Samuel Pecho Silva

Investigador con RENACYT P0201785 – María Rostworowski III

Scopus: https://bit.ly/34dJRPB
Profesor Universidad de Piura

Neumólogo Clínico y Ocupacional

Hospital Nacional Edgardo Rebagliati Martins - EsSalud

Egresado de la maestría en Epidemiología Clínica y Bioestadística

Egresado del Master en Ecografía Clínica para Emergencias y Cuidados Críticos.

Diplomados en Ecografía Especializada en el Paciente Crítico, Epidemiología Clínica, Sin conflictos que declarar
Auditoría Médica Basada en la Evidencia y en Salud Ocupacional

Lima, 24 y 25 de julio del 2021

Indicaciones iniciales
 Información general
• El enlace para el ingreso a la clase en vivo se envía antes de cada clase de cada módulo
• Las clases quedan grabadas para que puedan ser visualizadas tantas veces se necesiten
• La clase se envía en formato pdf antes de la clase en vivo: la clase en pdf puede contener más información que la que se discute en vivo ya que cada clase
es un compendio de información histórico desde el inicio de la pandemia
• Preguntas durante las clases:
• Preguntas cada media hora: 5 minutos de respuestas y todas referentes al tema del módulo que se lleva a cabo
• Al final de la clase: ronda de preguntas y comentarios
• Cada módulo tiene 2 clases:
• Cada clase se graba por separado, los enlaces para visualizar las clases grabadas se envían hasta el día miércoles siguiente al módulo
• Material complementario
• Este se envía hasta el jueves siguiente al módulo
• Evaluaciones post módulo
• Estas se envían al inicio de la siguiente semana luego de concluido el módulo y se entregan a más tardar a las 17:00 del sábado en que se lleva a
cabo el siguiente módulo. No todos los módulos tienen evaluación. Las evaluaciones son calificadas y sirven para mejorar el puntaje del examen
final. El cronograma de envío y entrega de las evaluaciones post módulo se les enviará luego del primer módulo
• Talleres
• Este se llevará a cabo durante la segunda mitad del diplomado y es generalmente sobre el manejo con oxigeno y dispositivos especiales y
demostraciones
• Durante todo el diplomado se tendrá una interacción constante a través del grupo de whatsapp
• Asistencia y participación:
• Se toma en cuenta como parte de la nota final
• Examen Final:
• 20 preguntas relacionadas a los 8 módulos del diplomado
Participantes: …….
La Medicina Basada en la Evidencia
EviSalud – Evidencias en Salud
• 𝐂𝐮𝐫𝐬𝐨 "𝐏𝐮𝐛𝐥𝐢𝐜𝐚𝐧𝐝𝐨 𝐞𝐧 𝐫𝐞𝐯𝐢𝐬𝐭𝐚𝐬 𝐈𝐧𝐝𝐢𝐳𝐚𝐝𝐚𝐬" 📖
• Este curso online 💻, organizado por la UCSUR y dictado mayormente por Percy Mayta, es
imperdible para quienes queiran redactar y publicar artículos científicos. 👩‍🔬👨‍🔬
• 𝐋𝐢𝐧𝐤𝐬 𝐚 𝐥𝐚𝐬 𝐜𝐥𝐚𝐬𝐞𝐬:
• 👉 1) Publicación científica en Perú y búsqueda: https://bit.ly/3iYtX0o
• 👉 2) Autoría, filiación y creación de perfiles científicos: https://bit.ly/32b9f6q
• 👉 3) Elegir en qué revista publicar: https://bit.ly/3hgtzd3
• 👉 4) Escribir sin plagio: https://bit.ly/2Q5CvWK
• 👉 5) Escribir una carta al editor: https://bit.ly/2QcHRPS
• 👉 6) Escribir reportes de caso y artículos originales: https://bit.ly/33uqT5O
• 👉 7) Escribir resultados y métodos: https://bit.ly/3hItP3P
• 👉 8) Escribir discusión e introducción: https://bit.ly/3iHiWRa
• 👉 9) Titulación por publicación y docencia en investigación: https://bit.ly/35KJBJ9
 Centros de Información Confiables
• https://covid-19tracker.milkeninstitute.org/
• https://www.cebm.net/oxford-covid-19-evidence-service/
• https://www.cebm.net/covid-19/registered-trials-and-analysis/
• https://saludconlupa.com/comprueba/cientificamente-comprobado-un-analisis-de-los-
tratamientos-mas-usados-contra-el-covid-19
• https://www.epistemonikos.org/es
• https://www.health.gov.au/news/health-alerts/novel-coronavirus-2019-ncov-health-alert
• https://bestpractice.bmj.com/topics/es-es/3000168/guidelines
https://covid-19tracker.milkeninstitute.org/
https://www.cebm.net/covid-19/registered-trials-and-analysis/
https://bestpractice.bmj.com/topics/en-gb/3000168/treatment-algorithm#patientGroup-0-0
NIH, OMS, OPS, BMJ/NHS/NICE, IDSA, IETSI-EsSalud, ACCP, ACP, Consenso brasileño, Guías: Colombiana, Australia,
Alemana, Koreana, ATS/ERS, CDC, FDA, EMA, Sociedades científicas latinoamericanas, Cochrane, epistemonikos,
salud con lupa, ECAs y RS, evidencias en salud, your local epidemiologist, etc
ACEPTA QUE LAS COSAS QUE VALEN MUCHO, SUELEN COSTAR MUCHO.

LOS PREMIOS NO SE OTORGAN AL PRINCIPIO DE LA CARRERA; SINO AL

FINAL. SIN ESFUERZO Y PERSEVERANCIA NO SE LLEGA LEJOS.
EL GENIO ES UNA LARGA PACIENCIA.

DESCONFÍA DE QUIÉN TE OFRECE LAS COSAS FÁCILES.

 Definición
• Coronavirus disease 2019 (COVID-19) is defined as illness caused by a novel coronavirus called severe acute respiratory syndrome
coronavirus 2 (SARS-CoV-2; formerly called 2019-nCoV), which was first identified amid an outbreak of respiratory illness cases in
Wuhan City, Hubei Province, China.
• It was initially reported to the World Health Organization (WHO) on December 31, 2019. On January 30, 2020, the WHO declared
the COVID-19 outbreak a global health emergency. On March 11, 2020, the WHO declared COVID-19 a global pandemic, its first
such designation since declaring H1N1 influenza a pandemic in 2009.

• Illness caused by SARS-CoV-2 was termed COVID-19 by the WHO, the acronym derived from "coronavirus disease 2019." The name
was chosen to avoid stigmatizing the virus's origins in terms of populations, geography, or animal associations. On February 11,
2020, the Coronavirus Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses issued a statement announcing an
official designation for the novel virus: severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2).

• On April 3, 2020, the CDC issued a recommendation that the general public, even those without symptoms, should begin wearing
face coverings in public settings where social-distancing measures are difficult to maintain to abate the spread of COVID-19.

• The CDC had postulated that this situation could result in large numbers of patients requiring medical care concurrently, resulting
in overloaded public health and healthcare systems and, potentially, elevated rates of hospitalizations and deaths. The CDC advised
that nonpharmaceutical interventions (NPIs) are the most important response strategy for delaying viral spread and reducing
disease impact. Unfortunately, these concerns have been proven accurate.
Nature Reviews | Immunology
El virus
 TAXONOMÍA
 Orden: nidoviridae o nidovirales

 Familia: coronaviridae

 Sub-familia: coronavirinae u orthocoronavirinae

 Género: 4

 Características
 Gran diversidad genética
 Capacidad de infectar a varias especies
 Alta frecuencia de mutaciones
 Inestabilidad de la RNA polimerasa
 Recombinación de RNA homólogo
GÉNERO: 4 GÉNEROS DE CORONAVIRUS (COV)

 Circulan y causan infecciones todo el año

 excepto: MERS, SARS-Cov-1, SARS-CoV-2

 Virus ARN con 4 géneros: los alfa y beta (mamíferos) y los gamma y delta (aves y cerdos)
 10 a 30% de resfríos comunes, rinitis, faringitis, laringitis y en menores de 1 año bronquitis, bronquiolitis, neumonía
GÉNERO CORONAVIRUS
 Alphacoronavirus: Antes Grupo 1: murciélagos y humanos
 1-a: CoV-229E y CoV-NL63
 1-b: alfavirus 1

 Betacoronavirus: divididos en subgéneros o linajes. Antes Grupo 2: humanos y murciélagos.

 Linaje A (embecovirus): CoV-OC43 y CoV-HKU1
 Linaje B o subgrupo 2B (Sarbecovirus):
 Subgrupo 2b: SARS-Cov-1 y SARS-Cov-2: pandémicos y un subgrupo 2-a: coronavirus murino y virus de la hepatitis del ratón

 Linaje C (Merbecovirus): MERS y coronavirus de murciélagos: esporádicos brotes en Arabia

 Linaje D (Nobecovirus): Sólo de murciélagos
 Hibecovirus: Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013

 Gammacoronavirus: virus aviares

 Deltacoronarivus: virus porcinos
GÉNERO: BETA-CORONAVIRUS

 Embecovirus

 Sarbecovirus: Grubo 2b: SARS-Cov-2, SARS-Cov-1, MERS

 Merbecovirus

 Nobecovirus

 Hibecovirus
BROTES O EPIDEMIAS PREVIOS POR CORONAVIRUS
 SEVERE ACUTE RESPIRATORY SYNDROME (SARS)
AHORA SARS-COV-1

 En el año 2002
 Foshan, Guangdong, China
 Beta-CoV llamado SARS-CoV ahora SARS-CoV-1
 Reservorio : murciélago y hospedero intermedio o amplificador: “gato civeta” (vivérridos)
 20% to 30% required mechanical ventilation
 Letalidad: 10% con una transmission del 33–42% al personal de salud
 Human-to-human transmission was documented, mostly in health care settings
 8098 individuals were infected and 774 died. The pandemic cost the global economy an estimated $30 billion to $100 billion
 No se ha vuelto a reportar casos y no se encontró tratamiento

January 23, 2020. doi:10.1001/jama.2020.0757

 EL SÍNDROME RESPIRATORIO DEL MEDIO ESTE (MERS-COV)
• En el año 2012: Virus procedente del Murciélago

• Hospedero amplificador: camello dromedario (las llamas y cerdos

son susceptibles a la infección)

• It has caused explosive nosocomial transmission events, in some

cases linked to a single superspreader, which are devastating for
health care systems

• 2494 cases and 858 deaths con transmission entre pacientes: 62–
79% por MERS-CoV

• mechanical ventilation: 50-80% y Letalidad: 35-36%

• Brotes esporádicos locales, medicación: Remdesivir

January 23, 2020. doi:10.1001/jama.2020.0757

Contemporary Concise Review 2018: Respiratory infections and tuberculosis. Respirology (2019)
Jin Y, Yang H, Ji W, et al. Virology, Epidemiology, Pathogenesis, and Control of COVID-19.
Viruses. 2020;12(4):372. Published 2020 Mar 27. doi:10.3390/v12040372
 SARS-Cov-2
• Virus de RNA monocatenario, no segmentario, doble capa
lipídica, sentido positivo:
– mRNA a poliproteína: 1p1a/pp1ab
• Genoma: 30000 nt de longitud (G+C:38%)
• 1273 aminoácidos y 15 genes
• Dentro del ORf3 proteína con hélice alfa y hoja beta ORF8
 ESTRUCTURA DEL SARS-COV-2
• Proteína “espiga” o spike (S): glicoproteína de 9 – 12 nm
• Interactúa con los Receptores para el ingreso,
responsable del trofismo tisular: escoge al
hospedero.
• 1160 – 1400 aa en forma de “corona”
• Induce respuesta inmune
• Subunidad S1: dominio terminal N, C (receptor de
unión dominante o RBD: la mutación ayudó ha
encontrar nuevo hospedero)
• Subunidad S2 que interviene en la fusión celular y
estabiliza la unión
Tamaño del Virion: 60 – 140 nm
• La membrana proteica (M): la más abundante, da la
forma a la envoltura del genoma, se une a la núcleo
cápside
 • 1273 aa
• 27 substituciones
• 6 de ellas en el RBD (dominio de unión al receptor)
• La envoltura (E): actúa en la patogénesis,
• 6 en subdominios subyacentes (subdominios)
ensamble, liberación, rara y pequeña:
viroporina, es siempre similar, su inactivación
o ausencia altera la virulencia y trofismo.

• La nucleocápside (N): multipropósito,

inmunogénica induce producción de
anticuerpos es de una simetría helicoidal (raro
en virus ARN), engloba al genoma, puede
funcionar como antagonista del IFN y ARN.
Potencia la transcripción, interacciona con la
proteína M, tiene 5 aa mutadas con respecto
al SARS-Cov-1

Tamaño del Virion: 60 – 140 nm

Jin Y, Yang H, Ji W, et al. Virology, Epidemiology, Pathogenesis, and Control of COVID-19. Viruses. 2020;12(4):372. Published
2020 Mar 27. doi:10.3390/v12040372
• El genoma del SARS-CoV-2 es 96.2% idéntico a los SARS-Like Cov de murciélagos:
– bat-SL-CoVZC45 y bat-SL-CoVZXC21
– CoV RaTG13 (murciélago)
– CoV pangolino: 99% de identidad secuencial

• Comparte un 79.5-80% de similitud con el SARS-CoV-1

– 94.6% de semenjanza en el ORF1ab (open Reading frame)

• Comparte un 50-53% de similitud con el MERS-CoV

• Se cree que pasó del murciélago al humano por un intermediario aún no definido
(pangolino (ahora más alejado), erizos o gato civeta en donde mutó el RBD) o se
cree que ambos virus comparten un antecesor común.
The phylogenetic analysis, study of genetic variation, multisequence, and microsatellite analysis,
showed that the bat is the native host of SARSCoV2.

Additionally, it also concluded that BATCoV is closely related to SARSCoV2.

There is a possibility of the presence of an intermediate host to initiate the transmission of

COVID19 from BAT to humans.

However, more research is required to validate this assumption. The FMSD tool revealed that
SARSCoV is more closely associated with SARSCoV2 than BATCoV.

https://www.news-medical.net/news/20210402/Comparative-study-of-SARS-MERS-BATe28090SARS-and-SARS-CoV-2.aspx
 Replicación
• Dependiente del receptor del ACE2 (Proteína larga multifuncional clase I
transmembrana – proteína no mutable):
– El SARS-Cov-2 Ingresa al organismos a través del receptor de ACE2
– El ACE2 está presente en las células epiteliales de la vía aérea, tráquea,
bronquios, alveolos, glándulas mucosas bronquiales, monocitos y macrófagos
alveolares, intestino delgado (TMPRSS4), riñón, corazón

• Dependiente de la proteína CD147

– Presente en epitelio de vía aérea, riñón, células de la inmunidad innata, linfocitos
CD4
E. Ortiz-Prado et al. / Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 98 (2020) 115094
 Otros mecanismos de ingreso
• A través de la proteína CD147
– Presente en epitelio de vía aérea, riñón, células de la inmunidad innata, linfocitos CD4

• ADE: Antibody-dependent enhancement o mejora dependiente de Ac

– Visto también en Dengue y puede pasar en SARS-Cov-2
– Promueve la entrada viral a la célula
– Ac pre-existentes contra SARS-Cov o CoV pueden promover la entrada viral de manera
independiente al ACE2
– Pueden favorecer la entrada al macrófago sin generar replicación o excreción
– Pueden producir injuria o inflamación tisular
– TLR-3,7,8 y aumento de FNT y de IL-6 con disminución de IL-10 y FCT-B
 A new study has found that there are about ten
virus particles in each cell in the body.

The research team from the Weizmann Institute of

Science in Israel and the University of California in
the USA estimate that each infected person carries
around 10-9 a 10-11 virions during peak infection.

About 1 to 10 percent of lung and airway cells

contain the needed ACE2 receptor to be infected
with SARSCoV2. The number is higher than the
estimate for the total number of infected cells. This
suggests that out of the cells that express both
ACE2 and TMPRSS2 (Transmembrane protease,
serine 2), only a small fraction get infected by the
virus.

Sender, R et al. (2020). The total number and mass of SARSCoV2 virions in an infected person. medRxiv. doi:
https://doi.org/10.1101/2020.11.16.20232009, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.11.16.20232009v1
Fisiopatología
Cevik M et al. Virology, transmission, and pathogenesis of SARS-CoV-2. BMJ 2020;371:m3862. http://dx.doi.org/10.1136/bmj.m3862. Published:
23 October 2020
Dhama K, Patel SK, Pathak M, et al. An update on SARS-CoV-2/COVID-19 with particular reference to its clinical pathology, pathogenesis, immunopathology and
mitigation strategies [published online ahead of print, 2020 May 30]. Travel Med Infect Dis. 2020;101755. doi:10.1016/j.tmaid.2020.101755
JAMA. doi:10.1001/jama.2020.12839
JAMA. doi:10.1001/jama.2020.12839
JAMA. doi:10.1001/jama.2020.12839
 Promote the expression of type I IFNs. Nevertheless, a
deficient type I IFN response is observed during SARS-
CoV-2 infection in vitro. An inefficient type I and type III
IFN response has been suggested to associated with
increased patient fatality. No IFN-b and IFN-ƛ could be
detected in plasma samples and lung biopsies

Lymphopenia is the most characteristic immune

manifestation of patients infected with SARS-CoV-2 .
Subsets of T cells as CD4+, CD8+, and memory T cells are
lower in severe cases, implying an inadequate antiviral
response after SARSCoV-2 infection

Front. Immunol. 11:569760.

doi: 10.3389/fimmu.2020.569760
Parasher A. Postgrad Med J Epub ahead of print: [please include Day Month Year].
doi:10.1136/postgradmedj-2020-138577
Nohora Cristina Ayola-Serrano, Namrata Roy, Zareena Fathah, Mohammed
Moustapha Anwar, Bivek Singh, Nour Ammar, Ranjit Sah, Areej Elba, Rawan Sobhi
Utt, Samuel Pecho-Silva, Alfonso J. Rodriguez-Morales, Kuldeep Dhama, Sadeq
Quraishi. Inflammation Research. https://doi.org/10.1007/s00011-021-01473-y
• Peak viral replication occurs in the initial 7-10 days and
primary immune response usually occurs by day 10-14 which
is followed by virus clearance.

• Days 0-5: incubation period. SARS-CoV-2 enter cell via ACE2

receptors on human type 1/2 pneumocytes and start
replicating.

• Until day 10: moderate symptoms. The initial immune

response produces IL-18, IP-10, MCP-1 and MIP-1α which
starts to recruit specific immune cells.

• Day 10: severe infection leading to risk of mortality.

Macrophages via BTK, T-cells via JAK, neutrophils and B-cells
produce cytokines, resulting in a cytokine storm by day 14.

J Glob Health 2021;11:10003.

 Inflammatory mechanisms, alveolar epithelial and endothelial damage, and coagulopathy in COVID-19
(A) In the early stage of disease, SARS-CoV-2 infects the bronchial epithelial cells as well as type I and type II alveolar pneumocytes and capillary endothelial cells.
The serine protease TMPRSS2 promotes viral uptake by cleaving ACE2 and activating the SARS-CoV-2 S-protein. During early infection, viral copy numbers can be
high in the lower respiratory tract. Inflammatory signalling molecules are released by infected cells and alveolar macrophages, in addition to recruited T lymphocytes,
monocytes, and neutrophils. (B) With disease progression, plasma and tissue kallikreins release vasoactive peptides known as kinins that activate kinin receptors on
the lung endothelium, which in turn leads to vascular smooth muscle relaxation and increased vascular permeability. This process is controlled by the ACE2 receptor.
Without ACE2 blocking the ligands of kinin receptor B1, the lungs are prone to vascular leakage, angioedema, and downstream activation of coagulation.
Dysregulated proinflammatory cytokine (TNF, IL-1, IL-6) and NO release and signalling contribute to these processes. As a consequence, pulmonary oedema fills the
alveolar spaces, followed by hyaline membrane formation, compatible with early-phase acute respiratory distress syndrome. Anomalous coagulation frequently
results in the formation of microthrombi and subsequent thrombotic sequelae. ACE2=angiotensin-converting enzyme 2. AT1 receptor=type 1 angiotensin II receptor.
IL=interleukin. NO=nitric oxide. TMPRSS2=transmembrane protease serine 2. TNF=tumour necrosis factor.

Published online May 6, 2021 https://doi.org/10.1016/S2213-2600(21)00218-6

Published online May 14, 2021 https://doi.org/10.1016/S2213-2600(21)00213-7
PLOS ONE | https://doi.org/10.1371/journal.pone.0250708 April 28, 2021
Nohora Cristina Ayola-Serrano, Namrata Roy, Zareena Fathah, Mohammed
Moustapha Anwar, Bivek Singh, Nour Ammar, Ranjit Sah, Areej Elba, Rawan Sobhi
Utt, Samuel Pecho-Silva, Alfonso J. Rodriguez-Morales, Kuldeep Dhama, Sadeq
Quraishi. Inflammation Research. https://doi.org/10.1007/s00011-021-01473-y
 J.M. Pericas et al. European Heart Journal (2020) 41, 2092–2108 doi:10.1093/eurheartj/ehaa462
Hasan K. Siddiqi y col. International Society for Heart and Lung Transplantation. Doi: 10.1016/j.healun.2020.03.012
 Asintomáticos, Leves, Moderados

Severos / Críticos
Hasan K. Siddiqi y col. International Society for Heart and Lung Transplantation. Doi: 10.1016/j.healun.2020.03.012
Se sabe desde hace mucho tiempo que los coronavirus poseen potencial pandémico. El SARS-CoV-2 es el noveno
coronavirus humano documentado y el séptimo coronavirus humano identificado en los últimos 20 años. La gran
mayoría de los virus humanos y todos los coronavirus humanos anteriores tienen claros orígenes zoonóticos. Hay
muchas firmas de eventos zoonóticos previos relacionados con la aparición del SARS-CoV-2, que muestra claras
similitudes con la propagación del SARS-CoV a los humanos en la provincia de Guangdong, China, en noviembre
de 2002 y en 2003.

There is also no evidence to show that WIV possessed or studied a SARS-CoV-2 progenitor before the COVID-19
pandemic. The suspicion about SARS-CoV-2’s lab origins stems from the fact that it was first detected in a city with
a major virological lab investigating coronaviruses. Wuhan, the largest city in central China, has multiple animal
markets and is well connected to other Chinese as well as international cities. The virus’s link to Wuhan is more
likely since such pathogens need heavily populated areas to spread rapidly and get established.

Holmes et al. (2021, July 7). The Origins of SARSCoV2: A Critical Review (Version 1.0). Zenodo. http://doi.org/10.5281/zenodo.5075888
The United States reported its first case of SARS-CoV-2 on January 21, 2020, in a 35-year-old American citizen traveling
from Wuhan, China to his home in Washington state. This individual had a symptom onset date of January 19, 2020.
Importantly, two other individuals of the 12 cases that were first identified in the United States around this time
identified their symptom onset dates to be January 14, 2020.

Basavaraju et al. (2021). Serologic Testing of US Blood Donations to Identify Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARSCoV2)–Reactive
Antibodies: December 2019–January 2020. Clinical Infectious Diseases 72(12); e1004e1009. doi:10.1093/cid/ciaa1785.
ttps://academic.oup.com/cid/article/72/12/e1004/6012472.
Transmisión
Transmisión
DOI https://doi.org/10.1055/s-0040-1722256.
 COVID-19 transmission—up in the air
• Transmisión por gotas: inicialmente y algo que por mucho tiempo se manejó es que las gotas eran
aquellas partículas de secreción con contenido viral o bacteriano mayor a 5 um ahora se dice
mayor a 100 um y que las partículas que caen rápido al piso y de las cuales nos protegemos con
los 2 metros de distanciamiento son las de 60 a 100 um.
• La distancia de persona a persona segura pasó rápido de 1 a 2 metros.
• Los aerosoles son parte del mecanismo de transmisión definidos como partículas de secreciones
respiratorias que miden menos de 5 um de diámetro promedio y que pueden quedarse
suspendidas en el aire más tiempo y viajar más de 2 metros.
• Los principales lugares para la transmisión por aerosoles son los lugares cerrados y poco
ventilados y los procedimientos médicos ya conocidos. Unos 30 minutos bastan para la
transmisión en un lugar cerrado y no ventilado.
• La transmisión por contacto también es posible y depende de la viabilidad que tenga el virus en
diferentes superficies.
Published online October 29, 2020 https://doi.org/10.1016/ S2213-2600(20)30514-2
https://www.medscape.com/viewarticle/938593?src=soc_fb_201011_mscpedt_news_mdscp_sarscov2&faf=1
 Transmisión
• La transmisión presintomática: 44% (25-69%)
– Si la transmisión presintomática es mayor al 30%

– Con un R0 de 2.5: no basta el aislamiento a menos que el 90% de contactos sean

rastreados
– Los síntomas en los contactos pueden aparecer antes que en los casos
• Intervalo de serie: aparición de síntomas entre casos sucesivos en una cadena de
transmisión: 5.8 días
• Periodo de incubación: tiempo entre la infección y la aparición de síntomas: 5.2 días
 SARSCoV2 viral load peaks prior to symptom onset: a systematic review
and individual pooled analysis of coronavirus viral load from 66 studies

“Ignoring these important differences

would make predictions from simpler
models incorrect with potentially
dangerous public health responses.”
Since the maximum viral loads for
SARS-CoV-2 are during the
presymptomatic stage, they suggest
the need for robust contact tracing
and isolation measures.

Benefiel et al. medRvix. https://doi.org/10.1101/2020.09.28.20202028

 Pregnancy and Breastfeeding During COVID-19 Pandemic: A
Systematic Review of Published Pregnancy Cases

• We identified 161 original studies reporting 3,985 cases of pregnant women with COVID-19 (1,007 discharged
while pregnant).

• The 2,059 published cases with pregnancy outcomes resulted in 42 abortions, 21 stillbirths, and 2,015 live births.
• Preterm birth occurred in 23% of cases. Around 6% of pregnant women required admission to an intensive care
unit and 28 died.

• There were 10 neonatal deaths.

• From the 163 cases with amniotic fluid, placenta, and/or cord blood analyzed for the SARS-CoV-2 virus, 10 were
positive. Sixty-one newborns were positive for SARS-CoV-2. Four breast milk samples from 92 cases showed
evidence of SARS-CoV-2

Rodrigues C et al. Pregnancy and Breastfeeding During COVID-19 Pandemic: A Systematic Review of Published Pregnancy Cases. Front Public
Health. 2020 Nov 23;8:558144. doi: 10.3389/fpubh.2020.558144. PMID: 33330308; PMCID: PMC7719788.
 Characterization of neonates born to mothers with
SARS-CoV-2 infection: Review and meta-analysis
• 32 studies involving 261 neonates were included in meta-analysis.

• Most neonates born to infected mothers did not show any clinical abnormalities (80.4%).

• Clinical features were dyspnea in 11 (42.3%) and fever in 9 newborns (19.1%). Of 261 neonates,
120 neonates were tested for infection, of whom 12 (10.0%) tested positive.
• S
• wabs from placenta, cord blood and vaginal secretion were negative. Neonates are mostly non
affected by the mother's SARS-CoV-2 infection.

• The risk of vertical transmission is low

Neef V et al. Characterization of neonates born to mothers with SARS-CoV-2 infection: Review and meta-analysis. Pediatr Neonatol. 2020 Oct
24:S1875-9572(20)30164-9. doi: 10.1016/j.pedneo.2020.10.001. Epub ahead of print. PMID: 33334687
After matching on maternal characteristics:

• Maternal SARS-CoV-2 test positivity was significantly associated with admission for neonatal care (11.7%vs 8.4%; odds
ratio [OR], 1.47; 95%CI, 1.26-1.70) and with neonatal morbidities such as respiratory distress syndrome (1.2%vs 0.5%;
• OR, 2.40; 95%CI, 1.50-3.84), any neonatal respiratory disorder (2.8%vs 2.0%; OR, 1.42; 95%CI, 1.07-1.90), and
hyperbilirubinemia (3.6%vs 2.5%; OR, 1.47; 95%CI, 1.13-1.90).

• Mortality (0.30% vs 0.12%; OR, 2.55; 95%CI, 0.99-6.57), breastfeeding rates at discharge (94.4%vs 95.1%; OR, 0.84;
95%CI, 0.67-1.05), and length of stay in neonatal care (median, 6 days in both groups; difference, 0 days; 95%CI, −2 to
7 days) did not differ significantly between the groups.

• Twenty-one infants (0.90%) of SARS-CoV-2–positive mothers tested positive for SARS-CoV-2 in the neonatal period; 12
did not have neonatal morbidity, 9 had diagnoses with unclear relation to SARS-CoV-2, and none had congenital
pneumonia.

JAMA. doi:10.1001/jama.2021.5775
Published online April 29, 2021.
 10 things we have now learned about COVID-19

• WE SHOULDN’T PANIC ABOUT CONTAMINATED SURFACES

• Studies that showed how long the COVID-19 virus could last on surfaces, such as plastic and
metal, led to concern that touching contaminated surfaces could be a way to become
infected.

• Now it is clear that although people may pick up the virus if they touch infected surfaces and
then touch their face, it is not thought to be the main way the virus is transmitted.

• Nevertheless, hand-washing and hand sanitising remains important because respiratory

droplets from an infected person’s sneezes or coughs could still land on our hands.

https://www.gavi.org/vaccineswork/10-things-we-have-now-learned-about-covid-19
 Características
• Baja patogenicidad con lta transmisibilidad
• Letalidad inicial estimada: 2-3%
• Infection Fatality Risk (IFR) o CFR: 0.3-0.6% (0.6-3.5)
– Se asemeja al de la pandemia por influenza asiática de 1957-58
• Ro (número de reproducción) parala variante salvaje u original:
– 1.4 – 3.9
– 1.4 – 2.5
– 2.24 – 2.5
– 2.8 – 3.3
– 3.2 – 3.9
– 2.2 (1.4 – 6.5)
• Inmunidad de Rebaño: 1 – 1/Ro = 60%
 “Supercontagiantes”
• Es una variación individual en la transmisión
• Medido por el factor de dispersión o “k”
• A menor “k” hay una mayor transmisión
• SARS: 0.16
• MERS: 0.25
• SARS-Cov-2: 0.1
• 10% de infectados son responsables del 80% de la transmisión
• La identificación es generalmente difícil
 10 things we have now learned about COVID-19

• SUPER-SPREADERS ARE A MAJOR THREAT

• Super-spreading events in which one person infects many others, sometimes hundreds, at an
event are starting to be seen more often.

• For example, over 100 people being infected from shaking hands with one infected person at
a conference.

• The study in India showed that super-spreaders are a clear phenomenon - just 5 percent of
people accounted for 80 percent of the infections.

https://www.gavi.org/vaccineswork/10-things-we-have-now-learned-about-covid-19
We find that, at any given time, just 2% of individuals carry 90%
of the virions circulating within communities, serving as viral
“super-carriers” and possibly also super-spreaders.

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2021.03.01.21252250

Periodos de la infección por el SARS-CoV-2 y
severidad clínica de la enfermedad COVID-19
 Importantly, the 28-day mortality rate of 31% in the
tocilizumab group, although lower than the placebo
group, remains unacceptably high, and thus additional
therapies are urgently needed to further reduce
mortality in severely ill patients with COVID-19.
www.thelancet.com Vol 397 May 1, 2021

Samuel Pecho-Silva et al. Chemotherapy

 Autor Asintomático Presintomático Leve Moderado Severo Crítico

OMS Síntomas presentes sin Sg de neumonía no severa: Neumonía severa : SatO2 < 90% o FR > 30 o Signos de SDRA, sepsis, shock séptico,
NICE evidencia de neumonía viral o SatO2 ≥ 90% (este punto SDRA. NICE adicionalmente indica que para requerimiento de soporte vital
hipoxemia es arbitrario y puede identificar a pacientes COVID-19 severo en la como VMI o terapia
evaluarse para cada caso) comunidad, debe usarse el umbral de <94% vasopresora.
NIH RT-PCR positiva sin síntomas Sg y Sx Resp y/o sistémicos sin Infección de vías Por lo menos alguno de ellos: SatO2 < 94%. FR > 30. SDRA, shock séptico, tormenta
(se incluye a pre-sintomáticos) dificultad respiratoria, disnea o respiratorias bajas por PaO2/FiO2 ≤ 300 mmHg. Infiltrados pulmonares > de citoquinas y/o disfunción
lesiones pulmonares evaluación clínica o 50% multiorgánica
tomográfica y SaTO2 ≥94%
CDC Sg y Sx Resp y/o sistémicos sin Infección de vías Por lo menos alguno de ellos: SatO2 < 94% (para SDRA, shock séptico, y/o
dificultad respiratoria, disnea o respiratorias inferiores por pacientes con hipoxemia crónica, una disminución disfunción multiorgánica
lesiones pulmonares evaluación clínica o desde el valor inicial de > 3%). FR > 30. PaO2/FiO2 ≤
tomográfica con 300 mmHg. Infiltrados pulmonares > 50%
saturación ≥ 94%
IDSA No Severo: SatO2 > 94% que no usa O2 SatO2 ≤ 94 incluidos los pacientes que reciben VMI, ECMO, disfunción de
oxígeno suplementario órganos terminales, sepsis,
shock séptico. SDRA
Guía No presenta síntomas de Estable, con Sx y Sg Cualquier de: FR ≥30, SatO2 ≤ 92 en reposo o PaO2/FiO2 < 200 o deterioro a
Australiana moderado o severo. Desde no respiratorios o sistémicos. PaO2/FiO2 ≤ 300 pesar de CNAF o VMNI/CPAP o
síntomas hasta síntomas leves Con SatO2 > 92% (o > 90% requerimiento de VMI o
del aparato respiratorio con enfermedad pulmonar hipotensión o Shock, trastorno
superior: tos, mialgia, leve crónica) con hasta 4 lpm de conciencia o falla orgánica
reducción de SatO2, disnea de O2 por CBN
Pecho-Silva, S RT-PCR o RT-PCR o prueba Infección de las vías respiratorias superiores o inferiores con Uno o más de: FR ≥ 30 o PaO2/FiO2 ≤ 300 mmHg. o SDRA moderado o severo o
21/04/21 prueba de de antígeno SatO2 promedio diaria > 93% durante 21 días con síntomas y SatO2/FiO2 < 310-460 o Trabajo Respiratorio ≥ 2 o SDRA tipo H o sepsis o shock
antígeno positiva sin signos respiratorios y sistémicos de duración e intensidad SDRA Tipo L o Infiltrados pulmonares > 50% séptico o requerimiento de
positiva sin síntomas al variable. El examen pulmonar puede ser normal o patológico predominantemente de tipo consolidación o SatO2 < soporte vital como VMI o
síntomas por momento pero y presentar o no lesiones en imágenes . No se recomiendan 94% y para pacientes con hipoxemia crónica una terapia vasopresora y/o
10 días desde que desarrollará exámenes auxiliares ni tomografía. Se recomiendan 4 a 6 disminución desde el valor inicial de > 3% hasta los disfunción multiorgánica o falla
la toma de la síntomas controles diarios de la SatO2 de manera no invasiva y usar el 2500 msnm. Para pacientes que residen por encima a la CNAF/CPAP o sistema
muestra promedio diario. de los 2500 msnm una disminución de ≥ 3% desde el artesanal de ser el caso
valor promedio normal de la región
Published Online. June 12, 2020. https://doi.org/10.1016/S1473-3099(20)30483-7
 Historia de la Infección por Sars-Cov-2
Incubación Fase Aguda Recuperación o Persistente Long COVID-19 o
síndrome post covid-
Cuarentena Aislamiento 19 o PASC

Prueba de
antígeno

Pruebas RT-PCR
Pruebas Serológicas
TAC

- 14 -7 0 7 14 21 28 3m 6m–8m

Samuel Pecho-Silva et al. Chemotherapy

Asintomáticos
 Asintomáticos representan el 40% del
total de infectados

Pueden tener lesiones pulmonares

hasta en un 54%

Un “asintomático” que evoluciona a

sintomático era un “presintomático” y
esto puede pasar en: 0 a 10.3% a
88.9%

Oran DP, Topol EJ. Prevalence of Asymptomatic SARS-CoV-2 Infection: A Narrative Review [published online ahead of
print, 2020 Jun 3]. Ann Intern Med. 2020;M20-3012. doi:10.7326/M20-3012
Chau NVV, Thanh Lam V, Thanh Dung N, et al. The natural history and transmission potential of asymptomatic SARS-CoV-
2 infection [published online ahead of print, 2020 Jun 4]. Clin Infect Dis. 2020;ciaa711. doi:10.1093/cid/ciaa711
 28 agosto 2020
https://www.thoracic.org/about/newsroom/press-releases/journal/2020/ats-statement-on-latest-covid-19-policy-actions.php
Upper respiratory viral load in asymptomatic individuals and mildly
symptomatic patients with SARS-CoV-2 infection

Asymptomatic individuals and symptomatic patients did not show any significant differences in the mean Ct
values of the E (31.15 vs 31.43; p>0.99), RdRp (32.26 vs 32.93; p=0.92) and N (33.05 vs 33.28; p>0.99) genes.

Ra SH, Lim JS, Kim G, et al. Thorax Epub ahead of print: [1171072020]. doi:10.1136/thoraxjnl-2020-215042
Duración del periodo de transmisibilidad y aislamiento
 Presencia Viral en Vías respiratorias
A systematic review and meta-analysis of SARS-CoV-2 case series, cohort studies, and randomized trials showed
RNA shedding for 17 days after symptom onset (95% CI, 15.5 to 18.6) in upper respiratory samples among a total of
3229 participants in 43 studies and for 14.6 days (95% CI, 14.4 to 20.1) in lower respiratory tract samples among a
total of 260 participants in 7 studies. Although RNA could be detected up to 83 days and 59 days in upper and lower
respiratory samples, respectively, no study detected live virus beyond day 9 of illness

In February 2021, the CDC, citing their own unpublished data and those from other sources, stated that in patients
with mild or moderate Covid-19, replication-competent virus hasn’t been recovered after 10 days following
symptom onsetEven in severe illness (the vast of majority of patients admitted to the ICU had been intubated),
the probability of virus isolation after 15 days was 5%.

• Cevik M et al. SARS-CoV-2, SARS-CoV, and MERS-CoV viral load dynamics, duration of viral shedding, and infectiousness: a
systematic review and meta-analysis. Lancet Microbe 2021; 2(1): e13-e22.
• Centers for Disease Control and Prevention. Duration of isolation & precautions for adults. February 13, 2021
(https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/hcp/duration-isolation.html).
 Close contact redefined
• The CDC has redefined what it considers a close contact of someone with COVID-
19.

• Someone is now considered to be a close contact if they were within 6 feet of an

infected person for at least 15 minutes over a 24-hour period beginning 2 days
before symptom onset (or 2 days before testing in asymptomatic patients).

• Previously, the 15-minute exposure window was continuous.

• Close contacts are asked to self-quarantine for 14 days to avoid spreading the
virus.

https://www.jwatch.org/fw117155/2020/10/22/covid-19-remdesivir-approved-close-contact-redefined
https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/hcp/duration-isolation.html
Predicting Infectious SARS-CoV-2 • cid 2020. DOI: 10.1093/cid/ciaa638:
DOI: 10.1093/cid/ciaa1249
doi/10.1093/cid/ciaa1249/5896916 by guest on 30 August 2020
doi/10.1093/cid/ciaa1249/5896916 by guest on 30 August 2020
 Comorbilidades de Riesgo
• The CDC has published a summary of evidence of comorbidities that are supported by meta-
analysis/systematic review that have a significant association with risk of severe COVID-19 illness. These
include the following conditions:

• Cancer
• Cerebrovascular disease
• Chronic kidney disease
• COPD (chronic obstructive pulmonary disease)
• Diabetes mellitus, type 1 and type 2
• Heart conditions (eg, heart failure, coronary artery disease, cardiomyopathies)
• Immunocompromised state from solid organ transplant
• Obesity (BMI 30 kg/m 2 or greater)
• Pregnancy
• Smoking, current or former
 Otras comorbilidades
• Comorbidities that are supported by mostly observational studies include: Children with certain
underlying conditions , Down syndrome , HIV (human immunodeficiency virus) , Neurologic
conditions, including dementia , Overweight (BMI 25 to less than 30 kg/m 2), Other lung disease
(including interstitial lung disease, pulmonary fibrosis, pulmonary hypertension), Sickle cell
disease, Solid organ or blood stem cell transplantation, Substance use disorders, Use of
corticosteroids or other immunosuppressive medications
• Comorbidities that are supported by mostly case series, case reports, or, if other study design,
the sample size is small include: Cystic fibrosis , Thalassemia
• Comorbidities supported by mixed evidence include Asthma, Hypertension, Immune deficiencies,
Liver disease ,
• Such individuals should consider the following precautions: Stock up on supplies. Avoid close
contact with sick people. Wash hands often. Stay home as much as possible in locations where
COVID-19 is spreading. Develop a plan in case of illness
Lancet Diabetes Endocrinol 2020: 8; 782–92
La respuesta inmunológica frente a la infección
 Los anticuerpos
• Antibodies are glycosylated protein molecules present on the surface of B cells (surface
immunoglobulins) serving as antigen receptors or are secreted into the extracellular space where
they can bind and neutralize their target antigens.
• A single antibody molecule consists of 4 protein chains: 2 “heavy” (H chains) and 2 “light” (L chains)
linked to each other by disulfide bonds. The N-terminus regions of the heavy and light chains, which
collectively make up the antigen-binding site, are where the variability between one antibody
molecule and another resides, hence determining specificity.
• An important feature is that each antibody recognizes a specific antigen, a phenomenon called
“antibody specificity.” For example, an antibody that recognizes the mumps virus cannot recognize
the measles virus and can only recognize one binding site on the mumps virus.
• There will likely be multiple antibodies to multiple different binding sites on an antigen such as a
virus. For example, some antibodies to COVID-19 will target binding sites on proteins in the outer
shell while some may target nucleic acid binding sites, but each will be specific and unique

D. Jacofsky et al. / The Journal of Arthroplasty 35 (2020) S74eS81

 Funciones de los anticuerpos
1. Antibodies are secreted into the blood and mucosa, where they bind to and inactivate foreign
substances such as pathogens and toxins (neutralization). Antibody neutralization is important for
protection from viruses, as it can prevent the virus from then being able to enter and infect cells. It
is also important in binding to bacterial toxins and is the primary mechanism for protection
conferred by successful vaccination.

2. Antibodies facilitate phagocytosis of foreign substances by phagocytic cells (opsonization).

Antibody binding, for example, will not prevent bacterial replication. Rather, in this setting, the
mechanism of enhanced protection through opsonization will increase phagocytosis by
macrophages and neutrophils.

3. The third function is antibody activation of the complement system to destroy pathogens through
lysis and enhanced chemotaxis.

D. Jacofsky et al. / The Journal of Arthroplasty 35 (2020) S74eS81

 IgA
• Presente en las secreciones de las mucosas:
– Saliva, lágrimas, calostro, leche, secreciones respiratorias,
gastrointestinales, genitourinarias
• Puede prevenir infecciones evitando el ingreso de
microorganismos al plasma
• Bloquea a organismos patógenos impidiendo se adhieran a
mucosas
• Puede asociarse a la severidad del cuadro clínico
 IgM
• Es una proteína altamente frecuente en seres vivos y mamíferos.
• Llamada también macroglobulina
• El tamaño es variable pudiéndose hacerse “mas grande” cuando se une a otras IgM
• Presenta una fracción Fc que le permite interaccionar con otras IgM y con el
complemento (Ag-Ac)
• Puede formar macromoléculas de hasta 5 IgM
• Capacidad de opsonización
• Primer Ac que responde frente a una infección

En SARS-Cov-1 aparece a los 17 días y los Ac neutralizantes pueden durar hasta 720 días
 IgG

Es la más abundante del plasma y Constituye el 80 % de las inmunoglobulinas totales

Su tiempo de vida media es de aproximadamente 25 días o más
• La IgG es la inmunoglobulina más pequeña: puede atravesar el sistema circulatorio y la placenta.
• La síntesis de IgG depende de los antígenos
• Tipos: 4 subclases: IgG1 al IgG4
• Tiene 2 fragmentos: fracción Fab (antigen binding) que se une a Ag. y fracción Fc (cristalizable)
• La Ig3 más que Ig1 y la Ig4 no tiene
Anticuerpos neutralizantes
◦ Determinan la verdadera inmunidad
◦ Ac específico contra el RBD de la proteína S
◦ Definidos in-vitro por su actividad para:
◦ Bloquear la entrada, la fusión y el egreso viral
◦ Tienen mayor especificidad, requieren de una concentración mínima, afinidad y de un
isotipo específico del Ac.
◦ Métodos: BSL-3 y prueba de reducción de la neutralización en placa o método de la
microneutralización
◦ 30% producen Ac. Neutralizantes luego de la recuperación, menor respuesta en
jóvenes
https://www.news-medical.net/health/What-are-Neutralizing-Antibodies.aspx
Iwasaki A, Yang Y. The potential danger of suboptimal antibody responses in COVID-19. Nat Rev Immunol. 2020;20(6):339-341.
doi:10.1038/s41577-020-0321-6
Wu, F. et al. Neutralizing antibody responses to SARS-CoV-2 in a COVID-19 recovered patient cohort and their implications. Preprint at
medRxiv https://doi.org/10.1101/2020.03.30.20047365 (2020)
 Robust neutralizing antibodies to SARS-CoV-2 infection persist for months

• Here we report that the vast majority of infected individuals with mild-to-
moderate COVID-19 experience robust IgG antibody responses against the viral
spike protein, based on a dataset of 30,082 individuals screened at Mount Sinai
Health System in New York City.

• We also show that titers are relatively stable for at least a period approximating 5
months and that anti-spike binding titers significantly correlate with
neutralization of authentic SARS-CoV-2.

• Our data suggests that more than 90% of seroconverts make detectible
neutralizing antibody responses. These titers remain relatively stable for several
months after infection.

A. Wajnberg et al., Science 10.1126/science.abd7728 (2020).

 Rapid increase of a SARS-CoV-2 variant with multiple spike protein mutations observed in the UK

https://www.news-medical.net/news/20201221/SARS-CoV-2-spike-protein-remains-remarkably-conserved-among-37-variants-from-
Hong-Kong.aspx
Antibodies attacking SARSCoV2 virus. Illustration Credit:
Kateryna Kon /Shutterstock
Natural immunity to COVID-19 may be long-lasting
 ¿Los títulos de anticuerpos neutralizantes predicen la
protección inmunitaria contra el COVID-19?
• En un análisis de ocho estudios, los títulos de anticuerpos neutralizantes normalizados estuvieron altamente
correlacionados con la eficacia de la vacuna y la protección aparente después de una infección natural.
• Reconocer los correlatos inmunitarios de la protección contra la infección por SARS-CoV-2 es un objetivo clave para
superar la pandemia de COVID-19. Un enfoque consiste en examinar los niveles de títulos de anticuerpos neutralizantes
con ensayos in vitro después de la vacunación o la infección natural.
• Utilizando datos de siete estudios de vacunas de fase 3 y un estudio de convalecencia, los investigadores normalizaron
los títulos de neutralización al título medio de convalecientes en todos los estudios. En comparación con la eficacia
protectora informada en estos estudios, se encontró una correlación muy significativa entre el título de convaleciente
normalizado y la eficacia de la vacuna (r = 0,905). En un modelo logístico, el nivel de neutralización para lograr un 50%
de protección contra la infección viral fue del 20,2% del título medio de convalecientes. Para prevenir una enfermedad
grave, el nivel de neutralización del 50% fue del 3,0% del título medio. Un modelo de desintegración exponencial indicó
que la vida media de los títulos de anticuerpos neutralizantes en individuos vacunados con ARNm e infectados
naturalmente fue similar, y se esperaría que una vacuna con una eficacia inicial del 95% mantuviera una eficacia
estimada del 77% a los 250 días.
Los autores reconocen que estos datos provienen de múltiples estudios que utilizan diferentes métodos para medir la respuesta de anticuerpos. A pesar de
esta salvedad, los resultados proporcionan evidencia importante de que se puede usar un título de anticuerpos neutralizantes, sustituto fácilmente medible,
para determinar la inmunidad protectora contra COVID-19. Esto debería ayudar a acelerar el desarrollo de nuevas vacunas e inmunoterapias, al mismo
tiempo que ayuda a los funcionarios de salud pública a determinar el grado de inmunidad en una comunidad determinada.

https://www.jwatch.org/na53675/2021/05/27/do-neutralizing-antibody-titers-foretell-immune-protection?query=etoc_jwid&jwd=000020210975&jspc=PUD
Riggioni C, Comberiati P, Giovannini M, et al. A compendium answering 150 questions on COVID-19 and SARS-CoV-2
[published online ahead of print, 2020 Jun 14]. Allergy. 2020;10.1111/all.14449. doi:10.1111/all.14449
Sethuraman N, Jeremiah SS, Ryo A. Interpreting Diagnostic Tests for SARS-CoV-2 [published online ahead of print, 2020
May 6]. JAMA. 2020;10.1001/jama.2020.8259. doi:10.1001/jama.2020.8259
Pediatr Allergy Immunol. 2020;31:454–470
 A robust memory B-cell and plasmablast expansion is detected early in infection, with secretion of serum IgM and
IgA antibodies by day 5 to 7 and IgG by day 7 to 10 from the onset of symptoms. In general, serum IgM and IgA titers
decline after approximately 28 days, and IgG titers peak at approximately 49 days.

Published online September 11, 2020Downloaded From: https://jamanetwork.com/ on 09/19/2020

Rethinking Covid-19 Test Sensitivity — A Strategy for Containment

This article was published on September 30, 2020, at NEJM.org. DOI: 10.1056/NEJMp2025631
https://www.medscape.com/viewarticle/938593?src=soc_fb_201011_mscpedt_news_mdscp_sarscov2&faf=1
BMJ 2020;371:m3862. http://dx.doi.org/10.1136/bmj.m3862. Published: 23 October 2020
 Factores que alteran la respuesta inmune (Ac)
• Severidad de la enfermedad
• Edad
• Estado nutricional
• Medicación recibida
• Infecciones concomitantes: probable inmunidad cruzada entre
estacionales HCoV-OC43 y HCoV-HKU1 que estuvieron activos
entre noviembre y febrero en EUA
Huang AT, Garcia-Carreras B, Hitchings MDT, et al. A systematic review of antibody mediated immunity to
coronaviruses: antibody kinetics, correlates of protection, and association of antibody responses with severity of
disease. Preprint. medRxiv. 2020;2020.04.14.20065771. Published 2020 Apr 17. doi:10.1101/2020.04.14.20065771
The study provides strong evidence that the presence of antibodies to SARSCoV2 is associated with strong protection
against reinfection, as indicated by a positive test, at eight or more months following the first positive test.

Earlier reports have also shown that among over 1,200 seropositive healthcare workers in the UK, only two infections
were detected after six months of follow up. Both were asymptomatic. This yields an incidence rate ratio of 0.12.

The sample in the above study was composed of healthy participants of working age, and the period of the study was
one of low incidence, with only 1 positive test per 10,000 days at risk. In contrast, the current study was carried out over
a period with sixfold higher incidence.

A Qatar study, including over 1,30,000 confirmed infections, showed that reinfection was detected in only 0.05% of them.
In this case, reinfection was determined on the basis of a positive PCR test at 45 or more days from the first positive
swab.

Documented SARSCoV2 reinfections were exceedingly rare, with an incidence of 0.3 infections for every 1000 persons-
week, and none were severe.”

Leidi, A. et al. (2021). Risk of reinfection after seroconversion to SARSCoV2: A population based propensity score matched cohort study.
medRxiv preprint. doi: 10.1101/2021.03.19.21253889
 https://doi.org/10.1038/d41586-021-01557-z

Se dispone de datos que arrojan luz sobre aspectos a más largo plazo de la respuesta inmune humana a la infección por
coronavirus. Un componente de la respuesta de defensa es la producción de anticuerpos que se dirigen a las proteínas
virales (línea roja). Durante la fase aguda inicial de la respuesta inmune, los niveles de anticuerpos alcanzan un pico
rápidamente; este pico es generado por células inmunes de vida corta llamadas células plasmáticas. Las células plasmáticas
de memoria de larga duración que producen anticuerpos se generan en la médula ósea. Estas células proporcionan una
producción de anticuerpos a largo plazo que ofrece una protección estable a un nivel del 10 al 20% durante la fase aguda
(línea azul). Las células plasmáticas de memoria son un tipo de célula que se puede mantener durante muchos años, si no
durante toda la vida.
DOI: https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2021.100354
Haveri A, et al. Persistence of neutralizing antibodies a year after SARSCoV2
infection. medRxiv, 2021. doi: https://doi.org/10.1101/2021.0
 Historia de la Infección por Sars-Cov-2
Incubación Fase Aguda Recuperación o Persistente Long COVID-19 o
síndrome post covid-
Cuarentena Aislamiento 19 o PASC

Prueba de
antígeno

Pruebas RT-PCR
Pruebas Serológicas
TAC

- 14 -7 0 7 14 21 28 3m 6m–8m

Samuel Pecho-Silva et al. Chemotherapy

 Autoantibodies in severe illness
• Patients with severe COVID-19 may be at risk for developing autoantibodies like those seen in
rheumatoid arthritis or lupus, according to a study on the preprint server MedRxiv.

• Of 52 severely or critically ill COVID-19 patients without histories of autoimmune disease at two
Atlanta hospitals, 44% tested positive for antinuclear antigen, and 24% were positive for
rheumatoid factor.

• Other positive tests included reactivity against phospholipids and prothrombin.

• The researchers say their findings suggest that "the immunological environment of serious
COVID-19 infection ... is sufficient to drive de novo autoreactivity against a variety of self-
antigens." They add, "These findings may be consequential for the identification of patients in
whom immunomodulation may be beneficial.

https://www.jwatch.org/fw117175/2020/10/28/covid-19-antibody-treatment-autoantibodies-severe-illness
SARS-CoV-2 Versus Influenza y otros Coronavirus
R0 del MERS: menor a 1
 Risk for In-Hospital Complications Associated with
COVID-19 and Influenza — Veterans Health
Administration, United States,
October 1, 2018–May 31, 2020

• Hospitalized patients with COVID-19 in the

Veterans Health Administration had a more than
five times higher risk for in-hospital death and
increased risk for 17 respiratory and non-
respiratory complications than did hospitalized
patients with influenza.

• The risks for sepsis and respiratory, neurologic,

and renal complications of COVID-19 were higher
among non-Hispanic Black or African American
and Hispanic patients than among non-Hispanic
White patients

https://www.cdc.gov/mmwr/volumes/69/wr/mm6942e3.htm#T2_down
Seasonal flu vs. COVID-19: A study in The Lancet Respiratory Medicine details the high
morbidity and mortality burden with COVID-19 relative to seasonal influenza.

Researchers studied nearly 46,000 patients who were hospitalized with influenza during the
2018–2019 flu season and 90,000 hospitalized with COVID-19 from March through April.

The in-hospital mortality rate was three times higher with COVID-19 (17% vs. 6% with
flu). Among adolescents, in-hospital mortality was 10 times higher with COVID-19
(1.1% vs. 0.1%). COVID-19 patients were more likely than flu patients to develop acute
respiratory failure, pulmonary embolism, septic shock, or hemorrhagic stroke; they
were less likely to experience myocardial infarction or atrial fibrillation.

The Lancet Respiratory Medicine article on flu vs. COVID-19

SARS-CoV-2 y otras especies
 COVID-19 and Animal
• We do not know the exact source of the current outbreak of coronavirus disease 2019 (COVID-19), but we
know that it originally came from an animal, likely a bat.

• Currently, there is no evidence that animals play a significant role in spreading SARS-CoV-2, the virus that
causes COVID-19, to people.

• Based on the limited information available to date, the risk of animals spreading COVID-19 to people is low.

• More studies are needed to understand if and how different animals could be affected by COVID-19.

• We are still learning about this virus, but it appears that it can spread from people to animals in some
situations.

• People with suspected or confirmed COVID-19 should avoid contact with animals, including pets, livestock,
and wildlife.

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/daily-life-coping/animals.html
 COVID-19 and Animals
• Recent experimental research shows that cats, dogs, ferrets, fruit bats, hamsters, and tree shrews can become infected with the
virus. Cats, ferrets, fruit bats, and hamsters can also spread the infection to other animals of the same species in laboratory
settings.
• Data from studies suggest that dogs can get infected but might not spread the virus to other dogs as easily as cats and ferrets can
spread the virus to other animals of the same species.
• Several studies have investigated non-human primates as models for human infection. Rhesus macaques, cynomolgus macaques,
Grivets, and common marmosets can become infected SARS-CoV-2 and become sick in a laboratory setting.
• Laboratory mice, pigs, chickens, and ducks do not seem to become infected or spread the infection based on results from studies.

• These findings were based on a small number of animals, and do not show whether animals can spread infection to people. More
studies are needed to understand if and how different animals could be affected by COVID-19.

• CDC, USDA, state public health and animal health officials, and academic partners are working in some states to conduct active
surveillance of SARS-CoV-2 in pets, including cats, dogs, and other small mammals, that had contact with a person with COVID-19.
These animals are being tested for SARS-CoV-2 infection and tested to see whether the pet develops antibodies to this virus. This
work is being done to help us better understand how common SARS-CoV-2 infection might be in pets as well as the possible role of
pets in the spread of this virus.

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/daily-life-coping/animals.html
Síntomas de Covid-19
Duración de los síntomas agudos

Leves y Moderados Severos y Críticos

14-21 días 28 a 35 días
StruyfT et al. Cochrane COVID-19 Diagnostic Test Accuracy Group. Signs and symptoms to determine if a patient presenting in primary care or hospital
outpatient settings has COVID-19. Cochrane Database of Systematic Reviews 2021, Issue 2. Art. No.: CD013665. DOI: 10.1002/14651858.CD013665.pub2.
We believe that a prior nasal epithelium invasion by SARS-CoV-2 should activate normal immunological reactions
in patients and promoted type 1 IF activating anti-viral immunity and suppression of hyperinflammation. This
means that infected cells are rapidly cleared, viruses are inactivated by neutralizing antibodies and there is
minimal inflammation. Avoiding in this way a dysfunctional immune response with excessive infiltration of
monocytes, macrophages and T cells, the systemic cytokine storm and the secondary pulmonary and multiorgan
damage.
Infection
https://doi.org/10.1007/s15010-021-01587-9
M. Bonet Beltrán et al. https://doi.org/10.1016/j.aprim.2020.08.009
Prevalencia y Mortalidad
 12 de enero del 2020: Novel coronavirus, nuevo coronavirus, neumonía
contagiosa específica, neumonía Wuhan
comité internacional de taxonomía de virus

06/03/2020: caso Cero en Perú

https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200131-sitrep-11-ncov.pdf?sfvrsn=de7c0f7_2
A 55-year-old individual from Hubei province in China may have been the first person
to have contracted COVID-19, the disease caused by the new coronavirus spreading
across the globe. That case dates back to Nov. 17, 2019, according to the South China
Morning Post.
 Huanan Seafood market

Jin Y, Yang H, Ji W, et al. Virology, Epidemiology, Pathogenesis, and Control of COVID-19. Viruses. 2020;12(4):372. Published
2020 Mar 27. doi:10.3390/v12040372
23 de julio del 2021: ordenados por mortalidad por millón de habitantes

https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries
Datos confiables: @cholega, parra wong
• In total, 47 studies involving 399,265 people from 23 countries met the inclusion criteria.

• The SARS-CoV-2 seroprevalence in the general population varied from 0.37% to 22.1%,
with a pooled estimate of 3.38% (95% CI, 3.05%–3.72%; 15,879/399,265).

• Extrapolating to the 2020 world population, we estimated that 263.5 million individuals
had been exposed or infected at the time of this study.

Rostami A et al. SARS-CoV-2 seroprevalence worldwide: a systematic review and meta-analysis, Clinical Microbiology and Infection,
https://doi.org/10.1016/j.cmi.2020.10.020.
 Seroprevalence metaanalysis predicts 643 million already
infected by SARSCoV2 globally

Overall, these findings indicate that estimating only confirmed COVID19 cases is not sufficient
to determine the actual burden of SARSCoV2 infection. By analyzing seroprevalence to
collective COVID19 incidence ratios, the scientists indicate that about 643 million people
may have already been infected by SARSCoV2 globally, which is much more than the
reported COVID19 cases (currently 56.5 million).

https://www.news-medical.net/news/20201119/Seroprevalence-meta-analysis-predicts-643-million-already-infected-by-SARS-CoV-2-globally.aspx
 Since there appears to be a gradual loss of the virus specific IgG titer, the authors
point out that their observed seroprevalence (11.616.6%) results may still
underestimate the number of individuals who have been infected by the SARSCoV2.

Francois Anna et al. High seroprevalence but shortl ived immune response to SARSCoV2 infection in
Paris. medRxiv 2020.10.25.20219030
https://doi.org/10.3390/microorganisms9040850
Published Online. May 19, 2021. https://doi.org/10.1016/S2214-109X(21)00173-X
 Prevalencia de infección por COVID-19 en distritos de Cusco,
setiembre 2020: estudio poblacional de seroprevalencia de
anticuerpos anti SARS-CoV2

• Se incluyó a 1915 participantes en este análisis, que provenían de 709 familias.

• Las seroprevalencias fueron en el distrito de Cusco de 38,1% (IC 95%: 32,6% - 44,5%), distritos
periféricos de Cusco de 35,3% (IC 95%: 30,7% - 40,4%), y en Quillabamba de 20,6% (IC 95%: 16,3% -
26,0%).

• Método: quimioluminiscencia (prueba Elecsys Anti-SARS-CoV-2 – ROCHE).

Charles Huamaní et al. Fondo Nacional de Desarrollo Científico, Tecnológico y de Innovación Tecnológica (FONDECYT – Perú), y Universidad
Andina del Cusco. “Incidencia de infección por COVID-19 y factores de propagación en una cohorte de pobladores residentes a gran altitud
(Cusco, 3300msnm)”
https://www.medscape.com/viewarticle/937308?src=soc_fb_200916_mscpedt_news_mdscp_hospitalrisk&faf=1
Chafloque-Vásquez R et al. Acta Med Peru. 2020;37(3). doi:https://doi.org/10.35663/amp.2020.373.1050
"Aunque el número de
médicos infectados en
Perú puede ser
considerado más bajo,
en comparación con
otros países de la
región, la tasa de
letalidad (CFR) de
médicos en Perú debido
a COVID-19 parece ser
más alto (~ 5%),
alcanzando valores aún
más altos en algunos
áreas del país“

German Valenzuela-Rodriguez, Lysien I. Zambrano, Fausto Muñoz-Lara, Samuel Pecho-Silva, Kovy Arteaga-Livias, Alfonso J. Rodriguez-Morales.
Intranational differences in the case fatality rates for COVID-19 among Peruvian physicians Int J Infect Dis. 2020 Sep 13;S1201-9712(20)30735-9. doi:
10.1016/j.ijid.2020.09.018
DOI: https://doi.org/10.1016/j.ijid.2021.07.022
Medidas de Prevención gubernamentales y personales
Nussbaumer-StreitB et al. Quarantine alone or in combination with other public health measures to control COVID-19:
a rapid review. Cochrane Database of Systematic Reviews 2020, Issue 4. Art. No.: CD013574.
DOI: 10.1002/14651858.CD013574
 Intervención Reducción Intervalo
Del R
Máscara en algunos 2% -14 – 16%
lugares públicos
Reuniones con menos 2% -20-20%
de 1000 personas
Reuniones con menos 21% 1-39%
de 100 personas
Reuniones con menos 36% 16-53%
de 10 personas
Cierre de negocios de 31% 13-46%
alto riesgo
Cierre de negocios no 40% 22-55%
esenciales
Cierre de escuelas 39% 21-55%
universidades
Permanencia 18% 4-31%
obligatoria en casa

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.05.28.20116129

Scientific Reports | (2020) 10:12567 | https://doi.org/10.1038/s41598-020-68862-x
Pecho-Silva et al. | J Pure Appl Microbiol | 14(suppl 1):713-716 | May 2020
 La mortalidad por COVID-19 se asocia con la eficiencia gubernamental y con el
número de pruebas de diagnóstico realizadas

1. En definitiva, la correlación más fuerte entre mayor mortalidad y menor número de pruebas
diagnósticas se dio en países de bajos ingresos, con puntuaciones más bajas de eficiencia
gubernamental y menor número de camas.
2. Esto sugiere que la intensificación en las pruebas diagnósticas podría ser un enfoque eficaz
para atenuar la mortalidad en aquellos países que hayan mostrado menos eficacia en el control
de brotes, o cuando el número de camas hospitalarias sea insuficiente
3. La idea que subyace en este artículo está en sintonía con el reciente comentario editorial en
The Lancet del Dr. Richard Horton, médico y editor de la misma, en que alude al concepto de la
COVID-19 como una sindemia y no una pandemia, y al consiguiente abordaje erróneo de los
gobiernos para contenerla:

“A diferencia del enfoque pandémico, centrado en controlar la transmisión viral, un enfoque

sindémico revela interacciones biológicas y sociales relevantes para el pronóstico, el
tratamiento y la política de salud”

La mortalidad por COVID-19 se asocia con la eficiencia gubernamental y con el número de pruebas de diagnóstico realizadas - Medscape - 26 de oct de 2020
www.thelancet.com Vol 395 June 27, 2020
https://www.jwatch.org/na52247/2020/09/10/masks-prevent-viral-respiratory-infections?ijkey=F-Lafd-EF
M.A. Benítez et al. https://doi.org/10.1016/j.hlpt.2020.08.014
Ejemplo:
For H1N1 influenza, contact
tracing was estimated to
be 4,363 times more cost-
effective than school closures
($2,260 vs. $9,860 per death
prevented).

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.20.20054726.this version posted June 15, 2020.

Lessons learnt from easing COVID-19 restrictions: an analysis of
countries and regions in Asia Pacific and Europe

Published Online September 24, 2020. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)32007-9

 Coronavirus en América Latina: 5 factores que contribuyeron a
convertir la región en el epicentro de la pandemia en el mundo
1.- ¿Cuarentenas mal sincronizadas?
2. Contagios importados
3. Fallas en el sistema de salud
4. Un mensaje poco claro
5. Una economía precaria

Ángel Bermúdez (@angelbermudez). BBC News Mundo. 17 junio 2020https://www.bbc.com/mundo/noticias-america-latina-53074005

Fisher KA, Tenforde MW, Feldstein LR, et al. Community and Close Contact Exposures Associated with COVID-19 Among Symptomatic Adults ≥18 Years in 11
Outpatient Health Care Facilities — United States, July 2020. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2020;69:1258–1264. DOI:
http://dx.doi.org/10.15585/mmwr.mm6936a5
aOR and 95% CI for community exposures associated with confirmed COVID-19 among symptomatic
adults aged ≥18 years (N = 314) — United States, July 1–29, 2020

Adjusted odds ratio

MMWR / September 11, 2020 / Vol. 69 / No. 36
A reevaluation in 40 family members
33.6 ± 2.7 days after the first
evaluation, show the persistence of
positive IgM and IgG in the 20 positive
cases in the first evaluation.

Having a primary case of COVID-19 in

home, the secondary attack rate of this
infection is 53%

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.09.06.20189456.this version posted September 9, 2020

https://www.medscape.com/viewarticle/937174?src=soc_fb_200912_mscpedt_news_mdscp_coronavirus&faf=1#vp_1
 Vincent et al. Crit Care (2021) 25:40
https://doi.org/10.1186/s13054-021-03467-y
Sohil Khan et al. Expert Opinion on Pharmacotherapy.
Published online: 04 Aug 2020. DOI:
10.1080/14656566.2020.1792884
 Anti-pneumococcal and influenza vaccinations were associated with a decreased probability of a SARS-CoV-2 NPS
positive test in the younger participants (OR = 0.61, 95% CI 0.41–0.91; OR = 0.85,95%CI 0.74–0.98; respectively).

A significantly lower probability of a positive test result was detected in the individuals 65 years who received anti-
pneumococcal vaccination (OR = 0.56, 95%CI 0.33–0.95).

These results need to be confirmed by further investigations, but they are relevant given the probable
coexistence of influenza, bacterial infections, and COVID-19 over the coming autumn–winter season

Vaccines 2020, 8, 471; doi:10.3390/vaccines8030471

Reinfección, Recaída, Re-positivización
 Reinfecciones o recaídas
• NO se ha demostrado hasta la fecha la reinfección o la recaída
• PCR ( - ) x 2 y luego PCR ( + ):
– Fluctuaciones en la carga viral
– En el periodo de recuperación
– Error del equipo
– contaminación
 ¿Reinfecciones?
Autor Casos Probables Referencia
Batisse et al. 11 Clinical recurrences of COVID-19 symptoms after recovery: viral relapse,
reinfection or inflammatory rebound? J Infect. 2020 Jun 30S0163-4453(20)30454-
0. doi: 10.1016/j.jinf.2020.06.073 .
Lafaie et al. 3 Recurrence or Relapse of COVID-19 in older patients: a description of three cases.
J Am Geriatr Soc 2020 1 August
Lan et al. 1 Positive RT-PCR test results in patients recovered from COVID-19. JAMA 2020; 323
:1502–3 .
Tomassini et al. 6 https://doi.org/10.1016/j.jinf.2020.08.011
0163-4453
Kai-Wang To 1 (Real) https://academic.oup.com/cid/advance-
142 días después article/doi/10.1093/cid/ciaa1275/5897019 by guest on 06 September 2020
Diferente clades/lineages
Reinfection of COVID-19 is possible. Studies indicate that about 10% of people with mild infections show little immune
response, increasing their risk for reinfection.

Tomassini et al. Possible SARS-CoV-2 reinfection / Journal of Infection xxx (xxxx) xxx
https://www.medscape.com/viewarticle/936574?src=soc_fb_200902_mscpedt_news_mdscp_whyte&faf=1
Reinfection with SARS-CoV-2: considerations for public health response

• The duration of viral RNA detection (identification of viral RNA through PCR testing in a patient) has been
shown to be variable, with the detection of RNA in upper respiratory specimens shown up to 104 days after the
onset of symptoms.

• Of note, patients have also been reported to have intermittent negative PCR tests, especially when the virus
concentration in the sampled material becomes low or is around the detection limit of a test.

• Additional challenges to classifying suspected cases as ‘confirmed’ reinfections have been the absence of testing
results and the lack of genetic sequencing. Confirmation is further complicated because common criteria for the
identification of reinfections have not yet been established.

• The study estimated the risk of reinfection to be very low at 0.04% (95% CI: 0.03-0.05%), and the incidence
rate of reinfections to be 1.09 (95% CI: 0.84-1.42) per 10 000 person-weeks
European Centre for Disease Prevention and Control. Reinfection with SARS-CoV: considerations for public
health response: ECDC; 2020
 Reinfecciones
• A case report showed a 42-year-old male who was infected with SARS CoV-2 on March 21, 2020 following a workplace exposure. The
patient had resolution of symptoms after 10 days with continued good health for 51 days. On May 24, 2020, the patient presented with
symptoms suggestive of COVID-19 following a new household exposure. Upon testing via SARS-CoV-2 RT-PCR, the patient had confirmed
positive COVID-19 with several potential genetic variations that differed from the SARS-CoV-2 strain sequenced from the patient in
March.

• A 33-year-old male in Hong Kong had contracted COVID-19 in March 2020, which was confirmed via saliva SARS-CoV-2 RT-PCR. The
patient had resolution of symptoms along with two negative SARS-CoV-2 RT-PCR results by April 14, 2020. The patient experienced a
second episode of COVID-19 in August 2020 following a trip to Spain. Although asymptomatic, the patient was tested upon returning to
Hong Kong and tested positive via SARS-CoV-2 RT-PCR. Genomic sequencing was performed on both RT-PCR specimens collected in
March and August. The genomic analysis showed the two strains of SARS-CoV-2 (from March and August) belonged to different viral
lineages, which suggests that the strain from the first episode differed from the strain in the second episode.

• The Collaborative Study COVID Recurrences (COCOREC) group in France reported 11 virologically-confirmed cases of patients with a
second clinically and virologically confirmed acute COVID-19 episodes between April 6, 2020 and May 14, 2020. Although, the letter does
not describe confirmation with viral genomic sequencing to understand if the cases were a relapse of the initial infection or a new
infection.

• Two cases of reinfection have emerged in the United States, a 25-year-old man from Nevada and a 42-year-old man in Virginia. These
cases were confirmed by gene testing that showed different strains of the SARS-CoV-2 virus during the 2 infection episodes in each
patient. In these cases, the patients experienced more severe symptoms during their second infections. It is unclear if the symptom
severity experienced the second time were related to the virus or the how the patients’ immune systems reacted.
European Centre for Disease Prevention and Control. Reinfection with SARS-CoV: considerations for public
health response: ECDC; 2020
In conclusion, our results suggest that in most cases the presumptive recurrence is indeed a prolonged, not
contagious, viral RNA persistence in the respiratory tract, probably due to a slow disease resolution. Further studies
are necessary to definitively understand if a COVID-19 recurrence is possible and whether it could be considered as
a real threat.
The incidence of recurrent SARS CoV 2 positivity was 14.81%. The estimated interval from disease onset to repeat
positivity was 35.44 days, and the estimated interval from the last negative result to recurrent positive result
duration was 9.76 days

European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. https://doi.org/10.1007/s10096-020-04057-6

European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. https://doi.org/10.1007/s10096-020-04088-z
https://doi.org/10.1101/2020.09.05.20189134 y https://doi.org/10.1101/2020.07.19.20157453
 Can elevated concentrations of ALT and AST
predict the risk of ‘recurrence’ of COVID-19?
‘Recurrence’ of coronavirus disease 2019 (COVID-19) has triggered numerous discussions of scholars at home and abroad.

A total of 44 recurrent cases of COVID-19 and 32 control cases admitted from 11 February to 29 March 2020 to Guanggu Campus
of Tongji Hospital affiliated to Tongji Medical College Huazhong University of Science and Technology were enrolled in this study.

All the 44 recurrent cases were classified as mild to moderate when the patients were admitted for the second time. The gender
and mean age in both cases (recurrent and control) were similar. At least one concomitant disease was observed in 52.27%
recurrent cases and 34.38% control cases.

The most prevalent comorbidity among them was hypertension. Fever and cough being the most prevalent clinical symptoms in
both cases.

On comparing both the cases, recurrent cases had markedly elevated concentrations of alanine aminotransferase (ALT) (P = 0.020)
and aspartate aminotransferase (AST) (P = 0.007). Moreover, subgroup analysis showed mild to moderate abnormal concentrations
of ALT and AST in recurrent cases. The elevated concentrations of ALT and AST may be recognized as predictive markers for the risk
of ‘recurrence’ of COVID-19, which may provide insights into the prevention and control of COVID-19 in the future.
Chen LZ et al. (2020). Can elevated concentrations of ALT and AST predict the risk of ‘recurrence’ of COVID-19? Epidemiology and Infection 148, e218,
1–7. https://doi.org/10.1017/S0950268820002186
Cases of reinfection with SARS-CoV-2 with different virus strains or
clades based on sequence analysis

https://academic.oup.com/cid/advance-article/doi/10.1093/cid/ciaa1866/6041697Reinfection with SARS-CoV-2: Implications for Vaccines

https://academic.oup.com/cid/advance-article/doi/10.1093/cid/ciaa1866/6041697Reinfection with SARS-CoV-2: Implications for Vaccines
Yahav D, et al. Definitions for COVID-19 reinfection, relapse and PCR re-positivity, Clinical Microbiology and Infection, https://doi.org/10.1016/j.cmi.2020.11.028.
 Probables Causas de re-positivización del RT-PCR

• Some researchers believe that a positive retest for SARS-CoV-2 may

be explained by:

• Reactivation or relapse of the infection

• Reinfection hypothesis

• A retest result of SARS-CoV-2 positivity should be interpreted correctly thanks

to a false-negative test result at discharge, prolonged virus shedding, a
rebound in virus replication after drug discontinuation and reinfection.
• However, the reinfection rate may be underestimated as a result of
asymptomatic infections in one or both episodes.
New Microbes and New Infections, Volume 38 Number C, --- 2020
Yahav D, et al. Definitions for COVID-19 reinfection, relapse and PCR re-positivity, Clinical Microbiology and Infection, https://doi.org/10.1016/j.cmi.2020.11.028.
 Implications of reinfection with SARS-CoV-2

• Precautions masks, distancing are still important after recovery from SARS CoV 2
in the absence of a potent vaccine or antiviral
• Previously infected persons may need vaccination
• Herd immunity from infection is unlikely to be sufficient to eliminate the virus if
reinfection is common
• Second infection is likely, but not necessarily, to be milder
• Vaccination may not provide lifelong immunity; booster doses may be needed
• Annual quadrivalent flu vaccine may include SARS CoV 2 vaccine as a component

https://academic.oup.com/cid/advance-article/doi/10.1093/cid/ciaa1866/6041697Reinfection with SARS-CoV-2: Implications for Vaccines

 SARS-CoV-2 Reinfection Uncommon, but Older Adults Seem at
Higher Risk

By Amy Orciari Herman

Edited by Susan Sadoughi, MD, and Richard Saitz, MD, MPH, FACP,
DFASAM

Risk for reinfection with SARS-CoV-2 is generally low — but it's higher
among adults aged 65 and older — according to a population-based
study from Denmark published in The Lancet.

Researchers examined PCR test results among roughly 525,000 people

who were tested for SARS-CoV-2 from February through December
2020. Of some 11,000 who tested positive during the first surge of the
pandemic in March-May, just 0.7% tested positive again during the
second surge in September-December. Of those who tested negative
during the first surge, 3.3% tested positive during the second surge.

In a separate analysis, the reinfection rate was 8 per 100,000 person-

days of follow-up among people aged 65 and older, versus 4-6 per
100,000 person-days among younger age groups.

Commentators write, "The quality, quantity, and durability of protective

immunity elicited by natural infection with SARS-CoV-2 are poor relative
to the much higher levels of virus-neutralising antibodies and T cells
induced by the vaccines." They add, "The hope of protective immunity
through natural infections might not be within our reach, and a global
vaccination programme with high efficacy vaccines is the enduring
solution
This implies a significantly reduced
risk of reinfection (relative risk
0.20, 95% CI 0.05 to 0.81) in those
with prior SARS-CoV-2 infection but
without detectable antibodies,
compared to those with no
previous evidence of infection. We
also found 2087 RNA-positive
antibody positive patients in the
first wave, with 18 reinfections
(0.86%) – this was like the
proportion in the RNA-positive
antibody-negative patients
(relative risk 1.04).

https://doi.org/10.1016/j.jinf.2021.05.024
• Across studies, the total number of PCR‐positive or antibody‐positive participants at baseline was 615,777, and
the maximum duration of follow‐up was more than 10 months in three studies.

• Reinfection was an uncommon event (absolute rate 0%–1.1%), with no study reporting an increase in the risk of
reinfection over time.

• Only one study estimated the population‐level risk of reinfection based on whole genome sequencing in a subset
of patients; the estimated risk was low (0.1% [95% CI: 0.08–0.11%]) with no evidence of waning immunity for up to
7 months following primary infection.

• These data suggest that naturally acquired SARS‐CoV‐2 immunity does not wane for at least 10 months
post‐infection.

• However, the applicability of these studies to new variants or to vaccine‐induced immunity remains uncertain.

https://doi.org/10.1002/rmv.2260
Mutaciones y Variantes
Descripción de mutaciones y variantes

ES UNA SÍNTESIS DE LA EVIDENCIA REALIZARA POR PECHO-SILVA ET AL.

Y ENVIADA PARA PUBLICACIÓN
SE PIDE NO USAR PÚBLICAMENTE
https://www.news-medical.net/news/20201110/Identifying-SARS-CoV-2-spike-protein-mutations-resistant-to-antibodies.aspx
 Mutaciones
• La secuenciación completa del genoma del SARS-CoV-2 se realizó el 7 de enero del 2020
haciéndose público el primer borrador del genoma del nuevo coronavirus el 10 de enero
del 2020. A la fecha, se han realizado más de 1,2 millones de secuencias genómicas del
SARS-CoV-2 y la comunidad científica ha ganado mucho conocimiento con estas
secuenciaciones.

• En su mayoría, las primeras 2700 mutaciones identificadas se han producido en los genes
que codifican a la prS. Las mutaciones se producen por varios mecanismos entre ellos la
adaptación al hospedero, la selección natural, la respuesta inmunológica durante la
infección, la presión farmacológica: vacunas, plasma convaleciente, entre otras. Las 10
primeras secuenciaciones genómicas que se realizaron del SARS-CoV-2 mostraron un
99.98% de coincidencia entre ellas indicando que a pesar de ser un virus de ARN tenía
una baja mutabilidad y esto sigue siendo así.
Clinical Implications of Basic Research. n engl j med
• D614G-associated SARSCoV-2 are more likely to have higher viral loads in the upper
respiratory tract than patients infected with virus strains without the mutation, but
disease severity is not affected.

• Pseudotyped viruses with the G614 form of the SARS-CoV-2 spike protein have been
reported to exhibit increased infectivity in continuous cell lines and increased
sensitivity to neutralization.

• In addition, structural analyses have revealed that the RBD of the G614 form of the
spike protein is more likely to assume an “open” conformation than the RBD of the
ancestral D614 form, implying an improved ability to bind to the hACE2 receptor.
 Mutaciones
• La mutación T478K: está ubicada en la prS y su frecuencia ha aumentado exponencialmente desde inicios
del 2021, esto ha sucedido junto a la mutación D614G que ya hemos descrito previamente (1).
Actualmente el 90% de los virus SARS-CoV-2 circulantes en el mundo tiene la mutación D614G. Por su
parte, sólo el 2% de los virus SARS-CoV-2 circulantes tiene la mutación T478K.

• La mutación N501Y: se produce porque el aminoácido asparagina (N) ha sido reemplazado por tirosina (Y)
en la posición 501. Esta mutación también está ubicada en el RBD de la prS y fue inicialmente observada
por el servicio de monitoreo de Inglaterra, luego de un aumento de casos en las ciudades de Kent y
Londres. Esta mutación llamó rápidamente la atención de los investigadores debido a que está mutación
se ha relacionado con un impresionante aumento de la transmisibilidad y también de una mayor
letalidad.

• La mutación E484K: también se ubica en la prS y puede generar un escape o falta de respuesta a los AcN
generados por la infección previa por el SARS-CoV-2 o por los generados por las vacunas, llegando a
conferir una reducción de hasta diez veces en la actividad neutralizante del suero de personas vacunas.
• Mutaciones L452R y la E484Q que se ubican en el RDB, y que de manera independiente parecen
contribuir a la falta de respuesta a los anticuerpos neutralizantes.
– La mutación E484Q sólo produce un menor impacto sobre la reducción de esta actividad. Pero
cuando se presentan las mutaciones combinadas E484Q y L452R en una misma variante la
pérdida de la sensibilidad al suero de pacientes vacunados es estadísticamente significativa
cuando se compara con el SARS-CoV-2 original o salvaje.
– Pero, una triple mutación conformada por las mutaciones E484Q/K más la mutación P681R si
puede aumentar significativamente la capacidad de fusión del SARS-CoV-2 al receptor ACE2 de la
célula humana. Las mutaciones L452R o E484Q parecen responsables de la disminución
moderada en la neutralización de anticuerpos producidos a partir de la vacuna de ARN de
Pfizer/BioNTech.
 Variantes
• Cuando los virus de una misma especie desarrollan diferentes secuencias
genómicas debidas a unas más mutaciones, se denominan variantes o linajes.
• Existen miles de variantes de SARS-CoV-2 que se diferencian entre sí por al menos
una mutación. La mayoría de estas variantes no son más peligrosas, incluso
algunas variantes pueden debilitar al virus.
• Al inicio de la pandemia se reportaron 3 variantes del genoma del virus que
pueden clasificarse filogenéticamente en diferentes clados:
• Tipo A y C que estaban presentes en Asia, Europa y Estados Unidos de Norteamérica
• Tipo B que es la variante más frecuente en Asia.
• Estos clados son grupos de variantes que comparten un antepasado común. También se han
descrito algunos tipos de clados de menor importancia como el tipo L que mostraba mayor
agresividad y velocidad de transmisión y el tipo S que era estructuralmente más estable.
Long, S. W. et al. (2020) Molecular Architecture of Early Dissemination and Massive Second Wave of the SARSCoV2 Virus in a Major
Metropolitan Area. MedRxiv 2020.09.22.20199125; doi: https://doi.org/10.1101/2020.09.22.20199125,
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.09.22.20199125v3
Zhang X, Tan Y, Ling Y, et al. Viral and host factors related to the clinical outcome of COVID-19 [published online ahead
of print, 2020 May 20]. Nature. 2020;10.1038/s41586-020-2355-0. doi:10.1038/s41586-020-2355-0
Recientemente, los autores han propuesto una modificación según la cual, los clados que alcancen una prevalencia del 30%
durante más de dos meses también serán nombrados con su propia letra a partir de ese momento, así como las variantes
emergentes que generen especial preocupación (VOC, del inglés variant of concern) las cuales, además, recibirán un sufijo
con la mutación más representativa, p. ej. 20I/501Y.V1.
Elaboración propia por Pecho-Silva et al. Para publicación científica – 27 de junio del 2021
 Variantes de Interés

• Se define por cambios genéticos que sugieren que podría ser más contagioso o que
pueden ayudarlo a escapar de la inmunidad conferida por la infección natural o la
vacunación. Es posible que las terapias y las pruebas no funcionen tan bien en su
contra.

• Dentro de este grupo se encuentran:

– B.1.427/B.1.429 (épsilon)
– P.2 (zeta)
– B.1.525 (eta)
– B.1.526 (iota)
– B.1.617.1 (kappa)
– C.37 (lambda)
 La variante B.1.427 y la variante B.1.429 o Epsilon según OMS

• Descubiertas en el estado de California en Estados Unidos de Norteamérica, también son llamadas

CAL.20C/L452R o B.1.427/B.1.429. Ambas son aproximadamente un 20% más transmisibles que el
SARS-CoV-2 “salvaje” y pueden no responder tan bien a ciertos tratamientos como los anticuerpos
monoclonales para los casos leves y moderados de COVID-19.
• La B.1.429 representa el 8.1% del SARS-CoV-2 circulante en los Estados Unidos de Norteamérica,
mientras que B.1.427 representa el 3.3%. Fueron detectadas por primera vez en el sur de California en
octubre del 2020 y luego por la Universidad de San Francisco en diciembre del 2020 aunque ahora
sabemos que surgieron en julio de 2020 en Los Ángeles, California. Al 24 de febrero del 2021 ya se ha
identificado esta variante en todos los estados de Estados Unidos de Norteamérica y en 19 países.
• En 4 meses, la prevalencia de esta variante aumentó de 0% a 21,3% en California. La B.1.427 y la
B.1.429 tienen 3 mutaciones en la prS. De las 3 mutaciones, lo que más preocupa es L452R, lo que
permite que el virus se adhiera más estrechamente a las células y pueda escapar a los tratamientos
con anticuerpos monoclonales. Se ha aislado esta variante de un gorila en el zoológico de San Diego
en California, el único caso registrado de infección por SARS-CoV-2 en un simio.
 La variante P.2 derivada de la B.1.1.248 o zeta según OMS

• Presentan la mutación E484K que permite el escape a la actividad neutralizante de

anticuerpos generados en infecciones pasadas. Es menos frecuente y transmisible
que la variante P.1 y también se le encuentra en la Amazonia brasileña.
• En un estudio experimental se ha logrado infectar a ratones de laboratorio no
modificados con dos de las variantes de SARS-CoV-2 (B.1.351 y P.1), algo que no
ocurría con la variante “salvaje” lo que sugiere un aumento de transmisibilidad
interespecies.
• Si esta noticia se confirma se abre la puerta a la existencia de nuevos reservorios no
humanos desde los que el virus puede evolucionar de manera independiente

• Una variante de este grupo es la P3

 La variante B.1.525 (eta) /1.526 (iota)

• Fue detectada en personas en Dinamarca desde el 20 de noviembre de 2020 y ya no

circula en humanos.
• Estaba asociada con la transmisión de cultivos de visones.
• Las implicaciones clínicas de esta nueva variante aún no se comprenden bien; sin
embargo, Se han informado mutaciones en la prS como la G/484K.V3. Todos los
visones de las granjas afectadas fueron sacrificados.
• Otros siete países han notificado SARS-CoV-2 en visones de cría (Lituania, Grecia,
España, Italia, Países Bajos, Suecia y Estados Unidos).

Eta B.1.525 G484K Nueva York

Iota B.1.526 S484K Nueva York

 Variante B.1.617.1 o Kappa según OMS

Es un linaje de la variante “india”

Esta variante tiene al menos 15 mutaciones, nueve de las cuales se ha producido en la prS, dos mutaciones se han
producido en el RBD y una mutación en la subunidad S2 de la prS. Pero la presencia de dos mutaciones simultáneas
son las que generan la mayor preocupación: la mutación E484Q que le confiere una potencial mayor unión al ACE2,
así como una mejor capacidad para evadir el sistema inmunológico y la mutación L452R que le confiere una mayor
afinidad de la prS al ACE2 y una menor capacidad de reconocimiento del sistema inmune

El linaje se divide a su vez en tres subgrupos, presentando todos ellos la mutación L452R:

1) B.1.617.1 (con mutaciones: L452R, E484Q o P681R): kappa

2) B.1.617.2 (con mutaciones: L452R, T478K, P681R y pierde la mutación E484Q: designada como VOC por tener
mayor infectividad
3) B.1.617.3 (reapareciendo la mutación E484Q)
 Variantes de preocupación

• Una variante de preocupación se define como aquella que está asociada con un
aumento de la transmisibilidad, una enfermedad más grave, una reducción de la
neutralización por anticuerpos generados por una infección o vacunación previa, una
reducción de la eficacia de los tratamientos o vacunas o evidencia de falla de la
prueba.

• El CDC está rastreando cinco de estos:

– B.1.1.7,
– B.1.351
– P.1
– B.1.617.2
 La variante B.1.1.7 o variante “británica” o Alfa según OMS
• Observada por el servicio de monitoreo de Inglaterra, luego de un aumento de casos en las ciudades de Kent y Londres.
• La presencia de la mutación N501Y fue la primera que se identificó dentro de esta variante que se denominó inicialmente VUI-
202012/01 y que luego pasaría a llamarse VOC-202012/01.
• Esta variante fue identificada como la primera variante investigada en diciembre de 2020. Sin embargo, se conoció luego que esta
variante ya circulaba en Inglaterra desde setiembre del 2020 y se informó de ella el 14 de diciembre del 2020 a la Organización
Mundial de la Salud (OMS). En estos momentos esta variante es la dominante en el Reino Unido y ya ha sido reportada en más de 90
países. Tiene en total 23 mutaciones
• Otras mutaciones dentro de la variante B.1.1.7: mutación P681H cuya función aún no está clara, delecciones en las posiciones 69-70
en la prS que se ha relacionado con escapes inmunitarios en pacientes inmunodeprimidos y con el aumento in vitro de la infectividad
viral. Estas delecciones pueden disminuir o alterar la sensibilidad diagnóstica de algunas pruebas moleculares (RT-PCR) que detectan
el gen S. Sin embargo, la mayoría de las pruebas comerciales de RT-PCR utilizan diferentes genes por lo que resulta difícil que esto
ocurra.
• Por otro lado, esta particularidad puede suponer una ventaja desde el punto de vista de la vigilancia epidemiológica ya que la
ausencia de amplificación del gen S en muestras positivas para otras dianas o genes evaluados podría ser de utilizada como cribado
para detectar esta nueva variante.
• Existe evidencia consistente de neutralización cruzada entre los sueros convalecientes de individuos que han sido infectados con otras
variantes y la variante B.1.1.7. Esto quiere decir que esta variante es afectada por la respuesta inmunológica adquirida luego de la
infección por otras variantes o por la inmunidad secundaria a la vacunación cualquiera sea esta (11,17).
 La variante B.1.1.7 o variante “británica” o Alfa según OMS
• Observada por el servicio de monitoreo de Inglaterra, luego de un aumento de casos en las ciudades de Kent y Londres.

• La presencia de la mutación N501Y fue la primera que se identificó dentro de esta variante que se denominó inicialmente VUI-
202012/01 y que luego pasaría a llamarse VOC-202012/01.

• Existe evidencia consistente de neutralización cruzada entre los sueros convalecientes de individuos que han sido infectados con otras
variantes y la variante B.1.1.7. Esto quiere decir que esta variante es afectada por la respuesta inmunológica adquirida luego de la
infección por otras variantes o por la inmunidad secundaria a la vacunación cualquiera sea esta (11,17).
 La variante B.1.1.7 o variante “británica” o Alfa según OMS
• Se ha reportado que un subgrupo de la variante B.1.1.7 también presenta la mutación E484K. Esto se ha informado a
partir de un pequeño grupo de casos en el suroeste de Inglaterra. No se han reportado mayor hospitalización o muerte
con esta variante con mutación E484K. No se han notificado casos internacionales, pero como se ha descrito, esta
mutación puede generar un escape o falta de respuesta a los AcN generados por la infección previa por el SARS-CoV-2 o
por los generados por las vacunas. A excepción de etesevimab, los otros cuatro anticuerpos monoclonales neutralizaron
activamente la variante B.1.1.7.
• A Nivel de América, la variante B.1.1.7 representa el 20 a 30% de todos los virus aislados de las muestras de pacientes
con COVID-19 de Estados Unidos de Norteamérica y ya ha sido reportado en México, Chile, Ecuador, Brasil, Perú y
Colombia entre otros.
• Reportes hasta el 21 de enero del 2021 indicaban que esta variante puede generar que mueran de 13 a 14 pacientes por
cada 1000 hombres de 60 años infectados, esto significa un aumento de 10 pacientes de cada 1000 comparado con el
virus “salvaje”. Esto se traduce en un incremento en la mortalidad promedio de 60 a 100% y un incremento de la
transmisibilidad de entre 40 a 70% (13–15). La B.1.1.7/V1 está causando actualmente la mayoría de las infecciones en
Europa y América del Norte.
• Estudios realizados en Inglaterra han reportado también un incremento en el riesgo de mortalidad debido a esta
variante del 55% luego de ser ajustado por edad, sexo y raza, falta de accesos a servicios de salud entre otros. Esto se
traduce en un incremento en la mortalidad para varones de entre 55 a 69 años de un 0.6% a un 0.9% dentro de los 28
días de haber salido positivo en una prueba RT-PCR
https://doi.org/10.1038/s41586-021-03426-1
 La variante 501Y.V2 o B.1.351 o variante “sudafricana” o beta según OMS

• Identificada a finales del 2020 por “The Network for Genomic Surveillance in South Africa”
• Se detectó la variante 501Y.V2 o variante PANGO B.1.351 y fue reportada a la OMS el 18 de diciembre
del 2020.
• Se caracteriza principalmente por la mutación N501Y (mutación que también está presente en la
variante “británica”).
• Esta variante es la dominante en ese país y ha desplazado al resto de variantes circulantes en
Sudáfrica desde el mes de octubre del 2020 y es la responsable de la gran velocidad de transmisión
del SARS-CoV-2 en la comunidad en la segunda ola.
• El análisis filogenético indica que tiene un origen diferente y es también diferente de la variante
B.1.1.7.
• Esta variante también presenta la mutación E484K, la K417N y la L18F. A finales de diciembre del 2020
la variante se había detectado ya en 4 países y actualmente se reporta en más de 50.
• Se caracteriza también por aumentar la carga viral y por lo tanto tener una mayor transmisibilidad
• Esta variante hasta la fecha no ha mostrado una adecuada neutralización a partir de la inmunidad
generada por las vacunas.
 La variante P.1 o Variante B.1.1.248 o variante “brasileña” o gamma según OMS

• Fue identificada inicialmente en Japón a principios de enero de 2021 en cuatro personas procedentes de la
Amazonía brasileña. Esta nueva variante presenta 17 mutaciones de las cuales 3 se ubican en la prS
(K417T, E484K y N501Y).
• Esta variante comparte la mutación N501Y con la variante “británica” y la “sudafricana” y comparte la
mutación E484K con la variante “sudafricana” y un subgrupo de la variante “británica”
• Estas mutaciones dan como resultado cambios antigénicos en la prS, lo que podría reducir la eficacia de los
anticuerpos neutralizantes generados contra el SARS-CoV-2.
• Brasil también ha informado de la presencia de esta nueva variante en varias secuencias obtenidas de la
región de Manaos en la Amazonía de Brasil recogidas en la segunda mitad de diciembre del 2020, por lo
que la dirección de transmisión se supone haya sido desde Brasil a Japón. Esta variante ya ha mostrado ser
más contagiosa, aunque no más letal y escapar de la capacidad de neutralización de los anticuerpos
producidos por una infección previa o por las vacunas.
• Se calcula que la variante “brasileña” en la ciudad de Manaos debió causar reinfecciones en 25 a 61% de
los previamente infectados en el 2020. Adicionalmente en Brasil se ha reportado un par de casos
infectados con dos variantes distintas al mismo tiempo, lo cual preocupa desde el punto de vista de
posibilidad de generar mayor variabilidad genética.
• La variante V3 del linaje P.1 se ha vuelto dominante en Brasil y en el sur América
 La variante B.1.617 o variante “india” o Delta según OMS):
• Fue inicialmente identificada en el estado de Maharashtra en India, el 5 de octubre del 2020, conocida como la variante con “doble
mutación” y previamente denominada VOC-21APR02.
• Esta variante tiene al menos 15 mutaciones, nueve de las cuales se ha producido en la prS, dos mutaciones se han producido en el RBD
y una mutación en la subunidad S2 de la prS. Pero la presencia de dos mutaciones simultáneas son las que generan la mayor
preocupación: la mutación E484Q que le confiere una potencial mayor unión al ACE2, así como una mejor capacidad para evadir el
sistema inmunológico y la mutación L452R que le confiere una mayor afinidad de la prS al ACE2 y una menor capacidad de
reconocimiento del sistema inmune
• La aparición de ambas mutaciones en la misma variante es única hasta el momento. También presenta otras mutaciones entre ella la
P681R.
• El linaje se divide a su vez en tres subgrupos, presentando todos ellos la mutación L452R:
– 1) B.1.617.1 (con mutaciones: L452R, E484Q o P681R)
– 2) B.1.617.2 (con mutaciones: L452R, T478K, P681R y pierde la mutación E484Q: designada como VOC por tener mayor
infectividad
– 3) B.1.617.3 (reapareciendo la mutación E484Q)
• Se estima que esta variante es la responsable de la alta trasmisibilidad en la India y el gran número de fallecidos aunque. Ya se estima
una mayor letalidad en sí misma.
• Con respecto a la variante B.1.617.2, todos los anticuerpos monoclonales excepto Bamlanivimab retuvieron su potencia activa de
neutralización del virus. La adquisición de la mutación L452R podría ser la causante la pérdida de efectividad del Bamlanivimab frente a
esta variante, así como una reducción de su respuesta al plasma convaleciente y Ac neutralizantes naturales y post vacunación
 Otras variantes I

• La variante B.1.1.22: fue detectada inicialmente en México en abril del 2020. La

mutación T478K está presente en alrededor del 65% de esta variante. Esta variante
está presente en el 38.1% de los casos de COVID-19 en México y en alrededor de
1.3% de los casos de Estados Unidos de Norteamérica y es muy infrecuente dentro
de los casos de COVID-19 en Europa.
• La variante B.1.1.207: tiene dos secuencias que se identificaron por primera vez en
Nigeria, aunque se desconoce hasta el momento en dónde surgió por primera vez. La
mutación P681H caracteriza a esta variante. Actualmente no hay evidencia que
sugiera que esta variante tenga algún impacto sobre la transmisión o la gravedad de
la enfermedad.
 Otra variantes II

• La variante B.1.111 o “variante colombiana”: presenta las mutaciones L249S y E484K

lo cual la convertiría en una variante de preocupación. Como hemos mencionado
estas mutaciones le confieren al virus la capacidad de escapar del sistema
inmunológico. Estas mutaciones están asociadas con las variantes “brasileña” y
“sudafricana”
• La variante A.VOI.V2: Identificada en Angola, esta nueva variante tiene un total de
31 mutaciones por sustitución de aminoácidos y 3 mutaciones por delección. De
estas, 11 de 31 mutaciones de sustitución y todas las mutaciones por deleción se
encontraron en la prS. Algunas mutaciones de interés de esta variante son R346K,
T478R y E484K. Aunque esta variante se ha identificado solo en tres pasajeros de
Tanzania, los científicos creen que se necesitan con urgencia más investigaciones
para controlar su transmisión dentro y fuera del país de origen
B.1.111

LaitonDonato K, et al. Novel highly divergent SARSCoV2 lineage with the Spike substitutions L249S
and E484K. medRxiv, 2021. doi: 10.1101/2021.03.12.21253000
 Otras variantes III

• La variante C.37: posee características similares a variantes de mayor preocupación por su

alta capacidad de transmisión como la P.1, B.1.1.7 y B.1351 pero aún no es posible afirmar
que es más contagiosa o letal. Esta variante desciende de la variante B.1.1.1 que circula por
todo el mundo desde inicios de la pandemia y se ha reportado en Perú y Chile. La C.37 y la
P.1 comparten la mutación ORF1a: 3675-3677 por este motivo es posible que muchas de las
muestras identificadas como P.1 sean en realidad C.37
• Otras variantes: Se han reportado otras variantes que hasta la fecha no han sido clasificadas
o están en investigación como la variante C.16 de Portugal, la variante del clado viral 19B
(con 18 mutaciones incluyendo las mutaciones N501Y, L452R, H655Y) y la variante 20C
ambas en Francia (25), la variante B.1.298 con una mutación predominante Y453F (6,21), la
B1.1.318 y B1.324.1 (estas dos últimas con mutación E484K), la P.3 en Filipinas y la
recientemente identificada variante GRL o linaje B.1.1/S con la mutación V1230L (26); la
importancia clínica aún se desconoce y están clasificadas como en investigación (VUI).
 Variante de gran consecuencia

• Hasta ahora, ninguna de las variantes emergentes ha cumplido con los criterios de
los CDC para variantes de gran consecuencia.

• Estos se definen como falla demostrada de las pruebas de diagnóstico, una reducción
significativa en la protección de la vacuna, una susceptibilidad significativamente
reducida a los tratamientos autorizados y una enfermedad clínica más grave y más
hospitalizaciones
 Cepa
• Cuando una variante tiene características muy diferentes al virus
original, como diferencias en su capacidad para propagarse o causar
una enfermedad grave, entonces se denomina cepa. Todas las cepas
son variantes, pero no todas las variantes son cepas. Hasta la fecha no
se ha detectado una nueva cepa del SARS-CoV-2.
The New England Journal of Medicine
El futuro…
• Hace solo un año, gran parte del mundo estaba unida en un encierro en medio del primer brote de COVID-19. Hoy, la experiencia
global es muy divergente:

• Israel, Nueva Zelanda, Vietnam y Brunei bien pueden estar acercándose a la eliminación.

• El Reino Unido, Estados Unidos y China, por su parte, parecen cohabitar.

• Por el contrario, India, otras partes del sudeste asiático y gran parte de América del Sur parecen estar abrumadas por un estado
similar a una conflagración.

• Revertir la suerte de las naciones que se encuentran en las garras de un estado similar a la conflagración requerirá la acumulación
de inmunidad a nivel de la población a través de vacunas capaces de neutralizar nuevas variantes virales.

• Los avances en el desarrollo de terapias altamente efectivas, en caso de que ocurran, podrían alterar aún más el status quo global
con miras a acelerar la recuperación, especialmente en el contexto de la conflagración.

• En última instancia, dónde terminen los países en el espectro final del juego dependerá tanto de las elecciones colectivas Y las
realidades de la comunidad global y la dinámica a menudo inescrutable y quizás impredecible del SARS-CoV-2.

Published Online: July 8, 2021.

doi:10.1001/jama.2021.11042
Evaluación del pronóstico, severidad,
requerimiento de TOT, VMI, UCI
35 463 patients were included in the derivation
dataset (mortality rate 32.2%) and 22 361 in the
validation dataset (mortality rate 30.1%).

BMJ2020;370:m3339
http://dx.doi.org/10.1136/bmj.m3339
At a score of >3, sensitivity, specificity, and positive and negative predictive values were 80% (73% a 85%), 76%
(70% a 81%), 69% (60% a 74%) and 85% (80% a 89%), respectively

Bartoletti M et al., Development and validation of a prediction model for severe respiratory failure in hospitalized patients with SARS-CoV-2 infection:
a multicentre cohort study (PREDI-CO study), Clinical Microbiology and Infection, https://doi.org/10.1016/j.cmi.2020.08.003
 The BAS²IC score: a useful tool to identify patients at high risk of
early progression to severe COVID-19
Using a cut-off of >6 points, the negative and positive predictive values were 87% and 49%, respectively. cohort
of 1,045 patients, the mean age was 66 years. Score ≤6 points with a NPV of 87%;

https://academic.oup.com/ofid/advance-article/doi/10.1093/ofid/ofaa405/5900303
 (https://qcovid.org/BMJ/)

Cite this as: BMJ 2020;371:m3731. http://dx.doi.org/10.1136/bmj.m3731. Accepted: 23 September 2020

Over 96% of subjects with CALL score of 4-6
points will not progress to severe disease. In
our cohorts of 208 patients, 133 (63.9%) had
4-6 points (class A), including patients age > 60
but without comorbidities, these patients
could be safely managed at peripheral or
district hospitals. On the other hand, some
patients age < 60 without comorbidities, might
benefit from early transfer to tertiary centers
if they had markedly elevated LDH and severe
lymphopenia (7 or more points)
Mancilla-Galindo J et al. (2020). Epidemiology and Infection 148,e286, 1–8. https://doi.org/10.1017/S0950268820002903
Resumen sugerido
• https://emedicine.staging.medscape.com/article/2500114-overview
[email protected]

Grupo Peruano de Salud Respiratoria

Muchas Gracias