Facultad de Química, UNAM
1630 Genética y Biología Molecular
Transcripción y Procesamiento
del RNA
Unidad V
Depto. de Bioquímica, Facultad de Química. UNAM
Proyecto PAPIME PE201017
Flashcards de la Unidad V
Las diapositivas de este archivo vienen organizadas en pares;
la primera tiene una pregunta sobre algún concepto de la
Unidad y la siguiente tiene la respuesta, generalmente ilustrada
con alguna imagen.
El objetivo es usarlas como herramientas de estudio que
contribuyan a reforzar el aprendizaje.
¿Compare los procesos de replicación del DNA y
transcripción?
Replicación: Transcripción:
•Se requiere un molde de DNA. •Se requiere un molde de DNA.
•Se copian las dos cadenas de de la •Se transcribe solamente una de las
doble hélice de DNA. cadenas.
•Se hace una copia de TODO el •Se transcribe solamente un
genoma. fragmento del genoma (gen).
RNA
¿Cuáles son los productos del evento de
transcripción?
Los productos de la transcripción son diversos RNAs, según el gen que se
está transcribiendo.
• RNA ribosomal. Muy abundantes (80% RNA de la célula). Forma parte
integral de los ribosomas. Participa en la síntesis de proteínas.
• RNA de transferencia. Transporta aminoácidos al sitio de la síntesis
de proteínas.
• RNA mensajero. Acarrea la información para la secuencia de una
proteína.
• snRNAs (RNAs pequeños nucleares; eucariontes). Participa en el
proceso de intrones de los RNAm eucariontes.
• microRNAs (eucariontes). Regula los niveles de RNAm.
• RNA pequeños (procariontes). Regula los niveles de RNAm.
¿A qué nos referimos con la estructura
secundaria y terciaria de la molécula de RNA?
Aunque las moléculas de RNA
son de cadena sencilla, se
pliegan, y a través de
interacciones de Watson-Crick
forman diversas estructuras.
Tallo Asa
El plegamiento que adquieren depende de la secuencia de nucleótidos del RNA
(estructura primaria).
- Estructura secundaria: Regiones helicoidales que adquieren distintas
formas como tallo y asa.
- Estructura terciara: Los arreglos de las estructuras secundarias en un
forma tridimensional compacta.
¿Cuáles son los principales RNAribosomales en
células procariontes y eucariontes?
PROCARIONTES:
RNAr 23S: 2,904 nts.
RNAr 16S: 1,542 nts.
EUCARIONTES:
RNAr 28S: 4,718 nts.
RNAr 18S: 1,874 nts. Electroforesis de
RNA ribosomal
S = Svedberg; unidades de
sedimentación. La partícula más
grande tiene mayor sedimentación en
un gradiente de densidad
¿Cuál es la relación entre las secuencias de la
cadena molde de DNA, la cadena codificante de
DNA y la secuencia de la cadena de RNA
transcrito?
Solamente un fragmento de DNA, que corresponde a un gen, es
copiado en RNA. Ésta es la cadena molde y su cadena
complementaria es la cadena codificante.
DNA Cadena codificante (sentido): 5’-ATTCCGATGTACGAGG-3’
DNA Cadena molde: (antisentido): 3’-TAAGGCTACATGCTCC-5’
RNA 5’-AUUCCGAUGUACGAGG-3’
La secuencia de la molécula de RNA que se sintetiza es
complementaria y antiparalela a la cadena molde.
La molécula de RNA que se sintetiza tiene la misma dirección y
secuencia (U -> T) que la cadena codificante (sentido).
¿Cuáles son las subunidades que forman la RNA
polimerasa de E. coli?
La RNA POLIMERASA de E. coli está formada por 4 subunidades
Subunidad : Participa en el ensamblaje de las unidades y unión al
DNA en la región UP. Hay dos subunidades en el núcleo de la RNA pol.
Subunidad : Contiene el sitio catalítico de la RNA pol.
Subunidad ’: Se une al DNA y también al cofactor Zn2+
Subunidad : Reconocimiento del promotor específico.
Las subunidades , , ’
constituyen el núcleo de la
RNA polimerasa.
La subunidad se asocia en
forma reversible.
¿Cuál es la función de la subunidad de la RNA
polimerasa de E. coli?
La subunidad sirve como nodo para ensamblar la RNA polimerasa
holoenzima y esta función reside en el dominio N- terminal (NTD) de la
proteína.
El domino C-terminal (CTD) de la subunidad interactúa con la
región UP de los promotores que la tengan.
¿Qué es un promotor y cuál es su función en el
proceso de transcripción?
Un promotor es una secuencia de DNA que, generalmente, se
encuentra “corriente arriba” del sitio de inicio de la transcripción
y sirve como sitio de reconocimiento de factores transcripcionales
y de la RNA polimerasa.
¿Cuáles son los elementos de los promotores de
genes procariontes?
Los elementos de los promotores procariontes son:
• Secuencia -10 o caja Pribnow (TATAAT) Apertura de la cadena.
• Secuencia –35 (TTGTCA) Es la región de reconocimiento e
interacción con el factor de la RNA polimerasa.
5 –8 pb
¿Cuál es la función del factor σ de la RNA
polimerasa procarionte?
El factor sigma de la RNA polimerasa participa en la iniciación
de la transcripción al unirse a la caja -35 del promotor. Esta
interacción causa la apertura de entre 10 - 17 pb de la doble
cadena de DNA y permite que el núcleo de la RNA polimerasa
se asocie fuertemente al DNA e inicie la transcripción. Cuando
esto sucede, el factor se disocia de complejo y puede ser
usado por otra molécula de RNA polimerasa.
RNA pol
¿Cuáles son los sustratos de la RNA polimerasa
y el mecanismo de elongación durante la
transcripción?
3’
Los sustratos de la RNA
polimerasa son:
1. Una cadena molde de DNA A
2. Los ribonucleótidos
trifosfato: ATP, GTP, CTP y UTP
Se añaden ribonucleótidos
polimerizándose la cadena a
través de la formación de enlaces
fosfodiéster. C
La cadena se sintetiza en
5’
dirección 5’ –> 3’
¿Cuáles son los mecanismos de terminación de
la transcripción en procariontes?
Hay dos mecanismo de terminación:
2. Mecanismo mediado por
1. Mecanismo dependiente de la terminadores intrínsecos
proteína Rho
La secuencia al final del gen contiene
repeticiones invertidas que son
La proteína Rho es un hexámero que complementarias y que permiten la
se une al RNA que se está formación de una estructura de tallo-
sintetizando y se mueve en dirección asa en el RNA. Hay una región rica en
al sitio de síntesis. Desestabiliza al Adeninas, de tal forma que el híbrido
híbrido DNA – RNA, facilitando así la DNA-RNA que se forma es débil y se
terminación de la transcripción. disocia.
RNA polimerasa
Proteína
Rho
¿Cuáles son las funciones y características de
las tres RNA polimerasas eucariontes?
Las RNA polimerasas eucariontes tienen funciones especializadas sobre
los genes que transcriben. Difieren también en su sensibilidad a la -
amanitina
Enzima Localización Producto Sensibilidad a
α-amanitina
RNA polimerasa I Nucleólo RNAr 18S / RNAr 28S Insensible
RNA polimerasa II Nucleoplasma RNA mensajeros Alta
RNA polimerasa III Nucleoplasma RNA transferencia Baja
¿Qué características tienen los promotores clase
II eucariontes?
Los promotores (clase II) de los genes que transcribe la RNA Pol II son
más complejos que los procariontes. Muestran varios elementos de
reconocimiento para la RNA polimerasas y no están conservados en
muchos genes.
Se distinguen dos regiones:
Promotor basal: Es la región donde se une la maquinaria
transcripcional (RNA polimerasa II y otras proteínas) y formar el
complejo de iniciación.
Promotor proximal. Se encuentra “río arriba” del promotor
basal y contiene URE (Elementos regulatorios “río arriba”). Son sitios
de unión de otras proteínas (factores de transcripción) que regulan
específicamente la expresión del gen.
¿Qué modificaciones post-transcripcionales
sufren los RNA ribosomales?
Regiones intergénicas
PreRNA
45S 18S 5.8S 28S
Algunos nucleótidos de los
RNAs ribosomales son
metilados
18S 5.8S 28S
corte
Los RNA ribosomales son sintetizados como una sola unidad transcripcional y se
genera un pre-RNA (45S) que sufre cortes endonucleolíticos para generar los
RNA ribosomales 28S, 18S, y 5.8S. Se eliminan así las regiones intergénicas.
¿Qué modificaciones post-transcripcionales
sufren los RNA mensajeros eucariontes en sus
extremos?
Los RNA mensajeros eucariontes son modificados en sus extremos 5’ y 3’
En el extremo 5’ ocurre la reacción de En el extremo 3’ ocurre la adición
“capping” o encapuchamiento que de poliadeninas.
consiste en la unión de un residuo de
7-metil guanosina, por una La secuencia –AAUAAA- en la región
guanililtransferasa. 3’-UTR funciona como señal para un
corte endonucleolítico en la molécula
Se forma un enlace 5´- 5´ trifosfato. de RNA que genera un extremo 3’-
OH. La poli-A polimerasa incorpora A
Esta modificación: (30 – 300). Usa ATP y no requiere un
molde de DNA.
Protege al RNAm de exonucleasas.
La cola de poli-Adeninas permite que
Facilita la unión del RNAm al el RNAm se una a la proteína PAB
ribosoma (Poly-A-Binding), favoreciendo su
estabilización.
¿Qué es el evento de “splicing” que sufren los
RNA mensajeros eucariontes?
El splicing es el evento mediante el cual se eliminan los intrones de un RNA
mensajero precursor (heteronuclear) y se empalman los exones para generar un
RNA mensajero maduro.
DNA
Transcripción
RNAm
hetero-
Procesamiento: nuclear
eliminación de intrones.
Empalme de exones
RNAm
maduro
¿Qué factores son responsables de realizar el
evento de “splicing”?
El “splicing” del RNAm es catalizado por snRNP (small nuclear RiboNuclear
Particles), que son están conformadas por RNAs asociadas a proteínas.
La subunidad de RNA (U1, U2, U4, U5 y U6) forma puentes de hidrógeno con
las bases en los sitios de reconocimiento de los intrones (3’, 5’ y la rama).
A todo este complejo de moléculas se le conoce como “Spliceosome” =
espliceosoma.
1. Definición del sitio de corte 3. Formación del complejo
catalítico => Corte y empalme
2. Ensamblaje
del complejo
¿Qué quiere decir “splicing” alternativo?
Los RNA heteronucleares(hn) de algunos genes pueden ser procesados (splicing)
de manera diferencial generando dos o más RNAm maduros distintos.
DNA
cromosomal
RNAhn
Transcrito
primario “Splicing” alternativo
Traducción Traducción Traducción
Proteína 1 Proteína 2 Proteína 3
Por lo general, el resultado del “splicing” alternativo son proteínas relacionadas
estructuralmente. Generalmente se obtienen isoformas de una proteína.
A partir de un gen, se produce más de una proteína.
