Historia de la bioinformática.
Desde que se iniciaron los estudios de la estructura del ADN con
Watson y Crick empieza la investigación en bioinformática.
En al año 1988 se creo el Centro nacional de informática y
biotecnología, y también
el proyecto de secuenciación del genoma humano: el cual aceleró el
desarrollo de varias técnicas y tecnologías, que permitieron surgir
otras ramas como: y al tener tanta información esto
impulsa a que se cree el campo de la biotecnología.
las proteómicas: es el estudio a gran escala de las proteínas. Las
proteínas son partes vitales de los organismos vivos, con muchas
funciones. El proteoma es el conjunto completo de proteínas que un
organismo o sistema produce o modifica.
Transcriptómica: es el estudio de todas las moléculas de ARN en
una célula. El ARN se copia de piezas de ADN y contiene información
para elaborar proteínas y realizar otras funciones importantes en la
células. La transcriptómica se usa para aprender más acerca de la
manera en que los genes se transforman en diferentes tipos de células
y cómo esto puede ayudar a la presentación de ciertas enfermedades
como el cáncer.
Metabolómica: es el estudio de los procesos químicos que involucran
metabolitos. estudio sistemático de las huellas únicas que dejan los
procesos celulares específicos en su paso", es decir, el estudio del
perfil de los metabolitos de una muestra biológica.
CAÑEDO Y ARENCIBIA.
Dicen que el nacimiento de la bioinformatica se debe al desarrollo de
la genética sobre todo en la aplicación de las leyes de Mendel y el
descubrimiento de la estructura del ADN. Ya que por medio de esto
se generaba una enorme información que era necesario guardar y
analizar.
Al proporcionarles la tecnología las herramientas practicas para que se
pueda explorar las proteínas Las proteínas, se consideran como
moléculas portadoras de información, basada en tres aspectos.
1. El código genético: demuestra como una sucesión de
nucleótidos puede transformarse en una sucesión de
aminoácidos.
2. La información molecular en una sucesión de aminoácidos
determina la estructura espacial tridimensional de las proteínas.
3. La información en el ADN que también determina la función de
las proteínas y observar el encadenamiento de residuos
pequeños llamados aminoácidos y nucleótidos.
Todo esto llevo a unir la teoría de la información, teorías matemáticas
y genéticas.
Permitiéndole a Claude Shannon padre de la teoría de la información
desarrollar una metáfora algebraica para modelar el código genético.
LAHOZ- BELTRÁ ellos dijeron que el nacimiento de la bioinformatica
data desde los estudios realizados por Margaret Dayhoff, debido a que
ella utilizo los ordenadores en la medicina y biología para crear bases
de datos de almacenamiento para la información de las secuencias del
ADN y las proteínas, a través de tarjetas perforadas realizando
cálculos en un problema biológico. Siendo esta base de datos,
utilizada en estudios de evolución molecular. La cual permitió que se
conociera como bioinformatica, desde entonces la utilización de los
ordenadores en biología se ligo al desarrollo y evolución de la
informática.
Medina dijo que la bioinformatica se inicia con la primera secuencia de
proteína en 1958,
seguida de la primera secuencia de ADN en 1975,
con el desarrollo de la técnica molecular del PCR, (reaccion de cadena
de la polimerasa).
Y con el inicio de la era genómica.
BUSTO, MORENO Y DUQUE, la bioinformatica se da por una
explosión de información al conseguir la secuenciación completa del
genoma humano.
1. Mendel descubre los genes.
2. Los acidos nucleicos 1871
3. 1953, se descubre la estructura del ADN.
4. Entre 1975 y 1979 se aisla el primer primer.
BARRAZA dice que la bioinformatica ha tenido diversas fases.
Primero, iniciándose con la genética con Mendel y sus leyes. Con la
búsqueda del gen y la sustancia hereditaria netre 1865 y 1952.
Segunda, con la biología molecular, con el descubrimiento de la doble
hélice y el código genético, con la aparición de la ingeniería genética y
la reaccion en cadena de la polimerasa.
Tercera, con la genómica,
Y en la actualidad con las nuevas tendencias en proteómica,
metabolómica, biología sistematica, unido a esto los primeros modelos
computacionales con Alan Turing en 1930-1950.
Luego con la evolución de las arquitecturas de computadora
Con la formalizacion de las bases de datos.
Con la era de la pc
Con el internet y la globalización en 1990,
En la actualidad con Grid Computing, computación ubicua y nado
computación, las cuales ha permitidio la nueva ciencia.
2. BIOINFORMÁTICA.
La bioinformatica tiene distintas definiciones de diversos autores.
CASTRO, es una aplicación para entender, organizar y analizar la
información asociada a las macromoléculas.
RAMIREZ, es la ciencia que examina la estructura y función de los
genes y proteínas a través del uso de análisis computacionales,
estadística y patrones de reconocimiento.
El diario gestión, es el uso de la tecnología de la información,
estadística y algoritmos para almacenar, recuperar y analizar datos
biológicos generados durante la investigación en ciencias de la vida.
Cañedo y Arencibia, es una disciplina emergente que utiliza las
tecnologías de la información y se encuentra entre las ciencias de la
vida y de la información proporcionando herramientas y recursos para
favorecer la investigación biomédica, desarrollando sistemas que
sirvan para comprender el flujo de información desde los genes a las
estructuras moleculares, su función bioquímica, conducta biológica
para conocer su influencia en las enfermedades y la salud con la
finalidad de utilizar esta información para desarrollar nuevas formas de
tratar, curar o prevenir la diversidad de enfermedades que afectan a la
humanidad.
3 APLICACIONES DE BIOINFORMÁTICA
4 SOFTWARE DE BIOINFORMÁTICA
Una base de datos es un software para organizar datos, el cual incluye
secuencias, estructuras, expresión génica, etc.
Trelles, dice que existen tres tipos de bases de datos:
1. Primarias Las que contienen información original de los objetos
biológicos.
Están: SwissProt, EMBL, GenBank.
2. Secundarias. Son datos obtenidos a patir de una base de datos
primarios
PRosite, Pfam, Scop, Cath, etc.
3. Base de datos compuestas, son las que integran una variedad
de fuentes de datos primarios, sirviendo para evitar búsquedas
multiples en diferentes fuentes.
Bases de datos.
GenBank: almacena una variedad de tipos de secuencias de
ADN, ARN, aminoácidos, secuencias de transcripto, gen,
cromosoma, genoma, secuencia de mutacion SNP. Tiene
libre acceso.
Entrez Gene: brinda a partir del nombre del gen información
sobre la localización cromosómica, trancriptos asociados
(nucleótidos), productos génicos (proteínas).
EBI. Esta compuesta por genoma, proteína y nucleótido.
UniProt: brinda información de proteínas, a través de tres
bases de datos; Swiss-prot, Translated EMBL y Protein
Sequence Database.
Expert protein Analysis System: es un compedio de
herramientas de análisis en proteómica
Navegador de genoma. Representa secuencias y otros datos
en función de su posición en los cromosomas. A través de sus
tres navegadores principales. Genoma Browser NCBI,
Genome Browser, UCSC.
Para la base de datos de secuencia de nucleótidos, se utilizan
programas de ordenador, los cuales realizan los encajes de
fragmentos basado en el solapamiento de los mismos, se
utiliza: Phred, Phrad, Consed. Es un paquete de software que
lee cromatogramas, asigna valores de calidad a las bases
individuales.
