BIOLOGIA ESTRUCTURAL // QUIMICA COMPUTACIONAL
Además de los métodos informáticos de detección de compuestos que se utilizan para
encontrar y desarrolla candidatos a fármacos adecuados, la química computacional solo
se puede utilizar si se conoce la estructura molecular tridimensional exacta de la proteína
en estudio.
Los biólogos estructurales determinan las propiedades moleculares, investigan la posición
de los receptores a los que se pueden unir los componentes activos y la interacción entre
estos receptores de proteínas y el principio activo. Para este propósito utilizan el análisis
de rayos x estructural que solo se puede realizar en proteínas diana cristalizadas. Sin
embargo el proceso de cristalización generalmente no tienen éxito con todas las
proteínas, la estructura reticular de la proteína cristalizada difracta el has de rayos x de
una manera característica. Los biólogos estructurales pueden leer la densidad electrónica
y por lo tanto la posición del átomo, a partir del patrón de difracción. De esta forma
pueden sacar conclusiones sobre la estructura molecular tridimensional.
La química computacional usa esta información para encontrar otras sustancias que se
ajustan a los receptores de unión de las proteínas objeto, para hacer esto utilizan
procesos de detección computarizados para buscar en bibliotecas de compuestos
virtuales, de esta manera puede identificar moléculas que aún no se han sintetizado y
otras que ya lo estén. La etapa posterior de optimización de plano también se beneficia de
la química computacional.
Además de tener el efecto deseado, una sustancia debe cumplir otros criterios, Si es
posible debe unirse solo al receptor que se desea acoplar y no a otras moléculas en el
cuerpo para así minimizar los efectos adversos, no debe descomponerse antes de que
tenga la oportunidad de tener o realizar su efecto, y debe ser soluble en agua para
ingresar al organismo.
Por lo tanto, los cálculos computacionales se pueden usar no solo para predecir que
modificaciones moleculares de una sustancia pueden mejorar su capacidad de unirse al
(organismo) objeto, sino también a propiedades biofísicas o toxicas que podrían estar
asociadas con una transformación estructural.
Esto permite al químico sintético hacer su trabajo en el laboratorio de una manera más
específica. Sin embargo la flexibilidad natural de la estructura de las proteínas dificulta
que las predicciones se han confiables. En última instancia lo que cuenta siempre es el
experimento realizado.
Los compuestos identificados hasta ahora no tienen n todas las propiedades necesarias
de un principio activo. En esta etapa, podrían compararse con los bloques clave que se
pueden insertar en la cerradura pero no girar. La química medicinal les da el acabado que
necesitan.
ANALISIS
El diseño de fármacos asistido por computadora consiste en aplicar algún procedimiento
Realizado por una computadora para relacionar la actividad de un compuesto con su
estructura química. Los objetivos principales de la química computacional y biología
estructural son descubrir moléculas activas, optimizar moléculas activas ya conocidas y
seleccionar, de un grupo dado de estructuras, a los candidatos que tengan mayor o menor
probabilidad de convertirse en fármacos exitosos. De esta manera, el uso de la
computadora puede ayudar a descubrir y diseñar estructuras químicas que tengan las
propiedades adecuadas para entrar en el proceso de desarrollo de un fármaco, utilizando
los resultados de la química teórica, incorporados en algún software para calcular las
estructuras y las propiedades de moléculas y cuerpos sólidos. Mientras sus resultados
normalmente complementan la información obtenida en experimentos químicos, pueden,
en algunos casos, predecir fenómenos químicos no observados a la fecha.
La Biología Molecular tiene como objetivo el estudio de los procesos que se desarrollan
en los seres vivos desde un punto de vista molecular, al estudiar el comportamiento
biológico de las moléculas que componen las células vivas, la Biología molecular roza
otras ciencias que abordan temas similares como la síntesis de moléculas con objetivos
farmacológicos ya que ayuda al estudio de la interacción que estos fármacos pueda tener
en el organismo causando los efectos beneficiosos o efectos adversos que se presenten
cuando estas moléculas se acoplen a receptores del organismo, evitando la mayor
cantidad de errores en la síntesis de nuevos compuestos.
CONCLUSIONES
Los cálculos computacionales se pueden usar no solo para predecir que
modificaciones moleculares de una sustancia pueden mejorar su capacidad
de unirse al (organismo) objeto, sino también a propiedades biofísicas o
toxicas que podrían estar asociadas con una transformación estructural.
La biología estructural determina las propiedades moleculares e investiga la
posición de los receptores a los que se pueden unir los componentes
activos y la interacción entre estos receptores de proteínas con el principio
activo.
la flexibilidad natural de la estructura de las proteínas dificulta que las
predicciones se han confiables. En última instancia lo que cuenta siempre
es el experimento realizado.
Además de tener el efecto deseado, una sustancia debe cumplir otros
criterios, Si es posible debe unirse solo al receptor que se desea acoplar y
no a otras moléculas en el cuerpo para así minimizar los efectos adversos,
no debe descomponerse antes de que tenga la oportunidad de tener o
realizar su efecto, y debe ser soluble en agua para ingresar al organismo.
La química computacional solo se puede utilizar si se conoce la estructura
molecular tridimensional exacta de la proteína en estudio.
QUIMICA MEDICINAL
Para crear moléculas con tales propiedades los químicos varían las cantidades principales
agrupando o eliminando varios grupos químicos que modifican la estructura molecular.
Crean cientos o incluso miles de variaciones diferentes utilizando procesos automatizados
luego se seleccionan para filtrar los candidatos que tienen más propiedades de cumplir
con los requisitos. Este proceso está respaldado por simulaciones por computador
proporcionado por los colegas de química computacional. Estos compuestos se someten
a pruebas biológicas. Esto le da a los químicos medicinales a ideas para nuevos pasos de
optimización.
El proceso de optimización alterno y prueba química usualmente toma varios años. Los
investigadores a menudo realizan cientos de modificaciones a compuestos en su
desarrollo (investigación). La experiencia de los químicos medicinales es muy importante
en este trabajo. Cuando mejoran una propiedad deseada de una molécula, esto a veces
empeora otras. Cuando los científicos están finalmente convencidos de que han
encontrado un compuesto que exhibe las propiedades deseadas, solicitan una patente. El
desarrollo preclínico ahora puede comenzar.
ANALISIS
La química medicinal también es conocida como química farmacéutica, sus raíces están
centradas en la química y la farmacología, su principal objeto de estudio es la síntesis, el
desarrollo y el diseño de moléculas con acciones biológicas y medicamentos con fines
terapéuticos. Su labor también radica en desarrollar nuevos compuestos químicos que
sean apropiados para el uso curativo.
También se enfoca en el descubrimiento de nuevos compuestos químicos que puedan ser
utilizados como medicamentos. En otras palabras tiene como objetivo el estudio químico
de los fármacos, tratando de elucidar la relación existente entre su estructura, sus
propiedades químicas y su respuesta biológica, con el fin último de proporcionar los
conocimientos necesarios para la creación de nuevos fármacos. Es decir, que el objetivo
de la química medicinal es de investigar cómo funcionan los fármacos, como se diseñan,
cómo se planean estructuralmente y cómo se hacen estos fármacos
Esta rama de la ciencia ha tenido un importante desarrollo a lo que se refiere a prototipos
moleculares.
El principal objetivo de un químico medicinal es conocer las características físico-químicas
de las sustancias utilizadas para la fabricación de los medicamentos, seleccionando las
técnicas y procedimientos apropiados en el diseño, aplicación y evaluación de reactivos,
métodos y técnicas analíticas.
CONCLUSIONES:
Su objeto de estudio también radica en las interacciones cuantitativas entre las
moléculas y sus efectos biológicos.
Esta rama tiene gran importancia para la sociedad porque gracias a sus
investigaciones y trabajos innovadores se pueden realizar aportes en el área de la
medicina, lo cual es muy provechoso para los pacientes que padezcan alguna
enfermedad.
Para crear moléculas con propiedades farmacológicas, los químicos varían las
cualidades principales agrupando o eliminando varios grupos químicos que
modifican la estructura molecular.
El proceso de optimización alterno y prueba química de un fármaco usualmente
toma varios años ya que los investigadores a menudo realizan cientos de
modificaciones a compuestos en las investigaciones que realizan.
Muchas veces Cuando los químicos mejoran una propiedad deseada de una
molécula, esto a veces empeora otras.
Cuando los científicos están finalmente convencidos de que han encontrado un
compuesto que tiene las propiedades deseadas, solicitan una patente. El
desarrollo preclínico ahora puede comenzar.
