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Taller de Microbiología: Análisis y Aplicaciones

Este documento presenta información sobre un taller de microbiología realizado por 4 estudiantes. Incluye preguntas sobre los postulados de Koch en relación al SARS-CoV-2, los efectos de los microorganismos en el medio ambiente y su contribución al mantenimiento de la calidad ambiental a través de ciclos como el del carbono y el nitrógeno. También describe conceptos clave como enfermedades infecciosas, métodos de transmisión y ejemplos de principales patógenos.

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Taller de Microbiología: Análisis y Aplicaciones

Este documento presenta información sobre un taller de microbiología realizado por 4 estudiantes. Incluye preguntas sobre los postulados de Koch en relación al SARS-CoV-2, los efectos de los microorganismos en el medio ambiente y su contribución al mantenimiento de la calidad ambiental a través de ciclos como el del carbono y el nitrógeno. También describe conceptos clave como enfermedades infecciosas, métodos de transmisión y ejemplos de principales patógenos.

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TALLER #1 DE MICROBIOLOGÍA

INTEGRANTES: ANDRES MONTERROZA,


CAMILA LEÓN GENES, MARÍA ALEJANDRA
MONCADA BUELVAS, YULISSA AGÁMEZ
TORRES.

1. ¿Cumple el sars-cov-2 los postulados de koch? Justifique su


respuesta.

El virus SARS-CoV-2 si cumple los postulados de Koch ya que se ha aislado el


virus de muestras de pacientes, se ha cultivado en células, y se ha ensayado en
modelos animales (al menos en macacos, hámster y ratones), en los que se ha
reproducido la enfermedad, se ha detectado el virus en los tejidos por técnicas
inmunocitoquímicas, se ha analizado la respuesta inmune, se ha estudiado el
modo de transmisión y se ha recuperado incluso el virus de los animales.
(https://n9.cl/muc0).

2. ¿Cómo pueden perjudicar los microorganismos los ambientes


naturales? Mencione casos puntuales en los distintos ecosistemas.

El primer hábitat natural de los microorganismos fue el agua. En su evolución,


algunos se adaptaron al medio terrestre, siendo estos medios sus principales
hábitat en la actualidad. También están en el aire pero en este hábitat su actividad
vital es mínima y llegan a él procedentes de los otros dos medios.
En el suelo: el números de microorganismos presentes depende de sus
características: acidez, humedad, aireación, disponibilidad de agua, etc... Los más
numerosos son las bacterias en todas sus variedades: arobia, anaerobia,
autótrofa, heterótrofa; abundan los actinomicetos, responsables de ese olor
terroso característico del suelo. También gran cantidad de mohos en forma
micelial, y en su superficie destacan algas verdes o diatomeas, así como
cianobacterias. También destacan los protozooz ciliados y rizópodos que se
alimenntan de ellas (https://n9.cl/ec1j).
La rizosfera es la zona del suelo rico en microorganismos, que es donde éstos
interaccionan con los vegetales. La función principal de estos microorganismos es
la producción de cambios de la materia orgánica originando productos nutritivos
para el mundo vegetal; es decir, son desintegradores y transformadores.
En el suelo la materia que se encuentra sobre la superficie se degrada por acción
microbiana. Producto de ésta es el humus, sustancia amorfa, de color oscuro,
formada por materia orgánica residual y no descompuesta en su totalidad. Este
humus irá liberando progresivamente compuestos inorgánicos en un proceso
denominado mineralización; entre éstos están el C, N, S(https://n9.cl/ec1j).

En el agua: abundan los microorganismos fotosintéticos constituyendo el


fitoplancton. Productores primarios de la cadena trófica. En las zonas oxigenadas
abundan algas y cianobacterias; en las zonas anoxigénicas existirán bacterias
fotosintéticas.
Hay un número mayor de ellos en lagos, ríos y zonas costeras que en alta mar
debido a que los nutrientes proceden del continente. En aguas continentales o
costeras es mayor el número de heterótrofos (bacterias, protozoos, hongos) si
existe contaminación por materia orgánica. Cuando la población de estos
microorganismos es tan grande se agota el oxígeno diciéndose que el medio está
eutrofizado (https://n9.cl/ec1j).
Enfermedades infecciosas:
Enfermedad es de cualquier alteración del estado de salud. Enfermedad infecciosa
es cuando la causa es cualquier tipo de microorganismos. Los microorganismos
causantes se denominan patógenos. Como tales se consideran virus, bacterias y
protozoos. También hongos, los cuales aunque se encuentren en la naturaleza
como saprófitos libres a veces se convierten en patógenos oportunistas causando
micosis. (Enfermedades causadas por hongos). En toda enfermedad infecciosa se
dan las siguientes etapas:
 Infección: penetración del microorganismo y multiplicación.
 Periodo de incubación: tiempo desde la infección hasta la aparición de los
primeros síntomas.
 Periodo agudo: tiempo en el cuál los síntomas son evidentes.
 Periodo de declive: tiempo en el cuál los síntomas van desapareciendo.
 Periodo de convalescencia: tiempo en el cuál el paciente recobra la
normalidad.
Transmisión:
El germen patógeno debe pasar de un hospedador (persona que padece la
enfermedad) a otro sano que se convierte en nuevo hospedador. Este fenómeno
se conoce como transmisión de la enfermedad y ocurre de dos modos:
 Directamente: por contacto corporal (roce de piel, sexual) o por vía respiratoria
(a través de gotículas de saliva, en tos, estornudos).
 Indirectamente: el germen pasa a través de un individuo a un ente inanimado.
Los seres vivos transmisores se denominan vectores (insectos). Si el agente
transmisor es inanimado (material quirúrgico, cubiertos...) se denomina fomite.
Cuando sea el agua o alimentos se dice vehículos(https://n9.cl/ec1j).

Principales enfermedades infecciosas:


Atendiendo al método de transmisión, sin incluir la transmisión por alimento,
tenemos:
 Transmitidas por aire: los microorganismos que se hallan en el aire prodecen
del suelo, agua y otros seres vivos; sobreviviendo difícilmente en este medio.
Especial importancia tienen los patógenos que proceden de otras personas
portadoras que los espelen al aire mediante estornudos y tos. Estos gérmenes
son recogidos del aire en la inspiración ocasionando por ello infecciones en las
vías respiratorias (fosas nasales, boca, faringe, bronquios, bronquiolos,
pulmones). Atendiendo al microorganismo causante pueden ser:
 Bacterianas: difteria, tos ferina, tuberculosis.
 Víricas: resfriado, gripe, sarampión, rubeola.

 Transmitidas por el agua: incluyen:


 Bacterias: cólera, Thyfus, gastrointeritis.
 Virus: poliomelitis, hepatitis A.
 Protozoos: disentería.
Estos microorganismos crecen en el tracto gastrointestinal y abandonan el
organismo por lasheces, siendo nuevo foco de transmisión. El tratamiento de
aguas residuales sería la forma de evitar la infección. (https://n9.cl/ec1j).

 Transmitidas por contacto directo: hay muchas; una de ellas es la lepra, que
aunque causada por una bacteria y catalogada desde muy antiguo como
enfermedad maldita, no es una enfermedad muy contagiosa, y los 15 millones
de afectados en el mundo se podían curar con una terapia adecuada. Mención
especial a las enfermedades de transmisión sexual (ETS). Enfermedades de
transmisión sexual:
 Bacterias: sífilis, gonorrea.
 Virus: SIDA, herpes genital.
 Protozoos: tricomoniasis (tricomonas vaginales).

 Transmitidas por vectores: El agente patógeno vive en animales y pasa a la


especie humana a través de otros animales que la transmiten a los hombres.
Salvo la rabia, transmitida por mamíferos, la mayoría son transmitidas por
artrópodos. Los gérmenes patógenos viven en animales salvajes, que es su
reservorio y no están controlados por ciudadanos veterinarios como los
domésticos. De los animales salvajes pasan a los animales domésticos y de
ahí por vectores a la especie humana. Enfermedades conocidas en la
península Ibérica:
 Bacterias: peste, thyfus exantemático.
 Virus: rabia.
 Protozoos: paludismo o malaria (el vector el mosquito anófeles).

3. ¿Cómo contribuyen los microorganismos al mantenimiento de la


calidad del ambiente?, de ejemplos exactos.

Relaciones beneficiosas.
 Reciclado de nutrientes: los microorganismos son responsables del
reciclado de la bacteria orgánica en descomposición, volviendo a originar
materia inorgánica asimilable por las plantas. En ésta acción se basa la
utilización del estiércol.

 Fijación del nitrógeno atmosférico: en la producción de arroz, soja, alfalfa,


judías, guisantes, lentejas, garbanzos cuya simbiosis con la bacteria
Rhizobium ya ha sido espuesta. Plantas de interés forestal como alisos, el
emborrachacabras, mirtos son plantas pioneras en la colonización de suelo
pobres en N gracias a su simbiosis con el actinomyceto Frankia.

Los microorganismos en las transformaciones o ciclos biogeoquímicos.

 Las bacterias y los hongos son los microorganismos que, junto a los
productores, permiten la existencia del ciclo de la materia en la biosfera. Su
función es descomponer la materia orgánica procedente de restos
vegetales, cadáveres y excrementos, convirtiéndola en materia inorgánica
que vuelve a ser utilizada por los productores. Muchos de los elementos
químicos que componen los materiales terrestres están sometidos a unos
circuitos cíclicos que consisten, básicamente, en que pasan de formar parte
de materia inorgánica inerte a formar parte de materia constitutiva de seres
vivos y de éstos, posteriormente, de nuevo a materia inorgánica inerte,
cerrándose el ciclo. Estos ciclos de la materia son los ciclos biogeoquímicos
(https://n9.cl/rptk)

 EL CICLO DEL CARBONO.-Mediante el proceso de fotosíntesis, las


plantas toman el carbono en forma de CO 2 de la atmósfera o del agua,
asimilándolo durante la fase oscura de dicho proceso para formar
moléculas orgánicas. Parte del carbono vuelve al medio inerte en la misma
forma de CO2 como resultado de la respiración tanto de las propias plantas
como de los organismos consumidores y descomponedores. Los desechos,
restos o cadáveres que contienen carbono vuelven también al medio
inorgánico por acción de los descomponedores (bacterias y hongos).

 Una parte muy importante del carbono, puede tardar millones de años en
incorporarse al medio inerte. Es el caso del carbono que llega a formar
parte del petróleo y del carbón mineral. Este carbono puede volver al ciclo
por combustión de estos combustibles fósiles.

 El ciclo del nitrógeno. La fuente principal de nitrógeno es la atmósfera, de


la que este gas constituye un 78%; sin embargo, este nitrógeno atmosférico
sólo puede ser fijado por un grupo de bacterias fijadoras del nitrógeno que
transforman este gas en compuestos nitrogenados utilizados directamente
por las plantas. Entre el grupo de bacterias fijadoras del nitrógeno está el
género Rhizobium que se encuentra en simbiosis con las raíces de las
plantas leguminosas (guisantes, judías, tréboles, alfalfa, etc.), estas
bacterias se introducen en los tejidos del vegetal, donde proliferan y
desarrollan una especie  de nódulos fijadores del nitrógeno. Existe un grupo
de bacterias desnitrificantes que en condiciones anaerobias y de inundación
convierten los nitratos del suelo en nitrógeno molecular que escapa a la
atmósfera. Por eso los agricultores drenan las tierras para reducir la
desnitrificación y añaden fertilizantes para incrementar los niveles de nitrato
del suelo (https://n9.cl/21gx).

Los microorganismos y el medio ambiente.

 Diversas técnicas biotecnológicas permiten resolver, de diferentes y


novedosas maneras, el problema de la contaminación ambiental. Se
pueden utilizar diversos microorganismos para afrontar problemas de
tratamiento y control de la contaminación química en los ecosistemas,
ya que algunos de ellos, principalmente bacterias, tienen la capacidad
de eliminar del medio o degradar con enzimas gran número de
compuestos tóxicos y peligrosos. (https://n9.cl/ec1j)
 En la actualidad en los laboratorios se están creando bacterias,
levaduras y enzimas específicas para conseguir la degradación de los
residuos mediante las siguientes técnicas:

 Biometanización. Es un proceso de digestión anaerobia (sin oxígeno) de


la materia orgánica por microorganismos, que la descomponen dando lugar
a una mezcla de gases, principalmente metano y dióxido de carbono.

 Lagunas de estabilización. Se utilizan bacterias y algas para depurar


residuos líquidos por procesos naturales.

 Filtros percoladores. Con filtros que contienen una población de


microorganismos que degradan la materia orgánica que haya en el residuo.

 Las mismas bacterias que causan daños y estragos en las producciones


agricolas, pueden ayudarnos a producir precipitaciones en forma de lluvia
y/o nieve.

 Recientes estudios indican que la llamada “bio-precipitación”, lluvias


causadas por microorganismos, podría ser más común de lo que se
pensaba.

 Antes de que se produzcan las precipitaciones, se deben formar las gotas


de agua o las partículas de nieve. Se sabía que habia agentes que
actuaban como catalizadores en la formación de las micro-gotas. Se
pensaba en pequeñas particulas minerales como los causantes primarios
de la formación de gotas en las nubes, pero estos recientes estudios
indican que grupos de bacterias, hongos e incluso algas, también colaboran
en la condensación del vapor de agua, y en consecuencia, en la formación
de la lluvia. (https://n9.cl/ec1j).

5. Escribe el nombre científico de por lo menos 4 microrganismos en cada una de las


siguientes categorías; fotoautótrofos, fotoheterótrofos, quimioautótrofos,
quimioheterótrofos.
 Fotoautótrofos: Chromatium vinosum, Thiospirillum jenense, Thiopedia rosea,
Chlorobium limicola, Prosthecochloris aestuarii y Pelodictyon clathratiforme.
 Fotoheterótrofos: Synechococcus elongatus, Heliorestis baculata, Heliorestis
acidaminivorans, Heliorestis daurensis y Heliorestis convulata.
 Quimioautótrofos: Desulfovibrio desulfuricans, Pseudomonas stutzeri,
Pseudomonas fluorescens y Frankia sp.
 Quimioheterótrofos: Borrelia burgdorfer, Salmonella typhi, Escherichia coli y
Klebsiella pneumoniae.
6. ¿Qué son los microorganismos extremofilos, como se clasifican y a que
dominios pertenecen, de ejemplos?
Son organismo que se desarrolla en condiciones físico- o geoquímico extremas
perjudiciales para la mayoría de la vida en la Tierra. Han adaptado sus genotipos y
fenotipos para sobrevivir a estas condiciones inusuales y por ello las condiciones no son
“extremas" para ellos.
Se clasifican teniendo en cuenta la temperatura, gracias a esto se tiene que existen
organismos:
 Hipertermófilos: Su temperatura óptima de crecimiento está por encima de los 80ºC
y el máximo crecimiento de cultivos puros se ha llegado a dar entre 110 y 113ºC.
Dominio Archeae, ejemplo Halobacterium, Haloferax y Natronobacterium.
 Termófilos: Crece por encima de los 45ºC. Dominio Archeae, ejemplo
Rhodothermus obamensis y Deferribacter desulfuricans.
 Mesófilos: Temperatura óptima alrededor de 37ºC. Frecuentemente son capaces de
crecer en rangos alrededor de 25 a 45ºC. Dominio Bacteria, ejemplo, Listeria
monocytogenes y Streptococcus pyogenes.
 Psicrófilos: Pueden ser de tipo facultativos o psicrófilos obligados. En el caso de los
psicrófilos facultativos, su temperatura óptima es la misma de los mesófilos, pero la
mínima es cercana a los 0 °C. Mientras que los obligados poseen una temperatura
óptima de 15 a 18 °C, una temperatura mínima de 0 °C y máxima de 20 °C.
Dominio Bacteria, ejemplo, Chlamydomonas raudensis y Cianobacterias
Scytonema.
7.Mencione por lo menos 5 ecosistemas colombianos donde se hayan reportado o se
puedan encontrar extremofilos.
A 45 minutos de Bogotá, en las aguas termales de Santa Mónica, en Choachí
(Cundinamarca), encontraron bacterias del género Bacillus y Mycrobacterium, que resisten
temperaturas de 55 ºC; así como hongos halófilos capaces de resistir altas concentraciones
de sal en la Mina de Sal de Nemocón (Cundinamarca), localizada a 60 m bajo tierra y con
una extensión de 2,5 km. El lago Azufral, en Nariño, allí hay microorganismos que viven
en la laguna que es la boca del volcán, sostiene Bueno, también se cuenta con la existencia
de microorganismos en la roca salina en las minas de sal de Zipaquirá (Cundinamarca). Por
último, se tienen los manantiales termales de Boyacá, la mayoría de organismos que
habitan son anaerobios termofílicos, dentro de los hallazgos importantes se resalta el
reporte de una nueva especie de organismo halotolerante (que tolera ambientes salados),
termófilo y sulfato-reductor denominada Desulfomicrobium thermophilum, involucrada en
la transformación y ciclaje de materia orgánica. Además, se han encontrado organismos de
los géneros Thermoanaerobacter, Caloramator y Anoxybacillus.

8. ¿Qué enzimas y proteínas con aplicaciones biotecnológicas o industriales se pueden


aislar de las arqueobacterias y para que se emplean?
El descubrimiento de los microorganismos extremoófilos, capaces de vivir bajo
condiciones extremas de temperatura, pH, presión, salinidad, radiación y sus
combinaciones ha proporcionado herramientas invaluables para su aplicación en una amplia
gama de procesos biotecnológicos, permitiendo el manejo racional de los recursos naturales
(Reed y col., 2013).
El ejemplo más conocido de aplicación de una enzima termoestable es la de la enzima Taq
polimerasa aislada de Thermus aquaticus, que significó un avance trascendental en la
biología molecular, al permitir la automatización de la tecnología de Reacción en Cadena
de la Polimerasa (PCR), que permite la amplificación de fragmentos de DNA en unas
cuantas horas, lo cual representó una gran ventaja para laboratorios e industrias (Reed y
col., 2013).
Otros ejemplos de estas aplicaciones son:
 Termófilos: se utilizan enzimas como las proteasas, glucosilhidrolasas
(amilasas, glucoamilasas, celulasas), quitinasas, xilanasas, lipasas, esterasas,
ADN polimerasas, deshidrogenasas, su aplicación se logra observar en
detergentes, hidrolisis en alimento y bebidas, panificación, procesamiento
de almidón, celulosas, pectinas y procesamiento de textiles, modificación de
quitina para uso farmacéutico y alimenticio, blanqueo de papel,
modificación de grasas y lácteos, reacciones estero-específicas y biosíntesis
orgánicas, biocatálisis en disolventes orgánicos y curtido de pieles, biología
molecular( PCR) y reacciones de óxido-reducción.
 Psicrófilos: se utilizan enzimas como proteasas, amilasas, deshidrogenasas
y lipasas, su aplicación se observa en detergentes e industrias de alimentos,
panificación, biosensores, alimentos y cosméticos.
 Halófilos: se utilizan las siguientes enzimas, proteasas y deshidrogenasas,
estas se utilizan para síntesis de péptidos y biocatalisis en disolventes
orgánicos.
 Alcalófilos y acidófilos: se utilizan enzimas como las proteasas, celulasas,
amilasas, glucoamilasas y oxidasas, su aplicación se da en detergentes e
industria de los alimentos, procesamiento de almidón, componentes de
alimento y desulfuración del carbono.
9. ¿Qué es y cuál es la función de la bacteriorrodopsina en halobacterium, y de la
halorrodopsina?
Al aislar Halobacterium salinarum el primer hecho que se observó fue que al poner la
bacteria en agua destilada se producía la disgregación de las células como consecuencia de
un choque osmótico. La fragmentación de la membrana nuclear de la bacteria dio lugar a
fragmentos de membrana diferenciados de la membrana citoplasmática que, debido a que
presentan una coloración púrpura, se denominó membrana púrpura (MP). Se descubrió que
la MP estaba constituida por una única proteína transmembrana y que tenía una molécula
de retinal unida (Oesterhelt et al, 1971). Al analizar en más profundidad la membrana
púrpura se comprobó que tenía un máximo de absorbancia en el visible de 560nm. Este
máximo variaba cuando la MP era iluminada con diferentes longitudes de honda, intuyendo
que la proteína podía actuar como un fotorreceptor. Este comportamiento junto con el
hecho de que la proteína tuviera una molécula de retinal unida, hacían que la proteína de la
MP tuviera mucha similitud con la rodopsina visual. Es por este motivo que a esta proteína
se le llamó Bacteriorodopsina (Oesterhelt et al., 1971).
Mediante una serie de mecanismos moleculares, tales como enzimas que mantienen su
actividad a concentraciones elevadas de sal, membranas púrpuras que permite el
crecimiento fotógrafo, sensores como rodopsina que regulan la respuesta fototáctica. El
transporte de iones de Cl¨ al interior de la célula de H. halobium se lleva a cabo por una
segunda bomba impulsada por la energía de la luz, la halodorropsina. En forma similar a la
bacteriorrodopsina, la halorrodopsina sufre cambios conformacionales dirigidos por la
energía de la luz. La H. halobium cuenta con dos bombas de iones altamente homólogas,
pero, mientras la bacteriorrodopsina bombea H+ pero no Cl¨, la halorrodopsina bombea
Cl¨, pero no H+.

Bibliografía.
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Psicrófilos: http://lacienciaysusdemonios.com/2010/01/11/psicrofilos-amantes-del-frio/
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