Angeles Torres Valdetano
Ejercicio de replicación:
Dirección 5´ 3´ cadena retardada
Ejercicio A
La helicasa reconoce en origen y avanza en dos direcciones abriendo las cadenas formando
INICIACIÓN
una horquilla de replicación
Paso 1 TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTCAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAGTTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTAA
GATGTTTCCTGTGGCCTAGCTCCTTTTTATTGCCGAGGGCTACTCTGTTGTATGAAAACCACAATTCATTTCTCCCTTCTC
CTACAAAGGACACCGGATCGAGGAAAAATAACGGCTCCCGATGAGACAACATACTTTTGGTGTTAAGTAAAGAGGGAAGAC
CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
Dirección 3´ 5´ retardada
Paso 2
Se unen las
TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTCAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
proteínas SSB para
evitar que las
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAGTTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTAA
cadenas se vuelvan
unir
Se une la GATGTTTCCTGTGGCCTAGCTCCTTTTTATTGCCGAGGGCTACTCTGTTGTATGAAAACCACAATTCATTTCTCCCTTCTC
CTACAAAGGACACCGGATCGAGGAAAAATAACGGCTCCCGATGAGACAACATACTTTTGGTGTTAAGTAAAGAGGGAAGAC
topoisomerasa
para liberar
tensión CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
La primasa sintetiza el
cebador
TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTCAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
Paso 3
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAGTTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTAA
GATGTTTCCTGTGGCCTAGCTCCTTTTTATTGCCGAGGGCTACTCTGTTGTATGAAAACCACAATTCATTTCTCCCTTCTC
CTACAAAGGACACCGGATCGAGGAAAAATAACGGCTCCCGATGAGACAACATACTTTTGGTGTTAAGTAAAGAGGGAAGAC
CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
Angeles Torres Valdetano
La hebra retardada se va
complementando con los
Cebador Cebador fragmentos de Okasaki
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAGTTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTA
Paso 4 TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTCAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
Cebador AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAGTTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTAA
Polimerasa III reconoce el cebador y añade los dNPTs
GATGTTTCCTGTGGCCTAGCTCCTTTTTATTGCCGAGGGCTACTCTGTTGTATGAAAACCACAATTCATTTCTCCCTTCTC
CTACAAAGGACACCGGATCGAGGAAAAATAACGGCTCCCGATGAGACAACATACTTTTGGTGTTAAGTAAAGAGGGAAGAC
CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
Cebador Cebador
Elongación
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAGTTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTA
TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTCAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT Se eliminan las SSB
Paso 5
cuando participa la
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAGTTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTAA
pol III
TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTCAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
GATGTTTCCTGTGGCCTAGCTCCTTTTTATTGCCGAGGGCTACTCTGTTGTATGAAAACCACAATTCATTTCTCCCTTCTC
CTACAAAGGACACCGGATCGAGGAAAAATAACGGCTCCCGATGAGACAACATACTTTTGGTGTTAAGTAAAGAGGGAAGAC
La POLIMERASA
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
III sigue
añadiendo
dNPTs a la
cadena
CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
Angeles Torres Valdetano
La Pol I elimina los
cebadores de la
Cebador cadena retardada
Cebador Cebador
Cebador
terminacion
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAGTTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTA
Ligasa une los fragmentos de Okasaki
TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTCAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
Paso 6
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAGTTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTAA
TTTUTGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTCAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
GATGTTTCCTGTGGCCTAGCTCCTTTTTATTGCCGAGGGCTACTCTGTTGTATGAAAACCACAATTCATTTCTCCCTTCTC
CTACAAAGGACACCGGATCGAGGAAAAATAACGGCTCCCGATGAGACAACATACTTTTGGTGTTAAGTAAAGAGGGAAGAC
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
Cebador Cebador
Paso 7
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAGTTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTAA
Se eliminan todas
las enzimas y las
TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTCAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
cadenas se unen
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAGTTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTAA
con su
complemento, Y
TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTCAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
TERMINA Con el
sitio TUS-TER
CTACAAAGGACACCGGATCGAGGAAAAATAACGGCTCCCGATGAGACAACATACTTTTGGTGTTAAGTAAAGAGGGAAGAC
GATGTTTCCTGTGGCCTAGCTCCTTTTTATTGCCGAGGGCTACTCTGTTGTATGAAAACCACAATTCATTTCTCCCTTCTC
CTACAAAGGACACCGGATCGAGGAAAAATAACGGCTCCCGATGAGACAACATACTTTTGGTGTTAAGTAAAGAGGGAAGAC
GATGTTTCCTGTGGCCTAGCTCCTTTTTATTGCCGAGGGCTACTCTGTTGTATGAAAACCACAATTCATTTCTCCCTTCTC
Angeles Torres Valdetano
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
Considera la secuencia anterior como un DNA circular cuando presenta un solo sitio de inicio
de la replicación (marcado en negritas)
Realiza la replicación de esta molécula.
1. Describe que tipo de organismo realiza este tipo de replicación si su DNA es
circular y ¿qué características presenta en su replicación? PROCARIONTAS (bacterias)
Se da en el citosol. Tiene un punto de inicio llamado Ori C, ES BIDIRECCIONAL, semiconservador SECUANCIAL Y
SEMIDESCONTINUA UTILIZA ENZIMAS SSB, HOLOENZIMA POLI III, Pol I y II, UTILIZA las proteínas DNAs A, B
Y C, se necesita un cebador, DNPTS, COFACTOR, MOLDE O PLANTILLA Y LAS DIFERENTES ENZIMAS COMO
HELICASA, TOPOISOMERASA, PRIMASA Y LIGASA. Tiene un punto de terminación llamado tus-ter
2. Indica e ilustra en la misma molécula lo que le pasa en cada paso de la replicación:
el inicio, la elongación y la finalización.
Angeles Torres Valdetano
INICIACIÓN HORQUILLA DE
La helicasa reconoce en origen y
REPLICACIÓN
avanza en dos direcciones abriendo
Proteínas
las cadenas formando una horquilla
RPAs
de replicación
Ejercicio B
TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTTAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAATTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTAA
TOPOISOMERASAS
Sitios de inicio llamados ARS, EN DONDE SE UNE EL ORE Y EL ORC
GATGTTTCCTGTGGCCTAGCTCCTTTTTATTGCCGAGGGCTACTCTGTTGTATGAAAACCACAATTCATTTCTCCCTTCTC
CTACAAAGGACACCGGATCGAGGAAAAATAACGGCTCCCGATGAGACAACATACTTTTGGTGTTAAGTAAAGAGGGAAGAC
CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
POLI DELTA Y EPSIÓN ON RECONOCE LOS
CEBADOR PRIMERS AÑADE LOS DNTPs
ELONGACIÓN POLIMERASA ALFA (PRIMASA
SINTETIZA LOS CEBADORES)
TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTTAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAATTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTAA
PASA EN TODOS LOS PUNTOS DE INICIO
GATGTTTCCTGTGGCCTAGCTCCTTTTTATTGCCGAGGGCTACTCTGTTGTATGAAAACCACAATTCATTTCTCCCTTCTC
CTACAAAGGACACCGGATCGAGGAAAAATAACGGCTCCCGATGAGACAACATACTTTTGGTGTTAAGTAAAGAGGGAAGAC
CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
Fragmentos de Okasaki EN LAS
Angeles Torres Valdetano
CADENAS RETARDADAS
CEBADOR AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAATTC CEBADOR AGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGT
TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTTAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAATTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTAA
TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTTAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
SINTESIS DE LA CADEDA ADELANTADA
PASA EN TODOS LOS PUNTOS DE INICIO
GATGTTTCCTGTGGCCTAGCTCCTTTTTATTGCCGAGGGCTACTCTGTTGTATGAAAACCACAATTCATTTCTCCCTTCTC
CTACAAAGGACACCGGATCGAGGAAAAATAACGGCTCCCGATGAGACAACATACTTTTGGTGTTAAGTAAAGAGGGAAGAC
CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
SE TERMINA DE DUPLICAR LA CADENA
ADELANTADA Y RETRASADA
TERMINACIÓN
cebador Una polimerasa elimina el cebador y la ligasa une los fragmentos
de okasaki
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAATTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTAA
TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTTAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
AAATACAACAAGTTGAACTGAACTTGTTGTGAAATTCAGTTCAAACCTAGACCGAAGAAGACGAGTCAACGCTCCGGGTAA
TTTATGTTGTTCAACTTGACTTGAACAACACTTTAAGTCAAGTTTGGATCTGGCTTCTTCTGCTCAGTTGCGAGGCCCATT
CTACAAAGGACACCGGATCGAGGAAAAATAACGGCTCCCGATGAGACAACATACTTTTGGTGTTAAGTAAAGAGGGAAGAC
GATGTTTCCTGTGGCCTAGCTCCTTTTTATTGCCGAGGGCTACTCTGTTGTATGAAAACCACAATTCATTTCTCCCTTCTC
CTACAAAGGACACCGGATCGAGGAAAAATAACGGCTCCCGATGAGACAACATACTTTTGGTGTTAAGTAAAGAGGGAAGAC
GATGTTTCCTGTGGCCTAGCTCCTTTTTATTGCCGAGGGCTACTCTGTTGTATGAAAACCACAATTCATTTCTCCCTTCTC
Angeles Torres Valdetano
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
CAAACCACAAGTAAACGTGACAAAGGTCGGACCCCGTTACTACTCATTTCGACAATTTTTGTCCGTGTATACAAAAGGAAA
CTTTGGTGAACATTTGCACTGTTTCCAGCCTGGGGCAATGATGAGTAAAGCTGTTAAAAACAGGCACATATGTTTTCCTTT
La telomerasa evita el acortamiento de los telomeros
Considera la secuencia anterior como un DNA lineal cuando presenta varios sitios
de inicio de la replicación (marcado en negritas)
Realiza la replicación de esta molécula.
1. Describe que tipo de organismo realiza este tipo de replicación si su DNA
es lineal y ¿qué características presenta en su replicación?
Eucariontas,
Intervienen enzimas similares a los que actuan en las células procariontes
y otros enzimas que han de duplicar las histonas que forman parte de los
nucleosomas. Los nucleosomas viejos permanecen en la hebra conductora.
Todo se da en el núcleo. Las unidades de replicación se denominan
replicones Es bidireccional, semiconservativa, secuencial , semidescontinua
Utiliza la polimerasa 1 y 2, también los RPAs que funcioan como los SSB,un
cebador, un molde los DNTPs, cofactores, enzimas helicasa, topoisomerasas,
ligasa y primasa y telomerasa, ya que existe acortamiento de los
telomeros ,Ademas Contienen tres ADN polimerasas que sustituyen a la pol I
Y polI, que son: α (alfa): nuclear, replicación ADN. β (beta):
nuclear,reparación ADN y ε (épsilon): nuclear, reparación
ADN,corrección de errores. El ADN de las células eucariotas
está fuertemente asociadoa+histonas,formando nucleosomas. El ADN
eucariótico es mucho más largo que el ADN procariota,por lo que su
replicación es mucho más lenta
2. Indica e ilustra en la misma molécula lo que le pasa en cada paso de la
replicación: el inicio, la elongación y la finalización.
