UNIVERSIDAD NACIONAL JORGE BASADRE GROHMANN
FACULTAD DE INGENIERÍA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA QUÍMICA
CURSO DE BIOQUÍMICA
BIOELEMENTOS,
BIOMOLÉCULAS Y AGUA
Dr. Raúl Paredes Medina
Tacna – Perú
INTRODUCCIÓN
La Bioquímica es una ciencia que estudia la
composición de los seres vivos en términos moleculares,
es decir el estudio de las características químicas de las
biomoléculas (carbohidratos, lípidos, proteínas,
nucleótidos), las transformaciones que estas sufren
como componentes de las células y los tejidos, así como
la interrelación entre ellas. Desde un enfoque
metabólico, la Bioquímica se encarga del análisis del
enorme conjunto de reacciones bioquímicas que se
llevan a cabo dentro de la célula, con la finalidad de
producir energía y/o la síntesis de moléculas que el
organismo necesita, lo que se denomina, catabolismo y
anabolismo respectivamente.
Definición
La bioquímica es la ciencia que estudia la
composición química, la estructura y las interacciones
de las sustancias que constituyen a los seres vivos.
Objetivo
El objetivo fundamental de la bioquímica es
estudiar la estructura, la organización y las funciones
(metabolismo) de los componentes de la materia viva,
desde el punto de vista molecular.
Campos de estudio de la Bioquímica
La bioquímica puede dividirse en tres grandes campos
de estudio:
• Estructural: estudia la composición, conformación,
configuración, y estructura de las moléculas,
relacionándolas con su función bioquímica.
• Metabólica: estudia las transformaciones, funciones
y reacciones químicas que sufren o llevan a cabo las
moléculas en los organismos vivos.
• Molecular: estudia la química de los procesos y
moléculas implicadas en la transmisión y
almacenamiento de la información biológica.
Bioelementos
De los más de 100 elementos encontrados en la
Tabla periódica, la materia viva está constituida
por unos 70 elementos y solo alrededor de 21, son
esenciales para el desarrollo y conservación de la
vida. Estos elementos se llaman bioelementos o
elementos biogénicos.
CLASIFICACIÓN DE LOS BIOELEMENTOS
Bioelementos Primarios
Están formados por: C, H, O, N, P y S, los cuales constituyen
alrededor del 96,2 % de la materia viva en base seca. Son los
componentes fundamentales de las biomoléculas. Son
imprescindibles para formar: carbohidratos, lípidos, proteínas y
ácidos nucleicos.
Bioelementos Secundarios
Grupo comprendido por los iones: Na+, K+, Ca2+, Mg2+, Cl-.
Estos elementos, aunque se encuentran en menor proporción
que los primarios, también son indispensables para los seres
vivos. En medio acuoso (solvente presente en células tejidos y
órganos), siempre se encuentran ionizados.
Oligoelementos
Son aquellos bioelementos que se encuentran en los
seres vivos en un porcentaje menor del 0,1 %. Algunos,
los indispensables, se encuentran en todos los seres
vivos, mientras que otros, variables, solamente los
necesitan algunos organismos. En este grupo se
encuentran: Fe, Cu, Zn, Mn, I, Ni y Co (que aparecen
en la mayoría de los organismos) y Si, F, Cr, Li, B, Mo
y Al (sólo están presentes en grupos concretos).
Constituyen menos del 0,1 % y son esenciales para
desempeñar procesos bioquímicos y fisiológicos.
Tabla Resumen de los bioelementos
El hecho de que los bioelementos primarios sean tan abundantes
en los seres vivos se debe a que presentan ciertas características
que los hacen idóneos para formar las biomoléculas que
constituirán las estructuras biológicas y llevarán a cabo las
funciones vitales.
El C, H, O, N, P y S tienen capas electrónicas externas
incompletas, pueden formar enlaces covalentes y dar lugar a la
formación de biomoléculas. Por eje, el carbono C: 1s2, 2s2, 2p2
El C y el N presentan la misma afinidad para unirse al oxígeno o
al hidrógeno, por lo que pasan con la misma facilidad del estado
oxidado al reducido. Esto es de gran importancia, pues los
procesos de oxidación-reducción son la base de muchos procesos
químicos muy importantes y en particular de los relacionados con
la obtención de energía como la fotosíntesis y la respiración
celular.
El C, H, O y N son elementos que tienen una masa
atómica pequeña y variabilidad de valencias, por lo
que pueden formar entre sí enlaces covalentes fuertes
y estables. Debido a esto dan lugar a una gran variedad
de moléculas y de gran tamaño. Como poseen un
número atómico bajo, los electrones compartidos en la
formación de los enlaces se hallan próximos al núcleo
y las moléculas originadas son estables.
El O y N son muy electronegativos, por lo tanto,
proporcionan polaridad a las biomoléculas,
haciéndolas solubles en agua; lo cual facilita su
incorporación y eliminación en las células.
BIOMOLÉCULAS
Los elementos biogénicos se unen por enlaces
químicos para formar las moléculas constituyentes de
los organismos vivos, que se denominan biomoléculas.
Clasificación de algunas biomoléculas
Los compuestos orgánicos y los seres vivos
La mayor parte del material sólido de los seres vivos y
por ende de sus células está formado por compuestos que
contienen carbono. El estudio de tales compuestos cae
dentro del dominio de la Química Orgánica. Por esta
razón para entender la Bioquímica es importante conocer
algo de química. Enseguida se muestran los principales
compuestos orgánicos que se estudian en bioquímica, los
sitios de mayor reactividad en las moléculas (llamados
grupos funcionales) y las principales uniones (enlaces)
que se forman al reaccionar los grupos funcionales.
Los principales compuestos bioquímicos o
biomoléculas esenciales para la vida son: Carbohidratos
(glúcidos o azúcares), Lípidos, Proteínas, Aminoácidos,
Ácidos nucleicos, Vitaminas, Hormonas, etc. Todas
estas biomoléculas pueden interaccionar entre sí en un
medio apropiado: el agua. Aunque el agua no es un
simple medio ni una mera fase inerte, sino por el
contrario es un líquido muy altamente reactivo.
Interviene en muchas reacciones químicas, ya sea como
reactivo o como producto de la reacción, y resulta
imprescindible para la estabilidad de muchas sustancias
biológicas, por ejemplo, para las proteínas.
(a) Compuestos Orgánicos
(b) Grupos Funcionales
(c) Enlaces entre los Compuestos Bioquímicos
Acetil-Coenzima A
Grado de Oxidación del Carbono en moléculas biológicas
Totalmente reducido
Totalmente oxidado
• Todos los organismos vivos “construyen”
moléculas con los mismos monómeros.
• La estructura de una macromolécula
determina su actividad biológica.
• Cada género y especie está definida por su
set de macromoléculas.
Aminoácidos
Adenina
Ácido
palmítico
Glucosa
EL AGUA
El agua es el componente más abundante en los seres vivos.
Existe tanto en forma intracelular como fuera de las células. Se
dice que los seres vivos contienen en promedio un 70% de agua.
Aunque no todos tienen la misma cantidad. En general los
vegetales tienen más agua que los animales. Hay tejidos que
tienen más agua que otros, por ejemplo, el tejido adiposo se
estima que contiene alrededor de 15 %, mientras que tejido
nervioso, contiene aproximadamente el 90 %. El contenido
también varía con la edad del tejido, por ejemplo, en la carne de
becerros es más tierna que la de las vacas, por tener mayor
cantidad de agua.
Propiedades Físicas
Estructura
Como es de conocimiento general, la molécula de agua está
formada por dos átomos de H, unidos covalentemente a un
átomo de O. En la figura de abajo se muestran las distancias de
las variables estructurales de la molécula, medidas en
Armstrong (1 m = 10 000 000 000 de Å, o sea: 1 m = 1010 Å).
En la siguiente figura se puede observar que los orbitales sp3
forman una estructura tetraédrica (parecida al átomo de carbono en
la molécula de metano), de tal forma que quedan dos orbitales con
un par de electrones cada uno. Esta geometría angular de la
molécula de agua tiene enormes implicaciones biológicas en los
seres vivos, tales como la polaridad y la capacidad para formar
puentes de hidrógeno.
Como consecuencia de su geometría, en cada molécula
de agua los enlaces covalentes entre el oxígeno y los dos
átomos de hidrógeno forman un ángulo de 104,5°.
Además, debido a que el átomo de O es más
electronegativo que el H, atrae más hacia su núcleo al
par de electrones compartidos y dado que cuenta con sus
dos orbitales electrónicos no apareados, en total queda
con una carga parcial negativa de -0,66 e, mientras que
cada átomo de H una de +0,33, donde e es la carga de un
electrón. Esta condición hace que se puedan dar
atracciones electrostáticas entre las moléculas de agua,
así como entre el agua y otras moléculas polares o
cargadas.
Al ser las moléculas de agua dipolos eléctricos, pueden formar
entre sí, las interacciones llamadas puentes de Hidrógeno que se
dan entre el átomo de oxígeno de una molécula y los átomos de
hidrogeno de las moléculas vecinas. Estos puentes de hidrogeno se
forman y se rompen a gran velocidad, y su estabilidad disminuye
al elevarse la temperatura.
PUENTES DE HIDRÓGENO
La presencia de puentes de H hace que las moléculas
de agua se mantengan unidas (cohesividad) y la
sustancia se presente en forma líquida a temperaturas a
las que otras sustancias de masas moleculares similares,
como el CH4 y el H2S son gaseosas.
El hecho de que el agua sea líquida en un amplio
rango de temperaturas que se dan en la Tierra, es lo que
ha posibilitado el desarrollo de la vida en nuestro
planeta. De la cohesividad dependen una serie de
propiedades del agua de gran importancia para los seres
vivos.
PROPIEDADES DEL AGUA
A continuación, se muestran algunas de las propiedades más
importantes del agua relacionadas con la formación de puentes de H:
PROPIEDADES DEL AGUA
Puntos de fusión, ebullición y calor de
vaporización de algunos solventes comunes
Solubilidad
Debido a su alta polaridad, el agua es un buen disolvente para los
compuestos polares e iónicos. Como se puede ver en la siguiente
figura, en el estado cristalino los iones de NaCl permanecen
altamente ordenados, mientras que, en solución, las moléculas de
agua se disponen alrededor de los iones positivos (Na+) con la
parte negativa de su molécula hacia ellos; por su parte, los iones
negativos (Cl-) enfrentan la carga parcial positiva del agua.
La esfera de moléculas de agua que rodea a cada ion se llama
esfera de solvatación y con frecuencia contiene varias capas de
agua de solvatación. A las moléculas que se pueden disociar y
formar iones en solución acuosa, se les llama electrolitos. La
ionización ocurre porque uno de los átomos gana uno o más
electrones y mientras que el otro se los cede. Los electrolitos no
son las únicas sustancias hidrofílicas que son solubles en agua.
Toda molécula polar, también tendrá tendencia a solvatarse por
moléculas de agua. Además, la solubilidad de muchas sustancias
orgánicas aumenta por la capacidad que tengan sus grupos
funcionales para formar puentes de H con las moléculas de agua.
Algunas moléculas que contienen un gran número de átomos de
O, como por ejemplo los carbohidratos ó N, como por ejemplo
poliaminas y poliamidas de bajo peso molecular, también serán
solubles en agua debido a las interacciones por puentes de H.
Por el contrario, las sustancias orgánicas que presentan una
elevada proporción de átomos de C e H y pocos átomos de O son
solutos de baja polaridad y por lo tanto poco solubles en agua. Un
ejemplo de ello son los lípidos.
Algunas sustancias tienen una parte de su molécula que es
soluble en agua (hidrófila) y otra parte insoluble (hidrófoba).
Estas sustancias se dice que son anfipáticas. Este es un hecho
común en el caso de moléculas de cadenas hidrocarbonadas con un
extremo cargado, como fosfolípidos y esfingolípidos. Cuando las
moléculas de un compuesto anfipático están presentes en un medio
acuoso, se ordenan y orientan para dar lugar a la formación de
micelas o bicapas, tal y como ocurre en las membranas celulares y
en las vesículas, o simplemente en monocapas al estar presentes en
la superficie acuosa.
Micela que forma el jabón en el agua
Las moléculas de gran tamaño como los polisacáridos y las
proteínas, cuando son solubles en agua, forman un tipo especial de
disoluciones denominadas coloides. Las disoluciones coloidales
pueden existir en los estados: sol y gel. En el estado de sol
predomina la fase dispersante, el agua, por ejemplo, sobre la fase
dispersa y la solución es más fluida. En estado de gel predomina la
fase dispersa, por ejemplo: la proteína, sobre la fase dispersante, y
la solución es más viscosa.
El paso de un estado a otro es reversible y diversos factores
físicos y químicos pueden hacer que una solución pase de un
estado a otro sin necesidad de variar la concentración de soluto.
Estos factores pueden ser: el pH, la temperatura o una alteración en
la concentración de determinados iones presentes en el medio.
Las soluciones coloidales pueden separarse por diálisis
por medio de membranas cuyos poros sólo permiten pasar
las moléculas de pequeño tamaño y no las partículas
coloidales.
Ionización y valor de pH del agua
Una de las propiedades más importantes del agua es su pequeña
tendencia a ionizarse. El agua pura no está formada solo por H2O,
sino que también puede existir una baja concentración de iones
hidronio (H3O+) y una concentración igual de iones hidroxilo (OH-).
Esos iones se forman por un ataque nucleofílico del átomo de
oxígeno contra un átomo de H de una molécula de agua vecina. Tal
y como se muestra en la figura siguiente:
Como puede verse en la figura de abajo, en el sentido
inverso de la reacción, los iones hidronio pueden actuar
como ácidos (donadores de protones) cediendo su protón
hacia el ion hidroxilo formando nuevamente dos
moléculas de agua (H2O). En este caso el ion hidroxilo
actúa como base (ganando protones).
La doble flecha de la reacción de ionización del agua indica
que ambas reacciones se llevan a cabo continuamente, es decir se
trata de una reacción reversible. Continuamente moléculas de
agua están formando iones a la vez que esos iones están
regenerándose en moléculas de agua, hasta alcanzar un estado de
equilibrio, estado en el cual la concentración molar de iones
hidronio e hidroxilo, así como la de las moléculas de agua serán
constantes. Como puede observarse sin embargo la flecha de
reacción en sentido hacia la ionización es menor que la flecha en
sentido inverso hacia la regeneración de las moléculas de agua.
Esto indica que en el equilibrio tendremos una concentración
mayor de moléculas de agua que la concentración de los iones.
EL AGUA SOLVENTE UNIVERSAL
Escala de pH
EQUILIBRIOS IÓNICOS
Ionización del Agua, el pH
Ionización del Agua, el pH
Equilibrios ácido - base
Equilibrios ácido - base
Disoluciones amortiguadoras
