Un ramo de estructuras de ADN: diversidad emergente.
resumen
El polimorfismo estructural del ADN ha evolucionado constantemente desde el momento de la
ilustración del modelo de ADN de doble hélice de Watson y Crick. Una variedad de estructuras de
ADN no canónicas se han documentado constantemente en todo el mundo. El ADN atrajo la
atención mundial como portador de información genética. Además del dúplex clásico de Watson-
Crick, el ADN puede adoptar diversas estructuras durante su participación activa en procesos
celulares como la replicación, la transcripción, la recombinación y la reparación. Estructuras como
horquilla, cruciforme, triplex, G-triplex, cuadruplex, i-motivo y otras estructuras de ADN no
canónicas alternativas se han estudiado en detalle y también han demostrado su presencia in vivo.
Esta revisión se centra principalmente en las estructuras no canónicas adoptadas por los
oligonucleótidos de ADN que tienen ciertos requisitos previos para su formación en términos de
secuencia, su longitud, número y orientación de las cadenas junto con diversas condiciones de
solución. Este polimorfismo conformacional del ADN podría ser la base de diferentes propiedades
funcionales de un conjunto específico de secuencias de ADN, brindando además algunos
conocimientos sobre diversos fenómenos biológicos extremadamente complicados. Muchas de
estas estructuras ya han demostrado sus vínculos con enfermedades como el cáncer y los
trastornos genéticos, lo que las convierte en un objetivo extremadamente llamativo para el diseño
de fármacos de estructura específica y aplicaciones terapéuticas.
1. Introducción
En las células eucariotas, el ácido nucleico de la desoxirribosa (ADN) está presente en su forma
superenrollada que se estabiliza por proteínas auxiliares. Sin embargo, durante los procesos
biológicos, como la replicación y la transcripción, el ADN se desenrolla y puede formar estructuras
que difieren de la forma de ADN de Watson-Crick. Este fenómeno biológico de adoptar diversas
conformaciones por esta maravillosa biomolécula se conoce como polimorfismo estructural y
depende de varios factores como la secuencia de oligonucleótidos, el estado de la solución, la
hidratación, los iones, las proteínas, los ligandos y el estrés superhelical. La forma B de doble
hélice del ADN, propuesta por Watson y Crick, generalmente representa la mayor parte del
comportamiento del ADN en la célula [1]. Las conformaciones de ADN ampliamente estudiadas
son formas A, B y Z, mientras que las estructuras de ADN como abultamiento, horquilla,
cruciforme, ADN de hebra paralela, triplex, cuadruplex e i-motif también están bien
documentadas. Estas estructuras de ADN alternativas podrían no solo ser importantes para las
interacciones con proteínas involucradas en la replicación, la expresión de genes y la
recombinación, sino que también tendrían un impacto en el daño del ADN, la reparación y la
estabilidad genética [2]. También desempeñan diferentes roles en la formación de nucleosomas y
otras estructuras supramoleculares que involucran el ADN.
Con la excepción de la forma A, que generalmente es adoptada por los dúplex de ARN y es capaz
de acomodar cualquier secuencia, todas las estructuras de ADN conocidas son dependientes de la
secuencia. El requisito de secuencia para Z-DNA es una secuencia alterna de purina-pirimidina /
GCrich y tales secuencias formadoras de Z-DNA han demostrado su presencia cerca de puntos de
ruptura cromosómicos que involucran a los genes cMYC y BCL-2 [4]. Se ha demostrado que las
secuencias de ADN que contienen (CGG) n repeticiones forman Z-ADN en concentraciones altas de
sal y milimolar de iones Ni2þ [5]. Además, su estabilidad se puede mejorar con la metilación de las
repeticiones CGG. Las propiedades conformacionales de las secuencias de ADN que contienen
repeticiones (CCA) n y (TGG) n fueron informadas por Zemánek et al. mediante espectroscopia de
CD, electroforesis en gel de poliacrilamida y espectroscopia de absorción UV. Este estudio reveló
que las repeticiones (CCA) n se asocian para formar una estructura de i-motif a pH ácido, mientras
que existía como una sola hebra a pH alcalino o neutro. Las secuencias de ADN que contienen
(TGG) n estiramientos forman homodúplex antiparalelo o estructura de horquilla a bajas
concentraciones de sal, mientras que estas secuencias adoptan la estructura del cuadrúplex G en
presencia de iones de potasio a pH fisiológico [6]. Las secuencias de ADN repetidas invertidas son
capaces de formar estructuras cruciformes, mientras que las formaciones de G-quadruplex e i-
motif requieren un tramo contiguo de guaninas y citosinas, respectivamente [7, 8]. Algunos de los
requisitos de secuencia para la formación de diversas estructuras de ADN no canónicas se
resumen en la Tabla 1. La mayoría de estas estructuras de ADN no canónicas ya han demostrado
su existencia in vivo, lo que las hace biológicamente muy significativas. Algunas de estas
fascinantes estructuras de ADN (Fig. 1) se discuten en las siguientes secciones.
2) ADN cruciforme.
El superenrollamiento de ADN y las secuencias de bases son los dos factores primos que son
responsables de la complejidad estructural de la molécula de ADN. Se forma una estructura
cruciforme cuando el emparejamiento de bases entre cadenas en el ADN dúplex con repeticiones
invertidas se convierte en un emparejamiento de bases intrastrand. Está bien documentado que
un requisito esencial para la formación de ADN cruciforme es una secuencia de ADN repetida
invertida que debe integrarse en una región rica en AþT [9]. Es de gran importancia en muchos
procesos biológicos, incluido el posicionamiento, replicación y regulación de la expresión génica de
los nucleosomas. Se proponen dos mecanismos para la formación de una estructura cruciforme
que difiere en la concentración de sal, la energía de activación y la temperatura [10]. La estabilidad
termodinámica del cruciforme es muy inferior en comparación con el ADN-B normal y mostró una
movilidad altamente retardada en el gel de poliacrilamida. Hasta ahora se han encontrado dos
clases de cruciformes, una con simetría cuádruple con todos los brazos perpendiculares entre sí y
otra con los brazos en un ángulo agudo. Las estructuras cruciformes son generalmente una
preferencial.
Tabla 1
Resumiendo los requisitos de secuencia para varias estructuras de ADN.
S.No. Referencia de secuencia de estructuras
1. ADN de cadena paralela 5′-CCTATTAAATCC
5′-AAAAAAAAAATAATTTTAAATATTT [51]
[52]
2. Horquilla (CAG) n / (CTG) n [35]
5′-TGGGGA / GCCCCA (horquilla y dúplex) [11,12]
3. Cruciforme 5′-ATGGTCTTACCTA [92]
4. Triplex 5 '- (AAG) 5 (triplex intermolecular) [93]
5′-C2TC5TC2T5G2AG5AG2T5G2AG5AG2 [58]
5. Motivo i 5'-CCCTAACCCTAA (bimolecular) [65,66]
5 '- (CCCTAACCCTAA) 2 (Unimolecular) [66]
6. Quadruplex 5′-AG6AG3AG3TG2 (dimérico paralelo) [73]
5′-GGTTGGTGTGGTTGG (Antiparalelo unimolecular) [94]
5′-TTAGGGTTAGGG (tetramer antiparalelo) [70]
7. Z-DNA 5 '- (CGCGCGCGCGCG) 2 [95]
8. A-DNA 5 '- (GCGGGCCCGC) 2 [96]
para muchas proteínas, como las proteínas HMG, las histonas H1 y H5, y ayuda a atacar muchas
enfermedades [9].
3) ADN de horquilla
Las secuencias de ADN con repeticiones invertidas (IR) o palíndromos conducen a la formación de
una estructura de horquilla, que también podría estar en equilibrio con el ADN dúplex,
dependiendo de las concentraciones de sal u oligómero. Se demostró que un polimorfismo de un
solo nucleótido (SNP) en un oligonucleótido de ADN 11mer (d-TGGGG (A / G) CCCCA) exhibía
equilibrio entre dúplex y horquilla [11,12], mientras que su homólogo de ARN (UGGGG (G / A)
CCCCA) adoptó solamente la estructura de la horquilla [13]. Este polimorfismo de las secuencias
de ADN de la región Locus Control (LCR) del gen de la beta-globina se analizó en nuestro
laboratorio en una revisión [14]. Las horquillas tienen un vástago de base emparejada y un
pequeño bucle de bases no emparejadas, que generalmente se forman a través de dos
mecanismos principales. En el primer mecanismo, la horquilla se forma de la misma manera que la
estructura cruciforme se forma a partir de ADN de doble cadena. En el segundo mecanismo, el
ADN monocatenario (ADNss), producido durante varios procesos celulares como la replicación en
la plantilla para la síntesis de cadenas retrasadas, la reparación del ADN, la replicación del círculo
rodante (RCR) y la infección por algunos virus conduce a la formación de horquillas [15 ]. La
proteína de unión a ADN monocatenario (SSB) facilita la unión de RecA a ssDNA sin especificidad
de secuencia y conduce a la formación de horquilla [16]. Básicamente, la posibilidad de que se
forme una horquilla o cruciforme en el sitio de unión a la proteína puede afectar el estado de
enrollamiento del ADN, lo que puede facilitar o prevenir las interacciones ADN-proteína y alterar la
expresión del gen. Aunque las horquillas que forman largos palíndromos son genéticamente
inestables, se sabe que la estructura de la horquilla desempeña un papel clave en varios procesos
celulares, como la expresión de genes, la recombinación y la transcripción.
Las secuencias de poli (dG) poli (dC) exhiben formas A y B dependiendo de las condiciones de la
solución. Estas secuencias adoptan la forma A del ADN en condiciones de sal más altas (molares),
mientras que a una concentración baja de sal (milimolar), existen en forma B [17]. La transición de
la forma Bto A se puede inducir en presencia de metanol o hexamina, cobalto o espermina, o con
el uso de una alta concentración de oligómeros [18-21]. Sobre la base de la espectroscopia de CD,
la espectroscopia de RMN y la dinámica molecular no restringida, se demostró que d (CCCCGGGG)
exhibía características de ADN tanto de A como de B. Este estudio sugirió que el apilamiento entre
bases es responsable de la forma A, mientras que el marco de la red troncal es responsable de las
firmas de B-DNA [22].
Por el contrario, la secuencia con tractos de guanina y citosina invertidos, es decir, d (GGGGCCCC)
mostró características de forma B y A, que eran los atributos del apilamiento de bases de bases de
citosina y guanina respectivamente [23]. Se ha informado que la geometría de apilamiento de
bases tipo A de las bases de guanina en el B-ADN se reconoce por los factores de transcripción [24]
y, por lo tanto, tales secuencias pueden jugar un papel importante en los procesos celulares como
la transcripción y la replicación [25].
4) Dúplex de burbuja o bulto de ADN
Estas estructuras de ADN se forman en ADN de doble cadena debido a la presencia de nucleótidos
no apareados en una cadena y su determinación de estructura junto con la dinámica ha sido
revisada por Turner [26]. Las protuberancias pueden tener uno o más nucleótidos y se clasifican en
diferentes tipos según su ubicación: en una cadena, en ambas cadenas (bucle interno) o en una
unión. Estas protuberancias pueden parecerse a la burbuja de replicación o transcripción,
afectando así la interacción ADN-proteína durante tales eventos [27]. Además, las protuberancias
de ADN son capaces de liberar la energía de flexión del ADN dúplex altamente doblado, lo que
mejora el proceso de envoltura del ADN alrededor de las histonas y, por lo tanto, actúa como un
elemento fundamental para la condensación del ADN [28].
FIGURA 1
5) ADN deslizado (S-ADN)
El S-ADN está formado por secuencias que contienen tramos de repeticiones directas y participa
en la mutagénesis de cambio de marco durante la replicación. El deslizamiento de varias unidades
de repetición produce una unión de tres vías en forma de una protuberancia o una horquilla que
es termodinámicamente desfavorable, en relación con el ADN dúplex [29]. Agregar o eliminar una
sola base desplaza el marco de lectura, codificando así los aminoácidos diferentes de los presentes
en la proteína de tipo salvaje. Además, el S-ADN involucrado en mutagénesis de repetición de
tripletes ricos en GC (CTG) n (CAG) n, y (CGG) n (CCG) n se han asociado con enfermedades
neurodegenerativas genéticas o sitios frágiles [30,31]. Originalmente, las expansiones se limitaban
a repeticiones de trinucleótidos solamente. Más tarde, se descubrió que las repeticiones
tetramérica (CCTG) n (CAGG) n [32], pentamérica (TGGAA) n (TTCCA) n [33] y dodecamérica
(C4GC4GCG) n (CGCG4CG4) n [34] también están asociadas con una Número de enfermedades
genéticas humanas [35].
6) ADN doblado / curvado
El fenómeno de la flexión de ADN dirigida por secuencia se descubrió hace más de 30 años;
cuando los fragmentos de restricción del cuerpo cinetoplástico de Leishmania tarentolae
parecieron migrar de forma anómala lenta en los geles de poliacrilamida [36]. Un estudio posterior
que comparó la migración electroforética de moléculas de ADN circularmente permutadas de la
misma longitud, con la curva colocada de manera diferente en cada una, localizó el fenómeno en
tramos cortos de 4-6 adeninas, que se repitieron en fase con la repetición helicoidal [37].
La flexión es importante en el empaquetamiento del ADN y en la regulación de diversos procesos
celulares. Una partícula de núcleo de nucleosoma consta de 147 pares de bases de ADN envueltos
alrededor de un octámero de histonas. El fenómeno de la unión preferencial del octámero de
histona en posiciones particulares en una parte larga de ADN se denomina posicionamiento de
nucleosomas. Juega un papel importante en la regulación génica, ya que la unión del nucleosoma
a regiones específicas del ADN impide la unión del factor de transcripción en estos sitios, lo que
influye en la transcripción tanto de forma negativa como positiva [38]. También se cree que la
flexión del ADN facilita el reconocimiento inicial de la base no coincidente para los mecanismos de
reparación en la célula [39].
7) ADN de hebra paralela
Además del dúplex antiparalelo habitual, el ADN también tiene la capacidad de formar dúplex de
cadena paralela (dúplex-ps), que se estabiliza mediante enlaces de hidrógeno de Watson-Crick o
Hoogsteen inversos. Pueden jugar un papel importante en la regulación de la transcripción, los
procesos mutacionales y el plegamiento cromosómico.
Las secuencias ricas en purina (dGdA) n están representadas en exceso en el genoma eucariótico
[40], incluidos los centrómeros, y participan en diversos procesos biológicos. Dichas secuencias
son capaces de formar estructuras peculiares como homodúplex antiparalelo, homodúplex de
hebra paralela (ps-homodúplex), horquilla y tríplex de ADN según las condiciones de la solución
[41,42]. Las secuencias con repeticiones de GA, (GA) n se asocian para adaptar ps-homoduplex en
condiciones fisiológicas [43], mientras que se formó una estructura helicoidal monocatenaria [44-
46] a pH bajo, donde la adenina está protonada. Dicha estructura helicoidal monocatenaria
también se forma en presencia de etanol, donde la adenina no está protonada [47]. Se ha
demostrado que existe una secuencia similar (AG) 20,30 en pshomoduplex que tiene pares AþAþ y
GG [46].
El ADN, el ARN triplex y el cuadruplex también podrían formarse utilizando estiramientos de hebra
paralela como plantilla [48,49]. Se demostró que los ps-duplex son menos estables que los dúplex
antiparalelos [50]. Parvathy et al. demostró que el enlace C * Cþ en ambos lados de una secuencia
que contiene pares de bases A-T complementarios es responsable de la formación de ps-dúplex a
pH ácido, lo que se confirma aún más por RMN [51]. Recientemente, se han introducido
nucleósidos modificados (dG.isoCd) y (dC.isoGd) para estabilizar los dúplex ps que contienen pares
G: C [52].
8) ADN triplex
Los triplex se forman mediante el reconocimiento de dúplex de oligopurineoligopyrimidine por
oligonucleótidos formadores de triplex de cadena simple (TFO) de una manera específica de
secuencia a través de enlaces de hidrógeno Hoogsteen o Hoogsteen inversa. La existencia de
triplex se mostró por primera vez en 1957, por Felsenfeld et al. [53] que inició la idea de que las
hélices dobles que contienen solo purinas en una cadena podrían unirse a un polinucleótido de la
tercera cadena que contiene pirimidinas [54] o purinas [55]. Una función biológica potencial de
triplex se descubrió en 1968, cuando Morgan y Wells informaron que la formación de triplex era
capaz de inhibir la transcripción [54]. La importancia biológica de los triplex no se prestó ninguna
atención durante casi 20 años, hasta que dos grupos de investigación liderados por Peter Dervan
[56] y Claude Hélène [57] en 1987 publicaron simultáneamente que podrían usarse
oligonucleótidos cortos para inducir una escisión del ADN a una Sitio en el ADN a través de la
formación de triplex.
Los triplex pueden formarse a partir de cadenas de ARN o ADN o sus combinaciones, dando lugar a
triplex intramolecular o intermolecular, que puede ocurrir tanto en los motivos de purina como de
pirimidina. La formación del ADN tríplex depende de varios factores como la longitud del
oligonucleótido, la composición de la base, el pH, el catión divalente y la temperatura. En un
informe de nuestro propio laboratorio, se informó sobre la formación de un triplex intramolecular
de purina y triplex que contiene el objetivo del protooncogén c-jun humano [58]. La especificidad
y selectividad de la tercera hebra en el reconocimiento dúplex ha llevado a una variedad de
aplicaciones potenciales de los triplex en biología molecular, diagnóstico y terapéutica [59-61].
También se demostró que los oligonucleótidos que forman hélices triples pueden inhibir la
transcripción de un gen específico [62]. La investigación sobre triplex se ha vuelto muy significativa
después de la detección de triplex dentro de células humanas utilizando psoralenos [63].
9) ADN de i-motivo
La cadena complementaria de secuencias ricas en G crea una estructura muy interesante al hacer
un par de bases C * Cþ, en el que dos cadenas paralelas ricas en citosina que forman el dúplex se
intercalan en orientación antiparalela, lo que resulta en la formación de un “motivo intercalado” o
“i”. ADN del motivo ”[64–66]. Se sabe que estas estructuras están formadas por una, dos o cuatro
hebras que conducen a la formación de estructuras uni, bi y tetramoleculares, que difieren en la
orientación de las hebras, la longitud de la secuencia, el número de pares de bases C * C, etc. [65,
66]. Estas estructuras están estabilizadas por el pH ácido y, por lo tanto, se utilizan de forma
bastante extensa como interruptores de pH para un gran número de aplicaciones de
nanotecnología [67]. Se supone que estos interruptores de pH o motores moleculares tendrán la
capacidad de funcionar como motores de proteínas naturales, que están presentes dentro de las
células. Además, varios ligandos ahora se han diseñado para estabilizar las estructuras i-motif para
que puedan ser exploradas para aplicaciones más biológicas [64].
10) Cuadruplex de guanina
Sobre la base de la disposición cíclica de cuatro guaninas que forman tétradas de G a través del
enlace de hidrógeno de Hoogsteen, en 1962, Gellert et al. Descubrieron una nueva familia de
estructuras de ácido nucleico, que se denominó G-quadruplex [68]. Las secuencias de ADN ricas en
guanina han mostrado su aparición en la región telomérica más ampliamente caracterizada de los
cromosomas eucariotas [69]. La bioinformática se había utilizado ampliamente para investigar la
prevalencia de secuencias ricas en G que forman cuadruplex en los genomas de varios organismos,
especialmente en regiones como el promotor, 5′-UTR y oncogenes.
Los cuadrúplex G son de naturaleza altamente polimórfica y pueden formar estructuras
intramoleculares / intermoleculares y paralelas / antiparalelas. Nuestro laboratorio matriz
también informó un cuadruplex tetramérico antiparalelo formado por la doble repetición (d-
TTAGGGTTAGGG) de la secuencia telomérica humana [70]. La alta estabilidad observada de
cuadruplex se debe a la unión de hidrógeno que se produce dentro de cada cuarteto, el
apilamiento de cuartetos hidrófobos entre sí y la coordinación de contraiones monovalentes (Naþ,
Kþ). Los cuadrúplex G se pueden clasificar en términos de estequiometría (uni, bi y
tetramolecular), orientación (paralela, antiparalelo y mixta), formas (silla o canasta) y bucles
(lateral, hélice, diagonal, en forma de V). ) [71]. Algunas estructuras avanzadas como (3þ1) G-
quadruplex, G-triplex y G-quadruplex con protuberancias también han sido bien documentadas
[8].
Hasta hace poco, los informes se habían limitado a cuadruplexes G uni, bi o tetramoleculares [72],
pero ahora se había informado un cuádruple dímero interesante formado por el minisatélite CEB1
humano, que tenía dos subunidades apiladas que incluían un acuerdo de snapback paralelo. Este
andamio se compone de tres bucles de inversión de doble cadena, un bucle en forma de V y tres
capas de cuarteto G. Estas dos subunidades se apilan enfrentando sus extremos 5 'entre sí dando
lugar a múltiples rotámeros de apilamiento [73]. Hasta el momento, solo se han estudiado los
cuadrúplex para diestros, pero recientemente, también se ha informado de un cuadrúplex en G
zurdo [74]. Los estudios de RMN y rayos X de una secuencia rica en G de AGRO100 mostraron
actividad antiproliferativa contra las células cancerosas y se demostró que adoptan un motivo
cuádruple de hebra paralela. Los espectros de CD mostraron un perfil invertido del de la topología
para diestros, lo que confirma su conformación para zurdos [74]. Varias estructuras intrigantes
amplían el repertorio de G-quadruplex para una mejor comprensión de esta estructura altamente
polimórfica [75,76].
11) Aplicaciones biológicas de estructuras de ADN alternativas.
En las últimas décadas, se le ha otorgado al ADN el estado de "Libro de la vida" con el conjunto
completo de instrucciones para descifrarlo. A medida que los investigadores descubrieron el velo
sobre la existencia de una riqueza de estructuras de ADN inusuales, se desconcertaron sobre su
relevancia biológica y las consideraron como estructuras transitorias. Los científicos han
caracterizado casi más de una docena de estructuras de ADN no canónicas, entre las cuales son
más comunes las estructuras cuadruplex, triplex, cruciforme y con deslizamiento [77]. Sin
embargo, muchos investigadores abogan por que estas estructuras representen puntos calientes
para mutaciones, como deleciones o expansiones, y también participen en diversos procesos
biológicos gobernados por la interacción de proteínas como la recombinación, reparación,
replicación y translocación, etc. [78,79]. Las aplicaciones biológicas de varias estructuras de ADN
alternativas se resumen e ilustran sistemáticamente en la Fig. 2.
Las formas estructuradas de ADN, con emparejamiento intrasimétrico con secuencias repetidas
invertidas forman una horquilla o cruciforme y su estabilidad termodinámica proviene de la
relajación del superenrollamiento negativo y, por lo tanto, afecta el grado de superenrollamiento
del ADN y el posicionamiento de los nucleosomas en vivo. Hay tres formas en que tales sistemas
de tallo-lazo pueden interactuar con las proteínas y afectar la fisiología celular: (i) la formación de
cruciformes modifica el estado de enrollamiento del ADN, que se sabe que afecta la unión de las
proteínas reguladoras; (ii) la interacción ADN-proteína puede inhibirse, si una horquilla se
superpone a un sitio de reconocimiento de proteínas; [80] y (iii) las proteínas pueden reconocer
directamente y unirse a las horquillas de ADN (Fig. 3a) [9,15,30].
Del mismo modo, las secuencias de formación de triplex están ubicadas predominantemente en
regiones no codificantes y pueden desempeñar un papel importante en la regulación,
recombinación y evolución [81]. Los triplexos de ADN intramolecular pueden existir in vivo y
pueden actuar como interruptores moleculares para modular la expresión de genes y otros
eventos del metabolismo del ADN de una manera dependiente de la estructura, además de la
regulación específica de la secuencia bien establecida [82]. Moser y Dervan demostraron una
división específica del ADN plasmídico con un oligonucleótido corto conjugado con EDTA-Fe y
sugirieron su uso potencial en el mapeo de cromosomas [56]. El efecto de los compuestos
farmacéuticos en los triplexes [83,84] y las terapias de transcripción dirigida podrían extender sus
aplicaciones en el futuro.
Es bien sabido que las estructuras del cuarteto G juegan un papel crucial en diversos procesos
celulares, como en el mantenimiento de los extremos cromosómicos, la transcripción, la
traducción, etc. [72], junto con su amplia aplicación en nanotecnología debido a su auto-
ensamblaje, formación y estabilidad [85– 87]. El papel de la estructura de G-quadruplex en
enfermedades neurodegenerativas y transcriptomas no codificantes también se ha informado
recientemente [88].
Una ilustración que muestra la formación de cuadrúplex G en los telómeros cromosómicos sugiere
su clara relevancia biológica durante la formación del huso en la división celular de los eucariotas
(Fig. 3b). Recientemente, la formación de cuadrúplex G se ha visualizado en el sistema de vida de
los mamíferos [89] y en la región promotora del oncogén utilizando una estrategia de reticulación
[90]. Se ha encontrado que un aptámero formador de cuadrúplex con una capacidad de unirse a
ciertas proteínas celulares inhibe la proliferación en diversas células cancerosas. También se ha
informado de que la formación de cuadrúplex G puede proporcionar una media para la detección
y comunicación de largo alcance entre ubicaciones genómicas distales para coordinar
transacciones reguladoras en el ADN genómico [91].
FIGURA 2
FIGURA 3
12) Perspectivas y direcciones futuras.
La comprensión de las estructuras de ADN no canónicas abre aún más un nuevo campo de
exploración de sus aplicaciones biológicas que podrían ser relevantes para comprender el
mecanismo de las regulaciones de los procesos celulares. Como la mayoría de estas estructuras de
ADN ya han demostrado su existencia in vivo en el pasado reciente, los modelos mecanísticos de
su funcionamiento deberían ser ahora el foco de la comunidad científica. Muchas de estas
estructuras, como la guanina cuádruple, ahora se han relacionado con enfermedades como el
cáncer y los trastornos genéticos, lo que proporciona las claves para la futura correlación de las
mismas con el diseño personalizado de varias dianas terapéuticas. Esta revisión refuerza el papel
de las estructuras de ADN alternativas en la regulación de los genes y hace hincapié en la
necesidad de comprender su formación y los mecanismos de control en diversas ubicaciones
genómicas. Un conocimiento profundo de estos mecanismos de estructuras de ADN no canónicas
también podría ayudarnos a diseñar estrategias eficientes para combatir enfermedades al alterar
la expresión de genes
