Departamento de Ingeniería Bioquímica
Biocatálisis
Unidad 1: Generalidades
Nelson Caicedo, Ph. D.
Carlos Alvarez-Vasco, Ph.D.
Universidad Icesi, Cali-CO. Enero 28, 2019
Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
Guía del día.
Unidad 1: Generalidades en Biocatálisis.
Unidad 1: Nomenclatura de las Enzimas.
Cierre: Unidad 1.
Verificación de objetivos Unidad 1.
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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
Que es la Biocatálisis?
La velocidad de reacción aumenta en un factor 106-1012
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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
Que es la Biocatálisis?
La velocidad de reacción aumenta en un factor 106-1012
Como logra bajar la barrera (Ea):
• Los reactivos son posicionados muy
cerca el uno del otro, y en una
orientación que facilita la reacción.
• Cambian el ambiente local.
• Participando directamente en la
reacción (temporalmente).
−
k
R=cte gases, T= temp (K), Ea= Energía de activación 4
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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
Ejercicio de practica 1.
La velocidad de reacción aumenta en un factor 106-1012
−
k
R=cte gases, T= temp (K),
Ea= Energía de activación
Actividad: One minute paper
1. Formar parejas (la que este en la fila del frente)
2. Discutir por 1 min que pasa con la velocidad de reacción cuando:
a) Disminuye la Ea, b) Aumenta la temperatura.
3. El profesor seleccionará aleatoriamente a una pareja para que explique los eventos a y b.
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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
Ejercicio de practica 1.
−
k
R=cte gases, T= temp (K),
Ea= Energía de activación
Actividad: One minute paper
1. Formar parejas (la que te mire primero)
2. Discutir por 5 min el ejercicio de practica 1, pensando en la estrategia de solución:
a) Antes de empezar: Unidades?, b) Estrategia, c) Suposiciones?
3. El profesor seleccionará aleatoriamente por tiempos una pareja para que explique los
eventos a, b y c.
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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
Ejercicio de practica 2.
−
k
R=cte gases, T= temp (K),
Ea= Energía de activación
Actividad: Consultar los ejercicios de
practica de la unidad 1 en Moodle.
Primero: Intente solucionarlos por usted mismo, sin ver la solución.
Segundo: Compare su solución, con la solución propuesta por el profesor.
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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
Ejemplos de procesos?
Catalizados por enzimas
Porque es importante eliminar el Oxigeno de los alimentos?
Glucosa Oxidasa
β-D-Glucosa + O2 → D-Glucono-lactona + H2O2
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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
Ejemplos de procesos?
Catalizados por complejos enzimáticos
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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
Catalizados por complejos enzimáticos
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CAAV2
Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
Ejemplos de procesos?
Catalizados por células completas
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Diapositiva 11
CAAV2 A que se deben las cicatrices en la superficies de las celulas de levadura?
Carlos Andres Alvarez Vasco; 6/08/2018
Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
Ejemplos de procesos?
Catalizados por células completas
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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
Generalidades
Son las enzimas estructuras rígidas?
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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
Generalidades
Son las enzimas estructuras rígidas?
Las enzimas son estructuras
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dinámicas 14
(se adaptan)
CAAV5
CAAV6
Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
CAAV7
CAAV8
Clasificación de acuerdo al numero de fases
Biocatálisis
Homogénea
S, P y
biocatalizador
están disueltos en
una sola fase.
Biocatálisis Heterogénea
P
S P S,
S, P
Biocatalizador
S P 15
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Diapositiva 15
CAAV5 Biocatalisis Heterogenea
Carlos Andres Alvarez Vasco; 6/08/2018
CAAV6 1. El biocatalizador esta en la fase solida, el sustrato y el producto en la fase liquida.
Carlos Andres Alvarez Vasco; 6/08/2018
CAAV7 2. El biocatalizador en una fase liquida (hidrofilica, acuosa), el sustrato y el producto en las dos fases (equilibrio o separados por
membrana)
Carlos Andres Alvarez Vasco; 6/08/2018
CAAV8 3. El Sustrato y biocatalizador en una fase (acuosa), y el producto en otra fase (Hidrofobica)
Carlos Andres Alvarez Vasco; 6/08/2018
Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura
Nomenclatura
A los inicios no se contaba con una guía sistemática para la asignación de nombres a las
enzimas.
Era posible que dos diferentes enzimas tuviesen el mismo nombre.
Ejemplo: catalasa, enzima de pH 5.
A partir de 1950, la International Union of Biochemestry and Molecular Biology
(IUBMB) estableció la comisión de enzimas.
Está en actualización permanente y puede ser consultada on-line.
La nomenclatura sugiere dos nombres para cada enzima:
1. Nombre común o recomendado.
2. Nombre sistemático.
Ambos están basados en la naturaleza de la reacción catalizada 16
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Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura
Nomenclatura
La comisión de enzimas (EC) desarrollo un sistema de identificación
numérico basado en algunos criterios. Normalmente se recomienda
referenciar los dos nombres para especificar a una enzima.
Numero EC consta de cuatro (4) dígitos.
EC (i).(ii).(iii).(iv)
(i) Hace referencia al tipo de reacción catalizada y esta asociado a las 7
clases.
(ii) Sub clase. Indica el tipo de sustrato, el tipo de grupo funcional
transferido o la naturaleza de un enlace especifico involucrado en la
reacción catalítica.
(iii) Sub clase. Da cuenta de la naturaleza del sustrato o del co-sustrato.
(iv) Numero arbitrario
[Link] 17
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Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura
Nomenclatura
Clase Nombre Tipo de reacción Information adicional CAAV3
CAAV4
1 Oxidoreductasa Transferencia de electrones, Son estrictamente intracelulares. Están
hidrogeno o átomos de oxigeno involucradas en las rutas centrales del
metabolismo y requieren de coenzimas.
2 Transferasas Catalizan la transferencia de un Juegan un rol importante en el
grupo funcional de un donor a un metabolismo celular. Tag DNA polimerasa.
aceptor.
3 Hidrolasas Catalizan las reacciones de Son relevantes para el catabolismo. Muchas
hidrolisis. Rompimiento de un no requieren coenzimas, muchas son
enlace por acción del agua. extracelulares y robustas.
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Diapositiva 18
CAAV3 Oxidoreductasas: Porque requieren de coenzimas?
Carlos Andres Alvarez Vasco; 6/08/2018
CAAV4 Porque las especies reactivas d eoxigeno son altamente reactivas y podrian dañar la estructura proteica si los aminoacidos participaran.
Carlos Andres Alvarez Vasco; 6/08/2018
Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura
Nomenclatura
Clase Nombre Tipo de reacción Information adicional
4 Liasas Catalizan reacciones de rompimiento Muchas son intracelulares y algunas no
de enlaces por vías distintas de la requieren de coenzimas. Nitrilo
hidrolisis y de oxido reducción. hidratasa.
Adición grupos a dobles enlaces o
formación de estos.
5 Isomerasas Convierten un sustrato en su isomero Muchas son intracelulares y requieren
de cofactor mas no de coenzimas.
Glucosa isomerasa.
6 Ligasas Catalizan las reacciones de unión Son las responsables del anabolismo.
covalente de dos moléculas. Estrictamente intracelular y con
Requieren ATP, u otra fuente de requerimiento de coenzimas. T4 DNA
energía. ligasa.
7 Translocasa Catalyse the movement of ions Several of these involve the
(2018/10) or molecules across membranes hydrolysis of ATP and had been
or their separation within previously classified as ATPases
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membranes (EC 3.6.3.-), although the
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hydrolytic reaction is not their
primary function.
Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura
Nomenclatura: Ejemplos
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Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura
Nomenclatura: Ejemplos
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Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura
Nomenclatura
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Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura
Observaciones Nomenclatura
La fuente biológica de la enzima no está incluido en el sistema de nomenclatura.
Cuando se reporta una enzima es importante mencionar este origen.
Por ejemplo: la enzima empleada para catalizar la reacción química para
producir “Acrilamida” debería ser descrita así:
Nitrilo hidratasa (EC [Link]) extraída de Rhodococcus rhodochorous.
Nombres comerciales de algunas enzimas dificulta la selección de un
biocatalizador.
Novozyme 435TM (Novozymes).
Lipasa B C. antartica.
Triacilglicerol lipasa. (EC [Link])
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Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura
Nomenclatura Ejercicios
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Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura
Nomenclatura Ejercicios
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Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura
Resumen Unidad 1
Objetivos específicos
Comprender la importancia de las reacciones catalizadas por células, enzimas o
complejos enzimáticos.
Usar la terminología y comprender las variables y constantes de las ecuaciones que
se usan para describir reacciones catalizadas por enzimas.
Clasificar las enzimas de acuerdo a las reacciones que ellas catalizan.
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