Universidad de Puerto Rico en Cayey, Departamento de Biología

Itinerario para el Laboratorio de Biología General I (Biología 3033)

Auspiciado por el Howard Hughes Medical Institute, Science Education
Alliance,
National Genomics Research Initiative (NGRI)
Primer Semestre 2010 - 2011
RESUMEN DEL CURSO

Profesor: Dr. Edwin Vázquez Laboratorio (BIOL 3033, Sección 128: jueves 12:30 PM –
3:30 PM)
Teléfono: 787-738-2161 X3213
Email: [email protected]
Oficina: NEC210
Horas de Oficina:Lunes: 1-3 PM; Miércoles: 1-3 PM: Viernes 10-12 AM (Sujeto a cambios con
previo aviso)

Objetivo General: Proveer al estudiante experiencias educativas relacionadas a la

investigación biológica específicamente envueltas en el descubrimiento, aislación, purificación y
caracterización molecular de bacteriófagos de suelo denominados mycobacteriófagos.
Objetivos Generales y Específicos del Curso: Los objetivos generales y específicos se
enumeren en el manual de laboratorio descrito a continuación.

Manual de Laboratorio: National Genomics Research Initiative (NGRI) Phage Resource Guide,
Science Education Alliance, Howard Hughes Medical Institute, Chevy Chase, MD. 2009. Nota: El
manual se entrega sin costo a los participantes del NGRI.
Moodle y Wiki: Este curso utiliza recursos tecnológicos suplementarios como parte integral del
programa de estudio.
Referencias Adicionales: Algunas referencias adicionales se desglosen en el recurso
electrónico de Wiki asociado con este curso.
Acomodo Razonable: Este curso provee acomodo razonable a estudiantes que según dispone
la Ley 51 de Servicios Educativos Integrales para personas con impedimentos, así lo soliciten al
Profesor(a).

EVALUACION DEL ESTUDIANTE

Criterio Puntuación Valor

Porcentual
Dos Exámenes Teóricos (a Mitad del Curso y al Final) 200 40%
Dos Exámenes Prácticos 50 10%
Pruebas Cortas u Otros Trabajos Escritos 50 10%
Portafolio de artículos sobre Bacteriófagos 25 5%
Informes de Laboratorio (Libreta y Informe Para Archivar 25 5%
Datos Finales)
Informe Escrito Tipo Publicación Científica 50 10%
Informe Oral Final de los Resultados Científicos 50 10%
Asistencia y Participación 50 10%
Bono (Seminarios, Preguntas Especiales) (Opcional) 25 5%
Total 500 Puntos 100%

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Profesores: Dr. Edwin Vázquez, Departamento de Biología, UPR-Cayey – Página 1
Evaluación Para el Laboratorio (500 Puntos) (100%):
Exámenes Teóricos (2) (200 puntos)
EXAMEN 1 100 puntos
EXAMEN 2 100 puntos
TOTAL 200 puntos
Exámenes Prácticos (2) (50 puntos)
EXAMEN 1 25 puntos
EXAMEN 2 25 puntos
TOTAL 50 puntos
El estudiante tendrá 10 días para resolver con el profesor cualquier reclamación relacionado con
sus exámenes.
Si por alguna razón debidamente justificada usted no puede tomar algún examen, la reposición
se hará durante la última semana de clases con un examen de substitución comprensivo (cubre
todo el material del semestre entero). No se repondrán exámenes finales! Si falta a algún
examen sin justificación éste no será repuesto y recibirá una calificación de cero (“0”).

Pruebas Cortas u Otros Trabajos Escritos (Máximo de 50 puntos)

Se ofrecerán pruebas cortas a discreción del instructor y sin previo aviso (Máximo de 50 puntos
en pruebas cortas). Si el estudiante falta una prueba corta, la próxima cuenta doble hasta un
máximo de una vez, después de cual las pruebas cortas faltadas resultarán en cero (“0”). En
adición, posiblemente se ofrecerán otros trabajos escritos como asignaciones.

Portafolio de Artículos Científicos Sobre Bacteriófagos (Máximo de 25 puntos)

Se entregarán artículos científicos y los estudiantes buscarán artículos científicos adicionales
sobre bacteriófagos para leer, estudiar, presentar y discutir en el laboratorio.

Informes de Laboratorio (Libreta y Informe Para Archivar Datos Finales) (Máximo de 25 puntos)
Cada estudiante mantendrá una libreta de laboratorio durante todo el semestre para
documentar la teoría, procedimientos, resultados y discusión de los resultados de su
investigación relacionada con su mycobacteriófago aislado y caracterizado. Al fin del semestre,
los estudiantes completarán y entregarán un informe estandarizado para archivar los datos
finales de su mycobacteriófago aislado y caracterizado.

Informe Escrito Tipo Publicación Científica (Máximo de 50 puntos)

Los estudiantes redactarán un informe final escrito estilo publicación en el formato científico
donde se presentarán la teoría, procedimientos, resultados, datos y discusión de los resultados
de su investigación relacionada con su mycobacteriófago aislado y caracterizado.

Informe Oral Final de los Resultados Científicos (Máximo de 50 puntos)

Los estudiantes presentarán un informe final oral antes sus colegas y facultad con recursos
audiovisuales en el formato científico donde se explicarán la teoría, procedimientos, resultados,
datos y discusión de los resultados de su investigación relacionada con su mycobacteriófago
aislado y caracterizado.

Preparación, Presentaciones, Asistencia, y Participación Activa en la Clase (Máximo de 50

puntos)
Se requiere la asistencia y la participación activa en la clase (Máximo de 50 puntos en
preparación, presentaciones, asistencia, y participación activa). Se les asignarán a todos los
estudiantes varios temas para preparar informes y ofrecer presentaciones frente a la clase en
varias ocasiones durante el semestre. La asistencia de los estudiantes se registrará durante
cada clase. Ausencias resultarán en una reducción en la nota final del estudiante. Tres
ausencias injustificadas durante el semestre resultarán en una nota final de “F” en el curso
BIOL3033.

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Bono (Seminarios, Preguntas Especiales) (Opcional) (Máximo de 25 puntos)
Los estudiantes podrán asistir a seminarios científicos y contestar preguntas especiales en el
SEA Wiki para acumular puntos adicionales de bono (completamente opcional).

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Forma de Otorgar las Calificaciones (Sujeto a Cambios):
90% - 100% A
80% - 89% B
70% - 79% C
60% - 69% D
0% - 59% F

Nota Importante:
Cada examen se estandarizará considerando la puntuación más alta y la distribución de las
notas de los estudiantes.
Una posible estandarización ajuste las notas de tal modo que la puntuación más alta equivaldrá
a la nota "A".

Posibles Ejemplos: Si la puntuación más alta fue de 90/100, entonces no habrá factor de
estandarización
y 90% es "A". Todas las puntuaciones de los estudiantes permanecen
inalteradas.
Si la puntuación más alta fue de 78/100, entonces se procederá a añadir 12
puntos a los exámenes de todos los estudiantes, 78 + 12 = 90% que
equivale a "A".

REGLAS Y NORMAS
1. La asistencia a la conferencia y al laboratorio son requisito y el estudiante debe llegar a
tiempo. Si el estudiante llega tarde, debe entrar callado y no molestar a los demás.
Solamente se permite salir de las conferencias en caso de emergencia.

2. El estudiante es responsable de leer y estudiar la lectura y el material asignado para la

conferencia y el laboratorio. Esto prepara al estudiante para seguir y entender mejor la
conferencia y llevar a cabo los experimentos. También prepara al estudiante para participar
en la clase y contestar preguntas, oralmente o por escrito en la pizarra, relacionados con los
temas. Es importante que el estudiante estudie la materia regularmente.

3. El uso de celulares está estrictamente prohibido en la clase y en el laboratorio y resultará en

una reducción de puntos que afectará la nota final del curso! Favor de apagar los mismos
durante las clases o ponerlos en función de vibrar.

4. No se permitirá el uso de computadoras durante el laboratorio a menos que el profesor así lo

indique.

5. Cada estudiante está obligado a observar todas las reglas de seguridad del laboratorio.

Nota: Cualquier forma de intentar de evitar una evaluación justa (por trampa o engaño)
resultará en una puntuación de cero para esa evaluación ("Cheating in any form will result in a
zero"). Además, el profesor podría tomar medidas punitivas adicionales y más severas.

Sugerencias:
Establezca un horario de trabajo
Lea todas las instrucciones
Piense antes de actuar
Prepare una lista de los materiales y equipo necesario para el proyecto (ejercicios de laboratorio)
Escriba los procedimientos, observaciones, y conclusiones (ejercicios de laboratorio)
Los informes de laboratorio se escriben en un formato científico

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Cada persona en el grupo es responsable de su propio informe
Recuerde los 5 P's: "Proper planning prevents poor performance"

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TEMAS A CUBRIR POR SEMANA (Sujeto a Cambios)

Semana Tema(s) Páginas del Manual

1 Formularios y Avalúo, Entrega de Materiales y
Manual I – ix
Orientación al Proyecto y al Laboratorio (HHMI
Video) Before You Start A.1 – A.7
Seguridad en el Laboratorio Before You Start B.1 – B.4
Pipetas, Micropipetas y Técnica Esteril Capture A1 – A6
Libreta de Laboratorio Documento Suplementario
Introducción a Bacteriófagos Capture B1 – B2
Coordinados de GPS
Colección de Muestras
2 Estilos de Vida de Bacteriófagos Capture C1 – C6
Procesamiento de Muestras de Suelo Capture B1 – B4
Enriquecimiento y Siembra Directa Capture B1 – B10
3 Verificar Placas (“phage plaques”) Tame A1 – A4
Prueba de Punto (“spot test”) para Fagos Tame A1 – A4
Purificación de Placas Tame A5 – A10
Determinar Número de Fagos en el Filtrado Tame A5 – A10
4 Purificación de Placas Tame A11 – A16
Purificación de Fagos por reinfección (3X)
5 Purificación de Placas Tame A11 – A16
Purificación de Fagos por reinfección (3X)
6 Prueba Empírica Tame B1 – B4

7 Preparar filtrado de fagos Tame B5 – B9

Infectar Bacterias Tame B5 – B9
Cosechar lisado con filtro Tame B7 – B8
Prueba de Punto (“spot test”) para Fagos Tame A1 – A4
Determinar Número de Fagos en el Filtrado Tame A5 – A10
8 Aislar DNA del Bacteriófago Dissect B1 – B3
Coleccionar y Cosechar DNA del Bacteriófago
9 Examen 1 (Teórico y Práctico)
10 Purificar DNA del Bacteriófago Dissect B1 – B3
Determinar Cantidad y Calidad del DNA del Dissect B1 – B3
Bacteriófago Documento Suplementario
11 Análisis de Restricción por Digestión Dissect C1 – C8
Enzimática del DNA del Bacteriófago
12 Compara Mapa de Restricción Entre Dissect C1 – C8
Bacteriófagos
13 Evaluación de la Calidad del DNA Genómico Dissect D1 – B4
Enviar DNA a la Facilidad de Secuenciación
Evaluación de la Calidad del DNA Genómico Dissect D1 – B4
Enviar DNA a la Facilidad de Secuenciación
14 Visualizar el Bacteriófago con el Microscopio Dissect A1 – A3
Electrónico
15 Visualizar el Bacteriófago con el Microscopio Dissect A1 – A3
Electrónico
16 Examen 2 (Teórico y Práctico)
Presentaciones Finales (a Ser Programado)
El profesor se reserva el derecho de admisión tanto a la conferencia como al laboratorio.