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Acidos Nucleicos

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ACIDOS NUCLEICOS

4ta biomolecula

Al igual que los carbohidratos y que las proteínas, son polímeros biológicos, o sea que son
moléculas muy grandes

Cadena polinucleotida – imagen

Se denominan ácidos porque todos en sus estructura tienen fosfato que viene del acido fosfórico
de ahí su naturaleza ácida y el termino nucleico no es tan preciso porque no todos acidos están en
el nucleo, unos están en organelos citoplasmáticos.

Comparación con las proteinas son polímeros de AA, los carbohidratos son proteinas de
monosacáridos o disacáridos (heteropolizacaridos), y los acidos nulceicos son polímeros de unas
unidades que se llaman nucleótidos

Cada nucleótido está integrado por fosfato pentosa, y base nitrogenada, la repetición N veces se
estos nucleótidos son los que da como resultado la cadena polinucleótida que son las estructuras
poliméricas de los ácidos nucleicos.
BASES NITROGENADAS

Un compuesto nitrogenado resulta de tener un carácter básico, existen dos tipos:

LAS PURINAS

Son bases nitrogenadas grandes en relación a la espirimidina, esta formada por dos ciclos, uno
hexagonal unido a otro pentagonal.

Las bases nitrogenadas que forman los acidos nucleicos forman puentes de hidrogeno entre ellas
según una determinada complementariedad, de hecho la ADENINA forma puentes de Hidrógeno
con su complementaria TIMINA o con URACILA, la GUANINA forma puentes de hidrógeno con la
CITOCINA

En las bases nitrogenadas purinas y pirimidinas podemos encontrar grupos covalentes polares,
entre ellos que tengan hidrógeno para poder formar enlace puente de hidrógeno

En la purinas en su estrcutura es el ciclo grande el que entre en contacto con la base nitrogenada
no es ciclocorto, porque el ciclocorto se encuentra relacionado con la pentosa.

IMAGEN 1: ADENINA, la base nitrogenada adenina tiene dos grupos covalentes polares, por lo
tanto la timina y el uracilo deben tener por lo menos 2 grupos covalentes polares para que puedan
formar puentes de hidrógeno con los N de la adenina. El ciclo pequeño es el H de N9 en que esta
relacionado con el enlace

IMAGEN2: GUANINA, tiene 3 grupos covalentes polares, por lo tanto, la citosina puede tener hasta
3 grupos covalentes polares con los cuales formar puentes de H con la GUANINA, en el ciclo
pequeño el N9 y su respectivo H es el que esta relacionado con el enlace a la pentosa
BASES PIRIMIDINICAS

Son pequeñas tienen un solo ciclo, en este caso es el N1 y su correspondiente H el que interviene
en el enlace con la pentosa

La CITOCINA es la complementaria con la GUANINA que por lo tanto va a tener 3 grupos


covalentes polares, por lo tanto esos 3 grupos van a formar puentes de H con los 3 grupos de la
GUANINA

TIMINA, es la base nitrogenada exclusiva del ADN y el URACILO exclusiva de los ARN, la diferencia
estrcutural entre ambos es el metilo que si está en la TIMINA pero no en el URACILO, es la única
diferencia estructural.

TIMINA Y URACILO que son complementarios con la ADENINA debería tener por los menos 2
grupos covalentes polares para formar los puentes de H, que si los tienen

El N1 es el que lo utilizan para la unión. El caso de la TIMINA exclusivamente la desoxirribosa y en


el URACILO la ribosa.

T Y U si tiene otro grupo covalente polar que es el C-O que podría formar puente de H pero la
ADENANINA en la tercera posición tienen C-H que es no polar por lo tanto no puede interactuar
con el C-O para formar puentes de H
LA PENTOSA

Puede ser la RIBOSA en el caso de los ARN y la DESOXIRRIBOSA en el caso del ADN, la diferencia
estructural esta en el C 2, pero aquí es la forma beta la que interviene

¿cuál es la parte de la pentosa que interviene en la formación de los acidos nucleicos?

El OH del C1 o anomerico, que sirve para el enlace con el azúcar y el OH del C5 que es el que va a
servir para enlace con el fosfato
FOSFATO

Deriva del acido fosfórico y la presencia de los OH en la estructura es lo que permite que forme
esteres fosfóricos con las pentosas

EMSAMBLAJE DE LAS 3 PARTES DEL NUCLEÓTIDO

La unión de la base nitrogenada con la pentosa se denomina, nucleosido son 4 en el ADN donde la
diferencia es la base nitrogenada y en el ARN son 4

GRAFICO 1: en el caso de los nucleosidos del ADN es la desoxiadenosina, la union de la adenina


con la desoxirribosa, en donde intervienen N9 Y C1, el N9 elimina el H, el C1 elimina el OH por lo
tanto como resultado da un enlace covalente N-C que permite dar origen al nucleósido.

Grafico 2: es el mismo proceso en el ARN pero lo que cambia es el azúcar


NUCLEOTIDOS DEL ADN

Los nucleótidos son la base estructural de los polímeros de acidos nucleicos

Imágenes de los 4 nucleotidos donde su diferencia recae en la base nitrogenada

- Ya unido al nucleosido por enlace ester se encuentra unido al C5 el fosfato

-
NUCLEOTIDOS DEL ARN

URACILO
RIBOSA

GRUPO FOSFATO esterificado al OH del C5

Los otro 4 nucleotidos del ARN van a resultar reemplazando en la parte del URACILO por
CITOCINA, GUANINA, ADENINA

NIVELES CONFORMACIONALES DE LOS A.N

La estructura primaria de los acidos nucleicos resulta de la union de nucleótidos entre si , es decir
de la fromacion de la cadena polinucleotida

La cedena polinucleotida (estructura primaria): se define como el numero, tipo y secuencia de


nucleótidos que están unidos por enlace FOSFODIESTER

Imagen: 3 nucleotidos

¿Quiénes intervienen en la formación de la cadena polinucleotida?

Los grupos fosfatos del C5 de la pentosa (ARN, o ADN), OH del C3 de la ribosa pentosa (ARN, o
ADN)

¿Cómo van a intervenir?

El primer nucleótido hace reaccionar el OH del C3 de la pentosa con el OH del fosfato del C5 de la
pentosa del siguiente nucleótido, por lo tsnto en el proceso se libera agua se juntan 2 OH y se
elimina y se forma el enlace cocvalente entre el C3 y el O del fosfato del C5 de la pentosa del
nucleótido 2, llamado enlace covalente tipo ester. El fosfato por medio de enlace fosfodiester esta
uniendo 2 nucleotidos a través de la pentosas con enlace fosfodiester porque es ester con la
pentosa del otro nucleótido y asi mismo con el otro
- El primer nucleótido no va a ser reaccionar su fosfato, osea el C5 de la pentosa, este
extremo del C5 se llama 5 prima de la cadena polinucleotida
- El ultimo nucleótido de la cadena no va a hacer reaccionar su OH del C3 de la pentosa,
este C3 se denomina extremo 3 prima

Es importante este proceso y direccionalidad porque las funciones metabólicas y biológicas de los
acidos nucleicos están relacionados con la direccionalidad de las cadenas al igual que su estructura

La molecula de ADN tiene estructura secundaria que consiste en una doble cadena polinucleotida
que tomar forma de hélice, doble cadena helicoidal, mientras que la estructura primaria es cada
cadena polinucleotida, y la secundaria es dos cadenas polinucleotidas que están unidas entre si
por medio de puentes de hidrógeno entre las bases nitrogenadas complementarias.

La doble cadena helicoidal en sentido de sus características estrcturales es que ambas cadenas
cursan en dirección contraria desde 3 prima a 5 prima y la otra en sentido 5 prima y 3 prima.
También tiene dos conformaciones helicoidales, la dextrógira porque vista desde arriba el
enrollamiento va en sentido de la manesillas del reloj y la conformación helocoidal levógira en la
cual el enrollamiento va en sentido contrario a las manesillas del reloj.

ADN el modelo estrucutural fue establecido por primera vez en 1916 por los padres de la genética,
que obtuvieron por rayos X

La mayor parte del ADN se encuentra en el núcleo y una pequeña fracción se encuentra en 37
genes se encuentra en las mitocondrias como ADN mitocondrial

La cantidad de ADN depende del tipo de celula, las células somaticas que son diploides 2N tienen
6x10 a la -6 microgramos, y la células sexuales que son haploides N tienen la mitad 6x10 a la -6
divido por 2

CONFORMACIÓN DEXTROGIRA tiene dos tipos:


A: se caracteriza porque cada vuelta de hélice tiene 11 pares de bases (doble cadena unida por
complementariedad de bases) es un ADN anomal

B: se caracteriza es de 10 pares de bases por vuelta de hélice, es normal y el que tiene función

CONFORMACIÓN LEVOGIRA

Z: tienen 12 pares de bases por cade vuelta de hélice, es normal pero no se conoce la función

CONFORMACION B DEXTROGIRA

Para que se de este tipo el ADN debe guardar ciertas propiedades como:

-dimensiones: entre bases contiguas la distancia debe ser de 0,34 nanometros para que cada
vuelta de hélice como tiene 10 pares de bases tenga 3,4 nn, son medidas estándar del ADN y entre
las bases complementarias debe haber una distancia de 0,8 nn para que los grupos polares de las
bases complementarias puedan interactuar y formar los puentes de H

- la complementariedad de bases nitrogenadas es función de dos factores:

1. la presencia de los grupos covalentes polares en las B.N que permiten formar puentes de H:
entre TIMINA Y ADENINA 2, y entre CITOCINA Y GUANINA 3, entonces el número de puentes de H
que pueden formar entre ellas es la función de la complementariedad, pero derivado de las
dimensiones estándar del ADN entre bases complementarias de 1,08 viene la otra causa de la
complementariedad, A,C,T,G, y se denomina impedimento esterico

Impedimento esterico: es un impedimento de espacio que obliga a que la complementariedad sea


A-T y C-G, es decir una base grande con una chiquita, una base purina con un pirimidina
Porque si se quisiera cambiar las uniones de complementariedad y se uniera las bases grandes A y
G al ser muy grandes de traslaparía una encima de otra y entonces los grupos polares no se van a
encontrar y a la vez no se van a formar puentes de H como tampoco se formará la doble cadena

Y si están las bases chiquitas C y T entre ellas va a haber impedimento esterico porque ya no
respetan el espacio mínimo para que los dipolos actúen y formen en puente H porque están muy
lejos

PROPORCIONES DEL CHARGAFF

Aunque los ADN de cada individuo son característico, sin embargo todos los ADN deben cumplir
con las proporciones de Chargaff porque en la medida de que cumplan entonces será un ADN
normal, funcional, no alterado y estas proporciones fijadas de Chargaff por complementariedad de
bases nitrogenadas, la relación de T-A es 1 porque la cantidad de A es igual a la cantidad de T
debido a su complementariedad, de igual forma con C-G =1 porque igual cantidad C y G

Chargaff dijo la cantidad de purinas, A+G va a ser igual a la cantidad de pirimidinas T+C
ADN presenta estructura terciaria también, su diferencia es que el empaquetamiento nuclear del
ADN es la estructura terciaria, la una no está en reproducción celular y la otra es cuando la célula
esta reproducción celular

Cuando no está en reproducción celular se encuentra en forma terciaria como cromatina

Cromatina: resulta de la formación de unos nucleosomas que están separadas ADN espaciador
50,60 pares de bases de la doble hélice, entonces el conjunto de nucleosomas con un ADN
espaciador es lo que se denomina como cromatina.

LOS NUCLEOSOMAS

Se sustenta el ADN a un octamero de histonas, que son:

Dos moléculas de histona 2ª

Dos moléculas de histona 2B

Dos moléculas de histona 3

Dos moléculas de histona 4

Sobre el octamero de histonas se da dos vueltas el ADN, las cuales equivales 146 pares de bases
por medio de enlaces de puentes salinos

HISTONA 1: una molécula se coloca al inicio del enrollamiento y la otra al final


Cuando ya empieza reproducción celular llamada INTERFASE, suceden acciones biológicas como la
condensación de la cromatina para llegar al estado de cromosoma

EMPAQUETAMIENTO DEL ADN EN REPRODUCCION CELULAR

Para la cromatina para condensarse al cromosoma es formar el solenoide, el solenoide es una


hélice de cromatina donde cada vuelta de hélice tiene 6 nucleosomas y las histones H1 que están
al inicio y al final del enrollamiento de cada nucleosoma se ubican hacia el centro como un eje
central sobre el cual se va formando la hélice de cromatina, es el solenoide

En adelante el sistema de condensación es el sistema ESCAFOL (andamio) que se denomina así por
que la condensación consiste en que existen unos andamios de proteínas SMC (proteínas de
mantenimiento de los cromosomas) estas proteínas conjuntamente con enzimas de tipo
topoisomerasa actúan como una base o andamio sobre el cual el solenoide inicia formando rizos y
las zonas de union al andamio se denominan zonas SARS que significa de zonas o regiones de
union al andamio

En adelante la condensación consiste en que los rizos vuelven a formar otros rizos gracias a
proteínas SMC o sea el mismo sistema de escafol hasta llegar a la conformación del cromosoma

ADN MITOCONDRIAL

ADN bacteriano tiene en común con el mitocondrial la conformación estructural del ADN, de que
ambos son de tipo circular.

Son circular porque el extremo 5 prima y 3 prima de las cadenas polinucleotidas que tiene el ADN
están libres y el fosfato y el OH.
En el caso del ADN circular, el extremo 5 prima y el extremo 3 prima reaccionan entre sí para
formar un enlace ester fosfórico que da como origen que la doble cadena de ADN se cierre

El hecho de que la mitocondria tenga ADN mitocondrial como el de las bacterias sustenta la teoría
de que hace millones de años hubo una simbiosis entre nuestras células y las bacterias, el
producto evolutivo ha generado que nuestras mitocondrias tengan un ADN circular similar al
bacteriano.

El ADN mitocondrial es exclusivamente de origen materno, porque cuando se realiza la


fecundación el espermatozoide ingresa su contenido nuclear al citosol del ovulo

El ADN mitoncondrial tiene 37 genes que producen algunas enzimas o sirven para sintetizar ARN
de transferencia y mensajero pero que no son suficientes a la mitocondria, de hecho el resto de
nutrientes que usa la mitocondria son gracias a la información que se encuentra en el ADN del
núcleo

ARN

TAMBIÉN TIENEN ESTRUCTURAS SECUNDARIAS

Pero a diferencia del ADN su estrcutura secundaria solo la pueden lograr con una única cadena
polinucleotida, cuando esta cadena pliega sobre si misma y se da complementariedad de bases
nitrogenadas entonces se forman zonas de doble hélice, denominadas doble hélice modificada
porque solo ocurre por el plegamiento de la única cadena polinucleotida sobre si misma

Como los ARN tienen la función de la expresión de los genes

El ARN mensajero dentro de la función de expresión hace la función de copiar, es el 5 % de los ARN
mensajeros, y copia por complementariedad de bases la información que carga el ADN
Lo que se ha copiado lleva del nucleo hasta el citosol para que con el ARN de transferencia le
pueda hacer la lectura y decodificación de la información que trae el ARN este solo copia no
interpreta. El que se encarga de codificar es el ARN de tranferencia.

De las ASAS en la estructura del ARN una de ellas que es ASA anticodon , entonces el ARN lee de
cada triplete en triplete en cada CODON (son 3 nucleotidos unidos entre si) y da una información
de un AA

Entonces el ARN t decodifica por comprementariedad de bases nitrogenadas, entonces el ARN


mensajero trajo el codon GCC el ARN a través de su asa anticodon acaba de leerlo por
complementariedad por lo tanto CGG y el ARN t sabe que CGG es ARGININA y cumple su otra
función que es ligar el AA en cuestión con un enlace ester con la ribosa del último nucleótidos, del
extremo 3 prima que siempre va a ser el de adenina y a ese nucelotido se va a esterificar el AA en
cuestión que como ejemplo esta la ARGININA, entonces lo transfiere al ribosoma para la síntesis
de proteínas

Nota: el ARN de transferencia es el 10 % de los arn, el 80 % es el ARN ribosómico

ARN RIBOSIMICO

Es el mas abundante porque conjuntamente con proteínas esta formando los organelos
citoplasmáticos.

Los ribosomas son el lugar donde se sintetizan las proteínas

El ribosoma tiene dos lugares una subnunidad mayor que es la asociacion de ARN con proteínas y
la subunidad mehor con 3 cadenas polinucleotidas de ARN unidos a proteínas en la subunidad
menor el ARN de transferencia va depositando los AA que va decodificando y se va sintetizando las
proteínas

El otro 5 % de ARN son de diferentes tipos existe :

El ARN nucleolar que se asocia también con proteínas y que forma el nucléolo

El nucléolo interviene en la síntesis de ARN mensajero

ARN (sn RNPs) mensajero interviene que se asocia con proteínas y que interviene en la síntesis de
ARN mensajeros
RIBOSIMOS: son una pequeña fracción de ARN que tienen actividad catalítica o sea que actúan
como enzimas

No todos lo nucleótidos están formando acidos nucleicos existen nuceloticods libres, como el ATP
que es ADENINA unido a Ribosa con 3 fosfatos cuando la base nitrogenada cambia por G,T,U y
citosina existen los otros tipo de nucleótidos trifosfatados

Por reacciones catabólicas se obtiene energía en forma de ATP pero también en forma UTP, CTP,
etc

¿Porque los nucleótidos trifosfatados, son la manera en que la celula almacena energía?

Porque el enlace fosfato es muy de alta energía, entonces cuando una celula requiere de energía
hidroliza el enlace fosfato obtiene energía y puede realizar su anabolismo.

Las reacciones anabólicas son las que consumen ATP

El AMPC cíclico es un nucleótido de A, ribosa y fosfato que esta esterificado, tanto en el OH del C5
como OH del C3 por lo tanto de ahi el termino cíclico
COMO SE USA O EN QUE PROCESOS BIOSINTETICOS SE UTILIZA LOS NUCLEOTIDOS
TRIFOSFATADOS, TODO EN PROCESO ANABOLICOS

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