RIBOZIMAS.
ESCUELA SUPERIOR DE MEDICINA
IPN
RIBOZIMAS.
DANIELA ARCINIEGA.
RIBOZIMAS.
RIBOZIMAS.
CONCEPTO.
Las ribozimas son ARN (ácido ribonucleico) con capacidad catalítica, es
decir, capaces de acelerar las reacciones químicas que ocurren en el
organismo. Algunas ribozimas pueden actuar solas, mientras que otras
necesitan de la presencia de una proteína para realizar efectivamente la
catálisis.
Las ribozimas descubiertas hasta ahora participan en reacciones de
generación de moléculas de ARN de transferencia y en las reacciones del
splicing*: la transesterificación que participan en la eliminación de intrones
de las moléculas de ARN ya sea mensajero, de transferencia o ribosómico.
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*El splicing, o proceso de corte y empalme de ARN, es un fenómeno que ocurre en organismos
eucariotas tras la transcripción del ADN a ARN e involucra la eliminación de los intrones de un gen,
conservando los exones.
HISTORIA.
El estudio de catalizadores biológicos se intensificó a mediados de 1800
cuando Louis Pasteur llamó fermentos a los agentes presentes en las
levaduras que convertían azúcar en alcohol. En 1926 se purificó la primer
enzima, la "ureasa", a partir de plantas, encontrando que estaba
compuesta por material proteico. Los cientos de enzimas purificadas y
analizadas desde entonces resultaron ser de naturaleza proteica, por lo
que se concluyó que todas las enzimas eran proteínas.
Este dogma pareció cambiar cuando en 1982 (1981 según otras fuentes),
en el laboratorio de Thomas Cech, estudiando el procesamiento de RNA
en el protozoo ciliado Tetrahymena thermophila* se observó que el corte y
empalme (splicing) de un intrón del pre-rRNA era autocatalítico, es decir ,el
RNA se escindía (dividía) por sí mismo sin ayuda de un catalizador proteico.
Paralelamente, en el laboratorio de Sidney Altman se investigaban las
propiedades de la enzima ribonucleasa P, que se encuentra en todos los
organismos. La RNAsa P fue una de las primeras ribozimas en ser
descubierta y consta tanto de proteínas como de ARN. Esta participa en la
generación de moléculas de ARN de trasferencia partiendo de precursores
más grandes.
Las estructuras de las enzimas permiten tomar un sustrato y transformarlo en
cierto producto. Las moléculas de ARN también tienen esta capacidad de
plegarse y catalizar reacciones.
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* El protozoo ciliado Tetrahymena thermophila constituye, junto con Paramecium, un micro-
organismo eucariota modelo dentro del grupo de los protozoos.
TIPOS Y SU EMPLEO MEDICO.
Existen cinco clases o tipos de ribozimas: tres de estos participan en
reacciones de automodificación, mientras que los dos restantes
(ribonucleasa P y el ARN ribosomal) usan un sustrato distinto en la reacción
catalítica. En otras palabras, una molécula diferente al ARN catalítico.
Los intrones autocatalíticos del grupo I. Son los primeros ARN con actividad
de ribozima descritos, tiene 413 nucleótidos, esta presentes en ARNr y ARNt
y genes que codifican proteínas. Tienen nueve dominios estructurales los
cuales son P1-P9. Se han clasificado en cuatro grandes subgrupos que van
desde IA al ID. Este tipo de intrones se ha encontrado en genes
mitocondriales de parásitos, hongos, bacterias y hasta del virus (como el
bacteriófago T4).
Por ejemplo, en el protozoo de la especie Tetrahymena thermofila, un
intrón es eliminado del precursor del ARN ribosomal en una serie de pasos:
primero, un nucleótido o un nucleósido de guanosina reacciona con el
enlace fosfodiéster que une el intrón con el exón – reacción de
transesterificación.
Los intrones autocatalíticos del grupo II. Han sido encontrados en algunos
hongos, mitocondrias y cloroplastos. Son interesantes debido a su posible
relación evolutiva con los intrones del pre-ARNm, lo cual es sugerido por la
descripción de similitudes en los mecanismos de corte, eliminación de
intrones. Estos poseen seis dominios estructurales, en los cuales se ubican
dos tipos importantes de regiones, una conocida como sitios de enlace
exón y otro sitio de enlace al intrón.
Los intrones del grupo II se conocen como “de autoempalme”, ya que
estos ARN son capaces autoempalmarse. Los intrones de esa categoría se
encuentran en los precursores del ARN mitocondrial en el linaje de los
hongos.
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Intrones del grupo III. Los intrones del grupo III se denominan ARN
“autocortable” y han sido identificados en los virus patógenos de los
vegetales.
Estos ARN poseen la peculiaridad de poder cortarse a sí mismos en la
reacción de maduración de los ARN genómicos, partiendo de precursores
con muchas unidades.
En este grupo se encuentra una de las ribozimas más populares y
estudiadas: la ribozima cabeza de martillo. Esta se halla en agentes
infecciosos ribonucleicos de los vegetales, denominados viroides.
Estos agentes requieren del proceso de autoescisión para propagarse y
producir varias copias de sí mismo en una cadena de ARN continua.
Los viroides deben ser separados unos de otros, y esta reacción es
catalizada por la secuencia de ARN que se encuentra en ambos lados de
la región de unión. Una de estas secuencias es la “cabeza de martillo” y se
denomina así por la similitud de su estructura secundaria a este
instrumento.
Ribonucleasa P. El cuarto tipo de ribozimas se encuentra formada tanto por
moléculas de ARN como por proteínas. En las ribonucleasas, la estructura
del ARN es vital para llevar a cabo de proceso catalítico.
En el ambiente celular, la ribonucleasa P actúa de la misma forma que los
catalizadores proteicos, cortando precursores de ARN de transferencia con
el fin de generar un extremo 5´ maduro.
Se diferencian del grupo anterior (ribozimas cabeza de martillo) y ARN
similares a este, por el producto final del corte: la ribonucleasa produce un
extremo 5´ fosfato.
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Ribosoma bacteriano. Estudios de la estructura del ribosoma de las
bacterias han permitido concluir que este también posee propiedades de
una ribozima. El sitio encargado de la catálisis se ubica en la subunidad
50S.
EMPLEO MÉDICO.
La ribozima cabeza de martillo es una de las enzimas DEL ARN más
pequeñas conocidas; en estudios in vitro, ribozimas anti-ras se han utilizado
para discriminar secuencias mutadas en el oncogen Hras en el codón* 12 y
en otro estudio utilizando ribozimas se logró actuar sobre genes
defectuosos sin afectar el gen normal, en líneas celulares de vejiga.
Los blancos potenciales para la degradación mediada por ribozimas
incluyen proteínas virales, reguladoras del ciclo celular, factores de
transcripción y proteínas de fusión aberrantes. Existen algunos productos en
la industria farmacéutica que utilizan ribozimas: en fase clínica I Herzyme®,
cuyo blanco es HER-2* que se encuentra alterado en varios procesos
tumorales, y Angiozyme®, en fase clínica II, con blanco en VEGF-R 1* para
cáncer colorrectal metastásico.
El mayor reto para el uso de esta técnica in vivo, es mantener la eficiencia
catalítica de las ribozimas en un ambiente celular donde ocurren
complejas interacciones moleculares.
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*VEGF-R receptores para el factor de crecimiento endotelial vascular, Hay tres subtipos principales
de VEGFR, numerados 1, 2 y 3.
*HER-2 es un protooncogén localizado en el brazo grande del cromosoma 17.
*Codón es unidad de información básica en el proceso de traducción del ARNm, hay 64 codones
diferentes.
BIBLIOGRAFÍAS.
-GELAMBI, M. (2019). RIBOZIMAS: CARACTERÍSTICAS Y TIPOS - LIFEDER.
[ONLINE] LIFEDER. URL: https://www.lifeder.com/ribozimas-caracteristicas-
y-tipos.
-ARTICULO. MODELOS EN DESARROLLO DE TERAPIAS DERIVADAS DE
BIOTECNOLOGÍA
GUSTAVO JAIMES MONROY. GRUPO DE INVESTIGACIÓN, FACULTAD DE
MEDICINA, FUNDACIÓN UNIVERSITARIA SAN MARTÍN, BOGOTÁ, D.C.,
COLOMBIA. RECIBIDO PARA EVALUACIÓN: 19 DE FEBRERO DE 2007.
ACEPTADO PARA PUBLICACIÓN: 28 DE MAYO DE 2007.
URL(archivo pdf):http://www.scielo.org.co/pdf/rccqf/v36n1/v36n1a07.pdf
-SILVANA,M . (2019). ARN- ÁCIDOS NUCLEICOS UIA:ARN. (Blogger.com)
URL: http://acidosnucleicosuia.blogspot.com/p/arn.html
- SILVIA BILLI.( JEFATURA DE TRABAJOS PRÁCTICOS- DEPTO. DE
QUÍMICA BIOLÓGICAFCEYN – UBA).
RIBOZIMAS: RESABIOS DEL MUNDO PRIMITIVO. REVISTA QUÍMICAVIVA.
NÚMERO 1, AÑO 1, DICIEMBRE 2002. RECIBIDO 30 DE OCTUBRE DE 2002.
ACEPTADO 29 DE NOVIEMBRE DE 2002. URL(ARCHIVO PDF):
https://www.redalyc.org/pdf/863/86310104.pdf
