáticos y / o gramaticales (ver Tablas 8.1 y 8.2) y deben ir seguidos por el cromosoma o los cromosomas céntricos involucrados en
el evento, si se pueden identificar.
Alfabético Los símbolos son abreviaturas de letras significativas que representan un evento específico. Por lo general, varían de una a cuatro
letras, como en t para translocación (código de una sola letra), cp para compuesto (dos letras), del para eliminación (triplete) e idic para
isodicéntrico (cuatro letras), aunque hay excepciones (ver Tabla 8.1 para obtener una lista de los símbolos alfabéticos que se utilizan en este
capítulo).
Matemático los signos y otros símbolos asociados con la cantidad, incluyen el signo más para una ganancia (+21), menos para una
pérdida (-3), multiplicación (mar×2), sin espacios, para copias múltiples (que solo se usa con descripciones repetidas, estructuralmente
anormales), la línea inclinada (/) como separador para múltiples líneas celulares y clones, y la aproximación o tilde (1 ~ 3 ), sin espacios,
para indicar un rango o valor medio. Por ejemplo, el cariotipo de forma corta para una ganancia numérica de un cromosoma 21
estructuralmente normal (denominado trisDios mío indicando tres copias del mismo “cuerpo” o cromosoma) en una paciente femenina
se escribiría 47, XX, + 21, usando una coma, sin espacios, para separar la anormalidad del complemento sexual. El recuento de
cromosomas también aumentará porque está presente una estructura céntrica adicional. La descripción de las ganancias o pérdidas de
cromosomas sexuales en un cariotipo se maneja de manera diferente en los estudios constitucionales y se discutirá en la sección 8.4,
Eventos numéricos.
El más utilizado gramático el símbolo es la coma. Como se mencionó anteriormente, separa el número total de cromosomas de su
complemento de cromosomas sexuales y separa cada evento descrito (numérico o estructural, balanceado o desequilibrado) dentro de
una cadena de eventos de cariotipo. No se colocan espacios antes o después de cada coma, por ejemplo, 47, XX, + 21 y debido a que la
coma indica continuación, nunca termina el cariotipo.
Otro signo gramatical de uso común es el paréntesis, que generalmente, pero no siempre, se usa en dos conjuntos contiguos, por
ejemplo, del (16) (p13.1), sin espacios intermedios ni puntuación. Este formato mantiene el (los) cromosoma (s) del evento y los
respectivos puntos de ruptura separados pero conectados entre sí.
Otros símbolos gramaticales incluyen el punto y coma (;) cuando se separan diferentes cromosomas y sus respectivos puntos de
ruptura entre paréntesis contiguos; el signo de interrogación (?) cuando una estructura no es identificable, o el punto de ruptura
preciso no es seguro; y el período (.ish) en el que se informa más de un método en el mismo cariotipo. Este período no debe
confundirse con el “punto” decimal que precede a la notación de subbanda descrita en 8.2.3, Idiograma.
Los eventos estructurales involucran la rotura de cromosomas. Una rotura de cromosomas (chrb), también conocida comoisolocus o
isocroma tid ruptura, se define como "discontinuidad en el mismo locus en ambas cromátidas de un solo cromosoma" [1, sección
10.2.1]. La definición de un cambio estructural en el cariotipo de forma abreviada incluye el símbolo del evento, los cromosomas involucrados y
los puntos de ruptura involucrados. Roturas de cromosomasmayo convertirse en notificables si el mismo evento se observa en más de una celda
(ver 8.8, Aleatorio versus notificable). Un espacio (g), por otro lado, es una “región que no mancha (lesión acromática)” en un brazo de cromátida
hermana (chtg) [1, sección 10.2.1]. Los espacios (chtg y chrg) y las roturas de cromátidas (chtb) son
368 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
Cuadro 8.1 símbolos alfabéticos. Esta tabla proporciona una lista de los símbolos seleccionados que se utilizan en este capítulo.
Símbolo Explicación
as fragmento acéntrico
amperio amplificado
arr formación
C anomalía constitucional
cen centrómero
chi quimera, que contiene más de una línea celular constitucional de más de un cigoto
cp compuesto
Connecticut cromotripsis
del supresión
dic dicéntrico
dn de novo
fin endorreduplicación
I isocromosoma
ídem utilizado en subclones neoplásicos para indicar la presencia de aberraciones previamente definidas en el clon más
básico mencionado en primer lugar (línea madre); las variaciones adicionales siguen la coma después del ídem
idico isodicéntrico
Cª incompleto
inh heredado
En s inserción
inv invertido
mos mosaico, que contiene más de una línea celular constitucional (de un cigoto) número
Símbolo Explicación
psu dic pseudodicéntrico, es decir, cuando un centrómero en un cromosoma dicéntrico está inactivo
psu idic pseudoisodicéntrico, cuando un isocromosoma se forma por una ruptura dentro del brazo opuesto, no
en p10 o q10 y un centrómero está inactivo
q brazo largo
qdp cuadriplicado
rea recombinante
robar translocación robertsoniana o de todo el brazo entre dos acrocéntricos en cariotipos constitucionales solamente
s satélite
sdl hermanas
sep separación de las señales FISh del locus adyacente como resultado de la reordenación de la
t translocación
tr trirradial
trc tricéntrico
trp triplicado
generalmente considerado como un subproducto del procesamiento cultural, especialmente si el cultivo ha sido tratado con
reactivos para mejorar la calidad de la resolución, por ejemplo, 5-bromo-2′ -desoxiuridina. Las ocurrencias aleatorias no se
incluyen en un cariotipo, pero se registrarían en los estudios de rotura. Este capítulo no discute los requisitos para calificar y
documentar sitios frágiles, roturas y estudios de exposición clastogénica; por lo tanto, el lector debe consultar el Capítulo 10 en
ISCN 2016 [1].
Seleccionar el punto de ruptura preciso de un evento estructural no es difícil cuando la ruptura ocurre dentro de una banda: simplemente es
esa banda. En la Figura 8.8, por ejemplo, el cromosoma más a la izquierda muestra una ruptura de cromátida (chtb) claramente dentro de la
banda 16p13.1. El desafío comienza cuando aparece la ruptura en el límite entre dos bandas. La regla general es elegir la másdistal band [1,
sección 4.2], pero cuando cualquiera de las posiciones puede ser un candidato probable, se puede usar el símbolo “o”, por ejemplo, del (16) (p13.1
o p13.2).
La morfología subóptima en algunos tejidos neoplásicos también puede dificultar la capacidad de señalar la banda dentro de una región de
referencia; por lo tanto, también es aceptable usar el número de región, por ejemplo, del (1) (p3), o seguir el número de región con un signo de
interrogación (ver 8.7, Símbolos de incertidumbre), por ejemplo, del (1) ( p3?), lo que indica que la ruptura se produjo dentro de la región histórica
3, pero cualquier localización adicional es incierta [1, sección 4.2].ISCN 2016 También agrega que "los puntos de interrupción dentro del mismo
reordenamiento o cadena de cariotipo pueden estar en diferentes niveles de resolución, lo que refleja la precisión del cariograma". [1, sección
4.2, p. 40]
370 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
Cuadro 8.2 Símbolos no alfabéticos. esta tabla es una lista parcial de los símbolos no alfabéticos utilizados en este capítulo. la lista no incluye
todos los símbolos; por lo tanto, el lector debe consultar el Capítulo 3 enISCN 2016 [1] para una lista más completa
46, XY, del (7) (pter→q32 :) FLECHA → FLECHA indica la región o regiones intermedias entre dos
puntos en el sistema de cariotipo detallado.
46, XY [20] SOPORTES, cuadrados SOPORTES CUADRADOS con recuento de celdas se colocan al final de cada
[20] línea celular cuando existen múltiples líneas, como en mosaico o líneas celulares
quiméricas en cariotipos constitucionales; después del receptor: líneas celulares
de donantes en estudios de trasplantes; después de clones individuales; al final
de todos los cariotipos neoplásicos (citogenéticos y FISh); y, opcionalmente,
siguiendo eventos individuales relevantes dentro de un cariotipo compuesto.
46, XY, del (7) (pter→q32 :) COLON, sencillo: COLON SIMPLE indica una ruptura, pero no un reenganche en la
descripción detallada del cariotipo.
46, XX, del (7) (q32), + 21, −22 COMA, lo simple COMA indica continuación y se coloca entre cada
evento independiente o designación de locus en una cadena
de cariotipo. No se utilizan espacios antes o después de la
coma. Por ejemplo:
46, XY, + 21, −22 MENOS y Cuando se coloca antes de un cromosoma o evento dentro de un cariotipo,
MÁS -, +, ++ MÁS o MENOS los signos representan una ganancia o una pérdida,
respectivamente. Estos signos también se pueden utilizar para describir el
tamaño heteromórfico o la intensidad de la tinción colocando el signo
después de la región que se describe. también indicarán la presencia (+),
ausencia (-) o duplicación (++) de un locus cuando se escriban después del
nombre de la sonda objetivo en los cariotipos FISh en metafase.
48, XX, + mar×2 MULTIPLICACIÓN × MULTIPLICACIÓN firmar (×2) indica el número de copias idénticas. Se
usa con mayor frecuencia en cariotipos de hibridación para reflejar el
número de señales observadas por sonda, pero también es útil cuando se
escriben copias duplicadas de un evento estructural. Estáno, sin
embargo, se utiliza para la aneuploidía de cromosomas estructuralmente
normales.
46, XX, del (7) (q32) PADRES () PADRES (simple o adyacente) mantienen los elementos
asociados con un evento juntos como una unidad o conjunto.
46, XY, del (17) (p11.2p11.2) .ish PERÍODO . PERÍODO (no confundir con la subbanda "punto") se utiliza
para separar diferentes tipos de pruebas, por ejemplo,
46, [Link] con metafase FISh, 46, [Link] ish con FISh nuclear y
46, [Link] con microarrays. Algunos llaman a esto un "punto".
22q12.1 PUNTO . los PUNTO (no debe confundirse con el 'período' anterior)
delimita el nivel de la subbanda de la banda y la región
histórica (ver Figura 8.7).
46, XY, t (7;?) (Q22 ;?) MARCO DE PREGUNTA? MARCO DE PREGUNTA (?) indica incertidumbre. Los signos de
interrogación deben colocarse directamente antes del valor real en
cuestión (ver 8.7, Símbolos de incertidumbre). Las derivadas con
origen céntrico desconocido también usarán? como su identidad, y
aparecerá al final del cariotipo, antes de anillos, marcadores y
minutos dobles.
t (7; 14) (q22; q32) SEMICOLON; PUNTO Y COMA separa más de un cromosoma en un
reordenamiento específico, y sus respectivos puntos de ruptura en
un segundo conjunto de paréntesis contiguo.
46, XY [3] // 46, XX [17] LÍNEA INCLINADA, doble // SOLIDUS DOBLE (dos líneas inclinadas hacia adelante) se utiliza para
separar líneas celulares quiméricas y cariotipos de trasplante de médula de
receptor // donante.
mos 47, XX, + 21 [15] / 46, XX [5] LÍNEA INCLINADA, simple / SOLIDUS ÚNICO (línea inclinada hacia adelante única) separa
múltiples líneas celulares (constitucionales) o clones (neoplásicos) y,
por lo tanto, aparecerá junto con mos y chi en cariotipos
constitucionales (que se muestran en el ejemplo). También se utiliza
en cariotipos FISh para indicar loci contiguos.
47 ~ 50, XY, + 1 ~ 4mar [cp20] TILDA ~ TILDA El signo representa un rango, como en un rango de recuento de
cromosomas (47 ~ 50,), una presencia variable (+1 ~ 4mar), o ubicaciones de
puntos de interrupción igualmente potenciales (p11 ~ 22).
47, XY, + der (1)t (1;1) (p36,3; q21) SUBRAYO 1 SUBRAYAR debajo de un número se distingue un homólogo del otro,
como cuando los homólogos están involucrados en el mismo o en
eventos idénticos; esto permite rastrear las líneas laterales sin
ambigüedad.
as
13,3
13,2
13,3
13,2
13,1 13,1
12 12
11,2 11,2
11,1 11,1
11,1 11,1
11,2 11,2
12-13 12-13
12-23 21-23
24 24
Figura 8.8 Cromátida versus rotura de cromosomas. una ruptura de cromátida (chtb) muestra la discontinuidad completa de una sección del brazo, pero su
cromátida hermana permanece intacta. una ruptura de cromosomas (chrb) involucra a ambas cromátidas hermanas. Debido a que el fragmento no tiene
centrómero (as), se perderá, dejando el cromosoma 16 eliminado en generaciones posteriores.
Diagrama ISCN del cromosoma 16 humano a nivel de 300 bandas (© 2009 Nicole Chia) utilizado con permiso del artista. reproducido deISCN 2013: Un
sistema internacional de nomenclatura citogenética humana 2013. Shaffer LG, McGowan-Jordan J, Schmid M, eds. Editores S. Karger, Basilea.
372 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
Aunque los espacios NO se utilizan generalmente en una cadena de eventos de cariotipo, existen condiciones especiales en las que se requiere un espacio:
■ un símbolo alfabético que sigue a otro símbolo alfabético (símbolos duales) estará separado por un espacio, por ejemplo, psu dic
para pseudodicéntrico [1, sección 9.2.4] o mar mat para un cromosoma marcador de origen cromosómico desconocido que ha sido
heredado del madre [1, sección 4.1];
■ un símbolo alfabético que precede a un número entero será seguido por un espacio, por ejemplo, cuando el símbolo del mosaico (mos) debe
usarse para indicar un cariotipo con más de una línea celular constitucional de un solo cigoto, por ejemplo, mos 46 [1, sección 4.1];
■ aparecerá un espacio antes y después del símbolo o (ver 8.7, Símbolos de incertidumbre), por ejemplo, (p13or q13) [1, sección 5.3];
■ los símbolos con (conectados) y sep (separados) también usan un espacio antes y después del símbolo. Estos símbolos se utilizan cuando se
describe un cambio de posición en el patrón de señal normal en ciertas estrategias de interfase FISH, por ejemplo, (ABL1 con BCRx1) o (5′
CBFB 3 de septiembre′CBFBx1) (ver 8.10.8, Cariotipo de fusión en interfase y 8.10.9, Estrategia de sonda de ruptura) [1, sección 13.3.2].
Se puede encontrar una lista selecta de símbolos en las Tablas 8.1 y 8.2. Para obtener una lista más completa, se remite al lectorISCN 2016
[1, Capítulo 3].
La forma de cariotipo más familiar utilizada en publicaciones, informes clínicos y pruebas de aptitud es el sistema corto, que se centra
en el evento y sus puntos críticos. Define los cambios numéricos y estructurales notificables respondiendo a tres preguntas: qué evento
ha ocurrido, qué cromosoma (s) céntrico (s) está involucrado y dónde ocurrió el cambio, cuando es estructural, a través de la notación
de brazo (s) y punto (s) de ruptura. Las variaciones entre las fórmulas de cariotipo (ver Figura 8.9) para el cariotipo de forma corta
dependerán de cuántas rupturas hayan involucrado cuántos cromosomas.
La fórmula de sistema corto más simple implica solo una ruptura (conocida) en un cromosoma, por ejemplo, evento (cromosoma)
(armbreakpoint), sin espacios ni puntuación. Debido a que involucra solo un cromosoma, es un evento intracromosómico.
La figura 8.10 demuestra esta supuesta eliminación de terminal causada por una sola ruptura. El segmento acéntrico (as) desde la banda 2q35
hasta el extremo terminal del brazo largo (q) (2qter) del cromosoma 2 se pierde (se elimina).
Los eventos que utilizarán esta fórmula de cariotipo corto incluyen deleciones terminales, isocromosomas, isodicentrías, fisiones céntricas (no
incluidas en este capítulo), sitios frágiles, material adicional y material de tinción homogénea (ver 8.5, Eventos estructurales).
Intracromosómico
Intercromosómico
Figura 8.9 Fórmulas de cariotipo de forma corta. La mayoría de los cariotipos se escriben con una de estas cuatro fórmulas básicas, según la cantidad de
cromosomas y puntos de corte involucrados. no hay espacios en estas fórmulas.
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 373
Normal
Homólogo
dieciséis
25,3
25,1
11,2
11,1
11,1
11,2
14,1
14,2
14.3
21,1
21,2
21,3
24,1
24,2
24,3
32,1
32,2
32,3
37,1
37,2
24
23
22
21
15
14
13
12
12
13
31
33
34
36
22
23
37,3
ROTURA 35
q35 :)
35
36
37,1
Cariotipo del sistema detallado pinta la imagen a través de una descripción simbólica
37,2
37,3
Acéntrico (as)
46, XY, del (2) (pter q35 :) el fragmento se pierde
Figura 8.10 eliminación terminal. este idiograma de una deleción terminal de una ruptura demuestra cómo la pérdida de un pequeño segmento
terminal del brazo largo del cromosoma 2 se escribe tanto por el método del cariotipo corto como por el detallado.
Diagrama ISCN de los cromosomas humanos 2 en el nivel de 550 bandas (© 2009 Nicole Chia) utilizado con permiso del artista. reproducido deISCN 2013: Un
sistema internacional de nomenclatura citogenética humana 2013. Shaffer LG, McGowan-Jordan J, Schmid M, eds. Editores S. Karger, Basilea.
Cuando ocurren dos roturas dentro del mismo cromosoma y los extremos terminales no están involucrados, se ha producido un evento intersticial. El
cariotipo para este evento intracromosómico simplemente agregaría un segundo punto de ruptura a la fórmula de una sola ruptura, por ejemplo,
evento (cromosoma) (armbreakpointarmbreakpoint). Nuevamente, no se usa puntuación, porque involucra el mismo cromosoma. El orden en el que se
enumeran los puntos de interrupción depende de qué brazos se vean afectados. Las rupturas que ocurren en brazos opuestos, como las que se encuentran
en algunas inversiones, enumerarán los puntos de ruptura enbrazo p antes brazo q orden, por ejemplo, evento (cromosoma) (pbreak-pointqbreakpoint). Los
puntos de interrupción que ocurren dentro del mismo brazo, por ejemplo, el evento (cromosoma) (qbreakpointqbreakpoint) aparecerá enproximal al orden
distal relativo al centrómero.
Los eventos que utilizarán la fórmula intracromosómica de dos rupturas incluyen deleciones intersticiales, duplicaciones, cuadruplicaciones,
microdeleciones, microduplicaciones, inversiones y anillos.
Cuando dos cromosomas céntricos están involucrados en un reordenamiento, es decir, intercromosómico, se agregará un segundo
conjunto de cromosomas a la fórmula básica, con punto y coma separando las dos entidades cromosómicas, por ejemplo, evento
(cromosoma; cromosoma) (punto de ruptura del brazo; punto de ruptura del brazo). El orden en el que se escriben los cromosomas
generalmente seguirá la prioridad de orden de cariotipo estándar, es decir, X antes de Y antes del número autosómico ascendente (ver
8.3.7, Prioridad de orden de cariotipo). Los dos puntos de ruptura diferentes, que están separados por un punto y coma en el segundo
paréntesis, deben colocarse en el mismo orden que sus cromosomas asociados en el primer paréntesis.
Los eventos que utilizarán el cariotipo intercromosómico de dos rupturas incluyen dicéntricos, anillos, asociaciones teloméricas, translocaciones y
derivados acrocéntricos (consulte 8.5, Eventos estructurales y 8.6, Cromosomas derivados).
Estas tres fórmulas básicas describirán la mayoría de los eventos constitucionales informados por el análisis citogenético. Incluso el
cromosoma derivado que se deriva de un evento anterior incluirá estas fórmulas cuando pertenezca a su evento originario. La inserción
es el único evento que tiene su propia fórmula única y prioridad de cariotipo, ya que requiere al menos tres puntos de ruptura: uno
para recibir el material insertado y dos para liberar el segmento de su posición original (ver 8.5.4, Inserción ).
Algunos reordenamientos neoplásicos pueden resultar bastante difíciles de describir. La dirección web en [Link]
OnlineAnalysis / [Link] proporciona una herramienta que creará un idiograma a partir de la descripción del cariotipo, que puede
ayudar a verificar que la descripción escrita coincide con lo que se observa visualmente [17].
Una eliminación terminal, como su nombre lo indica, comenzará o finalizará su descripción detallada con el símbolo de interrupción de dos
puntos simples (:), según el brazo involucrado.
Una eliminación intersticial utiliza dos puntos dobles (: :) en el cariotipo detallado para indicar dónde se reunieron los dos puntos de interrupción,
con el segmento intersticial eliminado. El orden enumerado para el formato de cariotipo detallado sigue en ap→q dirección.
Cuando se involucran dos o más cromosomas diferentes en el mismo evento, cada cromosoma se describe de forma independiente, separado del siguiente
cromosoma por un punto y coma, sin espacios, y se enumera en orden de prioridad de cariotipo: X antes de Y antes de un número automático ascendente
(ver Orden de cariotipo prioridad siguiente). Todas las rupturas y cambios desde el extremo p terminal hasta el extremo q terminal se definirían dentro de
cada cromosoma. Más adelante en este capítulo se muestran ejemplos.
La prioridad estándar para determinar el primer cromosoma en un evento de dos cromosomas es X antes de Y antes de los autosomas en orden
numérico ascendente (Figura 8.11). Por ejemplo, una translocación entre los cromosomas 2 y 16, p. Ej., T (2;16) (q35; q24), enumerará el
cromosoma 2 antes del cromosoma 16. Este cromosoma en la primera lista también determinará el orden de ubicación dentro de una cadena de
eventos en un cariotipo, por ejemplo, 47, XX, t (2;16) (q35; q24), +12. Comas, sin espacios, separan cada evento independiente dentro de la
cadena. Debido a que los cromosomas sexuales se manejan de manera diferente (ver 8.4.4, Aneuploidía de los cromosomas sexuales), usaremos
autosomas para demostrar la construcción de una serie de eventos.
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 375
Figura 8.11 Prioridad de orden de cariotipo. la ubicación de los eventos que se describen en un cariotipo sigue un orden de prioridad específico.
* Ver discusión en 8.3.8, descripción repetida.
La prioridad de orden para describir un cariotipo con múltiples eventos que involucran homólogos es la siguiente:
1. Numérico antes que estructural, es decir, la ganancia o pérdida (+ o -) de homólogos estructuralmente normales (eventos numéricos) se enumeran
antes de los homólogos estructuralmente anormales que son el único cromosoma o el primer cromosoma en sus eventos, por ejemplo,
+ 12,t (12; 16) (q13; q24). El cromosoma 12 adicional, sin embargo, no precedería al evento si su homólogo es el segundo
cromosoma de la lista, por ejemplo, t (9;12) (q13; q13), +12. La clave de esta regla es que los elementos adicionales o faltantes
homólogo (s) debe ser estructuralmente normal y que lo estructuralmente anormal homólogo (s) debe ser el único o primero en la lista
cromosoma de su evento.
2. Alfabéticamente por símbolo, por ejemplo, +12, del (12) (q13),inv (12) (p13q22). Debido a que ambos eventos involucran homólogos, el
símbolo de eliminación cae alfabéticamente antes del símbolo de inversión (inv); por lo tanto, el orden del cariotipo enumera primero la
ganancia numérica del cromosoma 12, luego la deleción y luego las descripciones de inversión. Nota: Si ocurren múltiples eventos dentro de
un solo homólogo, consulte 8.6, Cromosoma derivado.
3. Cuando el símbolo del evento y el número de cromosoma son iguales, la prioridad pasa a brazo p antes brazo q; por ejemplo, t (9;11) (pag22;
q23),t (9;22) (q34; q11.2).
4. Cuando el símbolo de evento (t), el cromosoma (9) y el brazo (q) son todos iguales, la prioridad se mueve al más proximalq13) punto
de ruptura antes del más distal (q34) uno, por ejemplo, t (9;11) (q13;q23),t (9;22) (q34;q11.2).
Si todos estos parámetros son iguales, la prioridad pasa al segundo cromosoma de la lista:
5. X antes de Y antes del orden autosómico ascendente, p. Ej., T (9;11) (q13; q23), t (9;22) (q13; q11.2). Si los cromosomas enumerados en segundo lugar
también son homólogos:
6. brazo p antes brazo q. Si el brazo también es el mismo:
7. proximal→orden distal de los puntos de ruptura dentro de ese brazo.
376 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
Las excepciones a estas reglas de cariotipo estándar incluyen las siguientes situaciones:
■ Cambios numéricos o estructurales en los cromosomas sexuales constitucionales (ver 8.4.4, Aneuploidía de los cromosomas sexuales);
■ Eventos que reservan la posición de la primera lista para un propósito específico (ver 8.5.4, Inserción);
■ Un evento que involucra múltiples cromosomas (ver 8.5.12, Translocación multicromosómica);
■ Un evento reordenado con más de un centrómero, pero solo un centrómero está activo (ver 8.5.2, Pseudodicentric y
8.6.6, Derivado del anillo que involucra más de un cromosoma);
■ Reordenamientos donde el origen del centrómero no es identificable (ver 8.7, Símbolos de incertidumbre);
■ Derivados de eventos múltiples que usan pter→orden qter (ver 8.6.4, Derivada de eventos múltiples) [1, Capítulo 6].
Una vez que se hayan descrito todos los eventos autosómicos, se enumerarán los símbolos de incertidumbre, si están presentes (ver 8.7,
Símbolos de incertidumbre). El sistema detallado también se puede utilizar como sustituto o en conjunto con el sistema corto para estos
retamamentos, como se indica enISCN 2016: "Es aceptable combinar el sistema corto (4.3.1) y el sistema detallado (4.3.2) para designar cariotipos
complejos". [1, sección 9.2.3, p. sesenta y cinco]
El recuento total de células entre corchetes [20] finalizará toda la cadena de eventos de cariotipo para todos los cariotipos neoplásicos, normales o anormales (ver
8.7.10, Cariotipo compuesto para una excepción), y después de cada línea celular en estudios constitucionales con múltiples líneas celulares.
En resumen, una serie de eventos de cariotipo neoplásico, multieventos, utilizando algunos de los ejemplos de esta sección, podría verse así:
48, XY, del (2) (q35), t (2; 16) (q35; q24), t (9; 11) (q13; q23), t (9; 22) (q34; q11.2), + 12, + del (12) (q13) [20]
48, XY: El recuento de cromosomas ahora es 48 porque hay dos cromosomas adicionales, +12 y + del (12) (q13). Con estos cromosomas
adicionales, el número total de entidades céntricas es 48. Los eventos restantes son estructurales; sin un signo más, el lector debe asumir que
han reemplazado a sus homólogos céntricos normales. Debido a que estos eventos afectan solo a los autosomas, se enumeran en orden
numérico por suúnico or cromosoma en primer lugar, por ejemplo, el cromosoma 2 como el cromosoma único o el primer cromosoma se
describirá antes de todos los eventos que involucren a los cromosomas 9 y 12 como el cromosoma único o el primer cromosoma.
del (2) (q35),t (2;16) (q35; q24): Sin signos más (+), el lector debe asumir que estos dos eventos han involucrado y, por lo tanto, han
reemplazado a ambos homólogos normales de los cromosomas 2. Debido a que estos dos eventos autosómicos involucran el mismo
cromosoma único o el primero en la lista, la ubicación de su cariotipo seguirá el orden alfabético por símbolos de evento; por lo tanto,Del
eción se describirá antes treubicación. Ambos cromosomas céntricos se enumeran en el primer paréntesis del evento de translocación, lo que
indica que ambos socios enumerados (cromosoma 2 y 16) están presentes y son estructuralmente anormales. El cariograma usará flechas
para indicar los tres cromosomas afectados: el homólogo 2 eliminado, el homólogo 2 translocado y el homólogo 16 translocado.
t (9;11) (q13;q23),t (9;22) (q34;q11.2): siguiendo un orden autosómico numérico, los eventos que involucran al cromosoma 9 como único o
cromosoma en primer lugar se describirá a continuación. Los eventos homólogos que involucran el mismo brazo cromosómico seguirán el
orden proximal al distal de sus puntos de ruptura; por lo tanto, el evento con un punto de ruptura más proximal (9q13) se describiría antes
que el punto de ruptura más distal (9q34). La omisión de un signo más en ambos eventos estructurales indica que no hay homólogos
normales presentes para ese cromosoma. Nuevamente, la lista de ambos cromosomas céntricos dentro del primer paréntesis del evento
indica que los cromosomas enumerados en segundo lugar (homólogos 11 y 22, respectivamente) también son estructuralmente anormales.
Sus descripciones no necesitan repetirse en el cariotipo, porque pueden asumirse; sin embargo, el cariograma indicará los cuatro socios
involucrados.
+ 12, + del (12) (q13): La ganancia o pérdida (evento numérico) de un cromosoma estructuralmente normal (+12) precede a cualquier evento
estructural que involucre a su homólogo como el único o primero en la lista cromosoma; por lo tanto, el cromosoma 12 adicional, pero
estructuralmente normal, se enumera antes del cromosoma 12 adicional con la deleción. Debido a que ambos eventos están precedidos por
signos más (+), el lector puede asumir que ambos homólogos normales también están presentes. El cariograma mostrará así cuatro
homólogos del cromosoma 12: tres copias estructuralmente normales y un homólogo eliminado.
[20]: Un número entre paréntesis al final de una línea celular o cariotipo indica el número de células analizadas que compartieron este mismo cariotipo.
En este ejemplo, las 20 celdas mostraron el mismo resultado.
no cambia. Cabe señalar que la aparición de dos inversiones idénticas, sin otros homólogos normales, suscita la sospecha
de pérdida de heterocigosidad (LOH) para el cromosoma 12 (véase 8.5.13, Disomía uniparental y pérdida de
heterocigosidad).
Un segundo atajo elimina la repetición de puntos de interrupción cuando se hace referencia a eventos descritos anteriormente en el mismo
cariotipo, siempre que no haya eventos similares que creen ambigüedad (p. ej., mismo evento, cromosoma y punto de ruptura en la primera
lista). Como se indica enISCN 2016: “Cuando hay una copia adicional de un cromosoma reordenado, los puntos de corte se especifican solo una
vez, la primera vez que aparece en el cariotipo” [1, sección 4.2, p. 40]. En el siguiente ejemplo, un homólogo normal del cromosoma
12, junto con dos cromosomas eliminados, están presentes.
En este ejemplo, hay tres copias centroméricas del cromosoma 12: una normal y dos eliminadas. El primer cariotipo
(a) describe el cromosoma 12 normal como la copia adicional, y usa el sufijo × 2 para indicar la presencia de dos copias idénticas
eliminadas del cromosoma 12. El numérico La ganancia del cromosoma 12 normal se describe antes de la estructuralmente
copias anormales, siguiendo el orden de prioridad del cariotipo (como se define arriba). La descripción es simple y no deja
ambigüedad, pero no proporciona información sobre la derivación del evento, porque el homólogo normal del cromosoma
12 no es la causa real del recuento de 47 cromosomas. El segundo ejemplo (b) es aceptable, pero repite el punto de
interrupción innecesariamente. La tercera alternativa (c) muestra un cromosoma eliminado reemplazando un homólogo
normal del cromosoma 12 (por lo tanto, sin signo más), y el cromosoma adicional (+) como una copia duplicada de la
descripción eliminada (por lo tanto, sin puntos de corte). Se asume el homólogo normal no involucrado y, por lo tanto, no se
menciona. Las tres opciones son alternativas aceptables [1, secciones 4.2, 9.3]. El último ejemplo, sin embargo, no solo
representa una clara representación de su formación,
Los cariotipos largos y complicados no son infrecuentes en los estudios neoplásicos, como se demostrará más adelante en este capítulo. ISCN
2016 introdujo una nueva alternativa para describir una serie de eventos, y recomienda usar esta descripción de cariotipo más corta [1, sección 6]
cuando sea posible.
Si los resultados citogenéticos se informaron como normales, pero después de realizar la FISH, se encontró que la muestra tenía una anomalía, se
puede volver a examinar el caso citogenético. Si la anomalía es detectable después de un nuevo examen, el informe puede modificarse. Incluso si
solo una célula mostró el reordenamiento por análisis cromosómico en estudios de rutina, que en ese momento no cumplían con los estándares
clonales informables, el informe ahora puede cambiarse porque el hallazgo ha sido confirmado por FISH. Sin embargo, si la anomalía aún no es
reconocible después de reexaminar los cromosomas, el reordenamiento puede ser críptico y no detectable mediante análisis cromosómico de
rutina; por lo tanto, el cariotipo citogenético no se cambiaría [1, sección 13.1], pero el resultado de FISH debe agregarse a la cadena de cariotipo.
378 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
Cuadro 8.3 Directrices cuasi-ploides. Se han establecido pautas casi ploides para escribir un cariotipo cuando el
rango de ploidía no está claro debido a complicaciones aneuploides. la diferencia entre cada nivel de ploidía es
norte ± 11. Usando el rango diploide, por ejemplo, un recuento de cromosomas que cae entre 35 y 45 se
considera un número hipodiploide, y los rangos de recuento que están entre 47 y 57 son hiperdiploides.
Ploidía # Distancia
Figura 8.12 endorreduplicación. endorreduplicaciónfin) es un derivado poliploide que se produce después de la replicación del ADN, cuando las
cromátidas hermanas no se separan y la célula no se divide (citocinesis), lo que da lugar a cromosomas de cuatro hebras en las etapas posteriores de
profase y metafase.
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 379
Si euploidía representa un múltiplo del conjunto de 23 haploides, entonces aneuploide significa literalmente no euploide, es decir, no un múltiplo
del conjunto de 23; por lo tanto, los recuentos de cromosomas de 45 (2norte–1), 47 (2n +1), 70 (3n +1) y 88 (4norte–4) todos representan ejemplos
de aneuploidía. Si el único cambio en un cariotipo es una ganancia (trisomía) o una pérdida (monosomía) de un autosoma completo
estructuralmente normal, el cariotipo simplemente agregaría una coma después del último cromosoma sexual, seguida de un signo más (+) o
menos (- ) para indicar una ganancia o pérdida, y el número autosoma, todo sin espacios ni paréntesis, por ejemplo, 47, XX, + 21. Más de una
ganancia o pérdida de autosomas estructuralmente normales se enumerarían en orden numérico ascendente en el cariotipo, con una coma que
separa cada evento: 48, XY, + 18, + 21. Un tipo específico de monosomía, la nulisomía (es decir, faltan ambos homólogos), no es un hallazgo
constitucional viable, pero cuando se encuentra en condiciones neoplásicas, se escribiría 44, XX, –21, –21.
A continuación se enumeran tres síndromes constitucionales aneuploides (trisómicos) (consulte el Capítulo 9, Figura 9.2):
Cariotipo constitucional
Los cromosomas sexuales generalmente se enumeran antes de los autosomas (véase 8.5.4, Inserción, para una excepción), pero la forma en que
se escribirán dependerá de si la muestra es un estudio constitucional o neoplásico. Para estudios constitucionales, múltiples copias de
cromosomas sexuales estructuralmente normales se enumeran juntas en X antes del orden Y, independientemente de su cantidad, sin espacios y
sin signos más (+) o menos (-). Los ejemplos de cariotipo de aneuploidía de cromosomas sexuales incluyen los siguientes:
Cariotipo neoplásico
Una diferencia importante entre los cariotipos neoplásicos y los constitucionales es cómo se describe la aneuploidía de los cromosomas sexuales. Cada
ganancia o pérdida de un cromosoma sexual como resultado de una neoplasia, ya sea estructuralmente normal o anormal, se escribe después del
complemento sexual constitucional, usando un signo más o menos. Otra distinción es incluir el recuento de células entre corchetes, sin espacios, al final de
todos los cariotipos neoplásicos, normales o anormales, y siguiendo a cada clon dentro de un cariotipo multiclonal.
45, Y, –X [20]
El cromosoma sexual X faltante como resultado de la neoplasia, visto en las 20 células analizadas de una muestra neoplásica, sigue
la Y normal y usa el signo menos, sin espacios.
380 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
Si se observa una anomalía del cromosoma sexual constitucional conocida en una muestra neoplásica, el cariotipo usará los estándares del
cariotipo constitucional para describir este evento y agregará una minúscula. C, o su origen paterno, estera o palmadita, si se conoce, o
inh si no se conoce, después de su descripción (ver 8.5.8, Origen constitucional).
45, Xc [20]
Los resultados neoplásicos en una muestra de médula ósea de una paciente con síndrome de Turner conocido no muestran
anomalías clonales como resultado de su neoplasia en veinte células analizadas. La descripción sigue reglas constitucionales,
aunque el cariotipo es de tejido neoplásico. La c minúscula verifica que el evento anormal (monosomía para el cromosoma sexual X)
es constitucional.
Una anomalía constitucional, por ejemplo, falta el cromosoma sexual X, no poder se escribiría 45, X, –X [20], que sería la descripción si la
pérdida fuera el resultado de su neoplasia, ni se escribiría 45, X, –Xc, porque el evento debe seguir la convención de cariotipo
constitucional. Los espacios generalmente no se utilizan con elC símbolo a menos que siga a otro símbolo, por ejemplo,
47, XX, +mar c. Incluso si la aneuploidía constitucional es el único hallazgo anormal, el recuento de células entre corchetes se
incluirá al final de un cariotipo neoplásico.
8.4.5 Pseudodiploide
Si euploidía significa literalmente un múltiplo de 23, entonces el cariotipo 46, X, + 21 plantea un dilema interesante. El recuento parece como si
fuera euploide (46), pero la muestra en realidad muestra una ganancia y una pérdida como resultado de dos apariciones aneuploides
independientes, cada una asociada con consecuencias genéticas, es decir, síndrome de Down (+21) agregado al síndrome de Turner ( 45, X).
Aunque el número total es un múltiplo euploide (2norte), la composición cromosómica no contiene un conjunto completo de cromosomas y, por
lo tanto, no es genéticamente equivalente a 2 × 23. Debido a que el valor numérico de ploidía denorte refleja la composición genética contenida
dentro de los 23 pares de cromosomas, no simplemente un recuento, nuestro ejemplo se llama pseudodiploide [1, sección 11.2]. De la misma
forma, el cariotipo 69, XXY, –12, + 21 sería pseudotriploide.
Esta sección presentará el formato de cariotipo breve y detallado para la mayoría de los eventos estructurales. Debido a su complejidad potencial,
las derivadas y los símbolos de incertidumbre se discutirán en sus propias secciones.
La supresión significa una pérdida parcial. Cuando solo se puede identificar un punto de interrupción, sin volver a adjuntarlo posteriormente, se supone que
el extremo del terminal está incluido en la pérdida y el evento se denomina eliminación de terminal.
Eliminación de terminal
Cuando se pierde el lado distal de una rotura, un brazo aparecerá truncado. A menos que el fragmento roto y acéntrico (as) puede
regenerar un centrómero, se perderá.
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 381
En realidad, los telómeros son tan críticos para la estabilidad cromosómica que cuando faltan, los cromosomas a menudo se regeneran o adquieren estas
secuencias repetitivas de nucleótidos de una cromátida hermana, un cromosoma homólogo o no homólogo [18].
Eliminación intersticial
Una eliminación intersticial se crea mediante dos rupturas, donde los dos bordes rotos se vuelven a unir y el segmento acéntrico intermedio se
pierde.
Microdeleción
El análisis citogenético de rutina está limitado por el tamaño en el que se puede detectar una anomalía, aproximadamente de 5 a 10 Mb [1,
sección 2.5], con una resolución más alta que extiende este rango a 3 ~ 5 Mb [19]. Las supresiones o duplicaciones que caen dentro o por debajo
de los límites inferiores de detección [20-22] se beneficiarían, por tanto, de una selección de objetivos más específica de locus, por ejemplo, FISH
o matrices de base molecular. En el cariotipo de forma abreviada, estos eventos crípticos se denominan microdeleciones o microduplicaciones
(ver 8.5.3, Duplicación) y se describen en el cariotipo mediante una repetición del mismo punto de ruptura como los límites superior e inferior de
la región de ruptura, sin espacios ni puntuación. .
No todos los cromosomas analizados en una célula en metafase estarán exactamente al mismo nivel de resolución al mismo tiempo; por lo tanto,
se debe prestar especial atención a cada cromosoma individual al comparar la composición de la banda y determinar el nivel de banda alcanzado,
especialmente para la evaluación de alta resolución. En cada uno de estos casos de microdeleciones, las presuntas deleciones deben confirmarse
mediante FISH, microarrays o una detección similar basada en moléculas.
por tanto, el nuevo cromosoma dicéntrico muestra dos constricciones primarias. Debido a que ambos centrómeros están presentes en esta
nueva estructura, ambos cromosomas se enumeran en el primer paréntesis; y debido a que ambos centrómeros están activos, su orden
seguirá el orden de cariotipo estándar: X antes de Y antes de los autosomas en orden numérico creciente. Si solo un centrómero está activo
(p. Ej., Solo hay una constricción presente), consulte Pseudodicéntrico, a continuación. Se utiliza un punto y coma, sin espacios, para separar
Califica los dos cromosomas diferentes y sus respectivos puntos de corte.
22,3
22,2
22,1
21,3
21.221.1
15,3
15,2 13,3
15,1 13,2
14.3
14,2 13,1
14,1
13 12
12,3
12,2 11,2
12,1
11,2 11,1
11,1
11,1 11,1
11.21 11,2
11.22 12
21,1 13
11.23 21,2 12
21.31 11,2
21.11 11,1
21.12 21.13 21.32 11,1
21.12 21,33 11.21
21,2 11.22
22
23,1 11.23
21,3 12,1
22,1 23,2 12,2
23,3 12,3
22,2 24
22,3 13,1
31,1
31,2 25,1 13,2
31,32 31,31
25,2 13.31
31,33
25,3 13.32
32,1 13,33
32,2
32,3
33
34
35
36,1
36,2
36,3
Figura 8.13 Microdeleciones. Debido a que la citogenética de rutina no puede detectar anomalías de menos de 3 ~ 5 Mb, las microdeleciones no
siempre se detectan mediante análisis citogenético estándar.
la microdeleción en 17p11.2 para el síndrome de Smith Magenis involucra un segmento que mide 1.5 ~ 9 Mb de longitud, con una media de 5 Mb2, lo que indica
que los tamaños más grandes pueden detectarse potencialmente mediante análisis de alta resolución.
Figura 8.14 Cromosoma dicéntrico. un dicéntrico verdadero mostrará dos constricciones centroméricas. este reordenamiento neoplásico que
involucra a los cromosomas 17 y 20 se observa en pacientes con aML y MDS.
Debido a que la presencia de una inversión no es aparente cuando se usa solo el cariotipo corto para describir triplicaciones y
cuadriplicaciones, el sistema detallado puede ser necesario si se necesita aclarar la orientación [1, secciones 9.2.14, 9.2.19].
30,3
30,2
30,1
35
34,3
34,2
34,1
33
32
31
30,3
22
30,2
21
30,1
35 13
34,3
34,2 12
11
34,1
33 11
11
12
32
31
21
22 22
23
21 24
25
31
13
12 32
11 21
11
22
12 23
24
25
31
21
32
22 21
23 22
24 23
26 24
25
31
31
32 32
41 41
42 42
43
43 44
44
Inserción intracromosómica
Una inserción intracromosómica involucra solo un cromosoma. Se describirán tres puntos de interrupción en el segundo paréntesis, con el punto
de interrupción de recepción primero y los dos últimos colocados en el orden en que se insertaron. No se colocan signos de puntuación ni
espacios entre estos puntos de corte, porque involucran el mismo cromosoma. La posición en la que se inserta el segmento (directo o invertido)
se entiende por su orientación del punto de ruptura (proximal a distal) dentro del cariotipo.
Inserción intercromosómica
Una inserción intercromosómica ocurre cuando un segmento de dos rupturas de un cromosoma (donante) se inserta en una posición de una ruptura de un
segundo cromosoma (receptor). El cromosoma receptor aparece en primer lugar, independientemente de las reglas normales de colocación del cariotipo.
Por lo tanto, esta selección aleatoria anulará la regla para colocar X antes de Y antes del autosoma más bajo [1, secciones
[Link], 9.2.9]. Como en cualquier evento de dos cromosomas, el punto y coma separará las identidades cromosómicas y sus puntos de ruptura,
pero no separará los puntos de ruptura dentro del mismo cromosoma (cromosoma donante).
46, XY, ins (12; 3) (12pter→12q15 ::3p13→3p21 ::12q15→12qter; 3pter→3p21 :: 3p13→3qter) El cariotipo detallado, por otro lado, describe
ambos cromosomas reorganizados en orden pter a qter, con las dos descripciones cromosómicas separadas por un punto y coma, sin
espacios. El cromosoma 12 es normal desde su extremo p-terminal hasta la banda 12q15, donde el símbolo de ruptura del doble colon ::
reincorporación (12q15: :) muestra el segmento 3p13→3p21 insertado entre los dos lados del punto de interrupción. El orden proximal a distal
de los puntos de corte insertadosdentro del brazo largo del cromosoma 12
indica que la inserción es directa. A diferencia del sistema corto, el cariotipo detallado también describirá el nuevo cromosoma 3 derivado
(eliminado), utilizando un punto y coma, sin espacios, para separar las dos descripciones cromosómicas.
involucran a ambos brazos, por lo que incluyen al centrómero). Las inversiones pericéntricas son generalmente más fáciles de detectar, porque la proporción de los
brazos suele verse afectada. Ambas formas utilizan la fórmula de cariotipo intracromosómico / de dos rupturas.
386 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
23,3
23,2 pag
23,3
23,2
23,1 21,3
ruptura / unión
21,2
22 21.13
21.12
21,3 21.11
13,3
21,2
13,2 13,1
21,1 12,2
pag 11.2211.2312 q
12,2 12,1
11.23
11.21
centrómero 11,1
11,1
11.22
11.21
11.21
11.23 11,1
11.21
centrómero
11.23 11.2211.23
12.212.1 12
q 12,3
pag
21,1
13.213.1 21,2
13,3
21.11 21,3
21.12
21.13 22
22,2
21,3
ruptura / unión
23,1
22,1 22,1
22,2 22,2
22,3 22,3
23,1 22,1
23,2 22,2
23,3
24.11
22,3
24.11
inv (8) (p23.1q22.1)
24.12 24.12
24.13 24.13 inv (8) (pter p23.1 :: q22.1 p23.1 :: q22.1 qter)
24,21 24,21
24,22 24,22
24,23 24,23
24,3 24,3
Figura 8.16 inversión pericéntrica. Cuando se producen roturas en ambos brazos (pyq) de un cromosoma, y los bordes rotos se vuelven a unir a los
brazos opuestos, se produce una inversión pericéntrica. los puntos de corte para las inversiones pericéntricas rodean y por lo tanto involucran al
centrómero, lo que también facilitará la detección si la proporción de brazos del cromosoma se distorsiona por este desplazamiento. el cariotipo de
forma corta describirá el evento como una inversión (inv), y el lector puede inferir por los brazos involucrados si es pericéntrico (brazos diferentes) o
paracéntrico (mismo brazo). el cariotipo detallado describe el cromosoma tal como aparece, desde el final del brazo corto (pter) hasta el final del brazo
largo (qter), utilizando dos puntos dobles donde se produjo cada ruptura y unión.
Diagrama ISCN del cromosoma 8 humano en el nivel de bandas 700 y 850 (© 2009 Nicole Chia) utilizado con permiso del artista. reproducido deISCN 2013: Un
sistema internacional de nomenclatura citogenética humana 2013. Shaffer LG, McGowan-Jordan J, Schmid M, eds. Editores S. Karger, Basilea.
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 387
(a) (B)
Figura 8.17 Comparación de isocromosomas, 21q y 12p. (a)yo (21) (q10) dos brazos q duplicados en este isocromosoma 21q dan tres copias de la
región crítica del síndrome de Down, lo que hace que el paciente sea positivo para el síndrome de Down. (B)yo (12) (p10) este isocromosoma adicional
puede verse como (a), pero en realidad es un isocromosoma para los brazos cortos del cromosoma 12, lo que resulta en una tetrasomía para ese
brazo. el cariograma completo de esta celda se puede ver en la Figura 8.6. La tetrasomía 12p en mosaico se encuentra en pacientes con síndrome de
pallister-Killian.
26
25
pter
24
23
22
22,3
3. 22
22,2
21
2. 22
22,1
1. 22
13
21 12
12
11
11,1
11,4
11,3 4. 11
11,2
3. 11
11,2 11,2
2. 11
11,1 11,1
11 1. 11 11
12 11 12
13 21 13
31
13 21
12
12
11
11,1
22
11,2
22 23
11,3
11,4 24
32
21 42
25
26
22,1 52
22,2 62 27
22,3
72 28
82
pter X
qter
homólogo normal
homólogo normal
46, X, idic (X) (q13) 46, X, psu idico (X) (p11.2)
Figura 8.18 Isodicentrías y pseudoisodicentrías. 46, X, idic (X) (q13) (Izquierda): aunque este cromosoma es una imagen especular de los brazos p, la
ruptura se produjo en la banda q13, no en el centrómero, dejando el segmento proximal del brazo q también duplicado. Ambos centrómeros
permanecen activos, lo que hace que esta estructura sea isodicéntrica, con el segmento del brazo p duplicado incrustado entre los dos centrómeros.46,
X, psu idico (X) (p11.2) (derecha): esta imagen especular de los brazos q del cromosoma sexual X incluye una duplicación, no solo del brazo largo, sino
también de la región proximal p11.2 del brazo corto. Debido a que solo hay una constricción primaria visual, el cromosoma se llama
pseudoisodicéntrico. Si se mira con atención, los dos brazos de este pseudodicéntrico no tienen la misma longitud.
Diagrama ISCN del cromosoma X humano en el nivel de 400 bandas (© 2009 Nicole Chia) utilizado con permiso del artista. reproducido deISCN 2013: Un
sistema internacional de nomenclatura citogenética humana 2013. Shaffer LG, McGowan-Jordan J, Schmid M, eds. Editores S. Karger, Basilea.
La ruptura se ha producido en el brazo corto en Xp11.2, con el brazo corto duplicado (Xp10 a Xp11.2) enterrado entre los brazos
largos duplicados. Esto obliga al cariotipo detallado a describir este cromosoma de orden qter a qter. Un espacio separa los dos
símbolos, psu e idic.
1. uno de los padres es un portador conocido de una inversión o inserción (por ejemplo, una gran inversión dentro del cromosoma 7 estaba presente en el
padre del ejemplo posterior);
2. y un intercambio meiótico desequilibrado entre el cromosoma reordenado y su homólogo homólogo ocurrió durante la
etapa de paquiteno de la meiosis [1, Figura 9].
46, XY, rec (7) dup (7p) inv (7) (p15q32) pat
46, XY, rec (7) (pter→q32 :: p15→pter) palmadita
El cromosoma 7 recombinante del probando (es decir, la persona inicialmente remitida para la prueba) se formó mediante un intercambio
meiótico desequilibrado como resultado de una gran inversión pericéntrica heredada de su padre. El cariotipo del padre, inv (7) (p15q32), se
incluye en el cariotipo corto. El cariotipo detallado pinta una imagen virtual del cromosoma recombinante desequilibrado, mostrando que el
segmento de brazo corto (p) duplicado de 7p15 a 7pter (ver Figura 8.19) ha reemplazado al extremo distal
del brazo largo de 7q32 a 7qter [1, secciones 4.5, 9.2.3].
pag pag 36
22 22 35 22 22
21
34
21 33 21 21
15
15
32
METRO
15 15 15
32
14
14
31 mi 14 14
13 13 13 13
12 12 12
11,2 22 I 12
12
11,2 11,2
21 1.2 S 21 21 21
22 12
12 I 22 22 22
13
31 31 31 31
14 S
32
15
32 32
32 32
15 15
33 33 21 33 21
34 34 34
35 35 I 22 35 22
36 36 36
q
padre (con probando con
normal meiótico
gran inversión) recombinante
homólogo Transversal
inv (7) (p15q32) tapete cromosoma 7
brazo p
rec (7) dup (7p) inv (7) (p15q32) mat
q brazo
46, XY, rec (7) dup (7p) inv (7) (p15q32) mat
46, XY, rec (7) (pter→q32 :: p15→pter) inv (7) (pter→p15 :: q32→p15 :: q32→qter) estera
la madre (mat) de este probando tiene una inversión pericéntrica del cromosoma 7, en la que todo el segmento entre 7p15 y 7q32 está invertido.
como resultado del cruce durante la profase I demitosis, el segmento del brazo p desde 7p15 a su terminal 7p está ahora presente en ambos
extremos del cromosoma 7 recombinante (por lo tanto, duplicado), y el segmento del brazo q desde 7q32 a su extremo terminal 7q está eliminado.
Consulte el inserto para ver la representación del color de esta figura.
Diagramas ISCN del cromosoma 7 humano a nivel de 400 bandas (© 2009 Nicole Chia) utilizados con permiso del artista. reproducido deISCN 2013: Un sistema
internacional de nomenclatura citogenética humana 2013. Shaffer LG, McGowan-Jordan J, Schmid M, eds. Editores S. Karger, Basilea.
390 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
Un cromosoma en anillo (r) (véase la figura 8.20) se forma cuando se producen roturas en ambos brazos que rodean un centrómero y
los bordes rotos se unen. Puede involucrar un cromosoma o varios cromosomas, y puede tener uno o más centrómeros, como en los
anillos dicéntricos (dic r) y tricéntricos (trc r). Cuando se conoce la fuente de centrómero dentro de un cromosoma en anillo, la
descripción del anillo se coloca en el orden de cariotipo, es decir, X antes de Y antes de los autosomas en orden numérico creciente (ver
8.3.7, Prioridad de orden de cariotipo) por identidad de centrómero. El primer paréntesis que sigue al símbolo indicará qué centrómero
está presente en ese evento. Si dos centrómeros diferentes están presentes dentro de una estructura, ambos cromosomas céntricos se
enumerarán en el primer paréntesis, seleccionándose el primer cromosoma enumerado siguiendo el orden de cariotipo estándar.
Debido a la inestabilidad mitótica, los cromosomas en anillo que se originan en una sola célula pueden tener diferentes apariencias estructurales, por
ejemplo, tamaños más grandes o más pequeños, figuras en ocho, formaciones sin anillo, pérdida o copias adicionales. Colocar el símbolo mos antes de la
descripción del evento informará al lector que la apariencia de la estructura era inconsistente, pero clonal.
Un anillo que involucra dos cromosomas, pero con solo un centrómero presente, se escribirá como un derivado (ver 8.6.6, Derivado del
anillo que involucra más de un cromosoma) [1, sección 9.2.15]. Las formaciones de anillos adicionales se describen en 8.7, Símbolos de
incertidumbre.
46, XY, tas (5; 12; 8; 16) (5q35; 12p13; 8p23; 16q24)
46, XY, tas (5; 12; 8; 16) (5pter→5 cuartos→12pter→12 cuartos→8pter→8 cuartos→16 cuartos→16pter)
Este ejemplo expande el concepto básico anterior con socios adicionales, dejando que los extremos terminales sean el brazo corto
del cromosoma 5 y el brazo corto del cromosoma 16.
Translocación recíproca
Cuando un cromosoma intercambia un segmento de su brazo con otro cromosoma, se produce una translocación (figura 8.21). Hablando
constitucionalmente, si el reordenamiento es equilibrado y el paciente no tiene síntomas clínicos, es posible que ni siquiera sea derivado para pruebas
genéticas hasta que experimente problemas reproductivos o a menos que no lo sea. En la neoplasia, sin embargo, un reordenamiento aparentemente
"equilibrado" puede no ser tan inocente como parece. Ciertas yuxtaposiciones genéticas se han convertido en indicadores diagnósticos críticos de anomalías
hematológicas específicas (véase el capítulo 11, Análisis citogenético de enfermedades hematológicas malignas). Estos reordenamientos interrumpen la
codificación crítica o crean nuevos códigos que alterarán el producto final de un gen y, en última instancia, conducirán a las características clínicas asociadas
con la enfermedad neoplásica en particular.
46, XY, t (9; 22) (9pter→9q34 :: 22q11.2→22 cuartos; 22 pies→22q11.2 :: 9q34→9 cuartos)
El cariotipo detallado comienza igual que la forma corta, por ejemplo, 46, XY, t (9; 22), pero reemplazará el segundo paréntesis con una
descripción del cromosoma translocado (9) y su socio, el cromosoma 22, separados por un punto y coma, sin espacios. Las regiones distales a
los dos puntos de ruptura, es decir, 9q34→9qter y 22q11.2→22qter, se intercambian a través de dos eventos break :: rejoin.
Para ser elegible como una translocación de brazo completo, una reordenación debe: (i) intercambiar brazos completos de los cromosomas involucrados, (ii)
estar equilibrada y (iii) tener un centrómero de origen desconocido. El recuento de cromosomas permanece en 46 y ningún signo más precede al símbolo del
evento. El formato del cariotipo es similar a una translocación recíproca, pero usa solo puntos de corte centroméricos (p10 y q10) para reflejar el brazo que
está presente. En otras palabras, si el brazo corto está presente, p10 se utiliza como punto de interrupción.
El primer cromosoma de la lista será seleccionado por el brazo corto del orden de mayor prioridad, es decir, X antes de Y antes del autosoma numérico
más bajo. La posición del cariograma también estará determinada por el brazo corto del cromosoma de mayor prioridad. Sin embargo, un reordenamiento
desequilibrado debe describirse como un cromosoma derivado (véase 8.6.7, Derivado no acrocéntrico de todo el brazo).
24
23
24
23
Cariotipo corto
22 22
21 21
13 13
12 12
11 11
11 11
12 12 evento(cromosoma 1;chr omosoma2) (armbreakpoint1;armbreakpoint2)
13 13
21 21
22 22
31
32
31
32
13
12
13
12 46, XY,t (9;22) (q34;q11.2)
33 33 11,2 11,2
11,1 11,1
11,1 11,1
34 11,2 34 11,2
12 12
Normal der (22)
13 13
9
Cariotipo detallado
der (9) Normal 22
Diagrama ISCN de los cromosomas humanos 9 y 22 a nivel de 400 bandas (© 2009 Nicole Chia) utilizado con permiso del artista. reproducido de
ISCN 2013: Un sistema internacional de nomenclatura citogenética humana 2013. Shaffer LG, McGowan-Jordan J, Schmid M, eds. Editores S.
Karger, Basilea.
Aunque las translocaciones acrocéntricas o robertsonianas se tratan de manera similar, incurren en una pérdida de los brazos cortos y, por lo
tanto, se describen en 8.6.7, Derivada acrocéntrica.
Translocación multicromosómica
Cuando varios cromosomas están involucrados en una translocación, el cromosoma de la primera lista tendrá la máxima prioridad, es
decir, X antes de Y antes del autosoma numérico más bajo. Una vez que se selecciona ese primer cromosoma, el orden dependerá de
qué cromosoma recibió su segmento roto. Esta reacción en cadena continúa hasta que se enumeran todos los cromosomas
involucrados. Si se hace correctamente, el último cromosoma debería ser el que dona su segmento al primer cromosoma, completando
así un círculo virtual.
Cuando los reordenamientos involucran múltiples cromosomas en patrones complejos, los números de cromosomas pueden incluirse con
sus respectivos puntos de ruptura en el segundo paréntesis. Para reordenamientos multicromosómicos más complejos, consulte
ISCN 2016 [1, sección [Link]].
Este ejemplo (ver Figura 8.22) no involucra cromosomas sexuales; por lo tanto, el cromosoma 5, que es el número autosómico más
bajo, aparece en primer lugar. El cromosoma 12 recibe el segmento del cromosoma 5 y dona su segmento al cromosoma 8, quien a
su vez pasa su segmento al cromosoma 21. El último cromosoma (21) dona su segmento al cromosoma 5 y
el intercambio circular está completo.
5pter
15,3
12qter
15,2 24,3
15,1
24,2
14
24,1
8 pter
13 23
12 22
11 23
11,1
22
11,2 21
12 21
12
13 15
11,2
11,1
14 11,1
14 11,2
15
13
12
13
21pter
13
21 12 12
11
21,1 11,2
11,1 11,1
22 11,2 21,2
5q31 12p13 21,3 8q22
23 12
22,1
31 13 22
22,2
32
22,3 23
33
24,1
34
24,2
24,3
35
21q22.1
Como se explica en el Capítulo 10, Impresión genómica, el descubrimiento de la disomía uniparental (upd) reveló la
capacidad innata de la célula para "autocorregirse", es decir, para rescatar un resultado de monosomía potencialmente
letal reteniendo dos copias del mismo cromosoma, o rescatar un resultado trisómico letal al eliminar uno,
desafortunadamente el homólogo equivocado. En ambos casos, lo que queda después del rescate es un par homólogo
del mismo padre. Debido a que cada homólogo todavía contiene la cantidad correcta de material genético, en la
superficie parecería que el probando está genéticamente balanceado, pero este no es el caso cuando se trata de genes
de impronta (aquellos que están específicamente afectados por el origen parental). La fórmula para escribir un cariotipo
"upd" es origen upd (cromosoma), por ejemplo, 46, XY, upd (15) pat. Ver 8.6.7, Derivada acrocéntrica,
La disomía uniparental segmentaria como una enfermedad adquirida también se está descubriendo con una incidencia alarmantemente alta
en asociación con ciertas enfermedades neoplásicas, como el SMD (síndrome mielodisplásico) [25,26]. Debido a que el problema es técnicamente
la pérdida de heterocigosidad somática, en lugar de un error reproductivo meiótico, la abreviatura molecularLOH para la pérdida de
heterocigosidad se utiliza para referirse a estas situaciones. La citogenética de rutina o FISH no pueden detectar la homocigosidad segmentaria
con absoluta confianza, incluso si los homólogos exhiben heterogeneidad; por lo tanto, los estudios de microarrays, como los SNP (polimorfismos
de un solo nucleótido), serían necesarios para detectar LOH si se sospechaba.
8.6.3 Isoderivada
Un isocromosoma que se forma a partir de un cromosoma derivado se denomina isoderivado.
Cuando ha ocurrido más de un evento estructural independiente, el evento de cariotipo debe escribirse como una derivada [1,
sección 9.2.3].
46, XY, der (16) del (16) (p13.1) del (16) (q24)
46, XY, der (16) (: p13.1→q24 :)
Ambos brazos muestran deleciones terminales (p13.1 y q24). La forma corta debe describir cada evento involucrado en esta derivada por
separado. El cariotipo detallado simplifica el cariotipo al describir solo el producto final, comenzando y terminando con dos puntos simples, es
decir, (: p13.1→q24 :).
Cuando un cromosoma derivado involucra múltiples eventos, se describen en pter→qter orden, independientemente del orden
alfabético de sus símbolos asociados.
46, XY, der (16) del (16) (p13.1) sumar (16) (q24)
46, XY, der (16) (: p13.1→q24 ::?)
Han ocurrido dos eventos dentro del cromosoma 16: una deleción en un extremo y una adición de material no identificable en el
otro extremo. El cariotipo enumerará los puntos de interrupción en orden pter a qter, independientemente del orden alfabético
396 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
de sus símbolos de eventos; por lo tanto, la eliminación (del) del brazo corto se describirá antes de la adición (sumar) del brazo largo.
Consulte 8.7, Símbolos de incertidumbre, para conocer las reglas que rigen la adición de material cromosómico no identificable.
Si un segmento acéntrico forma un nuevo (neo) centrómero (ver Capítulo 9, sección 9.2.5, Cromosomas neocentroméricos o analfoides) en una
posición que generalmente no contiene un centrómero, se pueden usar los símbolos der o neo. Es posible que el sistema corto no siempre sea
suficiente para describir este evento.
Cuando sea necesario para mayor claridad, la posición del neocentrómero se puede indicar con el símbolo neo [1, sección 9.2.13], para
ejemplo, 47, XY, + der (1) (cuarto→q23→neo→q23 :).
Los anillos que se forman a partir de más de un cromosoma se adaptarán a la fórmula que mejor explique su formación (ver 8.7.6,
Anillos de origen desconocido). Un anillo monocéntrico derivado de dos cromosomas se escribiría como un derivado, con el cromosoma
que proporciona el centrómero en primer lugar.
Derivada acrocéntrica
La mayoría de las translocaciones acrocéntricas de todo el brazo se originan a partir de roturas en los brazos cortos, lo que las convierte en dicéntricas [1, sección
[Link]]; sin embargo, sin pruebas especiales para verificar el origen centromérico, ambos socios se enumeran en el primer paréntesis. En
términos generales, el uso de puntos de ruptura centroméricos en el cariotipo, por ejemplo, p10 o q10, refleja el brazo que estáregalo
en la celda (ver 8.5.12, Translocación de todo el brazo); por lo tanto, las derivadas acrocéntricas usarán q10 para ambos socios en el
segundo paréntesis. La pérdida de sus respectivas contrapartes del brazo p, que por sí sola respalda el comportamiento acéntrico, tiene
un efecto clínico poco conocido sobre el portador, porque involucran regiones organizadoras del nucleolo (NOR). En algunas
situaciones, sin embargo, un cromosoma marcador bisatelitado está presente en algunas o en todas las células analizadas, lo que
podría tener un significado clínico, dependiendo de dónde se hayan producido las roturas y qué material genético esté involucrado. Por
ejemplo, si la ruptura involucró el locus del gen del síndrome de Prader-Willi / Angelman en 15q, el desequilibrio subsiguiente de sus
genes de impronta podría afectar potencialmente al probando. El símbolorobar para la translocación robertsoniana es otra opción para
describir las translocaciones de todo el brazo, pero solo si involucran cromosomas acrocéntricos [1, sección [Link]], y solo en forma
constitucional, no neoplásicos (adquiridos), cariotipos [1, sección [Link]]. Su aplicabilidad, por tanto, es limitada, pero de importancia
histórica.
De manera similar al derivado acrocéntrico anterior, las translocaciones de todo el brazo de los cromosomas no acrocéntricos se convierten en derivados
cuando se pierden sus parejas, lo que deja un cariotipo desequilibrado. Se utiliza la fórmula del cariotipo intercromosómico / de dos rupturas, que enumera
ambos cromosomas en el primer paréntesis que sigue al símbolo del evento derivado (der). Los puntos de interrupción reflejarán qué brazos están
presentes.
? incertidumbre
r
mar marcador
Cª incompleto
cp compuesto
Cuando la identidad no está clara, se coloca un signo de interrogación directamente antes del elemento en cuestión. Colocar el signo de
interrogación es importante, ya que una ubicación incorrecta conducirá a una conclusión equivocada por parte del lector. Por ejemplo, si se
cuestiona el evento, la marca precederá al símbolo, por ejemplo,? Del. Si la identidad cromosómica es incierta, el signo de interrogación
precederá al número de cromosoma sospechoso, por ejemplo, del (? 5). Si el punto de ruptura no está claro, el signo de interrogación se colocaría
antes de la banda específica en la que su identidad ya no es absoluta; por ejemplo, 46, XY, del (5) (p? 15.1) establece que un
398 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
- 18p 21
21
11,1
BREAK :: REUNIÓN 11,2
12
- 9q
21
22
23
9 9 +9 9 +9 der 18
18q
(9; 18)
9pter→9p10 :: 18q10→18pter
se ha producido una deleción terminal en el brazo corto (p) del cromosoma 5, pero cuestiona qué región está involucrada. Por otro lado,
46, XY, del (5) (p15.?1) es capaz de señalar la ruptura de la banda p15, pero no está claro qué subbanda se ve afectada. Consulte 8.7.5,
Rango de aproximación para opciones adicionales.
El signo de interrogación también se utiliza cuando se debe describir una estructura cromosómica clonal no identificable que contiene un
centrómero dentro del cariotipo, o cuando un segmento de un cromosoma conocido está reordenado con este cromosoma céntrico no
identificable.
47, XY, + 3, ‐7, ‐20, + der (?) T (?; 1) (?; p11.2), + mar, inc [20]
47, XY, + 3, ‐7, ‐20, + der (?) (1pter→1p11.2 ::?→cen→?), +mar, inc [20]
Aunque el cromosoma 1 es un participante conocido en esta estructura derivada, el signo de interrogación indica que no se puede
identificar el origen del centrómero. El evento se coloca al final del cariotipo antes de los otros símbolos de incertidumbre, es decir,
anillos, marcadores y minutos dobles (ver 8.3.7, Prioridad de orden del cariotipo). El símbolo incompleto (inc) al final indica que
también se estaban cuestionando inconsistencias adicionales, pero que no pudieron ser identificadas de manera definitiva o clonal
en este momento. Debido a que el número entre corchetes no especifica que el cariotipo es un compuesto (ver 8.7.10, Cariotipo
compuesto), las veinte células analizadas mostraron estas mismas anomalías clonales.
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 399
Como su nombre lo indica, el triplete add se usa cuando se desconoce, el material adicional se une a uno, pero solo uno, extremo
terminal de un cromosoma (o en el punto de ruptura de una deleción que incluye el extremo terminal) [1, sección 9.2.1]. La forma corta
no usa el signo de interrogación, porque se entiende por el uso de laagregar símbolo; sin embargo, el formato detallado describe la
imagen virtual y, por lo tanto, requiere la marca.
Cuando material adicional no identificable "se adhiere a ambos brazos de un cromosoma y / o reemplaza más de un segmento en un
cromosoma" [1, sección 9.2.1, pág. 61], se usa el símbolo derivado, p. Ej., 46, XY, der (16) sumar (16) (p13.3) sumar (16) (q24) (1,
sección 9.2.3).
Cuando un cromosoma contiene más de una región hsr o un cambio estructural además de hsr, el evento se describe
como un derivado [1, sección 9.2.8].
8.7.4 O
Símbolo o se utiliza para interpretaciones alternativas de una aberración, como cuando ambas interpretaciones forman estructuras de apariencia
idéntica, ambas se observan citogenéticamente o ambas se confirman mediante pruebas adicionales. También usa un espacio antesy después del
símbolo.
Otro potencial para usar el o El símbolo es cuando diferentes puntos de ruptura han afectado al mismo cromosoma, pero No al mismo
tiempo.
Cuando un punto de ruptura preciso solo se puede localizar en un rango dentro de un segmento, en lugar de una posición específica con certeza,
o cuando el número de copias de anillos, marcadores o minutos dobles varía dentro de las celdas examinadas, el signo de aproximación o tilde (~)
puede utilizarse para indicar los límites superiores (más distales) e inferiores (más proximales) [1, Capítulo 3].
400 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
Figura 8.25 región de tinción homogénea (hsr). El cromosoma 9 muestra una inserción de una región de tinción homogénea no identificable.
Un anillo puede ser monocéntrico o multicéntrico; puede involucrar solo un cromosoma o podría involucrar segmentos de múltiples
cromosomas [1, sección 9.2.15]. Su fuente cromosómica original no siempre es identificable; por lo tanto, se utilizan varios métodos
diferentes para describir un cromosoma en anillo. Los cromosomas en anillo con una fuente de centrómero conocida ya se han
analizado en 8.5.10, Anillo de origen céntrico conocido. Cuando se desconoce la identidad de un anillo, se coloca al final del cariotipo
con otras estructuras no identificables, en el siguiente orden [1, Capítulo 6]:
El símbolo se coloca después de todas las descripciones autosómicas conocidas, antes de las descripciones de los marcadores, si también están presentes. La trisomía
21 se agregó en este ejemplo para enfatizar el orden numérico ascendente de ubicación de los autosomas; por lo tanto, el cariotipo listaría
Como resultado de su inestabilidad potencial, los cromosomas en anillo pueden aparecer en una variedad de formas y tamaños, por ejemplo,
anillos dobles, figuras en ocho, segmentos rotos, etc., pero el cariotipo solo necesita describir la formación original del anillo. Esta inestabilidad
también puede conducir a múltiples copias de las mismas o diferentes estructuras de anillo que aparecen. Cuando hay más de una estructura de
anillo clonal pero no identificable, el número o rango de copias precederá al símbolo del anillo, sin un espacio, como se muestra en los siguientes
ejemplos.
Si las estructuras del anillo no son identificables, pero clonalmente distinguibles, ascendente Arábica los números se pueden agregar como sufijo.
La notación numérica que indica diferentes entidades morfológicas del anillo, por ejemplo, r1 y r2, no debe confundirse con la
descripción del cariotipo para un anillo que involucra el cromosoma 2, por ejemplo, r (2), que encierra el número de cromosoma
involucrado entre paréntesis [1, sección 9.2.15].
Cuando hay más de una formación de anillo clonal diferente y una (r1) tiene varias copias, el signo de la hora (x) con su número
de copia seguirá su notación de anillo, sin espacios [1, sección 9.2.12].
Una última variación es el cromosoma en anillo que se ha heredado de uno de los padres, por ejemplo, de origen materno o paterno.
Se pueden encontrar ejemplos de anillos adicionales en 8.5.10 Anillo de origen céntrico conocido, 8.6.6 Derivado del anillo que involucra
más de un cromosoma y 8.7.10 Cariotipo compuesto.
1. Se escribirían dos marcadores (no necesariamente iguales) por celda 48, XY, + 2mar [20].
2. Se escribirían dos formas de marcadores clonales diferentes, distinguibles 48, XY, + mar1, + mar2 [20].
3. Copias adicionales del mismo marcador clonal usarán un símbolo de tiempo (×): 49, XY, + mar1 × 2, + mar2 [20].
4. Un marcador constitucional de novo (c) en un cariotipo neoplásico, o uno que se sabe que se hereda de un padre (mat o pat), utilizará
un espacio para separar los dos símbolos alfabéticos: 47, XY, + mar c [20] o 47, XY, + mar mat [20].
402 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
46, XY, 5 minutos [20] el uso de un valor numérico absoluto indica que todas las celdas tenían 5 dmin;
46, XY, ~ 22 dmin [20] indica que las células mostraron aproximadamente 22 dmin (como número medio) por célula;
46, XY, 5 ~ 22 dmin [20] define un rango definitivo que no era inferior a 5 ni superior a 22 dmin por celda.
47 ~ 50, XX, + 1 [5], + 3 [4], + 17 [14], + 22 [7], + mar [2], ~ 22dmin [18] [cp20]
Una opción más informativa para escribir el mismo cariotipo compuesto anterior sería incluir recuentos de células individuales entre
corchetes después de cada evento [1, sección 11.1.5]. Esto permite al lector apreciar la frecuencia de cada evento, pero no proporciona cómo
los eventos se relacionan entre sí. Por ejemplo, en este cariotipo aprendemos que solo cuatro de cada 20 células mostraron una ganancia del
cromosoma 3, pero no sabemos si esas mismas células también incluyeron una ganancia del cromosoma 22.
sea un compuesto.
Debido a que el autor del cariotipo debe hacer todo lo posible por describir la evolución del subclón, el lector del cariotipo asumirá a
partir de una descripción compuesta que no hubo un patrón definitivo que hiciera posible la descripción del subclón.
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 403
Uno de los desafíos al analizar un espécimen es distinguir el verdadero mosaicismo de bajo nivel de la pérdida, ganancia o reordenamiento
aleatorio como resultado de un artefacto cultural. El primero está incluido en el cariotipo; el último no lo es. Por tanto, se han establecido
directrices que establecen un valor de corte razonable para detectar mosaicismo con un nivel de confianza del 95% cuando se encuentra una
varianza estructural o numérica [28-30]; sin embargo, cualquier hallazgo clínicamente sospechoso debe discutirse con el supervisor o director del
laboratorio. La determinación clonal en tejido neoplásico también puede requerir consideraciones especiales, p. Ej., Número de células
analizadas, tipo de cultivo utilizado, tiempo de cultivo o tipo de anomalía encontrada [1, sección 11.1.1].
A menos que se haya informado previamente de la anomalía, las pautas requieren la presencia de al menos dos células con exactamente la misma
ganancia (p. Ej., Trisomía) o reordenamiento estructural para que se considere mosaicismo verdadero (ver 8.9, Múltiples líneas celulares). Debido a un
potencial levemente mayor de pérdida de cromosomas como un artefacto del riguroso proceso de recolección y preparación de portaobjetos, la pérdida del
mismo cromosoma en los estudios constitucionales debe observarse en al menos tres células para que sea notificable.
Los cultivos in situ de tejido tumoral generalmente requieren la observación de la misma ganancia numérica o anomalía estructural en al
menos dos células en metafase de dos cultivos primarios diferentes (es decir, cultivos de primera generación iniciados a partir de la fuente de
tejido original) o de dos regiones claramente separadas en la misma diapositiva. La pérdida requerirá tres de tales observaciones para ser
considerada clonal; sin embargo, si dos células que muestran la misma pérdida cromosómica también muestran una ganancia cromosómica
idéntica o anomalías estructurales, la pérdida es notificable [1, sección 11.1.1]. Las pautas prenatales in situ o en matraz tienen restricciones
ligeramente diferentes y se analizan en el Capítulo 5, Diagnóstico prenatal de cromosomas.
También se sabe que ciertos factores externos están asociados con hallazgos cromosómicos específicos, por ejemplo, edad avanzada con
aneuploidía de cromosomas sexuales o PHA de mitógeno de células T con la t (7; 14); por lo tanto, las bajas ocurrencias de anormalidades
numéricas o estructurales sospechosas deben ser discutidas con el supervisor o director. Debido a que estas pautas se establecieron para ayudar
a distinguir el artefacto cultural del verdadero mosaicismo de bajo nivel, las ganancias o pérdidas cuestionables deben verificarse al verificar el
área circundante bajo el microscopio para determinar si una coincidencia morfológica flotante del cromosoma faltante puede encontrar, o si una
ganancia puede ser un flotador de una celda de metafase incompleta vecina. Si estas ganancias o pérdidas son verdaderas y cumplen con los
estándares de las pautas, se pueden informar.
En el espectro opuesto, aunque la mayoría de los hallazgos de células individuales son ocurrencias al azar, los tecnólogos experimentados han
encontrado casos raros en los que una sola célula anormal en una muestra normal mostró una anomalía que era un hallazgo potencialmente relevante para
los síntomas del paciente, especialmente en estudios neoplásicos. Cuando se investigó más a fondo mediante recuentos adicionales o pruebas
complementarias como FISH, esta única célula se confirmó como una verdadera línea celular notificable para esa muestra.
Una ocurrencia de una sola celda se vuelve notificable cuando ha sido
1. informado previamente en una muestra anterior de este paciente [1, sección 11.1.1]. Este clon se enumeraría primero, independientemente de
su tamaño, si representaba un predecesor clonal de otro clon relacionado en el análisis [1, sección 11.1.6]. Sin embargo, si es un clon
evolucionado cariotípicamente, se describiría después de un clon menos complicado, siguiendo el orden de cariotipo estándar para la
evolución clonal neoplásica;
2. confirmado por otra prueba, por ejemplo, FISH u otra fuente de tejido (por ejemplo, piel, mucosa bucal). El cariotipo de
confirmación FISH se escribiría después de un punto al final de la descripción citogenética [1, sección 11.1.1].
Ninguna regla general puede prever todos los factores posibles que podrían afectar el resultado de una muestra; por lo tanto, cualquier hallazgo
sospechoso debe notificarse al director del laboratorio.
Las regiones heterocromáticas (véase el capítulo 7) que rodean el centrómero normalmente muestran variaciones tanto en tamaño como en longitud. ISCN
2016 [1] utiliza tramas cruzadas direccionales opuestas en el idiograma para representar las diversas familias de α- ADN satélite repetitivo [1, sección 2.5]
que forman estas regiones heterocromáticas pericentroméricas (h), y las que están presentes de forma variable en todos los brazos cortos acrocéntricos y en
los cromosomas 1, 3, 9, 16, 19 e Y [1, sección 2.4] . En términos generales, estos cambios no tienen ningún efecto conocido sobre el portador, pero pueden
cambiar la apariencia morfológica de un cromosoma. Las variaciones heteromórficas se pueden escribir de la siguiente manera:
■ Variaciones de tamaño o longitud de regiones heterocromáticas (h), tallos acrocéntricos (stk) y satélites (s) con signos más (+) y
menos (-), por ejemplo, aumentar (h +, s +, stk +, Yqh +) y disminuir (h -, s–, stk–, Yqh–).
■ Reposicionamiento inter o intracromosómico, p. Ej., Inversión pericéntrica parcial (phqh), inversión completa (ph) o
reposicionamiento de una región heterocromática. Los ejemplos de reposicionamiento intercromosómico incluyen 3q24h, donde se
ha identificado heterocromatina en la banda q24 en el cromosoma 3, y 17qs, que indica que los satélites están unidos al brazo largo
del cromosoma 17.
404 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
13ps + pstk + cenh + tapete una combinación de los ejemplos anteriores en el mismo cromosoma; por lo tanto, sin comas
13ps +, 14pstk +, 21cenh + mat una combinación de los ejemplos anteriores en 3 cromosomas diferentes; las comas separan cada
Yqh− Falta (-) segmento heterocromático (h) en el brazo largo (q) del cromosoma sexual Y
1qh + mayor longitud (+) de la heterocromatina (h) en el brazo largo (q) del cromosoma 1
■ Presencia duplicada (pss, pstkstk) o nada (ps–, pstk–) (1, Capítulo 7) (ver Tabla 8.4). Incluso se han observado ocasionalmente
bandas adicionales dentro de las áreas heterocromáticas q12 de los cromosomas 1, 9 y la Y, pero debido a que se consideran parte
de la región variable de trama cruzada, no se muestran en el idiograma [1, sección 2.4].
Cuando se escribe una variación heteromórfica en formato de cariotipo, los puntos de corte se definen por la banda eucromática que se
encuentra adyacente a la región heterocromática sombreada en el idiograma [1, sección 7.1.2]. Ejemplos de inversiones heteromórficas
comunes son inv (1) (p13q21), inv (2) (p11.2q13), inv (3) (p11.2q12), inv (9) (p12q13), inv (10) (p11.2q21 .1), inv (16) (p11.2q12.1) e inv (Y)
(p11.2q11.2) [1, Capítulo 2, Tabla 1].
Otra forma de variante normal es el sitio frágil, que en términos de cariotipo es un locus cromosómico específico con propensión a la
constricción, brechas o roturas cromosómicas repetidas de cromátidas o isolocus, especialmente después de la exposición in vitro a sustancias
químicas que estresan la replicación de nucleótidos del ADN. Se han definido dos clases de sitios frágiles: comunes (CFS) y raros (RFS), el último
que ocurre con una frecuencia baja (5%) dentro de la población general. Estas regiones RFS de trinucleótidos expandidos o repeticiones de ADN
minisatélite se han asociado con ciertas enfermedades genéticas, como el síndrome del X frágil, algunos cánceres e incluso reordenamientos de
la línea germinal que podrían tener consecuencias genéticas [31].
Los sitios frágiles generalmente ocurren en regiones de banda G oscura (o banda R clara) ricas en AT, de replicación tardía, que se sabe que
están involucradas en la unión de la matriz nuclear, especialmente en la interfaz fronteriza con su vecina de banda G clara [ 31]. Debido a que
implica solo una ruptura, se escribirá en el formato de cariotipo intracromosómico de una ruptura (consulte 8.8.4, Sitios frágiles raros a
continuación). Muchos SFC se han identificado molecularmente sin consecuencias fenotípicas conocidas [32]; por lo tanto, se tratan como
variantes normales y no se incluyen en el cariotipo a menos que el protocolo de laboratorio indique lo contrario [1, sección 7.2].
Las RFS, heredadas o adquiridas, pueden tener consecuencias fenotípicas y se informarán en el cariotipo si se identifican mediante
pruebas citogenéticas. El evento usa el símbolo fra e involucra solo un cromosoma y un punto de ruptura.
ejemplo, ambas líneas celulares anormales son numéricas; por lo tanto, están ordenados en orden de complejidad creciente. (1, sección 4.1)
Cuando se identifica más de un clon de tumor independiente en una muestra neoplásica, se colocan en orden de frecuencia (mayor recuento de
células), comenzando con la línea principal o el clon más frecuente. Un cariotipo también puede tener más de una línea principal si el mismo
recuento de células absoluto más alto es compartido por más de un clon.
46, XY, t (14; 18) (q32; q21.3) [14] / 47, XY, + 12 [6]
El clon más frecuente, o línea principal, se muestra en (14; 18) en 14 de las 20 células analizadas y, por lo tanto, se enumera antes de las seis
células no relacionadas con trisomía 12. Si el recuento de células hubiera sido el mismo, los eventos seguirían el estándar El orden del
cariotipo y el numérico +12, que es el autosoma de menor valor numérico, precedería al estructural t (14; 18).
406 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
Ciertas condiciones anularán la escritura de clones no relacionados con una frecuencia decreciente. Por ejemplo, cuando se encuentra una anomalía
notificada anteriormente, se enumera en primer lugar [1, sección 11.1.6].
46, XY, t (14; 18) (q32; q21.3) [3] / 47, XY, + 8 [14] / 46, XY [3]
La t (14; 18) se había informado anteriormente y, por lo tanto, se escribe primero.
Si los clones relacionados están presentes con clones no relacionados, el clon en evolución se enumera primero en orden de complejidad creciente, seguido
de los clones no relacionados en frecuencia decreciente. La línea celular normal, si está presente, sería la última [1, sección 11.1.6].
El clon más básico en una serie de evolución clonal relacionada se llama línea madre (sl) y se escribe primero en el cariotipo (ver Figura 8.26). Los
subclones, llamados líneas laterales (sdl o sdl1, sdl2, etc.), siguen su línea madre asociada en complejidad creciente, independientemente de su
frecuencia [1, sección 11.1.4]. Debido a que un clon no necesita ser homogéneo, esta población subclonal todavía se considera parte del clon
original de la línea madre [1, sección 11.1.1].
Idem (en latín significa igual) representa solo las anomalías descritas en la línea madre. Es útil cuando se describe la evolución limitada de la
línea lateral, y se recomienda cuando dos o más líneas fundamentales (sl1, sl2, etc.) evolucionan cada una hacia su propio conjunto de líneas
laterales [1, sección 11.1.4]. Estos dos símbolos, sl e ídem, no se pueden mezclar cuando se describe una sola muestra de tumor [1, sección
11.1.2]. Demostraremos cómo utilizar estas herramientas para seguir la evolución clonal mediante la introducción de una sucesión de escenarios.
Escenario 1: en 20 celdas que usaron análisis de nivel de banda 400, 3 celdas eran hombres normales. Todas las células restantes se mostraron en la
ubicación trans (14; 18) en q32 en el cromosoma 14 y q21.3 en el cromosoma 18.
Hay dos clones presentes: uno anormal y otro normal. El clon anormal se enumera antes que el normal, y el cario-tipo se
escribiría:46, XY, t (14; 18) (q32; q21.3) [17] / 46, XY [3], con el solidus separando los clones, y los recuentos de células incluidos
al final de cada clon. El clon de translocación es tanto de línea madre (clon más básico) como de línea principal (clon más
frecuente) para este cariotipo.
Escenario 2: Dentro de las 17 células que tienen la translocación anterior, 13 células también muestran una trisomía 12.
El cariotipo ahora tiene tres clones: una línea madre, una línea lateral y una normal. El clon más básico, o línea madre, sigue siendo el clon con
solo la translocación t (14; 18) y, por lo tanto, permanecerá primero en el cariotipo, pero su recuento total de células se ha reducido a 4, por
ejemplo, t (14; 18). (q32; q21.3) [4]. Las 13 células restantes, que muestran trisomía 12 además de la ya presente t (14; 18), se convierten en su
primera línea lateral; por lo tanto, al usar el símbolo sl (línea madre) para representar la t (14; 18), su descripción se convierte en
47, sl, + 12 [13]. El recuento de cromosomas también aumentó a 47 como resultado del cromosoma 12 adicional. Esta línea lateral ahora se
convierte en el clon más frecuente, o línea principal, del cariotipo, pero el clon original y más básico sigue siendo la línea madre y aparecerá en
primer lugar. El cariotipo se puede escribir de dos formas:
46, XY, t (14; 18) (q32; q21.3) [4] / 47, sl, + 12 [13] / 46, XY [3]
donde el símbolo sl (para línea de origen) indica que todas las anomalías descritas en la línea de origen están presentes en este clon de línea lateral (en
este caso, la translocación). La nueva línea lateral agrega un cromosoma 12 adicional.
46, XY, t (14; 18) (q32; q21.3) [4] / 47, ídem, + 12 [13] / 46, XY [3]
donde idem se usa en lugar de sl para reducir la descripción repetitiva (es decir, la translocación de la línea madre). En este
recuento, sexo, evento [#] / recuento,sl,evento [#] / recuento,sdl1,evento [#] / recuento,sdl2,evento [#] / recuento, sexo [#]
Línea madre (lo más básico) Línea lateral 1 Línea lateral 2 Línea lateral 3 Línea celular normal
Figura 8.26 Evolución clonal. En un cariotipo neoplásico, cada clon en evolución se describe de forma independiente, comenzando con el evento (s) más
básico (línea madre) y continuando con una complejidad creciente. el número de células contadas en cada clon se encierra entre corchetes al final de
cada línea de células, y barras inclinadas de líneas de células separadas. la línea madre más básica se describe primero, seguida de sus líneas laterales en
complejidad creciente.
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 407
Escenario 3: Dentro de la línea lateral de 13 células anterior que tiene la translocación entre los cromosomas t (14; 18) y el cromosoma adicional
alrededor de 12, ocho (8) de las 13 células ahora también muestran una deleción intersticial del brazo largo del cromosoma 6 entre las bandas
q15 y q21.
La complejidad aumenta con la adición de una segunda línea lateral. Ahora hay tres clones anormales además del clon normal.
Línea madre (sl): la translocación t (14; 18) todavía se observa en 17/20 células, pero solo cuatro de esas 17 células la tienen como única
anomalía. Estas cuatro células todavía se consideran la línea madre y se enumerarán primero: 46, XY, t (14; 18) (q32; q21.3) [4]. Sin embargo,
no es la línea principal (clon más frecuente) del cariotipo.
Primera línea lateral (sdl o sdl1): tanto la translocación (representada por el símbolo sl) como la trisomía 12 están presentes en 13 de las 17 células
anormales, pero ocho de estas 13 células han evolucionado hasta convertirse en una segunda línea lateral, dejando 5 células definidas en la primera
línea lateral: / 47, sl, + 12 [5].
La segunda línea lateral (sdl2) tiene la t (14; 18) y +12 de la primera línea lateral, y ha agregado un cromosoma 6 eliminado en ocho células. Debido a que
no hay otras líneas laterales, la ambigüedad no es un problema y la primera línea lateral aún puede denominarse sdl, pero cambiará a sdl1 en el
siguiente escenario. El nuevo evento se convierte en 47, sdl, del (6) (q15q21) [8]. Con el recuento de células más alto (8 células), también se convierte en la
línea principal del cariotipo.
46, XY, t (14; 18) (q32; q21.3) [4] / 47, sl, + 12 [5] / 47, sdl, del (6) (q15q21) [8] / 46, XY [ 3]
Debido a que el uso de idem restringe la derivación solo al clon listado en primer lugar (línea madre), todos los eventos derivados de líneas laterales
anteriores deben repetirse; por lo tanto, el +12 debe colocarse después del (6), siguiendo la regla de los números autosómicos ascendentes, y el cariotipo se
convierte en:
46, XY, t (14; 18) (q32; q21.3) [4] / 47, ídem, + 12 [5] / 47, ídem, del (6) (q15q21), + 12 [8] / 46 , XY [3]
Escenario 4: Ampliando el escenario 3 anterior, cinco de estas 8 células con la deleción del cromosoma 6 ahora también muestran una deleción dentro del
brazo corto del cromosoma 17 en p13.
Con tres líneas laterales presentes, cada línea lateral está numerada para mayor claridad; por lo tanto, las líneas laterales se describirán como sdl1, sdl2, etc.
El nuevo cariotipo de línea madre-línea lateral está escrito:
46, XY,t (14; 18) (q32; q21.3) [4] / 47,sl, + 12 [5] /47,sdl1, del (6) (q15q21) [3] / 47,sdl2, del (17) (p13) [5] /46, XY [3]
El uso del símbolo sl en este ejemplo representa la t (14; 18); sdl1 suma +12 a la t (14; 18); y sdl2 indica del (6), +12 yt (14; 18). La línea lateral 1
y la línea lateral 3 son ambas líneas principales de este cariotipo, porque comparten el mismo recuento de células más alto.
(5), y son, por tanto, los clones que se observan con mayor frecuencia. Sin embargo, esto no cambia el orden del cariotipo, que todavía se
escribe con una complejidad creciente, no con una frecuencia.
A medida que aumenta la complejidad, también lo hace la descripción repetitiva con el uso del ídem.
46, XY,t (14; 18) (q32; q21.3) [4] / 47, ídem, + 12 [5] / 47, ídem, del (6) (q15q21), + 12 [3] / 47,ídem, del (6) (q15q21), + 12, del (17)
(pág. 13) [5] /46, XY [3]
La última línea lateral, por ejemplo, debe repetir del (6) (q15q21) y +12, además de incluir la nueva eliminación. La translocación
inicial de la línea madre, t (14; 18), está representada por el símbolo ídem.
En 20 células, se encontró que una muestra neoplásica tenía 6 células con t (14; 18) (q32; q21.3). También se analizaron cuatro células tetraploides que tenían
dos copias de esta translocación; las 10 células restantes eran casi tetraploides, con un recuento de cromosomas de 93, como resultado de una copia
adicional (cinco copias en total) del cromosoma 12, además de las dos copias de la translocación.
Este cariotipo se escribiría 46, XY, t (14; 18) (q32; q21.3) [6] / 92, slx2 [4] / 93, sdl, + 12 [10]. Todas las células tienen la translocación t (14; 18), lo que hace que
las seis células diploides tengan la translocación como la línea celular más básica, o línea madre, y se enumeran en primer lugar. La primera línea lateral es
tetraploide. La segunda línea lateral evolucionó a partir de la primera línea lateral (se puede usar sdl o sdl1, dependiendo de
408 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
preferencia de laboratorio), y ganó un cromosoma 12 adicional, lo que produjo un recuento de cromosomas casi tetraploides de 93 (ver Tabla
8.3). Usar idem puede ser incluso más sencillo en este momento. (1, sección 11.1.4)
46, XY, t (14; 18) (q32; q21.3) [6] / 92, idemx2 [4] / 93, idemx2, + 12 [10]
Las líneas madre clonales, independientes y múltiples se diferencian por números arábigos suficientes, por ejemplo, sl1, sl2, etc., si también evolucionan hacia líneas
laterales adicionales.
47, XY, + 12 [6] / 47, sl1, del (17) (p11.2) [8] / 46, XY, del (20) (q13.1) [2] / 47, sl2, + 8 [4]
Cada línea lateral debe seguir su línea de origen en orden de complejidad creciente y debe utilizar el indicador único de su línea de origen (sl1,
sl2, etc.) para evitar cualquier ambigüedad. Sin embargo, los símbolos de línea lateral, por ejemplo, sdl1, sdl2, etc., no deben usarse en estos
cariotipos multistemlineales; en cambio, todos los detalles de la línea lateral anterior que evolucionan a partir de la misma línea madre deben
repetirse [1, sección 11.1.4]. La única descripción que no es necesario repetir son las anomalías de la línea madre. Idem también se puede
sustituir [1, sección 11.1.4].
cariotipo se escribirá siguiendo un orden de prioridad similar a los descritos anteriormente para los clones no relacionados.
46, XY, t (14; 18) (q32; q21.3) [11] / 46, XY, t (7; 14) (q22; q32) [6] / 46, XY, t (11; 14) (q23; q32) [3]
Este ejemplo muestra tres reordenamientos diferentes que involucran la misma posición en el cromosoma 14 (14q32). El orden de cariotipo se
enumerará por frecuencia clonal [1, sección [Link]]; por lo tanto, la línea principal t (14; 18) es la primera con 11/20 celdas, t (7; 14) es la
siguiente con 6/20 celdas y la última es t (11; 14) con 3/20 celdas.
Los cariotipos neoplásicos pueden volverse bastante complejos, pero aún se deben hacer todos los intentos para identificar las líneas madre y las líneas
laterales de un clon en evolución. Los escenarios anteriores para el principiante pueden haber parecido abrumadoramente complejos, pero en la
citogenética del cáncer en tiempo real, los ejemplos que se proporcionan aquí son sencillos y fáciles de resolver. En la vida real, solo desearíamos que fuera
así. Quizás el lector ahora pueda apreciar el desafío al que se han enfrentado los citogenetistas neoplásicos durante décadas, tratando de darle sentido al
caos que trae la neoplasia al cariotipo humano.
pequeña para detectarla con confianza mediante un análisis cromosómico de rutina, y la secuencia del locus está disponible para el interrogatorio de fluorescencia, la FISH en metafase puede verificar la presencia o ausencia del
gen. Por otro lado, si el objetivo es examinar una gran cantidad de células en busca de un locus o reordenamiento específico, sin estar restringido a las células que experimentan mitosis, entonces la FISH de interfase / nuclear
sería la opción más deseable. Algunos usos de FISH en interfase / nuclear incluyen la confirmación o detección del mosaicismo de bajo nivel; identificar anomalías genéticas específicas cuando los cromosomas en metafase no
están disponibles (p. ej., líquido amniótico sin cultivar o tejido tumoral incluido en parafina); monitorear la efectividad continua de un trasplante de médula ósea o la presencia de enfermedad residual; y la búsqueda de una lista
cada vez mayor de ganancias, pérdidas y yuxtaposiciones que tienen importancia clínica para la neoplasia. La elección del método de hibridación adecuado también dependerá del tipo de anomalía que se espere; por lo tanto,
comprender el proceso detrás de FISH y los símbolos que representan estos procesos afectan la forma en que se escribe el cariotipo FISH. (Consulte el Capítulo 16, Hibridación in situ de fluorescencia, para una discusión más
profunda sobre este tema). La elección del método de hibridación adecuado también dependerá del tipo de anomalía que se espere; por lo tanto, comprender el proceso detrás de FISH y los símbolos que representan estos
procesos afectan la forma en que se escribe el cariotipo FISH. (Consulte el Capítulo 16, Hibridación in situ de fluorescencia, para una discusión más profunda sobre este tema). La elección del método de hibridación adecuado
también dependerá del tipo de anomalía que se espere; por lo tanto, comprender el proceso detrás de FISH y los símbolos que representan estos procesos afectan la forma en que se escribe el cariotipo FISH. (Consulte el
Capítulo 16, Hibridación in situ de fluorescencia, para una discusión más profunda sobre este tema).
El análisis FISH de interfase se basa en la presencia o ausencia de patrones de señal coloridos específicos. Sin embargo, ciertas situaciones
pueden producir patrones de señales falsos positivos que pueden desafiar la interpretación de una prueba, como la superposición coincidente de
la posición de la señal dentro del núcleo, el ruido de fondo de un contaminante desconocido o incluso la hibridación cruzada con secuencias
genéticas similares. Así como la citogenética convencional se basa en un número mínimo de células antes de que se pueda informar una
anomalía, FISH también se basa en un límite de ocurrencias, llamado valores de corte normales. Estos valores no son universales, sino que se
establecen [33] y se actualizan periódicamente mediante un proceso de validación paracada La sonda se utiliza clínicamente en el laboratorio
individual (consulte el Capítulo 16, sección 16.11, Prueba y validación de la sonda FISH).
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 409
El proceso de validación implica examinar muestras normales y anormales conocidas, y establecer una tasa confiable (corte normal) a la que
se pueden esperar patrones de señal falsa positiva para esa sonda en ese laboratorio y para ese tipo de tejido específico (ver Capítulo 19, sección
19.3.1, Determinación del límite normal para la validación FISH). La ejecución de un portaobjetos de control normal con cada sesión de
hibridación FISH también verificará que la sesión produjo resultados fiables; sin embargo, no puede anticipar la presencia de restos fluorescentes
que se habían introducido en portaobjetos de prueba individuales antes de la hibridación FISH. Un resultado de FISH anormal se puede informar
cuando su frecuencia excede el rango de corte normal para ese patrón usando la misma sonda.
El proceso de validación tiene sus limitaciones. Las células cancerosas son tan impredecibles que a veces se observan nuevos
patrones de señal que no se habían observado previamente en muestras de control normales o anormales. Cualquier patrón de señal
repetitivo o sospechoso debe ser informado al supervisor o director del laboratorio.
Las diferentes fuentes de tejido que utilizan la misma sonda también pueden requerir un proceso de validación específico para cada tejido, según lo
determine el director del laboratorio. El tejido incluido en parafina, sin embargo, debe validarse independientemente de los núcleos procesados
citogenéticamente, como se recomienda en el informe de julio de 2011 por un grupo de trabajo de genetistas que forman parte del comité de garantía de
calidad del American College of Medical Genetics (ACMG) [33]. En última instancia, la precisión se basa en un personal competente para realizar las pruebas
que se asignan y en los resultados que se basan en directrices fiables y en concordancia con al menos dos lectores independientes [34].
Una señal de sonda representa una secuencia genética que se ha marcado con un color fluorescente para permitir que se confirme la presencia,
ausencia o posición de un gen mediante microscopía de fluorescencia. Usaremos cuatro letras - R (rojo o naranja), G (verde), A (aguamarina) y F
(amarillo de fusión) - para representar los colores de señal más comúnmente utilizados. Sin embargo, la fusión de amarillo cromático (F) es no es
un color verdadero. En realidad, se crea por un tono rojo y verde que se encuentra físicamente dentro del mismo campo tridimensional que se ve
bajo el microscopio fluorescente. De hecho, sus componentes rojo y verde se pueden observar por separado bloqueando el color opuesto. Con
estos cuatro colores, explicaremos el proceso básico detrás del análisis FISH a través de algunas situaciones hipotéticas.
Usando una sonda marcada en rojo para apuntar a la región crítica del síndrome de Down (DSCR) en
una muestra de sangre periférica de un recién nacido remitido para trisomía 21, la presencia de dos
señales rojas (2R) indicaría que hay dos secuencias genéticas normales, una en cada homólogo. Tres
señales rojas (3R) indicarían la presencia de tres copias del gen, por lo tanto, trisomía para la región DSCR.
Sin embargo, una pérdida de una señal (1R) podría indicar la pérdida (deleción) de esa secuencia (1R) o la
pérdida (monosomía) del homólogo completo. Para distinguir estos dos escenarios, un control interno de
un segundo color, por ejemplo, verde, marcaría el centrómero o una secuencia en el brazo opuesto del
mismo cromosoma. Sin embargo, la investigación de una secuencia en cromosomas acrocéntricos no
puede utilizar la estrategia del brazo opuesto para los controles; por lo tanto,
Usando estas sondas hipotéticas, las nuevas interpretaciones de patrones de señal se convierten en:
Llevando este escenario un paso más allá, tres señales rojas de igual tamaño, pero solo dos señales centroméricas verdes (3R2G),
podrían indicar la presencia de un isocromosoma para el brazo largo del cromosoma 21, lo que también indicará un resultado positivo
para el síndrome de Down. Se necesitarían estudios de los padres para determinar si el isocromosoma se hereda.
Dependiendo de la situación y el tipo de muestra, la interpretación de la señal también puede requerir que se
apunte a un locus de control en un segundo cromosoma. Por ejemplo, usar la misma sonda marcada en rojo para
apuntar a la región DSCR para un estudio prenatal en núcleos de líquido amniótico, pero esta vez usando una señal
verde para apuntar a un locus (o centrómero) en un segundo cromosoma, por ejemplo, cromosomas 13, un resultado
positivo para el síndrome de Down mostraría tres señales rojas para el locus DSCR, pero solo dos señales verdes para el
gen en el cromosoma 13 (3R2G). Un patrón de señal 3R3G podría indicar trisomía para ambos objetivos, los
cromosomas 13 y 21, pero en la vida real, esa situación es poco probable y probablemente no viable. Lo que es
probable y podría ser viable es que el feto puede tener tres juegos de cada cromosoma (triploide),
A veces, la selección de la sonda debe ser creativa para confirmar una reordenación. Por ejemplo, suponga que se observa un patrón de señal
3R2G en el 20% de los núcleos en interfase, utilizando una señal roja para apuntar a una secuencia en el brazo largo del cromosoma 17 y un
control verde para apuntar a la región centromérica del cromosoma 17. Si un tercero Se agrega color, por ejemplo, aguamarina (A), que apunta a
un locus en el brazo corto del cromosoma 17, y solo está presente una señal para el brazo corto (3R2G1A), además de tres señales rojas para el
brazo largo del cromosoma 17 (3R) y dos señales verdes para los centrómeros del cromosoma 17 (2G), el patrón sugiere que un homólogo no
tiene un brazo corto y dos copias idénticas del brazo largo, por lo tanto, un isocromosoma.
410 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
La investigación de reordenamientos estructurales, por ejemplo, traslocaciones e inversiones, introduce dos estrategias de sonda
adicionales, sondas de ruptura (BAP) y de fusión (F). Una sonda BAP marcará las secuencias proximales y distales de un punto de ruptura
conocido con colores de señal rojo y verde, creando dos colores de señal de fusión amarillos (2F) cuando las secuencias normales están presentes
en ambos homólogos. Cuando la muestra es positiva para una inversión, el color de fusión amarillo se dividirá en señales individuales rojas y
verdes (1R1G1F). La estrategia de fusión, por otro lado, comenzará con un patrón normal de loci separados marcados con rojo y verde (2R2G).
Cuando se produce una translocación, el color de fusión amarillo se creará mediante la fusión de los dos puntos de interrupción diferentes ahora
en yuxtaposición. Dependiendo del posicionamiento de la etiqueta, las estrategias de fusión pueden ser de fusión única (SF), que aparecerá
1R1G1F cuando sea positivo; fusión dual (DF), que aparecerá como 1R1G2F cuando sea positiva; y extra-señal (ES), que aparecerá como 1R1r1G1F,
con la pequeña señal roja (r) verificando la señal de fusión (ver Capítulo 16, Figura 16.7).
Se espera que varíen algunos tamaños de señal de sonda; otros no lo son. Las sondas centroméricas, por ejemplo, se dirigen a secuencias altamente
repetitivas que muestran naturalmente variación dentro de la población normal; por lo tanto, se espera una variabilidad de tamaño con estas sondas
[33]. El tejido incluido en parafina también plantea un desafío, porque es un segmento cortado de un bloque tumoral; por lo tanto, las señales se pueden
truncar. Sin embargo, las secuencias genéticas únicas deberían tener un tamaño relativamente consistente para ambos homólogos; por lo tanto, cualquier
variación de tamaño puede requerir una mayor investigación.
El nombre de la sonda que se utiliza dentro del cariotipo (que generalmente lo proporciona el fabricante cuando se compra) se puede derivar de
los siguientes recursos:
■ Investigacion o nombre del clon: por ejemplo, N85A3 [35] se dirige a la región subtelomérica en el brazo largo del
cromosoma acrocéntrico 22 en 22q13.3, la región asociada con el síndrome de Phelan-McDermid (PMS) [36] (ver Capítulo 9,
Tabla 9.1). También se utiliza como control interno cuando se investiga la región crítica de DiGeorge (DGCR) más proximal
en 22q11.2.
■ Cuando el nombre del clon no está disponible, el locus designadoen orden trimestral) se puede utilizar desde UCSC actual
([Link]) o desde Ensemble ([Link]/) Genome Browsers [1, sección 13.2].
■ Organización del genoma humano (HUGO) el nombre del gen aprobado ([Link]‐[Link]/): por ejemplo, MI C
(homólogo del oncogén viral de mielocitomatosis c ‐ myc, aviar), se encuentra en el cromosoma 8 en 8q24 [37]; ABL1 (oncogén c ‐ abl
1, tirosina quinasa no receptora) se encuentra en el brazo largo (q) del cromosoma 9 en q34.1 [38]; suBCR (región de clúster de punto de
ruptura) la contraparte está en el brazo largo del cromosoma 22 en q11 [39].
Aunque se prefiere el nombre del clon, cualquiera de estas opciones de denominación (nombre de la sonda, nombre del clon, nombre del gen, número de acceso o
nombre D) se puede utilizar a discreción del investigador o director del laboratorio [34]. A diferencia de los nombres de genes humanos, los nombres de las sondas no
están en cursiva cuando se escriben en el texto o en la fórmula del cariotipo [1, sección 13.2]; sin embargo, los nombres de los genes tampoco están en cursiva dentro del
cariotipo.
Cuando una sonda se compone de múltiples loci contiguos, todos los nombres de las sondas se pueden incluir en el cariotipo en orden pter a
qter, separados por barras diagonales, sin espacios, o se puede usar una sola persona designada en el cariotipo para representar todos los loci
dentro el informe final. Por ejemplo, D21S259 / D21S341 / D21S342 describe las secuencias genéticas contiguas de 21q22.13 a 21q22.2, que se
dirigen en el ensayo prenatal de Abbott Molecular Inc. para la detección de aneuploidías del cromosoma 21 [40]. Sin embargo, si las sondas
utilizan nombres de genes HUGODSCR3 y DSCR4 en 21q22.2 [41], una sola persona designada, por ejemplo, DSCR para regiones críticas del
síndrome de Down, puede usarse en el cariotipo, y su composición completa se describirá en el informe final [1, sección 13.3].
sin espacio
46, XY, del (22) (q11.2q11.2). ish del (22) (D22S75–, N85A3 +). sin espacio nuc ish (D22S75x1, N85A3x2)
1 2 3 4 5
6 7 8 9 10 11 12
13 14 15 dieciséis
17 18
19 20 21 22 X Y
46, XY, del (22) (q11.2q11.2) .ish del (22) (D22S75–, N85A3 +). Nuc ish (D22S75 × 1, N85A3 × 2)
Cuando se realizan múltiples pruebas en la misma muestra, se usa un período para separar cada prueba. estas pruebas se describen en el siguiente orden:
citogenética clásica, FISh de metafase, FISh de interfase / nuclear y análisis de microarrays de cromosomas. Los cariotipos neoplásicos incluirán el recuento de
células entre paréntesis al final de cada prueba. Consulte el inserto para ver la representación del color de esta figura.
separando cada grupo cohibridizado, pero sin espacios. ISCN 2016 declara, “Solo los resultados clínicamente relevantes o informativos deben
estar en el cariotipo” [1, sección 13.2]; por lo tanto, se puede omitir la sonda de control para 22q13.3 (N85A3). Cualquiera de las opciones de
cariotipo es aceptable [1, sección 13.2], porque el informe final aún definirá todas las sondas que se utilizaron.
Cuando aparece el cromosoma objetivo estructuralmente anormal, el cariotipo utilizará los símbolos más (+) o menos (-) para
representar las señales presentes o faltantes para el locus que se está interrogando. El cariotipo definirá la anomalía encontrada,
seguida del nombre de la sonda y un signo más (+) para una presencia normal, un signo menos (-) para ausencia y un doble más (++)
para duplicación. Cuando se puede contar el número de señales en el cromosoma estructuralmente anormal, se pueden usar múltiples
signos “+” [1, 13.2]. Las sondas cohíbridas se enumeran en el mismo paréntesis, separadas por una coma, sin espacios.
Los estudios neoplásicos deben examinar un mayor número de núcleos y no depender de células en división; por lo tanto, generalmente se
prefiere el FISH en interfase. Sin embargo, incluimos el siguiente ejemplo para demostrar cómo se construyen los cariotipos neoplásicos FISH en
un cariotipo FISH en metafase. La fórmula básica es la misma que en el ejemplo anterior, excepto que los estudios neoplásicos incluirán el
recuento total de células entre corchetes, por ejemplo, [20], al final del cariotipo cuando se observó el mismo número de señales para todos los
FISH en metafase células examinadas, o al final de cada sesión de hibridación si los recuentos de células varían.
MI C gen después de la sonda de control del centrómero. El segundo ejemplo puede omitir la sonda de control porque no agrega información adicional
relevante [1, 13.2]. Cualquiera de las dos opciones es aceptable.
47, XX, + 8 [20] .ish 8cen (D8Z2 × 3), 8q24.1 (MYC × 3) [20]
Los resultados anormales de FISH en metafase mostraron tres señales tanto para el loci objetivo como para el
control (3R3G), lo que indica un cromosoma 8 adicional. apariencia estructuralmente normal cromosomas 8,
se utiliza la notación × 3 en lugar de ++ [1, 13.2].
La aneuploidía del cromosoma sexual en la metafase constitucional FISH no describe el cromosoma X o Y extra o
faltante con un signo más o menos. Usando la sonda centromérica DXZ1, el cariotipo FISH en metafase para una mujer
normal se escribiría 46, [Link] Xcen (DXZ1×2). Un cariotipo FISH metafásico del síndrome de Turner se escribiría 45, [Link]
Xcen (DXZ1×1), y una X adicional sería 47, [Link] Xcen (DXZ1×3).
Además de identificar la ausencia o presencia de una secuencia genética o un cromosoma completo, se han diseñado diferentes arquitecturas de
sonda para identificar reordenamientos estructurales que están asociados con condiciones neoplásicas específicas. Estos pueden involucrar el
mismo cromosoma, diferentes cromosomas o incluso homólogos cromosómicos. Las estrategias de sonda de fusión simple (SF), dual (DF) y
extraseñal (ES) se dirigen a los loci que se sabe que, bajo ciertas condiciones neoplásicas, se yuxtaponen por reordenamiento, como a través de
una translocación o inversión.
Usando la t (9; 22) BCR / ABL1 translocación (ver 8.5.12, Translocación recíproca) para demostrar esta estrategia FISH, SF
FISH (1R1G1F) generalmente se dirigirá al ABL1 secuencia con una etiqueta roja en ambos homólogos del cromosoma
9, y la región proximal a la BCR secuencia con una etiqueta verde en ambos homólogos del cromosoma 22. Debido a
que la etiqueta verde proxi- mal en SF FISH permanece estacionaria cuando se ha producido una translocación, una
celda que es positiva para elBCR / ABL1 translocación emitirá un color de fusión amarillo en el punto donde la etiqueta
roja ABL1 gen se ha yuxtapuesto a la etiqueta verde BCR gen en el cromosoma derivado 22. Los dos homólogos no
involucrados emitirán un tono rojo (cromosoma 9 normal) y una señal verde para el otro (cromosoma 22 normal). El
cromosoma 22 derivado mostrará la señal amarilla fusionada (BCR +, ABL1 +), y el cromosoma 9 derivado no tendrá
etiqueta (ABL1–).
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 413
Las metodologías de sonda DF y ES se utilizan predominantemente en tejido neoplásico que requiere un gran número de núcleos para detectar
niveles bajos de reordenamiento; por lo tanto, el uso de cromosomas en metafase no es generalmente aplicable para esta estrategia [Link]
2016 [1], sin embargo, proporciona la capacidad de informar los resultados de la metafase; por lo tanto, se incluye aquí.
ish t (9; 22) (q34; q11.2) (ABL1 +, BCR +; BCR +, ABL1 +) [20]
Este cariotipo demuestra un resultado positivo de DF FISH, con una señal de fusión en ambos compañeros de translocación. El lado
estacionario proximal delABL1 La secuencia se enumera antes de la translocada. BCR segmento para el cromosoma 9; Asimismo, el
estacionarioBCR segmento en el cromosoma 22 en q11.2 se enumera antes de su yuxtaposición ABL1 Secuencia 9q34. Un punto y coma
separará las descripciones de los cromosomas 9 y 22.
ish der (9) t (9; 22) (q34; q11.2) del (9) (q34q34) (ASS1‐, ABL1‐, BCR +), der (22) t (9; 22) (BCR +, ABL1 +) [20]
Los resultados tricolor, DF, ES mostraron una microdeleción dentro de la región 9q34 del cromosoma 9 derivado que estaba involucrado en el
reordenamiento t (9; 22). Los resultados muestran la ausencia de ambosASS1 y ABL1 secuencias en el cromosoma derivado
9, pero la presencia de los desplazados BCR segmento del cromosoma 22. Su socio, el cromosoma 22 derivado, es positivo
para el BCR / ABL1 yuxtaposición. La derivada 22 no necesita repetir los puntos de corte previamente definidos en el cario-
tipo (ver 8.3.8, Descripción repetida) [1, sección 13.2].
A diferencia de las sondas específicas de locus, las pinturas de cromosomas completos (wcp) [1, sección 13.2] colorean todo el cromosoma, lo que hace que
un reordenamiento que involucre cualquier parte de ese cromosoma sea rastreable. Por ejemplo, las pinturas de cromosomas completos pueden verificar el
destinatario de una supuesta translocación equilibrada en estudios constitucionales, especialmente si no se detecta fácilmente a una pareja.
Otras opciones similares de FISH incluyen pinturas de cromosomas parciales (pcp) [1, sección 13.8], pinturas FISH subteloméricas [1, sección
13.2.2] y multicolores [1, sección 13.7], que también brindan la capacidad de rastrear por color el desplazamiento de segmentos cromosómicos.
Las pinturas de cromosomas parciales, por ejemplo, pueden verificar la presencia, ausencia, duplicación o desplazamiento de una región micro
disecada en cuestión, y están escritas en formato de cariotipo similar a wcp. El FISH multicolor (cariotipo espectral o SKY y multiplex ‐ FISH o M ‐
FISH; consulte el Capítulo 17) proporciona una imagen de todo el genoma de las anomalías citogenéticas en un solo experimento, lo que ayuda a
conectar las piezas de reordenamientos intercromosómicos múltiples y complejos en el tejido neoplásico . Esta técnica no tiene una
nomenclatura especial y, por lo tanto, también se basa en el formato wcp. Subtelomere FISH (ish subtel) se dirige a 41 extremos subteloméricos
cromosómicos únicos [1, sección 13.2.2]. Todas estas pruebas, y más, se han ganado un lugar bajo el paraguas de FISH.
cohibridación. Cada conjunto cohibridado está separado por una coma (sin espacios) de otros conjuntos, y todos los conjuntos se enumeran en
orden de prioridad de cariotipo estándar, según el orden de los cromosomas en la primera lista en X antes de Y antes del autosoma más bajo, o
pter (p-arm terminal) al orden qter (terminal del brazo q) cuando se dirigen a loci en el mismo cromosoma (ver 8.3.7, Prioridad de orden de
cariotipo). La ubicación precisa de la banda tanto para la sonda de investigación como para sus valores de corte normales se definirían por
separado en el texto del informe final. Los recuentos de señales se escriben entre paréntesis cuando solo se describe una sonda o cuando las
sondas cohibridizadas muestran diferentes recuentos de señales; si los recuentos son los mismos y se describe más de una sonda entre
paréntesis, el signo de la hora (x) y el número de señales se colocan fuera pero junto al paréntesis de cierre. Si los resultados son normales, se
pueden combinar múltiples hibridaciones en un solo conjunto de paréntesis. [1, sección 13.3.1]
46, XX, del (22) (q11.2q11.2) .ish del (22) (D22S75‐, N85A3 +).nuc ish (D22S75 × 1, N85A3 × 2)
Los resultados anómalos de FISH citogenético, metafásico y de interfase para la microdeleción de DiGeorge (1R2G) en el brazo largo del
cromosoma 22 en q11.2 muestran una señal de D22S75 (1R) para la región crítica de DiGeorge (DGCS) y dos señales para la controlar el N85A3
(2G) que se dirige a la región del subtelómero en el mismo cromosoma (ver Figura 8.27). Los recuentos de señales se colocan entre paréntesis
cuando varían entre objetivos cohibridados. Los estudios constitucionales no requieren el recuento total de células entre corchetes, a menos
que los patrones de señales muestren mosaicismo notificable.
La sonda de fusión y su arquitectura BAP FISH opuesta deben cambiar el formato del cariotipo para adaptarse a la descripción de la
señal de fusión formada o rota, respectivamente. Un cariotipo de fusión en interfase anormal coloca los nombres de las sondas y el
recuento total de señales en el primer paréntesis, seguido de un paréntesis contiguo que definirá cuántas señales de fusión se
observaron a partir de esas señales independientes (consulte la Figura 8.29).
Metafase
der (22)
22 22
22
9 9 der (9)
9
1R1G2F Anormal,
2R2G Normal
Fusión dual (DF)
INTERFASE
1R1G2F Anormal,
2R2G Normal Fusión dual (DF)
La estrategia BAP funciona a la inversa de la sonda de fusión descrita anteriormente, donde el símbolo de fusión estafa representa la
configuración normal de la sonda y el símbolo de separación sep indica el patrón anormal. Para las sondas BAP, las dos señales se
colocan normalmente en dos posiciones adyacentes en el mismo cromosoma, emitiendo así un color de fusión en condiciones
normales. Cuando se observa una separación como resultado de una reordenación, se verán distintas señales rojas y verdes en lugar
del color de fusión amarillo. Ver una célula en metafase puede ayudar a determinar si las señales residen en el mismo cromosoma, lo
que indica que una inversión ha separado las señales, o si aparecen en diferentes cromosomas, en particular, su homólogo, lo que
indica que se ha producido una translocación.
416 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
F GRAMO
2F (normal) 1R1G1F
(Reorganizado)
Cuando la inversión se verifica tanto por la citogenética clásica como por FISH en metafase, se utiliza el formato de cariotipo FISH detallado para
describir el cromosoma en orden pter a qter.
46, XY, inv (16) (p13.1q22).ish inv (16) (p13.1) (5′CBFB +) (q22) (3′CBFB +) [20] .nuc ish (CBFB × 2) (5′CBFB 3 de septiembre′CBFB × 1) [200]
Como resultado de una inversión, este 3′ final de la sonda CBFB ubicada en 16q22 ahora comenzará el cariotipo detallado. El
cariotipo debe mostrar que los dos extremos de la sonda se han separado para demostrar que se ha producido la inversión [1,
secciones 13.2, [Link]].
Debido a que la metodología de FISH ha evolucionado durante las últimas dos décadas, las opciones de cariotipo anteriores aún se pueden usar
con la aprobación del director, siempre que el formato sea comprensible para los genetistas a nivel internacional y toda la información esencial
esté incluida en el informe. La clave de cualquier cambio es la comprensión global entre los genetistas.
Para introducir el concepto de escribir el cariotipo FISH de interfase / nuclear utilizando múltiples hibridaciones,
demostraremos un panel FISH prenatal para detectar aneuploidías para los cinco síndromes aneuploides más comunes
(cromosomas sexuales X e Y, y autosomas 13, 18 y 21 ). La hibridación se realiza en núcleos no cultivados que se separaron del
líquido amniótico.
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 417
B GRAMO
R GRAMO GRAMO
R
B
R
nuc ish (DXZ1 × 1, DYZ3x1, D18Z1 × 2), (RB1, D21S259 / D21S341 / D21S342) × 2
(Izquierda) Patrón masculino normal para sondas centroméricas dirigidas al cromosoma 18 (2a), una X (1G) y una Y (1r). Si el resultado es femenino, el patrón no
mostrará ninguna señal Y roja y dos señales X verdes (2G). Nota: Las sondas centroméricas pueden mostrar una diferencia de tamaño debido a la variación
heteromórfica normal de ese DNa repetitivo. (derecha) Patrón normal para objetivos específicos de locus para los cromosomas 13 (2G) y 21 (2r). Nota: La
variación en los tamaños de las sondas específicas del locus podría indicar una deleción o duplicación y puede requerir una mayor investigación. Consulte el
inserto para ver la representación del color de esta figura.
En la figura 8.31 se muestran dos hibridaciones separadas. La primera incluye tres regiones centroméricas: DXZ1 (centrómero X en verde), DYZ3 (centrómero
Y en rojo) y D18Z1 (centrómero 18 en agua). Los tamaños de las sondas centroméricas pueden variar debido a su estructura de ADN altamente repetitiva y
también pueden parecer difusos; por lo tanto, tamaños de señal inusualmente pequeños o grandes pueden seguir siendo heteromorfismos normales. Las
sondas utilizadas en este conjunto cohibridado se enumerarán en el orden de cariotipo estándar, es decir, X antes de Y antes del autosoma 18.
El segundo conjunto utilizará dos secuencias genéticas específicas, RB1 (13q14) en verde que apuntará al cromosoma 13 en q14, y
tres loci de sonda contiguos en rojo (D21S259 / D21S341 / D21S342) para apuntar a la región crítica del síndrome de Down de 21q22.13
a 21q22.2 (ver 8.10.3, Nombre de la sonda) . Organizados en orden creciente de números autosómicos, cromosoma 13
RB1- la señal de destino se enumerará antes de los loci contig del cromosoma 21, por ejemplo, (RB1, D21S259 / D21S341 / D21S342)×2,
con la cantidad de señal (× 2) descrita fuera del paréntesis cuando todas las sondas enumeradas dentro del paréntesis mostraron el
mismo número de señales por sonda.
Siguiendo la prioridad de orden de cariotipo estándar, basada en el cromosoma listado en primer lugar dentro de cada grupo de cohibridación, el
conjunto que tiene la sonda del cromosoma sexual X como la primera lista se describirá antes del conjunto de cohibridación con la primera sonda de la lista
dirigida al locus en el autosoma 13 (RB1). Los paréntesis concurrentes en una cadena de hibridaciones están separados por comas, pero sin espacios, similar
a una cadena de eventos citogenéticos (ver 8.3.7, Orden de prioridad del cariotipo). Por tanto, los dos conjuntos cohibridados se colocarán en el siguiente
orden: (DXZ1, DYZ3, D18Z1), (RB1, D21S259 / D21S341 / D21S342). Los cariotipos que se describen a continuación muestran algunos de los posibles
resultados normales y anormales que se pueden observar con este conjunto de sondas.
nuc ish (DXZ1×1, DYZ3x1, D18Z1x2) (rB1, D21S259 / D21S341 / D21S342) × 2 hombre normal
núcleos (DXZ1×2, D18Z1×2), (rB1, D21S259 / D21S341 / D21S342) × 2 nuc ish ( mujer normal
DXZ1 × 2, DYZ3 × 1,D18Z1×2), (rB1, D21S259 / D21S341 / D21S342) × 2 núcleos 47, XXY Klinefelter
macho (DXZ1 × 1,D18Z1×2), (rB1, D21S259 / D21S341 / D21S342) × 2 núcleos 45, X turner hembra
(DXZ1×1, DYZ3×1,D18Z1 × 3), (rB1, D21S259 / D21S341 / D21S342) × 2 núcleos trisomía 18 masculina
(DXZ1×2, D18Z1)×2, (RB1 × 3,D21S259 / D21S341 / D21S342 × 2) núcleo (DXZ1×2, trisomía 13 femenina
nuc ish (DXZ1× 2,DYZ3× 1,D18Z1× 3), (rB1, DSCr) ×3 macho triploide
418 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
Cuando los estudios de citogenética clásica, FISH en metafase y FISH en interfase se informan en un cariotipo, se utilizan puntos para separar las
tres cadenas de prueba.
46, XX, t (9; 22) (q34; q11.2) [20] .ish t (9; 22) (ABL1 +, BCR +; BCR +, ABL1 +) [15/20] .nuc ish (ABL1, BCR) × 3 (ABL1 con
BCR × 2) [190/200]
Negativo (no amplificado) = relación de señal HER2 / CEP17 <2.0 (anteriormente ≥2.2) y señal HER2 promedio <4.0.
Equivocado =Relación de señal HER2 / CEP17 <2.0 y señal HER2 promedio ≥4.0 y <6.0.
Positivo (amplificado) = relación de señal HER2 / CEP17 ≥2.0, o señal HER2 promedio ≥6.0, o ambos. Por lo tanto, estas pautas incluirían
la situación poco común en la que la relación de señal HER2 / CEP17 es ≥2.0,PERO la señal de HER2 promedio es <4.0, como positiva
para la amplificación de HER2.
Debido a que la relación HER2 / CEN17 se informa con un solo punto decimal, las reglas de redondeo dependerán del segundo y los
siguientes dígitos decimales.
■ Si el segundo dígito decimal es <5, deje el primer dígito como está (1,94999 = 1,9).
■ Si el segundo dígito decimal es> 5, aumente al siguiente dígito (1,96000 = 2,0). De manera similar, si el segundo dígito es 5, pero va seguido
de cualquier número entero que tenga un valor distinto de cero, aumente al siguiente dígito (1.95001 = 2.0).
■ Si el segundo dígito = 5 y no hay dígitos siguientes o los dígitos siguientes son ceros, el primer dígito decimal se redondea al más
cercano. incluso número; por lo tanto, 1.95000 se convertiría en 2.0, pero 1.85000 seguiría siendo 1.8.
El informe debe incluir el número medio total por sonda y su relación de señal comparativa.
Se observaron dos copias de ambas señales en los 20 núcleos examinados dentro de las regiones tumorales objetivo. Siguiendo el orden paq,
el centrómero del cromosoma 17 viene antes que 7q12; por lo tanto, la sonda centromérica (D17Z1) para el cromosoma 17 se colocaría antes
del objetivoERBB2 locus en 17q12. Dado que ambos patrones de señal muestran el mismo número de objetivos, el número puede colocarse
fuera del paréntesis. La relación HER2 / CEP17 de 1.0 cae dentro del rango no amplificado, que tiene un límite de 2.0 para la amplificación. Sin
embargo, esta proporción por sí sola no puede proporcionar una interpretación de las guías actuales, porque un rango de HER2 de ≥4.0 y
<6.0 elevaría el diagnóstico a equívoco, incluso si la proporción HER2 / CEP17 es <2.0. En este ejemplo, sin embargo, la relación de HER2 es 2,0
y la muestra es negativa para la amplificación.
(a) (B)
ERBB2 / CEN 17
(a) amplificación de la ERBB2 locus con dos señales centroméricas D17Z1 (verde) del cromosoma 17. (b) Tumor de mama invasivo con señales de
erBB2 amplificadas junto con tejido no amplificado. Consulte el inserto para ver la representación del color de esta figura.
Sin un rango, este cariotipo establece que cada núcleo examinado mostró seis señales tanto para el centrómero del cromosoma 17 como
para el locus del gen objetivo. ERBB2 en 17q12. Esto se traduce en una relación de 1,0 de las señales D17Z1 a ERBB2, que se encuentra dentro
del rango no amplificado (<2,0); sin embargo, de acuerdo con las guías actuales de ASCO-CAP 2013, la proporción de 6,0 de señales de HER2
por núcleo se encuentra dentro del rango amplificado (corte ≥6), lo que hace que esta muestra sea positiva para la amplificación [44].
El símbolo de amplificación (amp) [1, sección 13.3.1] se utiliza cuando los núcleos muestran tantas copias de un solo locus que su número de
copias no puede cuantificarse de forma fiable (véase la figura 8.32). Aunque se asocia más comúnmente con una presencia de señal ERBB2
anormal en el tejido tumoral de mama incluido en parafina, también se ha identificado con otras situaciones neoplásicas [1, sección 13.3.2].
Este ejemplo es el único cariotipo en este género que proporciona un nivel de conclusión interpretativa dentro del cariotipo, pero el informe
aún debe confirmar todos los resultados al incluir todas las proporciones requeridas.
El análisis FISH in situ en tejido incluido en parafina depende en gran medida de la capacidad del lector para seleccionar núcleos malignos entre el tejido
circundante potencialmente normal; Por lo tanto, se aplican normas especiales para estas pruebas, incluida la participación del patólogo.
420 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
en la localización de las regiones objetivo. La pérdida de la topografía del tejido también complica la relación entre la imagen fluorescente y el
portaobjetos teñido con H&E (hematoxilina y eosina). Debido a estos inconvenientes, se han desarrollado alternativas de hibridación in situ
cromogénica (CISH) y mejorada con plata (SISH) que utilizan dos colores bajo microscopía de campo claro. Las ventajas de estos procedimientos
incluyen el uso de microscopios de campo claro internos en lugar de equipos de fluorescencia, y portaobjetos montados y teñidos
permanentemente [45].
Un cariotipo de trasplante de médula ósea utiliza su propio formato único para informar comparaciones de células receptoras /
donantes. El cariotipo del receptor se coloca a la izquierda de la doble barra (//), sin espacios, y el cariotipo del donante se coloca a la
derecha de la doble barra [1, sección 4.1]. Los siguientes ejemplos suponen que un receptor masculino con una translocación t (9; 22)
recibió un trasplante de médula ósea de una donante.
46, XY, t (9; 22) (q34; q11.2) [20] //- solo estaban presentes las células del paciente que portaban la translocación t (9; 22).
46, XY, t (9; 22) (q34; q11.2) [1] / 46, XY [5] // 46, XX [14] - se encontraron tres líneas celulares: una celda mostró el cariotipo masculino del
paciente (receptor) con la t (9; 22); cinco células mostraron células masculinas normales, también del paciente; y 14 células eran células
donantes femeninas normales. La t (9; 22) solo se observó en una celda, que no cumple con los estándares notificables por sí misma (ver 8.8,
Aleatorio versus notificable); sin embargo, debido a que la translocación se informó anteriormente en la médula ósea del paciente, no solo se
notificaría, sino que también se enumeraría en primer lugar, aunque solo se observó en una celda. Esta única célula podría reflejar una
enfermedad residual [1, sección 11.1.6].
// 46, XX [20] - solo se encontraron células de donantes femeninas. Debido a que no había células receptoras presentes, el cariotipo comienza con barras.
1. Si los resultados son normales, el cariotipo enumerará los autosomas primero, seguidos de los cromosomas sexuales, separados por una
coma. Los números de copia se colocan fuera del paréntesis. Por ejemplo, una mujer normal se escribiríaarr (1‐22, X) × 2 y un normal
masculino arr (1‐22) × 2, (X, Y) × 1.
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 421
2. Si los resultados son anormales, solo se enumeran las aberraciones, del cromosoma más bajo al más alto, y las anomalías de los cromosomas sexuales se enumeran en
3. Al definir los límites de nucleótidos, ISCN 2016 (1) eliminó las comas dentro del número de nucleótido y reemplazó el guión con un
guión bajo (_) para indicar el intervalo de nucleótidos afectados. Como se explica enISCN 2016, estos cambios están “en línea con la
nomenclatura genética molecular descrita por las recomendaciones de la Human Genome Variation Society (HGVS) ([Link]/
varnomen)” [1, Sección 14.1, p. 115].
4. Cuando se usan números de nucleótidos para definir un resultado anormal, la construcción del genoma especificada, por ejemplo, GRCh38, que significa ensamblaje de
Generación humana 38 del Consorcio de referencia del genoma, se coloca directamente detrás del símbolo de la matriz entre paréntesis, por ejemplo, arr [GRCh38],
generalmente seguido de un espacio. Sin embargo, la construcción del genoma específico no es necesaria cuando se describe un resultado masculino o femenino
5. Si la anomalía requiere un símbolo de herencia (dn, mat, pat, inh), un espacio precederá a ese símbolo, excepto cuando siga un
paréntesis en el formato detallado.
6. Cuando se escribe con otros cariotipos citogenéticos o FISH, el cariotipo de matriz se separará de la prueba anterior por un
punto; un espacio separará el símbolo arr de un número o letra de cromosoma sucesivo, pero no si va seguido de un
paréntesis o un corchete.
Los microarrays solo pueden demostrar ganancias o pérdidas de ADN; por lo tanto, el análisis del cariotipo FISHor es necesario para
demostrar la estructura de la mayoría de las anomalías. El cariotipo arr puede incluir posiciones de bandas cromosómicas si se usa junto con
el análisis cromosómico (1, sección 14.2).
7. Los cariotipos para poblaciones de células mixtas pueden incluir la proporción estimada entre paréntesis después del número de copia. Por
ejemplo,arr (X) x1 [0.3] muestra la pérdida de una sola copia del cromosoma X en el 30% de la población celular analizada. No es necesario
mostrar resultados normales o la construcción del genoma específico [1, sección 14.1] cuando se describe la aneuploidía mediante la
descripción breve.
La portada de este manual demuestra el avance de la investigación que ha llevado a la citogenética a la era de la citogenómica.
Las cuatro figuras contribuyen a la imagen citogenómica: una célula con banda G y su cariograma posterior, detección de FISH
para la microdeleción, y matriz (ver Figura 8.33) y matriz de SNP (polimorfismos de un solo nucleótido) para calificar la
extensión molecular de la deleción. e identificar cualquier cigosidad críptica, ya sea homocigótica (hmz) o heterocigota (htz).
Cada prueba trae consigo información sobre los misterios del citogenoma.
Los cariotipos anormales enumerarán solo las aberraciones, definiendo el alcance de una pérdida o ganancia en relación con sus límites de
nucleótidos relativos. “Se pueden enumerar múltiples nucleótidos, separados por comas, o se puede usar un guión bajo para indicar que la
ganancia o pérdida abarca el segmento entre los clones enumerados” [1, sección 14.2, p. 116].
Los ensayos de región específica (rsa) se utilizan para cuantificar el número de copias de un locus particular, o un conjunto limitado de loci, en
lugar de todo el genoma. Una rsa puede incluir amplificación de sonda multiplexada dependiente de litigio (MLPA), ensayos cuantitativos
fluorescentes o basados en PCR en tiempo real, o algunos ensayos basados en perlas. Estos ensayos de base molecular determinan el número
de copias de un cromosoma o región cromosómica, o pueden verificar una anomalía detectada por otra prueba. Si se utiliza un kit y se
desconocen las coordenadas genómicas, se puede utilizar el nombre del kit; sin embargo, es más preciso proporcionar números de nucleótidos.
46, [Link] del (22) (q11.2q11.2) (D22S75 × 1, N85A3 × 2) .rsa 22q11.2 (D22S75) × 1
Un cariotipo femenino normal mediante análisis citogenético se encontró anormal mediante un ensayo específico de región y se confirmó mediante FISH
en metafase para la detección de la región crítica de DiGeorge en 22q11.2. Si se usara un kit, su nombre podría usarse en el cariotipo anormal, antes del
resultado del número de copia anormal, por ejemplo,rsa 22q11.2 ('nombre del kit') × 1.
Las translocaciones se pueden escribir con el mismo símbolo de dos puntos (ruptura :: reunión) que se usa en el cariotipo citogenético detallado. Usando la
translocación 9; 22, un resultado positivo por un ensayo específico de región describiría la reordenación comorsa (BCR :: ABL1) pos.
Concluiremos esta sección creando un cariotipo para el caso que se muestra en la portada de este manual. El análisis de cromosomas con bandas
G mostró una posible deleción sospechosa dentro del brazo largo (q) del cromosoma 21, pero era demasiado críptico para informar sin
verificación. Usando una sonda BAP (fusión de separación-amarilla) (VIJyRM2029) para apuntar a la región subtelomérica 21q22.3 bajo
investigación, y una sonda de control de agua (RUNX1) para marcar un locus en el lado proximal del objetivo en 21q22.2, FISH en metafase
verificó que se eliminó la región objetivo (señal amarilla fusionada) en un homólogo. La interfase nuclear FISH verificó que
422 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
Figura 8.33 Microarray identifica una deleción de 3,3 Mb de la región subtelomérica del cromosoma 21 en q22.3. Harrison, Rikki. Cosquillas cerebrales.
JAGT, 2Dakota del Norte Trimestre de 2016; 42 [2], pág. 18. Consulte el inserto para ver la representación del color de esta figura.
no había presente el mosaicismo. El microarray identificó los nucleótidos faltantes y estimó que la deleción era de 3,3 Mb, un tamaño que es
difícil de detectar con la citogenética de rutina (ver Figura 8.33). Con estas confirmaciones, se podría informar la eliminación.
Si la deleción no se hubiera detectado inicialmente mediante análisis citogenético, se volverían a visitar las células. Después de una mirada
más cercana, si el tecnólogo determina que la deleción es reconocible, se informaría en el cariotipo citogenético o podría modificarse si se
informó previamente como normal. Sin embargo, si después de volver a visitarlo, aún no se pudo detectar, la eliminación no se informaría en la
sección de citogenética del cariotipo.
Aunque pequeña, la eliminación en nuestro ejemplo fue reconocible con G-banding (ver portada); por lo tanto, ahora se incluiría en
el cariotipo. Por otro lado, debido a que la interfase nuclear FISH no detectó mosaicismo, su inclusión no ofrece ninguna información
nueva y, por lo tanto, no se incluiría en el cariotipo, pero se mencionaría en el informe. Vale la pena señalar, sin embargo, que según los
estándares actuales, no es técnicamente "incorrecto" si se elige incluirlo dentro del cariotipo; se colocaría después de los resultados de
FISH en metafase.
El cariotipo final se escribe así:
46, XY, del (21) (q22.3) .ish del (21) (q22.3) (RUNX1 +, VIJyRM2029 -). Arr [GRCh37] 21q22.3 (44775092_48090352) × 1
En el entorno actual “fácil de usar”, los informes FISH finales pueden depender menos del ISCN y más de la conformidad con otros formatos de
informes de laboratorio que son más familiares para el médico no genético. Pero para el genetista, una línea de la fórmula ISCN proporciona toda
la información necesaria que tomaría una página completa para ser descrita para profesionales no genéticos.
8.12 Conclusión
Para aprender un nuevo idioma, uno debe comprender el alfabeto simbólico y su vocabulario para poder comunicarse de manera
efectiva en ese idioma. También lo es ISCN, una serie de descripciones formadas por símbolos y fórmulas (ver Tabla 8.5). Saber cómo
escribir un cariotipo requiere práctica, pero si el técnico puede recordar la imagen que se describe, puede darse cuenta de que este
lenguaje es tan lógico como su imagen original.
Expresiones de gratitud
Los creadores de ISCN fueron asombrosamente progresistas. Estamos eternamente agradecidos con estos genetistas intuitivos y con la
Fundación March of Dimes por apoyar una especialidad que alguna vez fue incipiente en un brazo central de la medicina. También expresamos
nuestro más sincero agradecimiento a los editores de S. Karger por proporcionar una parte de los ingresos de las ventas de libros de ISCN para
ayudar a financiar las reuniones del comité y el trabajo asociado con la preparación de las nuevas ediciones de ISCN. Agradecemos a Su Yang por
su amable revisión, a Ricki Harris por su interesante caso y a Helen Lawce con su equipo citogenético de OHSU por compartir algunos de los
ejemplos notables que adornan las páginas de este capítulo. Finalmente, agradecemos a Charles Dana Bangs por las numerosas lecturas críticas
de este capítulo. Sus valiosas contribuciones fueron muy apreciadas.
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 423
Cuadro 8.5 Fórmulas de cariotipo. una revisión de algunos de los cariotipos intracromosómicos e intercromosómicos
discutido en este capítulo
46, XY, agregue (9) (p12) material adicional un cromosoma, Monosomía para el segmento del brazo p del
de desconocido o un descanso cromosoma 9 de p12→pter; aunque el material
origen no identificable adicional puede involucrar uno o más cromosomas
y puntos de corte, se desconoce su identidad. Si se
encuentra material adicional en ambos extremos
terminales, se debe utilizar el cariotipo derivado.
46, XY, suprimir (2) (q35) Eliminación, terminal un cromosoma; Se ha producido una ruptura dentro del brazo largo
un descanso del cromosoma 2 en la banda q35, lo que indica
monosomía para 2q35.→2qter.
46, Y, fra (X) (q27.3) Sitio frágil un cromosoma, Sitio frágil en el cromosoma X en q27.3; La X
un descanso estructuralmente anormal se escribe después del
cromosoma sexual normal.
46, XY, hs (9) (p13) homogéneamente un cromosoma, Con tinción homogénea, material adicional de
región de tinción un descanso origen desconocido se duplica repetidamente en la
banda p13 del cromosoma 9.
46, XY, i (21) (q10) Isocromosoma un cromosoma; (1) trisomía del brazo q del cromosoma 21; pérdida de
45, XY, i (21) (q10) un descanso la región NOr y del brazo p; q10 representa el brazo
47, XY, i (X) (q10) que está presente; El recuento de 46 cromosomas
indica que el paciente tiene síndrome de Down. (2) El
recuento de 45 indica que el paciente es normal pero
que solo puede producir descendencia con síndrome
de Down. (3) el extra
el isocromosoma crea una tetrasomía para el
brazo largo del cromosoma X; no se utiliza el signo
más en los estudios constitucionales, pero el
reordenamiento estructural se colocará después
del cromosoma sexual Y normal.
46, X, idic (X) (q13) Isodicéntrico un cromosoma; Duplicación del brazo corto del cromosoma X y un
un descanso segmento del brazo largo de Xq10→Xq13;
monosomía para el brazo largo de X de q13→qter;
el cromosoma estructuralmente anormal se coloca
después del X normal; El cromosoma tiene dos
centrómeros y ambos están activos.
46, X, psu idico (X) pseudoisodicéntrico un cromosoma; trisomía para el segmento X de p11.2→qter y
(p11.2) un descanso monosomía para p11.2→pter; dos símbolos en
sucesión están separados por un espacio; aunque
ambos centrómeros están presentes, solo uno está
activo.
46, XY, suprimir (7) (q22q34) Supresión, intersticial un cromosoma; La deleción intersticial deja la monosomía del
dos descansos cromosoma 7 para el segmento entre 7q22 y
7q34.
46, XY, suprimir (17) Supresión, micro un cromosoma; El uso de los mismos puntos de corte en la fórmula
(p11.2p11.2) dos descansos del cariotipo indica una microdeleción. esta
microdeleción deja la monosomía del cromosoma
17 para un segmento dentro de la región p11.2
(síndrome de Smith Magenis).
(Continuado)
424 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
46, XY, dúplex (7) (q32q22) Duplicación, invertida un cromosoma; trisomía para el segmento 1q21→1q32; el
dos descansos segmento duplicado está invertido.
46, XY, dúplex (7) (q22q22) Duplicación, micro un cromosoma; Similar a una microdeleción, el uso de los mismos
dos descansos puntos de corte en la fórmula del cariotipo indica una
microduplicación. esto deja la trisomía del cromosoma
7 para un segmento dentro de la región q22.
46, XY, inv (11) Inversión, un cromosoma; Los puntos de ruptura ocurren dentro del mismo brazo; el
(q21q23) paracéntrico dos descansos segmento se invierte y se vuelve a unir; no hay pérdidas ni
ganancias, pero hay un cambio de posición.
46, XY, inv (7) (p14q34) Inversión pericéntrica un cromosoma; Los puntos de ruptura ocurren dentro de los brazos opuestos;
dos descansos el segmento se invierte y se vuelve a unir; no hay pérdidas ni
ganancias, pero hay un cambio de posición.
46, XY, rec (7) dup (7p) recombinante un cromosoma; trisomía para pter del segmento cromosómico→
del (7q) inv (7) (p15q32) dos descansos p15 y monosomía para q32→qter, como
palmadita resultado de un cruce desigual durante la
meiosis entre un cromosoma 7 reordenado que
se hereda del padre del paciente y su
contraparte normal.
1) 46, XY, r (18) (1) anillo (1 uno (1) Cromosoma de anillo monocéntrico que implica una
(p11.3q23) (2) anillo de origen desconocido cromosoma; dos ruptura y reunión en o cerca de los extremos
2) 49, XY, + r1x2, + r2 (uso de marcadores rompe terminales, en p11.3 y q23 en el cromosoma 18.
formato similar) (2) desconocido (2) dos formaciones de anillos diferentes de origen
desconocido: r1 mostró 2 copias por celda, y r2 tenía
solo una copia por celda. los anillos se describen
después de derivados con una identidad céntrica
desconocida y antes de los marcadores.
46, XY, ins (7) Inserción, directa un cromosoma; Segmento 7p13→7p15 se inserta en el brazo largo
(q36p13p15) tres descansos en 7q36; el segmento está en su orden natural
(directo); no hay pérdidas ni ganancias, pero hay un
cambio de posición.
(1) 46, XX, 2 ~ 15 minutos [20] Minutos dobles desconocido (1) está presente un rango de 2 a 15 minutos
(2) 46, XX, ~ 15 minutos [20] dobles; no se utilizan signos más con dmins y
el recuento de cromosomas no cambia;
(2) aproximadamente (rango medio) se observaron 15
minutos dobles por celda. el [20] para el número total
de células investigado se coloca después de las líneas
celulares mosaicas o quiméricas, y los cariotipos tanto
neoplásicos como FISh, cuando corresponda.
46, XY, upd (15) palmaditas Disomía uniparental un cromosoma homólogos homocigotos; ambos se heredan del
padre.
Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética / 425
45, XY, dic (17; 20) Dicéntrico dos cromosomas; Debido a que ambos centrómeros están presentes en este
(p11.2; q11.2) dos descansos cromosoma dicéntrico, el cromosoma 17 es monosomía
para la mayor parte de su brazo p
(p11.2→pter), y el cromosoma 20 es
monosomía para la mayor parte de su brazo q
(q11.2→qter).
45, XY, psu dic (20; 17) pseudodicéntrico dos cromosomas; El mismo efecto que el dicéntrico, pero
(q11.2; q11.2) dos descansos un centrómero ha sido inactivado.
47, XY, + dic r (7; 18) Anillo dicéntrico dos cromosomas; cromosoma en anillo dicéntrico adicional que
(p11.2q32; p11.2q22) cuatro descansos muestra una trisomía para los brazos q de los
cromosomas 7 y 18, incluida la región p11.2
adyacente al centrómero de ambos cromosomas.
46, XY, t (17; 20) translocación, entero dos cromosomas; El intercambio de cromosomas en el centrómero
(p10; q10) brazo dos descansos transloca el brazo p del cromosoma 17 con el
brazo q del cromosoma 20, y viceversa para los
brazos opuestos; no hay pérdidas ni ganancias,
pero hay un cambio de posición.
46, XY, ins (17; X) Inserción, directa dos cromosomas; Segmento q22 del cromosoma X→q26 se inserta en
(q21; q22q26) tres descansos el brazo largo del cromosoma 17 en q21; el
segmento está en su orden natural (directo); sin
pérdidas ni ganancias, pero hay un cambio de
posición; el cariotipo no sigue el orden de cariotipo
estándar porque el cromosoma receptor debe
aparecer en primer lugar.
46, XY, der (2) t (2; 5) Derivado, múltiple dos cromosomas, el cromosoma 2 derivado se derivó de una
(p23; q35) inv (2) evento cuatro descansos translocación entre el cromosoma 2p23 y 5q35,
(q21q31) y una inversión del brazo largo del cromosoma
2 entre 2q21 y 2q31. los eventos se colocan en
pter→orden qter; por lo tanto, la inversión en el
brazo q se escribe después de la translocación
que involucra al brazo p del cromosoma 2.
46, XY, t (5; 12; 8; 21) translocación, cuatro El cromosoma de la primera lista cumplirá con la
(q31; p13; q22; q22) multicromosómico cromosomas; prioridad más alta en el orden de cariotipo, es
cuatro descansos decir, X antes de Y antes del autosoma numérico
más bajo; los cromosomas restantes se
determinarán por cuál recibe el anterior
segmento de cromosoma; sin pérdida o ganancia
aparente, pero hay un cambio de posición.
47, XY, t (9; 22) Derivado dos cromosomas, Translocación equilibrada entre el brazo largo
(q34; q11.2), + der (22) dos descansos del cromosoma 9 en q34 y el brazo largo del
t (9; 22) [20] cromosoma 22 en q11.2; también conocido
como cromosoma philadelphia (ph). el derivado
adicional 22 usa la descripción repetida
abreviada. el [20] indica el número total de
celdas; se utiliza al final de líneas celulares
mos / chi, cariotipos neoplásicos y FISh.
45, XY, der (13; 21) Derivado, dos cromosomas, Similar a las translocaciones de todo el brazo,
(q10; q10) acrocéntrico dos descansos donde se producen roturas en la región del
centrómero y los brazos descritos en el cariotipo
son los brazos presentes. este cariotipo contiene
los brazos largos (q10) de los cromosomas 13 y 21.
Debido a que los brazos cortos de los acrocéntricos
son regiones NOr, la pérdida es intrascendente y el
portador no mostrará expresión fenotípica excepto
posibles problemas reproductivos.
426 / Capítulo 8: ISCN: el lenguaje universal de la citogenética
El símbolo previamente definido (hg) que representa una "construcción o ensamblaje del genoma humano" se ha eliminado. En su lugar,
GRCh (Genome Reference Consortium human: human build or assembly) se ha agregado. [1, capítulo 3]
El símbolo dir (que significa directo) también se ha eliminado de la tabla de símbolos (capítulo 3). Aunque fue útil en los primeros años de la
citogenética, su uso se ha vuelto innecesario a medida que se reconoce más la familiaridad con la numeración de bandas proximales a distales.
Se eliminaron las siguientes opciones de cariotipo (similares), que mostraban la separación de los objetivos cohibridados en paréntesis
separados: por ejemplo,
nuc ish (ABLx3), (BCRx3), (ABL1 con BCRx2) [400]
nuc ish (ABL1x3), (BCRx3), (ABL1 con BCRx1), (ABL1 con BCR con ABL1x1) [400]
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