TUTORIAL 2: CALCULO PUNTUAL DE ENERGÍA CON MÉTODOS
SEMIEMPÍRICOS
UNIVERSIDAD DEL ATLÁNTICO
FACULTAD DE QUÍMICA Y FARMACIA, PROGRAMA DE FARMACIA
INTRODUCCIÓN A LA QUÍMICA COMPUTACIONAL (ELECTIVA III)
Por: Angie Paola Rodriguez Rua
Docente: Fernando Castro Guerrero
RESUMEN
En el presente tutorial se explicará paso a paso el proceso para realizar cálculos
de energía puntual de la molécula de Metoprolol aplicando a los diferentes
métodos semiempíricos disponibles en el programa Spartan 14. A partir de los
resultados se pudo determinar un orden tomando en cuenta las diferencias
energéticas con el fin de intuir qué método es el más acertado para la respectiva
reproducción de datos experimentales.
Palabras Claves: Cálculos, Energía, Métodos Semiempíricos
Metoprolol
DESARROLLO DEL TUTORIAL
1. Seleccione New Sketch en el menú File o hacer click en el icono que
aparece en la parte superior de la pantalla con el fin de obtener la opción de
realizar el dibujo de su molécula.
2. Luego de haber dibujado la molécula, diríjase al menú File y haga click en
la opción Save para guardar el archivo Spartan antes de empezar a realizar
los cálculos.
3. Estando en la ventana de visualización, diríjase al menú Setup o en el
ícono y posteriormente haga clic en Calculations, inmediatamente
se abrirá una ventana de opciones para personalización, en esta tenemos
como objetivo calcular la energía del sistema.
4. En la ventana del menú Calculations hacemos una personalización para
los respectivos cálculos empezando por la escogencia de la opción cálculo
puntual de energía o Energy ( )en el primer cuadro
de selección de la ventana.
5. En la opción With ( ) haga clic en la barra lateral para escoger el
método con el que trabajará, seleccione el método Semi-Empirical.
6. Luego de haber rellenado todas las opciones de la sección Calculet,
proceda a obtener los cálculos dirigiéndonos a la parte inferior de la
ventana y haga clic en la opción Submit ( )e inmediatamente el
programa nos notificará que el cálculo ha sido iniciado.
7. Luego de haber culminado el cálculo, diríjase al menú Display y haga clic
en la opción Properties, aparecerá una ventana llamada molecule
properties, escoja la energía del sistema ( ) para obtener el valor
de esta.
8. Luego de ver los cálculos, diríjase al menú Geometry y haga clic en la
opción Measure dihedral, escoja 4 átomos para saber sus ángulos o
cambiarlos en este caso se van a escoger 3 carbonos y un nitrógeno (C11,
C12, N1 y C13) a 86º dihedral y luego de 86º a 43ºdihedral
86º
43º
9. Luego nos dirigimos a Geometry en la opción Measure Angle y escoja 3
átomos 2 carbonos y un oxígeno (O2,C10 y C11)
10. Luego nos dirigimos a Geometry en la opción Measure Distance se
escogen dos átomos O2 y O3
11. Hacer una tabla con los datos dados y calcular la energía relativa
# Grados de Energìa KJ/mol Energìa relativa
libertad
1 D(C10,C11,N1 y 118,80 0
C12)
2 D(C10,C11,N1 y 3772,24 3653,44
C12)
3 D(C10,C11,N1 y 1254,30 1135.5
C12)
4 MA(O2,C10 y 118,80 0
C11)
5 MDis (O2 y O3) 118,80 0
CONCLUSIONES
De acuerdo a los procedimientos explicados anteriormente, se podrán obtener
cálculos que involucran a la energía del fármaco Metoprolol, En los métodos
aplicados a la molécula para obtener las diferentes energías ya sea en dihedral,
ángulo y en la distancia se puede constatar que en algunas energías son iguales
con un resultado de 118, 80 por lo tanto su energía relativa es de 0 y a medida
que se le fue cambiando sus diferentes ángulos se pudo detectar que hubieron
moléculas o átomos que se acercaban.
REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS
● Spartan `14 – Spartan_1:M0001
