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SARS CoV 2

El documento resume información sobre el SARS-CoV-2, incluyendo su clasificación, genoma, epidemiología genómica global, origen, proteína spike y su interacción con ACE2, capacidad de propagación y enfermedad COVID-19. Explica que SARS-CoV-2 es un coronavirus que se transmite principalmente a través de gotículas respiratorias y tiene un período de incubación de 2 a 14 días. Su genoma consiste en ARN monocatenario positivo y proteínas como la proteína S, M, E y N. Su origen
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SARS CoV 2

El documento resume información sobre el SARS-CoV-2, incluyendo su clasificación, genoma, epidemiología genómica global, origen, proteína spike y su interacción con ACE2, capacidad de propagación y enfermedad COVID-19. Explica que SARS-CoV-2 es un coronavirus que se transmite principalmente a través de gotículas respiratorias y tiene un período de incubación de 2 a 14 días. Su genoma consiste en ARN monocatenario positivo y proteínas como la proteína S, M, E y N. Su origen
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SARS-CoV-2

Daniel Ricardo Rodriguez


Diego Fernando Marquiñez
Angie Vanessa Rivera
INDICE.
1 Introducción al
SARS-CoV-2
Aminoacidos
7
2 Clasificación y implicados
ubicación de los
Capacidad de 8
SARS-CoV
3 Genoma viral del
reproducción
SARS-CoV-2
Enfermedad 9
4 Epidemiologia (Covid-19)
genomica global
Vacunas
10
5 Origen del virus
Detección del virus
11
6 Genoma de la proteina spike
INTRODUCCION AL SARS-COV-2
Generalidades

● Es un virus altamente contagioso entre humanos.


● Tiene un R0 que oscila entre 1.4 y 2.5 según la OMS.
● La principal forma de contagio es por inhalación de los
fluidos respiratorios de un infectado.
● Su periodo de incubación oscila de los 2 a 14 dias,
mostrando síntomas de la enfermedad alrededor del
día 5.
● Es un virus de tipo 4.
● Una sola partícula puede hacer hasta 100000 copias de Tomado de:
sí misma en 24 horas. [Link]
INTRODUCCION AL SARS-COV-2
Estructura ● Nombre por su morfología en corona desde 1968.
● Mide entre 60 a 140 nm en su esfera y de 8 a 12 nm en sus
espigas.
● Su estructura consiste en una nucleocápside que protege el
material genético viral.
● Su ARN es mono-cadena de carácter positivo en dirección 5’ a
3’.
● Su estructura esta constituida por distintas proteinas:
- Proteina S.
- Proteina de membrana M.
- Proteina de la nucleocapside N.
- Proteina de envoltura E.
Tomado de: - Proteina accesoria HE.
[Link]
INTRODUCCION AL SARS-COV-2
Estructura Proteina de la
Proteina de la envoltura
nucleocapside N; Se
E; Es una proteína que
asocia con el genoma de
Proteina M; Posee dos funciona como porina,
ARN para formar la
extremos, un dominio N formando canales iónicos.
nucleocapside.
terminal corto que se
proyecta en la superficie
externa de la envoltura y Proteina accesoria HE; La
extremo C-terminal largo. hemaglutinina esterasa,
se encuentra solo en
algunos betacoronavirus,
Proteina S; Se proyecta facilita entrada y
a través de la envoltura propagación.
viral y forma las
espículas de la corona.
Tomado de: [Link]
CLASIFICACIÓN Y UBICACIÓN DE LOS SARS-COV

Tomado de: Hu B, (2021). Characteristics of SARS-CoV-2 and COVID-19. Microbiology. Nature Reviews.
Tomado de: Hu B, (2021).
Characteristics of SARS-CoV-2 and
COVID-19. Microbiology. Nature
Reviews.
GENOMA VIRAL DE SARS-COV-2

Tomado de: Ellis P, et al. (2021). Decoding Covid-19 with the SARS-CoV-2 genome. Current genetic medicine reports.
EPIDEMIOLOGIA GENOMICA GLOBAL

Tomado de: [Link]


EPIDEMIOLOGIA GENOMICA GLOBAL

Tomado de: [Link]


ORIGEN FILOGENÉTICO DEL CORONAVIRUS.
Huanan - Wuhan.
Los primeros casos reportados de personas
con neumonía desconocida y síntomas
parecidos a los del SARS y MERS (8-31 de
diciembre del 2019).

Francia.
Una muestra almacenada de un paciente con
neumonía a finales del 2019 resultó positiva
para SARS CoV - 2.
ORIGEN FILOGENÉTICO DEL CORONAVIRUS.
Los huéspedes reservorios del virus no se han probado con claridad, y se desconoce si el SARS-CoV-2 se
transmitió a los seres humanos a través de un huésped intermedio; sin embargo, se sabe que diversos
coronavirus similares al SARS-CoV-2 están circulando en la vida silvestre.

CIVETA DE PALMA
HI → SARS-CoV

MURCIELAGOS PANGOLIN
HUESPEDES HUESPEDES
DROMEDARIO NATURALES DEL INTERMEDIOS DEL
HI → MERS-CoV SARS - CoV - 2. SARS - CoV - 2.
ORIGEN FILOGENÉTICO DEL CORONAVIRUS.
Todavía no se conoce de dónde proviene el SARS-CoV-2; se puede descartar casi por completo la
posibilidad de que surgiera en un laboratorio debido a la acción humana; y tomando como base los otros
coronavirus conocidos, se sugiere que se originó por un proceso de transferencia zoonótica.

MURCIELAGO:
● RaTG13 →96,2%
● RmYN02 →93,3%

PANGOLIN:
● SARSr - CoV→85,5% - 92,4%
GENOMA DE LA PROTEINA SPIKE (S).
La proteína spike tiene una de las funciones más importantes en el proceso de infección del
SARS - CoV - 2; ya que es la que interacciona directamente con la proteína ACE2 de las células;
además, es la zona en la que se dan las mutaciones puntuales que hacen que el virus sea más
contagioso.
GENOMA DE LA PROTEINA SPIKE (S).

● S1: Interacciona con la proteína de


unión o receptora ACE2.
● S2: Interacciona con la proteína de
fusión.
● RBD: Es el dominio de unión al
receptor.
● RBM: Es el motivo de unión al
receptor.
GENOMA DE LA PROTEINA SPIKE (S).
AMINOÁCIDOS ESPECÍFICOS EN LA INTERACCIÓN RBD-ACE2.
Hay 5 aminoácidos específicos involucrados en la interacción de la RBD con el ACE2, y que
están directamente relacionados con el potencial de infección del virus.
AMINOÁCIDOS ESPECÍFICOS EN LA INTERACCIÓN RBD-ACE2.
El SARS - CoV - 2 originario (o el identificado inicialmente) ha sufrido una serie de
alteraciones en los aminoácidos del RBD, que han alterado su potencial de infección.
CAPACIDAD DE PROPAGACIÓN DEL VIRUS: ENTRADA Y SISTEMA INMUNE
CAPACIDAD DE PROPAGACIÓN DEL VIRUS: ENTRADA Y SISTEMA INMUNE
ENFERMEDAD COVID-19
La enfermedad por coronavirus
(COVID‑19) es una enfermedad
infecciosa provocada por el virus
SARS-CoV-2.
La mayoría de las personas que
padecen COVID‑19 sufren síntomas
de intensidad leve a moderada y se
recuperan sin necesidad de
tratamientos especiales. Sin
embargo, algunas personas
desarrollan casos graves y necesitan
atención médica.
CAPACIDAD DE PROPAGACIÓN

La propagación del virus a comparación de una


gripe normal es mucho más alta, e incrementa
también depende de las mutaciones del mismo.

- Wuhan: 2.4-2.6
- Europa: 3
- Reino Unido (Alpha): 4-5
- India (Delta): 5-8
CAPACIDAD DE PROPAGACIÓN
PRUEBAS DE DETECCIÓN COVID-19
TEST DE ANÁLISIS PCR TEST DE ANÁLISIS RÁPIDO
VACUNAS: TIPOS
VACUNAS: EFECTIVIDAD
BIBLIOGRAFIA

1. SARS-CoV-2: origen, estructura, replicación y patogénesis, José Eduardo Oliva Marín


[Link]
[Link]
2. Bases Genéticas y Moleculares del COVID-19 (SARS-CoV-2). Mecanismos de Patogénesis y de
Respuesta Inmune, Gabriel Pastrian Soto
[Link]
3. Etiología y fisiopatología del SARS-CoV-2 Irlanda Alvarado Amador,* Jessica Bandera
Anzaldo,* Laura Elena Carreto Binaghi,‡ Gandhi Fernando Pavón Romero,§ Alejandro Alejandre
García [Link]
4. Fisiopatología de la COVID-19 uNIVERSIDAD AUTONOMA DE AGUASCALIENTES
[Link]
5. Hu, B., Guo, H., Zhou, P. et al. Características de SARS-CoV-2 y COVID-19. Nat Rev Microbiol 19, 141-154 (2021).
[Link]
6. [Link]
[Link]
TALLER
1. Realice un dibujo de como se ve el virus SARS-CoV-2 observado mediante microscopía electrónica, señale
donde se ubican las proteínas que componen la estructura y explique su función.
2. Elabore un esquema que muestre el orden, la familia, la subfamilia y las divisiones de los virus CoV. Así
mismo enliste los virus CoV que afectan a humanos.
3. ¿Qué sucede cuando se cambia un aminoácido en específico dentro del genoma del SARS-CoV-2?
4. Haga un esquema explicado de una de las hipótesis del origen del SARS CoV 2 y la infección en humanos.
5. ¿Cuál es la diferencia entre el RBD y el RBM?
6. Explique cómo se generan las variantes del SARS CoV 2.
7. La proteína (S) del SARS CoV-2 posee dos subunidades que facilitan la entrada del virus a la célula ¿cómo
interactúan estas para realizar la endocitosis?
8. ¿Cuáles son los linfocitos que generan anticuerpos en el sistema inmunológico?
9. La enfermedad Covid 19 tiene diferentes fisiopatologías ¿Cuál de estas es responsable de la diarrea, náuseas,
vómito y dolor abdominal? ¿por qué se dan estos síntomas?
10. Realizar un cuadro comparativo del TEST RÁPIDO DE ANTICUERPOS vs TEST INMUNOLÓGICOS DE ANTICUERPOS.
GRACIAS

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