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5.1 Filogenia 2

Este documento describe métodos para construir árboles filogenéticos. Explica que el método de máxima parsimonia busca el árbol que requiere menos cambios evolutivos, mientras que el método de máxima probabilidad encuentra el árbol más probable dado un modelo de evolución. También cubre el bootstrapping como método para evaluar la precisión de los árboles filogenéticos mediante la construcción repetida de árboles a partir de datos alterados.

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EVOLUCIÓN Y TAXONOMÍA

Filogenética

Carlos Andrés Martínez Garay


Abril – 2020

carlos.martinez15@[Link]
Árbol Filogenético

Si se analizan 50 especies se pueden obtener 3 x 1076 árboles


diferentes
Máxima parsimonía
El método de máxima parsimonia se basa en la filosofía de
que la explicación más simple, la que requiere menos cambios
debe ser la correcta.

Mediante este método se obtienen árboles que ordenan las


ramas de modo tal que se minimiza el número de mutaciones
que deben haber ocurrido.
Máxima parsimonía
Máxima parsimonía
Máxima parsimonía
Máxima parsimonía
Máxima probabilidad
Busca el árbol más verosímil, es decir, el árbol que es más
probable que haya generado los datos que hemos observado.

En este método partimos de los datos y de un modelo de


evolución. Partiendo de esta base se calcula la probabilidad de
que nuestros datos hayan sido generado por los distintos
árboles posibles y se devuelve el árbol que presenta una
máxima probabilidad.

Para poder calcular uno de estos árboles es imprescindible


elegir un modelo de mutación a priori.
Máxima probabilidad
Evaluación de los árboles
filogenéticos
Bootstrapping

Es un método de medición de la precisión que realiza un


proceso repetitivo de construcción de árboles que se producen
después de una alteración discreta de un mismo set de datos
Evaluación de los árboles
filogenéticos

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