Nutrición Molecular la Ciencia
del Futuro
1. PROFESOR:
Francisco Samuel Bonilla Rodríguez
2. ALUMNOS:
Rubí Cristal Terrones Mares
Eduardo Gamón Serrano
Cindy Bridgette Jaramillo Guzmán
Cristopher Joshua Cruz Mesta
Melanie Montserrat Torres
Nutrición Molecular
El desarrollo de nuevas áreas de estudio dentro de la genética, como las ciencias ómicas
(transcriptómica, proteómica, metabolómica), ha permitido estudiar al genoma a
diferentes niveles de regulación y expresión. Gracias a esto, actualmente se pueden
estudiar las alteraciones génicas de un organismo de forma global “genoma” y se puede
identificar el efecto que tienen estas alteraciones a nivel de proteína y de la producción
de metabolitos. De manera importante, esta nueva forma de estudiar la genética ha
abierto nuevos campos de conocimiento y ha dilucidado nuevos mecanismos celulares
que rigen el funcionamiento de los sistemas biológicos. A nivel clínico, en los últimos
años se han implementado nuevas herramientas moleculares que permiten hacer una
mejor clasificación, un mejor diagnóstico, así como un pronóstico más acertado de
diversas enfermedades. Asimismo, en algunos casos se han establecido mejores
tratamientos que favorecen la calidad de vida de los pacientes. Debido a todo lo
anterior, es importante revisar y divulgar el cambio que ha tenido el estudio de la
genética gracias al desarrollo de las ciencias ómicas, el cual es el objetivo de esta
revisión (Ruíz, Velázquez, Arenas, & Salamanca, 2014).
Figura 1. Estudio global de
las patologías humanas. El
desarrollo de las ciencias
ómicas ha generado miles de
datos acerca de las
alteraciones moleculares
asociadas a una enfermedad.
En un futuro, se espera que las
alteraciones moleculares
características de cada
paciente permitan establecer
tratamientos personalizados.
(Ruíz, Velázquez, Arenas, & Salamanca, 2014).
Los resultados del proyecto genoma humano fueron el punto de partida de grandes
avances técnicos, metodológicos y conceptuales en la ciencia de la genética. Hoy en día
es claro que el ADN es una molécula compleja que presenta diversas interacciones
dinámicas consigo misma y con otros componentes del entorno celular. Asimismo, se
sabe que el ARN es una molécula fundamental para el entendimiento de las características
del organismo y de la respuesta de este a los estímulos del medioambiente. Además, los
mecanismos epigenéticos conjugan todos los eventos moleculares que determinan cuáles
serán los rasgos particulares (anatómicos, fisiológicos, metabólicos, etc.) de una entidad
biológica definida (Vargas-Hernández, 2016).
Los aspectos antes mencionados ofrecen la oportunidad de estudiar el conjunto de
interacciones existentes entre el genoma y la dieta, lo cual es muy relevante dado que la
ingesta de alimentos o de los componentes contenidos o derivados de los mismos es uno
de los factores del entorno más importantes a los que está expuesto un individuo a lo largo
de su vida, puesto que es capaz de condicionar positiva o negativamente el estado de salud
(Vargas-Hernández, 2016).
Nutrigenética
Nutrigenética investiga de manera sistemática el efecto de la composición genética en la
dieta individual respuesta (Corcuff & J. Merched, 2016). Commented [PB1]: ¿A qué se refiere con dieta individual
respuesta?
Commented [PB2]: Corregir la cita. Se especificó que se usaran
La nutrición se considera un determinante principal que influye en el estado de salud de referencias del 2012 a la fecha.
una persona durante toda la vida, y la nutrigenética es la ciencia que estudia cómo las Commented [PB3]: Hacer más clara está redacción.
variantes genéticas pueden afectar la capacidad individual de metabolizar nutrientes. La Commented [PB4]: ¿A qué referencia le pertenecen esas
líneas?
nutrigenética es una fuente útil de información desde diferentes perspectivas
nutricionales, como el metabolismo de macronutrientes, vitaminas, minerales y alimentos
comunes. También se debe enfatizar la nutrición personal, con el objetivo de mejorar la Commented [PB5]: ¿A qué referencia le pertenecen esas
líneas?
prevención primaria de enfermedades crónicas (Lucchini, 2017). Commented [PB6]: Mover esas líneas a otro apartado del
trabajo
Faltaría una bibliografía Commented [PB7]: Referencia controversial por no estar aún
publicada
Nutrigenómica
Nutrigenómica se centran en el papel de la dieta factores y productos nutritivos bioactivos Commented [PB8]: Agregar el artículo
en el gen expresión y estabilidad, estudia el efecto de nutrientes en el ADN y la expresión Commented [PB9]: Corregir redacción, hacerla clara, uso de
comas
génica; a menudo incluye los efectos sobre la estructura del ADN, como el epigenoma
(Corcuff & J. Merched, 2016). Commented [PB10]: Referencia fuera de los límites
establecidos
La Nutrigenómica hace referencia al campo de la ciencia que se ocupa de indagar acerca
de los efectos de los nutrientes sobre la expresión génica; sin embargo, este es un concepto
en constante evolución que está ampliando sus alcances. Con el fin de comprender a
cabalidad este término, es necesario tener presente, en primer lugar, algunos aspectos Commented [PB11]: Usar sinónimo mas claro
clave del proceso de expresión génica, el cual tiene como propósito la producción de
moléculas de ácido ribonucleico (ARN) y péptidos/proteínas a través de los mecanismos
de transcripción y traducción, respectivamente. Commented [PB12]: ¿Qué autor lo publicó?
La transcripción parte de la molécula de ácido desoxirribonucleico (ADN), cuya fuente Commented [PB13]: Poner solo ADN
principal en el organismo humano es el núcleo de cada una de las células, pues este
almacena la información biológica primordial de la especie; sin embargo, otra fuente
importante es el ADN contenido en las mitocondrias y en el microbioma de los distintos
órganos corporales. El ADN nuclear tiene la particularidad de encontrarse unido a Commented [PB14]: ¿A qué se refiere?
proteínas denominadas histonas, lo que le facilita enrollarse en estructuras hiperdensas
conocidas como cromosomas, los cuales exhiben un alto grado de actividad molecular. Commented [PB15]: ¿Qué autor lo publicó?
Durante la transcripción, diversas regiones del cromosoma se descondensan
simultáneamente debido a una separación temporal del DNA y las histonas, permitiendo
que proteínas denominadas factores de transcripción se unan a la doble hélice del DNA,
promuevan el desacoplamiento transitorio de las dos cadenas nucleotídicas y, a partir de
una de ellas, estimulen la síntesis de moléculas de RNA por acción de la enzima RNA
polimerasa. Las moléculas de RNA generadas se clasifican en ribosomal (rRNA), de
transferencia (tRNA), mensajero (mRNA), los pequeños no codificantes (p. ej. miRNAs),
entre otros; estas moléculas son exportadas al citoplasma donde participan activamente
en la síntesis de péptidos y/o proteínas, proceso denominado traducción.
La traducción inicia con el acoplamiento de un complejo proteína-rRNA, conocido como
ribosoma, a una molécula de mRNA. Una vez fijado en el mRNA, el ribosoma se mueve
en tripletas de nucleótidos —codones— hasta hallar una que tenga la secuencia AUG Commented [PB16]: Eliminar guiones
Commented [PB17]: Redactar con mayor claridad
(adenina, uracilo y citosina); a esta última se ensambla una tripleta complementaria —
anti codón— que hace parte de un tRNA específico que transporta el aminoácido
metionina en uno de sus extremos. La metionina se acopla al ribosoma constituyendo el
primer aminoácido de la molécula de péptido y/o proteína, a partir de esto el ribosoma se
desplaza por codones sobre el mRNA, en estos se fija un número igual de anti codones,
y por tanto de tRNAs; cada uno transporta uno de los 20 aminoácidos posibles que se
enlazan, sucesiva y ordenadamente, a la metionina de acuerdo a la información codificada
en la secuencia del mRNA. Commented [PB18]: ¿Qué autor lo publicó?
El conjunto de RNAs, péptidos/proteínas y metabolitos producidos en una muestra
biológica, pueden ser determinados por medio de técnicas moleculares altamente robustas
tales como los micro-arreglos, la secuenciación de última generación, la espectrometría Commented [PB19]: Duda de la traducción
de masas, etc. La información obtenida es analizada por medio de herramientas
bioinformáticas que permiten generar perfiles de expresión, identificar vías metabólicas
y construir redes de interacción que establecen la identidad de las moléculas sintetizadas,
el nivel de producción de cada una de ellas y las posibles relaciones funcionales entre las
mismas, aspectos variables dependiendo del tipo de muestra y de los factores, intrínsecos
y/o extrínsecos, a los que dicha muestra está expuesta en un momento especifico del
tiempo. Commented [PB20]: ¿Qué autor lo publicó?
En conclusión: La Nutrigenómica es un concepto en constante evolución que involucra Commented [PB21]: Enviar el párrafo a un apartado final de
conclusiones generales
procesos y factores que presentan interacciones altamente complejas que requieren de
aproximaciones cada vez más robustas para su comprensión. La evidencia más reciente,
que involucra el estudio en humanos, arroja datos interesantes y fascinantes que tienen
un enorme potencial, sin embargo es necesario que se lleven a cabo muchas más
investigaciones. (Vargas-Hernández, 2016)
Nutrigenética y Nutrigenómica ambos apuntan a entender mejor el gen de nutrientes Commented [PB22]: Mover de apartado y corregir sangría
interacciones. Un objetivo subyacente pero no exclusivo es visualizar estrategias de
nutrición personalizadas para una óptima salud y prevención de enfermedades. (Corcuff
& J. Merched, 2016)
Tema amplio para emplear solo dos referencias, una de ellas está fuera del rango de fechas
establecido.
Epigenética
Los cambios epigenéticos pueden influenciar la expresión de genes implicados en el
metabolismo de nutrientes y señalización. Los procesos epigenéticos regulan la actividad
del gen sin alterar el ADN subyacente secuencias, a través de mecanismos que incluyen
la metilación del ADN, las modificaciones de histonas y la no codificación de ARN
(Singh, Jakhu, & Gill, 2018). Por el contrario, los nutrientes pueden modular procesos Commented [PB23]: Referencia controversial al ser apenas un
manuscrito autorizado
que afectan la epigenética. La epigenética estudia modificaciones de ADN y proteínas de
unión al ADN a través de mecanismos que ocurren después de la replicación y la
traducción, respectivamente. Estas modificaciones alteran la transcripción de genes a
través de la compactación de ADN y accesibilidad a la transcripción proteínas. Trabajo
inicial sobre la influencia de la dieta sobre epigenética ha investigado las consecuencias
de la dieta materna en el desarrollo ‘in utero’ y, más importante, en la vida posterior,
incluida el envejecimiento de descendencia Se sugirió cambios para influenciar la
expresión de gen de alguna manera involucrado en el proceso de envejecimiento (Corcuff Commented [PB24]: Hacer mas clara la redacción de esas
líneas
& J. Merched, 2016). Commented [PB25]: Referencia fuera de rango
Los mecanismos epigenéticos son altamente sensibles y reversibles, por lo que ofrece Commented [PB26]: Corregir sangría
potencial significativo para su uso para desarrollar nuevas herramientas de diagnóstico, Commented [PB27]: Modificar redacción
farmacoterapias y cuidado de tratamiento personalizado (Singh, Jakhu, & Gill, 2018).
Se emplearon fuentes bibliográficas fuera de lo establecido. Ampliar el tema hablando de
nutrientes como agentes de cambios epigenéticos.
Ciencias Ómicas
El mayor conocimiento de la biología del organismo humano, su fisiología y
degeneración patológica, y el desciframiento del código genético de la célula humana
combinado con la micro ingeniería moderna y la bioinformática han llevado a enfoques
analíticos que abordan la complejidad biológica con una reducción limitada a priori. En Commented [PB28]: Redacción demasiada extensa, sin comas,
hacerla mas clara y citarla
lugar de analizar un solo gen, proteína o metabolito, se analiza su totalidad, el genoma, el
proteoma o el metaboloma. De acuerdo con el sufijo "-omica" que indica la totalidad,
estos enfoques se agrupan bajo la etiqueta "omicas". Las omicas se aplican en medicina Commented [PB29]: En español
translacional y también en nutrición molecular donde los resultados de la investigación
deben traducirse en aplicaciones clínicamente significativas en función de su potencial
intrínseco para la medicina personalizada y dietas de vanguardia (Amaro, Petretto,
Angelini, & Pfeffer, 2015). Commented [PB30]: No me enviaron el artículo
Es necesario redactar un enlace, un puente entre el último texto y los apartados que se
están por describir.
Genómica
La existencia de un componente genético responsable de las diferencias en la respuesta
dietética fue propuesta por primera vez hace ya varias décadas, y luego de la culminación
del proyecto internacional del genoma humano, se han dado grandes avances hacia una
mejor comprensión de cómo la nutrición influye en las vías metabólicas y en el control
homeostático, de cómo esta regulación se ve alterada durante la fase temprana de una
enfermedad relacionada con la dieta, y de hasta qué punto la carga genética individual
contribuye a tal enfermedad. El estudio de esta compleja interacción se ha denominado
genómica nutricional y su principal objetivo es estudiar las interacciones funcionales de
los alimentos y sus componentes con el genoma a nivel molecular, celular y sistémico, a
fin de prevenir o tratar enfermedades a través de la dieta. Esta interacción tiene un carácter
bidireccional, por lo cual se generan dos sub-conceptos: La nutrigenética o “nutrición
personalizada”: que estudia el efecto de las variaciones genéticas en la interacción entre
dieta y enfermedad, esto incluye la identificación y caracterización de las variantes
génicas asociadas, o responsables de, las respuestas diferenciales a los nutrientes. La
nutrigenómica: La cual estudia los efectos que los nutrientes o componentes dietéticos
tienen sobre el genoma (los genes), el proteoma (todas las proteínas), y el metaboloma
(todos los metabolitos). Es un área que se está investigando actualmente (Arata &
Bellabarba, 2015) Commented [PB31]: Todo el párrafo está mal ubicado, va en
distintos apartados
Metabolómica
Metabolómica se define como el análisis de moléculas más pequeño que 1,000 Da, que
se transforman como resultado de, y en apoyo del metabolismo de un organismo. El Commented [PB32]: Modificar un poco la redacción
metaboloma es por lo tanto un conjunto completo de metabolitos que puede ser producido
y consumido por organismos. Por lo general, el metaboloma se mide en fluidos o tejidos
En el pasado, estos experimentos se centró en un solo metabolito que se atribuyó a una Commented [PB33]: Modificar redacción
enfermedad específica o reacción enzimática. Hoy, tecnologías y herramientas
computacionales permiten una amplia investigación de muchos metabolitos en una sola
medida, proporcionando una visión más amplia de los mecanismos de las enfermedades.
Hay dos enfoques principales en metabolómica experimentos: análisis no específicos y Commented [PB34]: Redacción
específicos. Los enfoques focalizados se centran en un conjunto específico de
compuestos, que a menudo son similares en estructura y propiedades químicas y/o
derivadas de la misma vía biológica. Todos los aspectos del estudio, desde preparación
de muestras para el análisis de datos, se adaptan a la medida de estos metabolitos
específicos. A diferencia de, los enfoques no focalizados toman un enfoque global
buscando medir tantos metabolitos como sea posible y el uso de herramientas estadísticas
para identificar aquellos que difieren entre individuos sanos y enfermos. No focalizado Commented [PB35]: Idea demasiado larga
los enfoques son más desafiantes porque estos métodos son más complejos en
comparación con el análisis dirigido, y nuevas hipótesis para el diagnóstico y la etiología
de las enfermedades pueden derivarse de sus resultados (Marx, 2018) Commented [PB36]: ¿Le pertenece todo el texto al mismo
autor?
Incluir a los demás autores en las referencias
La metabolómica se ha utilizado ampliamente para evaluar los sistemas biológicos,
proporcionando información molecular relacionada con el fenotipo, ya que los
metabolitos son el producto final de la actividad de los genes, ARNm y proteínas. Existe
un número creciente de aplicaciones de metabolómica con el objetivo de identificar
biomarcadores para un diagnóstico preciso, proporcionar orientación terapéutica y
evaluar la respuesta terapéutica. El monitoreo de los niveles de biomarcadores en los
sistemas biológicos podría ayudar mucho a detectar las primeras etapas del desarrollo de
la enfermedad con una mejor sensibilidad. Las principales técnicas analíticas adoptadas
en el análisis de la metabolómica global son la espectroscopia de resonancia magnética
nuclear (RMN) y la espectrometría de masas (MS). La MS usualmente se dividió en
guiones con diferentes técnicas de separación, como cromatografía líquida (LC-MS),
cromatografía de gases (GC-MS) y electroforesis capilar (CE-MS) para mejorar la
sensibilidad (Chen, 2018). Commented [PB37]: De preferencia cambiar está bibliografía
Proteómica
Las proteínas realizan la mayoría de las funciones biológicas y constituyen los
principales objetivos farmacológicos. La proteómica puede revelar información que no
se puede obtener a nivel genético. Los recientes avances en proteómica están
relacionados con el rápido desarrollo de la tecnología de espectrometría de masas (Suna
& Mayr, 2017) Commented [PB38]: No me enviaron esa referencia
Las proteínas y péptidos constituyen la principal función y unidades estructurales de la
célula. Por lo tanto, el proteoma está asociado con el estado de salud de un organismo.
Diferencias cualitativas y cuantitativas de la composición del proteoma y el peptidoma
reflejan las condiciones patológicas porque la mayoría de las enfermedades humanas son
caracterizado por un paisaje complejo a nivel molecular nivel es imprescindible para
adquirir una imagen global del proteoma para representar las vías y las proteínas con
pivote papeles en la patogenia. La introducción de alta sensibilidad y espectrometría de Commented [PB39]: Redactar de forma más clara.
masas de resolución analítica enfoques ha permitido la identificación y cuantificación de Commented [PB40]: Redactar de forma más clara
proteínas y péptidos en tejidos y biológicos fluidos, y ofreció nuevas ideas sobre
enfermedades asociadas a procesos a nivel molecular. La información obtenidos de estos
experimentos podrían ser explotados en el entorno clínico mediante la introducción de
biomarcadores (diagnóstico, predictivo, pronóstico) y terapéutico dirigido enfoques
(Marx, 2018).
Texto con poca claridad en las ideas. Darle un mayor sentido referente a la
nutrición molecular.
Transcriptómica
Transcriptómica es el estudio del 'transcriptoma', un término cuyo primer uso, para
significar un conjunto completo de transcripciones, ha sido atribuido a Charles Auffray.
El termino transcriptoma ahora se entiende ampliamente que significa el completo
conjunto de todas las moléculas de ácido ribonucleico (ARN) expresadas en alguna
entidad dada, como una célula, tejido u organismo. Transcriptómica abarca todo lo
relacionado con el ARN. Esto incluye su transcripción y expresión niveles, funciones,
ubicaciones, tráfico y degradación. Eso también incluye las estructuras de las
transcripciones y sus padres genes con respecto a los sitios de inicio, secuencias
terminales 5 'y 3', patrones de empalme y modificaciones post transcripcionales.
Transcriptómica abarca todos los tipos de transcripciones, incluidos los ARN
mensajeros (ARNm), micro ARN (miRNAs) y diferentes tipos de ARN no codificantes
largos (lncRNAs).
La transcriptómica moderna usa métodos de alto rendimiento para analizar la expresión
de múltiples transcripciones en diferentes condiciones fisiológicas o patológicas y esto
es rápidamente ampliando nuestra comprensión de las relaciones entre los transcriptoma
y el fenotipo en una amplia gama de vida entidades (Milward, 2016)
Transcriptómica, permite detección y análisis simultáneos de todas las transcripciones o
ARNm expresado en un sistema biológico en un momento dado (Pius, 2017).
Texto sin formato. Se repiten ideas
Bibliografía
Amaro, A., Petretto, A., Angelini, G., & Pfeffer, U. (2015). Advancements in Omic Sciences.
Translational Medicine.
Arata, G., & Bellabarba, S. (2015). Genómica nutricional y enfermedad del Alzheimer. Revista
Venezolana de Endocrinología y Metabolismo.
Chen, L. (2018). Recent advances in the applications of metabolomics in eye research.
Analytica Chymica Acta.
Corcuff, J.-B., & J. Merched, A. (2016). Nutrigenomics and Nutrigenetics: The Basis of
Molecular Nutrition. Molecular Basis of Nutrition and Aging, 21.
Lucchini, V. (2017). Nutrigenetics in practice: little is better than nothing. Food Science, 1.
Marx, D. (2018). Proteomics and Metabolomics for AKI Diagnosis. Seminars in Nephrology, 4.
Milward, E. (2016). Transcriptomics. Encyclopedia of Cell Biology, 160.
Pius, J. (2017). Transcriptomics in toxicology. Food And Chemical Toxicology.
Singh, A., Jakhu, H., & Gill, G. (2018). Epigenetics and its implications for oral health. Journal Of
Oral Biosciences.
Suna, G., & Mayr, M. (2017). Proteomics. Encyclopedia of Cardiovascular Research and
Medicine.
Vargas-Hernández, J. E. (2016). Nutrigenómica humana: efectos de los alimentos o sus
componentes sobre la expresión RNA. Revista de la Facultad de Medicina, 339-349.
Ponerle un título al trabajo
Citan 11 autores y solo me enviaron 9 artículos.
A las referencias les faltaron las páginas de las revistas.
Complementar con componentes bioactivos.
Hablar sobre nutrientes en la expresión génica.
Usar cuando menos un par de tablas o de figuras.
Redactar sobre la dieta en el papel del cáncer.
Puntos extra si se habla sobre probióticos y antioxidantes para efectos moleculares,
