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Enzimas Apuntes PDF

Este documento describe las enzimas, que son biocatalizadores producidos en las células que aceleran las reacciones químicas en los seres vivos. Las enzimas son proteínas que actúan como catalizadores bajando la energía de activación necesaria para las reacciones. Las enzimas son muy específicas y solo catalizan ciertas reacciones.
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Enzimas Apuntes PDF

Este documento describe las enzimas, que son biocatalizadores producidos en las células que aceleran las reacciones químicas en los seres vivos. Las enzimas son proteínas que actúan como catalizadores bajando la energía de activación necesaria para las reacciones. Las enzimas son muy específicas y solo catalizan ciertas reacciones.
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ENZIMAS

Las enzimas son biocatalizadores producidos en las células, que catalizan, es decir facilitan y aceleran las reacciones
químicas que tienen lugar en los seres vivos, ya que disminuyen la energía de activación que se necesita para que
tengan lugar dichas reacciones, permitiendo que se produzcan a velocidades y temperaturas adecuadas.

Como catalizadores ,actúan mediante su presencia, no se consumen en la reacción y al finalizar esta quedan libres
pudiendo utilizarse de nuevo, por eso se necesitan en pequeñas cantidades. Además tienen otras características:

·Son muy específicas, por lo que actúan en una determinada reacción sin alterar otras.

·Actúan a temperatura ambiente, la del ser vivo.

.Presentan una masa molecular muy elevada.

·Son muy activas, algunas aumentan la velocidad de la reacción más de un millón de veces

Para que el sustrato se convierta en producto, sus moléculas deben superar la energía de activación (ΔG), y mientras
más alta sea, menos cantidad de producto se sintetizará. La función que cumple la enzima es bajar el nivel de ΔG,
para que más moléculas del sustrato puedan convertirse en producto.

Algunas enzimas no son activas hasta que actúa sobre ellas alguna sustancia , son los cimógenos o proencimas.
Ejemplo: pepsinógeno del estómago que se activa con Cl H , transformándose en pepsina activa.

Otras presentan isoenzimas, distintas formas moleculares que catalizan la misma reacción en diferentes tejidos.

1. COMPOSICIÓN
Todas las enzimas son proteínas globulares, que tienen pesos moleculares muy elevados (12000 –106 uma), por lo
que su tamaño es muy grande mucho mayor que el de la molécula sobre la que actúa a la que se
denomina sustrato.

Son solubles en agua y se difunden fácilmente en los líquidos orgánicos.

Excepcionalmente existen algunas moléculas de ARN, denominadas RIBOZIMAS que también tienen función
catalítica
TIPOS SEGÚN COMPOSICIÓN

• Enzimas que son proteínas simples u holoproteínas. Están formadas únicamente por una o varias cadenas
de aminoácidos. Son poco frecuentes, un ejemplo lo constituye la ribonucleasa que cataliza la hidrólisis del
ARN

. Enzimas que son proteínas conjugadas o heteroproteínas.

Estas son la mayoría, en este caso se denominan HOLOENZIMAS. En ellas se diferencia: una parte proteica
llamada APOENZIMA y una parte no proteica denominada COFACTOR.

El COFACTOR puede ser de distinta naturaleza:

PUEDEN SER CATIONES METÁLICOS como: Fe++, Mg2+, Cu2+ etc.

• Ej las quinasas que tienen como cofactor Mg2+

PUEDEN SER MOLÉCULAS ORGÁNICAS COMPLEJAS, en este caso se denominan:

• ·COENZIMAS si se unen débilmente y de forma temporal al apoenzima, por ejemplo el NAD+, FAD, etc,

• ·GRUPO PROSTÉTICO si se unen mediante enlaces covalente y de forma permanente al apoenzima, por
ejemplo el grupo hemo de las citocromo oxidasas.

• Tanto la apoenzima como el cofactor son inactivas por si mismas, han de estar unidas para que la enzima
(holoenzima) sea activa.

• El apoenzima determina la especificidad de la reacción, es decir , determina el sustrato sobre el que puede
actuar, mientras que el cofactor presenta los grupos que permiten la transformación del sustrato. Un mismo
cofactor puede ser constituyente de diferentes holoenzimas.

2. MECANISMO DE LA ACCIÓN ENZIMÁTICA


En toda reacción enzimática se diferencian dos fases:

El sustrato (reactivos) se fija específicamente a la enzima, formándose el complejo enzima-sustrato. La


unión éntre la enzima y el sustrato se debe a enlaces débiles (puentes de hidrógeno, atracciones
electrostáticas etc), que se rompen fácilmente una vez que la enzima ha realizado su acción. La unión se
produce en una zona del enzima denominado centro activo.

Liberación de los productos. Una vez producida la acción enzimática, el complejo enzima-sustrato se
desintegra quedando libre por un lado la enzima, que podrá volver a ser utilizada de nuevo y, por otro lado
el sustrato pero ya convertido en producto.

3. EL CENTRO ACTIVO
Es una pequeña región de la superficie de la enzima que tiene forma de hueco o repliegue, y cuya
estructura tridimensional se adapta perfectamente a la estructura complementaria del sustrato.
Este centro activo está formado por: los AMINOÁCIDOS DE UNIÓN que son los que le unen al sustrato y,
los AMINOÁCIDOS CATALÍTICOS que son los que realizan la acción enzimática. Estos aminoácidos pueden
encontrarse muy alejados en la secuencia de la proteína enzimática, pero se encuentran muy próximos entre
sí debido a la estructura terciaria de la proteína enzimática; por eso si la proteína enzimática se desnaturaliza
el centro activo se destruye y la enzima dejara de realizar su función.

Una vez que la enzima se une al sustrato mediante los aminoácidos de unión, actúan sobre él los
aminoácidos catalíticos que serán los que producen la ruptura de enlaces y la formación de otros nuevos,
transformando el sustrato en producto.

Cuando la enzima presenta un cofactor (coenzima…), este se localiza en el centro activo.

4. PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS


[Link]ón, por ser de naturaleza proteica.

[Link] se consumen en la reacción.

3. Especificidad enzimática.

Una de las características más importantes de las enzimas es su alta especificidad sobre la reacción que
catalizan. Cada enzima cataliza un solo tipo de reacción, y casi siempre actúa sobre un único sustrato o sobre
un grupo muy reducido de ellos. Esta especificidad se debe a la complementariedad que debe existir entre el
sustrato y el centro activo de la enzima.

GRADOS DE ESPECIFICIDAD

Especificidad de acción: Es decir solo puede realizar un determinado tipo de reacción: hidrólisis, óxido-
reducción, etc.

Especificidad de sustrato: Esto significa que sólo puede actuar sobre un sustrato, o sobre un reducido
número de sustratos. Esta especificidad puede ser:

-Absoluta. Actúa sobre un único sustrato. Ej. ureasa actúa sobre la urea y la desdobla en CO2 y NH3.

-De grupo. Actúa sobre un grupo de sustratos que presentan un determinado tipo de enlace. Ej las
descarboxilasas eliminan un grupo CO2 de los aminoácidos.

-Estereoquímica. Actúa sobre un estereoisómero y no sobre el otro. Ej. la aspartasa actúa sobre el L-
aspártico y no sobre la forma D.

5. MODELOS DE ACTUACIÓN
. Emil Fischer propuso la HIPÓTESIS DE LA LLAVE Y LA CERRADURA para explicar la especificidad enzimática.
Según esta hipótesis la especificidad entre la enzima y el sustrato es como la que existe entre una llave y su
cerradura, se pensaba que el centro activo tenía una forma tridimensional determinada y el sustrato sería
complementario a él y encajaría perfectamente.

. Daniel Koshland propuso la HIPÓTESIS DEL AJUSTE INDUCIDO o de la mano y el guante que es la que se acepta en
la actualidad.

• Esta teoría afirma que no hay una adaptación predeterminada como ocurre en el modelo de la llave-
cerradura, sino una adaptación inducida por los aminoácidos de unión, la especificidad radica en los
aminoácidos de unión del centro activo, que son los encargados de establecer enlaces débiles con el
sustrato.

Realizada la fijación la enzima posee libertad para cambiar su forma y amoldarse al sustrato de tal manera
que el centro activo quede correctamente situado.

6. FACTORES QUE INFLUYEN EN LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA

La eficacia de una enzima se mide por la velocidad de transformación del sustrato en producto. La actividad
de las enzimas se ve afectada por diversos factores entre los que destacan los siguientes:

1. CONCENTRACIÓN DEL SUSTRATO

En toda reacción catalizada por una enzima, si se mantiene constante la concentración del E, la velocidad
de la reacción aumenta exponencialmente al incrementarse la concentración del sustrato, ya que al existir
más moléculas de sustrato es más probable el encuentro con la enzima ,y la formación del complejo E-S.

Este aumento de velocidad es rápido para concentraciones bajas de sustrato y, a medida que este aumenta,
se va haciendo más lento hasta que la concentración del sustrato alcanza un cierto valor, a partir del cual,
aunque aumente la concentración del mismo, no aumenta la velocidad de la reacción. Esto es debido a que
la enzima está saturada por el sustrato; es decir, todas las moléculas están unidas al sustrato formando el
complejo E-S.

Cuando ocurre esto, se dice que la reacción ha alcanzado la velocidad máxima.

En 1913 Leonor Michaelis y a Maud Menten estudiaron la variación de la velocidad de una reacción
enzimática en función de la concentración del sustrato y propusieron la siguiente ecuación, que es válida
para concentraciones de sustrato no saturante.
V es la velocidad de la reacción para una determinada concentración de sustrato.

Vmax es la velocidad máxima de la reacción.

[S] es la concentración del sustrato.

Km es una constante denominada constante de Michaelis-Menten, es característica de cada enzima.

Km. Se puede definir como la concentración de sustrato necesario para que la velocidad de la reacción sea la mitad
de la velocidad máxima. Se mide en unidades de concentración. La Km nos indica la afinidad de una enzima por su
sustrato:

·Si Km es alta indica que la enzima tiene poca afinidad por el sustrato ya que se necesita una concentración de
sustrato elevada para alcanzar la mitad de la velocidad máxima.

·Si Km es baja indica que la enzima tiene mucha afinidad por el sustrato ya que se necesita una concentración de
sustrato baja para alcanzar la mitad de la velocidad máxima.

2. TEMPERATURA

• La Tª influye en la actividad enzimática. En general por cada 10ºC que aumente la temperatura la velocidad
de la reacción aumenta de 2 a 4 veces. Esta regla se cumple hasta que la temperatura alcanza un valor
máximo (Tª óptima) donde la actividad es máxima. Esto se debe a que al aumentar la Tª aumenta el
movimiento de las moléculas y, por tanto aumenta la probabilidad de encuentro entre el S y el E.

• Si la Tª aumenta por encima de la Tª óptima, disminuye e incluso cesa la actividad enzimática debido a que la
enzima se desnaturaliza.

3. VARIACIONES DE PH

El pH es otro factor que influye en la actividad enzimática, debido a que el pH influye en la ionización de los
grupos funcionales de los aminoácidos que forman la proteína enzimática.

Cada enzima realiza su acción dentro de un determinado intervalo de pH, dentro de este intervalo habrá un pH
óptimo donde la actividad enzimática será máxima.

Por debajo del pH mínimo o por encima del pH máximo la enzima se inactiva ya que se desnaturaliza. En la
mayoría de las enzimas el pH óptimo está próximo a la neutralidad, aunque hay excepciones.
4. INHIBIDORES

• Son compuestos químicos que se unen a la enzima, en distintos puntos de la misma y disminuyen, o incluso
impiden su actividad. Estos compuestos pueden ser de distintos tipos: iones, moléculas orgánicas y , a veces
,el producto final de la reacción.

• La inhibición puede ser:

INHIBICIÓN IRREVERSIBLE: Cuando el inhibidor impide permanentemente la actividad enzimática, bien porque se
une de forma permanente con grupos funcionales importantes del centro activo o bien porque altera su estructura.
A estos inhibidores se les denomina venenos y a la inhibición que realizan se la denomina envenenamiento del
enzima. Ejemplo: el ión cianuro actúa sobre la citocromo oxidasa (enzima respiratorio)

INHIBICIÓN REVERSIBLE: El inhibidor se une a la enzima de forma temporal mediante enlaces débiles e impide el
normal funcionamiento del mismo, pero no la inutiliza permanentemente.
Puede ser de dos tipos:

-Competitiva: El inhibidor es similar al sustrato y se puede unir al centro activo dela enzima impidiendo que
lo haga el sustrato. Es decir ambos, inhibidor y sustrato compiten por unirse al centro activo de la enzima. La acción
suele anularse aumentando la concentración del sustrato

-No competitiva: El inhibidor no compite con el sustrato, puede actuar de 2 formas:

-Sobre la enzima, uniéndose a ella en un lugar diferente al centro activo y modificando su estructura, lo que
dificulta que la enzima se pueda unir con el sustrato.

-Sobre el complejo E-S uniéndose a él y dificultando su desintegración y por lo tanto la formación de los productos.

COMPARACIÓN INHIBICIÓN COMPETITIVA/NO COMPETITIVA


En el primer caso, al aumentar la concentración de sustrato, se llega a alcanzar la velocidad de catálisis sin inhibidor.
5. ENZIMAS ALOSTÉRICAS

• Estas enzimas poseen además del centro activo, otro centro llamado centro regulador o alostérico donde se
puede unir un modulador o regulador alostérico , que puede ser un activador o un inhibidor de la enzima.

• Son enzimas que presentan dos conformaciones diferentes, estables e interconvertibles: una es la forma
activa R, que tiene una gran afinidad por el sustrato, y la otra es la forma inactiva T, que presenta baja
afinidad por el sustrato.

• El paso de la forma inactiva a la forma activa se produce al fijarse en el centro regulador un activador
alostérico o modulador positivo.

• El paso de la forma activa a la forma inactiva se produce al fijarse en el centro regulador un inhibidor
alostérico o modulador negativo.

CARACTERÍSTICAS DE LAS ENZIMAS ALOSTÉRICAS

• . Están formadas por varias subunidades, tienen estructura cuaternaria

• .Presentan efecto cooperativo entre la subunidades, es decir que si se activa o inhibe una de ellas provoca el
mismo efecto en las demás. Esto permite una regulación más rápida, con menos cantidad de activadores o
inhibidores.

• .En las enzimas alostéricas la cinética de las reacciones es diferente a la de las demás enzimas, la gráfica de la
velocidad frente al sustrato es una curva sigmoidea en lugar de hiperbólica como ocurre en las demás
enzimas.

• .Desempeñan un papel muy importante en la regulación de las reacciones metabólicas, suelen actuar en
puntos estratégicos de ellas como son: la primera reacción de la ruta o los puntos de ramificación .

• . El sustrato de la primera reacción actúa como activador alostérico, al unirse con el enzima produce el
cambio que da lugar a la conformación activa.

• El producto final de la ruta metabólica puede actuar como inhibidor alostérico, produciendo la aparición de
la conformación inactiva. Este proceso se denomina retroinhibición. Esto supone un ahorro energético para
el organismo, ya que el exceso de producto final inhibe su propia síntesis en una etapa temprana de la
misma.
La gráfica representa la modificación de la actividad de una enzima alostèrica.

• La presencia de ATP desplaza la curva hacia la derecha y por tanto actúa como un inhibidor.

. La concentración de ADP desplaza la curva hacia la izquierda, actuando como un activador.

7. NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS


- Algunas conservan el nombre inicial, como las digestivas pepsina, tripsina..ptialina etc.
-A muchas se las nombra con el nombre del sustrato acabado en asa. Ej. Maltasa, sacarasa etc.

-La denominación correcta consiste en :

. Se nombra el sustrato sobre el que actúa.


. A continuación el nombre de la coenzima, si la hay.
. La función que realiza acabado en asa.
Lactato nicotidín deshidrogenasa.

Generalmente el nombre del coenzima no se escribe, quedaría como: Lactato deshidrogenasa.

CLASIFICACIÓN

Se las clasifica en 6 grupos según el tipo reacción que catalizan. A cada uno de estos grupos se les designa con el
nombre de la reacción acabado en asa.

Clase I Oxidorreductasas: Catalizan reacciones de oxido-reducción o redox.


Normalmente las reacciones de oxidación van siempre acopladas a las de reducción, pues cuando un compuesto se
oxida otro se reduce.

Clase II Transferasas: Catalizan reacciones en las que se transfieren grupos funcionales de un compuesto a otro.

Clase III Hidrolasas: Catalizan reacciones de hidrólisis, es decir la ruptura de enlaces con la intervención del agua. A
este grupo pertenecen las enzimas digestivas.

Clase IV Liasas: Catalizan la adición y separación de grupos funcionales, mediante la eliminación o la formación de
dobles enlaces.

Isomerasas: Catalizan reacciones de isomerización, que producen reordenaciones de los átomos dentro de la
molécula
Clase VI Ligasas o sintetasas: Catalizan la unión de dos moléculas para sintetizar una mayor. Obtienen la energía
necesaria para crear el enlace de la hidrólisis del ATP.

8. COENZIMAS Y VITAMINAS
• Los coenzimas son compuestos orgánicos que se unen mediante enlaces débiles y de forma temporal al
apoenzima (inactivo) y forman el holoenzima ( activo).

Los coenzimas son portadores de diferentes grupos químicos, actuando en las reacciones enzimáticas como dadores
o receptores de dichos grupos.
Se alteran durante la reacción enzimática, pero, una vez acabada se regeneran de nuevo volviendo a ser funcionales.
Los coenzimas no suelen ser específicos de un solo tipo de apoenzima.
Algunos coenzimas son nucleótidos o derivados de nucleótidos, y pueden tener en su composición vitaminas.

TIPOS DE COENZIMAS

Aunque existen muchos tipos de coenzimas los 2 grupos más importantes son:

• COENZIMAS QUE INTERVIENEN EN LAS REACCIONES DE OXIDORREDUCCIÓN.

Actúan transfiriendo H+ y e- de unos sustratos a otros. Aquí se incluyen:

Piridín-nucleótidos: NAD , NADP.

Flavin-nucleótidos: FAD, FMN

. COENZIMAS QUE INTERVIENEN EN REACCIONES DE TRANSFERENCIA DE GRUPOS QUÍMICOS.

Los más importantes son:

• Nucleótidos trifosfatos. El más importante de todos es el adenosín trifosfato (ATP) hay otros como
CTP, UTP, etc.
Estos coenzimas transfieren grupos fosfato, además son importantes por la gran cantidad de energía que
acumulan en los enlaces que unen a las moléculas de fosfórico, esta energía se libera cuando estos enlaces
se rompen.

Coenzima A (CoA-SH). Interviene en la transferencia de grupos acetil de unos sustratos a otros.

VITAMINAS.

- Son compuestos orgánicos de composición variada, que son indispensables en cantidades muy pequeñas (mg
diarios) para el correcto funcionamiento del organismo.

- Son sintetizadas por vegetales y microorganismos pero no por los animales salvo algunas excepciones, por ello
tenemos que tomarlas obligatoriamente en la dieta bien como tales vitaminas o en forma de provitaminas
(sustancias precursoras que en el organismo se transforman en vitaminas).

- Se destruyen fácilmente por el calor, la luz, las variaciones de pH, el almacenamiento prolongado, etc.

- Algunas actúan como coenzimas o forman parte de ellas, y otras intervienen en funciones especializadas.
Tanto su déficit como su exceso originan trastornos metabólicos más o menos graves para el organismo. Estas
alteraciones pueden ser de tres tipos:

·Avitaminosis: Se produce por la ausencia total de una vitamina.

·Hipovitaminosis: Se origina por el déficit de alguna vitamina.

Estas dos alteraciones dan lugar a las llamadas enfermedades carenciales, que pueden resultar mortales.

·Hipervitaminosis: Se produce cuando hay exceso de alguna vitamina, en el caso de las vitaminas liposolubles puede
resultar tóxico por su dificultad para ser eliminadas.

CLASIFICACIÓN

• Antes se las nombraba mediante letras mayúsculas A, B, C… y también por la enfermedad que origina su
deficiencia. Ejemplo: Antiescorbútica o vitamina C.

• Hoy, aunque todavía se utilizan estos nombres, se las designa por el nombre del compuesto químico que las
constituye. Ejemplo ácido ascórbico

Atendiendo a su solubilidad se las divide en dos grupos:

• VITAMINAS LIPOSOLUBLES: Son de carácter lipídico y por lo tanto no son solubles en agua y sí lo son en
disolventes orgánicos. Si se toman en exceso pueden resultar tóxicas, puesto que al no disolverse en agua no
se eliminan por la orina. Generalmente no actúan como coenzimas.

Aquí se incluyen: el retinol (A), el calciferol (D), la filoquinona (K) y el tocoferol (E).

• VITAMINAS HIDROSOLUBLES: Son de naturaleza polar y por lo tanto solubles en agua, su exceso no resulta
tóxico ya que se eliminan por la orina.

Actúan generalmente como coenzimas o forman parte de ellos. Aquí se incluyen: el ácido ascórbico (C ) y
el complejo vitamínico B que comprende varias: la tiamina (B1), la riboflavina (B2), la niacina (B3), el ácido
pantoténico (B5), la piridoxina(B6), la biotina (B8), el ácido fólico (B9) y la cianocobalamina (B12).

FUNCIONES

Vit. B

Atúan en muchas vías metabólicas y en la formación de los glóbulos [Link] déficit causa anemia, degeneración
neuronal, debilidad muscular...
Vit.C

Interviene en la síntesis de colágeno, actúa como cofactor en algunas reacciones de hidroxilació[Link] déficit provoca
escorbuto, con hemorragias en encías y caida de dientes

Vit.A

Protege los epitelios, es necesaria para le percepción visual,porque en su función como grupo prostético regenera la
rodopsina, implicada en dicho proceso.
Vit.D

Regula absorción de Ca , eldéficit genera osteomalacia, [Link] exceso genera calcificaciones en riñón,
hígado..Para su síntesis a partir de la provitamina, es necesaria la insolación.

Vit.E

Antioxidante, impide que el oxígeno destruya los dobles enlaces de los ácidos grasos insaturados

Vit.K

Actúa sobre protrombina, molédula precursora de la trombina, que a su vez cataliza el paso del fibrinógeno a fibrina
en el proceso de coagulación sanguínea.

REGULACIÓN DE VÍAS METABÓLICAS

La necesidad de los productos en la célula es variable,por lo tanto tiene que regular la actividad de sus encimas.

1. Control de la síntesis , o sea de la expresión de los genes.

2. Regular la actividad de los encimas.

a. Síntesis en formas inactivas(proencimas)

b. b. Regulación alostérica

- Retroinhibición o feed back: el producto final actúa como inhibidor, uniendose al centro regulador.

- Inducción encimática:el sustrato inicial se fija al centro regulador y activa al encima.

DISPOSICIÓN DE LOS ENCIMAS EN LA CÉLULA PARA AUMENTAR EFECTIVIDAD.

Compartimentación celular

Los lugares donde se realizan vías metabólicas que no deben interferir están separados por membranas(
sítesis de a. grasos en citosol y degradación en mitocondrias.

Complejos multiencimáticos

Asociación de varios encimas que actúan sucesivamnete en una vía metabólica. El producto de uno es el
sustrato del siguiente encima. (Piruvato deshidrogenasa para pasar de pirúvico a Acetil CoA)
Inclusión en las membranas

Algunos complejos están englobados de forma ordenada en las membranas. Complejos multiencimáticos del
transporte electrónico en la cadena respiratoria, se encuentran en las crestas mitocomdrales

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