TEMA 7: ENZIMAS HIDROLTICAS
Estructura, sitios activos y mecanismos catalticos de algunas enzimas
hidrolticas
Aminocidos frecuentemente presentes
en sitios activos de enzimas hidrolticas
Mecanismo general de catlisis en una
proteasa
LIPASAS
lipasa de Candida antarctica: cal A
LIPASAS
lipasa de Candida antarctica: CAL A
Mecanismo de la serina hidrolasa
Trada cataltica: Asp, His, Ser (Disminuye pKa de Ser,
facilitando sus accin como nuclefilo)
His
Asp
O
Ser
O
O
H
N:
R1
OR 2
As el grupo acilo del sustrato se une covalentemente a la enzima
formando el intermedio acil-enzima mediante la liberacin del
alcohol
His
Asp
Ser
O
HOR2
R1
Nu:
Un nuclefilo (NU:) puede atacar el intermedio regenerando la
enzima y liberando el cido correspondiente
Seril Proteasas
Tripsina, quimotripsina, elastasa, subtilisina,
plasmina, etc.
trada cataltica
quimotripsina
H3N
Arg
Gly
Ser
Ala
Gly
Phe
Lys
Asn
Glu
Trp
COO
Val
Quimotripsina
Estructura globular
Quiomotripsina del pncreas bovino (PM 25.191). Estructura primaria
quimotripsina
Sitio activo de quimotripsina.
Modelo de superficie de quimotripsina.
En verde el bolsillo hidrofbico que
selecciona los restos aminoacdicos
aromticos neutros.
En rojo los aminocidos claves para la
catlisis Ser 195, His 57 y Asp 102
En azul el grupo aromtico del sustrato y
el nitrgeno de la amida.
En prpura el oxgeno del carbonilo.
En amarillo las zonas de carga que
estabilizan al oxgeno
En rojo Ser 195 e His 57
Pptido sustrato
Ser 195
Hys 57
Asp 102
Subtilisina
Bacillus subtilis
Quimioselectividad de las serilendopeptidasas
Lisozima
Agente antibacteriano
natural que se encuentra
en lgrimas y clara de
huevo
PM 14.296
Su estructura se estabiliza
por 4 puentes disulfuro
Su sustrato el muropptido
de paredes celulares
bacterianas
Presenta selectividad frente
a enlaces glicosdicos
(14) entre Mur2Ac
(NAM) y GlcNAc (NAG)
Cambios conformacionales de Lisozima al unir el sustrato
Se pueden plantear dos propuestas
mecansticas para interpretar la reaccin
catalizada por Lisozima
Una SN1 dnde el residuo de Asp 52 solo
actuara estabilizando el catin intermedio de la
reaccin
Una SN2 que es ms consistente con la
retencin de la configuracin observada en el
producto final
Mecanismo SN2 de lisozima
Estrictamente es un
mecanismo de doble inversin
de la configuracin
Glicosidasa con retencin de la configuracin
Glu1
OH
Glu1
HO
O
O
HO
O
O
SN2 Inversin
HO
OH
In oxonio unido al enzima
HO
HO
OH
OH
-O
ROH
Glu2
Glu2
Glu1
OH
HO
Glu1
O
HO
OH
Nu
SN2 Inversin
OH
-O
HO
Glu2
HO
Nu
HO
OH
Glu2
BIBLIOGRAFA
-ORGANIC CHEMISTRY. 2da. [Link] LOUDON. Editorial Benjamin
-ORGANIC CHEMISTRY. J. Mc MURRY. 3ra Edicin 1994. Ed Interamericana
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-BIOQUMICA. D.y J. Voet 1992. Ed. Omega
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