Universidad Distrital Francisco José de Caldas
Facultad de Ciencias y Educación
Proyecto Curricular de Licenciatura en biología
Genética Molecular
Jersson Jareth Cuervo Rodríguez
20151140383
Ensayo
Mundo RNA
Se analiza la atmósfera primitiva, los respiraderos submarinos, el origen autotrófico frente al
heterótrofo, los mundos de ARN y pre-ARN, y el tiempo requerido para que surja la vida y
evolucione a cianobacterias.
Comúnmente se reconoce que el O2 estuvo ausente sobre la composición de la atmósfera
primitiva. Los químicos atmosféricos favorecen mayormente CO2 1N2 alto, mientras que los
químicos prebióticos favorecen mayormente condiciones más reductoras. Se requieren
condiciones reductoras para la síntesis de aminoácidos, purinas, pirimidinas y azúcares, y tales
síntesis son muy eficientes (Stribling y Miller, 1987). Según lo que se sabe sobre la química
prebiótica, si la Tierra no se estuviera reduciendo, los compuestos orgánicos tendrían que ser
aportados por partículas de polvo, cometas y meteoritos (Anders, 1989; Chyba et al., 1990).
La temperatura de la Tierra primitiva durante el período del origen de la vida es desconocida.
Se piensa que todo el planeta, ha permanecido fundido durante varios cientos de millones de
años después de su formación (Wetherill, 1990). Algunos modelos atmosféricos incorporan
altas presiones parciales de CO2 para elevar la temperatura de la Tierra mediante un efecto
invernadero y así evitar la congelación completa de los océanos (Kasting, 1993). Los procesos
relevantes para el origen de la vida pueden haber tenido lugar en ambientes diferentes del
promedio terrestre, por ejemplo, aguas termales, agua de mar eutéctica o lagunas de secado.
Tras descubrir respiraderos submarinos, en crestas de las crestas oceánicas (Corliss et al.,
1979), se propuso una teoría del origen de la vida en estos respiraderos (Corliss et al., 1981).
Las aguas termales surgen cuando el agua de mar es empujada hacia los sedimentos por varios
kilómetros, calentada por magma y empujada a través de los respiraderos a 350 ° C. Se trata
de una gran cantidad de agua, con todo el océano pasando por ellos cada diez millones de
años. Los respiraderos submarinos desempeñaron un papel en la regulación de la composición
del océano y posiblemente la atmósfera y, más importante aún, la destrucción de compuestos
orgánicos producidos en la atmósfera. Esto significa que los compuestos orgánicos no se
acumularán durante períodos de tiempo muy largos, y por lo tanto la destrucción del
respiradero establece un marco de tiempo para el origen de la vida de aproximadamente Diez
millones de años (Stribling y Miller, 1987; Lazcano y Miller, 1994).
La teoría heterotrófica Oparin-Haldane del origen de la vida sobre la base de que un organismo
heterotrófico es más simple que uno autótrofo, y los experimentos de síntesis prebiótica
muestran cuán fácil es en condiciones reductoras producir compuestos orgánicos. Aun asi hay
propuestas autótrofas, uno es el modelo rico en CO2 de la atmósfera primitiva de la Tierra
(Kasting, 1993). Las altas presiones de CO2 (10-100 atm) implican la ausencia de condiciones
reductoras y síntesis de compuestos orgánicos, y por lo tanto sería necesario que los primeros
organismos biosinteticen sus compuestos orgánicos, o que hagan uso de las muy pequeñas
cantidades de compuestos orgánicos traídos por cometas y meteoritos. Se ha propuesto una
teoría autotrófica que implica reacciones no enzimáticas modeladas según las actuales rutas
bioquímicas del metabolismo intermedio (Hartmann, 1975). Wa ¨ chtersha¨ (1992, y sus
referencias), postula que la biosíntesis y la polimerización tienen lugar en la superficie de FeS y
FeS2. La reacción FeS + 1 H2S = FeS2 1 H2 es muy favorable, por lo que la combinación FeS /
H2S es un agente reductor fuerte. El ARN en sí puede haber sido el resultado evolutivo de una
serie de diferentes polímeros genéticos. El ARN es una molécula prebiótica poco probable. El
primer problema es que no hay una reacción prebiótica que proporcione en gran parte ribosa
en lugar de una mezcla de muchos azúcares, incluidos los que tienen cadenas ramificadas
(Shapiro, 1988). El segundo problema es que los azúcares se descomponen rápidamente en la
escala de tiempo geológica.
El origen de la vida tuvo lugar después de períodos geológicos prolongados. Existe una
convincente evidencia paleontológica de que las comunidades microbianas estaban
prosperando en la Tierra primitiva 3.5 3 hace 109 años (Schopf, 1993), y se ha sugerido que la
vida pudo haber sido exterminada hasta 3.8 3 hace 109 años si la Tierra se estaba sometiendo
impactos de grandes asteroides (Maher y Stevenson, 1988; Sleep et al., 1989). Se ha
argumentado que estos cortos períodos de tiempo hacen improbable la acumulación de la
sopa prebiótica y, por lo tanto, deben interpretarse como evidencia que respalda un origen
autótrofo de la vida (Maden, 1995). Cualquiera sea la naturaleza del primer polímero genético,
está claro que la hidrólisis debe haber limitado su acumulación en el entorno primitivo.
Se ha reconocido que la mayoría de la información genética no es esencial para el crecimiento
y la división celular.
Las enzimas han surgido por la duplicación de genes. La incertidumbre es la cantidad de
enzimas que no surgieron de esta manera, es decir, los tipos iniciales. En algunos casos, los
tipos de iniciadores pueden derivarse de reacciones lentas no enzimáticas donde la proteína
mejora en un proceso previamente lento. En el caso de la fotosíntesis dependiente de la
clorofila, se han conservado pruebas de duplicación e incluso duplicación de eventos en
ferrodoxinas, ATPasas de tipo F, reductasas implicadas en la biosíntesis de clorofila y
bacterioclorofila, el centro de reacción fotosintética bacteriana, los dos conjuntos de luz.
El tiempo para la evolución de los primeros organismos de ADN / proteína a cianobacterias
similares a osciladores se piensa que es muy largo, porque estos últimos tienen genomas
bastante grandes de 63 103 kb a 8 3 103 kb (Herdman, 1985) y generalmente se los considera
ser muy complejo. El origen y la evolución temprana de la vida fueron procesos lentos que
requirieron miles de millones de años se deriva del enfoque darwinista clásico de que los
cambios importantes son lentos y proceden paso a paso durante largos períodos de tiempo.
Toda la evidencia revisada aquí sugiere que la estabilidad de los monómeros y polímeros
esenciales para el origen de la vida limita fuertemente la posibilidad de una evolución lenta
que tuvo lugar poco después del comienzo de la vida, los procesos genéticos básicos y los
principales rasgos moleculares han persistido esencialmente sin cambios para más de tres mil
quinientos millones de años, tal vez debido a los vínculos de los genes involucrados y las
interacciones entre las diferentes rutas metabólicas.
La secuenciación de ADN, la transcripción in vitro y la reacción en cadena de la polimerasa han
permitido manipular y caracterizar secuencias de ácidos nucleicos casi completamente ex vivo.
A su vez, los principios que rigen la selección natural de organismos ahora se pueden aplicar a
las moléculas en un tubo de ensayo: se puede preparar y agrupar un conjunto de moléculas de
ácido nucleico variable heredable para secuencias que confieren un fenotipo mejorado, estos
fenotipos se pueden permitir compiten entre ellos, y los sobrevivientes pueden ser
amplificados preferencialmente. Una visión generalizada del mundo del ARN. Los sucesos que
supuestamente ocurrieron entre el origen de la vida y el progenito (el último antepasado
común de la vida moderna) están más o menos ordenados. La cronología fluye desde
'temprano' en la parte superior de la página (hace 3.500 millones de años) hasta 'tarde' en la
parte inferior. La celularización representa la inmovilización de autorreplicantes, y podría
haber ocurrido tan fácilmente en una superficie bidimensional como dentro de una vesícula
lipídica. Como la difusión habría reducido severamente la aptitud de los replicadores, la
celularización podría haber sido concomitante con el origen de la vida. De manera similar,
dado que el reabastecimiento de metabolitos de la sopa probablemente habría reemplazado la
necesidad de un genoma resistente a los errores, se ha demostrado que el metabolismo ocurre
antes de la invención del ADN. Los 'fósiles moleculares' que pueden haber persistido en
versiones anteriores de la vida están representados a la derecha.
Las Similitudes estructurales entre arginina y guanosina. Las dos estructuras se dibujan de
modo que el grupo de cabeza de guanidino de la arginina tenga una orientación similar a las
fracciones químicas relacionadas que se encuentran en la guanosina. La similitud se puede
extender a través de la base y hacia el azúcar, donde la amina primaria o el carboxilato del
aminoácido se pueden solapar con los hidroxilos en la ribosa.
La selección in vitro se ha utilizado para generar una amplia variedad de nuevas ribozimas. Dos
tipos de procedimientos de selección han producido catalizadores. La selección indirecta es
similar a los protocolos usados originalmente para aislar anticuerpos catalíticos. (Prudent. Et.
Al). Moléculas de ARN seleccionadas que pueden unirse a un análogo de bifenilo con puente
del estado de transición de una reacción de isomerización. Se descubrió que las especies de
unión son ribozimas capaces de catalizar la isomerización de sustratos químicamente similares
al análogo. La selección directa requiere que las moléculas de ARN activo en un grupo se
alteren durante el proceso de selección de tal manera que permita su aislamiento. Yarus
proponer un modelo para el origen del código genético. El modelo propone que los sitios de
unión a guanosina, como los encontrados en el intrón del grupo I, fueron seleccionados
originalmente durante la evolución de la autorreplicación. Las similitudes estructurales entre la
guanosina y la arginina permitieron que este aminoácido se uniera cerca del sitio activo de una
ribozima. Esta ribozima puede haber sido capaz de usar arginina como sustrato, catalizando su
activación y luego la aminoacilación de la ribozima por la arginina activada. El codón o
anticodón de arginina (o ambos) habría sido una característica clave del sitio de unión de la
ribozima de tipo ARNt sintetasa recientemente desarrollada.
Davies y Schroeder muestran dos modelos contrastantes para la presencia de sitios de unión a
aminoglucósidos en ARN modernos. La 'hipótesis LME' sugiere que los sitios modernos de
unión a aminoglucósidos son fósiles moleculares de un número relativamente limitado de
sitios de unión que se produjeron en los ARN antiguos. Los sitios se han conservado a través
del tiempo debido a su asociación con estructuras o funciones de ARN críticas. La 'hipótesis
estocástica' sugiere que, como los aminoglucósidos probablemente han evolucionado para
unirse al ARN, no es sorprendente que los sitios de unión a aminoglucósidos puedan
encontrarse por casualidad solo en ARN funcionales.
El articulo enfoca la selección in vitro y dice que se puede utilizar para evaluar la probabilidad
de la hipótesis histórica / LME mediante la evaluación de la probabilidad de su inverso: la
hipótesis nula (o "estocástica"). La principal conclusión que puede extraerse de los
experimentos de selección in vitro es que el número total de posibles motivos de unión y
catalizadores es gigantesco.