¿QUÉ ES UN MICROARRAY?
El microarray es una ingeniosa tecnología basada en la hibridación molecular: en una matriz de
vidrio, silicona, o nylon, se sitúan o “anclan” sondas (“spots”) de oligonucleótidos (fragmentos
de DNA) conocidos, y en una ubicación precisa. Sobre ellos se sitúan o “hibridan” fragmentos de
DNA desconocido, procedentes de tejidos o muestras de pacientes. Esta técnica, aunque
habitualmente se asocie al estudio del DNA, también se puede aplicar el estudio de las proteínas
e hidratos de carbono.
LA TÉCNICA DE MICROARRAYS
Está basada en la propiedad física de los ácidos nucleicos para hibridar con secuencias
complementarias, a temperaturas y pH adecuados.
1. De manera que las bases complementarias entre una muestra biológica y el microarray
se reconocen y esta hibridación se puede visualizar, mediante el uso de un trazador, que
habitualmente se trata de una molécula fluorescente.
2. De este modo, la muestra biológica se marca con el trazador y tras la hibridación y una
serie de lavados, el microarray se escanea y se visualiza una imagen.
3. Posteriormente, mediante el uso de un software especializado, se cuantifica la señal de
las imágenes.
4. Finalmente, se realiza un tratamiento informático de los datos que persigue minimizar
las variaciones inherentes a la técnica, optimizar la extracción fiable de los datos y
correlacionar dichos datos con el proceso biológico
TECNOLOGIAS APLICADAS
- Medir la expresión de genes (Microarray expression analysis), por ejemplo, en un tumor.
- Estudiar la mutación de un gen (Microarray for mutation analysis), por ejemplo, en una
enfermedad hereditaria.
- La hibridación genómica o CGH (Comparative Genomic Hybridization) es una
herramienta de análisis que permite un escaneado global de segmentos del genoma, o
bien del cariotipo, para detectar la presencia de ganancias (amplificaciones o
duplicaciones) o pérdidas (delecciones o nulisomías) respecto a un patrón conocido.
UTILIDAD
Su máxima utilidad se desarrolla en el campo del diagnóstico clínico, de la proteómica y de la
farmagenómica.
1. Microarray y cáncer:
El estudio de las alteraciones genéticas propias de cada tipo de cáncer está adquiriendo cada
vez mayor relevancia con la utilización de la tecnología de los microarrays. Esta tecnología es,
ideal para conocer la huella genética de un tumor (fingerprint): de la hibridación de una muestra
de tejido tumoral con “spots” de secuencias conocidas se permite deducir o no la presencia de
genes activados relacionados con el tumor, lo que permite conocer la etiopatogenia de los
procesos neoplásicos, identificar a los individuos con predisposición genética al cáncer.
Igualmente, esta tecnología puede usarse en muestras de sangre o de orina, donde es posible
detectar polimorfismos asociados con diferentes cánceres, entre ellos el colorectal
(RamplexCRC) o el de próstata (ProgensaPCA3)
2. Microarray y otros procesos patológicos:
Las enfermedades cardiovasculares (hipertensión, trombofilia, dislipemia), la osteoporosis, las
Enfermedades neurodegenerativas, la intolerancia a fármacos, y la demencia, etc. , empiezan a
contar con una valoración molecular de su etiopatogenia. Eventos moleculares, son hoy posibles
y se puede evaluar a los individuos con predisposición genética a padecer determinadas
patologías. Un análisis genético de este tipo aporta una visión general de un posible problema,
por lo que se puede prevenir, o retrasar, su aparición, o bien tratarla mucho antes de que se
produzca.
3. Microarray y diagnóstico prenatal
Actualmente, en el diagnóstico prenatal, se utilizan células fetales, en las que se detectan
anomalías diversas que afectan a un solo gen (estudios monogénicos), o bien mediante el
estudio del cariotipo que afectan a grandes fragmentos de un cromosoma (delecciones,
inversiones, translocaciones) o bien a su totalidad (aneuploidias). La utilización del microarray,
con una matriz donde se imprimen las partes del genoma que se desea investigar y que se
compararan con el material genético obtenido del feto, permite aumentar la sensibilidad de los
estudios, ya que se pueden analizar pequeños fragmentos de unas 50.000 bases, frente a la
resolución actual, que alcanza en el cariotipo grandes fragmentos de hasta 5.000.000 bases.
Además, se puede detectar, de una sola vez, todas las regiones del genoma que se saben
implicadas en cualquiera de las alteraciones cromosómicas más habituales.
4. Microarray y alergia
Una variante de la técnica es el diagnóstico de la alergia frente a los tradicionales métodos
inmunoquímicos. Se está comercializando el Biochip Immuno CAP ISAC por la casa Phadia en el
que las proteínas alergénicas, en su forma biológica activa, están sólidamente ancladas a la
superficie del chip y se enfrentan a muestras de plasma o suero problema, en un método de una
sola etapa. Del análisis de las imágenes obtenidas se obtiene un informe sobre 103 alérgenos.
Como vemos, no se busca la complementariedad de las bases de DNA sino una reacción
antígeno-anticuerpo sobre un soporte o matriz, utilizando pequeñísimas cantidades de alergeno
y suero problema, con una velocidad de reacción que no supera los 10 minutos.
5. Microarray y alimentación
Gracias a los avances en el conocimiento de las bases genéticas de la obesidad, y de los
mecanismos hormonales que contribuyen a la acumulación y distribución de la grasa corporal,
es posible un acercamiento molecular a los mecanismos que regulan el peso corporal, como son:
la adipogénesis, la termogénesis y la lipólisis. La obesidad es una patología de tipo multifactorial
en que la contribución ambiental, como en otros procesos vitales, es importante, pero en la que
también se ha puesto en evidencia un componente genético. La tecnología del microarray
permite un primer acercamiento con el estudio de 40 SNPs (Single Nucleotide Polimorphism)
que se relaciona con la obesidad en el kit CIC-NutriGEN del CIC Analítica Clínica Especial.
6. Microarray y modelos de vida
La introducción de la tecnología microarray, con la posibilidad de estudiar determinados genes,
permiten además modelar el estilo de vida a la nuestra realidad genética, por ejemplo en la
actividad deportiva: conocer el riesgo de padecer según qué tipo de lesiones, respuesta al estrés
oxidativo, capacidad física, combustión de grasa corporal, etc. Existe comercializado el Kit CIC
SportGEN de CIC Analítica Clínica Especial.
