Proteínas: Fundamental
Propiedades químicas
Las proteínas son macromoléculas que se encuentran en todos los productos biológicos.
sistemas, desde procariotas inferiores hasta eucariotas superiores.
Ocupan una posición destacada en las células vivas, ambas
cuantitativa y cualitativamente, lo que explica la
origen de su nombre derivado de la palabra griega proˆtos,
que significa "primer rango de importancia".
Cuantitativamente, las proteínas son la clase más abundante de
biomoléculas ya que representan más del 50% de la seca
peso de las células, mucho más que otros biopolímeros importantes
tales como ácidos nucleicos, polisacáridos o conjuntos lipídicos.
Cada organismo contiene una gran variedad de proteínas específicas,
de acuerdo con el número de genes correspondientes
presente en los cromosomas. Este número varía de unos pocos
cientos en ciertas especies bacterianas a varios miles
en animales y hombre.
Cualitativamente, las proteínas están involucradas en prácticamente todos
procesos biológicos Por lo tanto, la mayoría de las reacciones químicas
que ocurren en formas de vida son catalizadas por proteínas específicas
llamadas enzimas que pueden aumentar las velocidades de reacción en
varios órdenes de magnitud Las proteínas también pueden transportar
y almacenar una amplia gama de iones y moléculas pequeñas, así como
electrones Poseen actividad hormonal y, en la forma
de anticuerpos que distinguen entre uno mismo y uno mismo,
defienden organismos contra intrusos. Ellos participan
en la recepción y transmisión de señales y estímulos a
niveles intracelulares e intercelulares. Ellos juegan cruciales
papeles en la regulación de la expresión de genética
información, ya sea en transcripción o traducción, en
conexión con el control del crecimiento y la diferenciación
de células. También son necesarios para proporcionar el
soporte mecánico y arquitectura filamentosa dentro
y entre células, y en consecuencia son esenciales para
Contracción celular y movimiento coordinado.
Cualquiera sea su papel estructural o funcional, todas las proteínas
son polímeros compuestos de los mismos bloques de construcción, los
aminoácidos, que están unidos covalentemente por amida
enlaces, conocidos como enlaces peptídicos. Solo difieren en el
número, la naturaleza y el orden secuencial de sus
Aminoácidos constituyentes. Para entender lo funcional
diversidad de proteínas, es importante, primero, apreciar la
propiedades fisicoquímicas de los diferentes aminoácidos,
a pesar de que las propiedades de una molécula de proteína son enormemente
más complejo que la suma de las propiedades de sus diferentes
Aminoácidos constituyentes. Entonces es posible determinar el
estructuras tridimensionales que estos edificios vinculados
los bloques pueden adquirir y analizar las propiedades biológicas
de los polímeros correspondientes.
Composición química y propiedades
de proteínas
Proteínas de todos los organismos (virus, bacterias, plantas,
animales, etc.) están constituidos por los mismos 20 diferentes
aminoácidos (tabla 1). Cada aminoácido comprende un amino
grupo, un grupo carboxilo, un átomo de hidrógeno y un R específico
grupo unido a un átomo de carbono llamado a-carbon [I]. los
El grupo R se conoce como "cadena lateral" y varía en tamaño,
carga, forma y composición química de un amino
ácido al otro.
Características de los aminoácidos.
De los 20 aminoácidos generalmente presentes en las proteínas, 19 tienen
la estructura general mostrada en [I], pero un aminoácido -
prolina: tiene su cadena lateral unida al átomo de nitrógeno para
dar un iminoácido. La ocurrencia infrecuente adicional de
un vigésimo primer aminoácido, denominado selenocisteína, ha sido
reportado. En esta molécula, el átomo de azufre de la cisteína es
reemplazado por selenio.
En todos los aminoácidos excepto la glicina, donde el lado
la cadena es solo un átomo de hidrógeno, el carbono a es asimétrico,
pero de los dos posibles isómeros ópticos, d y l, solo el l-
El isómero se encuentra en las proteínas naturales. Dos aminoácidos
treonina y leucina, poseen un asimétrico adicional
centrarse en sus cadenas laterales y, de los cuatro posibles ópticos
isómeros, solo uno se usa biológicamente.
Los grupos carboxilo y amino de los aminoácidos son
ionizado en solución a pH fisiológico neutro, con el
grupo carboxilo con carga negativa (–COO 2) y
el grupo amino una carga positiva (–NH3
La ionizacion
el estado varía con el pH: en solución ácida el grupo carboxilo es
no ionizado (–COOH) y el grupo amino está ionizado
(–NH3
Por el contrario, en solución alcalina, el carboxilo
grupo tiene carga negativa (–COO 2) y el amino
grupo no está ionizado (–NH2).
Clasificación de aminoácidos.
En general, las propiedades de ionización del constituyente.
aminoácidos, incluidos los de sus cadenas laterales, en gran medida
influir en la solubilidad, estabilidad y organización estructural
Tabla 1 - continuación
Aminoácido Abreviatura de tres letras Símbolo de una letra Fórmula
Lisina Lys K
Metionina Met M
Fenilalanina Phe F
Proline Pro P
Serine Ser S
Treonina Thr T
Triptófano Trp W
Tirosina Tyr Y
Valine Val V
Proteínas: propiedades químicas fundamentales
ENCICLOPEDIA DE CIENCIAS DE LA VIDA / & 2002 Macmillan Publishers Ltd, Nature
Publishing Group / [Link] 3
ción de proteínas. Del mismo modo, la hidrofobicidad / hidrofi-
La liquidez de las cadenas laterales juega un papel importante en el
comportamiento fisicoquímico de las cadenas de polipéptidos y sus
plegado en estructuras tridimensionales. Diferentes clasi
Se han propuesto ficaciones de los 20 aminoácidos en el
base de las propiedades de sus grupos R. Uno de los mas
comúnmente utilizado incluye seis categorías:
Alifático (5 aminoácidos): glicina, el amino más simple
ácido con solo un átomo de hidrógeno en su cadena lateral;
alanina, valina, leucina e isoleucina, que contienen
cadenas no polares hidrofóbicas no cíclicas, poco solubles
ble en agua.
Hidroxílico (2 aminoácidos): serina y treonina
que contienen, respectivamente, un primario y un secundario
dary alcohol group, son polares y muy solubles en
agua.
Ácido o dicarboxílico, y las amidas correspondientes (4
aminoácidos): ácido aspártico y ácido glutámico, que
ambos poseen un segundo grupo carboxilo en su lado
cadena ionizada, cargada negativamente y muy polar
bajo condiciones fisiológicas; el correspondiente
derivados, asparagina y glutamina, que contienen
un grupo amida polar en lugar del segundo carboxilo
grupo.
Básico (3 aminoácidos): lisina y arginina, que
están ionizados, cargados positivamente y muy polares,
bajo la mayoría de las condiciones fisiológicas; histidina, con
un grupo imidazol, que está poco protonado en
pH 7.
Cíclico (4 aminoácidos): fenilalanina, tirosina y
triptófano, que contiene cada uno un aromático
ciclo; prolina, el iminoácido con un alifático
heterociclo
Que contiene azufre (2 aminoácidos): metionina, con un
cadena no polar hidrofóbica; y cisteína, que es
polar debido a su grupo sulfhidrilo.
Detección de aminoácidos y proteínas.
La detección de aminoácidos y proteínas se logra mediante
Técnicas físicas, químicas y biológicas. La presencia
de aminoácidos, cuando se polimerizan, pueden ser revelados por el
absorbancia ultravioleta del enlace peptídico por debajo de 230 nm.
Cuando están libres o unidos en polímeros, el
la presencia de aminoácidos también se puede detectar por su
absorbancia alrededor de 280 nm para aquellos que llevan un anillo de indol
(Trp) o un anillo aromático (Phe, Tyr).
Como las proteínas contienen aproximadamente 16% de nitrógeno en masa,
pueden ser analizados por el método Kjeldahl basado en
mineralización de ácido sulfúrico y medición de la
liberado amoniaco. Otro procedimiento es el biuret.
reacción que mide específicamente los enlaces peptídicos: cobre (-
ii) el sulfato en tartrato alcalino reacciona con un enlace peptídico para
producir un compuesto púrpura con máxima absorción a
540 nm. Un ensayo similar y más sensible es el Folin
método fenol desarrollado por Lowry y colaboradores, en
qué iones de cobre se agregan a la solución de proteína en el
presencia de una mezcla de fosfomolibdato-tungstato.
Los grupos amino de aminoácidos y proteínas también reaccionan con
ninhidrina para dar un producto morado con el máximo
absorbancia a 570 nm. Fluorescamina y o-ftalalde-
Hyde también reacciona con grupos amino y forma fluorescentes
productos
Un reactivo común para teñir proteínas es Coomassie
azul brillante que puede usarse para cuantificar proteínas en
solución o incluido en geles. Otra mancha sensible
El método implica nitrato de plata. Los ensayos biológicos toman
ventaja de las propiedades inmunológicas de las proteínas,
su afinidad por ligandos específicos o su actividad enzimática.
Estructura primaria El nivel primario de estructura se refiere a la secuencia lineal. de
aminoácidos a lo largo de una cadena de proteínas y a la ubicación de enlaces
covalentes, a saber, enlaces disulfuro, entre cadenas o dentro de una cadena. La
estructura primaria identifica una proteína. inequívocamente, determina su química y
biológica características, y especifica los niveles más altos de proteína estructura.
Estructura secundaria
En principio, una cadena de polipéptidos podría asumir una gran
flexibilidad debido a la rotación libre de los átomos alrededor
diferentes enlaces a lo largo de la cadena. Si lo hiciera, se comportaría
como una bobina aleatoria y teóricamente podría adoptar una miríada
de conformaciones de energías similares. De hecho, en biológico
condiciones, cada proteína adopta esencialmente solo una
conformación porque las cadenas laterales de su aminoácido
los residuos se asocian localmente entre sí y con el
solvente para producir una estructura global de máxima estabilidad.
El plegamiento correcto de proteínas a veces requiere la
asistencia de una clase particular de proteínas celulares llamada
chaperonas moleculares
Las interacciones involucradas son mayoritariamente no covalentes.
tipo: enlaces de hidrógeno donde un átomo de hidrógeno covalentemente
unido a un átomo electronegativo (el donante) interactúa
favorablemente con otro átomo electronegativo (la aceptación
colina); fuerzas electrostáticas entre cargas netas de opuesto
signos, conocidos como puentes de sal, o entre dos dipolos cada uno
formado a partir de la distribución asimétrica de electrones
dentro del enlace covalente de dos átomos que tienen diferentes
electronegatividades; fuerzas de repulsión entre electrones
orbitales de átomos, que funcionan como esferas impenetrables
definido por su radio de van der Waals; e hidrofóbico
interacciones entre residuos no polares, que dan la
mayor contribución individual a la estabilidad de la proteína. Además
estas interacciones no covalentes, la conformación de
Las proteínas también se estabilizan mediante algunos enlaces covalentes,
especialmente puentes disulfuro entre pares de cisteilo
residuos
Varios patrones de plegado ocurren repetidamente en partes de
Moléculas de proteínas. Se conocen colectivamente como segundos
estructura aria, que constituye el siguiente nivel de proteína
estructura después de la estructura primaria. Estos regular
disposiciones de las cadenas de polipéptidos lineales con
valores repetidos de los ángulos de torsión F y c y
Los enlaces de hidrógeno de la cadena principal son de dos tipos principales: un
hélices, con patrones repetitivos de enlaces de hidrógeno locales,
yb hojas, con patrones repetitivos entre partes distantes
de la cadena polipeptídica.
Estructura terciaria
El nivel terciario de estructura se refiere al espacio
disposición de una cadena polipeptídica mediante plegado y
enrollado para producir una forma globular compacta. Para algunos
proteínas la participación de chaperonas moleculares es
necesario. La estructura terciaria está esencialmente determinada
por el empaquetamiento de las estructuras secundarias, a hélices yb
hojas, que se combinan para formar una o varias unidades llamadas
"Dominios". Estas combinaciones son limitadas en número, y
Algunos de ellos son especialmente frecuentes en proteínas. Ellos
representan los elementos fundamentales del polipéptido globular
cadenas de mareas en términos de estructura tridimensional también
como en términos de función. En promedio, un solo dominio
consiste en 100-150 residuos de aminoácidos, correspondientes a
un glóbulo de aproximadamente 25 A ̊ de diámetro. Algunos dominios pueden ser
aislado como fragmentos por escisión proteolítica limitada de
la cadena peptídica de enlace. Tales fragmentos mantienen el
conformación original que tienen en la proteína nativa;
son estables y pueden plegarse / replegarse como autónomos
estructuras
Clasificación de estructuras proteicas.
Según los tipos de motivos estructurales que constituyen
los dominios, las estructuras proteicas se pueden clasificar en cuatro
grupos principales:
1. Proteínas, construidas exclusivamente a partir de una hélice en un
disposición antiparalela o perpendicular (por ejemplo, mio-
globina, hemoglobina, ferritina, bacteriorrodopsina,
fosfolipasa C).
2. Proteínas, que consisten exclusivamente en láminas b en las que
Los filamentos b están dispuestos predominantemente en un antipar-
moda alélica (por ejemplo, quimotripsina, rubredoxina, inmuno-
noglobulina, superóxido dismutasa, concanavalina A).
3. Proteínas a / b, que contienen láminas b, en su mayoría paralelas,
rodeado de una hélice (por ejemplo, alcohol deshidrogenasa,
subtilisina, tiorredoxina, hexoquinasa, carboxipeptidasa A).
4. a 1 b Proteínas, construidas a partir de una combinación de a
yb motivos distantes entre sí en el amino
secuencia ácida (p. ej., termolisina, insulina, papaína,
lisozima, ribonucleasa A).
La estructura espacial de las proteínas se puede determinar utilizando un
variedad de tecnicas. Por lo tanto, técnicas espectroscópicas
(ultravioleta, infrarrojo, fluorescencia) proporcionar información
sobre la ubicación e interacciones de ciertos químicos
grupos La espectroscopía de dicroísmo circular se puede utilizar para
Analizar los componentes estructurales secundarios. Para obtener
datos detallados sobre la disposición de los átomos dentro de un
proteína, las dos técnicas principales son los cristales de rayos X
lografía y resonancia magnética nuclear bidimensional
maricón. Así, la primera determinación de los tres completos
estructura dimensional de una proteína globular, el esperma
mioglobina de ballena, fue lograda en 1958 por John Kendrew
sobre la base de cristalografía de rayos X a baja resolución.
Estructura cuaternaria
Muchas proteínas están formadas por dos o más polipéptidos.
cadenas, llamadas subunidades o monómeros, que pueden tener
secuencias de aminoácidos idénticas o diferentes. Tal tipo de pólipo
agregación de mareas, que representa la estructura cuaternaria
Por lo general, es de importancia crítica para el correcto
funcionamiento de estas proteínas oligoméricas. De hecho, excepto en
algunos casos (por ejemplo, aspartato transcarbamilasa), sin proteínas
se observa actividad cuando las subunidades constituyentes son
apartado. Cada subunidad generalmente se pliega de forma independiente,
luego interactúa con las otras subunidades porque muestran
superficies complementarias en cuanto a formas y físico
las interacciones están preocupadas.
La rigidez de la unión es muy variable: algunos agregados
las puertas son muy estables y difíciles de disociar, mientras que otras
son bastante lábiles Las interacciones entre dos idénticos
las subunidades (un homodímero) son isólogas o heterogéneas
logous. La asociación isóloga utiliza las mismas superficies en
ambas subunidades, mientras que la interacción heteróloga implica
Dos sitios diferentes.
Como en subunidades individuales, ocurren interacciones no polares
preferentemente en el centro de las interfaces e hidrofílico
los grupos están ubicados en la periferia para interactuar con
disolventes polares En la agregación, el área de superficie accesible
de cada subunidad se reduce en aproximadamente 10-20%. Minimizar
la energía libre en forma agregada, las subunidades son
generalmente embalado de manera simétrica, como en cristales.
